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'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 3K9B _struct.title 'Crystal structure of human liver carboxylesterase 1 (hCE1) in covalent complex with the nerve agent Cyclosarin (GF)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3K9B _struct_keywords.text ;Hydrolase, organophosphorus nerve agent, Alternative splicing, Disulfide bond, Endoplasmic reticulum, Glycoprotein, Polymorphism, Serine esterase ; _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 3 ? 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UNP P23141 GLN 362 deletion ? 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? trimeric 3 2 software_defined_assembly PISA monomeric 1 3 software_defined_assembly PISA monomeric 1 4 software_defined_assembly PISA monomeric 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I 2 1 A,D,G 3 1 B,E,H 4 1 C,F,I # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 LEU A 37 ? 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TRP A 1357 MET A 1364 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 16 GLN A 351 ? SER A 361 ? GLN A 1375 SER A 1385 1 ? 11 HELX_P HELX_P17 17 SER A 361 ? CYS A 366 ? SER A 1385 CYS A 1390 1 ? 6 HELX_P HELX_P18 18 LEU A 371 ? GLY A 381 ? LEU A 1395 GLY A 1405 1 ? 11 HELX_P HELX_P19 19 VAL A 387 ? PHE A 402 ? VAL A 1411 PHE A 1426 1 ? 16 HELX_P HELX_P20 20 PHE A 402 ? ALA A 416 ? PHE A 1426 ALA A 1440 1 ? 15 HELX_P HELX_P21 21 GLU A 447 ? PHE A 452 ? GLU A 1471 PHE A 1476 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 22 GLY A 453 ? LEU A 457 ? GLY A 1477 LEU A 1481 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 23 GLU A 465 ? GLY A 483 ? GLU A 1489 GLY A 1507 1 ? 19 HELX_P HELX_P24 24 LYS A 516 ? ASN A 525 ? LYS A 1540 ASN A 1549 1 ? 10 HELX_P HELX_P25 25 LEU B 37 ? ARG B 41 ? LEU B 2060 ARG B 2064 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 26 ASP B 67 ? THR B 79 ? ASP B 2090 THR B 2102 1 ? 13 HELX_P HELX_P27 27 ALA B 125 ? TYR B 129 ? ALA B 2148 TYR B 2152 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 28 GLY B 131 ? ASN B 139 ? GLY B 2154 ASN B 2162 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 29 LEU B 149 ? PHE B 155 ? LEU B 2172 PHE B 2178 1 ? 7 HELX_P HELX_P30 30 ASN B 165 ? ILE B 182 ? ASN B 2188 ILE B 2205 1 ? 18 HELX_P HELX_P31 31 ALA B 183 ? PHE B 185 ? ALA B 2206 PHE B 2208 5 ? 3 HELX_P HELX_P32 32 SER B 198 ? SER B 210 ? SER B 2221 SER B 2233 1 ? 13 HELX_P HELX_P33 33 PRO B 211 ? LYS B 214 ? PRO B 2234 LYS B 2237 5 ? 4 HELX_P HELX_P34 34 THR B 229 ? VAL B 231 ? THR B 2252 VAL B 2254 5 ? 3 HELX_P HELX_P35 35 VAL B 238 ? ALA B 249 ? VAL B 2261 ALA B 2272 1 ? 12 HELX_P HELX_P36 36 THR B 255 ? LYS B 266 ? THR B 2278 LYS B 2289 1 ? 12 HELX_P HELX_P37 37 THR B 267 ? LYS B 279 ? THR B 2290 LYS B 2302 1 ? 13 HELX_P HELX_P38 38 THR B 308 ? GLN B 313 ? THR B 2331 GLN B 2336 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 39 TRP B 334 ? MET B 340 ? TRP B 2357 MET B 2364 1 ? 7 HELX_P HELX_P40 40 ALA B 354 ? SER B 361 ? ALA B 2378 SER B 2385 1 ? 8 HELX_P HELX_P41 41 LEU B 371 ? GLY B 381 ? LEU B 2395 GLY B 2405 1 ? 11 HELX_P HELX_P42 42 ASP B 385 ? PHE B 402 ? ASP B 2409 PHE B 2426 1 ? 18 HELX_P HELX_P43 43 PHE B 402 ? ALA B 416 ? PHE B 2426 ALA B 2440 1 ? 15 HELX_P HELX_P44 44 GLU B 447 ? PHE B 452 ? GLU B 2471 PHE B 2476 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 45 GLY B 453 ? LEU B 457 ? GLY B 2477 LEU B 2481 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 46 SER B 462 ? GLY B 483 ? SER B 2486 GLY B 2507 1 ? 22 HELX_P HELX_P47 47 LYS B 516 ? PHE B 527 ? LYS B 2540 PHE B 2551 1 ? 12 HELX_P HELX_P48 48 LEU C 37 ? ARG C 41 ? LEU C 3060 ARG C 3064 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 49 ASP C 67 ? THR C 79 ? ASP C 3090 THR C 3102 1 ? 13 HELX_P HELX_P50 50 ALA C 125 ? TYR C 129 ? ALA C 3148 TYR C 3152 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 51 GLY C 131 ? ASN C 139 ? GLY C 3154 ASN C 3162 1 ? 9 HELX_P HELX_P52 52 LEU C 149 ? PHE C 155 ? LEU C 3172 PHE C 3178 1 ? 7 HELX_P HELX_P53 53 ASN C 165 ? ILE C 182 ? ASN C 3188 ILE C 3205 1 ? 18 HELX_P HELX_P54 54 ALA C 183 ? PHE C 185 ? ALA C 3206 PHE C 3208 5 ? 3 HELX_P HELX_P55 55 SER C 198 ? SER C 210 ? SER C 3221 SER C 3233 1 ? 13 HELX_P HELX_P56 56 PRO C 211 ? LYS C 214 ? PRO C 3234 LYS C 3237 5 ? 4 HELX_P HELX_P57 57 THR C 229 ? VAL C 231 ? THR C 3252 VAL C 3254 5 ? 3 HELX_P HELX_P58 58 VAL C 238 ? ALA C 249 ? VAL C 3261 ALA C 3272 1 ? 12 HELX_P HELX_P59 59 THR C 255 ? LYS C 266 ? THR C 3278 LYS C 3289 1 ? 12 HELX_P HELX_P60 60 THR C 267 ? LYS C 279 ? THR C 3290 LYS C 3302 1 ? 13 HELX_P HELX_P61 61 THR C 308 ? ALA C 314 ? THR C 3331 ALA C 3337 1 ? 7 HELX_P HELX_P62 62 TRP C 334 ? LEU C 339 ? TRP C 3357 LEU C 3363 1 ? 6 HELX_P HELX_P63 63 ILE C 372 ? GLY C 381 ? ILE C 3396 GLY C 3405 1 ? 10 HELX_P HELX_P64 64 ASP C 391 ? PHE C 402 ? ASP C 3415 PHE C 3426 1 ? 12 HELX_P HELX_P65 65 PHE C 402 ? ALA C 416 ? PHE C 3426 ALA C 3440 1 ? 15 HELX_P HELX_P66 66 GLU C 447 ? PHE C 452 ? GLU C 3471 PHE C 3476 1 ? 6 HELX_P HELX_P67 67 GLY C 453 ? LEU C 457 ? GLY C 3477 LEU C 3481 5 ? 5 HELX_P HELX_P68 68 SER C 462 ? GLY C 483 ? SER C 3486 GLY C 3507 1 ? 22 HELX_P HELX_P69 69 LYS C 516 ? THR C 524 ? LYS C 3540 THR C 3548 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 64 SG ? ? ? 1_555 A CYS 93 SG ? ? A CYS 1087 A CYS 1116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.154 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 251 SG ? ? ? 1_555 A CYS 262 SG ? ? A CYS 1274 A CYS 1285 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 64 SG ? ? ? 1_555 B CYS 93 SG ? ? B CYS 2087 B CYS 2116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 0.866 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 251 SG ? ? ? 1_555 B CYS 262 SG ? ? B CYS 2274 B CYS 2285 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 64 SG ? ? ? 1_555 C CYS 93 SG ? ? C CYS 3087 C CYS 3116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 0.830 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 251 SG ? ? ? 1_555 C CYS 262 SG ? ? C CYS 3274 C CYS 3285 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? ? covale1 covale one ? D WW2 . P1 ? ? ? 1_555 A SER 198 OG ? ? A WW2 193 A SER 1221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale2 covale one ? E WW2 . P1 ? ? ? 1_555 B SER 198 OG ? ? B WW2 194 B SER 2221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.480 ? ? covale3 covale one ? F WW2 . P1 ? ? ? 1_555 C SER 198 OG ? ? C WW2 195 C SER 3221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 WW2 D . ? 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None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 3 ? B ? 11 ? C ? 2 ? D ? 2 ? E ? 3 ? F ? 11 ? G ? 2 ? H ? 2 ? I ? 3 ? J ? 11 ? K ? 2 ? 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