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HAdV-5 'Human adenovirus 5' 28285 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP HEX_ADE05 P04133 1 ;MATPSMMPQWSYMHISGQDASEYLSPGLVQFARATETYFSLNNKFRNPTVAPTHDVTTDRSQRLTLRFIPVDREDTAYSY KARFTLAVGDNRVLDMASTYFDIRGVLDRGPTFKPYSGTAYNALAPKGAPNPCEWDEAATALEINLEEEDDDNEDEVDEQ AEQQKTHVFGQAPYSGINITKEGIQIGVEGQTPKYADKTFQPEPQIGESQWYETEINHAAGRVLKKTTPMKPCYGSYAKP TNENGGQGILVKQQNGKLESQVEMQFFSTTEATAGNGDNLTPKVVLYSEDVDIETPDTHISYMPTIKEGNSRELMGQQSM PNRPNYIAFRDNFIGLMYYNSTGNMGVLAGQASQLNAVVDLQDRNTELSYQLLLDSIGDRTRYFSMWNQAVDSYDPDVRI IENHGTEDELPNYCFPLGGVINTETLTKVKPKTGQENGWEKDATEFSDKNEIRVGNNFAMEINLNANLWRNFLYSNIALY LPDKLKYSPSNVKISDNPNTYDYMNKRVVAPGLVDCYINLGARWSLDYMDNVNPFNHHRNAGLRYRSMLLGNGRYVPFHI QVPQKFFAIKNLLLLPGSYTYEWNFRKDVNMVLQSSLGNDLRVDGASIKFDSICLYATFFPMAHNTASTLEAMLRNDTND QSFNDYLSAANMLYPIPANATNVPISIPSRNWAAFRGWAFTRLKTKETPSLGSGYDPYYTYSGSIPYLDGTFYLNHTFKK VAITFDSSVSWPGNDRLLTPNEFEIKRSVDGEGYNVAQCNMTKDWFLVQMLANYNIGYQGFYIPESYKDRMYSFFRNFQP MSRQVVDDTKYKDYQQVGILHQHNNSGFVGYLAPTMREGQAYPANFPYPLIGKTAVDSITQKKFLCDRTLWRIPFSSNFM SMGALTDLGQNLLYANSAHALDMTFEVDPMDEPTLLYVLFEVFDVVRVHRPHRGVIETVYLRTPFSAGNATT ; 1 ? 2 UNP PEN3_ADE05 P12538 2 ;MRRAAMYEEGPPPSYESVVSAAPVAAALGSPFDAPLDPPFVPPRYLRPTGGRNSIRYSELAPLFDTTRVYLVDNKSTDVA SLNYQNDHSNFLTTVIQNNDYSPGEASTQTINLDDRSHWGGDLKTILHTNMPNVNEFMFTNKFKARVMVSRLPTKDNQVE LKYEWVEFTLPEGNYSETMTIDLMNNAIVEHYLKVGRQNGVLESDIGVKFDTRNFRLGFDPVTGLVMPGVYTNEAFHPDI ILLPGCGVDFTHSRLSNLLGIRKRQPFQEGFRITYDDLEGGNIPALLDVDAYQASLKDDTEQGGGGAGGSNSSGSGAEEN SNAAAAAMQPVEDMNDHAIRGDTFATRAEEKRAEAEAAAEAAAPAAQPEVEKPQKKPVIKPLTEDSKKRSYNLISNDSTF TQYRSWYLAYNYGDPQTGIRSWTLLCTPDVTCGSEQVYWSLPDMMQDPVTFRSTRQISNFPVVGAELLPVHSKSFYNDQA VYSQLIRQFTSLTHVFNRFPENQILARPPAPTITTVSENVPALTDHGTLPLRNSIGGVQRVTITDARRRTCPYVYKALGI VSPRVLSSRTF ; 1 ? 3 UNP HEX3_ADE05 P12537 3 ;MMQDATDPAVRAALQSQPSGLNSTDDWRQVMDRIMSLTARNPDAFRQQPQANRLSAILEAVVPARANPTHEKVLAIVNAL AENRAIRPDEAGLVYDALLQRVARYNSGNVQTNLDRLVGDVREAVAQRERAQQQGNLGSMVALNAFLSTQPANVPRGQED YTNFVSALRLMVTETPQSEVYQSGPDYFFQTSRQGLQTVNLSQAFKNLQGLWGVRAPTGDRATVSSLLTPNSRLLLLLIA PFTDSGSVSRDTYLGHLLTLYREAIGQAHVDEHTFQEITSVSRALGQEDTGSLEATLNYLLTNRRQKIPSLHSLNSEEER ILRYVQQSVSLNLMRDGVTPSVALDMTARNMEPGMYASNRPFINRLMDYLHRAAAVNPEYFTNAILNPHWLPPPGFYTGG FEVPEGNDGFLWDDIDDSVFSPQPQTLLELQQREQAEAALRKESFRRPSSLSDLGAAAPRSDASSPFPSLIGSLTSTRTT RPRLLGEEEYLNNSLLQPQREKNLPPAFPNNGIESLVDKMSRWKTYAQEHRDVPGPRPPTRRQRHDRQRGLVWEDDDSAD DSSVLDLGGSGNPFAHLRPRLGRMF ; 1 ? 4 UNP HEX8_ADE05 P24936 4 ;MSKEIPTPYMWSYQPQMGLAAGAAQDYSTRINYMSAGPHMISRVNGIRAHRNRILLEQAAITTTPRNNLNPRSWPAALVY QESPAPTTVVLPRDAQAEVQMTNSGAQLAGGFRHRVRSPGQGITHLTIRGRGIQLNDESVSSSLGLRPDGTFQIGGAGRP SFTPRQAILTLQTSSSEPRSGGIGTLQFIEEFVPSVYFNPFSGPPGHYPDQFIPNFDAVKDSADGYD ; 1 ? 5 UNP HEX9_ADE05 P03281 5 ;MSTNSFDGSIVSSYLTTRMPPWAGVRQNVMGSSIDGRPVLPANSTTLTYETVSGTPLETAASAAASAAAATARGIVTDFA FLSPLASSAASRSSARDDKLTALLAQLDSLTRELNVVSQQLLDLRQQVSALKASSPPNAV ; 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3IYN A 1 ? 952 ? 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P03281 1 ? 140 ? 1 140 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 3IYN _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.crystals_number ? # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp ? _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type ? # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength . _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _refine_hist.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 99595 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 99595 _refine_hist.d_res_high . _refine_hist.d_res_low . # _struct.entry_id 3IYN _struct.title '3.6-Angstrom cryoEM structure of human adenovirus type 5' _struct.pdbx_descriptor 'Hexon protein, Penton protein, Peripentonal hexon-associated protein, Hexon-associated protein' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3IYN _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS _struct_keywords.text ;human adenovirus, cryoEM, 3D reconstruction, full-atom model, interaction network, Capsid protein, Hexon protein, penton base protein, Virion, Hexon-associated protein, icosahedral virus, VIRUS ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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ALA A 540 LEU A 549 1 ? 10 HELX_P HELX_P18 18 VAL A 589 ? VAL A 592 ? VAL A 588 VAL A 591 1 ? 4 HELX_P HELX_P19 19 HIS A 624 ? ARG A 635 ? HIS A 623 ARG A 634 1 ? 12 HELX_P HELX_P20 20 ASP A 637 ? ASN A 639 ? ASP A 636 ASN A 638 1 ? 3 HELX_P HELX_P21 21 THR A 685 ? GLU A 687 ? THR A 684 GLU A 686 1 ? 3 HELX_P HELX_P22 22 PRO A 706 ? ASP A 709 ? PRO A 705 ASP A 708 1 ? 4 HELX_P HELX_P23 23 ASN A 715 ? THR A 717 ? ASN A 714 THR A 716 1 ? 3 HELX_P HELX_P24 24 LYS A 763 ? TYR A 774 ? LYS A 762 TYR A 773 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 25 SER A 786 ? LYS A 788 ? SER A 785 LYS A 787 1 ? 3 HELX_P HELX_P26 26 PHE A 794 ? ASN A 797 ? PHE A 793 ASN A 796 1 ? 4 HELX_P HELX_P27 27 ILE A 819 ? HIS A 821 ? ILE A 818 HIS A 820 1 ? 3 HELX_P HELX_P28 28 LEU A 888 ? GLN A 890 ? LEU A 887 GLN A 889 1 ? 3 HELX_P HELX_P29 29 LEU A 892 ? ASN A 896 ? LEU A 891 ASN A 895 1 ? 5 HELX_P HELX_P30 30 PRO B 8 ? MET B 13 ? PRO B 7 MET B 12 1 ? 6 HELX_P HELX_P31 31 ALA B 20 ? TYR B 23 ? ALA B 19 TYR B 22 1 ? 4 HELX_P HELX_P32 32 PRO B 26 ? ALA B 34 ? PRO B 25 ALA B 33 1 ? 9 HELX_P HELX_P33 33 ASN B 42 ? LYS B 44 ? ASN B 41 LYS B 43 1 ? 3 HELX_P HELX_P34 34 MET B 96 ? SER B 98 ? MET B 95 SER B 97 1 ? 3 HELX_P HELX_P35 35 ARG B 312 ? GLY B 316 ? ARG B 311 GLY B 315 1 ? 5 HELX_P HELX_P36 36 ASP B 331 ? PHE B 333 ? ASP B 330 PHE B 332 1 ? 3 HELX_P HELX_P37 37 THR B 342 ? ASN B 344 ? THR B 341 ASN B 343 1 ? 3 HELX_P HELX_P38 38 THR B 366 ? ILE B 377 ? THR B 365 ILE B 376 1 ? 12 HELX_P HELX_P39 39 SER B 385 ? TRP B 387 ? SER B 384 TRP B 386 1 ? 3 HELX_P HELX_P40 40 PRO B 396 ? ARG B 399 ? PRO B 395 ARG B 398 1 ? 4 HELX_P HELX_P41 41 LEU B 464 ? TYR B 480 ? LEU B 463 TYR B 479 1 ? 17 HELX_P HELX_P42 42 ASP B 483 ? LEU B 485 ? ASP B 482 LEU B 484 1 ? 3 HELX_P HELX_P43 43 TYR B 501 ? LYS B 506 ? TYR B 500 LYS B 505 1 ? 6 HELX_P HELX_P44 44 PRO B 511 ? VAL B 514 ? PRO B 510 VAL B 513 1 ? 4 HELX_P HELX_P45 45 ASP B 527 ? ASP B 530 ? ASP B 526 ASP B 529 1 ? 4 HELX_P HELX_P46 46 ALA B 541 ? LEU B 550 ? ALA B 540 LEU B 549 1 ? 10 HELX_P HELX_P47 47 VAL B 589 ? VAL B 592 ? VAL B 588 VAL B 591 1 ? 4 HELX_P HELX_P48 48 HIS B 624 ? ARG B 635 ? HIS B 623 ARG B 634 1 ? 12 HELX_P HELX_P49 49 ASP B 637 ? ASN B 639 ? ASP B 636 ASN B 638 1 ? 3 HELX_P HELX_P50 50 THR B 685 ? GLU B 687 ? THR B 684 GLU B 686 1 ? 3 HELX_P HELX_P51 51 PRO B 706 ? ASP B 709 ? PRO B 705 ASP B 708 1 ? 4 HELX_P HELX_P52 52 ASN B 715 ? THR B 717 ? ASN B 714 THR B 716 1 ? 3 HELX_P HELX_P53 53 LYS B 763 ? TYR B 774 ? LYS B 762 TYR B 773 1 ? 12 HELX_P HELX_P54 54 SER B 786 ? LYS B 788 ? SER B 785 LYS B 787 1 ? 3 HELX_P HELX_P55 55 PHE B 794 ? ASN B 797 ? PHE B 793 ASN B 796 1 ? 4 HELX_P HELX_P56 56 ILE B 819 ? HIS B 821 ? ILE B 818 HIS B 820 1 ? 3 HELX_P HELX_P57 57 LEU B 888 ? GLN B 890 ? LEU B 887 GLN B 889 1 ? 3 HELX_P HELX_P58 58 LEU B 892 ? ASN B 896 ? LEU B 891 ASN B 895 1 ? 5 HELX_P HELX_P59 59 GLN C 9 ? HIS C 14 ? 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T . n T 5 135 SER 135 135 ? ? ? T . n T 5 136 PRO 136 136 ? ? ? T . n T 5 137 PRO 137 137 ? ? ? T . n T 5 138 ASN 138 138 ? ? ? T . n T 5 139 ALA 139 139 ? ? ? T . n T 5 140 VAL 140 140 ? ? ? T . n # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete icosahedral assembly' ? 1200-MERIC 1200 2 'icosahedral asymmetric unit' ? eicosameric 20 3 'icosahedral pentamer' ? 100-meric 100 4 'icosahedral 23 hexamer' ? 120-meric 120 5 'icosahedral asymmetric unit, std point frame' ? eicosameric 20 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-60)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 2 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 3 '(1-5)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 4 '(1,2,6,10,23,24)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 5 P A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'transform to point frame' ? ? 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 1 'point symmetry operation' ? ? 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 5 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 -0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 6 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 7 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 8 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 9 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 10 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 11 'point symmetry operation' ? ? 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 12 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 13 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 14 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 -0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 15 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 16 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 17 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 18 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 19 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 -0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 20 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 -0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 21 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 22 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 23 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 24 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 -0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 25 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 26 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 27 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 28 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 29 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 -0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 30 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 31 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 32 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 33 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 34 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 35 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 36 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 37 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 38 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 39 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 40 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 41 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 42 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 43 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 44 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 45 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 46 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 47 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 48 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 49 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 50 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 -0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 51 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 52 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 53 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 54 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 55 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 -0.30901699 0.00000 -0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 56 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 57 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 58 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 59 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 60 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 # _pdbx_point_symmetry.entry_id 3IYN _pdbx_point_symmetry.Schoenflies_symbol I _pdbx_point_symmetry.circular_symmetry ? _pdbx_point_symmetry.H-M_notation ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2010-09-08 2 'Structure model' 1 1 2011-07-13 3 'Structure model' 1 2 2017-09-27 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 2 3 'Structure model' repository Obsolete ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' Advisory 3 3 'Structure model' Other # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 3 'Structure model' pdbx_database_PDB_obs_spr 2 3 'Structure model' pdbx_database_status # _pdbx_audit_revision_item.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal 3 _pdbx_audit_revision_item.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_item.item '_pdbx_database_status.status_code' # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 3IYN _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 3IYN _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.5 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'common lines' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 1.076 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 1.10 _em_3d_reconstruction.resolution 3.6 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration 'TMV images' _em_3d_reconstruction.details ;The program CTFFIND was used to determine the defocus value and astigmatism parameters for each micrograph. We determined particle orientation, centre parameters and subsequent 3D reconstruction with the IMIRS package, enhanced by icos ahedral symmetry-adapted functions for 3D reconstruction. We incorporated astigmatism in the CTF correction in both orientation-centre refinement and 3D reconstruction steps. The IMIRS procedure was optimized, and the data processing was completed within two months by three personal computers, each with eight 2.33GHz CPUs and 16G memory. ( Details about the particle: 756 micrographs that clearly showed signals up to 4 Angstrom in their power spectra were selected. Individual particle images (1024 pixel by 1024 pixel) were first boxed out automatically by the autoBox program in the IMIRS package, followed by manual screening with the EMAN boxer program to keep only the well-separated, contamination-free and intact 45000 particles. The program CTFFIND was used to determine the defocus value and astigmatism parameters for each micrograph. Determination of particle orientation and centre, and subsequent 3D reconstruction were done with the IMIRS package, enhanced by icosahedral symmetry-adapted functions. ) ; _em_3d_reconstruction.num_particles 31815 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '10 mM Tris, 1 mM MgCl2' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.details '10mM Tris-HCL,1mM MgCl2' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'human adenovirus type 5' _em_entity_assembly.type VIRUS _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ;icosahedral particle. E1B gene-attenuated oncolytic human adenovirus type 5 was propagated in HEK 293 cells, harvested and liberated by 3 cycles of freezing-thawing and purified by CsCl step gradient ultra-centrifugation. The virion particles were then dialyzed and resuspended in 10 mM Tris (pH 7.5), 1 mM MgCl2. ; _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 3IYN _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 1350 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 3IYN _em_imaging.id 1 _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.date 2009-05-01 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.temperature 90 _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.tilt_angle_min 0 _em_imaging.tilt_angle_max 0 _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 59000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details low-dose _em_imaging.specimen_holder_type Eucentric _em_imaging.specimen_holder_model OTHER _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.detector_distance 0.0 _em_imaging.electron_beam_tilt_params 0 _em_imaging.astigmatism 'objective lens astigmatism was corrected at 100,000 times magnification' _em_imaging.citation_id ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'This grid plus sample was kept in liquid nitrogen before cryoEM imaging.' _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? # _em_virus_entity.id 1 _em_virus_entity.virus_host_category VERTEBRATES _em_virus_entity.entity_assembly_id 1 _em_virus_entity.virus_type VIRION _em_virus_entity.virus_isolate SEROTYPE _em_virus_entity.empty NO _em_virus_entity.enveloped NO _em_virus_entity.details ? # _em_vitrification.entry_id 3IYN _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK I' _em_vitrification.details 'Vitrification carried out in a chamber with controlled humidity.' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp 90 _em_vitrification.method 'Blot for 4 seconds before plunging' _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.specimen_id 1 # _em_experiment.entry_id 3IYN _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 3IYN _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry I _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 C A THR 191 ? ? 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? -57.25 -5.83 266 1 ASN E 518 ? ? 38.50 51.00 267 1 ASP E 603 ? ? -86.42 31.63 268 1 ASN E 658 ? ? 69.43 -4.12 269 1 SER E 668 ? ? -34.94 123.11 270 1 THR E 699 ? ? -116.57 54.26 271 1 TYR E 712 ? ? -154.39 14.97 272 1 SER E 726 ? ? 68.43 73.96 273 1 SER E 727 ? ? 155.14 -43.88 274 1 VAL E 748 ? ? 39.46 -55.33 275 1 ALA E 756 ? ? 51.58 19.11 276 1 ASP E 788 ? ? -101.92 71.73 277 1 PRO E 833 ? ? -82.23 39.52 278 1 TYR E 841 ? ? 176.99 147.51 279 1 CYS E 865 ? ? -160.28 71.73 280 1 PHE E 878 ? ? 67.45 -2.84 281 1 ASP E 910 ? ? -75.90 33.58 282 1 PRO E 943 ? ? -72.57 -161.69 283 1 ASN E 948 ? ? -82.19 -152.76 284 1 ALA E 949 ? ? -149.41 -40.08 285 1 MET F 6 ? ? 106.00 -90.87 286 1 SER F 24 ? ? -32.25 131.70 287 1 GLU F 35 ? ? -58.16 24.54 288 1 THR F 36 ? ? -124.50 -66.76 289 1 HIS F 53 ? ? -179.58 144.74 290 1 VAL F 55 ? ? -144.56 -64.82 291 1 ASN F 90 ? ? 44.22 29.15 292 1 PRO F 114 ? ? -73.23 39.54 293 1 LYS F 126 ? ? -57.86 -4.74 294 1 VAL F 187 ? ? -167.35 112.42 295 1 GLU F 188 ? ? 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? 38.31 51.01 326 1 ASP F 603 ? ? -86.34 31.55 327 1 ASN F 658 ? ? 69.42 -4.19 328 1 SER F 668 ? ? -32.30 138.10 329 1 ARG F 669 ? ? 179.52 143.82 330 1 ASN F 670 ? ? -36.09 162.49 331 1 TRP F 671 ? ? -146.62 -3.68 332 1 THR F 699 ? ? -116.59 54.21 333 1 TYR F 712 ? ? -154.52 15.01 334 1 SER F 727 ? ? -176.01 -34.24 335 1 VAL F 748 ? ? 39.31 -55.33 336 1 ALA F 756 ? ? 51.63 19.21 337 1 ASP F 788 ? ? -101.90 71.65 338 1 ARG F 789 ? ? -69.74 -174.10 339 1 PRO F 833 ? ? -82.29 39.74 340 1 TYR F 841 ? ? 176.90 147.58 341 1 CYS F 865 ? ? -160.34 71.69 342 1 ARG F 867 ? ? 39.84 37.50 343 1 PHE F 878 ? ? 67.30 -2.73 344 1 ASP F 910 ? ? -76.04 33.79 345 1 PRO F 943 ? ? -68.33 -168.06 346 1 ASN F 948 ? ? 122.00 98.77 347 1 ALA F 949 ? ? 95.61 22.01 348 1 MET G 6 ? ? 106.03 -90.94 349 1 SER G 24 ? ? -32.19 131.73 350 1 GLU G 35 ? ? -58.09 24.34 351 1 THR G 36 ? ? -124.35 -66.84 352 1 HIS G 53 ? ? -179.62 144.86 353 1 VAL G 55 ? ? -144.49 -64.84 354 1 ASN G 90 ? ? 44.32 28.97 355 1 PRO G 114 ? ? -73.02 39.25 356 1 LYS G 126 ? ? -57.70 -4.78 357 1 VAL G 187 ? ? -167.51 112.42 358 1 GLU G 188 ? ? -66.52 88.49 359 1 PHE G 199 ? ? -147.57 -2.47 360 1 GLU G 214 ? ? 68.17 93.03 361 1 ILE G 248 ? ? 157.03 -97.49 362 1 LEU G 249 ? ? 115.08 35.83 363 1 LYS G 251 ? ? 88.70 -168.48 364 1 ASN G 254 ? ? 39.93 -109.31 365 1 LEU G 257 ? ? -59.40 -150.88 366 1 GLU G 258 ? ? -59.28 -174.19 367 1 SER G 259 ? ? -104.18 -98.09 368 1 GLN G 260 ? ? -170.11 -140.88 369 1 VAL G 261 ? ? 123.23 159.54 370 1 SER G 267 ? ? -112.49 -167.03 371 1 THR G 269 ? ? 71.90 36.02 372 1 ALA G 271 ? ? 68.59 132.79 373 1 ASN G 275 ? ? -104.92 -82.49 374 1 LEU G 279 ? ? -56.57 9.93 375 1 THR G 280 ? ? -27.71 125.43 376 1 GLN G 353 ? ? 62.65 -14.26 377 1 VAL G 419 ? ? 177.03 155.16 378 1 ASN G 421 ? ? -92.34 56.78 379 1 LYS G 431 ? ? 76.37 120.72 380 1 THR G 432 ? ? 120.53 -40.87 381 1 ASN G 436 ? ? 60.20 63.41 382 1 THR G 443 ? ? -81.12 39.77 383 1 PHE G 445 ? ? 71.18 62.85 384 1 CYS G 515 ? ? -57.25 -5.95 385 1 ASN G 518 ? ? 38.43 50.94 386 1 ASP G 603 ? ? -86.42 31.68 387 1 ASN G 658 ? ? 69.54 -4.31 388 1 PRO G 667 ? ? -31.16 153.14 389 1 ARG G 669 ? ? 178.73 161.56 390 1 LEU G 690 ? ? -68.06 -162.30 391 1 TYR G 694 ? ? 176.47 140.52 392 1 TYR G 712 ? ? -154.33 14.92 393 1 SER G 727 ? ? -176.10 -34.21 394 1 VAL G 748 ? ? 39.44 -55.41 395 1 ALA G 756 ? ? 51.61 19.07 396 1 ASP G 788 ? ? -101.88 71.83 397 1 PRO G 833 ? ? -82.23 39.59 398 1 TYR G 841 ? ? 176.90 147.49 399 1 CYS G 865 ? ? -160.27 71.79 400 1 PHE G 878 ? ? 67.26 -2.75 401 1 HIS G 898 ? ? -175.98 144.39 402 1 ASP G 910 ? ? -75.95 33.63 403 1 PRO G 943 ? ? -68.25 -168.19 404 1 SER G 945 ? ? -48.59 -172.89 405 1 ALA G 946 ? ? -99.45 -100.92 406 1 ASN G 948 ? ? 58.94 112.84 407 1 PRO H 3 ? ? -42.52 -103.14 408 1 SER H 24 ? ? -32.08 131.72 409 1 GLU H 35 ? ? -58.11 24.39 410 1 THR H 36 ? ? -124.41 -66.68 411 1 HIS H 53 ? ? -179.66 144.85 412 1 VAL H 55 ? ? -144.61 -64.88 413 1 ASN H 90 ? ? 44.24 29.02 414 1 PRO H 114 ? ? -73.14 39.41 415 1 LYS H 126 ? ? -57.79 -4.71 416 1 VAL H 187 ? ? -167.43 112.42 417 1 GLU H 188 ? ? -66.49 88.45 418 1 PHE H 199 ? ? -147.66 -2.40 419 1 GLU H 214 ? ? 68.20 93.05 420 1 ILE H 248 ? ? 157.04 -97.69 421 1 LEU H 249 ? ? 115.22 35.89 422 1 LYS H 251 ? ? 88.60 -168.62 423 1 ASN H 254 ? ? 39.87 -109.30 424 1 LEU H 257 ? ? -59.37 -150.93 425 1 GLU H 258 ? ? -59.24 -174.33 426 1 SER H 259 ? ? -104.14 -98.08 427 1 GLN H 260 ? ? -170.13 -140.96 428 1 VAL H 261 ? ? 123.24 159.55 429 1 SER H 267 ? ? -112.06 -168.10 430 1 THR H 269 ? ? 70.48 36.81 431 1 ALA H 271 ? ? 68.92 132.69 432 1 ASN H 275 ? ? -104.78 -82.51 433 1 LEU H 279 ? ? -56.53 9.70 434 1 THR H 280 ? ? -27.59 125.41 435 1 GLN H 353 ? ? 62.69 -14.20 436 1 VAL H 419 ? ? 177.02 155.27 437 1 ASN H 421 ? ? -92.22 56.73 438 1 LYS H 431 ? ? 78.40 121.11 439 1 THR H 432 ? ? 120.49 -41.27 440 1 ASN H 436 ? ? 60.29 63.36 441 1 THR H 443 ? ? -81.15 39.71 442 1 PHE H 445 ? ? 71.20 62.79 443 1 CYS H 515 ? ? -57.40 -5.71 444 1 ASN H 518 ? ? 38.31 51.07 445 1 ASN H 658 ? ? 69.60 -4.36 446 1 SER H 668 ? ? -34.99 123.16 447 1 LEU H 690 ? ? -68.70 -176.91 448 1 TYR H 694 ? ? 178.23 129.05 449 1 THR H 699 ? ? -116.51 54.08 450 1 TYR H 712 ? ? -154.25 14.89 451 1 SER H 727 ? ? -176.09 -34.19 452 1 VAL H 748 ? ? 39.31 -55.26 453 1 ALA H 756 ? ? 51.64 19.04 454 1 ASP H 788 ? ? -101.87 71.77 455 1 ARG H 789 ? ? -69.93 -174.16 456 1 PRO H 833 ? ? -82.16 39.53 457 1 TYR H 841 ? ? 176.87 147.39 458 1 CYS H 865 ? ? -160.30 71.77 459 1 PHE H 878 ? ? 67.54 -2.97 460 1 ASP H 910 ? ? -75.94 33.57 461 1 PRO H 943 ? ? -68.29 -168.24 462 1 SER H 945 ? ? -17.17 130.59 463 1 ALA H 946 ? ? -54.52 -82.26 464 1 MET I 6 ? ? 106.10 -91.08 465 1 SER I 24 ? ? -32.01 131.84 466 1 GLU I 35 ? ? -57.97 24.31 467 1 THR I 36 ? ? -124.44 -66.68 468 1 HIS I 53 ? ? -179.65 144.74 469 1 VAL I 55 ? ? -144.49 -64.68 470 1 ASN I 90 ? ? 44.30 28.96 471 1 PRO I 114 ? ? -73.25 39.50 472 1 LYS I 126 ? ? -57.80 -4.80 473 1 VAL I 187 ? ? -167.50 112.38 474 1 GLU I 188 ? ? -66.42 88.43 475 1 PHE I 199 ? ? -147.59 -2.41 476 1 GLU I 214 ? ? 68.34 92.87 477 1 ILE I 248 ? ? 157.03 -97.59 478 1 LEU I 249 ? ? 115.12 35.91 479 1 LYS I 251 ? ? 88.51 -168.43 480 1 ASN I 254 ? ? 39.89 -109.33 481 1 LEU I 257 ? ? -59.22 -150.92 482 1 GLU I 258 ? ? -59.25 -174.20 483 1 SER I 259 ? ? -104.19 -98.07 484 1 GLN I 260 ? ? -170.18 -141.06 485 1 VAL I 261 ? ? 123.41 159.43 486 1 SER I 267 ? ? -112.24 -166.76 487 1 THR I 269 ? ? 70.61 36.36 488 1 ALA I 271 ? ? 69.33 132.79 489 1 ASN I 275 ? ? -104.89 -82.56 490 1 LEU I 279 ? ? -55.71 9.19 491 1 THR I 280 ? ? -26.96 125.46 492 1 GLN I 353 ? ? 62.49 -14.13 493 1 VAL I 419 ? ? 176.99 155.18 494 1 ASN I 421 ? ? -92.17 56.76 495 1 LYS I 431 ? ? 75.51 120.95 496 1 THR I 432 ? ? 120.28 -41.66 497 1 THR I 443 ? ? -81.08 39.79 498 1 PHE I 445 ? ? 71.10 62.91 499 1 CYS I 515 ? ? -57.25 -5.90 500 1 ASN I 518 ? ? 38.36 50.97 501 1 ASP I 603 ? ? -86.31 31.47 502 1 ASN I 658 ? ? 69.46 -4.20 503 1 SER I 668 ? ? -34.98 123.14 504 1 THR I 699 ? ? -116.62 54.19 505 1 TYR I 712 ? ? -154.30 14.74 506 1 SER I 727 ? ? -176.02 -34.40 507 1 VAL I 748 ? ? 39.38 -55.36 508 1 ALA I 756 ? ? 51.62 19.04 509 1 ASP I 788 ? ? -101.94 71.76 510 1 ARG I 789 ? ? -70.00 -174.05 511 1 PRO I 833 ? ? -82.21 39.59 512 1 TYR I 841 ? ? 176.91 147.45 513 1 CYS I 865 ? ? -160.32 71.82 514 1 PHE I 878 ? ? 67.26 -2.83 515 1 ASP I 910 ? ? -75.99 33.54 516 1 PRO I 943 ? ? -74.00 -160.82 517 1 ALA I 946 ? ? -53.36 -117.14 518 1 ASN I 948 ? ? -98.00 -152.36 519 1 ALA I 949 ? ? -150.40 -39.89 520 1 MET J 6 ? ? 106.06 -91.07 521 1 SER J 24 ? ? -32.13 131.73 522 1 GLU J 35 ? ? -57.99 24.37 523 1 THR J 36 ? ? -124.52 -66.70 524 1 HIS J 53 ? ? -179.65 144.82 525 1 VAL J 55 ? ? -144.60 -64.81 526 1 ASN J 90 ? ? 44.25 29.02 527 1 PRO J 114 ? ? -73.18 39.52 528 1 LYS J 126 ? ? -57.84 -4.73 529 1 VAL J 187 ? ? -167.36 112.38 530 1 GLU J 188 ? ? -66.41 88.46 531 1 PHE J 199 ? ? -147.61 -2.35 532 1 GLU J 214 ? ? 68.31 92.93 533 1 ILE J 248 ? ? 157.03 -97.57 534 1 LEU J 249 ? ? 115.08 35.86 535 1 LYS J 251 ? ? 88.61 -168.44 536 1 ASN J 254 ? ? 39.89 -109.22 537 1 LEU J 257 ? ? -59.35 -150.96 538 1 GLU J 258 ? ? -59.27 -174.27 539 1 SER J 259 ? ? -104.17 -98.05 540 1 GLN J 260 ? ? -170.12 -140.98 541 1 VAL J 261 ? ? 123.31 159.49 542 1 SER J 267 ? ? -112.40 -166.79 543 1 THR J 269 ? ? 70.08 36.77 544 1 ALA J 271 ? ? 69.28 132.70 545 1 ASN J 275 ? ? -104.79 -82.62 546 1 LEU J 279 ? ? -56.63 10.40 547 1 THR J 280 ? ? -28.07 126.00 548 1 TYR J 286 ? ? -104.60 74.83 549 1 GLN J 353 ? ? 62.62 -14.14 550 1 VAL J 419 ? ? 177.06 155.29 551 1 ASN J 421 ? ? -92.31 56.69 552 1 LYS J 431 ? ? 77.81 120.98 553 1 THR J 432 ? ? 120.35 -41.43 554 1 THR J 443 ? ? -81.01 39.60 555 1 PHE J 445 ? ? 71.05 62.88 556 1 CYS J 515 ? ? -57.32 -5.75 557 1 ASN J 518 ? ? 38.28 51.06 558 1 ASP J 603 ? ? -86.28 31.57 559 1 ASN J 658 ? ? 69.54 -4.19 560 1 SER J 668 ? ? -34.90 123.13 561 1 THR J 699 ? ? -116.65 54.33 562 1 TYR J 712 ? ? -154.43 14.97 563 1 SER J 727 ? ? -176.11 -34.16 564 1 VAL J 748 ? ? 39.33 -55.27 565 1 ALA J 756 ? ? 51.63 19.07 566 1 ASP J 788 ? ? -101.90 71.78 567 1 PRO J 833 ? ? -82.31 39.65 568 1 TYR J 841 ? ? 176.80 147.45 569 1 CYS J 865 ? ? -160.30 71.76 570 1 PHE J 878 ? ? 67.41 -2.88 571 1 LEU J 891 ? ? -19.92 -64.21 572 1 LEU J 892 ? ? -31.63 -30.82 573 1 TYR J 893 ? ? -85.94 -77.49 574 1 ASN J 895 ? ? -32.43 -79.80 575 1 ASP J 910 ? ? -75.97 33.61 576 1 PRO J 943 ? ? -68.40 -168.08 577 1 ALA J 946 ? ? -22.47 94.98 578 1 ASN J 948 ? ? -38.22 -84.92 579 1 ALA J 949 ? ? 73.74 99.15 580 1 MET K 5 ? ? -19.82 130.32 581 1 MET K 6 ? ? 126.02 176.49 582 1 GLN K 8 ? ? -37.49 -28.87 583 1 SER K 24 ? ? -32.05 131.83 584 1 GLU K 35 ? ? -58.05 24.36 585 1 THR K 36 ? ? -124.44 -66.78 586 1 HIS K 53 ? ? -179.61 144.79 587 1 VAL K 55 ? ? -144.58 -64.78 588 1 ASN K 90 ? ? 44.29 29.04 589 1 PRO K 114 ? ? -73.06 39.30 590 1 LYS K 126 ? ? -57.87 -4.66 591 1 VAL K 187 ? ? -167.48 112.44 592 1 GLU K 188 ? ? -66.49 88.47 593 1 PHE K 199 ? ? -147.67 -2.34 594 1 GLU K 214 ? ? 68.29 92.93 595 1 ILE K 248 ? ? 156.97 -97.56 596 1 LEU K 249 ? ? 115.08 35.96 597 1 LYS K 251 ? ? 88.64 -168.54 598 1 ASN K 254 ? ? 40.02 -109.42 599 1 LEU K 257 ? ? -59.41 -150.87 600 1 GLU K 258 ? ? -59.20 -174.28 601 1 SER K 259 ? ? -104.25 -97.98 602 1 GLN K 260 ? ? -170.14 -140.96 603 1 VAL K 261 ? ? 123.27 159.78 604 1 SER K 267 ? ? -113.01 -169.63 605 1 THR K 269 ? ? 72.86 36.37 606 1 ALA K 271 ? ? 69.03 132.68 607 1 ASN K 275 ? ? -104.87 -82.51 608 1 LEU K 279 ? ? -56.62 9.91 609 1 THR K 280 ? ? -27.70 125.42 610 1 GLN K 353 ? ? 62.58 -14.19 611 1 VAL K 419 ? ? 177.04 155.26 612 1 ASN K 421 ? ? -92.35 56.71 613 1 LYS K 431 ? ? 77.97 121.05 614 1 THR K 432 ? ? 120.32 -41.93 615 1 THR K 443 ? ? -81.10 39.82 616 1 PHE K 445 ? ? 71.09 62.85 617 1 CYS K 515 ? ? -57.43 -5.76 618 1 ASN K 518 ? ? 38.23 51.15 619 1 ASP K 603 ? ? -86.38 31.44 620 1 ASN K 658 ? ? 69.59 -4.47 621 1 PRO K 667 ? ? -33.21 149.92 622 1 TYR K 694 ? ? 113.77 157.65 623 1 TYR K 697 ? ? -140.96 18.44 624 1 THR K 699 ? ? -116.61 54.26 625 1 TYR K 712 ? ? -154.34 14.87 626 1 ASP K 725 ? ? 84.03 17.14 627 1 SER K 726 ? ? 57.74 80.91 628 1 SER K 727 ? ? 150.92 -53.29 629 1 VAL K 748 ? ? 39.42 -55.35 630 1 ALA K 756 ? ? 51.77 18.96 631 1 ASP K 788 ? ? -101.83 71.77 632 1 ARG K 789 ? ? -69.97 -174.15 633 1 PRO K 833 ? ? -82.23 39.60 634 1 TYR K 841 ? ? 176.81 147.38 635 1 CYS K 865 ? ? -160.28 71.73 636 1 PHE K 878 ? ? 67.46 -2.97 637 1 LEU K 891 ? ? -26.86 -55.89 638 1 LEU K 892 ? ? -35.72 -38.76 639 1 TYR K 893 ? ? -81.92 -81.67 640 1 ALA K 894 ? ? -57.07 8.33 641 1 ASP K 910 ? ? -76.09 33.66 642 1 PRO K 943 ? ? -68.27 -168.20 643 1 SER K 945 ? ? -45.30 179.15 644 1 ALA K 946 ? ? -94.65 -91.19 645 1 ASN K 948 ? ? 59.95 113.74 646 1 PRO L 3 ? ? -35.40 -98.99 647 1 SER L 24 ? ? -32.19 131.77 648 1 GLU L 35 ? ? -58.02 24.29 649 1 THR L 36 ? ? -124.47 -66.62 650 1 HIS L 53 ? ? -179.60 144.86 651 1 VAL L 55 ? ? -144.49 -64.79 652 1 ASN L 90 ? ? 44.18 28.93 653 1 PRO L 114 ? ? -73.09 39.43 654 1 LYS L 126 ? ? -57.81 -4.72 655 1 VAL L 187 ? ? -167.39 112.47 656 1 GLU L 188 ? ? -66.53 88.49 657 1 PHE L 199 ? ? -147.65 -2.25 658 1 GLU L 214 ? ? 68.32 93.04 659 1 ILE L 248 ? ? 156.96 -97.50 660 1 LEU L 249 ? ? 115.03 35.79 661 1 LYS L 251 ? ? 88.59 -168.52 662 1 ASN L 254 ? ? 39.82 -109.36 663 1 LEU L 257 ? ? -59.39 -151.00 664 1 GLU L 258 ? ? -59.37 -174.29 665 1 SER L 259 ? ? -104.14 -98.02 666 1 GLN L 260 ? ? -170.22 -140.90 667 1 VAL L 261 ? ? 123.24 159.50 668 1 SER L 267 ? ? -112.61 -167.61 669 1 THR L 269 ? ? 70.63 36.75 670 1 ALA L 271 ? ? 68.88 132.73 671 1 ASN L 275 ? ? -104.83 -82.56 672 1 LEU L 279 ? ? -56.57 10.39 673 1 THR L 280 ? ? -28.04 126.01 674 1 TYR L 286 ? ? -105.64 75.76 675 1 GLN L 353 ? ? 62.53 -14.08 676 1 VAL L 419 ? ? 177.02 155.23 677 1 ASN L 421 ? ? -92.27 56.66 678 1 LYS L 431 ? ? 75.82 120.71 679 1 THR L 432 ? ? 120.61 -40.73 680 1 ASN L 436 ? ? 60.45 63.55 681 1 THR L 443 ? ? -81.02 39.69 682 1 PHE L 445 ? ? 71.12 62.80 683 1 CYS L 515 ? ? -57.25 -5.88 684 1 ASN L 518 ? ? 38.45 51.04 685 1 ASP L 603 ? ? -86.37 31.59 686 1 ASN L 658 ? 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