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_citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Budkevich, T.' 1 ? primary 'Giesebrecht, J.' 2 ? primary 'Altman, R.B.' 3 ? primary 'Munro, J.B.' 4 ? primary 'Mielke, T.' 5 ? primary 'Nierhaus, K.H.' 6 ? primary 'Blanchard, S.C.' 7 ? primary 'Spahn, C.M.' 8 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat '40S ribosomal RNA fragment' 15500.287 1 ? ? ? ? 2 polymer nat '40S ribosomal RNA fragment' 5426.301 1 ? ? ? ? 3 polymer nat '40S ribosomal RNA fragment' 2283.459 1 ? ? ? ? 4 polymer nat '40S ribosomal RNA fragment' 9934.950 1 ? ? ? ? 5 polymer nat '40S ribosomal RNA fragment' 4132.518 1 ? ? ? ? 6 polymer nat '40S ribosomal RNA fragment' 6794.028 1 ? ? ? ? 7 polymer nat '40S ribosomal RNA fragment' 35735.312 1 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Ribosomal 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. n N 14 18 G 18 2841 2841 G G 7 . n N 14 19 U 19 2842 2842 U U 7 . n N 14 20 U 20 2843 2843 U U 7 . n N 14 21 C 21 2844 2844 C C 7 . n N 14 22 A 22 2845 2845 A A 7 . n N 14 23 U 23 2846 2846 U U 7 . n N 14 24 A 24 2847 2847 A A 7 . n N 14 25 G 25 2848 2848 G G 7 . n N 14 26 C 26 2849 2849 C C 7 . n N 14 27 G 27 2850 2850 G G 7 . n N 14 28 A 28 2851 2851 A A 7 . n N 14 29 C 29 2852 2852 C C 7 . n N 14 30 A 30 2853 2853 A A 7 . n N 14 31 U 31 2854 2854 U U 7 . n N 14 32 U 32 2855 2855 U U 7 . n N 14 33 G 33 2856 2856 G G 7 . n N 14 34 C 34 2857 2857 C C 7 . n N 14 35 U 35 2858 2858 U U 7 . n N 14 36 U 36 2859 2859 U U 7 . n N 14 37 U 37 2860 2860 U U 7 . n N 14 38 U 38 2861 2861 U U 7 . n N 14 39 U 39 2862 2862 U U 7 . n N 14 40 G 40 2863 2863 G G 7 . n N 14 41 A 41 2864 2864 A A 7 . n N 14 42 U 42 2865 2865 U U 7 . n N 14 43 U 43 2866 2866 U U 7 . n N 14 44 C 44 2867 2867 C C 7 . n N 14 45 U 45 2868 2868 U U 7 . n N 14 46 U 46 2869 2869 U U 7 . n N 14 47 C 47 2870 2870 C C 7 . n N 14 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A G 10 N2 ? ? ? 1_555 A C 41 O2 ? ? a G 550 a C 581 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A G 10 O6 ? ? ? 1_555 A C 41 N4 ? ? a G 550 a C 581 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A C 12 N3 ? ? ? 1_555 A G 40 N1 ? ? a C 552 a G 580 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A C 12 N4 ? ? ? 1_555 A G 40 O6 ? ? a C 552 a G 580 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A C 12 O2 ? ? ? 1_555 A G 40 N2 ? ? a C 552 a G 580 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A U 14 N3 ? ? ? 1_555 A A 39 N1 ? ? a U 554 a A 579 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A U 14 O4 ? ? ? 1_555 A A 39 N6 ? ? a U 554 a A 579 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A G 15 N1 ? ? ? 1_555 A C 38 N3 ? ? a G 555 a C 578 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A G 15 N2 ? ? ? 1_555 A C 38 O2 ? ? a G 555 a C 578 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog229 hydrog ? ? K G 17 N2 ? ? ? 1_555 K C 42 O2 ? ? 2 G 2210 2 C 2235 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog230 hydrog ? ? K G 17 O6 ? ? ? 1_555 K C 42 N4 ? ? 2 G 2210 2 C 2235 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog231 hydrog ? ? K U 18 N3 ? ? ? 1_555 K G 41 O6 ? ? 2 U 2211 2 G 2234 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog232 hydrog ? ? K U 18 O2 ? ? ? 1_555 K G 41 N1 ? ? 2 U 2211 2 G 2234 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog233 hydrog ? ? K G 23 N2 ? ? ? 1_555 K A 36 N1 ? ? 2 G 2216 2 A 2229 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog234 hydrog ? ? K G 23 N2 ? ? ? 1_555 K C 37 O2 ? ? 2 G 2216 2 C 2230 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? ? hydrog235 hydrog ? ? K U 24 N3 ? ? ? 1_555 K A 35 N1 ? ? 2 U 2217 2 A 2228 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog236 hydrog ? ? K U 24 O4 ? ? ? 1_555 K A 35 N6 ? ? 2 U 2217 2 A 2228 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog237 hydrog ? ? 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CB B LYS 102 ? ? 1.65 234 1 N2 9 G 2672 ? ? O k ASN 20 ? ? 1.65 235 1 C5 9 A 2676 ? ? O k VAL 23 ? ? 1.65 236 1 N6 h A 1709 ? ? "O4'" Y A 38 ? ? 1.65 237 1 C5 3 U 2482 ? ? N B ILE 100 ? ? 1.65 238 1 C8 3 A 2484 ? ? C4 W C 56 ? ? 1.66 239 1 C6 3 A 2484 ? ? N6 W A 57 ? ? 1.66 240 1 C5 f C 1246 ? ? "O4'" Y C 34 ? ? 1.67 241 1 C5 f C 1246 ? ? "C3'" Y C 34 ? ? 1.67 242 1 N4 f C 1246 ? ? "C3'" Y C 34 ? ? 1.68 243 1 C4 f C 1246 ? ? "C2'" Y C 34 ? ? 1.68 244 1 "C1'" 3 A 2484 ? ? N1 W C 56 ? ? 1.68 245 1 N1 7 U 2829 ? ? C6 Y A 76 ? ? 1.68 246 1 P 3 A 2485 ? ? C B GLN 127 ? ? 1.69 247 1 "O4'" 9 A 2673 ? ? C k ASP 107 ? ? 1.69 248 1 "C5'" 9 A 2673 ? ? CB k ASP 107 ? ? 1.69 249 1 N9 3 A 2484 ? ? C6 W C 56 ? ? 1.70 250 1 C5 h A 1709 ? ? "C1'" Y A 38 ? ? 1.71 251 1 P 9 A 2673 ? ? CA k ILE 106 ? ? 1.71 252 1 "O2'" h C 1616 ? ? N7 2 A 2262 ? ? 1.71 253 1 C4 3 A 2484 ? ? C5 W C 56 ? ? 1.71 254 1 CZ S PHE 11 ? ? O k LYS 85 ? ? 1.72 255 1 N6 9 A 2679 ? ? CB k THR 56 ? ? 1.72 256 1 C6 f C 1246 ? ? "O4'" Y C 34 ? ? 1.72 257 1 "C1'" 7 U 2829 ? ? C6 Y A 76 ? ? 1.72 258 1 "C3'" 9 A 2673 ? ? CB k ASP 107 ? ? 1.72 259 1 "C2'" 7 U 2829 ? ? C5 Y A 76 ? ? 1.72 260 1 C6 3 U 2482 ? ? CA B LEU 99 ? ? 1.73 261 1 C6 3 A 2486 ? ? CB B LYS 98 ? ? 1.73 262 1 O4 W U 36 ? ? C6 w A 14 ? ? 1.73 263 1 O6 9 G 2677 ? ? CB k THR 56 ? ? 1.74 264 1 "O2'" 7 U 2862 ? ? "C2'" Y C 75 ? ? 1.74 265 1 CA B PRO 121 ? ? "O2'" W C 56 ? ? 1.74 266 1 "C2'" 7 U 2862 ? ? "C3'" Y C 75 ? ? 1.75 267 1 C6 9 A 2676 ? ? N k GLY 24 ? ? 1.75 268 1 C6 7 U 2829 ? ? N1 Y A 76 ? ? 1.75 269 1 OP2 9 A 2673 ? ? N k ILE 106 ? ? 1.76 270 1 C2 7 U 2829 ? ? C5 Y A 76 ? ? 1.76 271 1 "O5'" 9 G 2672 ? ? O k PHE 104 ? ? 1.76 272 1 C5 3 A 2484 ? ? C5 W A 57 ? ? 1.76 273 1 N6 9 A 2674 ? ? CA k VAL 23 ? ? 1.76 274 1 "O3'" 9 A 2673 ? ? CB k ASP 107 ? ? 1.76 275 1 "O5'" 3 A 2485 ? ? CA B GLN 127 ? ? 1.76 276 1 OP2 9 U 2681 ? ? N k TYR 52 ? ? 1.77 277 1 OP1 9 C 2682 ? ? O k LYS 49 ? ? 1.77 278 1 C5 9 A 2680 ? ? N k GLY 58 ? ? 1.77 279 1 C2 7 U 2862 ? ? "C3'" Y A 76 ? ? 1.77 280 1 C6 9 A 2678 ? ? P Y C 56 ? ? 1.77 281 1 P 9 C 2682 ? ? O k LYS 49 ? ? 1.77 282 1 "O5'" 9 G 2672 ? ? O k GLY 105 ? ? 1.77 283 1 "O4'" 9 A 2673 ? ? CA k ASP 107 ? ? 1.78 284 1 OP1 3 A 2486 ? ? CB B ALA 131 ? ? 1.78 285 1 N6 9 A 2674 ? ? O k SER 22 ? ? 1.78 286 1 "C3'" 7 U 2862 ? ? "O3'" Y C 75 ? ? 1.79 287 1 OP1 3 A 2485 ? ? N B GLN 127 ? ? 1.79 288 1 C6 7 U 2829 ? ? C2 Y A 76 ? ? 1.79 289 1 N9 9 A 2680 ? ? N k GLY 58 ? ? 1.79 290 1 N6 h A 1709 ? ? N9 Y A 38 ? ? 1.80 291 1 "O4'" d A 1548 ? ? "O4'" W C 41 ? ? 1.80 292 1 "C5'" 7 U 2862 ? ? OP2 Y A 76 ? ? 1.80 293 1 OP1 a C 584 ? ? NH2 X ARG 44 ? ? 1.80 294 1 "O2'" 9 A 2673 ? ? CB k GLU 108 ? ? 1.80 295 1 N6 9 A 2674 ? ? N k VAL 23 ? ? 1.80 296 1 "C2'" d G 1547 ? ? "O2'" W C 41 ? ? 1.80 297 1 "O5'" 9 A 2673 ? ? N k ASP 107 ? ? 1.80 298 1 "C1'" 3 A 2484 ? ? C4 W C 56 ? ? 1.80 299 1 C2 7 U 2862 ? ? "C5'" Y A 76 ? ? 1.81 300 1 OP1 9 C 2682 ? ? C k SER 48 ? ? 1.81 301 1 "O2'" 7 U 2862 ? ? "C4'" Y C 75 ? ? 1.81 302 1 N3 7 U 2862 ? ? "C1'" Y A 76 ? ? 1.82 303 1 N7 9 A 2680 ? ? CA k GLY 58 ? ? 1.82 304 1 "O2'" 9 A 2673 ? ? O k GLU 108 ? ? 1.82 305 1 N2 2 G 2250 ? ? O2 2 C 2267 ? ? 1.82 306 1 C2 9 A 2680 ? ? CB k PHE 57 ? ? 1.83 307 1 "O4'" 3 G 2483 ? ? O B ASN 96 ? ? 1.83 308 1 N3 h A 1709 ? ? "C2'" Y A 38 ? ? 1.83 309 1 C2 7 U 2829 ? ? N1 Y A 76 ? ? 1.83 310 1 OP2 3 A 2485 ? ? C B GLN 127 ? ? 1.83 311 1 "C1'" 9 A 2673 ? ? CA k GLU 108 ? ? 1.83 312 1 C2 Y A 37 ? ? N3 y U 19 ? ? 1.84 313 1 N6 9 A 2676 ? ? C k VAL 23 ? ? 1.84 314 1 C2 f C 1246 ? ? "O3'" Y C 34 ? ? 1.84 315 1 "O4'" 3 G 2483 ? ? CB B ASN 96 ? ? 1.84 316 1 C4 3 U 2482 ? ? O B LYS 97 ? ? 1.84 317 1 "C3'" 9 A 2673 ? ? C k ASP 107 ? ? 1.84 318 1 N6 9 A 2674 ? ? C k SER 22 ? ? 1.84 319 1 OP1 9 A 2673 ? ? C k ILE 106 ? ? 1.84 320 1 N6 9 A 2676 ? ? C k GLY 24 ? ? 1.84 321 1 C5 7 U 2829 ? ? C2 Y A 76 ? ? 1.84 322 1 P 3 G 2483 ? ? C B LYS 95 ? ? 1.85 323 1 "O4'" h A 1709 ? ? "O4'" y U 19 ? ? 1.85 324 1 "C4'" 3 U 2482 ? ? CB B LEU 99 ? ? 1.85 325 1 "C2'" 3 G 2483 ? ? O B ASN 96 ? ? 1.85 326 1 N6 9 A 2680 ? ? O k GLY 24 ? ? 1.86 327 1 C6 9 A 2679 ? ? CB k THR 56 ? ? 1.86 328 1 N1 7 U 2829 ? ? C5 Y A 76 ? ? 1.86 329 1 "C1'" 9 A 2673 ? ? C k ASP 107 ? ? 1.86 330 1 "O2'" 7 U 2829 ? ? N7 Y A 76 ? ? 1.87 331 1 O6 7 G 2828 ? ? "C2'" Y A 76 ? ? 1.87 332 1 N3 9 A 2673 ? ? CB k GLU 108 ? ? 1.87 333 1 N7 3 A 2484 ? ? N3 W C 56 ? ? 1.87 334 1 C4 W U 36 ? ? N1 w A 14 ? ? 1.87 335 1 P 9 A 2673 ? ? N k ILE 106 ? ? 1.88 336 1 O4 3 U 2482 ? ? CB B LYS 101 ? ? 1.88 337 1 "O2'" 3 G 2481 ? ? C B LYS 98 ? ? 1.88 338 1 C4 f C 1246 ? ? "O3'" Y C 34 ? ? 1.88 339 1 O2 3 U 2482 ? ? C B LYS 97 ? ? 1.88 340 1 C4 Y A 37 ? ? O2 y U 20 ? ? 1.88 341 1 "O5'" 9 G 2672 ? ? N k GLY 105 ? ? 1.88 342 1 "O2'" 3 G 2481 ? ? O B LYS 98 ? ? 1.88 343 1 O2 7 U 2862 ? ? "C4'" Y A 76 ? ? 1.88 344 1 C4 h A 1709 ? ? "O2'" Y A 38 ? ? 1.88 345 1 C6 9 A 2676 ? ? C k GLY 24 ? ? 1.89 346 1 "C1'" 9 U 2683 ? ? CB k ASN 20 ? ? 1.89 347 1 N1 7 U 2829 ? ? N3 Y A 76 ? ? 1.89 348 1 C5 3 G 2483 ? ? O B GLN 127 ? ? 1.89 349 1 "C3'" 9 A 2673 ? ? CA k ASP 107 ? ? 1.89 350 1 N4 9 C 2675 ? ? CB k GLU 25 ? ? 1.89 351 1 N1 9 A 2680 ? ? CB k PHE 57 ? ? 1.90 352 1 "O3'" 7 U 2862 ? ? "O5'" Y C 75 ? ? 1.90 353 1 "C4'" 7 U 2862 ? ? P Y A 76 ? ? 1.90 354 1 N3 Y A 37 ? ? O2 y U 20 ? ? 1.90 355 1 C2 f C 1246 ? ? "C2'" Y C 34 ? ? 1.90 356 1 C2 f C 1246 ? ? "C3'" Y C 34 ? ? 1.90 357 1 O B VAL 120 ? ? "O3'" W C 56 ? ? 1.91 358 1 P 9 C 2682 ? ? C k LYS 49 ? ? 1.91 359 1 C6 W A 35 ? ? C8 w A 15 ? ? 1.91 360 1 C6 3 U 2482 ? ? N B ILE 100 ? ? 1.91 361 1 "O4'" 9 A 2673 ? ? N k GLU 108 ? ? 1.91 362 1 N9 3 A 2484 ? ? C2 W C 56 ? ? 1.91 363 1 "C4'" 9 A 2673 ? ? N k ASP 107 ? ? 1.91 364 1 N1 7 U 2829 ? ? C4 Y A 76 ? ? 1.91 365 1 "O3'" 7 U 2862 ? ? P Y A 76 ? ? 1.92 366 1 "O4'" 3 A 2484 ? ? C2 W C 56 ? ? 1.92 367 1 "O3'" 3 A 2484 ? ? CA B GLN 127 ? ? 1.92 368 1 C6 3 A 2486 ? ? CA B LYS 98 ? ? 1.92 369 1 C6 9 G 2677 ? ? CB k THR 56 ? ? 1.93 370 1 "O3'" 3 A 2485 ? ? CA B ALA 131 ? ? 1.93 371 1 "C5'" 9 A 2673 ? ? N k ASP 107 ? ? 1.94 372 1 "C5'" 3 A 2485 ? ? CA B LEU 128 ? ? 1.94 373 1 "C3'" 7 U 2862 ? ? OP1 Y A 76 ? ? 1.94 374 1 "C5'" 3 U 2482 ? ? CB B LEU 99 ? ? 1.94 375 1 O2 2 C 2287 ? ? "O4'" 2 U 2298 ? ? 1.94 376 1 O4 7 U 2862 ? ? "C3'" Y A 76 ? ? 1.94 377 1 C5 3 A 2484 ? ? C6 W A 57 ? ? 1.94 378 1 C2 f C 1246 ? ? "C4'" Y C 34 ? ? 1.95 379 1 N1 7 U 2862 ? ? "O4'" Y A 76 ? ? 1.95 380 1 N4 9 C 2675 ? ? N k GLU 25 ? ? 1.96 381 1 N3 f C 1246 ? ? "C4'" Y C 34 ? ? 1.96 382 1 N1 h A 1709 ? ? C4 Y A 38 ? ? 1.96 383 1 OP1 h A 1709 ? ? "C4'" y U 20 ? ? 1.96 384 1 O4 3 U 2482 ? ? O B LYS 97 ? ? 1.96 385 1 "C1'" 9 U 2681 ? ? CB k ILE 65 ? ? 1.96 386 1 "O3'" 7 U 2829 ? ? N6 Y A 76 ? ? 1.96 387 1 N3 7 U 2862 ? ? "O4'" Y A 76 ? ? 1.97 388 1 N1 h A 1709 ? ? "O4'" Y A 38 ? ? 1.97 389 1 C5 3 U 2482 ? ? C B LEU 99 ? ? 1.97 390 1 N B ARG 122 ? ? 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C5 Y G 4 ? ? 107.90 105.40 2.50 0.40 N 99 1 C8 Y G 5 ? ? N9 Y G 5 ? ? C4 Y G 5 ? ? 109.29 106.40 2.89 0.40 N 100 1 N9 Y G 5 ? ? C4 Y G 5 ? ? C5 Y G 5 ? ? 102.47 105.40 -2.93 0.40 N 101 1 C4 Y G 6 ? ? C5 Y G 6 ? ? N7 Y G 6 ? ? 114.23 110.80 3.43 0.40 N 102 1 N9 Y G 6 ? ? C4 Y G 6 ? ? C5 Y G 6 ? ? 102.59 105.40 -2.81 0.40 N 103 1 C5 Y G 6 ? ? C6 Y G 6 ? ? O6 Y G 6 ? ? 123.93 128.60 -4.67 0.60 N 104 1 C6 Y U 8 ? ? N1 Y U 8 ? ? C2 Y U 8 ? ? 116.69 121.00 -4.31 0.60 N 105 1 C4 Y G 9 ? ? C5 Y G 9 ? ? N7 Y G 9 ? ? 107.63 110.80 -3.17 0.40 N 106 1 C5 Y G 9 ? ? N7 Y G 9 ? ? C8 Y G 9 ? ? 108.22 104.30 3.92 0.50 N 107 1 C2 Y G 12 ? ? N3 Y G 12 ? ? C4 Y G 12 ? ? 116.63 111.90 4.73 0.50 N 108 1 C5 Y G 12 ? ? C6 Y G 12 ? ? N1 Y G 12 ? ? 114.95 111.50 3.45 0.50 N 109 1 C5 Y G 12 ? ? C6 Y G 12 ? ? O6 Y G 12 ? ? 124.99 128.60 -3.61 0.60 N 110 1 C5 Y C 13 ? ? C4 Y C 13 ? ? N4 Y C 13 ? ? 115.97 120.20 -4.23 0.70 N 111 1 N3 Y G 15 ? ? C4 Y G 15 ? ? C5 Y G 15 ? ? 125.43 128.60 -3.17 0.50 N 112 1 N1 Y G 15 ? ? C6 Y G 15 ? ? O6 Y G 15 ? ? 115.17 119.90 -4.73 0.60 N 113 1 C5 Y G 15 ? ? C6 Y G 15 ? ? O6 Y G 15 ? ? 132.38 128.60 3.78 0.60 N 114 1 C6 Y C 16 ? ? N1 Y C 16 ? ? C2 Y C 16 ? ? 123.65 120.30 3.35 0.40 N 115 1 "C3'" Y C 17 ? ? "C2'" Y C 17 ? ? "C1'" Y C 17 ? ? 107.31 101.50 5.81 0.80 N 116 1 C5 Y C 17 ? ? C6 Y C 17 ? ? N1 Y C 17 ? ? 124.80 121.00 3.80 0.50 N 117 1 C5 Y G 18 ? ? C6 Y G 18 ? ? N1 Y G 18 ? ? 116.25 111.50 4.75 0.50 N 118 1 C4 Y G 18 ? ? C5 Y G 18 ? ? N7 Y G 18 ? ? 113.84 110.80 3.04 0.40 N 119 1 C5 Y G 18 ? ? N7 Y G 18 ? ? C8 Y G 18 ? ? 100.17 104.30 -4.13 0.50 N 120 1 C5 Y G 18 ? ? C6 Y G 18 ? ? O6 Y G 18 ? ? 123.22 128.60 -5.38 0.60 N 121 1 C8 Y G 19 ? ? N9 Y G 19 ? ? C4 Y G 19 ? ? 108.81 106.40 2.41 0.40 N 122 1 N1 Y U 20 ? ? C2 Y U 20 ? ? O2 Y U 20 ? ? 127.07 122.80 4.27 0.70 N 123 1 C2 Y A 21 ? ? N3 Y A 21 ? ? C4 Y A 21 ? ? 114.50 110.60 3.90 0.50 N 124 1 "O4'" Y G 22 ? ? "C1'" Y G 22 ? ? N9 Y G 22 ? ? 113.38 108.50 4.88 0.70 N 125 1 "O4'" Y C 23 ? ? "C1'" Y C 23 ? ? N1 Y C 23 ? ? 113.53 108.50 5.03 0.70 N 126 1 C5 Y U 24 ? ? C4 Y U 24 ? ? O4 Y U 24 ? ? 130.33 125.90 4.43 0.60 N 127 1 C2 Y G 26 ? ? N3 Y G 26 ? ? C4 Y G 26 ? ? 108.81 111.90 -3.09 0.50 N 128 1 "O4'" Y C 28 ? ? "C1'" Y C 28 ? ? N1 Y C 28 ? ? 113.41 108.50 4.91 0.70 N 129 1 N1 Y G 31 ? ? C2 Y G 31 ? ? N3 Y G 31 ? ? 119.76 123.90 -4.14 0.60 N 130 1 C2 Y G 31 ? ? N3 Y G 31 ? ? C4 Y G 31 ? ? 116.38 111.90 4.48 0.50 N 131 1 N3 Y G 31 ? ? C4 Y G 31 ? ? N9 Y G 31 ? ? 130.12 126.00 4.12 0.60 N 132 1 C5 Y G 31 ? ? C6 Y G 31 ? ? O6 Y G 31 ? ? 122.66 128.60 -5.94 0.60 N 133 1 C5 Y A 37 ? ? C6 Y A 37 ? ? N1 Y A 37 ? ? 114.54 117.70 -3.16 0.50 N 134 1 C5 Y A 37 ? ? N7 Y A 37 ? ? C8 Y A 37 ? ? 109.33 103.90 5.43 0.50 N 135 1 N7 Y A 37 ? ? C8 Y A 37 ? ? N9 Y A 37 ? ? 108.76 113.80 -5.04 0.50 N 136 1 C8 Y A 37 ? ? N9 Y A 37 ? ? C4 Y A 37 ? ? 108.20 105.80 2.40 0.40 N 137 1 N9 Y A 38 ? ? C4 Y A 38 ? ? 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N1 Y U 54 ? ? 129.48 122.70 6.78 0.50 N 151 1 "O5'" Y U 55 ? ? "C5'" Y U 55 ? ? "C4'" Y U 55 ? ? 103.87 109.40 -5.53 0.80 N 152 1 "O4'" Y U 55 ? ? "C1'" Y U 55 ? ? N1 Y U 55 ? ? 112.77 108.50 4.27 0.70 N 153 1 N1 Y U 55 ? ? C2 Y U 55 ? ? N3 Y U 55 ? ? 111.02 114.90 -3.88 0.60 N 154 1 C5 Y U 55 ? ? C6 Y U 55 ? ? N1 Y U 55 ? ? 126.31 122.70 3.61 0.50 N 155 1 C5 Y A 57 ? ? C6 Y A 57 ? ? N1 Y A 57 ? ? 120.71 117.70 3.01 0.50 N 156 1 C8 Y A 59 ? ? N9 Y A 59 ? ? C4 Y A 59 ? ? 108.94 105.80 3.14 0.40 N 157 1 N3 Y C 61 ? ? C4 Y C 61 ? ? C5 Y C 61 ? ? 118.18 121.90 -3.72 0.40 N 158 1 C4 Y C 61 ? ? C5 Y C 61 ? ? C6 Y C 61 ? ? 120.74 117.40 3.34 0.50 N 159 1 N3 Y C 61 ? ? C4 Y C 61 ? ? N4 Y C 61 ? ? 122.59 118.00 4.59 0.70 N 160 1 C6 Y C 62 ? ? N1 Y C 62 ? ? C2 Y C 62 ? ? 123.33 120.30 3.03 0.40 N 161 1 C4 Y C 62 ? ? C5 Y C 62 ? ? C6 Y C 62 ? ? 121.17 117.40 3.77 0.50 N 162 1 C5 Y C 62 ? ? C6 Y C 62 ? ? N1 Y C 62 ? ? 117.33 121.00 -3.67 0.50 N 163 1 N3 Y G 63 ? ? C4 Y G 63 ? ? N9 Y G 63 ? ? 130.75 126.00 4.75 0.60 N 164 1 N3 Y G 64 ? ? C2 Y G 64 ? ? N2 Y G 64 ? ? 115.51 119.90 -4.39 0.70 N 165 1 N1 Y C 65 ? ? C2 Y C 65 ? ? O2 Y C 65 ? ? 115.23 118.90 -3.67 0.60 N 166 1 C6 Y C 66 ? ? N1 Y C 66 ? ? C2 Y C 66 ? ? 123.85 120.30 3.55 0.40 N 167 1 C2 Y C 66 ? ? N3 Y C 66 ? ? C4 Y C 66 ? ? 123.07 119.90 3.17 0.50 N 168 1 C6 Y C 68 ? ? N1 Y C 68 ? ? C2 Y C 68 ? ? 116.92 120.30 -3.38 0.40 N 169 1 C5 Y C 68 ? ? C6 Y C 68 ? ? N1 Y C 68 ? ? 124.20 121.00 3.20 0.50 N 170 1 N1 Y C 69 ? ? "C1'" Y C 69 ? ? "C2'" Y C 69 ? ? 105.32 112.00 -6.68 1.10 N 171 1 C4 Y G 70 ? ? C5 Y G 70 ? ? N7 Y G 70 ? ? 107.63 110.80 -3.17 0.40 N 172 1 N1 Y C 71 ? ? C2 Y C 71 ? ? N3 Y C 71 ? ? 114.94 119.20 -4.26 0.70 N 173 1 C4 Y A 72 ? ? C5 Y A 72 ? ? C6 Y A 72 ? ? 113.99 117.00 -3.01 0.50 N 174 1 C5 Y A 72 ? ? C6 Y A 72 ? ? N1 Y A 72 ? ? 122.35 117.70 4.65 0.50 N 175 1 N1 Y A 72 ? ? C6 Y A 72 ? ? N6 Y A 72 ? ? 114.09 118.60 -4.51 0.60 N 176 1 N7 Y A 73 ? ? C8 Y A 73 ? ? 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? -1.70 -105.13 23 1 ARG L 76 ? ? -61.53 -84.72 24 1 SER L 79 ? ? 73.12 60.64 25 1 PRO L 87 ? ? -52.54 -144.69 26 1 MET L 88 ? ? -21.76 168.77 27 1 ASP L 89 ? ? -23.24 -102.72 28 1 CYS L 91 ? ? -20.37 -64.94 29 1 ASN L 98 ? ? 90.98 -2.89 30 1 ARG L 108 ? ? 41.18 116.33 31 1 GLN L 109 ? ? -51.67 97.90 32 1 PRO L 117 ? ? -91.12 -82.30 33 1 LYS L 138 ? ? -57.36 5.42 34 1 LYS L 139 ? ? -100.98 -76.07 35 1 LYS L 141 ? ? -172.34 144.14 36 1 LEU X 8 ? ? 166.43 -68.96 37 1 LYS X 24 ? ? -54.22 95.78 38 1 ASP X 25 ? ? -47.54 102.05 39 1 LYS X 26 ? ? -13.51 111.99 40 1 ARG X 28 ? ? -116.63 -96.06 41 1 ARG X 44 ? ? -129.92 -50.55 42 1 ASP X 53 ? ? -31.01 142.18 43 1 PRO X 60 ? ? -52.67 11.57 44 1 ASN X 61 ? ? -156.87 23.39 45 1 HIS X 63 ? ? -78.60 46.44 46 1 ALA X 64 ? ? -45.52 1.98 47 1 THR B 5 ? ? 23.14 64.61 48 1 GLN B 8 ? ? -59.66 -2.10 49 1 VAL B 13 ? ? -107.34 -76.85 50 1 LEU B 16 ? ? -113.84 76.53 51 1 LEU B 17 ? ? -153.84 1.54 52 1 LYS B 18 ? ? -154.24 38.43 53 1 SER B 20 ? ? 51.87 -160.53 54 1 ASN B 21 ? ? -161.68 33.95 55 1 GLU B 22 ? ? -160.32 -109.79 56 1 THR B 23 ? ? -104.82 -130.30 57 1 LYS B 24 ? ? -48.72 -89.08 58 1 LYS B 25 ? ? -173.28 18.47 59 1 ARG B 26 ? ? 87.12 -148.89 60 1 ASN B 27 ? ? -166.15 8.72 61 1 LEU B 29 ? ? -57.67 170.00 62 1 THR B 31 ? ? -165.22 91.30 63 1 GLU B 33 ? ? -169.55 -151.77 64 1 LEU B 34 ? ? -163.74 100.31 65 1 VAL B 36 ? ? -165.39 -119.15 66 1 LYS B 39 ? ? 166.54 -19.47 67 1 ASN B 40 ? ? 59.82 11.69 68 1 TYR B 41 ? ? -62.25 -86.70 69 1 ASP B 42 ? ? -172.34 14.00 70 1 GLN B 44 ? ? -168.83 -89.33 71 1 ARG B 45 ? ? -43.05 -74.03 72 1 LYS B 47 ? ? -171.09 -12.45 73 1 PHE B 49 ? ? -163.17 -99.19 74 1 LEU B 53 ? ? -92.07 -76.15 75 1 LEU B 55 ? ? 85.75 -134.89 76 1 PRO B 56 ? ? 77.38 115.83 77 1 ASN B 57 ? ? -174.56 -142.75 78 1 CYS B 58 ? ? -172.65 -108.70 79 1 PRO B 59 ? ? -88.52 -78.84 80 1 ARG B 60 ? ? 97.44 -32.84 81 1 PRO B 61 ? ? -178.88 109.01 82 1 ASN B 62 ? ? 62.55 164.73 83 1 MET B 63 ? ? -157.85 -3.10 84 1 ILE B 65 ? ? -111.73 -98.29 85 1 ILE B 67 ? ? -171.73 111.92 86 1 ALA B 77 ? ? -172.85 23.72 87 1 CYS B 80 ? ? -146.96 -99.95 88 1 SER B 86 ? ? 68.22 165.23 89 1 VAL B 87 ? ? -103.07 -61.82 90 1 ASP B 89 ? ? -142.91 -24.23 91 1 LYS B 92 ? ? -162.69 -55.54 92 1 LEU B 93 ? ? -163.50 74.59 93 1 LYS B 95 ? ? -177.62 140.85 94 1 ASN B 96 ? ? 176.29 -61.15 95 1 LYS B 97 ? ? -156.67 -64.38 96 1 LEU B 99 ? ? -93.76 -73.17 97 1 LYS B 101 ? ? -49.13 -76.29 98 1 LYS B 102 ? ? -18.65 -60.98 99 1 LYS B 106 ? ? -123.55 -80.80 100 1 TYR B 107 ? ? -166.41 -50.55 101 1 ASN B 108 ? ? -66.59 -80.06 102 1 ALA B 109 ? ? -179.48 -101.38 103 1 ILE B 111 ? ? -147.06 25.94 104 1 SER B 113 ? ? -108.44 -143.92 105 1 VAL B 115 ? ? 171.24 101.81 106 1 LEU B 116 ? ? -139.69 -52.41 107 1 ILE B 117 ? ? 78.73 -131.43 108 1 VAL B 120 ? ? -177.89 15.73 109 1 ARG B 122 ? ? 175.71 54.79 110 1 LEU B 123 ? ? -170.57 -105.14 111 1 LEU B 124 ? ? -59.63 -90.03 112 1 PRO B 126 ? ? -64.73 -94.72 113 1 GLN B 127 ? ? -47.87 87.07 114 1 LEU B 128 ? ? 170.33 -26.49 115 1 SER B 129 ? ? -39.88 -92.91 116 1 LYS B 133 ? ? 179.24 146.07 117 1 PHE B 134 ? ? -171.50 58.05 118 1 PRO B 135 ? ? 61.39 87.09 119 1 SER B 139 ? ? 31.42 47.02 120 1 ASN B 141 ? ? -157.88 -44.91 121 1 ASP B 143 ? ? 169.28 -132.96 122 1 LEU B 144 ? ? -147.20 45.33 123 1 TYR B 145 ? ? -129.20 -51.45 124 1 ASP B 150 ? ? -104.75 44.01 125 1 VAL B 151 ? ? 178.86 32.55 126 1 ARG B 152 ? ? -170.08 -68.61 127 1 THR B 154 ? ? 56.25 89.62 128 1 ILE B 155 ? ? 64.39 112.19 129 1 LYS B 156 ? ? 59.38 -155.31 130 1 PHE B 157 ? ? -165.45 75.12 131 1 LYS B 161 ? ? 61.03 -111.09 132 1 LEU B 163 ? ? 55.86 -135.33 133 1 CYS B 164 ? ? 74.71 140.80 134 1 LEU B 165 ? ? 175.99 -163.57 135 1 ALA B 168 ? ? 175.47 156.79 136 1 VAL B 169 ? ? -155.32 -60.55 137 1 ASN B 171 ? ? -113.56 -93.61 138 1 VAL B 172 ? ? -91.52 -73.69 139 1 MET B 174 ? ? -176.05 26.44 140 1 GLU B 176 ? ? -139.93 -90.50 141 1 SER B 186 ? ? -80.92 45.41 142 1 VAL B 187 ? ? -170.93 132.43 143 1 ASN B 188 ? ? -144.93 -101.38 144 1 PHE B 189 ? ? -69.83 22.45 145 1 LEU B 193 ? ? -171.46 -130.79 146 1 LEU B 194 ? ? -73.92 -129.91 147 1 LYS B 195 ? ? -54.88 103.82 148 1 LYS B 196 ? ? 55.67 116.45 149 1 ASN B 197 ? ? -172.32 21.99 150 1 GLN B 199 ? ? -177.21 139.90 151 1 ASN B 200 ? ? -163.00 63.74 152 1 VAL B 201 ? ? -158.87 -131.78 153 1 SER B 203 ? ? -167.34 -160.50 154 1 LEU B 204 ? ? 176.95 -141.83 155 1 VAL B 206 ? ? 172.47 164.34 156 1 LYS B 207 ? ? 176.84 -105.61 157 1 SER B 208 ? ? 165.51 -53.12 158 1 SER B 209 ? ? 177.37 -21.56 159 1 MET B 210 ? ? -62.35 -105.26 160 1 PRO B 212 ? ? 52.59 -161.65 161 1 ALA B 213 ? ? -156.62 -93.08 162 1 ARG J 4 ? ? -146.12 29.02 163 1 PRO J 5 ? ? 67.42 177.15 164 1 CYS J 8 ? ? -67.02 50.03 165 1 TYR J 9 ? ? -110.73 -163.79 166 1 TYR J 11 ? ? -175.51 -108.02 167 1 GLN J 12 ? ? -176.95 -74.99 168 1 LYS J 13 ? ? 32.30 22.37 169 1 ASN J 14 ? ? 161.91 120.74 170 1 LYS J 15 ? ? -53.08 -81.17 171 1 PRO J 16 ? ? -167.96 90.12 172 1 PRO J 18 ? ? -56.42 3.76 173 1 LYS J 19 ? ? 37.48 34.80 174 1 SER J 20 ? ? -82.51 -132.93 175 1 ARG J 21 ? ? -30.65 -30.78 176 1 ASN J 23 ? ? -115.01 78.30 177 1 ALA J 25 ? ? 151.24 11.68 178 1 VAL J 26 ? ? -44.04 99.96 179 1 PRO J 27 ? ? -47.11 106.21 180 1 ASP J 28 ? ? -38.34 155.96 181 1 SER J 29 ? ? -50.91 -148.87 182 1 LYS J 30 ? ? -157.27 -33.00 183 1 ILE J 31 ? ? -119.58 78.07 184 1 ARG J 32 ? ? -88.62 40.57 185 1 TYR J 34 ? ? 167.30 78.32 186 1 ASP J 35 ? ? 141.23 -26.98 187 1 LEU J 36 ? ? -9.63 96.66 188 1 LYS J 38 ? ? -78.05 45.29 189 1 LYS J 39 ? ? -39.41 -171.01 190 1 LYS J 40 ? ? 42.87 29.24 191 1 ALA J 41 ? ? -57.61 -178.50 192 1 VAL J 43 ? ? 63.44 -7.58 193 1 ASP J 44 ? ? -108.25 -147.92 194 1 GLU J 45 ? ? 56.74 -118.03 195 1 PHE J 46 ? ? -52.96 68.00 196 1 PRO J 47 ? ? -77.13 -136.84 197 1 LEU J 48 ? ? 7.71 94.44 198 1 ASN J 55 ? ? -108.55 68.28 199 1 GLU J 56 ? ? -177.71 70.87 200 1 LEU J 57 ? ? -9.52 81.30 201 1 LEU J 60 ? ? -56.19 99.40 202 1 SER J 61 ? ? -52.60 -171.74 203 1 SER J 62 ? ? -77.80 -81.40 204 1 GLU J 66 ? ? -51.15 -74.81 205 1 ILE J 70 ? ? -37.12 -90.59 206 1 LYS J 74 ? ? -29.50 -66.79 207 1 MET J 76 ? ? -26.56 -61.46 208 1 THR J 78 ? ? -40.12 -13.68 209 1 VAL J 79 ? ? -140.54 30.65 210 1 SER J 80 ? ? -157.49 -24.40 211 1 ALA J 84 ? ? 175.40 -41.43 212 1 PHE J 85 ? ? -80.89 -126.53 213 1 HIS J 86 ? ? 88.85 79.08 214 1 VAL J 91 ? ? -109.70 -110.92 215 1 HIS J 92 ? ? 114.98 138.27 216 1 PRO J 93 ? ? -112.21 72.48 217 1 PHE J 94 ? ? -76.06 -143.38 218 1 HIS J 95 ? ? 41.33 94.38 219 1 MET J 115 ? ? 161.72 18.66 220 1 PRO J 122 ? ? -43.48 155.89 221 1 HIS J 123 ? ? -155.74 30.96 222 1 ILE J 131 ? ? -62.47 94.64 223 1 PHE J 136 ? ? -11.63 57.52 224 1 SER J 143 ? ? -62.64 14.78 225 1 LYS J 145 ? ? -33.59 -87.04 226 1 VAL J 147 ? ? -35.78 -86.51 227 1 ARG J 154 ? ? -21.27 -66.96 228 1 ARG J 156 ? ? -37.58 -35.69 229 1 PHE J 159 ? ? 64.90 85.51 230 1 PRO J 160 ? ? 8.72 55.95 231 1 GLN J 162 ? ? 125.15 -165.19 232 1 GLN J 163 ? ? 91.23 111.96 233 1 ILE J 165 ? ? 38.07 54.66 234 1 SER J 168 ? ? -124.65 -137.02 235 1 LYS J 169 ? ? 161.38 -161.41 236 1 LYS J 170 ? ? -169.47 -164.38 237 1 TRP J 171 ? ? 72.60 -130.20 238 1 THR J 174 ? ? -161.25 -163.18 239 1 ASN J 175 ? ? -16.70 -66.93 240 1 ASP J 177 ? ? -39.56 98.44 241 1 ARG J 178 ? ? 20.30 12.53 242 1 TYR J 181 ? ? -63.67 -83.82 243 1 ARG J 185 ? ? -62.41 30.39 244 1 GLU J 189 ? ? 161.25 137.69 245 1 VAL J 190 ? ? 34.45 -159.13 246 1 ASP J 192 ? ? 66.32 -119.96 247 1 ASP J 193 ? ? 50.15 -129.99 248 1 ALA J 195 ? ? -164.07 105.15 249 1 PHE J 196 ? ? -169.43 -110.49 250 1 LYS J 198 ? ? -69.51 77.38 251 1 PHE J 199 ? ? -103.12 52.07 252 1 LEU J 200 ? ? -140.96 55.02 253 1 SER J 201 ? ? -2.91 70.92 254 1 LYS J 203 ? ? 84.49 144.99 255 1 SER J 205 ? ? -169.73 -56.57 256 1 LEU J 206 ? ? -125.18 -85.57 257 1 GLU J 207 ? ? -19.46 -73.70 258 1 ASN J 208 ? ? -18.62 -86.56 259 1 GLU J 212 ? ? -68.52 -81.68 260 1 PRO J 214 ? ? -36.17 -78.70 261 1 TYR J 216 ? ? -48.26 -15.00 262 1 GLN J 220 ? ? -69.81 45.18 263 1 PRO k 8 ? ? 91.01 56.23 264 1 ASP k 11 ? ? 154.60 169.99 265 1 LEU k 12 ? ? 73.13 123.50 266 1 ILE k 14 ? ? -107.18 68.53 267 1 GLU k 15 ? ? 12.88 -94.65 268 1 LEU k 17 ? ? -100.73 44.94 269 1 VAL k 18 ? ? -18.92 82.58 270 1 VAL k 23 ? ? -50.07 -116.98 271 1 SER k 26 ? ? -100.22 -90.17 272 1 ARG k 29 ? ? -109.84 -70.30 273 1 THR k 31 ? ? -60.82 73.33 274 1 ARG k 32 ? ? 164.87 -75.47 275 1 SER k 34 ? ? -53.54 -96.65 276 1 LYS k 35 ? ? -18.36 -62.46 277 1 VAL k 36 ? ? -43.27 -71.50 278 1 GLN k 47 ? ? -57.08 -165.03 279 1 LYS k 49 ? ? -68.94 -129.84 280 1 ALA k 50 ? ? 168.48 50.32 281 1 ARG k 51 ? ? -69.96 57.67 282 1 TYR k 52 ? ? 150.55 -81.89 283 1 VAL k 54 ? ? 166.12 -137.69 284 1 ARG k 55 ? ? -63.22 -120.09 285 1 THR k 56 ? ? -20.35 67.95 286 1 PHE k 57 ? ? 51.66 -142.62 287 1 ILE k 59 ? ? -97.52 57.43 288 1 ASN k 62 ? ? -41.49 87.17 289 1 GLU k 63 ? ? -179.56 137.22 290 1 LYS k 64 ? ? 61.02 91.34 291 1 ILE k 65 ? ? 174.57 41.57 292 1 ALA k 66 ? ? 148.46 162.52 293 1 VAL k 69 ? ? -12.44 110.72 294 1 LYS k 75 ? ? -70.45 36.68 295 1 ALA k 76 ? ? -53.00 -86.87 296 1 GLU k 77 ? ? -34.53 -24.53 297 1 LEU k 80 ? ? -67.97 13.32 298 1 ARG k 82 ? ? -173.44 8.95 299 1 LYS k 85 ? ? -39.01 -106.50 300 1 VAL k 86 ? ? -14.57 -62.41 301 1 LYS k 87 ? ? -108.83 57.54 302 1 GLU k 88 ? ? 28.20 35.56 303 1 ARG k 92 ? ? 2.58 90.23 304 1 ARG k 94 ? ? 63.26 134.81 305 1 ASN k 95 ? ? -156.51 -10.19 306 1 ALA k 98 ? ? 52.99 4.31 307 1 ASN k 101 ? ? 53.92 80.98 308 1 PHE k 102 ? ? -31.23 -27.70 309 1 GLU k 108 ? ? -49.73 -178.49 310 1 HIS k 109 ? ? -138.45 -159.29 311 1 ILE k 110 ? ? 107.84 -139.59 312 1 ASP k 111 ? ? 74.49 105.63 313 1 LEU k 112 ? ? 172.19 97.82 314 1 ILE k 114 ? ? -100.50 -88.55 315 1 LYS k 115 ? ? 44.76 167.39 316 1 ASP k 117 ? ? -52.19 176.04 317 1 SER k 119 ? ? 80.83 -157.60 318 1 ILE k 120 ? ? -66.19 -114.69 319 1 ILE k 122 ? ? 57.23 -15.23 320 1 PHE k 123 ? ? 89.28 83.53 321 1 MET k 125 ? ? 72.51 -176.50 322 1 PHE k 127 ? ? -60.20 37.92 323 1 VAL k 129 ? ? 145.28 63.89 324 1 VAL k 130 ? ? -117.92 -133.43 325 1 MET k 131 ? ? -104.57 -160.53 326 1 ASN k 132 ? ? 142.00 42.35 327 1 ARG k 133 ? ? 68.87 -162.43 328 1 PRO k 134 ? ? -148.69 -158.68 329 1 ALA k 136 ? ? -127.81 -127.67 330 1 ARG k 137 ? ? -148.76 -45.45 331 1 ARG k 140 ? ? -77.39 23.67 332 1 ARG k 141 ? ? -64.00 -154.45 333 1 ARG k 143 ? ? 41.41 150.99 334 1 CYS k 144 ? ? 22.22 70.01 335 1 VAL k 148 ? ? -44.52 176.29 336 1 ASN k 150 ? ? -113.77 56.59 337 1 HIS k 152 ? ? 83.63 176.92 338 1 THR k 154 ? ? -38.86 73.51 339 1 THR k 155 ? ? 46.18 -109.86 340 1 LYS k 156 ? ? 28.68 -108.80 341 1 GLU k 157 ? ? -59.84 4.61 342 1 ASP k 158 ? ? -131.72 -65.87 343 1 SER k 161 ? ? -73.89 26.58 344 1 TRP k 162 ? ? -148.29 14.89 345 1 TYR k 167 ? ? 52.23 93.05 346 1 ASP k 170 ? ? -178.78 -40.02 # _pdbx_validate_peptide_omega.id 1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 ARG _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 k _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 51 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 TYR _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 k _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 52 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_peptide_omega.omega 122.79 # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 C a 547 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 2 1 C a 559 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 3 1 A a 574 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 4 1 A d 1545 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 5 1 U g 1157 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 6 1 U g 1158 ? ? 0.109 'SIDE CHAIN' 7 1 G h 1610 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 8 1 U h 1714 ? ? 0.142 'SIDE CHAIN' 9 1 G Y 4 ? ? 0.051 'SIDE CHAIN' 10 1 U Y 8 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 11 1 G Y 15 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 12 1 G Y 29 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 13 1 U Y 33 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 14 1 G W 4 ? ? 0.051 'SIDE CHAIN' 15 1 U W 8 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 16 1 G W 15 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 17 1 G W 29 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 18 1 U W 33 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' # _pdbx_entry_details.entry_id 3J0Q _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ;ENTRY HAS BEEN MODELED WITH 60S RIBOSOMAL RNA AND PROTEINS FROM SACCHAROMYCES CEREVISIAE, 40S RIBOSOMAL RNA AND PROTEINS FROM TETRAHYMENA THERMOPHILA, AND TRNA DERIVED FROM PDB ENTRY 2XSY (THERMUS THERMOPHILUS). ; _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # loop_ _em_3d_fitting.id _em_3d_fitting.entry_id _em_3d_fitting.ref_protocol _em_3d_fitting.ref_space _em_3d_fitting.overall_b_value _em_3d_fitting.target_criteria _em_3d_fitting.details _em_3d_fitting.method 1 3J0Q 'RIGID BODY FIT' REAL ? ? ;METHOD--LOCAL RIGID BODY DOCKING REFINEMENT PROTOCOL--RIGID BODY DOCKING DETAILS--RIGID BODY DOCKING CARRIED OUT WITH THE CHIMERA SOFTWARE PACKAGE DETAILS--40S ; ? 2 3J0Q ? ? ? ? DETAILS--60S ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.details _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id _em_3d_fitting_list.chain_id _em_3d_fitting_list.chain_residue_range _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range _em_3d_fitting_list.source_name _em_3d_fitting_list.type _em_3d_fitting_list.accession_code 1 1 2XZM ? 40S 1 ? ? ? PDB 'experimental model' 2XZM 1 2 3O58 ? 60S 2 ? ? ? PDB 'experimental model' 3O58 # _em_3d_reconstruction.entry_id 3J0Q _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'SINGLE PARTICLE' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 2.52 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 2.52 _em_3d_reconstruction.resolution 10.6 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details 'PROJECTION MATCHING' _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 23347 _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name 'polyamine buffer' _em_buffer.details 'polyamine buffer' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'Mammalian 80S-PRE complex in rotated 2 state' _em_entity_assembly.type RIBOSOME _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.entry_id 3J0Q _em_imaging.id 1 _em_imaging.microscope_model 'FEI POLARA 300' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2006-10-17 _em_imaging.temperature 77 _em_imaging.nominal_defocus_min 2000 _em_imaging.nominal_defocus_max 4000 _em_imaging.tilt_angle_min 0 _em_imaging.tilt_angle_max 0 _em_imaging.nominal_cs 2.0 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_magnification 39000 _em_imaging.calibrated_magnification 65520 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details 'LOW DOSE' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'Carbon coated Quantifoil grids' _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? # _em_vitrification.entry_id 3J0Q _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK I' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details 'Ethane / Vitrobot (FEI) flash-frozen in liquid ethane' _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 3J0Q _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 3J0Q _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 J MET 102 ? 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P GLN 110 # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal A OP3 O N N 1 A P P N N 2 A OP1 O N N 3 A OP2 O N N 4 A "O5'" O N N 5 A "C5'" C N N 6 A "C4'" C N R 7 A "O4'" O N N 8 A "C3'" C N S 9 A "O3'" O N N 10 A "C2'" C N R 11 A "O2'" O N N 12 A "C1'" C N R 13 A N9 N Y N 14 A C8 C Y N 15 A N7 N Y N 16 A C5 C Y N 17 A C6 C Y N 18 A N6 N N N 19 A N1 N Y N 20 A C2 C Y N 21 A N3 N Y N 22 A C4 C Y N 23 A HOP3 H N N 24 A HOP2 H N N 25 A "H5'" H N N 26 A "H5''" H N N 27 A "H4'" H N N 28 A "H3'" H N N 29 A "HO3'" H N N 30 A "H2'" H N N 31 A "HO2'" H N N 32 A "H1'" H N N 33 A H8 H N N 34 A H61 H N N 35 A H62 H N N 36 A H2 H N N 37 ALA N N N N 38 ALA CA C N S 39 ALA C C N N 40 ALA O O N N 41 ALA CB C N N 42 ALA OXT O N N 43 ALA H H N N 44 ALA H2 H N N 45 ALA HA H N N 46 ALA HB1 H N N 47 ALA HB2 H N N 48 ALA HB3 H N N 49 ALA HXT H N N 50 ARG N N N N 51 ARG CA C N S 52 ARG C C N N 53 ARG O O N N 54 ARG CB C N N 55 ARG CG C N N 56 ARG CD C N N 57 ARG NE N N N 58 ARG CZ C N N 59 ARG NH1 N N N 60 ARG NH2 N N N 61 ARG OXT O N N 62 ARG H H N N 63 ARG H2 H N N 64 ARG HA H N N 65 ARG HB2 H N N 66 ARG HB3 H N N 67 ARG HG2 H N N 68 ARG HG3 H N N 69 ARG HD2 H N N 70 ARG HD3 H N N 71 ARG HE H N N 72 ARG HH11 H N N 73 ARG HH12 H N N 74 ARG HH21 H N N 75 ARG HH22 H N N 76 ARG HXT H N N 77 ASN N N N N 78 ASN CA C N S 79 ASN C C N N 80 ASN O O N N 81 ASN CB C N N 82 ASN CG C N N 83 ASN OD1 O N N 84 ASN ND2 N N N 85 ASN OXT O N N 86 ASN H H N N 87 ASN H2 H N N 88 ASN HA H N N 89 ASN HB2 H N N 90 ASN HB3 H N N 91 ASN HD21 H N N 92 ASN HD22 H N N 93 ASN HXT H N N 94 ASP N N N N 95 ASP CA C N S 96 ASP C C N N 97 ASP O O N N 98 ASP CB C N N 99 ASP CG C N N 100 ASP OD1 O N N 101 ASP OD2 O N N 102 ASP OXT O N N 103 ASP H H N N 104 ASP H2 H N N 105 ASP HA H N N 106 ASP HB2 H N N 107 ASP HB3 H N N 108 ASP HD2 H N N 109 ASP HXT H N N 110 C OP3 O N N 111 C P P N N 112 C OP1 O N N 113 C OP2 O N N 114 C "O5'" O N N 115 C "C5'" C N N 116 C "C4'" C N R 117 C "O4'" O N N 118 C "C3'" C N S 119 C "O3'" O N N 120 C "C2'" C N R 121 C "O2'" O N N 122 C "C1'" C N R 123 C N1 N N N 124 C C2 C N N 125 C O2 O N N 126 C N3 N N N 127 C C4 C N N 128 C N4 N N N 129 C C5 C N N 130 C C6 C N N 131 C HOP3 H N N 132 C HOP2 H N N 133 C "H5'" H N N 134 C "H5''" H N N 135 C "H4'" H N N 136 C "H3'" H N N 137 C "HO3'" H N N 138 C "H2'" H N N 139 C "HO2'" H N N 140 C "H1'" H N N 141 C H41 H N N 142 C H42 H N N 143 C H5 H N N 144 C H6 H N N 145 CYS N N N N 146 CYS CA C N R 147 CYS C C N N 148 CYS O O N N 149 CYS CB C N N 150 CYS SG S N N 151 CYS OXT O N N 152 CYS H H N N 153 CYS H2 H N N 154 CYS HA H N N 155 CYS HB2 H N N 156 CYS HB3 H N N 157 CYS HG H N N 158 CYS HXT H N N 159 G OP3 O N N 160 G P P N N 161 G OP1 O N N 162 G OP2 O N N 163 G "O5'" O N N 164 G "C5'" C N N 165 G "C4'" C N R 166 G "O4'" O N N 167 G "C3'" C N S 168 G "O3'" O N N 169 G "C2'" C N R 170 G "O2'" O N N 171 G "C1'" C N R 172 G N9 N Y N 173 G C8 C Y N 174 G N7 N Y N 175 G C5 C Y N 176 G C6 C N N 177 G O6 O N N 178 G N1 N N N 179 G C2 C N N 180 G N2 N N N 181 G N3 N N N 182 G C4 C Y N 183 G HOP3 H N N 184 G HOP2 H N N 185 G "H5'" H N N 186 G "H5''" H N N 187 G "H4'" H N N 188 G "H3'" H N N 189 G "HO3'" H N N 190 G "H2'" H N N 191 G "HO2'" H N N 192 G "H1'" H N N 193 G H8 H N N 194 G H1 H N N 195 G H21 H N N 196 G H22 H N N 197 GLN N N N N 198 GLN CA C N S 199 GLN C C N N 200 GLN O O N N 201 GLN CB C N N 202 GLN CG C N N 203 GLN CD C N N 204 GLN OE1 O N N 205 GLN NE2 N N N 206 GLN OXT O N N 207 GLN H H N N 208 GLN H2 H N N 209 GLN HA H N N 210 GLN HB2 H N N 211 GLN HB3 H N N 212 GLN HG2 H N N 213 GLN HG3 H N N 214 GLN HE21 H N N 215 GLN HE22 H N N 216 GLN HXT H N N 217 GLU N N N N 218 GLU CA C N S 219 GLU C C N N 220 GLU O O N N 221 GLU CB C N N 222 GLU CG C N N 223 GLU CD C N N 224 GLU OE1 O N N 225 GLU OE2 O N N 226 GLU OXT O N N 227 GLU H H N N 228 GLU H2 H N N 229 GLU HA H N N 230 GLU HB2 H N N 231 GLU HB3 H N N 232 GLU HG2 H N N 233 GLU HG3 H N N 234 GLU HE2 H N N 235 GLU HXT H N N 236 GLY N N N N 237 GLY CA C N N 238 GLY C C N N 239 GLY O O N N 240 GLY OXT O N N 241 GLY H H N N 242 GLY H2 H N N 243 GLY HA2 H N N 244 GLY HA3 H N N 245 GLY HXT H N N 246 HIS N N N N 247 HIS CA C N S 248 HIS C C N N 249 HIS O O N N 250 HIS CB C N N 251 HIS CG C Y N 252 HIS ND1 N Y N 253 HIS CD2 C Y N 254 HIS CE1 C Y N 255 HIS NE2 N Y N 256 HIS OXT O N N 257 HIS H H N N 258 HIS H2 H N N 259 HIS HA H N N 260 HIS HB2 H N N 261 HIS HB3 H N N 262 HIS HD1 H N N 263 HIS HD2 H N N 264 HIS HE1 H N N 265 HIS HE2 H N N 266 HIS HXT H N N 267 ILE N N N N 268 ILE CA C N S 269 ILE C C N N 270 ILE O O N N 271 ILE CB C N S 272 ILE CG1 C N N 273 ILE CG2 C N N 274 ILE CD1 C N N 275 ILE OXT O N N 276 ILE H H N N 277 ILE H2 H N N 278 ILE HA H N N 279 ILE HB H N N 280 ILE HG12 H N N 281 ILE HG13 H N N 282 ILE HG21 H N N 283 ILE HG22 H N N 284 ILE HG23 H N N 285 ILE HD11 H N N 286 ILE HD12 H N N 287 ILE HD13 H 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OXT O N N 520 VAL H H N N 521 VAL H2 H N N 522 VAL HA H N N 523 VAL HB H N N 524 VAL HG11 H N N 525 VAL HG12 H N N 526 VAL HG13 H N N 527 VAL HG21 H N N 528 VAL HG22 H N N 529 VAL HG23 H N N 530 VAL HXT H N N 531 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal A OP3 P sing N N 1 A OP3 HOP3 sing N N 2 A P OP1 doub N N 3 A P OP2 sing N N 4 A P "O5'" sing N N 5 A OP2 HOP2 sing N N 6 A "O5'" "C5'" sing N N 7 A "C5'" "C4'" sing N N 8 A "C5'" "H5'" sing N N 9 A "C5'" "H5''" sing N N 10 A "C4'" "O4'" sing N N 11 A "C4'" "C3'" sing N N 12 A "C4'" "H4'" sing N N 13 A "O4'" "C1'" sing N N 14 A "C3'" "O3'" sing N N 15 A "C3'" "C2'" sing N N 16 A "C3'" "H3'" sing N N 17 A "O3'" "HO3'" sing N N 18 A "C2'" "O2'" sing N N 19 A "C2'" "C1'" sing N N 20 A "C2'" "H2'" sing N N 21 A "O2'" "HO2'" sing N N 22 A "C1'" N9 sing N N 23 A "C1'" "H1'" 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"O5'" "C5'" sing N N 115 C "C5'" "C4'" sing N N 116 C "C5'" "H5'" sing N N 117 C "C5'" "H5''" sing N N 118 C "C4'" "O4'" sing N N 119 C "C4'" "C3'" sing N N 120 C "C4'" "H4'" sing N N 121 C "O4'" "C1'" sing N N 122 C "C3'" "O3'" sing N N 123 C "C3'" "C2'" sing N N 124 C "C3'" "H3'" sing N N 125 C "O3'" "HO3'" sing N N 126 C "C2'" "O2'" sing N N 127 C "C2'" "C1'" sing N N 128 C "C2'" "H2'" sing N N 129 C "O2'" "HO2'" sing N N 130 C "C1'" N1 sing N N 131 C "C1'" "H1'" sing N N 132 C N1 C2 sing N N 133 C N1 C6 sing N N 134 C C2 O2 doub N N 135 C C2 N3 sing N N 136 C N3 C4 doub N N 137 C C4 N4 sing N N 138 C C4 C5 sing N N 139 C N4 H41 sing N N 140 C N4 H42 sing N N 141 C C5 C6 doub N N 142 C C5 H5 sing N N 143 C C6 H6 sing N N 144 CYS N CA sing N N 145 CYS N H sing N N 146 CYS N H2 sing N N 147 CYS CA C sing N N 148 CYS CA CB sing N N 149 CYS CA HA sing N N 150 CYS C O doub N N 151 CYS C OXT sing N N 152 CYS CB SG sing N N 153 CYS CB HB2 sing N N 154 CYS CB HB3 sing N N 155 CYS SG HG sing N N 156 CYS OXT HXT sing N N 157 G OP3 P sing N N 158 G OP3 HOP3 sing N N 159 G P OP1 doub N N 160 G P OP2 sing N N 161 G P "O5'" sing N N 162 G OP2 HOP2 sing N N 163 G "O5'" "C5'" sing N N 164 G "C5'" "C4'" sing N N 165 G "C5'" "H5'" sing N N 166 G "C5'" "H5''" sing N N 167 G "C4'" "O4'" sing N N 168 G "C4'" "C3'" sing N N 169 G "C4'" "H4'" sing N N 170 G "O4'" "C1'" sing N N 171 G "C3'" "O3'" sing N N 172 G "C3'" "C2'" sing N N 173 G "C3'" "H3'" sing N N 174 G "O3'" "HO3'" sing N N 175 G "C2'" "O2'" sing N N 176 G "C2'" "C1'" sing N N 177 G "C2'" "H2'" sing N N 178 G "O2'" "HO2'" sing N N 179 G "C1'" N9 sing N N 180 G "C1'" "H1'" sing N N 181 G N9 C8 sing Y N 182 G N9 C4 sing Y N 183 G C8 N7 doub Y N 184 G C8 H8 sing N N 185 G N7 C5 sing Y N 186 G C5 C6 sing N N 187 G C5 C4 doub Y N 188 G C6 O6 doub N N 189 G C6 N1 sing N N 190 G N1 C2 sing N N 191 G N1 H1 sing N N 192 G C2 N2 sing N N 193 G C2 N3 doub N N 194 G N2 H21 sing N N 195 G N2 H22 sing N N 196 G N3 C4 sing N N 197 GLN N CA 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N N 241 GLY C OXT sing N N 242 GLY OXT HXT sing N N 243 HIS N CA sing N N 244 HIS N H sing N N 245 HIS N H2 sing N N 246 HIS CA C sing N N 247 HIS CA CB sing N N 248 HIS CA HA sing N N 249 HIS C O doub N N 250 HIS C OXT sing N N 251 HIS CB CG sing N N 252 HIS CB HB2 sing N N 253 HIS CB HB3 sing N N 254 HIS CG ND1 sing Y N 255 HIS CG CD2 doub Y N 256 HIS ND1 CE1 doub Y N 257 HIS ND1 HD1 sing N N 258 HIS CD2 NE2 sing Y N 259 HIS CD2 HD2 sing N N 260 HIS CE1 NE2 sing Y N 261 HIS CE1 HE1 sing N N 262 HIS NE2 HE2 sing N N 263 HIS OXT HXT sing N N 264 ILE N CA sing N N 265 ILE N H sing N N 266 ILE N H2 sing N N 267 ILE CA C sing N N 268 ILE CA CB sing N N 269 ILE CA HA sing N N 270 ILE C O doub N N 271 ILE C OXT sing N N 272 ILE CB CG1 sing N N 273 ILE CB CG2 sing N N 274 ILE CB HB sing N N 275 ILE CG1 CD1 sing N N 276 ILE CG1 HG12 sing N N 277 ILE CG1 HG13 sing N N 278 ILE CG2 HG21 sing N N 279 ILE CG2 HG22 sing N N 280 ILE CG2 HG23 sing N N 281 ILE CD1 HD11 sing N N 282 ILE CD1 HD12 sing N 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