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'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _pdbx_xplor_file.serial_no _pdbx_xplor_file.param_file _pdbx_xplor_file.topol_file _pdbx_xplor_file.pdbx_refine_id 1 parasch346572.pro topsch346572.pro 'X-RAY DIFFRACTION' 2 MSI_CNX_TOPPAR:water_rep.param MSI_CNX_TOPPAR:water.top 'X-RAY DIFFRACTION' 3 MSI_CNX_TOPPAR:ion.param MSI_CNX_TOPPAR:ion.top 'X-RAY DIFFRACTION' 4 MSI_CNX_TOPPAR:protein_rep.param MSI_CNX_TOPPAR:protein.top 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 3KMX _struct.title 'Structure of BACE bound to SCH346572' _struct.pdbx_descriptor 'Beta-secretase 1 (E.C.3.4.23.46)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3KMX _struct_keywords.text ;Alzheimer's, BACE1, Alternative splicing, Aspartyl protease, Disulfide bond, Endoplasmic reticulum, Endosome, Glycoprotein, Golgi apparatus, Hydrolase, Membrane, Polymorphism, Protease, Transmembrane, Zymogen ; _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLN A 62 ? SER A 66 ? GLN A 114 SER A 118 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 2 TYR A 132 ? ALA A 136 ? TYR A 184 ALA A 188 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 3 PRO A 144 ? THR A 153 ? PRO A 196 THR A 205 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 4 ASN A 171 ? SER A 178 ? ASN A 223 SER A 230 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 5 ASP A 189 ? 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ASP B 439 GLY B 444 5 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? A CYS 164 SG ? ? ? 1_555 A CYS 368 SG ? ? A CYS 216 A CYS 420 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf2 disulf ? ? A CYS 226 SG ? ? ? 1_555 A CYS 391 SG ? ? A CYS 278 A CYS 443 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? disulf3 disulf ? ? A CYS 278 SG ? ? ? 1_555 A CYS 328 SG ? ? A CYS 330 A CYS 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? disulf4 disulf ? ? B CYS 164 SG ? ? ? 1_555 B CYS 368 SG ? ? B CYS 216 B CYS 420 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf5 disulf ? ? B CYS 226 SG ? ? ? 1_555 B CYS 391 SG ? ? B CYS 278 B CYS 443 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf6 disulf ? ? B CYS 278 SG ? ? ? 1_555 B CYS 328 SG ? ? B CYS 330 B CYS 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 31 A . ? SER 83 A PRO 32 A ? PRO 84 A 1 0.71 2 ARG 137 A . ? ARG 189 A PRO 138 A ? PRO 190 A 1 0.31 3 TYR 231 A . ? TYR 283 A ASP 232 A ? ASP 284 A 1 8.71 4 GLY 381 A . ? GLY 433 A PRO 382 A ? PRO 434 A 1 -0.07 5 SER 31 B . ? SER 83 B PRO 32 B ? PRO 84 B 1 0.15 6 ARG 137 B . ? ARG 189 B PRO 138 B ? PRO 190 B 1 -1.16 7 TYR 231 B . ? TYR 283 B ASP 232 B ? ASP 284 B 1 5.97 8 GLY 381 B . ? GLY 433 B PRO 382 B ? PRO 434 B 1 -0.34 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 8 ? B ? 4 ? C ? 5 ? D ? 5 ? E ? 4 ? F ? 3 ? G ? 8 ? H ? 4 ? I ? 5 ? J ? 5 ? K ? 5 ? L ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? parallel A 4 5 ? anti-parallel A 5 6 ? parallel A 6 7 ? anti-parallel A 7 8 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel C 4 5 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel E 1 2 ? parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? parallel G 4 5 ? anti-parallel G 5 6 ? parallel G 6 7 ? anti-parallel G 7 8 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel I 3 4 ? anti-parallel I 4 5 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? parallel J 3 4 ? anti-parallel J 4 5 ? parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 LEU A 15 ? 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