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'associated EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Cong, Y.' 1 'Topf, M.' 2 'Sali, A.' 3 'Matsudaira, P.' 4 'Dougherty, M.' 5 'Chiu, W.' 6 'Schmid, M.F.' 7 # _citation.id primary _citation.title 'Crystallographic conformers of actin in a biologically active bundle of filaments.' _citation.journal_abbrev J.Mol.Biol. _citation.journal_volume 375 _citation.page_first 331 _citation.page_last 336 _citation.year 2008 _citation.journal_id_ASTM JMOBAK _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0022-2836 _citation.journal_id_CSD 0070 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 18022194 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.jmb.2007.10.027 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Cong, Y.' 1 ? primary 'Topf, M.' 2 ? primary 'Sali, A.' 3 ? primary 'Matsudaira, P.' 4 ? primary 'Dougherty, M.' 5 ? primary 'Chiu, W.' 6 ? primary 'Schmid, M.F.' 7 ? # loop_ 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6 PDB 3B63 3B63 6 1 ;TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKI WHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPI YEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDG QVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTM KIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEY ; ? 7 PDB 3B63 3B63 7 1 ;AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKI WHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPI YEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDG QVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTM KIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIV ; ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3B63 A 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 2 1 3B63 G 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 3 2 3B63 B 1 ? 364 ? 3B63 1 ? 364 ? 1 364 4 3 3B63 C 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 5 3 3B63 I 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 6 4 3B63 D 1 ? 357 ? 3B63 1 ? 357 ? 1 357 7 5 3B63 E 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 8 5 3B63 H 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 9 5 3B63 J 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 10 5 3B63 K 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 11 5 3B63 N 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 12 6 3B63 F 1 ? 357 ? 3B63 1 ? 357 ? 1 357 13 7 3B63 L 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 14 7 3B63 M 1 ? 365 ? 3B63 1 ? 365 ? 1 365 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLY A 50 ? 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GLY A 303 LEU A 315 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 16 TYR A 332 ? LEU A 344 ? TYR A 332 LEU A 344 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 17 THR A 346 ? TRP A 351 ? THR A 346 TRP A 351 5 ? 6 HELX_P HELX_P18 18 LYS A 354 ? GLY A 361 ? LYS A 354 GLY A 361 1 ? 8 HELX_P HELX_P19 19 ASN B 72 ? PHE B 84 ? ASN B 72 PHE B 84 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 20 ALA B 91 ? HIS B 95 ? ALA B 91 HIS B 95 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 21 PRO B 106 ? THR B 120 ? PRO B 106 THR B 120 1 ? 15 HELX_P HELX_P22 22 GLN B 131 ? GLY B 140 ? GLN B 131 GLY B 140 1 ? 10 HELX_P HELX_P23 23 PRO B 166 ? ILE B 169 ? PRO B 166 ILE B 169 5 ? 4 HELX_P HELX_P24 24 ALA B 175 ? GLY B 191 ? ALA B 175 GLY B 191 1 ? 17 HELX_P HELX_P25 25 THR B 196 ? CYS B 211 ? THR B 196 CYS B 211 1 ? 16 HELX_P HELX_P26 26 ASP B 216 ? SER B 227 ? ASP B 216 SER B 227 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 27 ASN B 246 ? CYS B 251 ? ASN B 246 CYS B 251 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 28 PRO B 252 ? PHE B 256 ? PRO B 252 PHE B 256 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 29 GLN B 257 ? ILE B 261 ? GLN B 257 ILE B 261 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 30 GLY B 267 ? MET B 277 ? GLY B 267 MET B 277 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 31 ILE B 281 ? ILE B 283 ? ILE B 281 ILE B 283 5 ? 3 HELX_P HELX_P32 32 ARG B 284 ? ALA B 289 ? ARG B 284 ALA B 289 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 33 GLY B 296 ? TYR B 300 ? GLY B 296 TYR B 300 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 34 GLY B 302 ? LEU B 314 ? GLY B 302 LEU B 314 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 35 GLU B 328 ? LYS B 330 ? GLU B 328 LYS B 330 5 ? 3 HELX_P HELX_P36 36 TYR B 331 ? LEU B 343 ? TYR B 331 LEU B 343 1 ? 13 HELX_P HELX_P37 37 SER B 344 ? MET B 349 ? SER B 344 MET B 349 5 ? 6 HELX_P HELX_P38 38 LYS B 353 ? GLY B 360 ? LYS B 353 GLY B 360 1 ? 8 HELX_P HELX_P39 39 PRO B 361 ? VAL B 364 ? PRO B 361 VAL B 364 5 ? 4 HELX_P HELX_P40 40 GLY C 50 ? LYS C 56 ? GLY C 50 LYS C 56 1 ? 7 HELX_P HELX_P41 41 ASN C 73 ? ASN C 87 ? ASN C 73 ASN C 87 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 42 ALA C 92 ? HIS C 96 ? ALA C 92 HIS C 96 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 43 PRO C 107 ? GLU C 120 ? PRO C 107 GLU C 120 1 ? 14 HELX_P HELX_P44 44 GLN C 132 ? SER C 140 ? GLN C 132 SER C 140 1 ? 9 HELX_P HELX_P45 45 PRO C 167 ? ILE C 170 ? PRO C 167 ILE C 170 5 ? 4 HELX_P HELX_P46 46 ALA C 176 ? GLU C 190 ? ALA C 176 GLU C 190 1 ? 15 HELX_P HELX_P47 47 THR C 197 ? CYS C 212 ? THR C 197 CYS C 212 1 ? 16 HELX_P HELX_P48 48 ASP C 217 ? SER C 228 ? ASP C 217 SER C 228 1 ? 12 HELX_P HELX_P49 49 SER C 229 ? GLU C 232 ? SER C 229 GLU C 232 5 ? 4 HELX_P HELX_P50 50 ASN C 247 ? ALA C 252 ? ASN C 247 ALA C 252 1 ? 6 HELX_P HELX_P51 51 PRO C 253 ? PHE C 257 ? PRO C 253 PHE C 257 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 52 HIS C 258 ? GLY C 263 ? HIS C 258 GLY C 263 5 ? 6 HELX_P HELX_P53 53 GLY C 268 ? CYS C 280 ? GLY C 268 CYS C 280 1 ? 13 HELX_P HELX_P54 54 ASP C 281 ? GLY C 290 ? ASP C 281 GLY C 290 1 ? 10 HELX_P HELX_P55 55 GLY C 297 ? PHE C 301 ? GLY C 297 PHE C 301 5 ? 5 HELX_P HELX_P56 56 GLY C 303 ? ALA C 316 ? GLY C 303 ALA C 316 1 ? 14 HELX_P HELX_P57 57 TYR C 332 ? LEU C 344 ? TYR C 332 LEU C 344 1 ? 13 HELX_P HELX_P58 58 THR C 346 ? MET C 350 ? THR C 346 MET C 350 5 ? 5 HELX_P HELX_P59 59 LYS C 354 ? GLY C 361 ? LYS C 354 GLY C 361 1 ? 8 HELX_P HELX_P60 60 PRO C 362 ? VAL C 365 ? PRO C 362 VAL C 365 5 ? 4 HELX_P HELX_P61 61 GLY D 49 ? ARG D 56 ? GLY D 49 ARG D 56 1 ? 8 HELX_P HELX_P62 62 ASN D 71 ? ASN D 85 ? ASN D 71 ASN D 85 1 ? 15 HELX_P HELX_P63 63 PRO D 105 ? THR D 119 ? PRO D 105 THR D 119 1 ? 15 HELX_P HELX_P64 64 GLN D 130 ? ALA D 137 ? GLN D 130 ALA D 137 1 ? 8 HELX_P HELX_P65 65 PRO D 165 ? ILE D 168 ? PRO D 165 ILE D 168 5 ? 4 HELX_P HELX_P66 66 ALA D 174 ? THR D 187 ? ALA D 174 THR D 187 1 ? 14 HELX_P HELX_P67 67 GLU D 188 ? GLY D 190 ? GLU D 188 GLY D 190 5 ? 3 HELX_P HELX_P68 68 THR D 195 ? CYS D 210 ? THR D 195 CYS D 210 1 ? 16 HELX_P HELX_P69 69 PHE D 216 ? SER D 226 ? PHE D 216 SER D 226 1 ? 11 HELX_P HELX_P70 70 SER D 227 ? GLU D 230 ? SER D 227 GLU D 230 5 ? 4 HELX_P HELX_P71 71 ASN D 245 ? THR D 253 ? ASN D 245 THR D 253 1 ? 9 HELX_P HELX_P72 72 GLY D 266 ? LYS D 277 ? GLY D 266 LYS D 277 1 ? 12 HELX_P HELX_P73 73 ILE D 282 ? ALA D 288 ? ILE D 282 ALA D 288 1 ? 7 HELX_P HELX_P74 74 GLY D 301 ? ALA D 314 ? GLY D 301 ALA D 314 1 ? 14 HELX_P HELX_P75 75 TYR D 330 ? LEU D 342 ? TYR D 330 LEU D 342 1 ? 13 HELX_P HELX_P76 76 PHE D 345 ? TRP D 349 ? PHE D 345 TRP D 349 5 ? 5 HELX_P HELX_P77 77 LYS D 352 ? GLU D 357 ? LYS D 352 GLU D 357 1 ? 6 HELX_P HELX_P78 78 GLY E 50 ? SER E 55 ? GLY E 50 SER E 55 1 ? 6 HELX_P HELX_P79 79 TRP E 74 ? TYR E 86 ? TRP E 74 TYR E 86 1 ? 13 HELX_P HELX_P80 80 ALA E 92 ? HIS E 96 ? ALA E 92 HIS E 96 5 ? 5 HELX_P HELX_P81 81 PRO E 107 ? GLU E 120 ? PRO E 107 GLU E 120 1 ? 14 HELX_P HELX_P82 82 GLN E 132 ? SER E 140 ? GLN E 132 SER E 140 1 ? 9 HELX_P HELX_P83 83 PRO E 167 ? ILE E 170 ? PRO E 167 ILE E 170 5 ? 4 HELX_P HELX_P84 84 ARG E 178 ? GLY E 192 ? ARG E 178 GLY E 192 1 ? 15 HELX_P HELX_P85 85 ALA E 199 ? CYS E 212 ? 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PRO N 167 ILE N 170 5 ? 4 HELX_P HELX_P254 254 ALA N 176 ? GLU N 190 ? ALA N 176 GLU N 190 1 ? 15 HELX_P HELX_P255 255 ALA N 199 ? LEU N 211 ? ALA N 199 LEU N 211 1 ? 13 HELX_P HELX_P256 256 PHE N 218 ? SER N 228 ? PHE N 218 SER N 228 1 ? 11 HELX_P HELX_P257 257 SER N 229 ? GLU N 232 ? SER N 229 GLU N 232 5 ? 4 HELX_P HELX_P258 258 ASN N 247 ? CYS N 252 ? ASN N 247 CYS N 252 1 ? 6 HELX_P HELX_P259 259 PRO N 253 ? PHE N 257 ? PRO N 253 PHE N 257 5 ? 5 HELX_P HELX_P260 260 GLY N 268 ? LYS N 279 ? GLY N 268 LYS N 279 1 ? 12 HELX_P HELX_P261 261 ASP N 281 ? ALA N 290 ? ASP N 281 ALA N 290 1 ? 10 HELX_P HELX_P262 262 GLY N 303 ? THR N 313 ? GLY N 303 THR N 313 1 ? 11 HELX_P HELX_P263 263 GLU N 329 ? LYS N 331 ? GLU N 329 LYS N 331 5 ? 3 HELX_P HELX_P264 264 TYR N 332 ? LEU N 344 ? TYR N 332 LEU N 344 1 ? 13 HELX_P HELX_P265 265 THR N 346 ? MET N 350 ? THR N 346 MET N 350 5 ? 5 HELX_P HELX_P266 266 LYS N 354 ? GLY N 361 ? LYS N 354 GLY N 361 1 ? 8 HELX_P HELX_P267 267 PRO N 362 ? 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ALA 199 L 1 7.53 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 6 ? B ? 3 ? C ? 2 ? D ? 3 ? E ? 5 ? F ? 2 ? G ? 6 ? H ? 3 ? I ? 3 ? J ? 5 ? K ? 2 ? L ? 6 ? M ? 3 ? N ? 2 ? O ? 3 ? P ? 5 ? Q ? 2 ? R ? 6 ? S ? 3 ? T ? 5 ? U ? 2 ? V ? 6 ? W ? 2 ? X ? 2 ? Y ? 3 ? Z ? 5 ? AA ? 2 ? AB ? 6 ? AC ? 3 ? AD ? 3 ? AE ? 5 ? AF ? 4 ? AG ? 2 ? AH ? 3 ? AI ? 2 ? AJ ? 3 ? AK ? 5 ? AL ? 2 ? AM ? 6 ? AN ? 3 ? AO ? 5 ? AP ? 2 ? AQ ? 6 ? AR ? 3 ? AS ? 2 ? AT ? 3 ? AU ? 5 ? AV ? 2 ? AW ? 6 ? AX ? 3 ? AY ? 2 ? AZ ? 3 ? BA ? 5 ? BB ? 2 ? BC ? 5 ? BD ? 3 ? BE ? 2 ? BF ? 3 ? BG ? 5 ? BH ? 2 ? BI ? 6 ? BJ ? 3 ? BK ? 2 ? BL ? 3 ? BM ? 5 ? BN ? 2 ? BO ? 2 ? BP ? 3 ? BQ ? 2 ? BR ? 3 ? BS ? 4 ? BT ? 2 ? BU ? 6 ? BV ? 3 ? BW ? 2 ? BX ? 3 ? BY ? 5 ? 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ALA B 24 PRO B 27 G 2 LEU B 11 ? PHE B 16 ? LEU B 11 PHE B 16 G 3 LEU B 3 ? ASN B 7 ? LEU B 3 ASN B 7 G 4 THR B 97 ? GLU B 101 ? THR B 97 GLU B 101 G 5 ALA B 125 ? ILE B 130 ? ALA B 125 ILE B 130 G 6 ILE B 351 ? THR B 352 ? ILE B 351 THR B 352 H 1 TYR B 48 ? VAL B 49 ? TYR B 48 VAL B 49 H 2 VAL B 30 ? PRO B 33 ? VAL B 30 PRO B 33 H 3 LEU B 60 ? LYS B 63 ? LEU B 60 LYS B 63 I 1 TYR B 163 ? ALA B 164 ? TYR B 163 ALA B 164 I 2 THR B 154 ? TYR B 160 ? THR B 154 TYR B 160 I 3 MET B 170 ? ARG B 171 ? MET B 170 ARG B 171 J 1 TYR B 163 ? ALA B 164 ? TYR B 163 ALA B 164 J 2 THR B 154 ? TYR B 160 ? THR B 154 TYR B 160 J 3 GLY B 144 ? SER B 149 ? GLY B 144 SER B 149 J 4 ASN B 291 ? SER B 294 ? ASN B 291 SER B 294 J 5 ILE B 323 ? ILE B 324 ? ILE B 323 ILE B 324 K 1 LYS B 232 ? GLU B 235 ? LYS B 232 GLU B 235 K 2 VAL B 241 ? ILE B 244 ? VAL B 241 ILE B 244 L 1 ALA C 24 ? PRO C 27 ? ALA C 24 PRO C 27 L 2 MET C 11 ? PHE C 16 ? MET C 11 PHE C 16 L 3 LEU C 3 ? ASP C 6 ? LEU C 3 ASP C 6 L 4 VAL C 98 ? 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CD2 C TRP 81 ? ? 113.08 106.30 6.78 0.80 N 38 1 CE2 C TRP 81 ? ? CD2 C TRP 81 ? ? CG C TRP 81 ? ? 101.21 107.30 -6.09 0.80 N 39 1 NE C ARG 142 ? ? CZ C ARG 142 ? ? NH2 C ARG 142 ? ? 116.54 120.30 -3.76 0.50 N 40 1 NE C ARG 178 ? ? CZ C ARG 178 ? ? NH1 C ARG 178 ? ? 124.11 120.30 3.81 0.50 N 41 1 NE C ARG 191 ? ? CZ C ARG 191 ? ? NH2 C ARG 191 ? ? 116.48 120.30 -3.82 0.50 N 42 1 NE C ARG 205 ? ? CZ C ARG 205 ? ? NH2 C ARG 205 ? ? 117.02 120.30 -3.28 0.50 N 43 1 CD1 C TRP 335 ? ? CG C TRP 335 ? ? CD2 C TRP 335 ? ? 112.06 106.30 5.76 0.80 N 44 1 CE2 C TRP 335 ? ? CD2 C TRP 335 ? ? CG C TRP 335 ? ? 101.54 107.30 -5.76 0.80 N 45 1 CD1 C TRP 351 ? ? CG C TRP 351 ? ? CD2 C TRP 351 ? ? 113.40 106.30 7.10 0.80 N 46 1 CB C TRP 351 ? ? CG C TRP 351 ? ? CD1 C TRP 351 ? ? 119.13 127.00 -7.87 1.30 N 47 1 CE2 C TRP 351 ? ? CD2 C TRP 351 ? ? CG C TRP 351 ? ? 100.89 107.30 -6.41 0.80 N 48 1 NE D ARG 22 ? ? CZ D ARG 22 ? ? NH2 D ARG 22 ? ? 115.54 120.30 -4.76 0.50 N 49 1 CD1 D TRP 72 ? ? 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CZ F ARG 58 ? ? NH1 F ARG 58 ? ? 124.16 120.30 3.86 0.50 N 74 1 NE F ARG 58 ? ? CZ F ARG 58 ? ? NH2 F ARG 58 ? ? 115.14 120.30 -5.16 0.50 N 75 1 CD1 F TRP 74 ? ? CG F TRP 74 ? ? CD2 F TRP 74 ? ? 112.81 106.30 6.51 0.80 N 76 1 CE2 F TRP 74 ? ? CD2 F TRP 74 ? ? CG F TRP 74 ? ? 101.28 107.30 -6.02 0.80 N 77 1 CD1 F TRP 81 ? ? CG F TRP 81 ? ? CD2 F TRP 81 ? ? 112.45 106.30 6.15 0.80 N 78 1 CE2 F TRP 81 ? ? CD2 F TRP 81 ? ? CG F TRP 81 ? ? 101.58 107.30 -5.72 0.80 N 79 1 NE F ARG 172 ? ? CZ F ARG 172 ? ? NH2 F ARG 172 ? ? 116.39 120.30 -3.91 0.50 N 80 1 NE F ARG 285 ? ? CZ F ARG 285 ? ? NH2 F ARG 285 ? ? 115.43 120.30 -4.87 0.50 N 81 1 NE F ARG 307 ? ? CZ F ARG 307 ? ? NH2 F ARG 307 ? ? 116.59 120.30 -3.71 0.50 N 82 1 CD1 F TRP 335 ? ? CG F TRP 335 ? ? CD2 F TRP 335 ? ? 112.81 106.30 6.51 0.80 N 83 1 CE2 F TRP 335 ? ? CD2 F TRP 335 ? ? CG F TRP 335 ? ? 101.05 107.30 -6.25 0.80 N 84 1 CD1 F TRP 351 ? ? CG F TRP 351 ? ? CD2 F TRP 351 ? ? 112.85 106.30 6.55 0.80 N 85 1 CE2 F TRP 351 ? ? 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? -55.62 -72.14 84 1 SER E 55 ? ? -48.41 -8.94 85 1 ARG E 57 ? ? 58.51 -125.72 86 1 LEU E 62 ? ? 56.45 73.83 87 1 HIS E 68 ? ? 51.23 11.47 88 1 PHE E 85 ? ? -71.24 -77.62 89 1 GLU E 120 ? ? -104.56 -81.93 90 1 PRO E 159 ? ? -67.54 87.64 91 1 ILE E 170 ? ? -68.16 94.91 92 1 ALA E 176 ? ? -157.43 -133.90 93 1 ARG E 191 ? ? -40.76 -83.50 94 1 SER E 194 ? ? -62.66 85.14 95 1 THR E 198 ? ? -5.27 -51.93 96 1 GLU E 200 ? ? -47.85 -6.00 97 1 GLU E 209 ? ? -69.87 1.32 98 1 LYS E 210 ? ? -131.20 -66.60 99 1 VAL E 242 ? ? -60.77 93.06 100 1 CYS E 252 ? ? -66.99 -84.56 101 1 THR E 255 ? ? -38.15 -36.22 102 1 ALA E 267 ? ? -49.61 156.91 103 1 ARG E 330 ? ? -25.50 -40.34 104 1 SER E 345 ? ? 24.64 -70.59 105 1 GLU E 359 ? ? -79.03 -75.84 106 1 SER E 363 ? ? -45.39 -9.10 107 1 ARG F 24 ? ? -90.24 -63.97 108 1 ASP F 47 ? ? -79.20 -144.19 109 1 ARG F 58 ? ? -19.39 -38.36 110 1 GLU F 68 ? ? -108.95 50.35 111 1 THR F 84 ? ? -61.03 -81.94 112 1 TYR F 86 ? ? -85.52 -76.16 113 1 LEU F 105 ? ? -57.26 -4.38 114 1 ASN F 106 ? ? -35.02 114.26 115 1 GLU F 120 ? ? -94.98 -77.62 116 1 ASN F 123 ? ? 77.41 36.22 117 1 PRO F 159 ? ? -69.69 95.40 118 1 GLU F 162 ? ? 39.40 59.23 119 1 ILE F 170 ? ? -62.17 91.42 120 1 ALA F 176 ? ? -150.91 -130.22 121 1 SER F 194 ? ? -175.66 130.59 122 1 PHE F 195 ? ? -108.71 -72.43 123 1 VAL F 196 ? ? 57.83 -68.39 124 1 THR F 197 ? ? -55.46 -104.54 125 1 THR F 198 ? ? -136.40 -65.22 126 1 GLU F 232 ? ? -60.00 81.56 127 1 PRO F 238 ? ? -44.70 -11.06 128 1 LYS F 279 ? ? -48.08 -16.38 129 1 CYS F 280 ? ? -73.02 -136.95 130 1 ASP F 281 ? ? -105.59 -118.97 131 1 ILE F 282 ? ? -142.25 -35.03 132 1 ASP F 287 ? ? -68.29 5.37 133 1 ARG F 330 ? ? -24.21 -31.07 134 1 LYS F 354 ? ? -68.11 78.25 135 1 GLN F 355 ? ? -169.57 -44.48 136 1 ILE G 38 ? ? -142.39 -4.31 137 1 ARG G 57 ? ? -56.74 6.72 138 1 PHE G 85 ? ? -67.48 -75.56 139 1 GLU G 88 ? ? -99.94 -74.36 140 1 ARG G 90 ? ? 72.66 61.47 141 1 ASN G 123 ? ? 38.33 41.09 142 1 HIS G 168 ? ? -2.56 -48.19 143 1 ASP G 174 ? ? -104.35 63.50 144 1 ALA G 176 ? ? -171.92 -159.93 145 1 ARG G 191 ? ? -88.49 43.59 146 1 SER G 196 ? ? -146.96 -52.95 147 1 LYS G 210 ? ? -94.12 -63.71 148 1 GLN G 227 ? ? -128.93 -68.22 149 1 SER G 229 ? ? -66.96 35.46 150 1 PRO G 238 ? ? -57.29 -5.55 151 1 THR G 299 ? ? -77.89 20.04 152 1 TRP G 351 ? ? -68.90 99.60 153 1 ILE G 352 ? ? -46.54 108.52 154 1 SER G 363 ? ? -57.84 -3.42 155 1 ILE G 364 ? ? -92.26 31.55 156 1 SER H 28 ? ? -66.86 86.10 157 1 MET H 39 ? ? -68.67 91.81 158 1 VAL H 40 ? ? -52.48 98.17 159 1 ARG H 57 ? ? -39.95 -33.33 160 1 GLU H 88 ? ? -80.06 -71.76 161 1 THR H 121 ? ? -108.14 -62.21 162 1 GLU H 162 ? ? 59.03 81.94 163 1 ILE H 170 ? ? -52.47 109.70 164 1 ALA H 176 ? ? -156.28 -129.67 165 1 ARG H 191 ? ? -63.60 18.63 166 1 ASP H 217 ? ? 50.46 83.77 167 1 SER H 228 ? ? 51.84 97.02 168 1 SER H 230 ? ? -77.56 48.96 169 1 ASP H 239 ? ? -82.19 -156.21 170 1 ARG H 251 ? ? -62.50 0.37 171 1 GLU H 265 ? ? -82.44 49.28 172 1 PRO H 302 ? ? -62.48 99.07 173 1 ARG H 330 ? ? -35.26 -22.67 174 1 TRP H 351 ? ? -62.29 97.00 175 1 MET I 42 ? ? -63.71 12.58 176 1 HIS I 68 ? ? 73.55 43.63 177 1 GLU I 88 ? ? -77.92 -72.77 178 1 MET I 105 ? ? 75.44 34.17 179 1 GLU I 120 ? ? -80.40 -79.97 180 1 ILE I 170 ? ? -64.81 90.04 181 1 SER I 196 ? ? -165.27 -27.32 182 1 SER I 229 ? ? -56.98 0.96 183 1 SER I 230 ? ? -35.06 -39.15 184 1 VAL I 242 ? ? -58.64 92.25 185 1 LEU I 344 ? ? -57.86 107.93 186 1 ARG J 23 ? ? -94.81 -68.92 187 1 GLN J 36 ? ? -69.27 91.37 188 1 VAL J 40 ? ? -64.52 93.29 189 1 LYS J 45 ? ? 61.14 126.50 190 1 ILE J 59 ? ? -76.79 23.49 191 1 HIS J 68 ? ? 54.27 17.24 192 1 THR J 84 ? ? -57.96 -73.79 193 1 ASN J 87 ? ? -128.98 -58.42 194 1 PRO J 104 ? ? 8.22 95.84 195 1 LEU J 105 ? ? 89.74 97.92 196 1 PRO J 107 ? ? -87.59 -110.62 197 1 LYS J 108 ? ? -151.08 -76.96 198 1 GLU J 120 ? ? -86.33 -70.31 199 1 ASN J 123 ? ? 80.63 28.23 200 1 THR J 143 ? ? -99.27 -71.11 201 1 GLU J 162 ? ? 56.37 -134.13 202 1 ASP J 174 ? ? -87.90 48.53 203 1 ALA J 176 ? ? -165.64 -157.01 204 1 TYR J 193 ? ? -103.69 -164.44 205 1 SER J 230 ? ? -24.57 -45.60 206 1 GLN J 241 ? ? -40.75 78.87 207 1 VAL J 242 ? ? -58.28 90.21 208 1 CYS J 252 ? ? -85.99 -76.68 209 1 PRO J 302 ? ? -63.58 93.49 210 1 LYS J 321 ? ? 62.19 73.13 211 1 SER J 363 ? ? -82.79 46.79 212 1 SER K 28 ? ? -67.08 70.17 213 1 VAL K 38 ? ? -56.01 90.65 214 1 MET K 39 ? ? -55.35 100.85 215 1 VAL K 40 ? ? -59.15 91.76 216 1 PHE K 85 ? ? -62.45 -73.33 217 1 GLN K 132 ? ? -29.19 -88.94 218 1 GLU K 162 ? ? 39.05 34.97 219 1 ILE K 170 ? ? -64.59 97.07 220 1 ALA K 176 ? ? -155.68 -145.81 221 1 ASP K 217 ? ? 51.64 71.69 222 1 SER K 228 ? ? 14.30 75.74 223 1 SER K 230 ? ? -67.81 33.90 224 1 ASP K 239 ? ? -91.16 -132.44 225 1 VAL K 242 ? ? -54.44 108.16 226 1 ASN K 247 ? ? -98.70 -61.98 227 1 ARG K 251 ? ? -62.53 7.75 228 1 PRO K 317 ? ? -69.60 -172.92 229 1 ARG K 330 ? ? -26.84 -27.21 230 1 TRP K 351 ? ? -63.63 90.91 231 1 ARG L 34 ? ? -175.07 139.92 232 1 GLN L 36 ? ? 60.72 -155.10 233 1 MET L 42 ? ? -94.81 -71.44 234 1 LYS L 45 ? ? 68.78 117.62 235 1 ARG L 57 ? ? 13.11 -81.33 236 1 ILE L 59 ? ? 161.32 -21.42 237 1 VAL L 71 ? ? -56.99 107.23 238 1 PHE L 85 ? ? -76.89 -72.42 239 1 ASN L 87 ? ? -134.66 -58.22 240 1 GLU L 88 ? ? -68.50 -70.81 241 1 LEU L 105 ? ? 67.60 63.54 242 1 ASN L 123 ? ? 19.79 49.07 243 1 THR L 143 ? ? -143.20 -49.69 244 1 PRO L 159 ? ? -67.88 94.56 245 1 ALA L 176 ? ? -169.17 -168.10 246 1 LEU L 188 ? ? -82.31 45.91 247 1 SER L 194 ? ? 30.24 -10.94 248 1 THR L 196 ? ? 38.90 -118.61 249 1 TYR L 213 ? ? -161.33 -169.58 250 1 SER L 228 ? ? 67.52 171.43 251 1 SER L 229 ? ? 64.05 -41.95 252 1 TYR L 235 ? ? -109.36 77.64 253 1 ASP L 239 ? ? -178.17 -86.65 254 1 PRO L 259 ? ? -68.55 2.08 255 1 ASP L 281 ? ? -27.31 134.79 256 1 PRO L 302 ? ? -67.41 91.03 257 1 THR L 319 ? ? -86.39 48.35 258 1 THR L 346 ? ? -59.87 6.44 259 1 GLN L 349 ? ? -76.19 43.90 260 1 MET L 350 ? ? -164.43 -46.17 261 1 SER M 9 ? ? -28.75 -49.88 262 1 PRO M 27 ? ? -50.28 106.41 263 1 SER M 28 ? ? -64.79 85.82 264 1 HIS M 35 ? ? 158.63 -29.32 265 1 GLN M 36 ? ? 60.47 -165.55 266 1 VAL M 38 ? 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? 56.08 19.90 297 1 THR N 84 ? ? -62.54 -85.09 298 1 TYR N 86 ? ? -91.39 -60.80 299 1 GLN N 132 ? ? -29.75 -63.06 300 1 ASP N 174 ? ? -83.86 33.15 301 1 ALA N 176 ? ? -168.29 -152.87 302 1 GLU N 190 ? ? -69.30 2.98 303 1 ALA N 215 ? ? -36.12 113.26 304 1 SER N 230 ? ? -35.34 -28.66 305 1 CYS N 252 ? ? -68.15 -72.04 306 1 GLN N 309 ? ? -72.73 -73.21 307 1 ALA N 314 ? ? 164.34 -6.26 308 1 LEU N 315 ? ? -132.39 -36.46 309 1 SER N 318 ? ? -23.25 -14.37 310 1 PHE N 347 ? ? -51.43 -4.21 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 ARG C 142 ? ? THR C 143 ? ? 148.38 2 1 ARG D 33 ? ? HIS D 34 ? ? -147.61 3 1 GLY D 57 ? ? ILE D 58 ? ? 45.14 4 1 VAL E 196 ? ? THR E 197 ? ? -148.51 5 1 PRO G 167 ? ? HIS G 168 ? ? 135.94 6 1 LYS I 186 ? ? ILE I 187 ? ? -149.13 7 1 LEU J 166 ? ? PRO J 167 ? ? -145.23 8 1 ASP J 281 ? ? ILE J 282 ? ? -142.70 9 1 PRO K 317 ? ? SER K 318 ? ? -123.38 10 1 SER M 227 ? ? SER M 228 ? ? 145.55 11 1 LEU N 60 ? ? THR N 61 ? ? 146.31 12 1 GLU N 190 ? ? ARG N 191 ? ? 149.28 # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 ARG A 57 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 2 1 TYR A 64 ? ? 0.107 'SIDE CHAIN' 3 1 ARG A 111 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 4 1 ARG A 142 ? ? 0.111 'SIDE CHAIN' 5 1 TYR A 161 ? ? 0.207 'SIDE CHAIN' 6 1 ARG A 191 ? ? 0.123 'SIDE CHAIN' 7 1 TYR A 193 ? ? 0.099 'SIDE CHAIN' 8 1 ARG A 249 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 9 1 ARG A 251 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 10 1 TYR A 274 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 11 1 ARG A 285 ? ? 0.098 'SIDE CHAIN' 12 1 TYR A 357 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 13 1 ARG B 34 ? ? 0.207 'SIDE CHAIN' 14 1 TYR B 48 ? ? 0.113 'SIDE CHAIN' 15 1 TYR B 64 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 16 1 ARG B 177 ? ? 0.114 'SIDE CHAIN' 17 1 ARG B 190 ? ? 0.089 'SIDE CHAIN' 18 1 TYR B 212 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 19 1 TYR B 273 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 20 1 ARG B 284 ? ? 0.106 'SIDE CHAIN' 21 1 ARG B 329 ? ? 0.126 'SIDE CHAIN' 22 1 TYR C 138 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 23 1 TYR C 161 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 24 1 TYR C 183 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN' 25 1 TYR C 213 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 26 1 TYR C 357 ? ? 0.092 'SIDE CHAIN' 27 1 ARG D 33 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 28 1 ARG D 140 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 29 1 ARG D 199 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 30 1 ARG E 57 ? ? 0.118 'SIDE CHAIN' 31 1 ARG E 90 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 32 1 ARG E 111 ? ? 0.105 'SIDE CHAIN' 33 1 TYR E 193 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 34 1 ARG E 201 ? ? 0.143 'SIDE CHAIN' 35 1 TYR E 274 ? ? 0.092 'SIDE CHAIN' 36 1 TYR E 357 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 37 1 ARG F 33 ? ? 0.112 'SIDE CHAIN' 38 1 TYR F 164 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 39 1 TYR F 183 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 40 1 TYR F 193 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 41 1 TYR F 301 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 42 1 ARG F 307 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 43 1 TYR F 332 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 44 1 TYR G 64 ? ? 0.131 'SIDE CHAIN' 45 1 ARG G 111 ? ? 0.125 'SIDE CHAIN' 46 1 ARG G 142 ? ? 0.120 'SIDE CHAIN' 47 1 TYR G 193 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 48 1 ARG G 251 ? ? 0.089 'SIDE CHAIN' 49 1 TYR G 274 ? ? 0.092 'SIDE CHAIN' 50 1 ARG H 57 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 51 1 TYR H 161 ? ? 0.181 'SIDE CHAIN' 52 1 ARG H 191 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 53 1 ARG H 205 ? ? 0.112 'SIDE CHAIN' 54 1 ARG H 249 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 55 1 TYR H 274 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 56 1 TYR H 332 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 57 1 TYR I 64 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 58 1 TYR I 161 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 59 1 TYR I 183 ? ? 0.162 'SIDE CHAIN' 60 1 ARG I 191 ? ? 0.096 'SIDE CHAIN' 61 1 TYR I 193 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 62 1 TYR I 274 ? ? 0.110 'SIDE CHAIN' 63 1 ARG I 307 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 64 1 TYR I 357 ? ? 0.098 'SIDE CHAIN' 65 1 TYR J 48 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 66 1 TYR J 164 ? ? 0.110 'SIDE CHAIN' 67 1 ARG J 191 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 68 1 ARG J 307 ? ? 0.130 'SIDE CHAIN' 69 1 TYR K 128 ? ? 0.120 'SIDE CHAIN' 70 1 TYR K 183 ? ? 0.091 'SIDE CHAIN' 71 1 ARG K 191 ? ? 0.131 'SIDE CHAIN' 72 1 TYR K 193 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 73 1 ARG K 201 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 74 1 ARG K 205 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 75 1 TYR K 274 ? ? 0.107 'SIDE CHAIN' 76 1 TYR K 332 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' 77 1 TYR L 64 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 78 1 TYR L 86 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 79 1 TYR L 128 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 80 1 TYR L 164 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 81 1 TYR L 213 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' 82 1 TYR M 64 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 83 1 TYR M 86 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 84 1 ARG M 111 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 85 1 TYR M 164 ? ? 0.097 'SIDE CHAIN' 86 1 TYR M 213 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 87 1 TYR N 64 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 88 1 ARG N 191 ? ? 0.093 'SIDE CHAIN' 89 1 TYR N 193 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 90 1 TYR N 213 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 91 1 TYR N 274 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 92 1 TYR N 357 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' # _pdbx_entry_details.entry_id 3B63 _pdbx_entry_details.sequence_details ;AUTHORS STATE THAT THE EM DENSITY MAP OBTAINED CONSISTS OF 14 INDEPENDENT ACTIN MOLECULES FROM THE SOURCE ORGANISM LIMULUS POLYPHEMUS. 9 DIFFERENT ACTIN PDB MODELS FROM DIFFERENT SOURCES WERE USED TO FIT INTO THESE 14 POSITIONS. THE DIFFERENT PDB ENTRIES THAT WERE USED FOR FITTING ARE 1T44,1HLU,1ATN,1YAG,1YVN,1MDU, 1HIV,1NWK, AND 1ESV. ; _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 3B63 _em_3d_fitting.ref_protocol 'AB INITIO MODEL' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria 'Best cross-correlation score between model and cryoEM map' _em_3d_fitting.details ;REFINEMENT PROTOCOL--Foldhunter program from EMAN single particle analysis package ; _em_3d_fitting.method ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code 1 1 1T44 ? ? 1 ? ? ? PDB 'experimental model' 1T44 1 2 1HLU ? ? 2 ? ? ? PDB 'experimental model' 1HLU 1 3 1ATN ? ? 3 ? ? ? PDB 'experimental model' 1ATN 1 4 1YAG ? ? 4 ? ? ? PDB 'experimental model' 1YAG 1 5 1YVN ? ? 5 ? ? ? PDB 'experimental model' 1YVN 1 6 1MDU ? ? 6 ? ? ? PDB 'experimental model' 1MDU 1 7 1HIV ? ? 7 ? ? ? PDB 'experimental model' 1HIV 1 8 1NWK ? ? 8 ? ? ? PDB 'experimental model' 1NWK 1 9 1ESV ? ? 9 ? ? ? PDB 'experimental model' 1ESV # _em_3d_reconstruction.entry_id 3B63 _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type '3D CRYSTAL' _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method ;Cross-correlation and merging of crystallographic reflections derived from cryoelectron micrographs of 3D crystals. For more information, please refer to EMDB entry EMD-1088 http://www.ebi.ac.uk/msd-srv/emsearch/atlas/1088_summary.html ; _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.resolution 9.5 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details ;Cross-correlation and merging of crystallographic reflections derived from cryoelectron micrographs of 3D crystalss: application to the Limulus acrosomal bundle, Michael F. Schmid, J. Struc. Biol., 144 (2003) 195-208 ; _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.details ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 'Acrosomal bundle from Limulus sperm' COMPLEX 0 ? ? ? 2 'An actin filament model in the acrosomal bundle refined from multiple actin crystal structures' ? 1 ? ;All the actin crystal structures as the starting coordinates before refinement in this model were listed under the Molecule Names entry ; ? # _em_imaging.entry_id 3B63 _em_imaging.id 1 _em_imaging.nominal_magnification 40000 _em_imaging.nominal_defocus_min 800 _em_imaging.nominal_defocus_max 3000 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature 106 _em_imaging.microscope_model 'JEOL 4000EX' _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source LAB6 _em_imaging.accelerating_voltage 400 _em_imaging.details 'For more information, please refer to EMDB entry EMD-1088 http://www.ebi.ac.uk/msd-srv/emsearch/atlas/1088_summary.html' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? # _em_vitrification.entry_id 3B63 _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'HOMEMADE PLUNGER' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.details ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 3B63 _em_experiment.id 1 _em_experiment.reconstruction_method CRYSTALLOGRAPHY _em_experiment.aggregation_state FILAMENT _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal ALA N N N N 1 ALA CA C N S 2 ALA C C N N 3 ALA O O N N 4 ALA CB C N N 5 ALA OXT O N N 6 ALA H H N N 7 ALA H2 H N N 8 ALA HA H N N 9 ALA HB1 H N N 10 ALA HB2 H N N 11 ALA HB3 H N N 12 ALA HXT H N N 13 ARG N N N N 14 ARG CA C N S 15 ARG C C N N 16 ARG O O N N 17 ARG CB C N N 18 ARG CG C N N 19 ARG CD C N N 20 ARG NE N N N 21 ARG CZ C N N 22 ARG NH1 N N N 23 ARG NH2 N N N 24 ARG OXT O N N 25 ARG H H N N 26 ARG H2 H N N 27 ARG HA H N N 28 ARG HB2 H N N 29 ARG HB3 H N N 30 ARG HG2 H N N 31 ARG HG3 H N N 32 ARG HD2 H N N 33 ARG HD3 H N N 34 ARG HE H N N 35 ARG HH11 H N N 36 ARG HH12 H N N 37 ARG HH21 H N N 38 ARG HH22 H N N 39 ARG HXT H N N 40 ASN N N N N 41 ASN CA C N S 42 ASN C C N N 43 ASN O O N N 44 ASN CB C N N 45 ASN CG C N N 46 ASN OD1 O N N 47 ASN ND2 N N N 48 ASN OXT O N N 49 ASN H H N N 50 ASN H2 H N N 51 ASN HA H N N 52 ASN HB2 H N N 53 ASN HB3 H N N 54 ASN HD21 H N N 55 ASN HD22 H N N 56 ASN HXT H N N 57 ASP N N N N 58 ASP CA C N S 59 ASP C C N N 60 ASP O O N N 61 ASP CB C N N 62 ASP CG C N N 63 ASP OD1 O N N 64 ASP OD2 O N N 65 ASP OXT O N N 66 ASP H H N N 67 ASP H2 H N N 68 ASP HA H N N 69 ASP HB2 H N N 70 ASP HB3 H N N 71 ASP HD2 H N N 72 ASP HXT H N N 73 CYS N N N N 74 CYS CA C N R 75 CYS C C N N 76 CYS O O N N 77 CYS CB C N N 78 CYS SG S N N 79 CYS OXT O N N 80 CYS H H N N 81 CYS H2 H N N 82 CYS HA H N N 83 CYS HB2 H N N 84 CYS HB3 H N N 85 CYS HG H N N 86 CYS HXT H N N 87 GLN N N N N 88 GLN CA C N S 89 GLN C C N N 90 GLN O O N N 91 GLN CB C N N 92 GLN CG C N N 93 GLN CD C N N 94 GLN OE1 O N N 95 GLN NE2 N N N 96 GLN OXT O N N 97 GLN H H N N 98 GLN H2 H N N 99 GLN HA H N N 100 GLN HB2 H N N 101 GLN HB3 H N N 102 GLN HG2 H N N 103 GLN HG3 H N N 104 GLN HE21 H N N 105 GLN HE22 H N N 106 GLN HXT H N N 107 GLU N N N N 108 GLU CA C N S 109 GLU C C N N 110 GLU O O N N 111 GLU CB C N N 112 GLU CG C N N 113 GLU CD C N N 114 GLU OE1 O N N 115 GLU OE2 O N N 116 GLU OXT O N N 117 GLU H H N N 118 GLU H2 H N N 119 GLU HA H N N 120 GLU HB2 H N N 121 GLU HB3 H N N 122 GLU HG2 H N N 123 GLU HG3 H N N 124 GLU HE2 H N N 125 GLU HXT H N N 126 GLY N N N N 127 GLY CA C N N 128 GLY C C N N 129 GLY O O N N 130 GLY OXT O N N 131 GLY H H N N 132 GLY H2 H N N 133 GLY HA2 H N N 134 GLY HA3 H N N 135 GLY HXT H N N 136 HIS N N N N 137 HIS CA C N S 138 HIS C C N N 139 HIS O O N N 140 HIS CB C N N 141 HIS CG C Y N 142 HIS ND1 N Y N 143 HIS CD2 C Y N 144 HIS CE1 C Y N 145 HIS NE2 N Y N 146 HIS OXT O N N 147 HIS H H N N 148 HIS H2 H N N 149 HIS HA H N N 150 HIS HB2 H N N 151 HIS HB3 H N N 152 HIS HD1 H N N 153 HIS HD2 H N N 154 HIS HE1 H N N 155 HIS HE2 H N N 156 HIS HXT H N N 157 ILE N N N N 158 ILE CA C N S 159 ILE C C N N 160 ILE O O N N 161 ILE CB C N S 162 ILE CG1 C N N 163 ILE CG2 C N N 164 ILE CD1 C N N 165 ILE OXT O N N 166 ILE H H N N 167 ILE H2 H N N 168 ILE HA H N N 169 ILE HB H N N 170 ILE HG12 H N N 171 ILE HG13 H N N 172 ILE HG21 H N N 173 ILE HG22 H N N 174 ILE HG23 H N N 175 ILE HD11 H N N 176 ILE HD12 H N N 177 ILE HD13 H N N 178 ILE HXT H N N 179 LEU N N N N 180 LEU CA C N S 181 LEU C C N N 182 LEU O O N N 183 LEU CB C N N 184 LEU CG C N N 185 LEU CD1 C N N 186 LEU CD2 C N N 187 LEU OXT O N N 188 LEU H H N N 189 LEU H2 H N N 190 LEU HA H N N 191 LEU HB2 H N N 192 LEU HB3 H N N 193 LEU HG H N N 194 LEU HD11 H N N 195 LEU HD12 H N N 196 LEU HD13 H N N 197 LEU HD21 H N N 198 LEU HD22 H N N 199 LEU HD23 H N N 200 LEU HXT H N N 201 LYS N N N N 202 LYS CA C N S 203 LYS C C N N 204 LYS O O N N 205 LYS CB C N N 206 LYS CG C N N 207 LYS CD C N N 208 LYS CE C N N 209 LYS NZ N N N 210 LYS OXT O N N 211 LYS H H N N 212 LYS H2 H N N 213 LYS HA H N N 214 LYS HB2 H N N 215 LYS HB3 H N N 216 LYS HG2 H N N 217 LYS HG3 H N N 218 LYS HD2 H N N 219 LYS HD3 H N N 220 LYS HE2 H N N 221 LYS HE3 H N N 222 LYS HZ1 H N N 223 LYS HZ2 H N N 224 LYS HZ3 H N N 225 LYS HXT H N N 226 MET N N N N 227 MET CA C N S 228 MET C C N N 229 MET O O N N 230 MET CB C N N 231 MET CG C N N 232 MET SD S N N 233 MET CE C N N 234 MET OXT O N N 235 MET H H N N 236 MET H2 H N N 237 MET HA H N N 238 MET HB2 H N N 239 MET HB3 H N N 240 MET HG2 H N N 241 MET HG3 H N N 242 MET HE1 H N N 243 MET HE2 H N N 244 MET HE3 H N N 245 MET HXT H N N 246 PHE N N N N 247 PHE CA C N S 248 PHE C C N N 249 PHE O O N N 250 PHE CB C N N 251 PHE CG C Y N 252 PHE CD1 C Y N 253 PHE CD2 C Y N 254 PHE CE1 C Y N 255 PHE CE2 C Y N 256 PHE CZ C Y N 257 PHE OXT O N N 258 PHE H H N N 259 PHE H2 H N N 260 PHE HA H N N 261 PHE HB2 H N N 262 PHE 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