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_refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean 102.07 _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 35ZV _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.correlation_coeff_I_to_Fcsqd_work ? _refine.correlation_coeff_I_to_Fcsqd_free ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.5665 ? 8785 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0441 ? 997 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0032 ? 1132 ? f_plane_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.1692 ? 893 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? # _struct.entry_id 35ZV _struct.title 'yeast 26S proteasome base assembly intermediate, Rpn14-Rpt6' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 35ZV _struct_keywords.text 'proteasome, chaperone, base, 26S, AAA, motor, assembly, MOTOR PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MOTOR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP RPN1_YEAST P38764 ? 1 ;MVDESDKKQQTIDEQSQISPEKQTPNKKDKKKEEEEQLSEEDAKLKTDLELLVERLKEDDSSLYEASLNALKESIKNSTS SMTAVPKPLKFLRPTYPDLCSIYDKWTDPNLKSSLADVLSILAMTYSENGKHDSLRYRLLSDVSDFEGWGHEYIRHLALE IGEVYNDQVEKDAEDETSSDGSKSDGSAATSGFEFSKEDTLRLCLDIVPYFLKHNGEEDAVDLLLEIESIDKLPQFVDEN TFQRVCQYMVACVPLLPPPEDVAFLKTAYSIYLSQNELTDAIALAVRLGEEDMIRSVFDATSDPVMHKQLAYILAAQKTS FEYEGVQDIIGNGKLSEHFLYLAKELNLTGPKVPEDIYKSHLDNSKSVFSSAGLDSAQQNLASSFVNGFLNLGYCNDKLI VDNDNWVYKTKGDGMTSAVASIGSIYQWNLDGLQQLDKYLYVDEPEVKAGALLGIGISASGVHDGEVEPALLLLQDYVTN PDTKISSAAILGLGIAFAGSKNDEVLGLLLPIAASTDLPIETAAMASLALAHVFVGTCNGDITTSIMDNFLERTAIELKT DWVRFLALALGILYMGQGEQVDDVLETISAIEHPMTSAIEVLVGSCAYTGTGDVLLIQDLLHRLTPKNVKGEEDADEEET AEGQTNSISDFLGEQVNEPTKNEEAEIEVDEMEVDAEGEEVEVKAEITEKKNGESLEGEEIKSEEKKGKSSDKDATTDGK NDDEEEEKEAGIVDELAYAVLGIALIALGEDIGKEMSLRHFGHLMHYGNEHIRRMVPLAMGIVSVSDPQMKVFDTLTRFS HDADLEVSMNSIFAMGLCGAGTNNARLAQLLRQLASYYSREQDALFITRLAQGLLHLGKGTMTMDVFNDAHVLNKVTLAS ILTTAVGLVSPSFMLKHHQLFYMLNAGIRPKFILALNDEGEPIKVNVRVGQAVETVGQAGRPKKITGWITQSTPVLLNHG ERAELETDEYISYTSHIEGVVILKKNPDYREEE ; 1 2 UNP PRS8_YEAST Q01939 ? 2 ;MTAAVTSSNIVLETHESGIKPYFEQKIQETELKIRSKTENVRRLEAQRNALNDKVRFIKDELRLLQEPGSYVGEVIKIVS DKKVLVKVQPEGKYIVDVAKDINVKDLKASQRVCLRSDSYMLHKVLENKADPLVSLMMVEKVPDSTYDMVGGLTKQIKEI KEVIELPVKHPELFESLGIAQPKGVILYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCKFIRVSGAELVQKYIGEGSRMVRELFVMAREH APSIIFMDEIDSIGSTRVEGSGGGDSEVQRTMLELLNQLDGFETSKNIKIIMATNRLDILDPALLRPGRIDRKIEFPPPS VAARAEILRIHSRKMNLTRGINLRKVAEKMNGCSGADVKGVCTEAGMYALRERRIHVTQEDFELAVGKVMNKNQETAISV AKLFK ; 1 3 UNP PRS6B_YEAST P33298 ? 3 ;MEELGIVTPVEKAVEEKPAVKSYASLLAQLNGTVNNNSALSNVNSDIYFKLKKLEKEYELLTLQEDYIKDEQRHLKRELK RAQEEVKRIQSVPLVIGQFLEPIDQNTGIVSSTTGMSYVVRILSTLDRELLKPSMSVALHRHSNALVDILPPDSDSSISV MGENEKPDVTYADVGGLDMQKQEIREAVELPLVQADLYEQIGIDPPRGVLLYGPPGTGKTMLVKAVANSTKAAFIRVNGS EFVHKYLGEGPRMVRDVFRLARENAPSIIFIDEVDSIATKRFDAQTGSDREVQRILIELLTQMDGFDQSTNVKVIMATNR ADTLDPALLRPGRLDRKIEFPSLRDRRERRLIFGTIASKMSLAPEADLDSLIIRNDSLSGAVIAAIMQEAGLRAVRKNRY VILQSDLEEAYATQVKTDNTVDKFDFYK ; 1 4 UNP RPN14_YEAST P53196 ? 4 ;MTKTITVAHIQYDFKAVLEENDENDDEFYINVDKNLNEIKEHKIVVLGNSRGVDAGKGNTFEKVGSHLYKARLDGHDFLF NTIIRDGSKMLKRADYTAVDTAKLQMRRFILGTTEGDIKVLDSNFNLQREIDQAHVSEITKLKFFPSGEALISSSQDMQL KIWSVKDGSNPRTLIGHRATVTDIAIIDRGRNVLSASLDGTIRLWECGTGTTIHTFNRKENPHDGVNSIALFVGTDRQLH EISTSKKNNLEFGTYGKYVIAGHVSGVITVHNVFSKEQTIQLPSKFTCSCNSLTVDGNNANYIYAGYENGMLAQWDLRSP ECPVGEFLINEGTPINNVYFAAGALFVSSGFDTSIKLDIISDPESERPAIEFETPTFLVSNDDEVSQFCYVSDDESNGEV LEVGKNNFCALYNLSNP ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 35ZV C 1 ? 993 ? P38764 1 ? 993 ? 1 993 2 2 35ZV I 1 ? 405 ? Q01939 1 ? 405 ? 1 405 3 3 35ZV J 1 ? 428 ? P33298 1 ? 428 ? 1 428 4 4 35ZV M 1 ? 417 ? P53196 1 ? 417 ? 1 417 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 40 ? GLU A 58 ? GLU C 40 GLU C 58 1 ? 19 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 60 ? SER A 62 ? ASP C 60 SER C 62 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 AA3 LEU A 63 ? ASN A 77 ? LEU C 63 ASN C 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P4 AA4 PRO A 88 ? ARG A 93 ? PRO C 88 ARG C 93 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 THR A 95 ? TRP A 106 ? THR C 95 TRP C 106 1 ? 12 HELX_P HELX_P6 AA6 ASP A 108 ? TYR A 126 ? ASP C 108 TYR C 126 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 AA7 HIS A 132 ? SER A 141 ? HIS C 132 SER C 141 1 ? 10 HELX_P HELX_P8 AA8 PHE A 146 ? TRP A 149 ? PHE C 146 TRP C 149 5 ? 4 HELX_P HELX_P9 AA9 GLY A 150 ? GLU A 170 ? GLY C 150 GLU C 170 1 ? 21 HELX_P HELX_P10 AB1 SER A 196 ? HIS A 214 ? SER C 196 HIS C 214 1 ? 19 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY A 216 ? ILE A 227 ? GLY C 216 ILE C 227 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 AB3 SER A 229 ? VAL A 237 ? SER C 229 VAL C 237 5 ? 9 HELX_P HELX_P13 AB4 THR B 146 ? VAL B 150 ? THR I 146 VAL I 150 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 LEU B 153 ? ILE B 164 ? LEU I 153 ILE I 164 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 AB6 ILE B 164 ? HIS B 170 ? 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SER M 88 LEU M 91 5 ? 4 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id ALA _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 241 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id B _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id ALA _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 241 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id I _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 242 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 B _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 242 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 I _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 0.09 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 7 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL B 139 ? 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