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HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 GB M26923 155076 1 ;AUUUGUUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGG UUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACU CGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCA UCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACU GAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGC UUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGU AAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAG GGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGA CGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGC CACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAA ACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAA GGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCU UACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAU GGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUU CGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGC CUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCC CAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAU ACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAG GCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUU UCUAA ; 645 ? 2 UNP RS2_THET2 P62662 4 ;MPVEITVKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDI VRMEAERAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPD AIFVVDPTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQ EAEATETPEGESEVEA ; 1 ? 3 UNP RS3_THET2 P62663 5 ;MGNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRG GERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGA EQARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE ; 1 ? 4 UNP RS4_THET2 P62664 6 ;MGRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFE EASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQ NLEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR ; 1 ? 5 UNP RS5_THET2 P62665 7 ;MPETDFEEKMILIRRTARMQAGGRRFRFGALVVVGDRQGRVGLGFGKAPEVPLAVQKAGYYARRNMVEVPLQNGTIPHEI EVEFGASKIVLKPAAPGTGVIAGAVPRAILELAGVTDILTKELGSRNPINIAYATMEALRQLRTKADVERLRKGEAHAQA QG ; 1 ? 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21 UNP RSHX_THET2 P62613 23 MGKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK 1 ? 22 UNP Q72GJ6_THET2 Q72GJ6 24 ;MRLASQSAILVKVWTWNASRNAWKASGGIFDIPQKETRLKELERRLEDPSLWNDPEAARKVSQEAARLRRTVDTFRSLES DLQGLLELMEELPAEEREALKPELEEAAKKLDELYHQTLLNFPHAEKNAILTIQPGAGGTEACDWAEMLLRMYTRFAERQ GFQVEVVDLTPGPEAGIDYAQILVKGENAYGLLSPEAGVHRLVRPSPFDASGRRHTSFAGVEVIPEVDEEVEVVLKPEEL RIDVMRASGPGGQGVNTTDSAVRVVHLPTGITVTCQTTRSQIKNKELALKILKARLYELERKKREEELKALRGEVRPIEW GSQIRSYVLDKNYVKDHRTGLMRHDPENVLDGDLMDLIWAGLEWKAGRRQGTEEVEAE ; 1 ? 23 PDB 3F1G 3F1G 2 ? ? ? 24 PDB 3F1G 3F1G 3 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3F1G A 1 ? 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Q72GJ6 1 ? 378 ? 1 378 23 23 3F1G Z 1 ? 77 ? 3F1G 1 ? 76 ? 1 76 24 23 3F1G Y 1 ? 77 ? 3F1G 1 ? 76 ? 1 76 25 24 3F1G V 1 ? 27 ? 3F1G 1 ? 27 ? 1 27 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 3F1G G A 457 ? GB 155076 C 1101 CONFLICT 466 1 11 3F1G ALA L 2 ? UNP P61941 ? ? INSERTION 2 2 11 3F1G LEU L 3 ? UNP P61941 ? ? INSERTION 3 3 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 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'Zn 2' 65.409 # _exptl.entry_id 3F1G _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 3.45 _exptl_crystal.density_percent_sol 64.00 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 296 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 7.0 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;100 MM TRIS-OAC, 200 MM KSCN, 3.5-4.5 % (W/V) PEG20K, 4-9 % PEG200, DEOXY BIGCHAP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K ; # loop_ _exptl_crystal_grow_comp.crystal_id _exptl_crystal_grow_comp.id _exptl_crystal_grow_comp.sol_id _exptl_crystal_grow_comp.name _exptl_crystal_grow_comp.volume _exptl_crystal_grow_comp.conc _exptl_crystal_grow_comp.details 1 1 1 TRIS-OAC ? ? ? 1 2 1 KSCN ? ? ? 1 3 1 PEG20K ? ? ? 1 4 1 PEG200 ? ? ? 1 5 1 'DEOXY BIGCHAP' ? ? ? 1 6 2 TRIS-OAC ? ? ? 1 7 2 KSCN ? ? ? 1 8 2 PEG20K ? ? ? 1 9 2 PEG200 ? ? ? 1 10 2 'DEOXY BIGCHAP' ? ? ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'MARMOSAIC 300 mm CCD' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2008-04 _diffrn_detector.details 'SI(111) DOUBLE CRYSTAL MONOCHROMATOR. ADJUSTABLE FOCUSING MIRRORS IN K-B GEOMETRY' # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'DOUBLE CRYSTAL CRYO-COOLED SI(111)' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.95370 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'APS BEAMLINE 23-ID-D' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site APS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 23-ID-D _diffrn_source.pdbx_wavelength 0.95370 _diffrn_source.pdbx_wavelength_list ? # _reflns.entry_id 3F1G _reflns.observed_criterion_sigma_I ? _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 49.951 _reflns.d_resolution_high 3.00 _reflns.number_obs 1148216 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 97.9 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 8.8 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 16.8 _reflns.R_free_details ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 # _reflns_shell.d_res_high 3.00 _reflns_shell.d_res_low 3.11 _reflns_shell.percent_possible_all 89.9 _reflns_shell.Rmerge_I_obs ? _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 2.40 _reflns_shell.pdbx_redundancy 8.40 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all ? _reflns_shell.number_measured_all ? _reflns_shell.number_measured_obs ? _reflns_shell.number_unique_obs ? _reflns_shell.pdbx_chi_squared ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 3F1G _refine.ls_number_reflns_obs 1148216 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 1.99 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 49.951 _refine.ls_d_res_high 3.000 _refine.ls_percent_reflns_obs 97.34 _refine.ls_R_factor_obs 0.2806 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.2803 _refine.ls_R_factor_R_free 0.3164 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 0.91 _refine.ls_number_reflns_R_free 10481 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details 'FLAT BULK SOLVENT MODEL' _refine.solvent_model_param_ksol 0.184 _refine.solvent_model_param_bsol 26.922 _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.11 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.90 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ;REFINEMENT WAS PERFORMED IN CNS V1.2 AND IN PHENIX. STATISTICS AS CALCULATED BY PHENIX. TLS/NCS DEFINITIONS ARE BASED ON SEGMENT DEFINITIONS (SEGID), AS IMPLEMENTED IN THE REFINEMENT PROGRAM CNS. HETERO ATOMS ARE NOT PART OF TLS/NCS DEFINITIONS. SEGID DEFINITIONS STARTING WITH CHARACTER A REFER TO RIBOSOME A (3F1E,3F1F); B REFERS TO RIBOSOME B (3F1G,3F1H). SUBSEQUENT CHARACTERS REFER TO MOLECULE NAME. SEGIDS AS02 THROUGH AS20 AND ATHX REFER TO RIBOSOMAL PROTEINS S2 THROUGH S20 AND RIBOSOMAL PROTEIN THX OF RIBOSOME A. SEGIDS AL02 THROUGH AL35 REFER TO RIBOSOMAL PROTEINS L2 THROUGH L35 OF RIBOSOME A. SEGIDS A16S, A23S AND A5S REFER TO 16S, 23S AND 5S RIBOSOMAL RNA OF RIBOSOME A. SEGID ARF2 REFERS TO RELEASE FACTOR RF2 IN RIBOSOME A COMPLEX. SEGIDS APTN AND AETN REFER TO P- AND E-SITE TRNAS OF RIBOSOME A COMPLEX. SEGID AMRN REFERS TO MESSENGER RNA OF RIBOSOME A COMPLEX. EQUIVALENT NAMING SCHEME WAS USED FOR RIBOSOME B. A COORDINATE FILE INCLUDING THE SEGID COLUMN IS AVAILABLE FROM THE DOWNLOAD AREA OF THE AUTHORS WEBSITE HTTP://RNA.UCSC.EDU. ; _refine.pdbx_starting_model 'PDB ENTRIES 3D5A, 3D5B, 3D5C, 3D5D' _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ML _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML 0.72 _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 21920 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 35826 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 272 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 58018 _refine_hist.d_res_high 3.000 _refine_hist.d_res_low 49.951 # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal 1 1 POSITIONAL A 87040 ? ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 1 1 2 POSITIONAL B 87040 0.031 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 2 2 1 POSITIONAL A 51387 ? ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 3 2 2 POSITIONAL B 51387 0.023 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 4 3 1 POSITIONAL A 1854 ? ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 5 3 2 POSITIONAL B 1854 0.023 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 6 4 1 POSITIONAL A 1640 ? ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 7 4 2 POSITIONAL B 1640 0.008 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 8 5 1 POSITIONAL A 1994 ? ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 9 5 2 POSITIONAL B 1994 0.017 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 10 6 1 POSITIONAL A 882 ? ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 11 6 2 POSITIONAL B 882 0.009 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 12 7 1 POSITIONAL A 2239 ? ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 13 7 2 POSITIONAL B 2239 0.015 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 14 8 1 POSITIONAL A 1241 ? ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 15 8 2 POSITIONAL B 1241 0.015 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 16 # loop_ _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs _refine_ls_shell.number_reflns_obs 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.0000 3.0341 32998 0.4402 85.00 0.4529 . . 313 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.0341 3.0698 34215 0.4352 88.00 0.4190 . . 319 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.0698 3.1072 34939 0.4354 90.00 0.4586 . . 375 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.1072 3.1465 35610 0.4277 92.00 0.4546 . . 370 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.1465 3.1879 36405 0.4254 94.00 0.4331 . . 335 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.1879 3.2316 36768 0.4219 95.00 0.4801 . . 220 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.2316 3.2778 36859 0.4062 95.00 0.4289 . . 367 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.2778 3.3267 37063 0.4051 96.00 0.4185 . . 369 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.3267 3.3786 37352 0.3894 96.00 0.4360 . . 368 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.3786 3.4340 37578 0.3851 97.00 0.4189 . . 332 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.4340 3.4932 38045 0.3806 98.00 0.4177 . . 106 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.4932 3.5567 37989 0.3693 98.00 0.4078 . . 411 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.5567 3.6251 38304 0.3475 99.00 0.4106 . . 408 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.6251 3.6991 38693 0.3371 99.00 0.3621 . . 186 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.6991 3.7795 38799 0.3234 100.00 0.3494 . . 331 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.7795 3.8674 38626 0.3075 100.00 0.3574 . . 411 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.8674 3.9641 38909 0.2929 100.00 0.3461 . . 217 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.9641 4.0712 38781 0.2687 100.00 0.3246 . . 375 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.0712 4.1909 38721 0.2513 100.00 0.3054 . . 387 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.1909 4.3261 38861 0.2352 100.00 0.2842 . . 417 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.3261 4.4806 38862 0.2215 100.00 0.2690 . . 379 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.4806 4.6599 38881 0.2088 100.00 0.2522 . . 401 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.6599 4.8718 38892 0.1967 100.00 0.2539 . . 371 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.8718 5.1284 39013 0.1816 100.00 0.2438 . . 398 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.1284 5.4494 39020 0.1670 100.00 0.2244 . . 401 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.4494 5.8695 39149 0.1618 100.00 0.2311 . . 376 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.8695 6.4591 39135 0.1622 100.00 0.2186 . . 408 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 6.4591 7.3912 39340 0.1658 100.00 0.2127 . . 368 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 7.3912 9.3023 39527 0.1855 100.00 0.2201 . . 370 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 9.3023 49.9582 40401 0.2555 100.00 0.2767 . . 392 . . . . # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details 1 1 ? 1 2 ? 2 1 ? 2 2 ? 3 1 ? 3 2 ? 4 1 ? 4 2 ? 5 1 ? 5 2 ? 6 1 ? 6 2 ? 7 1 ? 7 2 ? 8 1 ? 8 2 ? # loop_ _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 '(segid A23S or segid A5S or segid AL*) and not resid 2093:2196 and not resid 1051:1108 and not segid AL09' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1 '(segid B23S or segid B5S or segid BL*) and not resid 2093:2196 and not resid 1051:1108 and not segid BL09' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'segid A16S or segid AS* or segid AT*' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 'segid APTN or segid AMRN' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 'segid BPTN or segid BMRN' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 'segid AETN' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 'segid BETN' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 'segid ARF2 and not resid 1:124' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 'segid BRF2 and not resid 1:124' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 'segid ARF2 and resid 1:124' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 'segid BRF2 and resid 1:124' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 'segid A23S and resid 2093:2196' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 'segid B23S and resid 2093:2196' 1 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 'segid A23S and resid 1051:1108' 2 ? ? ? ? 1 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 'segid B23S and resid 1051:1108' # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? 6 ? 7 ? 8 ? # _struct.entry_id 3F1G _struct.title ;Crystal structure of a translation termination complex formed with release factor RF2. This file contains the 30S subunit, RF2, two tRNA, and mRNA molecules of the second 70S ribosome. The entire crystal structure contains two 70S ribosomes as described in remark 400. ; _struct.pdbx_descriptor '30S SUBUNIT' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3F1G _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME _struct_keywords.text 'RF2, RIBOSOME, TERMINATION, TRNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 2 ? E N N 4 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 7 ? I N N 8 ? J N N 9 ? K N N 10 ? L N N 11 ? M N N 12 ? N N N 13 ? O N N 14 ? P N N 15 ? Q N N 16 ? R N N 17 ? S N N 18 ? T N N 19 ? U N N 20 ? V N N 21 ? W N N 22 ? X N N 23 ? Y N N 24 ? Z N N 25 ? AA N N 25 ? BA N N 25 ? CA N N 25 ? DA N N 25 ? EA N N 25 ? FA N N 25 ? GA N N 25 ? HA N N 25 ? IA N N 25 ? JA N N 25 ? KA N N 25 ? LA N N 25 ? MA N N 25 ? NA N N 25 ? OA N N 25 ? PA N N 25 ? QA N N 25 ? RA N N 25 ? SA N N 25 ? TA N N 25 ? UA N N 25 ? VA N N 25 ? WA N N 25 ? XA N N 25 ? YA N N 25 ? ZA N N 25 ? AB N N 25 ? BB N N 25 ? CB N N 25 ? DB N N 25 ? EB N N 25 ? FB N N 25 ? GB N N 25 ? HB N N 25 ? IB N N 25 ? JB N N 25 ? KB N N 25 ? LB N N 25 ? MB N N 25 ? NB N N 25 ? OB N N 25 ? PB N N 25 ? QB N N 25 ? RB N N 25 ? SB N N 25 ? TB N N 25 ? UB N N 25 ? VB N N 25 ? WB N N 25 ? XB N N 25 ? YB N N 25 ? ZB N N 25 ? AC N N 25 ? BC N N 25 ? CC N N 25 ? DC N N 25 ? EC N N 25 ? FC N N 25 ? GC N N 25 ? HC N N 25 ? IC N N 25 ? JC N N 25 ? KC N N 25 ? LC N N 25 ? MC N N 25 ? NC N N 25 ? OC N N 25 ? PC N N 25 ? QC N N 25 ? RC N N 25 ? SC N N 25 ? TC N N 25 ? UC N N 25 ? VC N N 25 ? WC N N 25 ? XC N N 25 ? YC N N 25 ? ZC N N 25 ? AD N N 25 ? BD N N 25 ? CD N N 25 ? DD N N 25 ? ED N N 25 ? FD N N 25 ? GD N N 25 ? HD N N 25 ? ID N N 25 ? JD N N 25 ? KD N N 25 ? LD N N 25 ? MD N N 25 ? ND N N 25 ? OD N N 25 ? PD N N 25 ? QD N N 25 ? RD N N 25 ? SD N N 25 ? TD N N 25 ? UD N N 25 ? VD N N 25 ? WD N N 25 ? XD N N 25 ? YD N N 25 ? ZD N N 25 ? AE N N 25 ? BE N N 25 ? CE N N 25 ? DE N N 25 ? EE N N 25 ? FE N N 25 ? GE N N 25 ? HE N N 25 ? IE N N 25 ? JE N N 25 ? KE N N 25 ? LE N N 25 ? ME N N 25 ? NE N N 25 ? OE N N 25 ? PE N N 25 ? QE N N 25 ? RE N N 25 ? SE N N 25 ? TE N N 25 ? UE N N 25 ? VE N N 25 ? WE N N 25 ? XE N N 25 ? YE N N 25 ? ZE N N 25 ? AF N N 25 ? BF N N 25 ? CF N N 25 ? DF N N 25 ? EF N N 25 ? FF N N 25 ? GF N N 25 ? HF N N 25 ? IF N N 25 ? JF N N 25 ? KF N N 25 ? LF N N 25 ? MF N N 25 ? NF N N 25 ? OF N N 25 ? PF N N 25 ? QF N N 25 ? RF N N 25 ? SF N N 25 ? TF N N 25 ? UF N N 25 ? VF N N 25 ? WF N N 25 ? XF N N 25 ? YF N N 25 ? ZF N N 25 ? AG N N 25 ? BG N N 25 ? CG N N 25 ? DG N N 25 ? EG N N 25 ? FG N N 25 ? GG N N 25 ? HG N N 25 ? IG N N 25 ? JG N N 25 ? KG N N 25 ? LG N N 25 ? MG N N 25 ? NG N N 25 ? OG N N 25 ? PG N N 25 ? QG N N 25 ? RG N N 25 ? SG N N 25 ? TG N N 25 ? UG N N 25 ? VG N N 25 ? WG N N 25 ? XG N N 25 ? YG N N 25 ? ZG N N 25 ? AH N N 25 ? BH N N 25 ? CH N N 25 ? DH N N 25 ? EH N N 25 ? FH N N 25 ? GH N N 25 ? HH N N 25 ? IH N N 25 ? JH N N 25 ? KH N N 25 ? LH N N 25 ? MH N N 25 ? NH N N 25 ? OH N N 25 ? PH N N 25 ? QH N N 25 ? RH N N 25 ? SH N N 25 ? TH N N 25 ? UH N N 25 ? VH N N 25 ? WH N N 25 ? XH N N 25 ? YH N N 25 ? ZH N N 25 ? AI N N 25 ? BI N N 25 ? CI N N 25 ? DI N N 25 ? EI N N 25 ? FI N N 25 ? GI N N 25 ? HI N N 25 ? II N N 25 ? JI N N 25 ? KI N N 25 ? LI N N 25 ? MI N N 25 ? NI N N 25 ? OI N N 25 ? PI N N 25 ? QI N N 25 ? RI N N 25 ? SI N N 25 ? TI N N 25 ? UI N N 25 ? VI N N 25 ? WI N N 25 ? XI N N 25 ? YI N N 25 ? ZI N N 25 ? AJ N N 25 ? BJ N N 25 ? CJ N N 25 ? DJ N N 25 ? EJ N N 25 ? FJ N N 25 ? GJ N N 25 ? HJ N N 25 ? IJ N N 25 ? JJ N N 25 ? KJ N N 25 ? LJ N N 25 ? MJ N N 25 ? NJ N N 25 ? OJ N N 25 ? PJ N N 25 ? QJ N N 25 ? RJ N N 25 ? SJ N N 26 ? TJ N N 25 ? UJ N N 25 ? VJ N N 25 ? WJ N N 25 ? XJ N N 25 ? YJ N N 25 ? ZJ N N 25 ? AK N N 25 ? BK N N 25 ? CK N N 25 ? DK N N 25 ? EK N N 25 ? FK N N 25 ? GK N N 26 ? HK N N 25 ? IK N N 25 ? JK N N 25 ? KK N N 25 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 VAL E 7 ? GLY E 14 ? VAL B 7 GLY B 14 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 2 LYS E 27 ? ARG E 30 ? LYS B 27 ARG B 30 5 ? 4 HELX_P HELX_P3 3 ASP E 43 ? ARG E 64 ? ASP B 43 ARG B 64 1 ? 22 HELX_P HELX_P4 4 LYS E 74 ? GLN E 76 ? LYS B 74 GLN B 76 5 ? 3 HELX_P HELX_P5 5 ALA E 77 ? ARG E 87 ? ALA B 77 ARG B 87 1 ? 11 HELX_P HELX_P6 6 ASN E 104 ? PHE E 122 ? ASN B 104 PHE B 122 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 7 PRO E 131 ? SER E 150 ? PRO B 131 SER B 150 1 ? 20 HELX_P HELX_P8 8 GLU E 170 ? LEU E 180 ? GLU B 170 LEU B 180 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 9 ASP E 193 ? VAL E 197 ? ASP B 193 VAL B 197 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 10 ALA E 207 ? GLY E 227 ? ALA B 207 GLY B 227 1 ? 21 HELX_P HELX_P11 11 SER E 235 ? GLN E 240 ? SER B 235 GLN B 240 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 12 HIS F 6 ? ARG F 11 ? HIS C 6 ARG C 11 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 13 GLN F 28 ? GLU F 46 ? GLN C 28 GLU C 46 1 ? 19 HELX_P HELX_P14 14 LEU F 47 ? ALA F 50 ? LEU C 47 ALA C 50 5 ? 4 HELX_P HELX_P15 15 PRO F 73 ? GLY F 78 ? PRO C 73 GLY C 78 1 ? 6 HELX_P HELX_P16 16 GLU F 82 ? LYS F 93 ? GLU C 82 LYS C 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 17 ASN F 108 ? LEU F 111 ? ASN C 108 LEU C 111 5 ? 4 HELX_P HELX_P18 18 SER F 112 ? ARG F 126 ? SER C 112 ARG C 126 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 19 ALA F 129 ? SER F 144 ? ALA C 129 SER C 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P20 20 ILE F 157 ? ALA F 160 ? ILE C 157 ALA C 160 5 ? 4 HELX_P HELX_P21 21 LEU G 11 ? GLY G 16 ? LEU D 11 GLY D 16 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 22 GLY G 23 ? SER G 28 ? GLY D 23 SER D 28 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 23 SER G 52 ? GLY G 69 ? SER D 52 GLY D 69 1 ? 18 HELX_P HELX_P24 24 SER G 71 ? LYS G 85 ? SER D 71 LYS D 85 1 ? 15 HELX_P HELX_P25 25 VAL G 88 ? ARG G 100 ? VAL D 88 ARG D 100 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 26 ARG G 100 ? LEU G 108 ? ARG D 100 LEU D 108 1 ? 9 HELX_P HELX_P27 27 SER G 113 ? HIS G 123 ? SER D 113 HIS D 123 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 28 ALA G 149 ? ASN G 154 ? ALA D 149 ASN D 154 1 ? 6 HELX_P HELX_P29 29 LEU G 155 ? MET G 165 ? LEU D 155 MET D 165 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 30 ASP G 190 ? LEU G 194 ? ASP D 190 LEU D 194 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 31 ASN G 199 ? TYR G 207 ? ASN D 199 TYR D 207 1 ? 9 HELX_P HELX_P32 32 GLU H 50 ? ASN H 65 ? GLU E 50 ASN E 65 1 ? 16 HELX_P HELX_P33 33 GLY H 103 ? ALA H 113 ? GLY E 103 ALA E 113 1 ? 11 HELX_P HELX_P34 34 ASN H 127 ? ARG H 140 ? ASN E 127 ARG E 140 1 ? 14 HELX_P HELX_P35 35 THR H 144 ? ARG H 152 ? THR E 144 ARG E 152 1 ? 9 HELX_P HELX_P36 36 ASP I 15 ? TYR I 33 ? ASP F 15 TYR F 33 1 ? 19 HELX_P HELX_P37 37 PRO I 68 ? ASP I 70 ? PRO F 68 ASP F 70 5 ? 3 HELX_P HELX_P38 38 ARG I 71 ? ILE I 81 ? ARG F 71 ILE F 81 1 ? 11 HELX_P HELX_P39 39 ASP J 20 ? MET J 31 ? ASP G 20 MET G 31 1 ? 12 HELX_P HELX_P40 40 LYS J 35 ? THR J 54 ? LYS G 35 THR G 54 1 ? 20 HELX_P HELX_P41 41 GLU J 57 ? VAL J 69 ? GLU G 57 VAL G 69 1 ? 13 HELX_P HELX_P42 42 SER J 92 ? ARG J 111 ? SER G 92 ARG G 111 1 ? 20 HELX_P HELX_P43 43 ARG J 115 ? GLY J 130 ? ARG G 115 GLY G 130 1 ? 16 HELX_P HELX_P44 44 GLY J 132 ? ASN J 148 ? GLY G 132 ASN G 148 1 ? 17 HELX_P HELX_P45 45 ARG J 149 ? ARG J 155 ? ARG G 149 ARG G 155 5 ? 7 HELX_P HELX_P46 46 ASP K 4 ? ARG K 18 ? ASP H 4 ARG H 18 1 ? 15 HELX_P HELX_P47 47 SER K 29 ? GLU K 42 ? SER H 29 GLU H 42 1 ? 14 HELX_P HELX_P48 48 GLY K 96 ? ILE K 100 ? GLY H 96 ILE H 100 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 49 ARG K 102 ? LEU K 107 ? ARG H 102 LEU H 107 5 ? 6 HELX_P HELX_P50 50 THR K 120 ? GLY K 128 ? THR H 120 GLY H 128 1 ? 9 HELX_P HELX_P51 51 ASP L 32 ? PHE L 37 ? ASP I 32 PHE I 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P52 52 ARG L 42 ? ALA L 46 ? ARG I 42 ALA I 46 5 ? 5 HELX_P HELX_P53 53 LEU L 47 ? ALA L 52 ? LEU I 47 ALA I 52 1 ? 6 HELX_P HELX_P54 54 GLY L 69 ? TYR L 88 ? GLY I 69 TYR I 88 1 ? 20 HELX_P HELX_P55 55 TYR L 92 ? LEU L 96 ? TYR I 92 LEU I 96 5 ? 5 HELX_P HELX_P56 56 ASP M 12 ? ARG M 29 ? ASP J 12 ARG J 29 1 ? 18 HELX_P HELX_P57 57 ASN M 78 ? LEU M 85 ? ASN J 78 LEU J 85 1 ? 8 HELX_P HELX_P58 58 GLY N 45 ? GLY N 49 ? GLY K 45 GLY K 49 1 ? 5 HELX_P HELX_P59 59 SER N 53 ? GLY N 56 ? SER K 53 GLY K 56 5 ? 4 HELX_P HELX_P60 60 THR N 57 ? TYR N 75 ? THR K 57 TYR K 75 1 ? 19 HELX_P HELX_P61 61 GLY N 90 ? SER N 101 ? GLY K 90 SER K 101 1 ? 12 HELX_P HELX_P62 62 THR O 5 ? ARG O 11 ? THR L 5 ARG L 11 1 ? 7 HELX_P HELX_P63 63 SER O 115 ? GLY O 120 ? SER L 115 GLY L 120 5 ? 6 HELX_P HELX_P64 64 ARG P 14 ? TYR P 21 ? ARG M 14 TYR M 21 1 ? 8 HELX_P HELX_P65 65 GLY P 26 ? LYS P 36 ? GLY M 26 LYS M 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P66 66 THR P 49 ? TRP P 64 ? THR M 49 TRP M 64 1 ? 16 HELX_P HELX_P67 67 LEU P 66 ? GLY P 85 ? LEU M 66 GLY M 85 1 ? 20 HELX_P HELX_P68 68 CYS P 86 ? ARG P 91 ? CYS M 86 ARG M 91 1 ? 6 HELX_P HELX_P69 69 ALA P 107 ? GLY P 112 ? ALA M 107 GLY M 112 1 ? 6 HELX_P HELX_P70 70 ARG Q 3 ? THR Q 13 ? ARG N 3 THR N 13 1 ? 11 HELX_P HELX_P71 71 PHE Q 16 ? ALA Q 20 ? PHE N 16 ALA N 20 5 ? 5 HELX_P HELX_P72 72 ARG Q 41 ? GLY Q 51 ? ARG N 41 GLY N 51 1 ? 11 HELX_P HELX_P73 73 THR R 4 ? ALA R 16 ? THR O 4 ALA O 16 1 ? 13 HELX_P HELX_P74 74 SER R 24 ? LYS R 44 ? SER O 24 LYS O 44 1 ? 21 HELX_P HELX_P75 75 ASP R 49 ? ASP R 74 ? ASP O 49 ASP O 74 1 ? 26 HELX_P HELX_P76 76 ASP R 74 ? GLY R 86 ? ASP O 74 GLY O 86 1 ? 13 HELX_P HELX_P77 77 ASP S 52 ? VAL S 62 ? ASP P 52 VAL P 62 1 ? 11 HELX_P HELX_P78 78 THR S 67 ? ALA S 77 ? 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LEU X 354 GLU X 378 1 ? 25 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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D CYS 9 D ZN 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc9 metalc ? ? G CYS 12 SG ? ? ? 1_555 SJ ZN . ZN ? ? D CYS 12 D ZN 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc10 metalc ? ? G CYS 26 SG ? ? ? 1_555 SJ ZN . ZN ? ? D CYS 26 D ZN 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? metalc11 metalc ? ? G CYS 31 O ? ? ? 1_555 SJ ZN . ZN ? ? D CYS 31 D ZN 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc12 metalc ? ? G CYS 31 SG ? ? ? 1_555 SJ ZN . ZN ? ? D CYS 31 D ZN 5001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc13 metalc ? ? I ARG 80 O ? ? ? 1_555 VJ MG . MG ? ? F ARG 80 F MG 5008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc14 metalc ? ? O PRO 44 O ? ? ? 1_555 FK MG . MG ? ? L PRO 44 L MG 5017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? metalc15 metalc ? ? Q CYS 24 SG ? ? ? 1_555 GK ZN . ZN ? ? N CYS 24 N ZN 5002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.941 ? metalc16 metalc ? ? Q CYS 27 SG ? ? ? 1_555 GK ZN . ZN ? ? N CYS 27 N ZN 5002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? metalc17 metalc ? ? Q CYS 40 SG ? ? ? 1_555 GK ZN . ZN ? ? N CYS 40 N ZN 5002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.826 ? metalc18 metalc ? ? Q CYS 43 SG ? ? ? 1_555 GK ZN . ZN ? ? N CYS 43 N ZN 5002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.978 ? metalc19 metalc ? ? D A 77 OP2 ? ? ? 1_555 OJ MG . MG ? ? Y A 76 Y MG 5271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.500 ? metalc20 metalc ? ? B U 51 O4 ? ? ? 1_555 RI MG . MG ? ? Z U 50 Z MG 5248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc21 metalc ? ? A G 924 OP1 ? ? ? 1_555 MF MG . MG ? ? A G 945 A MG 5166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc22 metalc ? ? A U 1074 O4 ? ? ? 1_555 CG MG . MG ? ? A U 1090 A MG 5182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.530 ? metalc23 metalc ? ? A G 675 OP1 ? ? ? 1_555 WC MG . MG ? ? A G 690 A MG 5098 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc24 metalc ? ? A A 557 OP1 ? ? ? 1_555 UB MG . MG ? ? A A 572 A MG 5069 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc25 metalc ? ? A G 1440 O6 ? ? ? 1_555 TH MG . MG ? ? A G 1461 A MG 5225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.540 ? metalc26 metalc ? ? A A 762 OP1 ? ? ? 1_555 DE MG . MG ? ? A A 777 A MG 5131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? metalc27 metalc ? ? A U 1464 OP1 ? ? ? 1_555 XH MG . MG ? ? A U 1485 A MG 5229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc28 metalc ? ? A G 564 O6 ? ? ? 1_555 ZB MG . MG ? ? A G 579 A MG 5074 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.576 ? metalc29 metalc ? ? A C 1286 OP1 ? ? ? 1_555 CH MG . MG ? ? A C 1303 A MG 5208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? metalc30 metalc ? ? A C 755 OP1 ? ? ? 1_555 VD MG . MG ? ? A C 770 A MG 5123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? metalc31 metalc ? ? A G 1354 O6 ? ? ? 1_555 KH MG . MG ? ? A G 1370 A MG 5216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? metalc32 metalc ? ? A G 867 O6 ? ? ? 1_555 BF MG . MG ? ? A G 888 A MG 5155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? metalc33 metalc ? ? A G 1287 OP2 ? ? ? 1_555 CH MG . MG ? ? A G 1304 A MG 5208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.611 ? metalc34 metalc ? ? A G 758 OP1 ? ? ? 1_555 BE MG . MG ? ? A G 773 A MG 5129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc35 metalc ? ? A U 384 O4 ? ? ? 1_555 DB MG . MG ? ? A U 387 A MG 5052 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc36 metalc ? ? A G 315 OP2 ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? A G 318 A MG 5042 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? metalc37 metalc ? ? A G 1011 OP1 ? ? ? 1_555 WF MG . MG ? ? A G 1029 A MG 5176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc38 metalc ? ? A A 1094 OP2 ? ? ? 1_555 EG MG . MG ? ? A A 1110 A MG 5184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.620 ? metalc39 metalc ? ? A U 789 O4 ? ? ? 1_555 EE MG . MG ? ? A U 804 A MG 5132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc40 metalc ? ? A C 366 OP1 ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? A C 369 A MG 5051 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? metalc41 metalc ? ? A A 753 OP2 ? ? ? 1_555 UD MG . MG ? ? A A 768 A MG 5122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? metalc42 metalc ? ? A G 675 OP2 ? ? ? 1_555 XC MG . MG ? ? A G 690 A MG 5099 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? metalc43 metalc ? ? A C 913 OP1 ? ? ? 1_555 JF MG . MG ? ? A C 934 A MG 5163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? metalc44 metalc ? ? A A 777 OP2 ? ? ? 1_555 KE MG . MG ? ? A A 792 A MG 5138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? metalc45 metalc ? ? N LEU 103 O ? ? ? 1_555 EK MG . MG ? ? K LEU 103 K MG 5016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? metalc46 metalc ? ? A C 1172 O2 ? ? ? 1_555 EG MG . MG ? ? A C 1189 A MG 5184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc47 metalc ? ? A C 1008 OP1 ? A ? 1_555 UF MG . MG ? ? A C 102 A MG 5174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc48 metalc ? ? A U 1360 OP2 ? ? ? 1_555 MH MG . MG ? ? A U 1376 A MG 5218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc49 metalc ? ? A G 1173 O6 ? ? ? 1_555 RG MG . MG ? ? A G 1190 A MG 5197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? metalc50 metalc ? ? A A 953 "O2'" ? ? ? 1_555 PF MG . MG ? ? A A 974 A MG 5169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc51 metalc ? ? D C 62 OP2 ? ? ? 1_555 LJ MG . MG ? ? Y C 61 Y MG 5268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? metalc52 metalc ? ? A A 1482 OP2 ? ? ? 1_555 DI MG . MG ? ? A A 1503 A MG 5235 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc53 metalc ? ? A G 882 OP1 ? ? ? 1_555 CF MG . MG ? ? A G 903 A MG 5156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc54 metalc ? ? A G 1092 O6 ? ? ? 1_555 DG MG . MG ? ? A G 1108 A MG 5183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.675 ? metalc55 metalc ? ? A G 1483 OP2 ? ? ? 1_555 EI MG . MG ? ? A G 1504 A MG 5236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc56 metalc ? ? A G 756 OP2 ? ? ? 1_555 YD MG . MG ? ? A G 771 A MG 5126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc57 metalc ? ? A G 1011 OP2 ? ? ? 1_555 XF MG . MG ? ? A G 1029 A MG 5177 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? metalc58 metalc ? ? A G 635 OP2 ? ? ? 1_555 MC MG . MG ? ? A G 650 A MG 5087 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.695 ? metalc59 metalc ? ? A A 916 OP2 ? ? ? 1_555 KF MG . MG ? ? A A 937 A MG 5164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc60 metalc ? ? A G 1500 OP2 ? ? ? 1_555 II MG . MG ? ? A G 1521 A MG 5240 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.702 ? metalc61 metalc ? ? A A 839 OP2 ? ? ? 1_555 XE MG . MG ? ? A A 860 A MG 5151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? metalc62 metalc ? ? A C 349 OP2 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A C 352 A MG 5049 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? metalc63 metalc ? ? A A 1478 "O3'" ? ? ? 1_555 CI MG . MG ? ? A A 1499 A MG 5234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? metalc64 metalc ? ? A G 560 OP1 ? ? ? 1_555 WB MG . MG ? ? A G 575 A MG 5071 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.717 ? metalc65 metalc ? ? A G 993 O6 ? ? ? 1_555 TF MG . MG ? ? A G 1013 A MG 5173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? metalc66 metalc ? ? A G 577 OP2 ? ? ? 1_555 FC MG . MG ? ? A G 592 A MG 5080 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? metalc67 metalc ? ? A G 577 OP1 ? ? ? 1_555 EC MG . MG ? ? A G 592 A MG 5079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? metalc68 metalc ? ? A G 403 OP2 ? ? ? 1_555 FB MG . MG ? ? A G 406 A MG 5054 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? metalc69 metalc ? ? A C 755 "O3'" ? ? ? 1_555 XD MG . MG ? ? A C 770 A MG 5125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? metalc70 metalc ? ? A G 107 O6 ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A G 112 A MG 5031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? metalc71 metalc ? ? A A 1479 OP1 ? ? ? 1_555 CI MG . MG ? ? A A 1500 A MG 5234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc72 metalc ? ? A C 951 OP1 ? ? ? 1_555 OF MG . MG ? ? A C 972 A MG 5168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? metalc73 metalc ? ? A U 774 O4 ? ? ? 1_555 KE MG . MG ? ? A U 789 A MG 5138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? metalc74 metalc ? ? A G 743 OP1 ? ? ? 1_555 QD MG . MG ? ? A G 758 A MG 5118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? metalc75 metalc ? ? A C 949 OP2 ? ? ? 1_555 NF MG . MG ? ? A C 970 A MG 5167 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc76 metalc ? ? A U 87 OP2 ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? A U 89 A MG 5029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.757 ? metalc77 metalc ? ? A U 1491 O4 ? ? ? 1_555 HI MG . MG ? ? A U 1512 A MG 5239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.761 ? metalc78 metalc ? ? X ASP 5 OD2 ? ? ? 1_555 CH MG . MG ? ? U ASP 5 A MG 5208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? metalc79 metalc ? ? D G 9 OP2 ? ? ? 1_555 FJ MG . MG ? ? Y G 9 Y MG 5262 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc80 metalc ? ? B G 50 O6 ? ? ? 1_555 RI MG . MG ? ? Z G 49 Z MG 5248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? metalc81 metalc ? ? A A 295 OP2 ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? A A 298 A MG 5041 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.786 ? metalc82 metalc ? ? B C 70 O2 ? ? ? 1_555 YI MG . MG ? ? Z C 69 Z MG 5255 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? metalc83 metalc ? ? A A 558 OP2 ? ? ? 1_555 VB MG . MG ? ? A A 573 A MG 5070 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? metalc84 metalc ? ? I ARG 82 O ? ? ? 1_555 VJ MG . MG ? ? F ARG 82 F MG 5008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? metalc85 metalc ? ? A C 755 "O2'" ? ? ? 1_555 XD MG . MG ? ? A C 770 A MG 5125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? metalc86 metalc ? ? A A 661 OP1 ? ? ? 1_555 RC MG . MG ? ? A A 676 A MG 5093 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.800 ? metalc87 metalc ? ? A C 575 OP2 ? ? ? 1_555 DC MG . MG ? ? A C 590 A MG 5078 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.801 ? metalc88 metalc ? ? A G 373 O6 ? ? ? 1_555 DB MG . MG ? ? A G 376 A MG 5052 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? metalc89 metalc ? ? A A 1221 OP2 ? ? ? 1_555 WG MG . MG ? ? A A 1238 A MG 5202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.807 ? metalc90 metalc ? ? A G 1467 OP2 ? ? ? 1_555 YH MG . MG ? ? A G 1488 A MG 5230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.813 ? metalc91 metalc ? ? B G 65 OP2 ? ? ? 1_555 VI MG . MG ? ? Z G 64 Z MG 5252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.813 ? metalc92 metalc ? ? A G 589 O6 ? ? ? 1_555 JC MG . MG ? ? A G 604 A MG 5084 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.817 ? metalc93 metalc ? ? A G 1161 O6 ? ? ? 1_555 OG MG . MG ? ? A G 1178 A MG 5194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.817 ? metalc94 metalc ? ? A G 1045 OP1 ? ? ? 1_555 RG MG . MG ? ? A G 1061 A MG 5197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.826 ? metalc95 metalc ? ? A C 835 OP2 ? ? ? 1_555 WE MG . MG ? ? A C 856 A MG 5150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.827 ? metalc96 metalc ? ? A G 1277 O6 ? ? ? 1_555 BH MG . MG ? ? A G 1294 A MG 5207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? metalc97 metalc ? ? W GLN 42 OE1 ? ? ? 1_555 KK MG . MG ? ? T GLN 42 T MG 5021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.837 ? metalc98 metalc ? ? A G 79 OP2 ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? A G 80 A MG 5027 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.838 ? metalc99 metalc ? ? A A 346 OP1 ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? A A 349 A MG 5047 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.843 ? metalc100 metalc ? ? A C 311 "O3'" ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? A C 314 A MG 5042 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.847 ? metalc101 metalc ? ? A C 50 O2 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? A C 48 A MG 5026 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.847 ? metalc102 metalc ? ? D G 64 O6 ? ? ? 1_555 NJ MG . MG ? ? Y G 63 Y MG 5270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? metalc103 metalc ? ? A G 9 OP1 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? A G 7 A MG 5022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.850 ? metalc104 metalc ? ? B C 69 OP2 ? ? ? 1_555 XI MG . MG ? ? Z C 68 Z MG 5254 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.855 ? metalc105 metalc ? ? D A 59 OP2 ? ? ? 1_555 KJ MG . MG ? ? Y A 58 Y MG 5267 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.856 ? metalc106 metalc ? ? A G 354 O6 ? ? ? 1_555 BB MG . MG ? ? A G 357 A MG 5050 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc107 metalc ? ? A G 967 OP1 ? ? ? 1_555 QF MG . MG ? ? A G 988 A MG 5170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.872 ? metalc108 metalc ? ? A G 577 O6 ? ? ? 1_555 GC MG . MG ? ? A G 592 A MG 5081 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? metalc109 metalc ? ? A G 512 OP1 ? ? ? 1_555 QB MG . MG ? ? A G 527 A MG 5065 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? metalc110 metalc ? ? A A 326 OP2 ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? A A 329 A MG 5044 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.886 ? metalc111 metalc ? ? A G 1403 O6 ? ? ? 1_555 QH MG . MG ? ? A G 1419 A MG 5222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc112 metalc ? ? A G 676 OP2 ? ? ? 1_555 WC MG . MG ? ? A G 691 A MG 5098 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.895 ? metalc113 metalc ? ? A G 92 O6 ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? A G 95 A MG 5030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.902 ? metalc114 metalc ? ? D C 1 "O5'" ? ? ? 1_555 CJ MG . MG ? ? Y C 1 Y MG 5259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.902 ? metalc115 metalc ? ? D A 14 OP2 ? ? ? 1_555 GJ MG . MG ? ? Y A 14 Y MG 5263 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? metalc116 metalc ? ? A G 1441 O6 ? ? ? 1_555 TH MG . MG ? ? A G 1462 A MG 5225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.907 ? metalc117 metalc ? ? A C 692 OP1 ? ? ? 1_555 CD MG . MG ? ? A C 707 A MG 5104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? metalc118 metalc ? ? A G 1150 OP2 ? ? ? 1_555 IG MG . MG ? ? A G 1166 A MG 5188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.912 ? metalc119 metalc ? ? A G 670 O6 ? ? ? 1_555 VC MG . MG ? ? A G 685 A MG 5097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? metalc120 metalc ? ? A G 435 O6 ? ? ? 1_555 JB MG . MG ? ? A G 438 A MG 5058 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.917 ? metalc121 metalc ? ? A U 1485 OP2 ? ? ? 1_555 FI MG . MG ? ? A U 1506 A MG 5237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.918 ? metalc122 metalc ? ? A A 1359 OP1 ? ? ? 1_555 MH MG . MG ? ? A A 1375 A MG 5218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc123 metalc ? ? A G 656 "O3'" ? ? ? 1_555 OC MG . MG ? ? A G 671 A MG 5089 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.929 ? metalc124 metalc ? ? A G 1276 "O2'" ? ? ? 1_555 AH MG . MG ? ? A G 1293 A MG 5206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.930 ? metalc125 metalc ? ? D G 7 OP1 ? ? ? 1_555 GJ MG . MG ? ? Y G 7 Y MG 5263 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.937 ? metalc126 metalc ? ? N GLN 99 O ? ? ? 1_555 EK MG . MG ? ? K GLN 99 K MG 5016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc127 metalc ? ? A G 1500 OP1 ? ? ? 1_555 CI MG . MG ? ? A G 1521 A MG 5234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.950 ? metalc128 metalc ? ? A G 1276 O6 ? ? ? 1_555 BH MG . MG ? ? A G 1293 A MG 5207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.951 ? metalc129 metalc ? ? A U 1477 O4 ? ? ? 1_555 BI MG . MG ? ? A U 1498 A MG 5233 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.952 ? metalc130 metalc ? ? A G 252 OP2 ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? A G 255 A MG 5036 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.959 ? metalc131 metalc ? ? A A 1481 OP2 ? ? ? 1_555 EI MG . MG ? ? A A 1502 A MG 5236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.961 ? metalc132 metalc ? ? A G 471 "O4'" ? ? ? 1_555 NB MG . MG ? ? A G 485 A MG 5062 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.963 ? metalc133 metalc ? ? A U 1501 O4 ? ? ? 1_555 HI MG . MG ? ? A U 1522 A MG 5239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.969 ? metalc134 metalc ? ? A C 664 OP2 ? ? ? 1_555 TC MG . MG ? ? A C 679 A MG 5095 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.971 ? metalc135 metalc ? ? I ILE 81 O ? ? ? 1_555 WJ MG . MG ? ? F ILE 81 F MG 5009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.976 ? metalc136 metalc ? ? B G 23 OP2 ? ? ? 1_555 PI MG . MG ? ? Z G 22 Z MG 5246 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.979 ? metalc137 metalc ? ? A C 369 "O2'" ? ? ? 1_555 DB MG . MG ? ? A C 372 A MG 5052 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.980 ? metalc138 metalc ? ? A G 254 O6 ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? A G 257 A MG 5037 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.984 ? metalc139 metalc ? ? A G 821 O6 ? ? ? 1_555 TE MG . MG ? ? A G 836 A MG 5147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.988 ? metalc140 metalc ? ? A U 15 OP1 ? ? ? 1_555 QB MG . MG ? ? A U 13 A MG 5065 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.988 ? metalc141 metalc ? ? A U 935 "O4'" ? ? ? 1_555 UG MG . MG ? ? A U 956 A MG 5200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.994 ? metalc142 metalc ? ? A U 372 O4 ? ? ? 1_555 DB MG . MG ? ? A U 375 A MG 5052 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.995 ? metalc143 metalc ? ? A U 588 O4 ? ? ? 1_555 JC MG . MG ? ? A U 603 A MG 5084 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.996 ? metalc144 metalc ? ? A G 535 OP1 ? ? ? 1_555 TB MG . MG ? ? A G 550 A MG 5068 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.997 ? metalc145 metalc ? ? A G 141 O6 ? ? ? 1_555 JA MG . MG ? ? A G 145 A MG 5032 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.998 ? hydrog1 hydrog ? ? A G 9 N2 ? ? ? 1_555 A U 545 O4 ? ? A G 7 A U 560 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 11 N1 ? ? ? 1_555 A C 27 N3 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 11 N2 ? ? ? 1_555 A C 27 O2 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 11 O6 ? ? ? 1_555 A C 27 N4 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog5 hydrog ? ? A A 12 N1 ? ? ? 1_555 A U 26 N3 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? A A 12 N6 ? ? ? 1_555 A U 26 O4 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog7 hydrog ? ? A G 13 N1 ? ? ? 1_555 A C 25 N3 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog8 hydrog ? ? A G 13 N2 ? ? ? 1_555 A C 25 O2 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog9 hydrog ? ? A G 13 O6 ? ? ? 1_555 A C 25 N4 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog10 hydrog ? ? A U 14 N3 ? ? ? 1_555 A G 24 O6 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog11 hydrog ? ? A U 14 O2 ? ? ? 1_555 A G 24 N1 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog12 hydrog ? ? A U 15 O4 ? ? ? 1_555 A U 22 N3 ? ? A U 13 A U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? hydrog13 hydrog ? ? A U 15 N3 ? ? ? 1_555 A A 894 N7 ? ? A U 13 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog14 hydrog ? ? A U 15 O4 ? ? ? 1_555 A A 894 N6 ? ? A U 13 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog15 hydrog ? ? A G 17 N1 ? ? ? 1_555 A U 899 O2 ? ? A G 15 A U 920 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog16 hydrog ? ? A G 17 O6 ? ? ? 1_555 A U 899 N3 ? ? A G 15 A U 920 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog17 hydrog ? ? A A 18 N6 ? ? ? 1_555 A A 898 N1 ? ? A A 16 A A 919 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? hydrog18 hydrog ? ? A U 19 N3 ? ? ? 1_555 A A 897 N1 ? ? A U 17 A A 918 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog19 hydrog ? ? A U 19 O4 ? ? ? 1_555 A A 897 N6 ? ? A U 17 A A 918 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog20 hydrog ? ? A U 19 O2 ? ? ? 1_555 A G 1063 N2 ? ? A U 17 A G 1079 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? hydrog21 hydrog ? ? A C 20 N3 ? ? ? 1_555 A G 896 N1 ? ? A C 18 A G 917 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog22 hydrog ? ? A C 20 N4 ? ? ? 1_555 A G 896 O6 ? ? A C 18 A G 917 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog23 hydrog ? ? A C 20 O2 ? ? ? 1_555 A G 896 N2 ? ? A C 18 A G 917 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog24 hydrog ? ? A C 21 N3 ? ? ? 1_555 A G 895 N1 ? ? A C 19 A G 916 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog25 hydrog ? ? A C 21 N4 ? ? ? 1_555 A G 895 O6 ? ? A C 19 A G 916 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog26 hydrog ? ? A C 21 O2 ? ? ? 1_555 A G 895 N2 ? ? A C 19 A G 916 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog27 hydrog ? ? A U 22 O2 ? ? ? 1_555 A A 894 N6 ? ? A U 20 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog28 hydrog ? ? A G 23 N2 ? ? ? 1_555 A A 893 N7 ? ? A G 21 A A 914 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog29 hydrog ? ? A G 23 N3 ? ? ? 1_555 A A 893 N6 ? ? A G 21 A A 914 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog30 hydrog ? ? A G 24 N2 ? ? ? 1_555 A A 892 N3 ? ? A G 22 A A 913 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog31 hydrog ? ? A C 27 N4 ? ? ? 1_555 A A 544 N1 ? ? A C 25 A A 559 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-A MISPAIR' ? ? hydrog32 hydrog ? ? A A 28 N6 ? ? ? 1_555 A G 543 N3 ? ? A A 26 A G 558 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog33 hydrog ? ? A A 28 N7 ? ? ? 1_555 A G 543 N2 ? ? A A 26 A G 558 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog34 hydrog ? ? A G 29 N1 ? ? ? 1_555 A C 541 N3 ? ? A G 27 A C 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog35 hydrog ? ? A G 29 N2 ? ? ? 1_555 A C 541 O2 ? ? A G 27 A C 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog36 hydrog ? ? A G 29 O6 ? ? ? 1_555 A C 541 N4 ? ? A G 27 A C 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog37 hydrog ? ? A G 30 N1 ? ? ? 1_555 A C 540 N3 ? ? A G 28 A C 555 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog38 hydrog ? ? A G 30 N2 ? ? ? 1_555 A C 540 O2 ? ? A G 28 A C 555 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog39 hydrog ? ? A G 30 O6 ? ? ? 1_555 A C 540 N4 ? ? A G 28 A C 555 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog40 hydrog ? ? A G 31 N1 ? ? ? 1_555 A C 539 N3 ? ? A G 29 A C 554 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog41 hydrog ? ? A G 31 N2 ? ? ? 1_555 A C 539 O2 ? ? A G 29 A C 554 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog42 hydrog ? ? A G 31 O6 ? ? ? 1_555 A C 539 N4 ? ? A G 29 A C 554 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog43 hydrog ? ? A U 32 N3 ? ? ? 1_555 A A 538 N1 ? ? A U 30 A A 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog44 hydrog ? ? A U 32 O4 ? ? ? 1_555 A A 538 N6 ? ? A U 30 A A 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog45 hydrog ? ? A A 34 N1 ? ? ? 1_555 A U 537 N3 ? ? A A 32 A U 552 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog46 hydrog ? ? A A 34 N6 ? ? ? 1_555 A U 537 O4 ? ? A A 32 A U 552 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog47 hydrog ? ? A A 35 N1 ? ? ? 1_555 A U 536 N3 ? ? A A 33 A U 551 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog48 hydrog ? ? A A 35 N6 ? ? ? 1_555 A U 536 O4 ? ? A A 33 A U 551 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog49 hydrog ? ? A C 36 N3 ? ? ? 1_555 A G 535 N1 ? ? A C 34 A G 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog50 hydrog ? ? A C 36 N4 ? ? ? 1_555 A G 535 O6 ? ? A C 34 A G 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog51 hydrog ? ? A C 36 O2 ? ? ? 1_555 A G 535 N2 ? ? A C 34 A G 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog52 hydrog ? ? A G 37 N1 ? ? ? 1_555 A C 534 N3 ? ? A G 35 A C 549 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog53 hydrog ? ? A G 37 N2 ? ? ? 1_555 A C 534 O2 ? ? A G 35 A C 549 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog54 hydrog ? ? 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'(segid BL31)' # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal PHENIX refinement '(phenix.refine)' ? 1 XDS 'data reduction' . ? 2 XDS 'data scaling' . ? 3 CNS phasing 1.2 ? 4 # _pdbx_entry_details.compound_details ;THIS FILE, 3F1G, CONTAINS THE 30S SUBUNIT, MRNA, RF2 AND TWO TRNAS OF THE SECOND 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES AND ARE DEPOSITED THIS WAY: 70S RIBOSOME, BIOMOLECULE I: 3F1E (30S SUBUNIT, MRNA, RF2 AND P- AND E-SITE TRNAS), 3F1F (50S SUBUNIT); 70S RIBOSOME, BIOMOLECULE II: 3F1G (30S SUBUNIT, MRNA, RF2 AND P- AND E-SITE TRNAS), 3F1H (50S SUBUNIT). ; _pdbx_entry_details.sequence_details ;E.COLI NUMBERING IS USED FOR 5S, 16S AND 23S RRNA. P- AND E-TRNA (TRNA FMET) HAVE NUMBERING ACCORDING TO THE CANONICAL YEAST TRNA PHE. RF2 AND RIBOSOMAL PROTEINS HAVE NUMBERING BASED ON THE PREDICTED SEQUENCE POSITION OF THE START METHIONINE (POSITION 1). ; _pdbx_entry_details.entry_id 3F1G _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 CG K HIS 116 ? ? 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? -38.95 127.33 209 1 GLU M 67 ? ? 54.84 -154.14 210 1 ARG M 94 ? ? -151.35 11.64 211 1 GLN M 101 ? ? -57.03 -145.38 212 1 ARG M 104 ? ? -65.19 14.86 213 1 ASN M 106 ? ? 40.58 -144.35 214 1 ALA M 107 ? ? 59.46 16.37 215 1 THR M 116 ? ? 53.23 -115.09 216 1 VAL M 117 ? ? 63.17 114.08 217 1 ARG N 3 ? ? -130.47 -33.79 218 1 THR N 13 ? ? 41.89 76.64 219 1 PHE N 16 ? ? -35.34 144.34 220 1 ARG N 19 ? ? -65.88 2.27 221 1 ARG N 23 ? ? -171.21 125.08 222 1 ARG N 26 ? ? -81.91 -89.95 223 1 GLN N 52 ? ? -74.34 23.54 224 1 SER N 60 ? ? -170.83 129.94 225 1 PHE O 18 ? ? -173.57 130.60 226 1 VAL O 29 ? ? -53.65 -72.73 227 1 PHE P 9 ? ? -146.33 -147.76 228 1 HIS P 13 ? ? 59.34 -6.73 229 1 ASN P 14 ? ? -116.56 68.58 230 1 ALA P 24 ? ? -48.55 -19.40 231 1 ASP P 29 ? ? -94.49 41.51 232 1 GLU P 34 ? ? 173.98 120.51 233 1 TYR P 39 ? ? -160.43 109.94 234 1 TRP P 48 ? ? -59.42 2.00 235 1 LYS P 50 ? ? -176.49 138.39 236 1 ASP P 52 ? ? -67.35 77.52 237 1 GLU P 54 ? ? -57.36 -75.96 238 1 ALA P 64 ? ? -171.45 100.20 239 1 VAL P 79 ? 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Y GLN 6 213 1 Y 1 X SER 7 ? Y SER 7 214 1 Y 1 X ALA 8 ? Y ALA 8 215 1 Y 1 X ILE 9 ? Y ILE 9 216 1 Y 1 X LEU 10 ? Y LEU 10 217 1 Y 1 X VAL 11 ? Y VAL 11 218 1 Y 1 X LYS 12 ? Y LYS 12 219 1 Y 1 X VAL 13 ? Y VAL 13 220 1 Y 1 X TRP 14 ? Y TRP 14 221 1 Y 1 X THR 15 ? Y THR 15 222 1 Y 1 X TRP 16 ? 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