data_3MS0 # _entry.id 3MS0 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.280 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 3MS0 NDB NA0592 RCSB RCSB058926 WWPDB D_1000058926 # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id OBSLTE _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2014-12-10 _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 4V7P _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 3MS0 _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ;This entry with other split entries have been consolidated into a combined file for complete representation. No coordinates have been changed. ; # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.content_type PDB 3F1E ;Crystal structure of a translation termination complex formed with release factor RF2. This file contains the 30S subunit, RF2, two tRNA, and mRNA molecules of one 70S ribosome. The entire crystal structure contains two 70S ribosomes as described in remark 400. ; unspecified PDB 3D5A ;Structural basis for translation termination on the 70S ribosome. This file contains the 30S subunit, release factor 1 (RF1), two tRNA, and mRNA molecules of one 70S ribosome. The entire crystal structure contains two 70S ribosomes as described in remark 400. ; unspecified PDB 1zbt 'Crystal structure of Peptide chain release factor 1 (RF-1) (SMU.1085) from Streptococcus mutans at 2.34 A resolution' unspecified PDB 3MR8 '30S subunit in molecule A' unspecified PDB 3MS1 '50S subunit in molecule A' unspecified PDB 3MRZ '50S subunit' unspecified PDB 3MR8 . split PDB 3MRZ . split PDB 3MS0 . split PDB 3MS1 . split PDB 4V7P . 'complete structure' # _pdbx_database_status.entry_id 3MS0 _pdbx_database_status.status_code OBS _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2010-04-29 _pdbx_database_status.status_code_sf OBS _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Korostelev, A.' 1 'Zhu, J.' 2 'Asahara, H.' 3 'Noller, H.F.' 4 # _citation.id primary _citation.title 'Recognition of the amber UAG stop codon by release factor RF1.' _citation.journal_abbrev 'Embo J.' _citation.journal_volume 29 _citation.page_first 2577 _citation.page_last 2585 _citation.year 2010 _citation.journal_id_ASTM EMJODG _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0261-4189 _citation.journal_id_CSD 0897 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 20588254 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/emboj.2010.139 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Korostelev, A.' 1 primary 'Zhu, J.' 2 primary 'Asahara, H.' 3 primary 'Noller, H.F.' 4 # _cell.length_a 210.380 _cell.length_b 452.700 _cell.length_c 617.090 _cell.angle_alpha 90.000 _cell.angle_beta 90.000 _cell.angle_gamma 90.000 _cell.entry_id 3MS0 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.Z_PDB 4 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' _symmetry.entry_id 3MS0 _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.space_group_name_Hall ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation 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;MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELR IRDNVRRVMVVKSQEPFLANA ; F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;ARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRVG GANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; ;ARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRVG GANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTDVPASRFKEEILRILAREGFIKGYERVDVDGKPYLRVYLKYGPRRQGPDPRPEQVI HHIRRISKPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTSKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTDVPASRFKEEILRILAREGFIKGYERVDVDGKPYLRVYLKYGPRRQGPDPRPEQVI HHIRRISKPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTSKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;EQYYGTGRRKEAVARVFLRPGNGKVTVNGQDFNEYFQGLVRAVAALEPLRAVDALGRFDAYITVRGGGKSGQIDAIKLGI ARALVQYNPDYRAKLKPLGFLTRDARVVERKKYGKHKARRAPQYSKR ; 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;ARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKRL MDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVA ; ;ARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKRL MDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVA ; M ? 14 'polypeptide(L)' no no ARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW ARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW N ? 15 'polypeptide(L)' no no ;PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRAL IEKLGIRG ; ;PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRAL IEKLGIRG ; O ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQE ; ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQE ; P ? 17 'polypeptide(L)' no no ;PKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESGR MDLVEKYLIRRQNYQSLSK ; ;PKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESGR MDLVEKYLIRRQNYQSLSK ; Q ? 18 'polypeptide(L)' no no KAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSAKEQRILAKTIKRARILGLLPFTEKLVRK KAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSAKEQRILAKTIKRARILGLLPFTEKLVRK R ? 19 'polypeptide(L)' no no SLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTYR SLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTYR S ? 20 'polypeptide(L)' no no ;RNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAVQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARRKSRLMRK VRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; ;RNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAVQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARRKSRLMRK VRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; T ? 21 'polypeptide(L)' no no GKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRK GKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRK U ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MLDKLDRLEEEYRELEALLSDPEVLKDKGRYQSLSRRYAEMGEVIGLIREYRKVLEDLEQAESLLDDPELKEMAKAEREA LLARKEALEKELERHLLPKDPMDERDAIVEIRAGTGGEEAALFARDLFNMYLRFAEEMGFETEVLDSHPTDLGGFSKVVF EVRGPGAYGTFKYESGVHRVQRVPVTETQGRIHTSTATVAVLPKAEEEDFALNMDEIRIDVMRASGPGGQGVNTTDSAVR VVHLPTGIMVTCQDSRSQIKNREKALMILRSRLLEMKRAEEAERLRKTRLAQIGTGERSEKIRTYNFPQSRVTDHRIGFT THDLEGVLSGHLTPILEALKRADQERQLAALAEG ; ;MLDKLDRLEEEYRELEALLSDPEVLKDKGRYQSLSRRYAEMGEVIGLIREYRKVLEDLEQAESLLDDPELKEMAKAEREA LLARKEALEKELERHLLPKDPMDERDAIVEIRAGTGGEEAALFARDLFNMYLRFAEEMGFETEVLDSHPTDLGGFSKVVF EVRGPGAYGTFKYESGVHRVQRVPVTETQGRIHTSTATVAVLPKAEEEDFALNMDEIRIDVMRASGPGGQGVNTTDSAVR VVHLPTGIMVTCQDSRSQIKNREKALMILRSRLLEMKRAEEAERLRKTRLAQIGTGERSEKIRTYNFPQSRVTDHRIGFT THDLEGVLSGHLTPILEALKRADQERQLAALAEG ; V ? 23 polyribonucleotide no no CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA W ? 24 polyribonucleotide no no AAUGUAGAA AAUGUAGAA X ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 U n 1 2 G n 1 3 G n 1 4 A n 1 5 G n 1 6 A n 1 7 G n 1 8 U n 1 9 U n 1 10 U n 1 11 G n 1 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'X-RAY DIFFRACTION' 2 20 POSITIONAL S 51443 0.005 ? 19 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 2 21 POSITIONAL T 51443 0.005 ? 20 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 2 22 POSITIONAL U 51443 0.005 ? 21 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 3 2 POSITIONAL W 1789 0.006 ? 22 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 3 3 POSITIONAL X 1789 0.006 ? 23 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 4 2 POSITIONAL V 1984 0.006 ? 24 ? ? ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' 5 2 POSITIONAL V 829 0.003 ? 25 ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details 2 2 A 2 3 B 2 4 C 2 5 D 2 6 E 2 7 F 2 8 G 2 9 H 2 10 I 2 11 J 2 12 K 2 13 L 2 14 M 2 15 N 2 16 O 2 17 P 2 18 Q 2 19 R 2 20 S 2 21 T 2 22 U 3 2 W 3 3 X 4 2 V 5 2 V # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.selection_details _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id 2 2 1 ? A 5 A 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 3 1 ? B 5 B 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 4 1 ? C 5 C 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 5 1 ? D 5 D 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 6 1 ? E 5 E 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 7 1 ? F 5 F 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 8 1 ? G 5 G 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 9 1 ? H 5 H 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 10 1 ? I 5 I 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 11 1 ? J 5 J 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 12 1 ? K 5 K 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 13 1 ? L 5 L 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 14 1 ? M 5 M 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 15 1 ? N 5 N 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 16 1 ? O 5 O 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 17 1 ? P 5 P 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 18 1 ? Q 5 Q 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 19 1 ? R 5 R 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 20 1 ? S 5 S 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 21 1 ? T 5 T 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 2 22 1 ? U 5 U 1531 'segid B16S or segid BS* or segid BT*' ? ? ? ? ? ? ? ? 3 2 1 ? W 1 W 76 'segid BPTN or segid BMRN' ? ? ? ? ? ? ? ? 3 3 1 ? X 1 X 76 'segid BPTN or segid BMRN' ? ? ? ? ? ? ? ? 4 2 1 ? V 100 V 354 'segid BRF1 and not resid 1:100' ? ? ? ? ? ? ? ? 5 2 1 ? V 1 V 100 'segid BRF1 and resid 1:100' ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? 6 ? 7 ? # _struct.entry_id 3MS0 _struct.title ;Recognition of the amber stop codon by release factor RF1. This entry 3MS0 contains 30S ribosomal subunit. The 50S ribosomal subunit can be found in PDB entry 3MRZ. Molecule A in the same asymmetric unit is deposited as 3MR8 (30S) and 3MS1 (50S). ; _struct.pdbx_descriptor '30S RIBOSOMAL SUTNIT' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3MS0 _struct_keywords.text '70S, ribosome, termination, release factor, RF1, stop codon, UGA, amber, tRNA' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 25 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;The biological molecule is composed of both the 30S and 50S subunits. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT OF ONE 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 VAL B 1 ? HIS B 10 ? VAL B 7 HIS B 16 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 2 ASN B 19 ? ARG B 24 ? ASN B 25 ARG B 30 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 3 ASP B 37 ? GLY B 59 ? ASP B 43 GLY B 65 1 ? 23 HELX_P HELX_P4 4 LYS B 68 ? ARG B 81 ? LYS B 74 ARG B 87 1 ? 14 HELX_P HELX_P5 5 ASN B 98 ? LEU B 115 ? ASN B 104 LEU B 121 1 ? 18 HELX_P HELX_P6 6 PRO B 125 ? SER B 144 ? PRO B 131 SER B 150 1 ? 20 HELX_P HELX_P7 7 GLU B 164 ? LEU B 174 ? GLU B 170 LEU B 180 1 ? 11 HELX_P HELX_P8 8 ASP B 187 ? VAL B 191 ? ASP B 193 VAL B 197 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 9 ALA B 201 ? GLY B 221 ? ALA B 207 GLY B 227 1 ? 21 HELX_P HELX_P10 10 SER B 229 ? GLN B 234 ? SER B 235 GLN B 240 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 11 HIS C 5 ? LEU C 11 ? HIS C 6 LEU C 12 1 ? 7 HELX_P HELX_P12 12 GLN C 27 ? GLU C 45 ? GLN C 28 GLU C 46 1 ? 19 HELX_P HELX_P13 13 LEU C 46 ? ALA C 49 ? LEU C 47 ALA C 50 5 ? 4 HELX_P HELX_P14 14 GLU C 81 ? THR C 94 ? GLU C 82 THR C 95 1 ? 14 HELX_P HELX_P15 15 SER C 111 ? ARG C 125 ? SER C 112 ARG C 126 1 ? 15 HELX_P HELX_P16 16 ALA C 128 ? GLY C 144 ? ALA C 129 GLY C 145 1 ? 17 HELX_P HELX_P17 17 VAL D 7 ? GLY D 15 ? VAL D 8 GLY D 16 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 18 GLY D 22 ? SER D 27 ? GLY D 23 SER D 28 1 ? 6 HELX_P HELX_P19 19 SER D 51 ? GLY D 68 ? SER D 52 GLY D 69 1 ? 18 HELX_P HELX_P20 20 SER D 70 ? LYS D 84 ? SER D 71 LYS D 85 1 ? 15 HELX_P HELX_P21 21 VAL D 87 ? ARG D 99 ? VAL D 88 ARG D 100 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 22 ARG D 99 ? ARG D 106 ? ARG D 100 ARG D 107 1 ? 8 HELX_P HELX_P23 23 SER D 112 ? HIS D 122 ? SER D 113 HIS D 123 1 ? 11 HELX_P HELX_P24 24 GLU D 149 ? ASN D 153 ? GLU D 150 ASN D 154 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 25 LEU D 154 ? MET D 164 ? LEU D 155 MET D 165 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 26 ASN D 198 ? SER D 207 ? ASN D 199 SER D 208 1 ? 10 HELX_P HELX_P27 27 GLU E 46 ? ASN E 61 ? GLU E 50 ASN E 65 1 ? 16 HELX_P HELX_P28 28 GLY E 99 ? ALA E 109 ? GLY E 103 ALA E 113 1 ? 11 HELX_P HELX_P29 29 ASN E 123 ? ARG E 136 ? ASN E 127 ARG E 140 1 ? 14 HELX_P HELX_P30 30 THR E 140 ? GLY E 150 ? THR E 144 GLY E 154 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 31 ASP F 15 ? GLY F 34 ? ASP F 15 GLY F 34 1 ? 20 HELX_P HELX_P32 32 PRO F 51 ? ASP F 55 ? PRO F 51 ASP F 55 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 33 ARG F 71 ? ILE F 81 ? ARG F 71 ILE F 81 1 ? 11 HELX_P HELX_P34 34 ASP G 19 ? MET G 30 ? ASP G 20 MET G 31 1 ? 12 HELX_P HELX_P35 35 LYS G 34 ? THR G 53 ? LYS G 35 THR G 54 1 ? 20 HELX_P HELX_P36 36 GLU G 56 ? VAL G 68 ? GLU G 57 VAL G 69 1 ? 13 HELX_P HELX_P37 37 SER G 91 ? ARG G 110 ? SER G 92 ARG G 111 1 ? 20 HELX_P HELX_P38 38 ARG G 114 ? GLY G 129 ? ARG G 115 GLY G 130 1 ? 16 HELX_P HELX_P39 39 GLY G 131 ? ASN G 147 ? GLY G 132 ASN G 148 1 ? 17 HELX_P HELX_P40 40 ARG G 148 ? TYR G 153 ? ARG G 149 TYR G 154 5 ? 6 HELX_P HELX_P41 41 ASP H 4 ? VAL H 19 ? ASP H 4 VAL H 19 1 ? 16 HELX_P HELX_P42 42 SER H 29 ? GLU H 42 ? SER H 29 GLU H 42 1 ? 14 HELX_P HELX_P43 43 GLY H 96 ? ILE H 100 ? GLY H 96 ILE H 100 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 44 THR H 120 ? GLY H 128 ? THR H 120 GLY H 128 1 ? 9 HELX_P HELX_P45 45 ASP I 31 ? PHE I 36 ? ASP I 32 PHE I 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 46 VAL I 40 ? LEU I 46 ? VAL I 41 LEU I 47 1 ? 7 HELX_P HELX_P47 47 LEU I 46 ? VAL I 52 ? LEU I 47 VAL I 53 1 ? 7 HELX_P HELX_P48 48 GLY I 68 ? TYR I 87 ? GLY I 69 TYR I 88 1 ? 20 HELX_P HELX_P49 49 TYR I 91 ? LYS I 96 ? TYR I 92 LYS I 97 1 ? 6 HELX_P HELX_P50 50 ASP J 10 ? ARG J 27 ? ASP J 12 ARG J 29 1 ? 18 HELX_P HELX_P51 51 ASN J 76 ? LEU J 86 ? ASN J 78 LEU J 88 1 ? 11 HELX_P HELX_P52 52 GLY K 35 ? GLY K 39 ? GLY K 45 GLY K 49 1 ? 5 HELX_P HELX_P53 53 GLY K 42 ? THR K 47 ? GLY K 52 THR K 57 1 ? 6 HELX_P HELX_P54 54 THR K 47 ? MET K 63 ? THR K 57 MET K 73 1 ? 17 HELX_P HELX_P55 55 ALA K 64 ? GLY K 66 ? ALA K 74 GLY K 76 5 ? 3 HELX_P HELX_P56 56 GLY K 80 ? GLY K 92 ? GLY K 90 GLY K 102 1 ? 13 HELX_P HELX_P57 57 THR L 2 ? LYS L 9 ? THR L 5 LYS L 12 1 ? 8 HELX_P HELX_P58 58 ARG M 13 ? TYR M 20 ? ARG M 14 TYR M 21 1 ? 8 HELX_P HELX_P59 59 GLY M 25 ? LYS M 35 ? GLY M 26 LYS M 36 1 ? 11 HELX_P HELX_P60 60 ARG M 43 ? LEU M 47 ? ARG M 44 LEU M 48 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 61 THR M 48 ? TRP M 63 ? THR M 49 TRP M 64 1 ? 16 HELX_P HELX_P62 62 LEU M 65 ? ILE M 83 ? LEU M 66 ILE M 84 1 ? 19 HELX_P HELX_P63 63 CYS M 85 ? GLY M 94 ? CYS M 86 GLY M 95 1 ? 10 HELX_P HELX_P64 64 ALA M 106 ? GLY M 111 ? ALA M 107 GLY M 112 1 ? 6 HELX_P HELX_P65 65 ARG N 2 ? ALA N 9 ? ARG N 3 ALA N 10 1 ? 8 HELX_P HELX_P66 66 CYS N 39 ? GLY N 50 ? CYS N 40 GLY N 51 1 ? 12 HELX_P HELX_P67 67 THR O 3 ? PHE O 14 ? THR O 4 PHE O 15 1 ? 12 HELX_P HELX_P68 68 SER O 23 ? HIS O 45 ? SER O 24 HIS O 46 1 ? 23 HELX_P HELX_P69 69 ASP O 48 ? ASP O 73 ? ASP O 49 ASP O 74 1 ? 26 HELX_P HELX_P70 70 ASP O 73 ? GLY O 85 ? ASP O 74 GLY O 86 1 ? 13 HELX_P HELX_P71 71 ASP P 52 ? VAL P 62 ? ASP P 52 VAL P 62 1 ? 11 HELX_P HELX_P72 72 THR P 67 ? GLY P 78 ? THR P 67 GLY P 78 1 ? 12 HELX_P HELX_P73 73 ARG Q 80 ? GLN Q 95 ? ARG Q 81 GLN Q 96 1 ? 16 HELX_P HELX_P74 74 LYS R 3 ? LEU R 8 ? LYS R 21 LEU R 26 1 ? 6 HELX_P HELX_P75 75 ASN R 18 ? ARG R 24 ? ASN R 36 ARG R 42 1 ? 7 HELX_P HELX_P76 76 PRO R 34 ? GLY R 39 ? PRO R 52 GLY R 57 1 ? 6 HELX_P HELX_P77 77 SER R 41 ? LEU R 58 ? SER R 59 LEU R 76 1 ? 18 HELX_P HELX_P78 78 ASP S 9 ? ALA S 21 ? ASP S 12 ALA S 24 1 ? 13 HELX_P HELX_P79 79 VAL S 38 ? VAL S 42 ? VAL S 41 VAL S 45 5 ? 5 HELX_P HELX_P80 80 ALA T 5 ? GLY T 40 ? ALA T 12 GLY T 47 1 ? 36 HELX_P HELX_P81 81 ALA T 42 ? GLY T 62 ? ALA T 49 GLY T 69 1 ? 21 HELX_P HELX_P82 82 ASN T 68 ? GLU T 86 ? ASN T 75 GLU T 93 1 ? 19 HELX_P HELX_P83 83 THR U 7 ? ARG U 14 ? THR U 8 ARG U 15 1 ? 8 HELX_P HELX_P84 84 MET V 1 ? LEU V 18 ? MET V 1 LEU V 18 1 ? 18 HELX_P HELX_P85 85 GLU V 23 ? LYS V 26 ? GLU V 23 LYS V 26 5 ? 4 HELX_P HELX_P86 86 ASP V 27 ? SER V 63 ? ASP V 27 SER V 63 1 ? 37 HELX_P HELX_P87 87 ASP V 67 ? LEU V 97 ? ASP V 67 LEU V 97 1 ? 31 HELX_P HELX_P88 88 GLY V 117 ? MET V 138 ? GLY V 117 MET V 138 1 ? 22 HELX_P HELX_P89 89 ALA V 167 ? LYS V 172 ? ALA V 167 LYS V 172 1 ? 6 HELX_P HELX_P90 90 TYR V 173 ? SER V 175 ? TYR V 173 SER V 175 5 ? 3 HELX_P HELX_P91 91 ASN V 213 ? ASP V 215 ? ASN V 213 ASP V 215 5 ? 3 HELX_P HELX_P92 92 GLY V 229 ? THR V 235 ? GLY V 229 THR V 235 1 ? 7 HELX_P HELX_P93 93 SER V 257 ? ILE V 293 ? SER V 257 ILE V 293 1 ? 37 HELX_P HELX_P94 94 ASP V 323 ? LEU V 328 ? ASP V 323 LEU V 328 1 ? 6 HELX_P HELX_P95 95 LEU V 332 ? ALA V 352 ? LEU V 332 ALA V 352 1 ? 21 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc1 metalc ? ? 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'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 2 ? B ? 5 ? C ? 4 ? D ? 3 ? E ? 4 ? F ? 2 ? G ? 3 ? H ? 4 ? I ? 3 ? J ? 4 ? K ? 2 ? L ? 2 ? M ? 3 ? N ? 2 ? O ? 4 ? P ? 4 ? Q ? 4 ? R ? 3 ? S ? 5 ? T ? 4 ? U ? 3 ? V ? 2 ? W ? 6 ? X ? 3 ? Y ? 6 ? 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THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT CAN BE FOUND IN PDB ENTRY 3MRZ. ; _pdbx_entry_details.source_details ? # _pdbx_validate_close_contact.id 1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 "O2'" _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 A _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 G _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 438 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 O4 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 A _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 U _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 494 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_close_contact.dist 2.19 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "C3'" A A 243 ? ? 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? -62.73 92.16 22 1 ASN C 3 ? ? -119.33 -80.62 23 1 LYS C 4 ? ? 54.08 81.74 24 1 ILE C 14 ? ? -78.59 -72.00 25 1 THR C 15 ? ? -66.17 -101.83 26 1 TRP C 22 ? ? 175.92 152.92 27 1 LYS C 26 ? ? -67.46 3.76 28 1 LYS C 45 ? ? -72.70 -77.81 29 1 GLU C 46 ? ? -91.50 58.25 30 1 LEU C 47 ? ? -170.53 -14.17 31 1 ALA C 53 ? ? -140.49 -94.70 32 1 ARG C 54 ? ? -69.56 93.52 33 1 ALA C 60 ? ? -161.63 -46.79 34 1 ALA C 61 ? ? -171.27 90.63 35 1 ASP C 62 ? ? 68.04 -9.46 36 1 GLU C 82 ? ? -145.07 -48.58 37 1 THR C 95 ? ? -92.84 -158.69 38 1 GLU C 105 ? ? -66.94 -166.87 39 1 ASN C 108 ? ? -168.91 108.22 40 1 ARG C 127 ? ? 55.18 92.48 41 1 ALA C 129 ? ? -59.91 97.03 42 1 ARG C 156 ? ? -68.36 88.11 43 1 PRO C 174 ? ? -68.48 84.94 44 1 ARG C 179 ? ? -69.03 61.68 45 1 ALA C 187 ? ? -173.57 145.48 46 1 ALA C 189 ? ? -173.82 90.48 47 1 LEU C 204 ? ? -146.71 -69.51 48 1 TYR D 20 ? ? -102.07 50.36 49 1 LYS D 22 ? ? -80.25 -151.38 50 1 LYS D 30 ? ? -170.77 58.36 51 1 CYS D 31 ? ? -67.61 1.27 52 1 ALA D 32 ? ? 79.97 -19.94 53 1 PRO D 37 ? 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