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EMD-57731 'consensus EM volume' EMDB 'Cascade-TniQ-TnsC focused' EMD-57730 'focused EM volume' EMDB 'TnsC focused' EMD-57729 'focused EM volume' EMDB 'TnsAB focused' EMD-57728 'focused EM volume' EMDB 'Cryo-EM structure of the PseCascade-TniQ-TnsC-TnsAB holocomplex' EMD-57736 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 4 _pdbx_contact_author.email jinek@bioc.uzh.ch _pdbx_contact_author.name_first Martin _pdbx_contact_author.name_last Jinek _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-7601-210X # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Finocchio, G.' 1 0000-0001-6905-9308 'Oberli, S.' 2 0000-0002-3568-7637 'Schmitz, M.' 3 0000-0003-3216-7350 'Jinek, M.' 4 0000-0002-7601-210X # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Biorxiv _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2692-8205 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structural basis of RNA-guided DNA integration by type I CRISPR-associated transposases.' _citation.year 2026 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.64898/2026.05.18.725949 _citation.pdbx_database_id_PubMed 42239233 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Finocchio, G.' 1 0000-0001-6905-9308 primary 'Oberli, S.' 2 0000-0002-3568-7637 primary 'Lampe, G.' 3 0000-0002-2873-2372 primary 'Schmitz, M.' 4 0000-0003-3216-7350 primary 'Sternberg, S.H.' 5 0000-0001-8240-9114 primary 'Jinek, M.' 6 0000-0002-7601-210X # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'CRISPR RNA' 30196.002 1 ? ? ? 'CRISPR RNA (crRNA) from the type I-F PseCAST (Tn7016) Cascade complex of Pseudoalteromonas sp. S983.' 2 polymer syn TS_RE-transferred 44743.492 2 ? ? ? ;Target DNA strand complementary to the crRNA spacer sequence, fused to the transferred strand of the right end via a palindromic target site duplication (TSD) sequence. ; 3 polymer syn 'Non-target DNA strand' 27669.693 2 ? ? ? ;Non-target DNA strand containing a +1 to +18 region identical to the target DNA strand, rather than complementary, to facilitate crRNA annealing to the protospacer. ; 4 polymer syn RE_non-trasferred 16520.635 2 ? ? ? ;Non-transferred DNA strand complementary to the transferred strand of the right transposon end and bearing a 5'-TTT phosphorylated overhang. ; 5 polymer man Cas7.1 39845.145 6 ? ? ? 'CRISPR-associated protein Cas7 from the type I-F PseCAST (Tn7016) Cascade complex of Pseudoalteromonas sp. S983.' 6 polymer man Cas8 79290.211 1 ? ? ? 'CRISPR-associated protein Cas8 from the type I-F PseCAST (Tn7016) Cascade complex of Pseudoalteromonas sp. S983.' 7 polymer man Cas6 26631.074 1 ? ? ? ;CRISPR-associated protein Cas6 from the type I-F PseCAST (Tn7016) Cascade complex of Pseudoalteromonas sp. S983, bearing a C-terminal Twin-Strep tag. ; 8 polymer man TniQ.1 49832.406 2 ? ? ? ;CRISPR-associated protein TniQ from the type I-F PseCAST (Tn7016) system of Pseudoalteromonas sp. S983, bearing an N-terminal His10 tag followed by a TEV protease cleavage site. ; 9 polymer man 'AAA+ ATPase domain-containing protein' 38609.902 7 ? ? ? 'AAA+ ATPase TnsC from the type I-F PseCAST (Tn7016) system of Pseudoalteromonas sp. S983.' 10 polymer man 'Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,TnsA endonuclease N-terminal domain-containing protein,TnsB transposase' 142301.844 11 ? ? ? ;Fusion of TnsA (res 1-209, NCBI Reference Sequence WP_249364174.1) and TnsB (res 239-613, NCBI Reference Sequence TMP85090.1) from the type I-F PseCAST (Tn7016) system of Pseudoalteromonas sp. S983 with a synthetic NLS linker (res 210-238), and bearing an N-terminal His6-MBP tag followed by a TEV protease cleavage site.,Fusion of TnsA (res 1-209, NCBI Reference Sequence WP_249364174.1) and TnsB (res 239-613, NCBI Reference Sequence TMP85090.1) from the type I-F PseCAST (Tn7016) system of Pseudoalteromonas sp. S983 with a synthetic NLS linker (res 210-238), and bearing an N-terminal His6-MBP tag followed by a TEV protease cleavage site.,Fusion of TnsA (res 1-209, NCBI Reference Sequence WP_249364174.1) and TnsB (res 239-613, NCBI Reference Sequence TMP85090.1) from the type I-F PseCAST (Tn7016) system of Pseudoalteromonas sp. S983 with a synthetic NLS linker (res 210-238), and bearing an N-terminal His6-MBP tag followed by a TEV protease cleavage site. ; 11 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 13 ? ? ? ? 12 non-polymer man "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 507.181 7 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 10 _entity_name_com.name 'MMBP,Maltodextrin-binding protein,Maltose-binding protein,MBP' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polyribonucleotide no no ;GUGACCUGCCGUAUAGGCAGCUGAAAAUACAGUGGGGCCACUAGGGACAGGAUUGGUGACGUGACCUGCCGUAUAGGCAG CUGAAAAUGUAGC ; ;GUGACCUGCCGUAUAGGCAGCUGAAAAUACAGUGGGGCCACUAGGGACAGGAUUGGUGACGUGACCUGCCGUAUAGGCAG CUGAAAAUGUAGC ; 1 ? 2 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DA)(DT)(DT)(DA)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DT)(DA)(DT)(DG)(DG)(DT)(DT) (DG)(DC)(DA)(DT)(DT)(DA)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DA)(DA)(DC)(DT)(DA)(DT)(DG)(DG)(DT) (DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DT)(DG)(DG) (DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DA)(DC)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DA)(DA)(DG)(DT)(DT)(DG)(DT) (DG)(DT)(DT)(DC)(DT)(DT)(DC)(DT)(DT)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG) (DT)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT) (DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DC)(DA)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DG)(DG)(DA) (DT)(DT)(DA)(DC)(DC) ; ;AATTATGTCAAGGTATGGTTGCATTATGTCAAACTATGGTTGCAGCGACAGGCCCCGTGGAGCGGACCTTAAGAAGTTGT GTTCTTCTTTGCCTAGGCCGTCACCAATCCTGTCCCTAGTGGCCCCACTGTGGCTGAGGATTACC ; 2,5 ? 3 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DC) (DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT) (DG)(DG)(DT)(DG)(DA)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DA)(DA)(DG)(DA) (DA)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DA)(DC)(DT)(DT)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DG)(DT) (DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DC)(DG) ; ;GGTAATCCTCAGCCTGTCACCCCGGTGATCCCACAGGATTGGTGACGGCCTAGGCAAAGAAGAACACAACTTCTTAAGGT CCGCTCCACG ; 3,7 ? 4 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DT)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DA)(DC)(DC)(DA)(DT)(DA) (DG)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DT)(DA)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)(DA)(DC)(DC)(DA)(DT) (DA)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DT)(DA)(DA)(DT)(DT) ; TTTTTGTCGCTGCAACCATAGTTTGACATAATGCAACCATACCTTGACATAATT 4,6 ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MELCNILKYDRSLYPGKAVFFYKTADSDFVPLEADINKIRGPKSGFTEAFTPQFSPKNISPQDLTHNNILTLEECYVPPN VEHIFCRFSLRVQANSLVPSGCSDPEVFSLLKELAETFKECGGYKELAVRYCRNILIGTWLWRNQNTGNTQIEIKTSKGS CYLIDNTRKLAWESKWASDDLKVLEELSNEIESALTDPNVFWSADITAKIEASFCQEIYPSQILNDKVKQGEASKQFVKA KCADGRYAVSFNSVKIGAALQSIDDWWDEDASKRLRVHEFGADKEIGVARRPPDSEQNFYSIFKNTEWYLSALKNCITNK NEKIDPAIYYLFSVLIKGGMFQKKAEAKKA ; ;MELCNILKYDRSLYPGKAVFFYKTADSDFVPLEADINKIRGPKSGFTEAFTPQFSPKNISPQDLTHNNILTLEECYVPPN VEHIFCRFSLRVQANSLVPSGCSDPEVFSLLKELAETFKECGGYKELAVRYCRNILIGTWLWRNQNTGNTQIEIKTSKGS CYLIDNTRKLAWESKWASDDLKVLEELSNEIESALTDPNVFWSADITAKIEASFCQEIYPSQILNDKVKQGEASKQFVKA KCADGRYAVSFNSVKIGAALQSIDDWWDEDASKRLRVHEFGADKEIGVARRPPDSEQNFYSIFKNTEWYLSALKNCITNK NEKIDPAIYYLFSVLIKGGMFQKKAEAKKA ; A,B,C,D,E,F ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MHLKELLEITDTTERDRSLRRAFSPYTAMIDITGSEAVALIILLNLTYRKNQVDDLLDKKLAKQALKSEDHINKCIKEIA WFHTHNLKYPDIRVSKQNLAVEPPTLHSYVLSSANYPKAYGWSHNSAKVNFAKLFVSYFKWQNQVSWLAQVLATNSDNWK SAFTSLGLSVKAFKSLCVTVKNSLPEEAIPDSVDRYSRQIRMPYHDGYLAVTPVISHVVQSKIQQAAIDKRARFSNVEFT RPAAVSMLAASLGGVINVLNYPPYIRSKYHGLSNSRAFKLNNGQTVFNVEALLKPELIKALEGIIFSNNALALKQRRQQK VKNIKELRNTLLEWFSPVFEWRLDAIENGYDLEQLESASERLEYKILSLPDNELPSLTIPLFRLLNEMLGGVSMTQRYAF HPKLMSPLKAALQWLLVNLTDQKHVLIEEDDEHYRYLHLSGIRVFDAQALSNPYCSGIPSLTAVWGMIHSYQRKLNEALG TNVRFTSFSWFIRNYSAVAGKKLPELSLQGAQQSRLKRPGIIDGKYCDLVFDLIIHIDGYEDDLQAVDSKPDILKAHFPS 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CGFFKVSQVLAVPDSCEEVRFIRNQAVAKIFTGESRRRLKRLQKRALARGEDFNPKKIEAPREIDIFHRVAMTSKSSQED YILHIQKQDVDCQAEPYFSNYGLASNEKFKGTVPDLSPSIDRNSAWSHPQFEKGGGSGGGSGGSAWSHPQFEKSGGG ; ;MQRYYFTVHFLPKQANLALLTGRCISIMHGFILKHNIEGMGVTFPAWSDSSIGNEIAFVYTDKEILNTLKDQAYFVDMQD CGFFKVSQVLAVPDSCEEVRFIRNQAVAKIFTGESRRRLKRLQKRALARGEDFNPKKIEAPREIDIFHRVAMTSKSSQED YILHIQKQDVDCQAEPYFSNYGLASNEKFKGTVPDLSPSIDRNSAWSHPQFEKGGGSGGGSGGSAWSHPQFEKSGGG ; H ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MGHHHHHHHHHHGGSENLYFQSGMAFLFSPKARAFSDESLESYLLRVVSENFFDSYEGLSLAIREELHELDFEAHGAFPV DLKRLNVYHAKHNSHFRMRALGLLETLLDLPRYELQKLALLKSDIKFNSSVALYNNGVDIPLRFIRHHAEEAVDSIPVCS QCLAEEAYIKQSWHIKWVNACTKHQCALLHNCPECYAPINYIENESITHCSCGFELSCASTSPVNTLSIEHLNKLLDKGE RNDSNPLFNNMTLTERFAALLWYQERYSQTDNFCLNDAVNYFSKWPAVFNTELDELSKNAEMKLIDLFNKTEFKFIFGDA ILACPSTQKQSESHFIYRALLDYLVTLVESNPKTKKPNAADLLVSVLEAATLLGTSVEQVYRLYQNGILQTAFRHKMNQR INPYKGAFFLRHVIEYKTSFGNDKARMYLSAW ; ;MGHHHHHHHHHHGGSENLYFQSGMAFLFSPKARAFSDESLESYLLRVVSENFFDSYEGLSLAIREELHELDFEAHGAFPV DLKRLNVYHAKHNSHFRMRALGLLETLLDLPRYELQKLALLKSDIKFNSSVALYNNGVDIPLRFIRHHAEEAVDSIPVCS QCLAEEAYIKQSWHIKWVNACTKHQCALLHNCPECYAPINYIENESITHCSCGFELSCASTSPVNTLSIEHLNKLLDKGE RNDSNPLFNNMTLTERFAALLWYQERYSQTDNFCLNDAVNYFSKWPAVFNTELDELSKNAEMKLIDLFNKTEFKFIFGDA ILACPSTQKQSESHFIYRALLDYLVTLVESNPKTKKPNAADLLVSVLEAATLLGTSVEQVYRLYQNGILQTAFRHKMNQR INPYKGAFFLRHVIEYKTSFGNDKARMYLSAW ; I,J ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MNALTEIQIEKLRNFSDCIVMHPQIKTIFNDFDELRLNRKFQSDQQCMLLIGDTGVGKSHTINHYKKRVLATQNYSRNTM PVLVSRISRGKGLDATLVQMLADLELFGSSQIKKRGYKTDLTKKLVESLIKAQVELLIINEFQELIEFKSVQERQQIANG LKFISEEAKVPIVLVGMPWAAKIAEEPQWASRLVRKRKLEYFSLKNDSKYFRQYLMGLAKKMPFDVPPKLESKNTTIALF AACRGENRALKHLLLEALKLALSCNEYLENKHFITAYDKFDFFNDKEKLKSKNPFKQDIKDIEIYEVIKNSSYNPNALDP EDMLTDRVFAIVK ; ;MNALTEIQIEKLRNFSDCIVMHPQIKTIFNDFDELRLNRKFQSDQQCMLLIGDTGVGKSHTINHYKKRVLATQNYSRNTM PVLVSRISRGKGLDATLVQMLADLELFGSSQIKKRGYKTDLTKKLVESLIKAQVELLIINEFQELIEFKSVQERQQIANG LKFISEEAKVPIVLVGMPWAAKIAEEPQWASRLVRKRKLEYFSLKNDSKYFRQYLMGLAKKMPFDVPPKLESKNTTIALF AACRGENRALKHLLLEALKLALSCNEYLENKHFITAYDKFDFFNDKEKLKSKNPFKQDIKDIEIYEVIKNSSYNPNALDP EDMLTDRVFAIVK ; K,L,M,N,O,P,Q ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MGSSHHHHHHGSSMKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDR FGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSA LMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTI NGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKS YEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNSSSNNNNNNNNNNLGIEEN LYFQSNAMYIRNLRKPSPNKNVFKFASTKVSSVVMCESSLEFDACFHHEYNDLIESFGSQPEGFKYEFMGKSLPYTPDAL ISYTDKTQKYHEYKPYSKIASPLFRAEFAAKRAASLKLGIDLVLVTDRQIRVNPILNNLKLLHRYSGVYGISGIQKELLS FIHKSGVIKLNDISSQVGIPIGETRSFLFGLMHKGLVKADLGCDDLTNNPTLWATPGSGSGKRTADGSEFESPKKKRKVG SGSGGMTDFFNEFDESLVPLKPQTPTQYVKLDDANLIQRDLDTFSDTFKNQALQRYKLISTIDKKLSRGWTQRNLDPILD ELFKGGDVVRPNWRTVARWRKKYIESNGDIASLADKNHKMGNRTNRIKGDDKFFDKALERFLDAKRPTIATAYQYYKDLI 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'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample 'Biological sequence' 1 407 ? ? 'malE, b4034, JW3994' ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli K-12' 83333 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 2 sample 'Biological sequence' 408 645 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'Pseudoalteromonas sp. S983' 579572 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 3 sample 'Biological sequence' 646 1258 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'Pseudoalteromonas sp. S983' 579572 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 2 1 sample 1 145 'Pseudoalteromonas sp. S983' ? 579572 ? 3 1 sample 1 90 'Pseudoalteromonas sp. S983' ? 579572 ? 4 1 sample 1 54 'Pseudoalteromonas sp. S983' ? 579572 ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 ATP non-polymer . "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O13 P3' 507.181 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 G 1 -27 ? ? ? 1 . n A 1 2 U 2 -26 ? ? ? 1 . n A 1 3 G 3 -25 ? ? ? 1 . n A 1 4 A 4 -24 ? ? ? 1 . n A 1 5 C 5 -23 ? ? ? 1 . n A 1 6 C 6 -22 ? ? ? 1 . n A 1 7 U 7 -21 ? ? ? 1 . n A 1 8 G 8 -20 ? ? ? 1 . n A 1 9 C 9 -19 ? ? ? 1 . n A 1 10 C 10 -18 ? ? ? 1 . n A 1 11 G 11 -17 ? ? ? 1 . n A 1 12 U 12 -16 ? ? ? 1 . n A 1 13 A 13 -15 ? ? ? 1 . n A 1 14 U 14 -14 ? ? ? 1 . n A 1 15 A 15 -13 ? ? ? 1 . n A 1 16 G 16 -12 ? ? ? 1 . n A 1 17 G 17 -11 ? ? ? 1 . n A 1 18 C 18 -10 ? ? ? 1 . n A 1 19 A 19 -9 ? ? ? 1 . n A 1 20 G 20 -8 ? ? ? 1 . n A 1 21 C 21 -7 -7 C C 1 . n A 1 22 U 22 -6 -6 U U 1 . n A 1 23 G 23 -5 -5 G G 1 . n A 1 24 A 24 -4 -4 A A 1 . n A 1 25 A 25 -3 -3 A A 1 . n A 1 26 A 26 -2 -2 A A 1 . n A 1 27 A 27 -1 -1 A A 1 . n A 1 28 U 28 0 0 U U 1 . n A 1 29 A 29 1 1 A A 1 . n A 1 30 C 30 2 2 C C 1 . n A 1 31 A 31 3 3 A A 1 . n A 1 32 G 32 4 4 G G 1 . n A 1 33 U 33 5 5 U U 1 . n A 1 34 G 34 6 6 G G 1 . n A 1 35 G 35 7 7 G G 1 . n A 1 36 G 36 8 8 G G 1 . n A 1 37 G 37 9 9 G G 1 . n A 1 38 C 38 10 10 C C 1 . n A 1 39 C 39 11 11 C C 1 . n A 1 40 A 40 12 12 A A 1 . n A 1 41 C 41 13 13 C C 1 . n A 1 42 U 42 14 14 U U 1 . n A 1 43 A 43 15 15 A A 1 . n A 1 44 G 44 16 16 G G 1 . n A 1 45 G 45 17 17 G G 1 . n A 1 46 G 46 18 18 G G 1 . n A 1 47 A 47 19 19 A A 1 . n A 1 48 C 48 20 20 C C 1 . n A 1 49 A 49 21 21 A A 1 . n A 1 50 G 50 22 22 G G 1 . n A 1 51 G 51 23 23 G G 1 . n A 1 52 A 52 24 24 A A 1 . n A 1 53 U 53 25 25 U U 1 . n A 1 54 U 54 26 26 U U 1 . n A 1 55 G 55 27 27 G G 1 . n A 1 56 G 56 28 28 G G 1 . n A 1 57 U 57 29 29 U U 1 . n A 1 58 G 58 30 30 G G 1 . n A 1 59 A 59 31 31 A A 1 . n A 1 60 C 60 32 32 C C 1 . n A 1 61 G 61 33 33 G G 1 . n A 1 62 U 62 34 34 U U 1 . n A 1 63 G 63 35 35 G G 1 . n A 1 64 A 64 36 36 A A 1 . n A 1 65 C 65 37 37 C C 1 . n A 1 66 C 66 38 38 C C 1 . n A 1 67 U 67 39 39 U U 1 . n A 1 68 G 68 40 40 G G 1 . n A 1 69 C 69 41 41 C C 1 . n A 1 70 C 70 42 42 C C 1 . n A 1 71 G 71 43 43 G G 1 . n A 1 72 U 72 44 44 U U 1 . n A 1 73 A 73 45 45 A A 1 . n A 1 74 U 74 46 46 U U 1 . n A 1 75 A 75 47 47 A A 1 . n A 1 76 G 76 48 48 G G 1 . n A 1 77 G 77 49 49 G G 1 . n A 1 78 C 78 50 50 C C 1 . n A 1 79 A 79 51 51 A A 1 . n A 1 80 G 80 52 52 G G 1 . n A 1 81 C 81 53 ? 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ASP a 273 PHE a 277 5 ? 5 HELX_P HELX_P253 BC1 SER FA 685 ? LEU FA 706 ? SER a 278 LEU a 299 1 ? 22 HELX_P HELX_P254 BC2 THR FA 711 ? PHE FA 723 ? THR a 304 PHE a 316 1 ? 13 HELX_P HELX_P255 BC3 ASN FA 732 ? SER FA 746 ? ASN a 325 SER a 339 1 ? 15 HELX_P HELX_P256 BC4 ASP FA 749 ? ALA FA 754 ? ASP a 342 ALA a 347 5 ? 6 HELX_P HELX_P257 BC5 ASP FA 770 ? LEU FA 782 ? ASP a 363 LEU a 375 1 ? 13 HELX_P HELX_P258 BC6 THR FA 788 ? ILE FA 807 ? THR a 381 ILE a 400 1 ? 20 HELX_P HELX_P259 BC7 SER FA 816 ? ALA FA 826 ? SER a 409 ALA a 419 1 ? 11 HELX_P HELX_P260 BC8 PRO FA 828 ? HIS FA 837 ? PRO a 421 HIS a 430 1 ? 10 HELX_P HELX_P261 BC9 GLY FA 838 ? PHE FA 846 ? GLY a 431 PHE a 439 1 ? 9 HELX_P HELX_P262 BD1 SER FA 909 ? LYS FA 922 ? SER a 502 LYS a 515 1 ? 14 HELX_P HELX_P263 BD2 SER FA 956 ? ALA FA 966 ? SER a 549 ALA a 559 1 ? 11 HELX_P HELX_P264 BD3 LYS FA 977 ? LEU FA 980 ? LYS a 570 LEU a 573 5 ? 4 HELX_P HELX_P265 BD4 LYS FA 981 ? PHE FA 995 ? 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MG ? ? 6 DT -2 a MG 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? ? metalc10 metalc ? ? F DT 2 "O5'" ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? 6 DT -2 a MG 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? ? metalc11 metalc ? ? G DG 90 "O3'" ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? 7 DG 76 b MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? ? metalc12 metalc ? ? R SER 59 OG ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? K SER 59 K MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? ? metalc13 metalc ? ? LA ATP . O2G ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? K ATP 401 K MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? ? metalc14 metalc ? ? LA ATP . O1B ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? K ATP 401 K MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? ? metalc15 metalc ? ? LA ATP . O3B ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? K ATP 401 K MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.698 ? ? metalc16 metalc ? ? LA ATP . O2A ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? K ATP 401 K MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.971 ? ? metalc17 metalc ? ? LA ATP . O3A ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? K ATP 401 K MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? ? metalc18 metalc ? ? S SER 59 OG ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? 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M ATP 401 M MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? ? metalc28 metalc ? ? PA ATP . O3B ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? M ATP 401 M MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? ? metalc29 metalc ? ? PA ATP . O3A ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? M ATP 401 M MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.540 ? ? metalc30 metalc ? ? U SER 59 OG ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? N SER 59 N MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? ? metalc31 metalc ? ? RA ATP . O2G ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? N ATP 401 N MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? ? metalc32 metalc ? ? RA ATP . O3G ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? N ATP 401 N MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? ? metalc33 metalc ? ? RA ATP . O1B ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? N ATP 401 N MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.460 ? ? metalc34 metalc ? ? RA ATP . O3B ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? N ATP 401 N MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? ? metalc35 metalc ? ? RA ATP . O3A ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? N ATP 401 N MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? ? metalc36 metalc ? ? V SER 59 OG ? ? ? 1_555 UA MG . MG ? ? O SER 59 O MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? ? metalc37 metalc ? ? TA ATP . O2G ? ? ? 1_555 UA MG . MG ? ? O ATP 401 O MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? metalc38 metalc ? ? TA ATP . O3G ? ? ? 1_555 UA MG . MG ? ? O ATP 401 O MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? ? metalc39 metalc ? ? W SER 59 OG ? ? ? 1_555 WA MG . MG ? ? P SER 59 P MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? ? metalc40 metalc ? ? VA ATP . O2G ? ? ? 1_555 WA MG . MG ? ? P ATP 401 P MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? ? metalc41 metalc ? ? VA ATP . O1B ? ? ? 1_555 WA MG . MG ? ? P ATP 401 P MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? ? metalc42 metalc ? ? VA ATP . O3B ? ? ? 1_555 WA MG . MG ? ? P ATP 401 P MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.797 ? ? metalc43 metalc ? ? VA ATP . O2A ? ? ? 1_555 WA MG . MG ? ? P ATP 401 P MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? ? metalc44 metalc ? ? VA ATP . O3A ? ? ? 1_555 WA MG . MG ? ? P ATP 401 P MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? ? metalc45 metalc ? ? X SER 59 OG ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? Q SER 59 Q MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? ? metalc46 metalc ? ? XA ATP . O2G ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? Q ATP 401 Q MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? ? metalc47 metalc ? ? XA ATP . O3G ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? Q ATP 401 Q MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? ? metalc48 metalc ? ? XA ATP . O1B ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? Q ATP 401 Q MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? metalc49 metalc ? ? XA ATP . O3B ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? Q ATP 401 Q MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? ? metalc50 metalc ? ? XA ATP . O3A ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? Q ATP 401 Q MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.690 ? ? metalc51 metalc ? ? FA ASP 478 OD2 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? a ASP 71 a MG 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? ? metalc52 metalc ? ? FA GLU 492 OE2 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? a GLU 85 a MG 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? ? metalc53 metalc ? ? FA TYR 493 O ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? a TYR 86 a MG 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? ? metalc54 metalc ? ? FA LYS 494 NZ ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? a LYS 87 a MG 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? ? metalc55 metalc ? ? FA ASP 865 OD1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? a ASP 458 a MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? ? metalc56 metalc ? ? FA ASP 865 OD2 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? a ASP 458 a MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.908 ? ? metalc57 metalc ? ? FA ASP 949 OD2 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? a ASP 542 a MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? ? metalc58 metalc ? ? GA ASP 478 OD1 ? ? ? 1_555 BB MG . MG ? ? b ASP 71 b MG 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? ? metalc59 metalc ? ? GA ASP 478 OD2 ? ? ? 1_555 BB MG . MG ? ? b ASP 71 b MG 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? ? metalc60 metalc ? ? GA GLU 492 OE2 ? ? ? 1_555 BB MG . MG ? ? b GLU 85 b MG 1000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.420 ? ? metalc61 metalc ? ? GA ASP 865 OD2 ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? b ASP 458 b MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? ? metalc62 metalc ? ? GA ASP 949 OD2 ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? b ASP 542 b MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.156 ? ? hydrog1 hydrog ? ? 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A C 38 N4 ? ? ? 1_555 B DG 122 O6 ? ? 1 C 10 2 DG -10 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-DG PAIR' ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A C 41 N3 ? ? ? 1_555 B DG 119 N1 ? ? 1 C 13 2 DG -13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A C 41 N4 ? ? ? 1_555 B DG 119 O6 ? ? 1 C 13 2 DG -13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A C 41 O2 ? ? ? 1_555 B DG 119 N2 ? ? 1 C 13 2 DG -13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A U 42 N3 ? ? ? 1_555 B DA 118 N1 ? ? 1 U 14 2 DA -14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A U 42 O4 ? ? ? 1_555 B DA 118 N6 ? ? 1 U 14 2 DA -14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A A 43 N1 ? ? ? 1_555 B DT 117 N3 ? ? 1 A 15 2 DT -15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A A 43 N6 ? ? ? 1_555 B DT 117 O4 ? ? 1 A 15 2 DT -15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A G 44 N1 ? ? ? 1_555 B DC 116 N3 ? ? 1 G 16 2 DC -16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? 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A C 48 O2 ? ? ? 1_555 B DG 112 N2 ? ? 1 C 20 2 DG -20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A A 49 N1 ? ? ? 1_555 B DT 111 N3 ? ? 1 A 21 2 DT -21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A A 49 N6 ? ? ? 1_555 B DT 111 O4 ? ? 1 A 21 2 DT -21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A G 50 N1 ? ? ? 1_555 B DC 110 N3 ? ? 1 G 22 2 DC -22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A G 50 N2 ? ? ? 1_555 B DC 110 O2 ? ? 1 G 22 2 DC -22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A G 50 O6 ? ? ? 1_555 B DC 110 N4 ? ? 1 G 22 2 DC -22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A G 51 N1 ? ? ? 1_555 B DC 109 N3 ? ? 1 G 23 2 DC -23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? A G 51 N2 ? ? ? 1_555 B DC 109 O2 ? ? 1 G 23 2 DC -23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? A G 51 O6 ? ? ? 1_555 B DC 109 N4 ? ? 1 G 23 2 DC -23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog185 hydrog ? ? B DC 67 N4 ? ? ? 1_555 C DG 79 O6 ? ? 2 DC -65 3 DG 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog186 hydrog ? ? B DC 67 O2 ? ? ? 1_555 C DG 79 N2 ? ? 2 DC -65 3 DG 65 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog187 hydrog ? ? B DC 68 N3 ? ? ? 1_555 C DG 78 N1 ? ? 2 DC -64 3 DG 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog188 hydrog ? ? B DC 68 N4 ? ? ? 1_555 C DG 78 O6 ? ? 2 DC -64 3 DG 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog189 hydrog ? ? B DC 68 O2 ? ? ? 1_555 C DG 78 N2 ? ? 2 DC -64 3 DG 64 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog190 hydrog ? ? B DT 69 N3 ? ? ? 1_555 C DA 77 N1 ? ? 2 DT -63 3 DA 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog191 hydrog ? ? B DT 69 O4 ? ? ? 1_555 C DA 77 N6 ? ? 2 DT -63 3 DA 63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog192 hydrog ? ? B DT 70 N3 ? ? ? 1_555 C DA 76 N1 ? ? 2 DT -62 3 DA 62 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog193 hydrog ? ? 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sing N N 548 PHE N H sing N N 549 PHE N H2 sing N N 550 PHE CA C sing N N 551 PHE CA CB sing N N 552 PHE CA HA sing N N 553 PHE C O doub N N 554 PHE C OXT sing N N 555 PHE CB CG sing N N 556 PHE CB HB2 sing N N 557 PHE CB HB3 sing N N 558 PHE CG CD1 doub Y N 559 PHE CG CD2 sing Y N 560 PHE CD1 CE1 sing Y N 561 PHE CD1 HD1 sing N N 562 PHE CD2 CE2 doub Y N 563 PHE CD2 HD2 sing N N 564 PHE CE1 CZ doub Y N 565 PHE CE1 HE1 sing N N 566 PHE CE2 CZ sing Y N 567 PHE CE2 HE2 sing N N 568 PHE CZ HZ sing N N 569 PHE OXT HXT sing N N 570 PRO N CA sing N N 571 PRO N CD sing N N 572 PRO N H sing N N 573 PRO CA C sing N N 574 PRO CA CB sing N N 575 PRO CA HA sing N N 576 PRO C O doub N N 577 PRO C OXT sing N N 578 PRO CB CG sing N N 579 PRO CB HB2 sing N N 580 PRO CB HB3 sing N N 581 PRO CG CD sing N N 582 PRO CG HG2 sing N N 583 PRO CG HG3 sing N N 584 PRO CD HD2 sing N N 585 PRO CD HD3 sing N N 586 PRO OXT HXT sing N N 587 SER N CA sing N N 588 SER N H sing N N 589 SER N H2 sing N N 590 SER CA C sing N N 591 SER CA CB sing N N 592 SER CA HA sing N N 593 SER C O doub N N 594 SER C OXT sing N N 595 SER CB OG sing N N 596 SER CB HB2 sing N N 597 SER CB HB3 sing N N 598 SER OG HG sing N N 599 SER OXT HXT sing N N 600 THR N CA sing N N 601 THR N H sing N N 602 THR N H2 sing N N 603 THR CA C sing N N 604 THR CA CB sing N N 605 THR CA HA sing N N 606 THR C O doub N N 607 THR C OXT sing N N 608 THR CB OG1 sing N N 609 THR CB CG2 sing N N 610 THR CB HB sing N N 611 THR OG1 HG1 sing N N 612 THR CG2 HG21 sing N N 613 THR CG2 HG22 sing N N 614 THR CG2 HG23 sing N N 615 THR OXT HXT sing N N 616 TRP N CA sing N N 617 TRP N H sing N N 618 TRP N H2 sing N N 619 TRP CA C sing N N 620 TRP CA CB sing N N 621 TRP CA HA sing N N 622 TRP C O doub N N 623 TRP C OXT sing N N 624 TRP CB CG sing N N 625 TRP CB HB2 sing N N 626 TRP CB HB3 sing N N 627 TRP CG CD1 doub Y N 628 TRP CG CD2 sing Y N 629 TRP CD1 NE1 sing Y N 630 TRP CD1 HD1 sing N N 631 TRP CD2 CE2 doub Y N 632 TRP CD2 CE3 sing Y N 633 TRP NE1 CE2 sing Y N 634 TRP NE1 HE1 sing N N 635 TRP CE2 CZ2 sing Y N 636 TRP CE3 CZ3 doub Y N 637 TRP CE3 HE3 sing N N 638 TRP CZ2 CH2 doub Y N 639 TRP CZ2 HZ2 sing N N 640 TRP CZ3 CH2 sing Y N 641 TRP CZ3 HZ3 sing N N 642 TRP CH2 HH2 sing N N 643 TRP OXT HXT sing N N 644 TYR N CA sing N N 645 TYR N H sing N N 646 TYR N H2 sing N N 647 TYR CA C sing N N 648 TYR CA CB sing N N 649 TYR CA HA sing N N 650 TYR C O doub N N 651 TYR C OXT sing N N 652 TYR CB CG sing N N 653 TYR CB HB2 sing N N 654 TYR CB HB3 sing N N 655 TYR CG CD1 doub Y N 656 TYR CG CD2 sing Y N 657 TYR CD1 CE1 sing Y N 658 TYR CD1 HD1 sing N N 659 TYR CD2 CE2 doub Y N 660 TYR CD2 HD2 sing N N 661 TYR CE1 CZ doub Y N 662 TYR CE1 HE1 sing N N 663 TYR CE2 CZ sing Y N 664 TYR CE2 HE2 sing N N 665 TYR CZ OH sing N N 666 TYR OH HH sing N N 667 TYR OXT HXT sing N N 668 U OP3 P sing N N 669 U OP3 HOP3 sing N N 670 U P OP1 doub N N 671 U P OP2 sing N N 672 U P "O5'" sing N N 673 U OP2 HOP2 sing N N 674 U "O5'" "C5'" sing N N 675 U "C5'" "C4'" sing N N 676 U "C5'" "H5'" sing N N 677 U "C5'" "H5''" sing N N 678 U "C4'" "O4'" sing N N 679 U "C4'" "C3'" sing N N 680 U "C4'" "H4'" sing N N 681 U "O4'" "C1'" sing N N 682 U "C3'" "O3'" sing N N 683 U "C3'" "C2'" sing N N 684 U "C3'" "H3'" sing N N 685 U "O3'" "HO3'" sing N N 686 U "C2'" "O2'" sing N N 687 U "C2'" "C1'" sing N N 688 U "C2'" "H2'" sing N N 689 U "O2'" "HO2'" sing N N 690 U "C1'" N1 sing N N 691 U "C1'" "H1'" sing N N 692 U N1 C2 sing N N 693 U N1 C6 sing N N 694 U C2 O2 doub N N 695 U C2 N3 sing N N 696 U N3 C4 sing N N 697 U N3 H3 sing N N 698 U C4 O4 doub N N 699 U C4 C5 sing N N 700 U C5 C6 doub N N 701 U C5 H5 sing N N 702 U C6 H6 sing N N 703 VAL N CA sing N N 704 VAL N H sing N N 705 VAL N H2 sing N N 706 VAL CA C sing N N 707 VAL CA CB sing N N 708 VAL CA HA sing N N 709 VAL C O doub N N 710 VAL C OXT sing N N 711 VAL CB CG1 sing N N 712 VAL CB CG2 sing N N 713 VAL CB HB sing N N 714 VAL CG1 HG11 sing N N 715 VAL CG1 HG12 sing N N 716 VAL CG1 HG13 sing N N 717 VAL CG2 HG21 sing N N 718 VAL CG2 HG22 sing N N 719 VAL CG2 HG23 sing N N 720 VAL OXT HXT sing N N 721 # _em_admin.current_status REL _em_admin.deposition_date 2026-04-23 _em_admin.deposition_site PDBE _em_admin.entry_id 30GA _em_admin.last_update 2026-06-17 _em_admin.map_release_date 2026-06-17 _em_admin.title 'Cryo-EM structure of the PseCascade-TniQ-TnsC-TnsAB holocomplex' # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.id _em_buffer_component.name 1 20 mM C8H17KN2O4S 1 'HEPES potassium salt' 1 10 mM MgCl2 2 'magnesium chloride' 1 300 mM KCl 3 'potassium chloride' 1 1 mM C4H10O2S2 4 dithiothreitol 1 0.025 % C58H114O26 5 'polysorbate 20 (Tween 20)' 1 1 mM C10H14N5Na2O13P3 6 ;adenosin-5'-triphosphate disodium salt ; 1 10 mM C12H22O11 7 maltose # _em_ctf_correction.details ? _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 1.2 # _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 579572 _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Pseudoalteromonas sp. S983' _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? _em_entity_assembly_naturalsource.details ? # _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 469008 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Escherichia coli BL21(DE3)' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.details ? _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 # _em_image_recording.average_exposure_time 1.25 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 62.82 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 (6k x 4k)' _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 2 _em_image_recording.num_real_images 43220 # _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 1919871 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.category _em_software.details _em_software.id _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id _em_software.name _em_software.version _em_software.reference_DOI 'PARTICLE SELECTION' 'Blob Picker was used for particle selection' 1 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? 'IMAGE ACQUISITION' ? 2 ? ? 1 EPU 3.9 ? MASKING ? 3 ? ? ? ? ? ? 'CTF CORRECTION' 'Patch CTF Estimation was used for CTF correction' 4 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? 'LAYERLINE INDEXING' ? 5 ? ? ? ? ? ? 'DIFFRACTION INDEXING' ? 6 ? ? ? ? ? ? 'MODEL FITTING' ? 7 ? 1 ? Coot 0.9.4 ? OTHER ? 8 ? ? ? ? ? ? 'MODEL REFINEMENT' ? 9 ? 1 ? PHENIX 2.0_5936 ? 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' 'Ab-Initio Reconstruction was used for initial angular assignment' 10 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? 'FINAL EULER ASSIGNMENT' 'Non-Uniform Refinement was used fo final angular assignment' 11 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? CLASSIFICATION 'Heterogeneous refinement was used for final classification' 12 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? # _em_specimen.concentration 1.118 _em_specimen.details ;The sample was prepared by co-precipitation, using His-MBP-tagged TnsAB bound to the DNA substrate as bait to capture Cascade-TniQ and TnsC. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 30GA 'double helix' 30GA 'a-form double helix' 30GA 'b-form double helix' 30GA 'hairpin loop' 30GA 'mismatched base pair' 30GA 'internal loop' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A A 29 1_555 B DT 131 1_555 0.284 -0.401 -1.453 -9.888 -0.950 -3.589 1 1_A1:DT-1_2 1 1 ? 2 -1 ? 20 1 1 A C 30 1_555 B DG 130 1_555 0.161 -0.449 -1.242 -6.617 7.868 -3.117 2 1_C2:DG-2_2 1 2 ? 2 -2 ? 19 1 1 A A 31 1_555 B DT 129 1_555 0.082 -0.157 -0.652 7.476 3.784 -0.887 3 1_A3:DT-3_2 1 3 ? 2 -3 ? 20 1 1 A G 32 1_555 B DC 128 1_555 -0.209 -0.195 -0.237 4.555 17.206 0.408 4 1_G4:DC-4_2 1 4 ? 2 -4 ? 19 1 1 A U 33 1_555 B DA 127 1_555 -0.189 -0.106 -0.289 18.034 24.062 -2.192 5 1_U5:DA-5_2 1 5 ? 2 -5 ? 20 1 1 A G 35 1_555 B DC 125 1_555 -0.047 -0.114 -0.835 -23.307 13.664 -0.924 6 1_G7:DC-7_2 1 7 ? 2 -7 ? 19 1 1 A G 37 1_555 B DC 123 1_555 -0.231 -0.212 1.044 15.774 8.648 3.467 7 1_G9:DC-9_2 1 9 ? 2 -9 ? 19 1 1 A C 38 1_555 B DG 122 1_555 -0.349 -4.920 2.240 -34.555 0.236 83.775 8 1_C10:DG-10_2 1 10 ? 2 -10 ? ? ? 1 A C 41 1_555 B DG 119 1_555 0.277 -0.111 0.043 -10.206 16.470 0.450 9 1_C13:DG-13_2 1 13 ? 2 -13 ? 19 1 1 A U 42 1_555 B DA 118 1_555 0.054 -0.183 0.381 -3.267 21.139 6.915 10 1_U14:DA-14_2 1 14 ? 2 -14 ? 20 1 1 A A 43 1_555 B DT 117 1_555 0.103 -0.152 0.792 11.267 2.812 3.001 11 1_A15:DT-15_2 1 15 ? 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