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'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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ASP E 458 GLN E 461 5 ? 4 HELX_P HELX_P76 76 PHE M 443 ? GLY M 454 ? PHE E 462 GLY E 473 1 ? 12 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? A CYS 23 SG ? ? ? 1_555 A CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf2 disulf ? ? B CYS 19 SG ? ? ? 1_555 B CYS 93 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf3 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 88 SG ? ? J CYS 23 J CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf4 disulf ? ? D CYS 19 SG ? ? ? 1_555 D CYS 93 SG ? ? F CYS 22 F CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf5 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? K CYS 23 K CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf6 disulf ? ? F CYS 19 SG ? ? ? 1_555 F CYS 93 SG ? ? G CYS 22 G CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf7 disulf ? ? G CYS 23 SG ? ? ? 1_555 G CYS 88 SG ? ? M CYS 23 M CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf8 disulf ? ? H CYS 19 SG ? ? ? 1_555 H CYS 93 SG ? ? I CYS 22 I CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 7 A . ? THR 7 L PRO 8 A ? PRO 8 L 1 -1.18 2 SER 94 A . ? SER 94 L PRO 95 A ? PRO 95 L 1 -2.39 3 THR 7 C . ? THR 7 J PRO 8 C ? PRO 8 J 1 -1.05 4 SER 94 C . ? SER 94 J PRO 95 C ? PRO 95 J 1 -2.49 5 THR 7 E . ? THR 7 K PRO 8 E ? PRO 8 K 1 -1.16 6 SER 94 E . ? SER 94 K PRO 95 E ? PRO 95 K 1 -2.46 7 THR 7 G . ? THR 7 M PRO 8 G ? PRO 8 M 1 -1.07 8 SER 94 G . ? SER 94 M PRO 95 G ? PRO 95 M 1 -2.38 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 4 ? B ? 6 ? C ? 6 ? D ? 4 ? E ? 3 ? F ? 4 ? G ? 6 ? H ? 6 ? I ? 4 ? J ? 3 ? K ? 4 ? L ? 6 ? M ? 6 ? N ? 4 ? O ? 3 ? P ? 4 ? Q ? 6 ? R ? 6 ? S ? 4 ? T ? 3 ? U ? 3 ? V ? 4 ? W ? 4 ? X ? 3 ? Y ? 3 ? Z ? 2 ? AA ? 6 ? AB ? 3 ? AC ? 2 ? AD ? 4 ? AE ? 3 ? AF ? 3 ? AG ? 4 ? AH ? 4 ? AI ? 3 ? AJ ? 6 ? AK ? 3 ? AL ? 4 ? AM ? 4 ? AN ? 3 ? AO ? 3 ? AP ? 2 ? AQ ? 2 ? AR ? 4 ? AS ? 2 ? AT ? 6 ? AU ? 3 ? AV ? 4 ? AW ? 4 ? AX ? 3 ? AY ? 3 ? AZ ? 2 ? BA ? 2 ? BB ? 4 ? BC ? 2 ? BD ? 6 ? BE ? 3 ? BF ? 4 ? BG ? 4 ? BH ? 3 ? BI ? 3 ? BJ ? 2 ? BK ? 2 ? BL ? 4 ? BM ? 2 ? BN ? 6 ? BO ? 2 ? BP ? 2 ? BQ ? 4 ? BR ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel B 1 2 ? parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? anti-parallel B 5 6 ? anti-parallel C 1 2 ? parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel C 4 5 ? anti-parallel C 5 6 ? anti-parallel D 1 2 ? parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel F 3 4 ? anti-parallel G 1 2 ? parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel G 4 5 ? anti-parallel G 5 6 ? anti-parallel H 1 2 ? parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? anti-parallel H 5 6 ? anti-parallel I 1 2 ? parallel I 2 3 ? anti-parallel I 3 4 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel L 1 2 ? parallel L 2 3 ? anti-parallel L 3 4 ? anti-parallel L 4 5 ? anti-parallel L 5 6 ? anti-parallel M 1 2 ? parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel M 4 5 ? anti-parallel M 5 6 ? anti-parallel N 1 2 ? parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? anti-parallel P 3 4 ? anti-parallel Q 1 2 ? parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel Q 4 5 ? anti-parallel Q 5 6 ? anti-parallel R 1 2 ? parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel R 4 5 ? anti-parallel R 5 6 ? anti-parallel S 1 2 ? parallel S 2 3 ? anti-parallel S 3 4 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? anti-parallel V 3 4 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel W 2 3 ? anti-parallel W 3 4 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel X 2 3 ? parallel Y 1 2 ? parallel Y 2 3 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AA 3 4 ? anti-parallel AA 4 5 ? anti-parallel AA 5 6 ? parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? anti-parallel AD 3 4 ? parallel AE 1 2 ? parallel AE 2 3 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AF 2 3 ? anti-parallel AG 1 2 ? anti-parallel AG 2 3 ? anti-parallel AG 3 4 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AH 2 3 ? anti-parallel AH 3 4 ? anti-parallel AI 1 2 ? anti-parallel AI 2 3 ? parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AJ 3 4 ? anti-parallel AJ 4 5 ? anti-parallel AJ 5 6 ? parallel AK 1 2 ? anti-parallel AK 2 3 ? anti-parallel AL 1 2 ? anti-parallel AL 2 3 ? anti-parallel AL 3 4 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AM 2 3 ? anti-parallel AM 3 4 ? anti-parallel AN 1 2 ? anti-parallel AN 2 3 ? parallel AO 1 2 ? parallel AO 2 3 ? anti-parallel AP 1 2 ? anti-parallel AQ 1 2 ? anti-parallel AR 1 2 ? anti-parallel AR 2 3 ? anti-parallel AR 3 4 ? parallel AS 1 2 ? anti-parallel AT 1 2 ? anti-parallel AT 2 3 ? anti-parallel AT 3 4 ? anti-parallel AT 4 5 ? anti-parallel AT 5 6 ? parallel AU 1 2 ? anti-parallel AU 2 3 ? anti-parallel AV 1 2 ? anti-parallel AV 2 3 ? anti-parallel AV 3 4 ? anti-parallel AW 1 2 ? anti-parallel AW 2 3 ? anti-parallel AW 3 4 ? anti-parallel AX 1 2 ? anti-parallel AX 2 3 ? parallel AY 1 2 ? parallel AY 2 3 ? anti-parallel AZ 1 2 ? anti-parallel BA 1 2 ? anti-parallel BB 1 2 ? anti-parallel BB 2 3 ? anti-parallel BB 3 4 ? parallel BC 1 2 ? anti-parallel BD 1 2 ? anti-parallel BD 2 3 ? anti-parallel BD 3 4 ? anti-parallel BD 4 5 ? anti-parallel BD 5 6 ? parallel BE 1 2 ? anti-parallel BE 2 3 ? anti-parallel BF 1 2 ? anti-parallel BF 2 3 ? anti-parallel BF 3 4 ? anti-parallel BG 1 2 ? anti-parallel BG 2 3 ? anti-parallel BG 3 4 ? anti-parallel BH 1 2 ? anti-parallel BH 2 3 ? parallel BI 1 2 ? parallel BI 2 3 ? anti-parallel BJ 1 2 ? anti-parallel BK 1 2 ? anti-parallel BL 1 2 ? anti-parallel BL 2 3 ? anti-parallel BL 3 4 ? parallel BM 1 2 ? anti-parallel BN 1 2 ? anti-parallel BN 2 3 ? anti-parallel BN 3 4 ? anti-parallel BN 4 5 ? anti-parallel BN 5 6 ? parallel BO 1 2 ? anti-parallel BP 1 2 ? anti-parallel BQ 1 2 ? anti-parallel BQ 2 3 ? anti-parallel BQ 3 4 ? parallel BR 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 MET A 4 ? THR A 7 ? MET L 4 THR L 7 A 2 VAL A 19 ? ALA A 25 ? VAL L 19 ALA L 25 A 3 GLN A 70 ? ILE A 75 ? GLN L 70 ILE L 75 A 4 PHE A 62 ? GLY A 66 ? PHE L 62 GLY L 66 B 1 SER A 10 ? ALA A 13 ? SER L 10 ALA L 13 B 2 THR A 102 ? LEU A 106 ? THR L 102 LEU L 106 B 3 GLY A 84 ? HIS A 90 ? GLY L 84 HIS L 90 B 4 LEU A 33 ? GLN A 38 ? LEU L 33 GLN L 38 B 5 GLN A 45 ? TYR A 49 ? GLN L 45 TYR L 49 B 6 THR A 53 ? LEU A 54 ? THR L 53 LEU L 54 C 1 ALA B 6 ? ALA B 9 ? ALA H 9 ALA H 12 C 2 THR B 113 ? VAL B 117 ? THR H 107 VAL H 111 C 3 ALA B 89 ? ASP B 100 ? ALA H 88 ASP H 99 C 4 MET B 31 ? GLN B 36 ? MET H 34 GLN H 39 C 5 LEU B 42 ? ILE B 48 ? LEU H 45 ILE H 51 C 6 THR B 55 ? TYR B 57 ? THR H 57 TYR H 59 D 1 ALA B 6 ? ALA B 9 ? ALA H 9 ALA H 12 D 2 THR B 113 ? VAL B 117 ? THR H 107 VAL H 111 D 3 ALA B 89 ? ASP B 100 ? ALA H 88 ASP H 99 D 4 VAL B 103 B TRP B 109 ? VAL H 100 TRP H 103 E 1 VAL B 15 ? LYS B 20 ? VAL H 18 LYS H 23 E 2 THR B 75 ? LEU B 80 ? THR H 77 LEU H 82 E 3 ALA B 65 ? ASP B 70 ? ALA H 67 ASP H 72 F 1 MET C 4 ? THR C 7 ? MET J 4 THR J 7 F 2 VAL C 19 ? ALA C 25 ? VAL J 19 ALA J 25 F 3 GLN C 70 ? ILE C 75 ? GLN J 70 ILE J 75 F 4 PHE C 62 ? GLY C 66 ? PHE J 62 GLY J 66 G 1 SER C 10 ? ALA C 13 ? SER J 10 ALA J 13 G 2 THR C 102 ? LEU C 106 ? THR J 102 LEU J 106 G 3 GLY C 84 ? HIS C 90 ? GLY J 84 HIS J 90 G 4 LEU C 33 ? GLN C 38 ? LEU J 33 GLN J 38 G 5 GLN C 45 ? TYR C 49 ? GLN J 45 TYR J 49 G 6 THR C 53 ? LEU C 54 ? THR J 53 LEU J 54 H 1 ALA D 6 ? ALA D 9 ? ALA F 9 ALA F 12 H 2 THR D 113 ? VAL D 117 ? THR F 107 VAL F 111 H 3 ALA D 89 ? ASP D 100 ? ALA F 88 ASP F 99 H 4 MET D 31 ? GLN D 36 ? MET F 34 GLN F 39 H 5 LEU D 42 ? ILE D 48 ? LEU F 45 ILE F 51 H 6 THR D 55 ? TYR D 57 ? THR F 57 TYR F 59 I 1 ALA D 6 ? ALA D 9 ? ALA F 9 ALA F 12 I 2 THR D 113 ? VAL D 117 ? THR F 107 VAL F 111 I 3 ALA D 89 ? ASP D 100 ? ALA F 88 ASP F 99 I 4 VAL D 103 B TRP D 109 ? VAL F 100 TRP F 103 J 1 VAL D 15 ? LYS D 20 ? VAL F 18 LYS F 23 J 2 THR D 75 ? LEU D 80 ? THR F 77 LEU F 82 J 3 ALA D 65 ? ASP D 70 ? ALA F 67 ASP F 72 K 1 MET E 4 ? THR E 7 ? MET K 4 THR K 7 K 2 VAL E 19 ? ALA E 25 ? VAL K 19 ALA K 25 K 3 GLN E 70 ? ILE E 75 ? GLN K 70 ILE K 75 K 4 PHE E 62 ? GLY E 66 ? PHE K 62 GLY K 66 L 1 SER E 10 ? ALA E 13 ? SER K 10 ALA K 13 L 2 THR E 102 ? LEU E 106 ? THR K 102 LEU K 106 L 3 GLY E 84 ? HIS E 90 ? GLY K 84 HIS K 90 L 4 LEU E 33 ? GLN E 38 ? LEU K 33 GLN K 38 L 5 GLN E 45 ? TYR E 49 ? GLN K 45 TYR K 49 L 6 THR E 53 ? LEU E 54 ? THR K 53 LEU K 54 M 1 ALA F 6 ? ALA F 9 ? ALA G 9 ALA G 12 M 2 THR F 113 ? VAL F 117 ? THR G 107 VAL G 111 M 3 ALA F 89 ? ASP F 100 ? ALA G 88 ASP G 99 M 4 MET F 31 ? GLN F 36 ? MET G 34 GLN G 39 M 5 LEU F 42 ? ILE F 48 ? LEU G 45 ILE G 51 M 6 THR F 55 ? TYR F 57 ? THR G 57 TYR G 59 N 1 ALA F 6 ? ALA F 9 ? ALA G 9 ALA G 12 N 2 THR F 113 ? VAL F 117 ? THR G 107 VAL G 111 N 3 ALA F 89 ? ASP F 100 ? ALA G 88 ASP G 99 N 4 VAL F 103 B TRP F 109 ? VAL G 100 TRP G 103 O 1 VAL F 15 ? LYS F 20 ? 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3 263 SER 263 282 282 SER SER E . n M 3 264 THR 264 283 283 THR THR E . n M 3 265 ALA 265 284 284 ALA ALA E . n M 3 266 ASN 266 285 285 ASN ASN E . n M 3 267 LEU 267 286 286 LEU LEU E . n M 3 268 ALA 268 287 287 ALA ALA E . n M 3 269 SER 269 288 288 SER SER E . n M 3 270 SER 270 289 289 SER SER E . n M 3 271 ASN 271 290 290 ASN ASN E . n M 3 272 TYR 272 291 291 TYR TYR E . n M 3 273 PHE 273 292 292 PHE PHE E . n M 3 274 PRO 274 293 293 PRO PRO E . n M 3 275 THR 275 294 294 THR THR E . n M 3 276 PRO 276 295 295 PRO PRO E . n M 3 277 SER 277 296 296 SER SER E . n M 3 278 GLY 278 297 297 GLY GLY E . n M 3 279 SER 279 298 298 SER SER E . n M 3 280 MET 280 299 299 MET MET E . n M 3 281 VAL 281 300 300 VAL VAL E . n M 3 282 THR 282 301 301 THR THR E . n M 3 283 SER 283 302 302 SER SER E . n M 3 284 ASP 284 303 303 ASP ASP E . n M 3 285 ALA 285 304 304 ALA ALA E . n M 3 286 GLN 286 305 305 GLN GLN E . n M 3 287 ILE 287 306 306 ILE ILE E . n M 3 288 PHE 288 307 307 PHE PHE E . n M 3 289 ASN 289 308 308 ASN ASN E . n M 3 290 LYS 290 309 309 LYS LYS E . n M 3 291 PRO 291 310 310 PRO PRO E . n M 3 292 TYR 292 311 311 TYR TYR E . n M 3 293 TRP 293 312 312 TRP TRP E . n M 3 294 LEU 294 313 313 LEU LEU E . n M 3 295 GLN 295 314 314 GLN GLN E . n M 3 296 ARG 296 315 315 ARG ARG E . n M 3 297 ALA 297 316 316 ALA ALA E . n M 3 298 GLN 298 317 317 GLN GLN E . n M 3 299 GLY 299 318 318 GLY GLY E . n M 3 300 HIS 300 319 319 HIS HIS E . n M 3 301 ASN 301 320 320 ASN ASN E . n M 3 302 ASN 302 321 321 ASN ASN E . n M 3 303 GLY 303 322 322 GLY GLY E . n M 3 304 ILE 304 323 323 ILE ILE E . n M 3 305 CYS 305 324 324 CYS CYS E . n M 3 306 TRP 306 325 325 TRP TRP E . n M 3 307 GLY 307 326 326 GLY GLY E . n M 3 308 ASN 308 327 327 ASN ASN E . n M 3 309 GLN 309 328 328 GLN GLN E . n M 3 310 LEU 310 329 329 LEU LEU E . n M 3 311 PHE 311 330 330 PHE PHE E . n M 3 312 VAL 312 331 331 VAL VAL E . n M 3 313 THR 313 332 332 THR THR E . n M 3 314 VAL 314 333 333 VAL VAL E . n M 3 315 VAL 315 334 334 VAL VAL E . n M 3 316 ASP 316 335 335 ASP ASP E . n M 3 317 THR 317 336 336 THR THR E . n M 3 318 THR 318 337 337 THR THR E . n M 3 319 ARG 319 338 338 ARG ARG E . n M 3 320 SER 320 339 339 SER SER E . n M 3 321 THR 321 340 340 THR THR E . n M 3 322 ASN 322 341 341 ASN ASN E . n M 3 323 MET 323 342 342 MET MET E . n M 3 324 SER 324 343 343 SER SER E . n M 3 325 LEU 325 344 344 LEU LEU E . n M 3 326 CYS 326 345 345 CYS CYS E . n M 3 327 ALA 327 346 346 ALA ALA E . n M 3 328 ALA 328 347 347 ALA ALA E . n M 3 329 ILE 329 348 348 ILE ILE E . n M 3 330 SER 330 349 349 SER SER E . n M 3 331 THR 331 350 350 THR THR E . n M 3 332 SER 332 351 351 SER SER E . n M 3 333 GLU 333 352 352 GLU GLU E . n M 3 334 THR 334 353 353 THR THR E . n M 3 335 THR 335 354 354 THR THR E . n M 3 336 TYR 336 355 355 TYR TYR E . n M 3 337 LYS 337 356 356 LYS LYS E . n M 3 338 ASN 338 357 357 ASN ASN E . n M 3 339 THR 339 358 358 THR THR E . n M 3 340 ASN 340 359 359 ASN ASN E . n M 3 341 PHE 341 360 360 PHE PHE E . n M 3 342 LYS 342 361 361 LYS LYS E . n M 3 343 GLU 343 362 362 GLU GLU E . n M 3 344 TYR 344 363 363 TYR TYR E . n M 3 345 LEU 345 364 364 LEU LEU E . n M 3 346 ARG 346 365 365 ARG ARG E . n M 3 347 HIS 347 366 366 HIS HIS E . n M 3 348 GLY 348 367 367 GLY GLY E . n M 3 349 GLU 349 368 368 GLU GLU E . n M 3 350 GLU 350 369 369 GLU GLU E . n M 3 351 TYR 351 370 370 TYR TYR E . n M 3 352 ASP 352 371 371 ASP ASP E . n M 3 353 LEU 353 372 372 LEU LEU E . n M 3 354 GLN 354 373 373 GLN GLN E . n M 3 355 PHE 355 374 374 PHE PHE E . n M 3 356 ILE 356 375 375 ILE ILE E . n M 3 357 PHE 357 376 376 PHE PHE E . n M 3 358 GLN 358 377 377 GLN GLN E . n M 3 359 LEU 359 378 378 LEU LEU E . n M 3 360 CYS 360 379 379 CYS CYS E . n M 3 361 LYS 361 380 380 LYS LYS E . n M 3 362 ILE 362 381 381 ILE ILE E . n M 3 363 THR 363 382 382 THR THR E . n M 3 364 LEU 364 383 383 LEU LEU E . n M 3 365 THR 365 384 384 THR THR E . n M 3 366 ALA 366 385 385 ALA ALA E . n M 3 367 ASP 367 386 386 ASP ASP E . n M 3 368 VAL 368 387 387 VAL VAL E . n M 3 369 MET 369 388 388 MET MET E . n M 3 370 THR 370 389 389 THR THR E . n M 3 371 TYR 371 390 390 TYR TYR E . n M 3 372 ILE 372 391 391 ILE ILE E . n M 3 373 HIS 373 392 392 HIS HIS E . n M 3 374 SER 374 393 393 SER SER E . n M 3 375 MET 375 394 394 MET MET E . n M 3 376 ASN 376 395 395 ASN ASN E . n M 3 377 SER 377 396 396 SER SER E . n M 3 378 THR 378 397 397 THR THR E . n M 3 379 ILE 379 398 398 ILE ILE E . n M 3 380 LEU 380 399 399 LEU LEU E . n M 3 381 GLU 381 400 400 GLU GLU E . n M 3 382 ASP 382 401 401 ASP ASP E . n M 3 383 TRP 383 402 402 TRP TRP E . n M 3 384 ASN 384 403 403 ASN ASN E . n M 3 385 PHE 385 404 ? ? ? E . n M 3 386 GLY 386 405 ? ? ? E . n M 3 387 LEU 387 406 ? ? ? E . n M 3 388 GLN 388 407 ? ? ? E . n M 3 389 PRO 389 408 ? ? ? E . n M 3 390 PRO 390 409 ? ? ? E . n M 3 391 PRO 391 410 ? ? ? E . n M 3 392 GLY 392 411 ? ? ? E . n M 3 393 GLY 393 412 ? ? ? E . n M 3 394 THR 394 413 ? ? ? E . n M 3 395 LEU 395 414 ? ? ? E . n M 3 396 GLU 396 415 ? ? ? E . n M 3 397 ASP 397 416 ? ? ? E . n M 3 398 THR 398 417 ? ? ? E . n M 3 399 TYR 399 418 ? ? ? E . n M 3 400 ARG 400 419 ? ? ? E . n M 3 401 PHE 401 420 ? ? ? E . n M 3 402 VAL 402 421 ? ? ? E . n M 3 403 THR 403 422 ? ? ? E . n M 3 404 SER 404 423 ? ? ? E . n M 3 405 GLN 405 424 ? ? ? E . n M 3 406 ALA 406 425 ? ? ? E . n M 3 407 ILE 407 426 ? ? ? E . n M 3 408 ALA 408 427 ? ? ? E . n M 3 409 CYS 409 428 ? ? ? E . n M 3 410 GLN 410 429 ? ? ? E . n M 3 411 LYS 411 430 ? ? ? E . n M 3 412 HIS 412 431 ? ? ? E . n M 3 413 THR 413 432 ? ? ? E . n M 3 414 PRO 414 433 ? ? ? E . n M 3 415 PRO 415 434 ? ? ? E . n M 3 416 ALA 416 435 ? ? ? 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E . n M 3 419 GLU 419 438 438 GLU GLU E . n M 3 420 ASP 420 439 439 ASP ASP E . n M 3 421 PRO 421 440 440 PRO PRO E . n M 3 422 LEU 422 441 441 LEU LEU E . n M 3 423 LYS 423 442 442 LYS LYS E . n M 3 424 LYS 424 443 443 LYS LYS E . n M 3 425 TYR 425 444 444 TYR TYR E . n M 3 426 THR 426 445 445 THR THR E . n M 3 427 PHE 427 446 446 PHE PHE E . n M 3 428 TRP 428 447 447 TRP TRP E . n M 3 429 GLU 429 448 448 GLU GLU E . n M 3 430 VAL 430 449 449 VAL VAL E . n M 3 431 ASN 431 450 450 ASN ASN E . n M 3 432 LEU 432 451 451 LEU LEU E . n M 3 433 LYS 433 452 452 LYS LYS E . n M 3 434 GLU 434 453 453 GLU GLU E . n M 3 435 LYS 435 454 454 LYS LYS E . n M 3 436 PHE 436 455 455 PHE PHE E . n M 3 437 SER 437 456 456 SER SER E . n M 3 438 ALA 438 457 457 ALA ALA E . n M 3 439 ASP 439 458 458 ASP ASP E . n M 3 440 LEU 440 459 459 LEU LEU E . n M 3 441 ASP 441 460 460 ASP ASP E . n M 3 442 GLN 442 461 461 GLN GLN E . n M 3 443 PHE 443 462 462 PHE PHE E . n M 3 444 PRO 444 463 463 PRO PRO E . n M 3 445 LEU 445 464 464 LEU LEU E . n M 3 446 GLY 446 465 465 GLY GLY E . n M 3 447 ARG 447 466 466 ARG ARG E . n M 3 448 LYS 448 467 467 LYS LYS E . n M 3 449 PHE 449 468 468 PHE PHE E . n M 3 450 LEU 450 469 469 LEU LEU E . n M 3 451 LEU 451 470 470 LEU LEU E . n M 3 452 GLN 452 471 471 GLN GLN E . n M 3 453 LEU 453 472 472 LEU LEU E . n M 3 454 GLY 454 473 473 GLY GLY E . n M 3 455 LEU 455 474 474 LEU LEU E . n # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete icosahedral assembly' ? 780-MERIC 780 2 'icosahedral asymmetric unit' ? tridecameric 13 3 'icosahedral pentamer' ? 65-meric 65 4 'icosahedral 23 hexamer' ? 78-meric 78 5 'icosahedral asymmetric unit, std point frame' ? tridecameric 13 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-60)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M 2 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M 3 '(1-5)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M 4 '(1,2,6,10,23,24)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M 5 P A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'transform to point frame' ? ? -0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 1 'point symmetry operation' ? ? 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 0.80901700 0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 0.80901700 0.00000 3 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.50000000 0.80901700 0.00000 0.50000000 -0.80901700 -0.30901700 0.00000 0.80901699 0.30901700 0.50000000 0.00000 4 'point symmetry operation' ? ? -0.30901700 0.50000000 0.80901700 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 0.30901700 0.00000 0.80901700 -0.30901699 0.50000000 0.00000 5 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.80901699 0.30901700 0.00000 -0.80901699 0.30901700 0.50000000 0.00000 0.30901700 -0.50000000 0.80901699 0.00000 6 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 0.30901700 0.50000001 0.00000 0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 0.49999999 0.80901700 0.30901699 0.00000 7 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 8 'point symmetry operation' ? ? 0.80901700 0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901700 0.30901699 0.00000 9 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.80901700 -0.30901699 0.00000 0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901700 -0.50000000 0.80901699 0.00000 10 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.80901699 0.30901700 0.00000 0.80901699 -0.30901700 0.50000000 0.00000 -0.30901700 0.50000000 0.80901699 0.00000 11 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 -0.80901700 0.30901699 -0.49999999 0.00000 0.30901700 -0.50000001 -0.80901699 0.00000 12 'point symmetry operation' ? ? -0.80901700 0.30901700 0.50000000 0.00000 -0.30901700 0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901700 -0.30901699 0.00000 13 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 14 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.50000000 -0.80901700 0.00000 -0.50000000 0.80901700 -0.30901699 0.00000 15 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.80901699 -0.30901700 0.00000 -0.80901699 -0.30901700 -0.50000000 0.00000 0.30901700 0.50000000 -0.80901699 0.00000 16 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.49999999 -0.80901700 0.00000 0.50000001 -0.80901699 -0.30901700 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 17 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 -0.50000000 -0.80901700 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 -0.80901699 0.30901700 -0.50000000 0.00000 18 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 -0.80901699 -0.30901700 0.00000 -0.80901700 0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 19 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 20 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.80901699 -0.30901700 0.00000 0.80901699 0.30901700 -0.50000000 0.00000 -0.30901700 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 21 'point symmetry operation' ? ? -0.49999999 -0.80901700 -0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901700 -0.50000001 0.00000 0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 22 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 23 'point symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.80901700 -0.30901699 0.00000 -0.80901700 -0.30901699 0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 0.80901699 0.00000 24 'point symmetry operation' ? ? 0.30901700 0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901700 0.30901699 0.00000 0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 25 'point symmetry operation' ? ? 0.30901700 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 -0.30901700 0.00000 0.80901699 -0.30901700 0.50000000 0.00000 26 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 27 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.50000000 -0.80901700 0.00000 -0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 0.80901700 0.30901699 -0.50000000 0.00000 28 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.30901700 -0.50000000 0.00000 0.30901699 0.50000000 -0.80901700 0.00000 0.50000000 -0.80901700 -0.30901700 0.00000 29 'point symmetry operation' ? ? -0.80901700 0.30901699 -0.50000000 0.00000 0.30901700 -0.50000000 -0.80901700 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 0.30901700 0.00000 30 'point symmetry operation' ? ? -0.30901700 0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 -0.30901700 0.00000 -0.80901699 0.30901700 0.50000000 0.00000 31 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.49999999 0.80901700 0.00000 0.50000001 -0.80901699 -0.30901700 0.00000 32 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 -0.30901700 0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 0.80901700 0.00000 -0.50000000 -0.80901699 0.30901699 0.00000 33 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 -0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 0.30901700 0.00000 -0.80901700 0.30901699 0.50000000 0.00000 34 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 35 'point symmetry operation' ? ? 0.30901700 0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 0.30901700 0.00000 0.80901699 0.30901700 -0.50000000 0.00000 36 'point symmetry operation' ? ? -0.30901700 0.50000001 0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 -0.80901700 0.30901699 -0.49999999 0.00000 37 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.80901700 0.30901699 0.00000 0.80901700 -0.30901700 -0.50000000 0.00000 -0.30901700 0.50000000 -0.80901699 0.00000 38 'point symmetry operation' ? ? 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 39 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.80901700 0.30901699 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.50000000 -0.80901700 0.00000 40 'point symmetry operation' ? ? -0.30901700 -0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901699 0.30901700 0.00000 -0.80901699 -0.30901700 -0.50000000 0.00000 41 'point symmetry operation' ? ? -0.50000001 0.80901699 0.30901700 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 -0.49999999 0.80901700 0.00000 42 'point symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 -0.80901699 0.30901700 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 0.80901700 0.00000 43 'point symmetry operation' ? ? 0.80901700 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 0.30901700 0.00000 44 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 45 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.30901700 0.50000000 0.00000 -0.30901700 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901699 0.30901700 0.00000 46 'point symmetry operation' ? ? 0.80901700 -0.30901699 0.49999999 0.00000 0.30901700 -0.50000001 -0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 -0.30901699 0.00000 47 'point symmetry operation' ? ? 0.30901700 -0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 -0.80901700 -0.30901699 0.00000 0.80901700 -0.30901700 -0.50000000 0.00000 48 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 -1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 49 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.50000000 0.80901700 0.00000 -0.50000000 0.80901700 -0.30901699 0.00000 -0.80901699 -0.30901699 0.50000000 0.00000 50 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 0.30901700 0.50000000 0.00000 0.30901700 0.50000000 -0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901699 0.30901700 0.00000 51 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.49999999 0.80901700 0.30901699 0.00000 0.80901699 -0.30901700 -0.50000001 0.00000 52 'point symmetry operation' ? ? 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 0.00000 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 -1.00000000 0.00000000 0.00000 53 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 -0.50000000 -0.80901699 0.00000 0.50000000 -0.80901700 0.30901699 0.00000 -0.80901700 -0.30901699 0.50000000 0.00000 54 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.30901699 -0.50000000 0.00000 -0.30901700 -0.50000000 0.80901699 0.00000 -0.50000000 0.80901700 0.30901699 0.00000 55 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 0.30901700 -0.50000000 0.00000 -0.30901700 0.50000000 0.80901699 0.00000 0.50000000 0.80901699 -0.30901700 0.00000 56 'point symmetry operation' ? 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# loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Data collection' # _pdbx_audit_revision_category.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal 3 _pdbx_audit_revision_category.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_category.category em_software # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 3 'Structure model' '_em_software.image_processing_id' 2 3 'Structure model' '_em_software.name' # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 3J8W _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details 'REFINEMENT PROTOCOL--RIGID BODY' _em_3d_fitting.method ? # loop_ _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id _em_3d_fitting_list.id _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id _em_3d_fitting_list.details 1 1 3OAE A ? 1 2 3OAE B ? 1 3 3OAE C ? 1 4 3OAE D ? 1 5 3OAE E ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 3J8W _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.5 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'Cross-common Lines' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 2.86 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 2.86 _em_3d_reconstruction.resolution 13.0 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details ;Semi-automatic particle selection was performed using e2boxer.py to obtain the particle coordinates, followed by particle boxing, linearization, normalization, and apodization of the images using Robem. Defocus and astigmatism values used to perform contrast transfer function (CTF) correction were assessed using Robem for the extracted particles. The icosahedrally averaged reconstruction was initiated using a random model generated with setup_rmc and reached 14 A resolution estimated at a Fourier Shell Correlation (FSC) of 0.5. For the last step of refinement, the final maps were CTF-corrected using a B factor of 200 A2. (Single particle details: The particles were selected using semi-automatic program e2boxer.py (EMAN2)) (Single particle--Applied symmetry: I) ; _em_3d_reconstruction.num_particles 8908 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '1 M NaCl, 200 nM Tris' _em_buffer.pH 7.4 _em_buffer.details '1 M NaCl, 200 nM Tris' # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 'quasi-HPV16 complexed with H263.A2 Fabs' COMPLEX 0 ? ? ? 2 'Human papillomavirus 16' VIRUS 1 ? ? ? 3 'H263.A2 Fab' ? 1 ? ? ? # _em_image_scans.entry_id 3J8W _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 264 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 3J8W _em_imaging.id 1 _em_imaging.date 2014-07-31 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.temperature 95 _em_imaging.microscope_model 'JEOL 2100' _em_imaging.nominal_defocus_min 1490 _em_imaging.nominal_defocus_max 5520 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'SPOT SCAN' _em_imaging.nominal_magnification 40000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source LAB6 _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'GATAN LIQUID NITROGEN' _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.citation_id ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'glow-discharged holey carbon supported grid' _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? # _em_virus_entity.id 1 _em_virus_entity.virus_host_category VERTEBRATES _em_virus_entity.entity_assembly_id 1 _em_virus_entity.virus_type VIRION _em_virus_entity.virus_isolate OTHER _em_virus_entity.empty NO _em_virus_entity.enveloped NO _em_virus_entity.details ? # _em_vitrification.entry_id 3J8W _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.details 'Plunged into liquid ethane (GATAN CRYOPLUNGE 3).' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 90 _em_vitrification.temp 102 _em_vitrification.instrument 'GATAN CRYOPLUNGE 3' _em_vitrification.method ? _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.specimen_id 1 # _em_experiment.entry_id 3J8W _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 3J8W _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry I _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 HB3 G ASP 99 ? ? 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