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? ? ? ? 13 ? ? ? 2 D 285 D 305 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 13 ? ? ? 1 A 311 A 331 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 14 ? ? ? 2 D 311 D 331 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 14 ? ? ? 1 A 349 A 361 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 15 ? ? ? 2 D 349 D 361 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 15 ? ? ? 1 A 365 A 380 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 16 ? ? ? 2 D 365 D 380 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 16 ? ? ? 1 A 390 A 404 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 17 ? ? ? 2 D 390 D 404 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 17 ? ? ? 1 A 428 A 453 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 18 ? ? ? 2 D 428 D 453 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 18 ? ? ? 1 A 456 A 473 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 19 ? ? ? 2 D 456 D 473 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 19 ? ? ? 1 A 498 A 519 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 20 ? ? ? 2 D 498 D 519 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 20 ? ? ? 1 A 529 A 540 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 21 ? ? ? 2 D 529 D 540 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 21 ? ? ? 1 A 546 A 560 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 22 ? ? ? 2 D 546 D 560 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 22 ? ? ? 1 A 568 A 583 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 23 ? ? ? 2 D 568 D 583 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 23 ? ? ? 1 A 596 A 614 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 24 ? ? ? 2 D 596 D 614 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 24 ? ? ? 1 A 623 A 635 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 25 ? ? ? 2 D 623 D 635 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 25 ? ? ? 1 A 642 A 658 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 26 ? ? ? 2 D 642 D 658 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 26 ? ? ? 1 A 661 A 691 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 27 ? ? ? 2 D 661 D 691 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 27 ? ? ? 1 A 715 A 733 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 28 ? ? ? 2 D 715 D 733 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 28 ? ? ? 1 A 765 A 787 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 29 ? ? ? 2 D 765 D 787 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 29 ? ? ? 1 A 832 A 852 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 30 ? ? ? 2 D 832 D 852 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 30 ? ? ? 1 A 867 A 878 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 31 ? ? ? 2 D 867 D 878 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 31 ? ? ? 1 A 884 A 901 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 32 ? ? ? 2 D 884 D 901 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 32 ? ? ? 1 A 911 A 937 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 33 ? ? ? 2 D 911 D 937 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 33 ? ? ? 1 A 952 A 978 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 34 ? ? ? 2 D 952 D 978 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 34 ? ? ? 1 A 1018 A 1035 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 35 ? ? ? 2 D 1018 D 1035 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 35 ? ? ? 1 A 1041 A 1059 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 36 ? ? ? 2 D 1041 D 1059 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 36 ? ? ? 1 A 1065 A 1081 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 37 ? ? ? 2 D 1065 D 1081 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 37 ? ? ? 1 A 1087 A 1102 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 38 ? ? ? 2 D 1087 D 1102 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 38 ? ? ? 1 A 1109 A 1119 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 39 ? ? ? 2 D 1109 D 1119 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 39 ? ? ? 1 A 1122 A 1136 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 40 ? ? ? 2 D 1122 D 1136 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 40 ? ? ? 1 A 1305 A 1317 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 41 ? ? ? 2 D 1305 D 1317 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 41 ? ? ? 1 B 7 B 176 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 42 ? ? ? 2 E 7 E 176 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 42 ? ? ? 1 C 1 C 63 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 43 ? ? ? 2 F 1 F 63 1 1 ? ? ? ? ? ? ? ? 43 ? ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? 6 ? 7 ? 8 ? 9 ? 10 ? 11 ? 12 ? 13 ? 14 ? 15 ? 16 ? 17 ? 18 ? 19 ? 20 ? 21 ? 22 ? 23 ? 24 ? 25 ? 26 ? 27 ? 28 ? 29 ? 30 ? 31 ? 32 ? 33 ? 34 ? 35 ? 36 ? 37 ? 38 ? 39 ? 40 ? 41 ? 42 ? 43 ? # _database_PDB_matrix.entry_id 3A6P _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 3A6P _struct.title 'Crystal structure of Exportin-5:RanGTP:pre-miRNA complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3A6P _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTEIN TRANSPORT/NUCLEAR PROTEIN/RNA' _struct_keywords.text ;EXPORTIN-5, PRE-MICRORNA, RANGTP, NUCLEAREXPORT, IMPORTIN-BETA FAMILY, Nucleus, Phosphoprotein, Protein transport, RNA-binding, RNA-mediated gene silencing, Transport, tRNA-binding, Cell cycle, Cell division, GTP-binding, Isopeptide bond, Mitosis, Nucleotide-binding, PROTEIN TRANSPORT-NUCLEAR PROTEIN-RNA COMPLEX ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 4 ? J N N 5 ? K N N 6 ? L N N 7 ? M N N 6 ? N N N 7 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP XPO5_HUMAN Q9HAV4 1 ;MAMDQVNALCEQLVKAVTVMMDPNSTQRYRLEALKFCEEFKEKCPICVPCGLRLAEKTQVAIVRHFGLQILEHVVKFRWN GMSRLEKVYLKNSVMELIANGTLNILEEENHIKDALSRIVVEMIKREWPQHWPDMLIELDTLSKQGETQTELVMFILLRL AEDVVTFQTLPPQRRRDIQQTLTQNMERIFSFLLNTLQENVNKYQQVKTDTSQESKAQANCRVGVAALNTLAGYIDWVSM SHITAENCKLLEILCLLLNEQELQLGAAECLLIAVSRKGKLEDRKPLMVLFGDVAMHYILSAAQTADGGGLVEKHYVFLK RLCQVLCALGNQLCALLGADSDVETPSNFGKYLESFLAFTTHPSQFLRSSTQMTWGALFRHEILSRDPLLLAIIPKYLRA SMTNLVKMGFPSKTDSPSCEYSRFDFDSDEDFNAFFNSSRAQQGEVMRLACRLDPKTSFQMAGEWLKYQLSTFLDAGSVN SCSAVGTGEGSLCSVFSPSFVQWEAMTLFLESVITQMFRTLNREEIPVNDGIELLQMVLNFDTKDPLILSCVLTNVSALF PFVTYRPEFLPQVFSKLFSSVTFETVEESKAPRTRAVRNVRRHACSSIIKMCRDYPQLVLPNFDMLYNHVKQLLSNELLL TQMEKCALMEALVLISNQFKNYERQKVFLEELMAPVASIWLSQDMHRVLSDVDAFIAYVGTDQKSCDPGLEDPCGLNRAR MSFCVYSILGVVKRTCWPTDLEEAKAGGFVVGYTSSGNPIFRNPCTEQILKLLDNLLALIRTHNTLYAPEMLAKMAEPFT KALDMLDAEKSAILGLPQPLLELNDSPVFKTVLERMQRFFSTLYENCFHILGKAGPSMQQDFYTVEDLATQLLSSAFVNL NNIPDYRLRPMLRVFVKPLVLFCPPEHYEALVSPILGPLFTYLHMRLSQKWQVINQRSLLCGEDEAADENPESQEMLEEQ LVRMLTREVMDLITVCCVSKKGADHSSAPPADGDDEEMMATEVTPSAMAELTDLGKCLMKHEDVCTALLITAFNSLAWKD TLSCQRTTSQLCWPLLKQVLSGTLLADAVTWLFTSVLKGLQMHGQHDGCMASLVHLAFQIYEALRPRYLEIRAVMEQIPE IQKDSLDQFDCKLLNPSLQKVADKRRKDQFKRLIAGCIGKPLGEQFRKEVHIKNLPSLFKKTKPMLETEVLDNDGGGLAT IFEP ; 1 ? 2 UNP RAN_CANFA P62825 3 ;MAAQGEPQVQFKLVLVGDGGTGKTTFVKRHLTGEFEKKYVATLGVEVHPLVFHTNRGPIKFNVWDTAGQEKFGGLRDGYY IQAQCAIIMFDVTSRVTYKNVPNWHRDLVRVCENIPIVLCGNKVDIKDRKVKAKSIVFHRKKNLQYYDISAKSNYNFEKP FLWLARKLIGDPNLEFVAMPALAPPEVVMDPALAAQYEHDLEVAQTTALPDEDDDL ; 1 ? 3 PDB 3A6P 3A6P 2 ? ? ? 4 PDB 3A6P 3A6P 4 ? ? ? 5 PDB 3A6P 3A6P 5 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3A6P A 1 ? 1204 ? Q9HAV4 1 ? 1204 ? 1 1204 2 2 3A6P C 1 ? 216 ? P62825 1 ? 216 ? 1 216 3 1 3A6P F 1 ? 1204 ? Q9HAV4 1 ? 1204 ? 1 1204 4 2 3A6P H 1 ? 216 ? P62825 1 ? 216 ? 1 216 5 3 3A6P B 1 ? 13 ? 3A6P 1305 ? 1317 ? 1305 1317 6 3 3A6P G 1 ? 13 ? 3A6P 1305 ? 1317 ? 1305 1317 7 4 3A6P D 1 ? 24 ? 3A6P 1 ? 24 ? 1 24 8 4 3A6P I 1 ? 24 ? 3A6P 1 ? 24 ? 1 24 9 5 3A6P E 1 ? 24 ? 3A6P 40 ? 63 ? 40 63 10 5 3A6P J 1 ? 24 ? 3A6P 40 ? 63 ? 40 63 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? pentameric 5 2 author_defined_assembly ? pentameric 5 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,E,K,L 2 1 F,G,H,I,J,M,N # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLN A 5 ? ASP A 22 ? GLN A 5 ASP A 22 1 ? 18 HELX_P HELX_P2 2 THR A 26 ? CYS A 44 ? THR A 26 CYS A 44 1 ? 19 HELX_P HELX_P3 3 ILE A 46 ? ALA A 55 ? ILE A 46 ALA A 55 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 4 VAL A 60 ? ARG A 78 ? VAL A 60 ARG A 78 1 ? 19 HELX_P HELX_P5 5 TRP A 79 ? MET A 82 ? TRP A 79 MET A 82 5 ? 4 HELX_P HELX_P6 6 SER A 83 ? GLY A 101 ? SER A 83 GLY A 101 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 7 GLU A 109 ? TRP A 128 ? GLU A 109 TRP A 128 1 ? 20 HELX_P HELX_P8 8 ASP A 134 ? GLN A 145 ? ASP A 134 GLN A 145 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 9 GLY A 146 ? THR A 166 ? GLY A 146 THR A 166 1 ? 21 HELX_P HELX_P10 10 PRO A 171 ? ASN A 185 ? PRO A 171 ASN A 185 1 ? 15 HELX_P HELX_P11 11 ASN A 185 ? LYS A 208 ? ASN A 185 LYS A 208 1 ? 24 HELX_P HELX_P12 12 GLN A 213 ? GLY A 233 ? GLN A 213 GLY A 233 1 ? 21 HELX_P HELX_P13 13 SER A 239 ? ALA A 245 ? SER A 239 ALA A 245 1 ? 7 HELX_P HELX_P14 14 CYS A 248 ? LEU A 257 ? CYS A 248 LEU A 257 1 ? 10 HELX_P HELX_P15 15 LEU A 258 ? GLU A 260 ? 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THERE IS DISCONTINUOUS ELECTRON DENSITY, SO THE AUTHOR COULDN'T SPECIFY THE AMINO ACID. ; _pdbx_entry_details.entry_id 3A6P _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O F THR 305 ? ? 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"C3'" "H3'" sing N N 537 U "O3'" "HO3'" sing N N 538 U "C2'" "O2'" sing N N 539 U "C2'" "C1'" sing N N 540 U "C2'" "H2'" sing N N 541 U "O2'" "HO2'" sing N N 542 U "C1'" N1 sing N N 543 U "C1'" "H1'" sing N N 544 U N1 C2 sing N N 545 U N1 C6 sing N N 546 U C2 O2 doub N N 547 U C2 N3 sing N N 548 U N3 C4 sing N N 549 U N3 H3 sing N N 550 U C4 O4 doub N N 551 U C4 C5 sing N N 552 U C5 C6 doub N N 553 U C5 H5 sing N N 554 U C6 H6 sing N N 555 VAL N CA sing N N 556 VAL N H sing N N 557 VAL N H2 sing N N 558 VAL CA C sing N N 559 VAL CA CB sing N N 560 VAL CA HA sing N N 561 VAL C O doub N N 562 VAL C OXT sing N N 563 VAL CB CG1 sing N N 564 VAL CB CG2 sing N N 565 VAL CB HB sing N N 566 VAL CG1 HG11 sing N N 567 VAL CG1 HG12 sing N N 568 VAL CG1 HG13 sing N N 569 VAL CG2 HG21 sing N N 570 VAL CG2 HG22 sing N N 571 VAL CG2 HG23 sing N N 572 VAL OXT HXT sing N N 573 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 3A6P 'double helix' 3A6P 'a-form double helix' 3A6P 'bulge 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