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N GLN 764 OE1 151 1 Y 1 C GLN 764 ? NE2 ? N GLN 764 NE2 152 1 Y 1 D GLU 194 ? CG ? O GLU 194 CG 153 1 Y 1 D GLU 194 ? CD ? O GLU 194 CD 154 1 Y 1 D GLU 194 ? OE1 ? O GLU 194 OE1 155 1 Y 1 D GLU 194 ? OE2 ? O GLU 194 OE2 156 1 Y 1 D GLU 196 ? CG ? O GLU 196 CG 157 1 Y 1 D GLU 196 ? CD ? O GLU 196 CD 158 1 Y 1 D GLU 196 ? OE1 ? O GLU 196 OE1 159 1 Y 1 D GLU 196 ? OE2 ? O GLU 196 OE2 160 1 Y 1 D MET 508 ? CG ? O MET 508 CG 161 1 Y 1 D MET 508 ? SD ? O MET 508 SD 162 1 Y 1 D MET 508 ? CE ? O MET 508 CE 163 1 Y 1 D GLU 554 ? CG ? O GLU 554 CG 164 1 Y 1 D GLU 554 ? CD ? O GLU 554 CD 165 1 Y 1 D GLU 554 ? OE1 ? O GLU 554 OE1 166 1 Y 1 D GLU 554 ? OE2 ? O GLU 554 OE2 167 1 Y 1 D ILE 590 ? CG1 ? O ILE 590 CG1 168 1 Y 1 D ILE 590 ? CG2 ? O ILE 590 CG2 169 1 Y 1 D ILE 590 ? CD1 ? O ILE 590 CD1 170 1 Y 1 D GLN 714 ? CG ? O GLN 714 CG 171 1 Y 1 D GLN 714 ? CD ? O GLN 714 CD 172 1 Y 1 D GLN 714 ? OE1 ? O GLN 714 OE1 173 1 Y 1 D GLN 714 ? NE2 ? O GLN 714 NE2 174 1 Y 1 D GLN 763 ? CG ? O GLN 763 CG 175 1 Y 1 D GLN 763 ? CD ? O GLN 763 CD 176 1 Y 1 D GLN 763 ? OE1 ? O GLN 763 OE1 177 1 Y 1 D GLN 763 ? NE2 ? O GLN 763 NE2 178 1 Y 1 D GLN 764 ? CG ? O GLN 764 CG 179 1 Y 1 D GLN 764 ? CD ? O GLN 764 CD 180 1 Y 1 D GLN 764 ? OE1 ? O GLN 764 OE1 181 1 Y 1 D GLN 764 ? NE2 ? O GLN 764 NE2 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 31OL _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 31OL _struct.title 'CryoEM structure of substrate engaged p97 in complex with Ufd1/Npl4 and Delta-N-FAF1' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 31OL _struct_keywords.text 'Complex, ATPase, Protein unfolding, Cell cycle, TRANSLOCASE' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSLOCASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 5 ? K N N 5 ? L N N 5 ? M N N 5 ? N N N 5 ? O N N 5 ? P N N 6 ? Q N N 7 ? R N N 8 ? S N N 6 ? T N N 7 ? U N N 8 ? V N N 7 ? W N N 6 ? X N N 7 ? Y N N 6 ? Z N N 7 ? AA N N 8 ? BA N N 7 ? CA N N 8 ? DA N N 7 ? EA N N 6 ? FA N N 7 ? GA N N 8 ? HA N N 6 ? IA N N 8 ? JA N N 6 ? KA N N 6 ? LA N N 8 ? MA N N 8 ? NA N N 6 ? OA N N 7 ? PA N N 8 ? QA N N 6 ? RA N N 7 ? SA N N 8 ? TA N N 6 ? UA N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP NPL4_HUMAN Q8TAT6 ? 1 ;MAESIIIRVQSPDGVKRITATKRETAATFLKKVAKEFGFQNNGFSVYINRNKTGEITASSNKSLNLLKIKHGDLLFLFPS SLAGPSSEMETSVPPGFKVFGAPNVVEDEIDQYLSKQDGKIYRSRDPQLCRHGPLGKCVHCVPLEPFDEDYLNHLEPPVK HMSFHAYIRKLTGGADKGKFVALENISCKIKSGCEGHLPWPNGICTKCQPSAITLNRQKYRHVDNIMFENHTVADRFLDF WRKTGNQHFGYLYGRYTEHKDIPLGIRAEVAAIYEPPQIGTQNSLELLEDPKAEVVDEIAAKLGLRKVGWIFTDLVSEDT RKGTVRYSRNKDTYFLSSEECITAGDFQNKHPNMCRLSPDGHFGSKFVTAVATGGPDNQVHFEGYQVSNQCMALVRDECL LPCKDAPELGYAKESSSEQYVPDVFYKDVDKFGNEITQLARPLPVEYLIIDITTTFPKDPVYTFSISQNPFPIENRDVLG ETQDFHSLATYLSQNTSSVFLDTISDFHLLLFLVTNEVMPLQDSISLLLEAVRTRNEELAQTWKRSEQWATIEQLCSTVG GQLPGLHEYGAVGGSTHTATAAMWACQHCTFMNQPGTGHCEMCSLPRT ; 1 2 UNP UBB_HUMAN P0CG47 ? 2 MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG 1 3 UNP FAF1_HUMAN Q9UNN5 ? 3 ;RKSPMMPENAENEGDALLQFTAEFSSRYGDCHPVFFIGSLEAAFQEAFYVKARDRKLLAIYLHHDESVLTNVFCSQMLCA ESIVSYLSQNFITWAWDLTKDSNRARFLTMCNRHFGSVVAQTIRTQKTDQFPLFLIIMGKRSSNEVLNVIQGNTTVDELM MRLMAAMEIFTAQQQEDIKDEDEREARENVKREQDEAYRLSLEADRAKREAHEREMAEQFRLEQIRKEQEEEREAIRLSL EQALPPEPKEENAEPVSKLRIRTPSGEFLERRFLASNKLQIVFDFVASKGFPWDEYKLLSTFPRRDVTQLDPNKSLLEVK LFPQETLFLEAKE ; 318 4 UNP UFD1_HUMAN Q92890 ? 4 ;MFSFNMFDHPIPRVFQNRFSTQYRCFSVSMLAGPNDRSDVEKGGKIIMPPSALDQLSRLNITYPMLFKLTNKNSDRMTHC GVLEFVADEGICYLPHWMMQNLLLEEGGLVQVESVNLQVATYSKFQPQSPDFLDITNPKAVLENALRNFACLTTGDVIAI NYNEKIYELRVMETKPDKAVSIIECDMNVDFDAPLGYKEPERQVQHEESTEGEADHSGYAGELGFRAFSGSGNRLDGKKK GVEPSPSPIKPGDIKRGIPNYEFKLGKITFIRNSRPLVKKVEEDEAGGRFVAFSGEGQSLRKKGRKP ; 1 5 UNP TERA_HUMAN P55072 ? 5 ;MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDE KIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRA VEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRG ILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEV ERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVA NETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIG GLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVR EIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLD QLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAM EVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDN DDDLYG ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 31OL G 1 ? 608 ? Q8TAT6 1 ? 608 ? 1 608 2 2 31OL I 1 ? 76 ? P0CG47 1 ? 76 ? 1 76 3 2 31OL J 1 ? 76 ? P0CG47 1 ? 76 ? 1 76 4 2 31OL K 1 ? 76 ? P0CG47 1 ? 76 ? 1 76 5 2 31OL N 1 ? 76 ? P0CG47 1 ? 76 ? 1 76 6 2 31OL L 1 ? 76 ? P0CG47 1 ? 76 ? 1 76 7 2 31OL M 1 ? 76 ? P0CG47 1 ? 76 ? 1 76 8 3 31OL T 1 ? 333 ? Q9UNN5 318 ? 650 ? 318 650 9 4 31OL H 1 ? 307 ? Q92890 1 ? 307 ? 1 307 10 5 31OL E 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 11 5 31OL B 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 12 5 31OL A 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 13 5 31OL F 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 14 5 31OL C 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 15 5 31OL D 1 ? 806 ? P55072 1 ? 806 ? 1 806 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 10 31OL GLU E 232 ? UNP P55072 ALA 232 'engineered mutation' 232 1 10 31OL GLN E 578 ? UNP P55072 GLU 578 'engineered mutation' 578 2 11 31OL GLU B 232 ? UNP P55072 ALA 232 'engineered mutation' 232 3 11 31OL GLN B 578 ? UNP P55072 GLU 578 'engineered mutation' 578 4 12 31OL GLU A 232 ? UNP P55072 ALA 232 'engineered mutation' 232 5 12 31OL GLN A 578 ? UNP P55072 GLU 578 'engineered mutation' 578 6 13 31OL GLU F 232 ? UNP P55072 ALA 232 'engineered mutation' 232 7 13 31OL GLN F 578 ? UNP P55072 GLU 578 'engineered mutation' 578 8 14 31OL GLU C 232 ? UNP P55072 ALA 232 'engineered mutation' 232 9 14 31OL GLN C 578 ? UNP P55072 GLU 578 'engineered mutation' 578 10 15 31OL GLU D 232 ? UNP P55072 ALA 232 'engineered mutation' 232 11 15 31OL GLN D 578 ? UNP P55072 GLU 578 'engineered mutation' 578 12 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 15 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 25 ? GLY A 38 ? THR G 25 GLY G 38 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 108 ? GLN A 117 ? ASP G 108 GLN G 117 1 ? 10 HELX_P HELX_P3 AA3 GLU A 149 ? LEU A 155 ? GLU G 149 LEU G 155 1 ? 7 HELX_P HELX_P4 AA4 PHE A 164 ? GLY A 173 ? PHE G 164 GLY G 173 1 ? 10 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY A 174 ? LYS A 177 ? GLY G 174 LYS G 177 5 ? 4 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN A 230 ? GLY A 245 ? ASN G 230 GLY G 245 1 ? 16 HELX_P HELX_P7 AA7 LYS A 292 ? LEU A 303 ? LYS G 292 LEU G 303 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 337 ? HIS A 351 ? SER G 337 HIS G 351 1 ? 15 HELX_P HELX_P9 AA9 SER A 388 ? GLU A 398 ? SER G 388 GLU G 398 1 ? 11 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN A 475 ? LEU A 479 ? ASN G 475 LEU G 479 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 ASP A 484 ? ASN A 495 ? ASP G 484 ASN G 495 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 AB3 VAL A 499 ? SER A 505 ? VAL G 499 SER G 505 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP A 506 ? ASN A 516 ? ASP G 506 ASN G 516 1 ? 11 HELX_P HELX_P14 AB5 SER A 524 ? ARG A 535 ? SER G 524 ARG G 535 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 AB6 ASN A 536 ? LYS A 544 ? 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A ADP 907 A MG 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? ? metalc38 metalc ? ? HA ADP . O1A ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A ADP 907 A MG 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.904 ? ? metalc39 metalc ? ? HA ADP . O2A ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A ADP 907 A MG 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? ? metalc40 metalc ? ? HA ADP . O3A ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A ADP 907 A MG 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.820 ? ? metalc41 metalc ? ? M LYS 251 NZ ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? F LYS 251 F MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.952 ? ? metalc42 metalc ? ? KA ADP . O1B ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? F ADP 902 F MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? ? metalc43 metalc ? ? KA ADP . O2B ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? F ADP 902 F MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.916 ? ? metalc44 metalc ? ? KA ADP . O3B ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? F ADP 902 F MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.904 ? ? metalc45 metalc ? ? N THR 525 OG1 ? ? ? 1_555 PA MG . MG ? ? C THR 525 C MG 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? metalc46 metalc ? ? N ARG 635 NH2 ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? 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