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E GLU 339 OE2 149 1 Y 1 6 ASN 340 ? CG ? E ASN 340 CG 150 1 Y 1 6 ASN 340 ? OD1 ? E ASN 340 OD1 151 1 Y 1 6 ASN 340 ? ND2 ? E ASN 340 ND2 152 1 Y 1 6 ARG 341 ? CG ? E ARG 341 CG 153 1 Y 1 6 ARG 341 ? CD ? E ARG 341 CD 154 1 Y 1 6 ARG 341 ? NE ? E ARG 341 NE 155 1 Y 1 6 ARG 341 ? CZ ? E ARG 341 CZ 156 1 Y 1 6 ARG 341 ? NH1 ? E ARG 341 NH1 157 1 Y 1 6 ARG 341 ? NH2 ? E ARG 341 NH2 158 1 Y 1 6 PHE 343 ? CG ? E PHE 343 CG 159 1 Y 1 6 PHE 343 ? CD1 ? E PHE 343 CD1 160 1 Y 1 6 PHE 343 ? CD2 ? E PHE 343 CD2 161 1 Y 1 6 PHE 343 ? CE1 ? E PHE 343 CE1 162 1 Y 1 6 PHE 343 ? CE2 ? E PHE 343 CE2 163 1 Y 1 6 PHE 343 ? CZ ? E PHE 343 CZ 164 1 Y 1 6 TRP 344 ? CG ? E TRP 344 CG 165 1 Y 1 6 TRP 344 ? CD1 ? E TRP 344 CD1 166 1 Y 1 6 TRP 344 ? CD2 ? E TRP 344 CD2 167 1 Y 1 6 TRP 344 ? NE1 ? E TRP 344 NE1 168 1 Y 1 6 TRP 344 ? CE2 ? E TRP 344 CE2 169 1 Y 1 6 TRP 344 ? CE3 ? E TRP 344 CE3 170 1 Y 1 6 TRP 344 ? CZ2 ? E TRP 344 CZ2 171 1 Y 1 6 TRP 344 ? CZ3 ? E TRP 344 CZ3 172 1 Y 1 6 TRP 344 ? CH2 ? E TRP 344 CH2 173 1 Y 1 6 THR 345 ? OG1 ? E THR 345 OG1 174 1 Y 1 6 THR 345 ? CG2 ? E THR 345 CG2 175 1 Y 1 6 LEU 346 ? CG ? E LEU 346 CG 176 1 Y 1 6 LEU 346 ? CD1 ? E LEU 346 CD1 177 1 Y 1 6 LEU 346 ? CD2 ? E LEU 346 CD2 178 1 Y 1 E LYS 224 ? CD ? G LYS 224 CD 179 1 Y 1 E LYS 224 ? CE ? G LYS 224 CE 180 1 Y 1 E LYS 224 ? NZ ? G LYS 224 NZ 181 1 Y 1 C GLU 119 ? CG ? K GLU 119 CG 182 1 Y 1 C GLU 119 ? CD ? K GLU 119 CD 183 1 Y 1 C GLU 119 ? OE1 ? K GLU 119 OE1 184 1 Y 1 C GLU 119 ? OE2 ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' f_angle_d 32742 1.380 ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' f_chiral_restr 3754 0.052 ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' f_plane_restr 4195 0.006 ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' f_dihedral_angle_d 9118 13.882 ? ? ? # loop_ _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.number_reflns_obs _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs 3.7001 3.7927 14 100.0000 50945 . 0.8250 0.8463 . 144 . 51089 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 3.7927 3.8952 14 100.0000 50468 . 0.5649 0.5837 . 144 . 50612 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 3.8952 4.0099 14 100.0000 51083 . 0.4687 0.4904 . 168 . 51251 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 4.0099 4.1393 14 100.0000 51054 . 0.4202 0.3992 . 144 . 51198 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 4.1393 4.2873 14 100.0000 50842 . 0.3473 0.4083 . 132 . 50974 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 4.2873 4.4589 14 100.0000 51299 . 0.3003 0.2847 . 144 . 51443 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 4.4589 4.6619 14 100.0000 50528 . 0.2708 0.3259 . 156 . 50684 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 4.6619 4.9077 14 100.0000 50871 . 0.2503 0.2842 . 132 . 51003 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 4.9077 5.2152 14 100.0000 50787 . 0.2584 0.2949 . 168 . 50955 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 5.2152 5.6179 14 100.0000 51070 . 0.2814 0.3018 . 144 . 51214 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 5.6179 6.1833 14 100.0000 50800 . 0.3260 0.3330 . 120 . 50920 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 6.1833 7.0781 14 100.0000 50727 . 0.3352 0.3610 . 192 . 50919 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 7.0781 8.9177 14 100.0000 51313 . 0.3052 0.3643 . 96 . 51409 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . 8.9177 259.1935 14 99.0000 50365 . 0.2308 0.2392 . 142 . 50507 . 'ELECTRON MICROSCOPY' . # _database_PDB_matrix.entry_id 3JC6 _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 3JC6 _struct.title 'Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3JC6 _struct_keywords.pdbx_keywords REPLICATION _struct_keywords.text 'CMG helicase, Cryo-EM, REPLICATION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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5 UNP MCM6_YEAST P53091 5 ;MSSPFPADTPSSNRPSNSSPPPSSIGAGFGSSSGLDSQIGSRLHFPSSSQPHVSNSQTGPFVNDSTQFSSQRLQTDGSAT NDMEGNEPARSFKSRALNHVKKVDDVTGEKVREAFEQFLEDFSVQSTDTGEVEKVYRAQIEFMKIYDLNTIYIDYQHLSM RENGALAMAISEQYYRFLPFLQKGLRRVVRKYAPELLNTSDSLKRSEGDEGQADEDEQQDDDMNGSSLPRDSGSSAAPGN GTSAMATRSITTSTSPEQTERVFQISFFNLPTVHRIRDIRSEKIGSLLSISGTVTRTSEVRPELYKASFTCDMCRAIVDN VEQSFKYTEPTFCPNPSCENRAFWTLNVTRSRFLDWQKVRIQENANEIPTGSMPRTLDVILRGDSVERAKPGDRCKFTGV EIVVPDVTQLGLPGVKPSSTLDTRGISKTTEGLNSGVTGLRSLGVRDLTYKISFLACHVISIGSNIGASSPDANSNNRET ELQMAANLQANNVYQDNERDQEVFLNSLSSDEINELKEMVKDEHIYDKLVRSIAPAVFGHEAVKKGILLQMLGGVHKSTV EGIKLRGDINICVVGDPSTSKSQFLKYVVGFAPRSVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEEGGDYTIEAGALMLADNGICCIDE FDKMDISDQVAIHEAMEQQTISIAKAGIHATLNARTSILAAANPVGGRYNRKLSLRGNLNMTAPIMSRFDLFFVILDDCN EKIDTELASHIVDLHMKRDEAIEPPFSAEQLRRYIKYARTFKPILTKEARSYLVEKYKELRKDDAQGFSRSSYRITVRQL ESMIRLSEAIARANCVDEITPSFIAEAYDLLRQSIIRVDVDDVEMDEEFDNIESQSHAASGNNDDNDDGTGSGVITSEPP ADIEEGQSEATARPGTSEKKKTTVTYDKYVSMMNMIVRKIAEVDREGAEELTAVDIVDWYLLQKENDLGSLAEYWEERRL AFKVIKRLVKDRILMEIHGTRHNLRDLENEENENNKTVYVIHPNCEVLDQLEPQDSS ; 1 ? 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# loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3JC6 2 1 ? 868 ? 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'expression tag' 672 22 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details undecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 11 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASN A 202 ? 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LEU 7 139 THR 7 158 1 ? 20 HELX_P HELX_P44 44 ARG F 216 ? ILE F 220 ? ARG 7 216 ILE 7 220 5 ? 5 HELX_P HELX_P45 45 THR F 338 ? VAL F 340 ? THR 7 338 VAL 7 340 5 ? 3 HELX_P HELX_P46 46 GLN G 7 ? ASN G 18 ? GLN E 7 ASN E 18 1 ? 12 HELX_P HELX_P47 47 ASN G 35 ? GLN G 52 ? ASN E 35 GLN E 52 1 ? 18 HELX_P HELX_P48 48 GLY G 63 ? LEU G 74 ? GLY E 63 LEU E 74 1 ? 12 HELX_P HELX_P49 49 ASP G 91 ? GLU G 97 ? ASP E 91 GLU E 97 1 ? 7 HELX_P HELX_P50 50 ASN G 130 ? PHE G 135 ? ASN E 130 PHE E 135 1 ? 6 HELX_P HELX_P51 51 LEU G 152 ? GLU G 157 ? LEU E 152 GLU E 157 1 ? 6 HELX_P HELX_P52 52 ASP G 219 ? TYR G 240 ? ASP E 219 TYR E 240 1 ? 22 HELX_P HELX_P53 53 SER G 250 ? GLY G 263 ? SER E 250 GLY E 263 1 ? 14 HELX_P HELX_P54 54 ASN G 266 ? THR G 278 ? ASN E 266 THR E 278 1 ? 13 HELX_P HELX_P55 55 VAL G 287 ? ASN G 289 ? VAL E 287 ASN E 289 5 ? 3 HELX_P HELX_P56 56 ARG G 290 ? ARG G 301 ? ARG E 290 ARG E 301 1 ? 12 HELX_P HELX_P57 57 SER G 333 ? TYR G 340 ? SER E 333 TYR E 340 1 ? 8 HELX_P HELX_P58 58 TYR G 343 ? LEU G 348 ? TYR E 343 LEU E 348 1 ? 6 HELX_P HELX_P59 59 ASN G 352 ? GLY G 367 ? ASN E 352 GLY E 367 1 ? 16 HELX_P HELX_P60 60 PRO G 369 ? GLU G 375 ? PRO E 369 GLU E 375 1 ? 7 HELX_P HELX_P61 61 THR G 376 ? MET G 380 ? THR E 376 MET E 380 5 ? 5 HELX_P HELX_P62 62 ASP G 381 ? GLU G 387 ? ASP E 381 GLU E 387 1 ? 7 HELX_P HELX_P63 63 ILE G 390 ? LEU G 396 ? ILE E 390 LEU E 396 1 ? 7 HELX_P HELX_P64 64 ASP G 397 ? GLY G 400 ? ASP E 397 GLY E 400 5 ? 4 HELX_P HELX_P65 65 ALA G 421 ? VAL G 434 ? ALA E 421 VAL E 434 1 ? 14 HELX_P HELX_P66 66 ALA G 463 ? ALA G 483 ? ALA E 463 ALA E 483 1 ? 21 HELX_P HELX_P67 67 LEU G 491 ? GLU G 515 ? LEU E 491 GLU E 515 1 ? 25 HELX_P HELX_P68 68 ASP G 537 ? ARG G 540 ? ASP E 537 ARG E 540 5 ? 4 HELX_P HELX_P69 69 ASN G 541 ? ALA G 557 ? ASN E 541 ALA E 557 1 ? 17 HELX_P HELX_P70 70 ASN G 604 ? ALA G 614 ? ASN E 604 ALA E 614 1 ? 11 HELX_P HELX_P71 71 ARG G 633 ? LEU G 646 ? 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GLY A 3 ARG A 22 1 ? 20 HELX_P HELX_P86 86 GLU J 34 ? GLY J 61 ? GLU A 34 GLY A 61 1 ? 28 HELX_P HELX_P87 87 VAL J 67 ? ASN J 104 ? VAL A 67 ASN A 104 1 ? 38 HELX_P HELX_P88 88 SER J 124 ? ASP J 145 ? SER A 124 ASP A 145 1 ? 22 HELX_P HELX_P89 89 GLN J 193 ? GLN J 201 ? GLN A 193 GLN A 201 1 ? 9 HELX_P HELX_P90 90 ASP K 5 ? ASP K 12 ? ASP C 5 ASP C 12 1 ? 8 HELX_P HELX_P91 91 LEU K 48 ? ALA K 55 ? LEU C 48 ALA C 55 1 ? 8 HELX_P HELX_P92 92 PRO K 77 ? PHE K 80 ? PRO C 77 PHE C 80 5 ? 4 HELX_P HELX_P93 93 SER K 81 ? ILE K 88 ? SER C 81 ILE C 88 1 ? 8 HELX_P HELX_P94 94 PHE K 104 ? SER K 116 ? PHE C 104 SER C 116 1 ? 13 HELX_P HELX_P95 95 LYS K 118 ? ASN K 136 ? LYS C 118 ASN C 136 1 ? 19 HELX_P HELX_P96 96 THR K 164 ? LEU K 169 ? THR C 164 LEU C 169 5 ? 6 HELX_P HELX_P97 97 GLU K 170 ? PHE K 192 ? GLU C 170 PHE C 192 1 ? 23 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? D CYS 186 SG ? ? ? 1_555 D CYS 211 SG ? ? 5 CYS 186 5 CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? metalc1 metalc ? ? F CYS 262 SG ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? 7 CYS 262 7 ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? ? metalc2 metalc ? ? F CYS 289 SG ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? 7 CYS 289 7 ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # _pdbx_struct_conn_angle.id 1 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id SG _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id F _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id CYS _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id 262 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id 7 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id CYS _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id 262 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id ZN _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id L _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id ZN _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id . _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id 7 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id ZN _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id 1001 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id SG _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id F _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id CYS _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id 289 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id 7 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id CYS _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id 289 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.value 96.4 _pdbx_struct_conn_angle.value_esd ? # _pdbx_modification_feature.ordinal 1 _pdbx_modification_feature.label_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.label_asym_id D _pdbx_modification_feature.label_seq_id 186 _pdbx_modification_feature.label_alt_id ? _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id D _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id 211 _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id ? _pdbx_modification_feature.auth_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.auth_asym_id 5 _pdbx_modification_feature.auth_seq_id 186 _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code ? _pdbx_modification_feature.symmetry 1_555 _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id CYS _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id 5 _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id 211 _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code ? _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry 1_555 _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom SG _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom SG _pdbx_modification_feature.modified_residue_id . _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id . _pdbx_modification_feature.ref_comp_id . _pdbx_modification_feature.type None _pdbx_modification_feature.category 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 234 A . ? LEU 234 2 GLY 235 A ? GLY 235 2 1 -28.63 2 PRO 301 A . ? PRO 301 2 THR 302 A ? THR 302 2 1 -13.72 3 CYS 341 A . ? CYS 341 2 LEU 342 A ? LEU 342 2 1 23.52 4 GLN 353 A . ? GLN 353 2 ASP 354 A ? ASP 354 2 1 -6.00 5 SER 355 A . ? SER 355 2 ASN 356 A ? ASN 356 2 1 -28.75 6 ILE 359 A . ? ILE 359 2 ARG 360 A ? ARG 360 2 1 -1.45 7 ASN 433 A . ? ASN 433 2 TYR 434 A ? TYR 434 2 1 -14.75 8 ASP 435 A . ? ASP 435 2 GLY 436 A ? GLY 436 2 1 4.20 9 GLY 436 A . ? GLY 436 2 ASN 437 A ? ASN 437 2 1 -9.52 10 ARG 459 A . ? ARG 459 2 GLU 460 A ? GLU 460 2 1 -0.58 11 THR 34 B . ? THR 34 3 PHE 35 B ? PHE 35 3 1 -14.87 12 ASP 137 B . ? ASP 137 3 ASP 138 B ? ASP 138 3 1 -26.20 13 GLY 159 B . ? GLY 159 3 SER 160 B ? SER 160 3 1 5.73 14 PHE 161 B . ? PHE 161 3 GLY 162 B ? GLY 162 3 1 2.10 15 THR 172 B . ? THR 172 3 ALA 173 B ? ALA 173 3 1 10.43 16 THR 187 B . ? THR 187 3 LYS 188 B ? LYS 188 3 1 -9.74 17 ALA 204 B . ? ALA 204 3 LYS 205 B ? LYS 205 3 1 0.95 18 PRO 228 B . ? PRO 228 3 ALA 229 B ? ALA 229 3 1 18.61 19 THR 236 B . ? THR 236 3 GLU 237 B ? GLU 237 3 1 0.05 20 ASN 310 B . ? ASN 310 3 SER 311 B ? SER 311 3 1 -0.02 21 GLY 323 B . ? GLY 323 3 ASN 324 B ? ASN 324 3 1 -13.45 22 PHE 201 C . ? PHE 201 4 LYS 202 C ? LYS 202 4 1 -5.34 23 LYS 204 C . ? LYS 204 4 PHE 205 C ? PHE 205 4 1 21.04 24 TYR 225 C . ? TYR 225 4 TYR 226 C ? TYR 226 4 1 -11.11 25 LEU 249 C . ? LEU 249 4 ALA 250 C ? ALA 250 4 1 6.41 26 LYS 252 C . ? LYS 252 4 GLN 253 C ? GLN 253 4 1 9.60 27 ASP 292 C . ? ASP 292 4 LEU 293 C ? LEU 293 4 1 -7.76 28 VAL 351 C . ? VAL 351 4 CYS 352 C ? CYS 352 4 1 -2.99 29 CYS 352 C . ? CYS 352 4 ASP 353 C ? ASP 353 4 1 -0.31 30 ARG 370 C . ? ARG 370 4 CYS 371 C ? CYS 371 4 1 -18.28 31 ARG 373 C . ? ARG 373 4 ILE 374 C ? ILE 374 4 1 -23.38 32 ILE 374 C . ? ILE 374 4 ASP 375 C ? ASP 375 4 1 -28.37 33 ASP 375 C . ? ASP 375 4 CYS 376 C ? CYS 376 4 1 -1.80 34 CYS 376 C . ? CYS 376 4 ASN 377 C ? ASN 377 4 1 20.15 35 ASP 408 C . ? ASP 408 4 GLY 409 C ? GLY 409 4 1 28.21 36 ASN 447 C . ? ASN 447 4 SER 448 C ? SER 448 4 1 -4.00 37 LYS 467 C . ? LYS 467 4 LYS 468 C ? LYS 468 4 1 -0.02 38 ASP 41 D . ? ASP 41 5 SER 42 D ? SER 42 5 1 -9.07 39 ASN 130 D . ? ASN 130 5 SER 131 D ? SER 131 5 1 -6.14 40 ASN 196 D . ? ASN 196 5 PHE 197 D ? PHE 197 5 1 7.31 41 ASN 235 D . ? ASN 235 5 CYS 236 D ? CYS 236 5 1 -2.78 42 GLY 237 D . ? GLY 237 5 PRO 238 D ? PRO 238 5 1 -10.23 43 LEU 264 D . ? LEU 264 5 VAL 265 D ? VAL 265 5 1 -7.65 44 GLY 320 D . ? GLY 320 5 VAL 321 D ? VAL 321 5 1 1.16 45 VAL 321 D . ? VAL 321 5 ALA 322 D ? ALA 322 5 1 -8.00 46 LEU 331 D . ? LEU 331 5 GLY 332 D ? GLY 332 5 1 -27.72 47 VAL 337 D . ? VAL 337 5 GLU 338 D ? GLU 338 5 1 -0.54 48 GLU 338 D . ? GLU 338 5 THR 339 D ? THR 339 5 1 -14.62 49 VAL 100 E . ? VAL 100 6 LYS 101 E ? LYS 101 6 1 -14.49 50 PHE 122 E . ? PHE 122 6 SER 123 E ? SER 123 6 1 -0.73 51 GLY 130 E . ? GLY 130 6 GLU 131 E ? GLU 131 6 1 -14.84 52 GLU 133 E . ? GLU 133 6 LYS 134 E ? LYS 134 6 1 29.84 53 LYS 134 E . ? LYS 134 6 VAL 135 E ? VAL 135 6 1 10.75 54 THR 310 E . ? THR 310 6 CYS 311 E ? CYS 311 6 1 -13.59 55 CYS 311 E . ? CYS 311 6 ASP 312 E ? ASP 312 6 1 5.77 56 LYS 326 E . ? LYS 326 6 TYR 327 E ? TYR 327 6 1 7.59 57 THR 328 E . ? THR 328 6 GLU 329 E ? GLU 329 6 1 -1.55 58 ASN 335 E . ? ASN 335 6 PRO 336 E ? PRO 336 6 1 5.06 59 PRO 336 E . ? PRO 336 6 SER 337 E ? SER 337 6 1 -20.29 60 ASN 340 E . ? ASN 340 6 ARG 341 E ? ARG 341 6 1 -0.82 61 TRP 344 E . ? TRP 344 6 THR 345 E ? THR 345 6 1 -7.13 62 ASP 355 E . ? ASP 355 6 TRP 356 E ? TRP 356 6 1 -20.34 63 THR 370 E . ? THR 370 6 GLY 371 E ? GLY 371 6 1 2.59 64 LEU 94 F . ? LEU 94 7 GLN 95 F ? GLN 95 7 1 14.23 65 GLY 96 F . ? GLY 96 7 THR 97 F ? THR 97 7 1 -2.45 66 PRO 128 F . ? PRO 128 7 THR 129 F ? THR 129 7 1 -22.61 67 LYS 135 F . ? LYS 135 7 ASP 136 F ? ASP 136 7 1 -15.32 68 SER 208 F . ? SER 208 7 GLN 209 F ? GLN 209 7 1 -11.55 69 ARG 214 F . ? ARG 214 7 TYR 215 F ? TYR 215 7 1 5.08 70 ASN 292 F . ? 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GLY 172 A GLU 173 J ? GLU 173 A 1 -0.12 123 GLY 35 K . ? GLY 35 C ARG 36 K ? ARG 36 C 1 -12.31 124 ASN 101 K . ? ASN 101 C SER 102 K ? SER 102 C 1 4.41 125 THR 162 K . ? THR 162 C SER 163 K ? SER 163 C 1 -5.71 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 5 ? B ? 5 ? C ? 8 ? D ? 3 ? E ? 3 ? F ? 2 ? G ? 2 ? H ? 2 ? I ? 2 ? J ? 2 ? K ? 2 ? L ? 7 ? M ? 3 ? N ? 2 ? O ? 2 ? P ? 6 ? Q ? 2 ? R ? 2 ? S ? 4 ? T ? 5 ? U ? 3 ? V ? 6 ? W ? 3 ? X ? 3 ? Y ? 2 ? Z ? 3 ? AA ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? parallel A 4 5 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? parallel C 4 5 ? anti-parallel C 5 6 ? anti-parallel C 6 7 ? anti-parallel C 7 8 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel H 1 2 ? parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? parallel L 3 4 ? anti-parallel L 4 5 ? anti-parallel L 5 6 ? anti-parallel L 6 7 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel N 1 2 ? parallel O 1 2 ? parallel P 1 2 ? parallel P 2 3 ? anti-parallel P 3 4 ? anti-parallel P 4 5 ? anti-parallel P 5 6 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel R 1 2 ? parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel S 3 4 ? parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? anti-parallel T 4 5 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel V 1 2 ? parallel V 2 3 ? parallel V 3 4 ? parallel V 4 5 ? anti-parallel V 5 6 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel W 2 3 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel X 2 3 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel Z 2 3 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 PHE A 331 ? 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LEU 3 241 THR 3 243 E 1 VAL C 332 ? SER C 335 ? VAL 4 332 SER 4 335 E 2 ILE C 397 ? GLN C 400 ? ILE 4 397 GLN 4 400 E 3 SER C 414 ? LEU C 417 ? SER 4 414 LEU 4 417 F 1 ILE C 339 ? MET C 342 ? ILE 4 339 MET 4 342 F 2 PHE C 391 ? LYS C 394 ? PHE 4 391 LYS 4 394 G 1 VAL C 344 ? ALA C 345 ? VAL 4 344 ALA 4 345 G 2 VAL C 358 ? GLU C 359 ? VAL 4 358 GLU 4 359 H 1 ILE C 365 ? GLN C 366 ? ILE 4 365 GLN 4 366 H 2 SER E 419 ? THR E 420 ? SER 6 419 THR 6 420 I 1 VAL C 435 ? THR C 436 ? VAL 4 435 THR 4 436 I 2 HIS C 465 ? VAL C 466 ? HIS 4 465 VAL 4 466 J 1 PHE C 439 ? ILE C 442 ? PHE 4 439 ILE 4 442 J 2 LYS C 458 ? VAL C 461 ? LYS 4 458 VAL 4 461 K 1 SER D 60 ? VAL D 63 ? SER 5 60 VAL 5 63 K 2 GLN D 136 ? LEU D 139 ? GLN 5 136 LEU 5 139 L 1 TYR D 298 ? TYR D 301 ? TYR 5 298 TYR 5 301 L 2 THR D 325 ? LYS D 329 ? THR 5 325 LYS 5 329 L 3 ASN D 273 ? THR D 277 ? ASN 5 273 THR 5 277 L 4 LEU D 256 ? GLU D 260 ? LEU 5 256 GLU 5 260 L 5 LEU D 162 ? THR D 169 ? LEU 5 162 THR 5 169 L 6 ARG D 291 ? 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(Single particle--Applied symmetry: C1) ; _em_3d_reconstruction.num_particles 469818 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.details '20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'Saccharomyces cerevisiae CMG complex' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 3JC6 _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 8000 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 3JC6 _em_imaging.id 1 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2015-08-01 _em_imaging.temperature ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.nominal_defocus_min 1500 _em_imaging.nominal_defocus_max 3500 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 29000 _em_imaging.calibrated_magnification 49505 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.citation_id ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details '400 mesh holey carbon C-flat grid, glow-discharged in air' _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? # _em_vitrification.entry_id 3JC6 _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.details 'Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 90 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method 'Blot for 3 seconds before plunging' _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.specimen_id 1 # _em_experiment.entry_id 3JC6 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 3JC6 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 2 MET 1 ? 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