data_3MS1 # _entry.id 3MS1 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.280 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 3MS1 NDB NA0593 RCSB RCSB058927 WWPDB D_1000058927 # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id OBSLTE _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2014-12-10 _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 4V7P _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 3MS1 _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ;This entry with other split entries have been consolidated into a combined file for complete representation. No coordinates have been changed. ; # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.content_type PDB 3F1E ;Crystal structure of a translation termination complex formed with release factor RF2. This file contains the 30S subunit, RF2, two tRNA, and mRNA molecules of one 70S ribosome. The entire crystal structure contains two 70S ribosomes as described in remark 400. ; unspecified PDB 3D5A ;Structural basis for translation termination on the 70S ribosome. This file contains the 30S subunit, release factor 1 (RF1), two tRNA, and mRNA molecules of one 70S ribosome. The entire crystal structure contains two 70S ribosomes as described in remark 400. ; unspecified PDB 1zbt 'Crystal structure of Peptide chain release factor 1 (RF-1) (SMU.1085) from Streptococcus mutans at 2.34 A resolution' unspecified PDB 3MR8 '30S subunit' unspecified PDB 3MS0 '30S subunit in molecule B' unspecified PDB 3MRZ '50S subunit in molecule B' unspecified PDB 3MR8 . split PDB 3MRZ . split PDB 3MS0 . split PDB 3MS1 . split PDB 4V7P . 'complete structure' # _pdbx_database_status.entry_id 3MS1 _pdbx_database_status.status_code OBS _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2010-04-29 _pdbx_database_status.status_code_sf OBS _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Korostelev, A.' 1 'Zhu, J.' 2 'Asahara, H.' 3 'Noller, H.F.' 4 # _citation.id primary _citation.title 'Recognition of the amber UAG stop codon by release factor RF1.' _citation.journal_abbrev 'Embo J.' _citation.journal_volume 29 _citation.page_first 2577 _citation.page_last 2585 _citation.year 2010 _citation.journal_id_ASTM EMJODG _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0261-4189 _citation.journal_id_CSD 0897 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 20588254 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/emboj.2010.139 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Korostelev, A.' 1 primary 'Zhu, J.' 2 primary 'Asahara, H.' 3 primary 'Noller, H.F.' 4 # _cell.entry_id 3MS1 _cell.length_a 210.380 _cell.length_b 452.700 _cell.length_c 617.090 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 3MS1 _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation 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250 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polyribonucleotide no no ;AGAUGGUAAGGGCCCACGGUGGAUGCCUCGGCACCCGAGCCGAUGAAGGACGUGGCUACCUGCGAUAAGCCAGGGGGAGC CGGUAGCGGGCGUGGAUCCCUGGAUGUCCGAAUGGGGGAACCCGGCCGGCGGGAACGCCGGUCACCGCGCUUUUUGCGCG GGGGGAACCUGGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCCAGAGGAGAGGAAAGAGAAAUCGACUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGA AAGGGGACCAGCCUAAACCGUCCGGCUUGUCCGGGCGGGGUCGUGGGGCCCUCGGACACCGAAUCCCCAGCCUAGCCGAA GCUGUUGGGAAGCAGCGCCAGAGAGGGUGAAAGCCCCGUAGGCGAAAGGUGGGGGGAUAGGUGAGGGUACCCGAGUACCC CGUGGUUCGUGGAGCCAUGGGGGAAUCUGGGCGGACCACCGCCUAAGGCUAAGUACUCCGGGUGACCGAUAGCGCACCAG UACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAUAGAGCCUGAAACCGUGGGCUUACAAGCAGUCACGG CCCCGCAAGGGGUUGUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUCACGGUCGUGGGCGAGCUUAAGCCGUUGAGGCG 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GAGGCGUAGGGAAACCGAGUCCGAACAGGGCGUCUAGUCCGCGGCCGUGGACCCGAAACCGGGCGAGCUAGCCCUGGCCA GGGUGAAGCUGGGGUGAGACCCAGUGGAGGCCCGAACCGGUGGGGGAUGCAAACCCCUCGGAUGAGCUGGGGCUAGGAGU GAAAAGCUAACCGAGCCCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGACUUUAGGGUCAGCCUCAGGCGCUGACUGGGGCCUG UAGAGCACUGAUAGGGCUAGGGGGCCCACCAGCCUACCAAACCCUGUCAAACUCCGAAGGGUCCCAGGUGGAGCCUGGGA GUGAGGGCGCGAGCGAUAACGUCCGCGUCCGAGCGCGGGAACAACCGAGACCGCCAGCUAAGGCCCCCAAGUCUGGGCUA AGUGGUAAAGGAUGUGGCGCCGCGAAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGC UCACUGGUCGAGUGGCGCCGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUUAAGCCCAGCGCCGAAGCUGCGGGUCUGGGGGAUGACCCC AGGCGGUAGGGGAGCGUUCCCGAUGCCGAUGAAGGCCGACCCGCGAGGGCGGCUGGAGGUAAGGGAAGUGCGAAUGCCGG CAUGAGUAACGAUAAAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGU UAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAU GGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCG CCUCCCAAAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGUACGGGUGACAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAA 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GAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCCACGGGCGCAGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAG UACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAA GGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCG GGAAGACUACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCGAGGUCU ; A ? 2 polyribonucleotide no no ;UCCCCCGUGCCCAUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACU GGGCGGGCGACCGCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGG ; ;UCCCCCGUGCCCAUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACU GGGCGGGCGACCGCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGG ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;AVKKFKPYTPSRRFMTVADFSEITKTEPEKSLVKPLKKTGGRNNQGRITVRFRGGGHKRLYRIIDFKRWDKVGIPAKVAA IEYDPNRSARIALLHYVDGEKRYIIAPDGLQVGQQVVAGPDAPIQVGNALPLRFIPVGTVVHAVELEPKKGAKLARAAGT SAQIQGREGDYVILRLPSGELRKVHGECYATVGAVGNADHKNIVLGKAGRSRWLGRRPHVRGAAMNPVDHPHGGGEGRAP RGRPPASPWGWQTKGLKTRKRRKPSSRFIIARRKK ; ;AVKKFKPYTPSRRFMTVADFSEITKTEPEKSLVKPLKKTGGRNNQGRITVRFRGGGHKRLYRIIDFKRWDKVGIPAKVAA 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;MKVILLEPLENLGDVGQVVDVKPGYARNYLLPRGLAVLATESNLKALEARIRAQAKRLAERKAEAERLKEILENLTLTIP VRAGETKIYGSVTAKDIAEALSRQHGITIDPKRLALEKPIKELGEYVLTYKPHPEVPIQLKVSVVAQE ; ;MKVILLEPLENLGDVGQVVDVKPGYARNYLLPRGLAVLATESNLKALEARIRAQAKRLAERKAEAERLKEILENLTLTIP VRAGETKIYGSVTAKDIAEALSRQHGITIDPKRLALEKPIKELGEYVLTYKPHPEVPIQLKVSVVAQE ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MPNKRNVELLATLKENLERAQGSFFLVNYQGLPAKETHALRQALKQNGARLFVAKNTLIRLALKELGLPELDGLQGPSAV VFYEDPVAAAKTLVQFAKSNPKGIPQVKSGLLQGQILTAKDVEALAELPTMDELRAELVGVLQAPMAELVGVLGGVAREL VGILEAYAEKKAA ; ;MPNKRNVELLATLKENLERAQGSFFLVNYQGLPAKETHALRQALKQNGARLFVAKNTLIRLALKELGLPELDGLQGPSAV VFYEDPVAAAKTLVQFAKSNPKGIPQVKSGLLQGQILTAKDVEALAELPTMDELRAELVGVLQAPMAELVGVLGGVAREL VGILEAYAEKKAA ; I ? 10 'polypeptide(L)' no no ;KTYVPKQVEPRWVLIDAEGKTLGRLATKIATLLRGKHRPDWTPNVAMGDFVVVVNADKIRVTGKKLEQKIYTRYSGYPGG LKKIPLEKMLATHPERVLEHAVKGMLPKGPLGRRLFKRLKVYAGPDHPHQAQRPEKLEV ; ;KTYVPKQVEPRWVLIDAEGKTLGRLATKIATLLRGKHRPDWTPNVAMGDFVVVVNADKIRVTGKKLEQKIYTRYSGYPGG LKKIPLEKMLATHPERVLEHAVKGMLPKGPLGRRLFKRLKVYAGPDHPHQAQRPEKLEV ; J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MIQPQTYLEVADNTGARKIMCIRVLKGSNAKYATVGDVIVASVKEAIPRGAVKEGDVVKAVVVRTKKEVKRPDGSAIRFD DNAAVIINNQLEPRGTRVFGPVARELREKGFMKIVSLAPEVL ; ;MIQPQTYLEVADNTGARKIMCIRVLKGSNAKYATVGDVIVASVKEAIPRGAVKEGDVVKAVVVRTKKEVKRPDGSAIRFD DNAAVIINNQLEPRGTRVFGPVARELREKGFMKIVSLAPEVL ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MKLSDLRPNPGANKRRKRVGRGPGSGHGKTATRGHKGQKSRSGGLKDPRRFEGGRSTTLMRLPKRGMQGQVPGEIKRPRY QGVNLKDLARFEGEVTPELLVRAGLLKKGYRLKILGEGEAKPLKVVAHAFSKSALEKLKAAGGEPVLLEA ; ;MKLSDLRPNPGANKRRKRVGRGPGSGHGKTATRGHKGQKSRSGGLKDPRRFEGGRSTTLMRLPKRGMQGQVPGEIKRPRY QGVNLKDLARFEGEVTPELLVRAGLLKKGYRLKILGEGEAKPLKVVAHAFSKSALEKLKAAGGEPVLLEA ; L ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MLMPRRMKYRKQQRGRLKGATKGGDYVAFGDFGLVALEPAWITAQQIEAARVAMVRHFRRGGKIFIRIFPDKPYTKKPLE VRMGKGKGNVEGYVAVVKPGRVMFEVAGVTEEQAMEALRIAGHKLPIKTKIVRRDAYDEAQ ; ;MLMPRRMKYRKQQRGRLKGATKGGDYVAFGDFGLVALEPAWITAQQIEAARVAMVRHFRRGGKIFIRIFPDKPYTKKPLE VRMGKGKGNVEGYVAVVKPGRVMFEVAGVTEEQAMEALRIAGHKLPIKTKIVRRDAYDEAQ ; M ? 14 'polypeptide(L)' no no ;RHLKSGRKLNRHSSHRLALYRNQAKSLLTHGRITTTVPKAKELRGFVDHLIHLAKRGDLHARRLVLRDLQDVKLVRKLFD EIAPRYRDRQGGYTRVLKLAERRRGDGAPLALVELVE ; ;RHLKSGRKLNRHSSHRLALYRNQAKSLLTHGRITTTVPKAKELRGFVDHLIHLAKRGDLHARRLVLRDLQDVKLVRKLFD EIAPRYRDRQGGYTRVLKLAERRRGDGAPLALVELVE ; N ? 15 'polypeptide(L)' no no ;ARLTAYERRKFRVRNRIKRTGRLRLSVFRSLKHIYAQIIDDEKGVTLVSASSLALKLKGNKTEVARQVGRALAEKALALG IKQVAFDRGPYKYHGRVKALAEGAREGGLEF ; ;ARLTAYERRKFRVRNRIKRTGRLRLSVFRSLKHIYAQIIDDEKGVTLVSASSLALKLKGNKTEVARQVGRALAEKALALG IKQVAFDRGPYKYHGRVKALAEGAREGGLEF ; O ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MNRGALIKLVESRYVRTDLPEFRPGDTVRVSYKVKEGNRTRIQDFEGIVIRIRRNGFNTTFTVRKVSYGVGVERIFPLHS PLIQKIDIVQRGRARRAKLYFIRNLSDREIRRKLRADRKRIDKDRAAERAAKEEVQKAQEPEASQE ; ;MNRGALIKLVESRYVRTDLPEFRPGDTVRVSYKVKEGNRTRIQDFEGIVIRIRRNGFNTTFTVRKVSYGVGVERIFPLHS PLIQKIDIVQRGRARRAKLYFIRNLSDREIRRKLRADRKRIDKDRAAERAAKEEVQKAQEPEASQE ; P ? 17 'polypeptide(L)' no no ;PRAKTGVVRRRKHKKILKLAKGYWGLRSKSRKARETLFAAGNYAYAHRKRRKRDFRRLWIVRINAACRQHGLNYSTFIHG LKKAGIEVDRKNLADLAVREPQVFAELVERAKAAQG ; ;PRAKTGVVRRRKHKKILKLAKGYWGLRSKSRKARETLFAAGNYAYAHRKRRKRDFRRLWIVRINAACRQHGLNYSTFIHG LKKAGIEVDRKNLADLAVREPQVFAELVERAKAAQG ; Q ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MFAIVKTGGKQYRVEPGLKLRVEKLDAEPGATVELPVLLLGGEKTVVGTPVVEGASVVAEVLGHGRGKKILVSKFKAKVQ YRRKKGHRQPYTELLIKEIRG ; ;MFAIVKTGGKQYRVEPGLKLRVEKLDAEPGATVELPVLLLGGEKTVVGTPVVEGASVVAEVLGHGRGKKILVSKFKAKVQ YRRKKGHRQPYTELLIKEIRG ; R ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MEAKAIARYVRISPRKVRLVVDLIRGKSLEEARNILRYTNKRGAYFVAKVLESAAANAVNNHDMLEDRLYVKAAYVDEGP ALKRVLPRARGRADIIKKRTSHITVILGEKHG ; ;MEAKAIARYVRISPRKVRLVVDLIRGKSLEEARNILRYTNKRGAYFVAKVLESAAANAVNNHDMLEDRLYVKAAYVDEGP ALKRVLPRARGRADIIKKRTSHITVILGEKHG ; S ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MKTAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAI VQVAPGQKIEALEGLI ; ;MKTAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAI VQVAPGQKIEALEGLI ; T ? 21 'polypeptide(L)' no no ;RVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACGK PTRVRKKFLENGKKIRVCAKCGGALDTEE ; ;RVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACGK PTRVRKKFLENGKKIRVCAKCGGALDTEE ; U ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MEYRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRR RRPEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPG VELAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAAEVAEPEVIKKGKEEEEE ; ;MEYRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRR RRPEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPG VELAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAAEVAEPEVIKKGKEEEEE ; V ? 23 'polypeptide(L)' no no ;AHKKGLGSTKNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVHV RPLA ; ;AHKKGLGSTKNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVHV RPLA ; W ? 24 'polypeptide(L)' no no ;MSKVCEISGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGL RLEGLSPKEIKKELLKLL ; ;MSKVCEISGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGL RLEGLSPKEIKKELLKLL ; X ? 25 'polypeptide(L)' no no MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLTVLNEKRRQNA MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLTVLNEKRRQNA Y ? 26 'polypeptide(L)' no no MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVV MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVV Z ? 27 'polypeptide(L)' no no MKEGIHPKLVPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKCHPFYTGQQRFVDTEGRVERFQRRYGDSYRKGR MKEGIHPKLVPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKCHPFYTGQQRFVDTEGRVERFQRRYGDSYRKGR 1 ? 28 'polypeptide(L)' no no AKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPILVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYAGRKVLEV AKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPILVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYAGRKVLEV 2 ? 29 'polypeptide(L)' no no MASEVRIKLLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREVKI MASEVRIKLLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREVKI 3 ? 30 'polypeptide(L)' no no MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRK MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRK 4 ? 31 'polypeptide(L)' no no PKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPYE PKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPYE 5 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 A n 1 2 G n 1 3 A n 1 4 U n 1 5 G n 1 6 G n 1 7 U n 1 8 A n 1 9 A n 1 10 G n 1 11 G n 1 12 G n 1 13 C n 1 14 C n 1 15 C n 1 16 A n 1 17 C n 1 18 G n 1 19 G n 1 20 U n 1 21 G n 1 22 G n 1 23 A n 1 24 U n 1 25 G n 1 26 C n 1 27 C n 1 28 U n 1 29 C n 1 30 G n 1 31 G n 1 32 C n 1 33 A n 1 34 C n 1 35 C n 1 36 C n 1 37 G n 1 38 A n 1 39 G n 1 40 C n 1 41 C n 1 42 G n 1 43 A n 1 44 U n 1 45 G n 1 46 A n 1 47 A n 1 48 G n 1 49 G n 1 50 A n 1 51 C n 1 52 G n 1 53 U n 1 54 G n 1 55 G n 1 56 C n 1 57 U n 1 58 A n 1 59 C n 1 60 C n 1 61 U n 1 62 G n 1 63 C n 1 64 G n 1 65 A n 1 66 U n 1 67 A n 1 68 A n 1 69 G n 1 70 C n 1 71 C n 1 72 A n 1 73 G n 1 74 G n 1 75 G n 1 76 G n 1 77 G n 1 78 A n 1 79 G n 1 80 C n 1 81 C n 1 82 G n 1 83 G n 1 84 U n 1 85 A n 1 86 G n 1 87 C n 1 88 G n 1 89 G n 1 90 G n 1 91 C n 1 92 G n 1 93 U n 1 94 G n 1 95 G n 1 96 A n 1 97 U n 1 98 C n 1 99 C n 1 100 C n 1 101 U n 1 102 G n 1 103 G n 1 104 A n 1 105 U n 1 106 G n 1 107 U n 1 108 C n 1 109 C n 1 110 G n 1 111 A n 1 112 A n 1 113 U n 1 114 G n 1 115 G n 1 116 G n 1 117 G n 1 118 G n 1 119 A n 1 120 A n 1 121 C n 1 122 C n 1 123 C n 1 124 G n 1 125 G n 1 126 C n 1 127 C n 1 128 G n 1 129 G n 1 130 C n 1 131 G n 1 132 G n 1 133 G n 1 134 A n 1 135 A n 1 136 C n 1 137 G n 1 138 C n 1 139 C n 1 140 G n 1 141 G n 1 142 U n 1 143 C n 1 144 A n 1 145 C n 1 146 C n 1 147 G n 1 148 C n 1 149 G n 1 150 C n 1 151 U n 1 152 U n 1 153 U n 1 154 U n 1 155 U n 1 156 G n 1 157 C n 1 158 G n 1 159 C n 1 160 G n 1 161 G n 1 162 G n 1 163 G n 1 164 G n 1 165 G n 1 166 A n 1 167 A n 1 168 C n 1 169 C n 1 170 U n 1 171 G n 1 172 G n 1 173 G n 1 174 G n 1 175 A n 1 176 A n 1 177 C n 1 178 U n 1 179 G n 1 180 A n 1 181 A n 1 182 A n 1 183 C n 1 184 A n 1 185 U n 1 186 C n 1 187 U n 1 188 C n 1 189 A n 1 190 G n 1 191 U n 1 192 A n 1 193 C n 1 194 C n 1 195 C n 1 196 A n 1 197 G n 1 198 A n 1 199 G n 1 200 G n 1 201 A n 1 202 G n 1 203 A n 1 204 G n 1 205 G n 1 206 A n 1 207 A n 1 208 A n 1 209 G n 1 210 A n 1 211 G n 1 212 A n 1 213 A n 1 214 A n 1 215 U n 1 216 C n 1 217 G n 1 218 A n 1 219 C n 1 220 U n 1 221 C n 1 222 C n 1 223 C n 1 224 U n 1 225 G n 1 226 A n 1 227 G n 1 228 U n 1 229 A n 1 230 G n 1 231 C n 1 232 G n 1 233 G n 1 234 C n 1 235 G n 1 236 A n 1 237 G n 1 238 C n 1 239 G n 1 240 A n 1 241 A n 1 242 A n 1 243 G n 1 244 G n 1 245 G n 1 246 G n 1 247 A n 1 248 C n 1 249 C n 1 250 A n 1 251 G n 1 252 C n 1 253 C n 1 254 U n 1 255 A n 1 256 A n 1 257 A n 1 258 C n 1 259 C n 1 260 G n 1 261 U n 1 262 C n 1 263 C n 1 264 G n 1 265 G n 1 266 C n 1 267 U n 1 268 U n 1 269 G n 1 270 U n 1 271 C n 1 272 C n 1 273 G n 1 274 G n 1 275 G n 1 276 C n 1 277 G n 1 278 G n 1 279 G n 1 280 G n 1 281 U n 1 282 C n 1 283 G n 1 284 U n 1 285 G n 1 286 G n 1 287 G n 1 288 G n 1 289 C n 1 290 C n 1 291 C n 1 292 U n 1 293 C n 1 294 G n 1 295 G n 1 296 A n 1 297 C n 1 298 A n 1 299 C n 1 300 C n 1 301 G n 1 302 A n 1 303 A n 1 304 U n 1 305 C n 1 306 C n 1 307 C n 1 308 C n 1 309 A n 1 310 G n 1 311 C n 1 312 C n 1 313 U n 1 314 A n 1 315 G n 1 316 C n 1 317 C n 1 318 G n 1 319 A n 1 320 A n 1 321 G n 1 322 C n 1 323 U n 1 324 G n 1 325 U n 1 326 U n 1 327 G n 1 328 G n 1 329 G n 1 330 A n 1 331 A n 1 332 G n 1 333 C n 1 334 A n 1 335 G n 1 336 C n 1 337 G n 1 338 C n 1 339 C n 1 340 A n 1 341 G n 1 342 A n 1 343 G n 1 344 A n 1 345 G n 1 346 G n 1 347 G n 1 348 U n 1 349 G n 1 350 A n 1 351 A n 1 352 A n 1 353 G n 1 354 C n 1 355 C n 1 356 C n 1 357 C n 1 358 G n 1 359 U n 1 360 A n 1 361 G n 1 362 G n 1 363 C n 1 364 G n 1 365 A n 1 366 A n 1 367 A n 1 368 G n 1 369 G n 1 370 U n 1 371 G n 1 372 G n 1 373 G n 1 374 G n 1 375 G n 1 376 G n 1 377 A n 1 378 U n 1 379 A n 1 380 G n 1 381 G n 1 382 U n 1 383 G n 1 384 A n 1 385 G n 1 386 G n 1 387 G n 1 388 U n 1 389 A n 1 390 C n 1 391 C n 1 392 C n 1 393 G n 1 394 A n 1 395 G n 1 396 U n 1 397 A n 1 398 C n 1 399 C n 1 400 C n 1 401 C n 1 402 G n 1 403 U n 1 404 G n 1 405 G n 1 406 U n 1 407 U n 1 408 C n 1 409 G n 1 410 U n 1 411 G n 1 412 G n 1 413 A n 1 414 G n 1 415 C n 1 416 C n 1 417 A n 1 418 U n 1 419 G n 1 420 G n 1 421 G n 1 422 G n 1 423 G n 1 424 A n 1 425 A n 1 426 U n 1 427 C n 1 428 U n 1 429 G n 1 430 G n 1 431 G n 1 432 C n 1 433 G n 1 434 G n 1 435 A n 1 436 C n 1 437 C n 1 438 A n 1 439 C n 1 440 C n 1 441 G n 1 442 C n 1 443 C n 1 444 U n 1 445 A n 1 446 A n 1 447 G n 1 448 G n 1 449 C n 1 450 U n 1 451 A n 1 452 A n 1 453 G n 1 454 U n 1 455 A n 1 456 C n 1 457 U n 1 458 C n 1 459 C n 1 460 G n 1 461 G n 1 462 G n 1 463 U n 1 464 G n 1 465 A n 1 466 C n 1 467 C n 1 468 G n 1 469 A n 1 470 U n 1 471 A n 1 472 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20 UNP RL23_THET2 Q72I06 20 ;MKTAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAI VQVAPGQKIEALEGLI ; 1 ? 21 UNP RL24_THET2 Q72I15 21 ;RVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACGK PTRVRKKFLENGKKIRVCAKCGGALDTEE ; 2 ? 22 UNP RL25_THET2 Q72IA7 22 ;MEYRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRR RRPEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPG VELAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAAEVAEPEVIKKGKEEEEE ; 1 ? 23 UNP RL27_THET2 Q72HR3 23 ;AHKKGLGSTKNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVHV RPLA ; 2 ? 24 UNP RL28_THET2 Q72G84 24 ;MSKVCEISGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGL RLEGLSPKEIKKELLKLL ; 1 ? 25 UNP RL29_THET2 Q72I12 25 MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLTVLNEKRRQNA 1 ? 26 UNP RL30_THET2 Q72I22 26 MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVV 1 ? 27 UNP RL31_THET2 Q72JR0 27 MKEGIHPKLVPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKCHPFYTGQQRFVDTEGRVERFQRRYGDSYRKGR 1 ? 28 UNP RL32_THET2 P62652 28 AKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPILVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYAGRKVLEV 2 ? 29 UNP RL33_THET2 Q72GW3 29 MASEVRIKLLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREVKI 1 ? 30 UNP RL34_THET8 P80340 30 MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRK 1 ? 31 UNP RL35_THET2 Q72L77 31 PKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPYE 2 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3MS1 A 1 ? 2879 ? AE017221.1 1534494 ? 1537372 ? 6 2897 2 2 3MS1 B 1 ? 119 ? AE017221.1 1537462 ? 1537580 ? 1 118 3 3 3MS1 C 1 ? 275 ? Q72I07 2 ? 276 ? 2 276 4 4 3MS1 D 1 ? 206 ? Q72I04 1 ? 206 ? 1 206 5 5 3MS1 E 1 ? 205 ? Q72I05 1 ? 205 ? 6 210 6 6 3MS1 F 1 ? 181 ? Q72I16 2 ? 182 ? 2 182 7 7 3MS1 G 1 ? 180 ? Q72I19 1 ? 180 ? 1 180 8 8 3MS1 H 1 ? 148 ? Q72GV5 1 ? 148 ? 1 148 9 9 3MS1 I 1 ? 173 ? Q72GS1 1 ? 173 ? 1 173 10 10 3MS1 J 1 ? 139 ? Q72IN1 2 ? 140 ? 25 163 11 11 3MS1 K 1 ? 122 ? Q72I14 1 ? 122 ? 1 122 12 12 3MS1 L 1 ? 150 ? Q72I23 1 ? 150 ? 1 150 13 13 3MS1 M 1 ? 141 ? Q72I11 1 ? 141 ? 1 141 14 14 3MS1 N 1 ? 117 ? Q72I33 2 ? 118 ? 2 118 15 15 3MS1 O 1 ? 111 ? Q72I20 2 ? 112 ? 2 112 16 16 3MS1 P 1 ? 146 ? Q72JU9 1 ? 146 ? 1 146 17 17 3MS1 Q 1 ? 116 ? Q72L76 2 ? 118 ? 2 118 18 18 3MS1 R 1 ? 101 ? Q72HR2 1 ? 101 ? 1 101 19 19 3MS1 S 1 ? 112 ? Q72I09 1 ? 112 ? 1 112 20 20 3MS1 T 1 ? 96 ? Q72I06 1 ? 96 ? 1 96 21 21 3MS1 U 1 ? 109 ? Q72I15 2 ? 110 ? 2 110 22 22 3MS1 V 1 ? 206 ? 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Q ? ? UNP Q72L76 PHE 32 DELETION ? 3 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.crystals_number 1 _exptl.entry_id 3MS1 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # loop_ _diffrn.id _diffrn.ambient_temp _diffrn.ambient_temp_details _diffrn.crystal_id 1 ? ? 1 2 ? ? 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector ? _diffrn_detector.type ? _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2009-08-05 _diffrn_detector.details ? # loop_ _diffrn_radiation.diffrn_id _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol _diffrn_radiation.monochromator _diffrn_radiation.wavelength_id _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type 1 'SINGLE WAVELENGTH' ? 1 M x-ray 2 'SINGLE WAVELENGTH' ? 1 M x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength . _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # loop_ _diffrn_source.diffrn_id _diffrn_source.source _diffrn_source.type _diffrn_source.pdbx_wavelength_list _diffrn_source.pdbx_wavelength _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 1 SYNCHROTRON 'APS BEAMLINE 23-ID-D' ? ? APS 23-ID-D 2 SYNCHROTRON 'SSRL BEAMLINE BL12-2' ? ? SSRL BL12-2 # _reflns.entry_id 3MS1 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.observed_criterion_sigma_I ? _reflns.d_resolution_high 3.52 _reflns.d_resolution_low 90 _reflns.number_all 724157 _reflns.number_obs 723953 _reflns.percent_possible_obs 100 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI ? _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy ? _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1,2 _reflns.pdbx_ordinal 1 # _refine.entry_id 3MS1 _refine.ls_d_res_high 3.620 _refine.ls_d_res_low 49.953 _refine.pdbx_ls_sigma_F 1.99 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_percent_reflns_obs 99.990 _refine.ls_number_reflns_obs 663328 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.details ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs 0.260 _refine.ls_R_factor_R_work 0.260 _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free 0.291 _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 2.000 _refine.ls_number_reflns_R_free 13271 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.B_iso_mean 162.473 _refine.solvent_model_param_bsol 68.406 _refine.solvent_model_param_ksol 0.200 _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.aniso_B[1][1] -19.139 _refine.aniso_B[2][2] -5.866 _refine.aniso_B[3][3] 25.005 _refine.aniso_B[1][2] 0.000 _refine.aniso_B[1][3] 0.000 _refine.aniso_B[2][3] 0.000 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML 0.590 _refine.overall_SU_B ? _refine.solvent_model_details 'FLAT BULK SOLVENT MODEL' _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.110 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.900 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.pdbx_starting_model 'PDB ENTRIES 3F1E & 3F1F' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ML _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.B_iso_max 509.19 _refine.B_iso_min 23.63 _refine.occupancy_max 1.00 _refine.occupancy_min 1.00 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 26265 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 64548 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 250 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 91063 _refine_hist.d_res_high 3.620 _refine_hist.d_res_low 49.953 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function f_bond_d 319010 0.002 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_angle_d 476570 0.659 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_chiral_restr 60294 0.041 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_plane_restr 26226 0.002 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_dihedral_angle_d 172552 18.407 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal 'X-RAY DIFFRACTION' 1 1 POSITIONAL A 87351 0.007 ? ? ? ? ? ? ? 1 'X-RAY DIFFRACTION' 6 1 POSITIONAL A 2239 0.003 ? ? ? ? ? ? ? 2 'X-RAY DIFFRACTION' 7 1 POSITIONAL A 1241 0.007 ? ? ? ? ? ? ? 3 # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details 1 1 A 6 1 A 7 1 A # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.selection_details _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id 1 1 1 ? A 6 A 2093 '(segid A23S or segid A5S or segid AL*) and not resid 2093:2196 and not resid 1051:1108' ? ? ? ? ? ? ? ? 1 1 2 ? A 2196 A 2897 '(segid A23S or segid A5S or segid AL*) and not resid 2093:2196 and not resid 1051:1108' ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 1 ? A 2093 A 2196 'segid A23S and resid 2093:2196' ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 1 ? A 1051 A 1108 'segid A23S and resid 1051:1108' ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? 6 ? 7 ? # _struct.entry_id 3MS1 _struct.title ;Recognition of the amber stop codon by release factor RF1. This entry 3MS1 contains 50S ribosomal subunit. The 30S ribosomal subunit can be found in PDB entry 3MR8. Molecule B in the same asymmetric unit is deposited as 3MRZ (50S) and 3MS0 (30S). ; _struct.pdbx_descriptor '50S RIBOSOMAL SUBUNIT' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3MS1 _struct_keywords.text '70S, ribosome, termination, release factor, RF1, stop codon, UGA, amber, tRNA' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 26 ? AA N N 27 ? BA N N 28 ? CA N N 29 ? DA N N 30 ? EA N N 31 ? FA N N 32 ? GA N N 32 ? HA N N 32 ? IA N N 32 ? JA N N 32 ? KA N N 32 ? LA N N 32 ? MA N N 32 ? NA N N 32 ? OA N N 32 ? PA N N 32 ? QA N N 32 ? RA N N 32 ? SA N N 32 ? TA N N 32 ? UA N N 32 ? VA N N 32 ? WA N N 32 ? XA N N 32 ? YA N N 32 ? ZA N N 32 ? AB N N 32 ? BB N N 32 ? CB N N 32 ? DB N N 32 ? EB N N 32 ? FB N N 32 ? GB N N 32 ? HB N N 32 ? IB N N 32 ? JB N N 32 ? KB N N 32 ? LB N N 32 ? MB N N 32 ? NB N N 32 ? OB N N 32 ? PB N N 32 ? QB N N 32 ? RB N N 32 ? SB N N 32 ? TB N N 32 ? UB N N 32 ? VB N N 32 ? WB N N 32 ? XB N N 32 ? YB N N 32 ? ZB N N 32 ? AC N N 32 ? BC N N 32 ? CC N N 32 ? DC N N 32 ? EC N N 32 ? FC N N 32 ? GC N N 32 ? HC N N 32 ? IC N N 32 ? JC N N 32 ? KC N N 32 ? LC N N 32 ? MC N N 32 ? NC N N 32 ? OC N N 32 ? PC N N 32 ? QC N N 32 ? RC N N 32 ? SC N N 32 ? TC N N 32 ? UC N N 32 ? VC N N 32 ? WC N N 32 ? XC N N 32 ? YC N N 32 ? ZC N N 32 ? AD N N 32 ? BD N N 32 ? CD N N 32 ? DD N N 32 ? ED N N 32 ? FD N N 32 ? GD N N 32 ? HD N N 32 ? ID N N 32 ? JD N N 32 ? KD N N 32 ? LD N N 32 ? MD N N 32 ? ND N N 32 ? OD N N 32 ? PD N N 32 ? QD N N 32 ? RD N N 32 ? SD N N 32 ? TD N N 32 ? UD N N 32 ? VD N N 32 ? WD N N 32 ? XD N N 32 ? YD N N 32 ? ZD N N 32 ? AE N N 32 ? BE N N 32 ? CE N N 32 ? DE N N 32 ? EE N N 32 ? FE N N 32 ? GE N N 32 ? HE N N 32 ? IE N N 32 ? JE N N 32 ? KE N N 32 ? LE N N 32 ? ME N N 32 ? NE N N 32 ? OE N N 32 ? PE N N 32 ? QE N N 32 ? RE N N 32 ? SE N N 32 ? TE N N 32 ? UE N N 32 ? VE N N 32 ? WE N N 32 ? XE N N 32 ? YE N N 32 ? ZE N N 32 ? AF N N 32 ? BF N N 32 ? CF N N 32 ? DF N N 32 ? EF N N 32 ? FF N N 32 ? GF N N 32 ? HF N N 32 ? IF N N 32 ? JF N N 32 ? KF N N 32 ? LF N N 32 ? MF N N 32 ? NF N N 32 ? OF N N 32 ? PF N N 32 ? QF N N 32 ? RF N N 32 ? SF N N 32 ? TF N N 32 ? UF N N 32 ? VF N N 32 ? WF N N 32 ? XF N N 32 ? YF N N 32 ? ZF N N 32 ? AG N N 32 ? BG N N 32 ? CG N N 32 ? DG N N 32 ? EG N N 32 ? FG N N 32 ? GG N N 32 ? HG N N 32 ? IG N N 32 ? JG N N 32 ? KG N N 32 ? LG N N 32 ? MG N N 32 ? NG N N 32 ? OG N N 32 ? PG N N 32 ? QG N N 32 ? RG N N 32 ? SG N N 32 ? TG N N 32 ? UG N N 32 ? VG N N 32 ? WG N N 32 ? XG N N 32 ? YG N N 32 ? ZG N N 32 ? AH N N 32 ? BH N N 32 ? CH N N 32 ? DH N N 32 ? EH N N 32 ? FH N N 32 ? GH N N 32 ? HH N N 32 ? IH N N 32 ? JH N N 32 ? KH N N 32 ? LH N N 32 ? MH N N 32 ? NH N N 32 ? OH N N 32 ? PH N N 32 ? QH N N 32 ? RH N N 32 ? SH N N 32 ? TH N N 32 ? UH N N 32 ? VH N N 32 ? WH N N 32 ? XH N N 32 ? YH N N 32 ? ZH N N 32 ? AI N N 32 ? BI N N 32 ? CI N N 32 ? DI N N 32 ? EI N N 32 ? FI N N 32 ? GI N N 32 ? HI N N 32 ? II N N 32 ? JI N N 32 ? KI N N 32 ? LI N N 32 ? MI N N 32 ? NI N N 32 ? OI N N 32 ? PI N N 32 ? QI N N 32 ? RI N N 32 ? SI N N 32 ? TI N N 32 ? UI N N 32 ? VI N N 32 ? WI N N 32 ? XI N N 32 ? YI N N 32 ? ZI N N 32 ? AJ N N 32 ? BJ N N 32 ? CJ N N 32 ? DJ N N 32 ? EJ N N 32 ? FJ N N 32 ? GJ N N 32 ? HJ N N 32 ? IJ N N 32 ? JJ N N 32 ? KJ N N 32 ? LJ N N 32 ? MJ N N 32 ? NJ N N 32 ? OJ N N 32 ? PJ N N 32 ? QJ N N 32 ? RJ N N 32 ? SJ N N 32 ? TJ N N 32 ? UJ N N 32 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;The biological molecule is composed of both the 30S and 50S subunits. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT OF ONE 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ALA C 198 ? ILE C 203 ? ALA C 199 ILE C 204 5 ? 6 HELX_P HELX_P2 2 ALA C 208 ? LEU C 214 ? ALA C 209 LEU C 215 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 3 ARG C 221 ? MET C 225 ? ARG C 222 MET C 226 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 4 LYS C 263 ? ILE C 269 ? LYS C 264 ILE C 270 5 ? 7 HELX_P HELX_P5 5 PRO D 62 ? LYS D 69 ? PRO D 62 LYS D 69 1 ? 8 HELX_P HELX_P6 6 THR D 92 ? PHE D 96 ? THR D 92 PHE D 96 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 7 GLY D 115 ? TRP D 120 ? GLY D 115 TRP D 120 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 8 ASN E 24 ? ARG E 40 ? ASN E 29 ARG E 45 1 ? 17 HELX_P HELX_P9 9 PRO E 97 ? GLU E 115 ? PRO E 102 GLU E 120 1 ? 19 HELX_P HELX_P10 10 LYS E 130 ? GLY E 142 ? LYS E 135 GLY E 147 1 ? 13 HELX_P HELX_P11 11 ASN E 155 ? LEU E 165 ? ASN E 160 LEU E 170 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 12 ASN E 177 ? THR E 184 ? ASN E 182 THR E 189 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 13 LEU E 191 ? ILE E 201 ? LEU E 196 ILE E 206 1 ? 11 HELX_P HELX_P14 14 LEU F 4 ? GLU F 12 ? LEU F 5 GLU F 13 1 ? 9 HELX_P HELX_P15 15 GLU F 13 ? PHE F 22 ? GLU F 14 PHE F 23 1 ? 10 HELX_P HELX_P16 16 ALA F 49 ? GLY F 64 ? ALA F 50 GLY F 65 1 ? 16 HELX_P HELX_P17 17 ILE F 76 ? LYS F 80 ? ILE F 77 LYS F 81 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 18 ARG F 94 ? VAL F 108 ? ARG F 95 VAL F 109 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 19 THR F 164 ? LEU F 175 ? THR F 165 LEU F 176 1 ? 12 HELX_P HELX_P20 20 GLU G 58 ? GLU G 81 ? GLU G 58 GLU G 81 1 ? 24 HELX_P HELX_P21 21 ASP G 137 ? ALA G 150 ? ASP G 137 ALA G 150 1 ? 14 HELX_P HELX_P22 22 LYS H 22 ? ASN H 28 ? LYS H 22 ASN H 28 1 ? 7 HELX_P HELX_P23 23 THR H 40 ? LEU H 72 ? THR H 40 LEU H 72 1 ? 33 HELX_P HELX_P24 24 THR H 93 ? GLN H 104 ? THR H 93 GLN H 104 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 25 ASN I 3 ? ARG I 19 ? ASN I 3 ARG I 19 1 ? 17 HELX_P HELX_P26 26 ASN I 56 ? GLY I 67 ? ASN I 56 GLY I 67 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 27 THR J 21 ? ARG J 34 ? THR J 45 ARG J 58 1 ? 14 HELX_P HELX_P28 28 ASN J 55 ? ILE J 59 ? ASN J 79 ILE J 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 29 LEU J 86 ? THR J 92 ? LEU J 110 THR J 116 1 ? 7 HELX_P HELX_P30 30 PRO J 94 ? LEU J 106 ? PRO J 118 LEU J 130 1 ? 13 HELX_P HELX_P31 31 GLY J 109 ? LEU J 119 ? GLY J 133 LEU J 143 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 32 ALA K 103 ? GLY K 110 ? ALA K 103 GLY K 110 5 ? 8 HELX_P HELX_P33 33 PHE K 111 ? ALA K 118 ? PHE K 111 ALA K 118 1 ? 8 HELX_P HELX_P34 34 LEU L 85 ? PHE L 91 ? LEU L 85 PHE L 91 1 ? 7 HELX_P HELX_P35 35 THR L 96 ? ALA L 103 ? THR L 96 ALA L 103 1 ? 8 HELX_P HELX_P36 36 SER L 133 ? ALA L 140 ? SER L 133 ALA L 140 1 ? 8 HELX_P HELX_P37 37 ALA M 44 ? PHE M 58 ? ALA M 44 PHE M 58 1 ? 15 HELX_P HELX_P38 38 THR M 110 ? LYS M 124 ? THR M 110 LYS M 124 1 ? 15 HELX_P HELX_P39 39 SER N 13 ? GLY N 31 ? SER N 14 GLY N 32 1 ? 19 HELX_P HELX_P40 40 VAL N 37 ? LYS N 55 ? VAL N 38 LYS N 56 1 ? 19 HELX_P HELX_P41 41 ASP N 58 ? ARG N 67 ? ASP N 59 ARG N 68 1 ? 10 HELX_P HELX_P42 42 ASP N 71 ? GLU N 81 ? ASP N 72 GLU N 82 1 ? 11 HELX_P HELX_P43 43 GLU N 81 ? TYR N 86 ? GLU N 82 TYR N 87 1 ? 6 HELX_P HELX_P44 44 PHE O 11 ? ARG O 19 ? PHE O 12 ARG O 20 1 ? 9 HELX_P HELX_P45 45 ASN O 60 ? LEU O 79 ? ASN O 61 LEU O 80 1 ? 20 HELX_P HELX_P46 46 GLY O 95 ? GLU O 106 ? GLY O 96 GLU O 107 1 ? 12 HELX_P HELX_P47 47 ARG P 3 ? SER P 12 ? ARG P 3 SER P 12 1 ? 10 HELX_P HELX_P48 48 TYR P 100 ? LEU P 105 ? TYR P 100 LEU P 105 1 ? 6 HELX_P HELX_P49 49 ASP P 107 ? LEU P 114 ? ASP P 107 LEU P 114 1 ? 8 HELX_P HELX_P50 50 ASP P 117 ? LYS P 137 ? ASP P 117 LYS P 137 1 ? 21 HELX_P HELX_P51 51 VAL Q 7 ? ALA Q 20 ? VAL Q 8 ALA Q 21 1 ? 14 HELX_P HELX_P52 52 TRP Q 24 ? SER Q 30 ? TRP Q 25 SER Q 31 5 ? 7 HELX_P HELX_P53 53 ARG Q 31 ? GLY Q 71 ? ARG Q 33 GLY Q 73 1 ? 41 HELX_P HELX_P54 54 ASN Q 73 ? GLY Q 85 ? ASN Q 75 GLY Q 87 1 ? 13 HELX_P HELX_P55 55 ASN Q 92 ? VAL Q 98 ? ASN Q 94 VAL Q 100 5 ? 7 HELX_P HELX_P56 56 GLU Q 100 ? GLY Q 116 ? GLU Q 102 GLY Q 118 1 ? 17 HELX_P HELX_P57 57 SER S 13 ? ARG S 25 ? SER S 13 ARG S 25 1 ? 13 HELX_P HELX_P58 58 SER S 28 ? THR S 39 ? SER S 28 THR S 39 1 ? 12 HELX_P HELX_P59 59 ARG S 42 ? ASN S 61 ? ARG S 42 ASN S 61 1 ? 20 HELX_P HELX_P60 60 LEU S 65 ? ASP S 67 ? LEU S 65 ASP S 67 5 ? 3 HELX_P HELX_P61 61 ARG S 88 ? ARG S 92 ? ARG S 88 ARG S 92 5 ? 5 HELX_P HELX_P62 62 SER T 14 ? GLU T 23 ? SER T 14 GLU T 23 1 ? 10 HELX_P HELX_P63 63 THR T 35 ? THR T 45 ? THR T 35 THR T 45 1 ? 11 HELX_P HELX_P64 64 ILE T 89 ? GLY T 94 ? ILE T 89 GLY T 94 1 ? 6 HELX_P HELX_P65 65 LYS V 14 ? GLY V 22 ? LYS V 14 GLY V 22 1 ? 9 HELX_P HELX_P66 66 LEU V 41 ? SER V 52 ? LEU V 41 SER V 52 1 ? 12 HELX_P HELX_P67 67 PRO V 108 ? ALA V 113 ? PRO V 108 ALA V 113 1 ? 6 HELX_P HELX_P68 68 SER V 153 ? LEU V 155 ? SER V 153 LEU V 155 5 ? 3 HELX_P HELX_P69 69 ASP V 179 ? GLU V 190 ? ASP V 179 GLU V 190 1 ? 12 HELX_P HELX_P70 70 HIS X 66 ? ALA X 77 ? HIS X 66 ALA X 77 1 ? 12 HELX_P HELX_P71 71 LYS X 78 ? LEU X 80 ? LYS X 78 LEU X 80 5 ? 3 HELX_P HELX_P72 72 SER X 86 ? LEU X 94 ? SER X 86 LEU X 94 1 ? 9 HELX_P HELX_P73 73 MET Y 1 ? ALA Y 13 ? MET Y 1 ALA Y 13 1 ? 13 HELX_P HELX_P74 74 SER Y 17 ? ILE Y 41 ? SER Y 17 ILE Y 41 1 ? 25 HELX_P HELX_P75 75 HIS Y 48 ? THR Y 62 ? HIS Y 48 THR Y 62 1 ? 15 HELX_P HELX_P76 76 PRO Z 16 ? LEU Z 26 ? PRO Z 16 LEU Z 26 1 ? 11 HELX_P HELX_P77 77 THR Z 40 ? VAL Z 50 ? THR Z 40 VAL Z 50 1 ? 11 HELX_P HELX_P78 78 SER BA 11 ? ARG BA 19 ? SER 2 12 ARG 2 20 1 ? 9 HELX_P HELX_P79 79 ASN DA 8 ? GLY DA 17 ? ASN 4 8 GLY 4 17 1 ? 10 HELX_P HELX_P80 80 GLY DA 17 ? THR DA 24 ? GLY 4 17 THR 4 24 1 ? 8 HELX_P HELX_P81 81 THR DA 24 ? GLY DA 38 ? THR 4 24 GLY 4 38 1 ? 15 HELX_P HELX_P82 82 HIS EA 6 ? LYS EA 11 ? HIS 5 7 LYS 5 12 1 ? 6 HELX_P HELX_P83 83 SER EA 36 ? LYS EA 43 ? SER 5 37 LYS 5 44 1 ? 8 HELX_P HELX_P84 84 LYS EA 51 ? LYS EA 58 ? LYS 5 52 LYS 5 59 1 ? 8 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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A A 1783 A MG 2903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? metalc9 metalc ? ? A G 225 O6 ? ? ? 1_555 VB MG . MG ? ? A G 240 A MG 2934 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc10 metalc ? ? A G 760 OP1 ? ? ? 1_555 FB MG . MG ? ? A G 739 A MG 2919 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc11 metalc ? ? A C 17 "O2'" ? ? ? 1_555 BH MG . MG ? ? A C 22 A MG 3061 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc12 metalc ? ? A A 1684 OP2 ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A A 1664 A MG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.576 ? metalc13 metalc ? ? A G 806 OP2 ? ? ? 1_555 RA MG . MG ? ? A G 785 A MG 2905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? metalc14 metalc ? ? A U 1659 OP1 ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? A U 1639 A MG 2899 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc15 metalc ? ? A G 422 OP2 ? ? ? 1_555 WF MG . MG ? ? A G 399 A MG 3030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? metalc16 metalc ? ? A U 1598 OP2 ? ? ? 1_555 HG MG . MG ? ? A U 1578 A MG 3041 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc17 metalc ? ? A U 942 O4 ? ? ? 1_555 LF MG . MG ? ? A U 922 A MG 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? metalc18 metalc ? ? A C 2595 O2 ? ? ? 1_555 JC MG . MG ? ? A C 2610 A MG 2948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? metalc19 metalc ? ? A C 1347 OP2 ? ? ? 1_555 WB MG . MG ? ? A C 1327 A MG 2935 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc20 metalc ? ? A C 183 OP1 ? ? ? 1_555 GB MG . MG ? ? A C 198 A MG 2920 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.640 ? metalc21 metalc ? ? A A 1285 OP1 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? A A 1265 A MG 2913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? metalc22 metalc ? ? A U 1691 OP2 ? ? ? 1_555 GC MG . MG ? ? A U 1671 A MG 2945 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? metalc23 metalc ? ? A U 761 OP2 ? ? ? 1_555 PA MG . MG ? ? A U 740 A MG 2903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc24 metalc ? ? A C 645 OP1 ? ? ? 1_555 SF MG . MG ? ? A C 624 A MG 3026 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc25 metalc ? ? A A 2562 OP1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A A 2577 A MG 2914 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc26 metalc ? ? A G 2577 OP1 ? ? ? 1_555 FD MG . MG ? ? A G 2592 A MG 2970 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? metalc27 metalc ? ? A C 177 OP1 ? ? ? 1_555 IB MG . MG ? ? A C 192 A MG 2922 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? metalc28 metalc ? ? A A 1289 OP2 ? ? ? 1_555 CB MG . MG ? ? A A 1269 A MG 2916 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? metalc29 metalc ? ? A G 2561 OP1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A G 2576 A MG 2914 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc30 metalc ? ? A U 2069 OP1 ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? A U 2074 A MG 2907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? metalc31 metalc ? ? A G 1256 OP1 ? ? ? 1_555 EG MG . MG ? ? A G 1236 A MG 3038 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? metalc32 metalc ? ? A A 1635 "O2'" ? ? ? 1_555 CC MG . MG ? ? A A 1616 A MG 2941 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.688 ? metalc33 metalc ? ? A G 619 O6 ? ? ? 1_555 MC MG . MG ? ? A G 600 A MG 2951 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc34 metalc ? ? A G 2224 OP2 ? ? ? 1_555 TA MG . MG ? ? A G 2239 A MG 2907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc35 metalc ? ? A G 747 O6 ? ? ? 1_555 TF MG . MG ? ? A G 726 A MG 3027 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc36 metalc ? ? A C 1656 OP2 ? ? ? 1_555 FE MG . MG ? ? A C 1636 A MG 2995 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc37 metalc ? ? A C 752 OP2 ? ? ? 1_555 PB MG . MG ? ? A C 731 A MG 2929 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? metalc38 metalc ? ? A C 1834 OP2 ? ? ? 1_555 ZE MG . MG ? ? A C 1830 A MG 3014 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.702 ? metalc39 metalc ? ? B G 101 OP2 ? ? ? 1_555 VH MG . MG ? ? B G 100 B MG 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc40 metalc ? ? B G 23 OP2 ? ? ? 1_555 WH MG . MG ? ? B G 23 B MG 184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? metalc41 metalc ? ? A G 815 OP2 ? ? ? 1_555 GG MG . MG ? ? A G 794 A MG 3040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? metalc42 metalc ? ? A C 990 OP2 ? ? ? 1_555 ZB MG . MG ? ? A C 971 A MG 2938 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? metalc43 metalc ? ? A A 823 OP1 ? ? ? 1_555 JF MG . MG ? ? A A 802 A MG 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.717 ? metalc44 metalc ? ? A U 2600 OP1 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? A U 2615 A MG 2913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? metalc45 metalc ? ? E ARG 163 O ? ? ? 1_555 CF MG . MG ? ? E ARG 168 A MG 158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? metalc46 metalc ? ? A C 234 OP1 ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? A C 249 A MG 2902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? metalc47 metalc ? ? A A 1965 OP1 ? ? ? 1_555 HD MG . MG ? ? A A 1970 A MG 2971 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? metalc48 metalc ? ? A U 2537 OP2 ? ? ? 1_555 BE MG . MG ? ? A U 2552 A MG 2991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc49 metalc ? ? A G 2334 OP1 ? ? ? 1_555 FF MG . MG ? ? A G 2349 A MG 3016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.730 ? metalc50 metalc ? ? A C 2249 OP2 ? ? ? 1_555 YB MG . MG ? ? A C 2264 A MG 2937 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc51 metalc ? ? A G 2592 O6 ? ? ? 1_555 UF MG . MG ? ? A G 2607 A MG 3028 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc52 metalc ? ? A G 472 OP2 ? ? ? 1_555 KA MG . MG ? ? A G 450 A MG 2898 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc53 metalc ? ? A U 2229 OP1 ? ? ? 1_555 GB MG . MG ? ? A U 2244 A MG 2920 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.740 ? metalc54 metalc ? ? A U 1621 "O2'" ? ? ? 1_555 LG MG . MG ? ? A U 1602 A MG 3045 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.741 ? metalc55 metalc ? ? A C 2191 OP2 ? ? ? 1_555 XD MG . MG ? ? A C 2196 A MG 2987 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? metalc56 metalc ? ? A G 190 OP2 ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? A G 205 A MG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.745 ? metalc57 metalc ? ? A U 1417 O4 ? ? ? 1_555 LG MG . MG ? ? A U 1397 A MG 3045 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.745 ? metalc58 metalc ? ? A U 2832 "O2'" ? ? ? 1_555 NH MG . MG ? ? A U 2849 A MG 3073 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.745 ? metalc59 metalc ? ? A U 2522 O4 ? ? ? 1_555 QE MG . MG ? ? A U 2537 A MG 3005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc60 metalc ? ? A A 814 "O2'" ? ? ? 1_555 GG MG . MG ? ? A A 793 A MG 3040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc61 metalc ? ? A G 2802 OP1 ? ? ? 1_555 RF MG . MG ? ? A G 2819 A MG 3025 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc62 metalc ? ? A G 2568 OP1 ? ? ? 1_555 LC MG . MG ? ? A G 2583 A MG 2950 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? metalc63 metalc ? ? A G 202 OP2 ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? A G 217 A MG 2900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? metalc64 metalc ? ? A U 1539 OP2 ? ? ? 1_555 DD MG . MG ? ? A U 1520 A MG 2968 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? metalc65 metalc ? ? A U 2217 O4 ? ? ? 1_555 HF MG . MG ? ? A U 2232 A MG 3018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? metalc66 metalc ? ? A U 2012 OP1 ? ? ? 1_555 HA MG . MG ? ? A U 2017 A MG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? metalc67 metalc ? ? A A 1285 OP2 ? ? ? 1_555 ZA MG . MG ? ? A A 1265 A MG 2913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? metalc68 metalc ? ? A A 1362 OP2 ? ? ? 1_555 WE MG . MG ? ? A A 1342 A MG 3011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? metalc69 metalc ? ? A A 1306 OP2 ? ? ? 1_555 TD MG . MG ? ? A A 1286 A MG 2983 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc70 metalc ? ? A G 2064 OP2 ? ? ? 1_555 GB MG . MG ? ? A G 2069 A MG 2920 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.775 ? metalc71 metalc ? ? A G 1646 OP1 ? ? ? 1_555 ZD MG . MG ? ? A G 1627 A MG 2989 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? metalc72 metalc ? ? A A 1562 OP2 ? ? ? 1_555 VF MG . MG ? ? A A 1543 A MG 3029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? metalc73 metalc ? ? A G 677 O6 ? ? ? 1_555 MC MG . MG ? ? A G 656 A MG 2951 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? metalc74 metalc ? ? B A 102 OP2 ? ? ? 1_555 VH MG . MG ? ? B A 101 B MG 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.781 ? metalc75 metalc ? ? K SER 116 O ? ? ? 1_555 AI MG . MG ? ? K SER 116 K MG 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.786 ? metalc76 metalc ? ? A G 2274 OP1 ? ? ? 1_555 XA MG . MG ? ? A G 2289 A MG 2911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.788 ? metalc77 metalc ? ? A G 2573 OP2 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? A G 2588 A MG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.798 ? metalc78 metalc ? ? A C 1690 OP1 ? ? ? 1_555 GC MG . MG ? ? A C 1670 A MG 2945 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.798 ? metalc79 metalc ? ? A A 526 "O4'" ? ? ? 1_555 EG MG . MG ? ? A A 505 A MG 3038 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.799 ? metalc80 metalc ? ? A U 2712 OP2 ? ? ? 1_555 VE MG . MG ? ? A U 2726 A MG 3010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.800 ? metalc81 metalc ? ? A G 875 O6 ? ? ? 1_555 LF MG . MG ? ? A G 854 A MG 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.801 ? metalc82 metalc ? ? A A 964 OP1 ? ? ? 1_555 MH MG . MG ? ? A A 945 A MG 3072 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.802 ? metalc83 metalc ? ? A A 2433 OP1 ? ? ? 1_555 XG MG . MG ? ? A A 2448 A MG 3057 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? metalc84 metalc ? ? A C 1144 OP1 ? ? ? 1_555 EH MG . MG ? ? A C 1124 A MG 3064 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.810 ? metalc85 metalc ? ? A C 2560 OP2 ? ? ? 1_555 EC MG . MG ? ? A C 2575 A MG 2943 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.811 ? metalc86 metalc ? ? A C 56 OP1 ? ? ? 1_555 IC MG . MG ? ? A C 62 A MG 2947 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.811 ? metalc87 metalc ? ? A G 1641 OP2 ? ? ? 1_555 JE MG . MG ? ? A G 1622 A MG 2999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? metalc88 metalc ? ? A G 883 OP2 ? ? ? 1_555 ED MG . MG ? ? A G 862 A MG 2969 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? metalc89 metalc ? ? A G 707 OP2 ? ? ? 1_555 CE MG . MG ? ? A G 686 A MG 2992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.818 ? metalc90 metalc ? ? A A 2751 OP2 ? ? ? 1_555 EF MG . MG ? ? A A 2765 A MG 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.819 ? metalc91 metalc ? ? A G 1886 O6 ? ? ? 1_555 KE MG . MG ? ? A G 1891 A MG 3000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.820 ? metalc92 metalc ? ? A G 966 O6 ? ? ? 1_555 DE MG . MG ? ? A G 947 A MG 2993 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.820 ? metalc93 metalc ? ? A U 1693 OP1 ? ? ? 1_555 BE MG . MG ? ? A U 1673 A MG 2991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? metalc94 metalc ? ? A U 2081 O4 ? ? ? 1_555 HF MG . MG ? ? A U 2086 A MG 3018 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? metalc95 metalc ? ? A C 2483 OP2 ? ? ? 1_555 XC MG . MG ? ? A C 2498 A MG 2962 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? metalc96 metalc ? ? A A 526 "O5'" ? ? ? 1_555 EG MG . MG ? ? A A 505 A MG 3038 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.826 ? metalc97 metalc ? ? A G 1667 OP2 ? ? ? 1_555 CC MG . MG ? ? A G 1647 A MG 2941 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.828 ? metalc98 metalc ? ? A G 612 O6 ? ? ? 1_555 QB MG . MG ? ? A G 593 A MG 2930 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? metalc99 metalc ? ? A A 2526 OP2 ? ? ? 1_555 NG MG . MG ? ? A A 2541 A MG 3047 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? metalc100 metalc ? ? A A 2433 OP2 ? ? ? 1_555 XC MG . MG ? ? A A 2448 A MG 2962 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.834 ? metalc101 metalc ? ? A U 1414 "O3'" ? ? ? 1_555 LG MG . MG ? ? A U 1394 A MG 3045 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.838 ? metalc102 metalc ? ? A G 2705 OP2 ? ? ? 1_555 MB MG . MG ? ? A G 2719 A MG 2926 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.841 ? metalc103 metalc ? ? A A 2690 OP2 ? ? ? 1_555 MG MG . MG ? ? A A 2705 A MG 3046 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? metalc104 metalc ? ? A A 2411 "O2'" ? ? ? 1_555 QC MG . MG ? ? A A 2426 A MG 2955 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.851 ? metalc105 metalc ? ? A G 1491 O6 ? ? ? 1_555 DD MG . MG ? ? A G 1470 A MG 2968 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? metalc106 metalc ? ? A G 1963 OP1 ? ? ? 1_555 FD MG . MG ? ? A G 1968 A MG 2970 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? metalc107 metalc ? ? A G 1145 OP2 ? ? ? 1_555 EH MG . MG ? ? A G 1125 A MG 3064 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? metalc108 metalc ? ? A C 1315 OP1 ? ? ? 1_555 UE MG . MG ? ? A C 1295 A MG 3009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.865 ? metalc109 metalc ? ? A C 1936 OP2 ? ? ? 1_555 UB MG . MG ? ? A C 1941 A MG 2933 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc110 metalc ? ? A C 1437 OP2 ? ? ? 1_555 HG MG . MG ? ? A C 1417 A MG 3041 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.868 ? metalc111 metalc ? ? A C 751 OP2 ? ? ? 1_555 PB MG . MG ? ? A C 730 A MG 2929 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.869 ? metalc112 metalc ? ? A A 1415 "O5'" ? ? ? 1_555 LG MG . MG ? ? A A 1395 A MG 3045 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? metalc113 metalc ? ? M ILE 127 O ? ? ? 1_555 CI MG . MG ? ? M ILE 127 M MG 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.873 ? metalc114 metalc ? ? A A 1788 OP2 ? ? ? 1_555 PA MG . MG ? ? A A 1784 A MG 2903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.873 ? metalc115 metalc ? ? A U 2489 OP1 ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? A U 2504 A MG 2904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc116 metalc ? ? A C 593 OP2 ? ? ? 1_555 PE MG . MG ? ? A C 574 A MG 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.877 ? metalc117 metalc ? ? A G 813 OP2 ? ? ? 1_555 RA MG . MG ? ? A G 792 A MG 2905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.878 ? metalc118 metalc ? ? A U 982 OP1 ? ? ? 1_555 OC MG . MG ? ? A U 963 A MG 2953 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.878 ? metalc119 metalc ? ? A G 2421 O6 ? ? ? 1_555 HH MG . MG ? ? A G 2436 A MG 3067 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.883 ? metalc120 metalc ? ? A G 2517 OP1 ? ? ? 1_555 CD MG . MG ? ? A G 2532 A MG 2967 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.883 ? metalc121 metalc ? ? A A 47 OP2 ? ? ? 1_555 PF MG . MG ? ? A A 53 A MG 3023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.886 ? metalc122 metalc ? ? A C 2370 OP1 ? ? ? 1_555 XA MG . MG ? ? A C 2385 A MG 2911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.896 ? metalc123 metalc ? ? A G 2432 OP2 ? ? ? 1_555 GD MG . MG ? ? A G 2447 A MG 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.896 ? metalc124 metalc ? ? A G 1436 O6 ? ? ? 1_555 JD MG . MG ? ? A G 1416 A MG 2973 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.897 ? metalc125 metalc ? ? A G 2310 OP2 ? ? ? 1_555 FG MG . MG ? ? A G 2325 A MG 3039 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.898 ? metalc126 metalc ? ? A A 1021 OP2 ? ? ? 1_555 QD MG . MG ? ? A A 1001 A MG 2980 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.898 ? metalc127 metalc ? ? A A 451 OP1 ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? A A 428 A MG 2912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? metalc128 metalc ? ? A C 1962 OP1 ? ? ? 1_555 YG MG . MG ? ? A C 1967 A MG 3058 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.906 ? metalc129 metalc ? ? A U 2422 O4 ? ? ? 1_555 HH MG . MG ? ? A U 2437 A MG 3067 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? metalc130 metalc ? ? A G 2498 O6 ? ? ? 1_555 GH MG . MG ? ? A G 2513 A MG 3066 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? metalc131 metalc ? ? A A 1208 OP2 ? ? ? 1_555 UA MG . MG ? ? A A 1189 A MG 2908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.912 ? metalc132 metalc ? ? A A 882 OP1 ? ? ? 1_555 ED MG . MG ? ? A A 861 A MG 2969 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.912 ? metalc133 metalc ? ? A A 594 "O3'" ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? A A 575 A MG 2904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc134 metalc ? ? A G 766 O6 ? ? ? 1_555 OD MG . MG ? ? A G 745 A MG 2978 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? metalc135 metalc ? ? A G 381 OP1 ? ? ? 1_555 ID MG . MG ? ? A G 361 A MG 2972 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.917 ? metalc136 metalc ? ? A A 2254 OP1 ? ? ? 1_555 JG MG . MG ? ? A A 2269 A MG 3043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.920 ? metalc137 metalc ? ? A U 2087 O4 ? ? ? 1_555 RB MG . MG ? ? A U 2092 A MG 2931 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc138 metalc ? ? A U 2230 O4 ? ? ? 1_555 HH MG . MG ? ? A U 2245 A MG 3067 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.924 ? metalc139 metalc ? ? A A 2587 "O3'" ? ? ? 1_555 VG MG . MG ? ? A A 2602 A MG 3055 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.929 ? metalc140 metalc ? ? A G 2490 O6 ? ? ? 1_555 JC MG . MG ? ? A G 2505 A MG 2948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.930 ? metalc141 metalc ? ? A U 1837 OP1 ? ? ? 1_555 CG MG . MG ? ? A U 1833 A MG 3036 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.933 ? metalc142 metalc ? ? A U 1621 O4 ? ? ? 1_555 WE MG . MG ? ? A U 1602 A MG 3011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? metalc143 metalc ? ? A G 2593 O6 ? ? ? 1_555 UF MG . MG ? ? A G 2608 A MG 3028 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.942 ? metalc144 metalc ? ? A A 1966 OP1 ? ? ? 1_555 HD MG . MG ? ? A A 1971 A MG 2971 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.942 ? metalc145 metalc ? ? A A 2009 OP1 ? ? ? 1_555 GE MG . MG ? ? A A 2014 A MG 2996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc146 metalc ? ? A G 781 OP1 ? ? ? 1_555 SE MG . MG ? ? A G 760 A MG 3007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? metalc147 metalc ? ? A C 1563 OP2 ? ? ? 1_555 VF MG . MG ? ? A C 1544 A MG 3029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.948 ? metalc148 metalc ? ? A G 796 "O2'" ? ? ? 1_555 GG MG . MG ? ? A G 775 A MG 3040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.949 ? metalc149 metalc ? ? A A 1885 OP2 ? ? ? 1_555 KE MG . MG ? ? A A 1890 A MG 3000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.951 ? metalc150 metalc ? ? A G 769 OP2 ? ? ? 1_555 HC MG . MG ? ? A G 748 A MG 2946 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.954 ? metalc151 metalc ? ? A A 691 "O2'" ? ? ? 1_555 WC MG . MG ? ? A A 670 A MG 2961 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.956 ? metalc152 metalc ? ? A U 988 O4 ? ? ? 1_555 DE MG . MG ? ? A U 969 A MG 2993 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.958 ? metalc153 metalc ? ? A A 1932 OP1 ? ? ? 1_555 OE MG . MG ? ? A A 1937 A MG 3004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.959 ? metalc154 metalc ? ? A A 2057 OP2 ? ? ? 1_555 JB MG . MG ? ? A A 2062 A MG 2923 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.959 ? metalc155 metalc ? ? A G 1305 O6 ? ? ? 1_555 NB MG . MG ? ? A G 1285 A MG 2927 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.963 ? metalc156 metalc ? ? A G 2030 OP1 ? ? ? 1_555 TB MG . MG ? ? A G 2035 A MG 2932 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.964 ? metalc157 metalc ? ? A G 1987 OP2 ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A G 1992 A MG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.965 ? metalc158 metalc ? ? A U 2391 OP1 ? ? ? 1_555 YF MG . MG ? ? A U 2406 A MG 3032 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.966 ? metalc159 metalc ? ? A C 2002 OP1 ? ? ? 1_555 DG MG . MG ? ? A C 2007 A MG 3037 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.967 ? metalc160 metalc ? ? A C 238 OP1 ? ? ? 1_555 XE MG . MG ? ? A C 253 A MG 3012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.970 ? metalc161 metalc ? ? A C 1584 "O2'" ? ? ? 1_555 KF MG . MG ? ? A C 1564 A MG 167 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.970 ? metalc162 metalc ? ? A A 2762 OP2 ? ? ? 1_555 KH MG . MG ? ? A A 2776 A MG 3070 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.971 ? metalc163 metalc ? ? A G 728 O6 ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? A G 707 A MG 2909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? metalc164 metalc ? ? A G 582 OP1 ? ? ? 1_555 FC MG . MG ? ? A G 563 A MG 2944 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.980 ? metalc165 metalc ? ? A G 2694 O6 ? ? ? 1_555 SG MG . MG ? ? A G 2709 A MG 3052 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.986 ? metalc166 metalc ? ? A C 699 OP1 ? ? ? 1_555 IG MG . MG ? ? A C 678 A MG 3042 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.990 ? metalc167 metalc ? ? A G 491 OP2 ? ? ? 1_555 PG MG . MG ? ? A G 469 A MG 3049 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.997 ? hydrog1 hydrog ? ? A A 1 N6 ? ? ? 1_555 A U 2879 O4 ? ? A A 6 A U 2897 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-U PAIR' ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 2 N1 ? ? ? 1_555 A C 2878 N3 ? ? A G 7 A C 2896 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 2 N2 ? ? ? 1_555 A C 2878 O2 ? ? A G 7 A C 2896 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 2 O6 ? ? ? 1_555 A C 2878 N4 ? ? A G 7 A C 2896 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog5 hydrog ? ? A A 3 N1 ? ? ? 1_555 A U 2877 N3 ? ? A A 8 A U 2895 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? A A 3 N6 ? ? ? 1_555 A U 2877 O4 ? ? A A 8 A U 2895 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog7 hydrog ? ? A A 8 N3 ? ? ? 1_555 A A 9 N6 ? ? A A 13 A A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? hydrog8 hydrog ? ? A G 10 N1 ? ? ? 1_555 A U 546 O2 ? ? A G 15 A U 525 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog9 hydrog ? ? A G 10 O6 ? ? ? 1_555 A U 546 N3 ? ? A G 15 A U 525 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog10 hydrog ? ? A G 11 N1 ? ? ? 1_555 A U 545 O2 ? ? A G 16 A U 524 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog11 hydrog ? ? A G 11 O6 ? ? ? 1_555 A U 545 N3 ? ? A G 16 A U 524 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog12 hydrog ? ? A G 12 N1 ? ? ? 1_555 A C 544 N3 ? ? A G 17 A C 523 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog13 hydrog ? ? A G 12 N2 ? ? ? 1_555 A C 544 O2 ? ? A G 17 A C 523 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog14 hydrog ? ? A G 12 O6 ? ? ? 1_555 A C 544 N4 ? ? A G 17 A C 523 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog15 hydrog ? ? A C 13 N3 ? ? ? 1_555 A G 543 N1 ? ? A C 18 A G 522 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog16 hydrog ? ? A C 13 N4 ? ? ? 1_555 A G 543 O6 ? ? A C 18 A G 522 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog17 hydrog ? ? A C 13 O2 ? ? ? 1_555 A G 543 N2 ? ? A C 18 A G 522 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog18 hydrog ? ? A C 14 N3 ? ? ? 1_555 A G 542 N1 ? ? A C 19 A G 521 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog19 hydrog ? ? A C 14 N4 ? ? ? 1_555 A G 542 O6 ? ? A C 19 A G 521 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog20 hydrog ? ? A C 14 O2 ? ? ? 1_555 A G 542 N2 ? ? A C 19 A G 521 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog21 hydrog ? ? A C 14 N3 ? ? ? 1_555 A G 543 N1 ? ? A C 19 A G 522 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog22 hydrog ? ? A C 14 N4 ? ? ? 1_555 A G 543 O6 ? ? 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WATSON-CRICK ? ? hydrog32 hydrog ? ? A G 18 O6 ? ? ? 1_555 A C 538 N4 ? ? A G 23 A C 517 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog33 hydrog ? ? A G 19 N1 ? ? ? 1_555 A C 537 N3 ? ? A G 24 A C 516 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog34 hydrog ? ? A U 20 O2 ? ? ? 1_555 A A 536 N6 ? ? A U 25 A A 515 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog35 hydrog ? ? A G 21 N2 ? ? ? 1_555 A A 535 N7 ? ? A G 26 A A 514 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog36 hydrog ? ? A G 21 N3 ? ? ? 1_555 A A 535 N6 ? ? A G 26 A A 514 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog37 hydrog ? ? A G 22 N2 ? ? ? 1_555 A A 534 N7 ? ? A G 27 A A 513 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog38 hydrog ? ? A A 23 N6 ? ? ? 1_555 A G 533 N3 ? ? A A 28 A G 512 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? hydrog39 hydrog ? ? A U 24 N3 ? ? ? 1_555 A U 532 O2 ? ? A U 29 A U 511 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? hydrog40 hydrog ? ? A U 24 O4 ? ? ? 1_555 A U 532 N3 ? ? A U 29 A U 511 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_16_PAIR ? ? hydrog41 hydrog ? ? 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B G 76 N2 ? ? ? 1_555 B A 102 N1 ? ? B G 76 B A 101 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog2928 hydrog ? ? B U 77 N3 ? ? ? 1_555 B A 100 N7 ? ? B U 77 B A 99 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? hydrog2929 hydrog ? ? B U 77 O2 ? ? ? 1_555 B A 100 N6 ? ? B U 77 B A 99 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? hydrog2930 hydrog ? ? B A 78 N6 ? ? ? 1_555 B G 99 N3 ? ? B A 78 B G 98 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog2931 hydrog ? ? B A 78 N7 ? ? ? 1_555 B G 99 N2 ? ? B A 78 B G 98 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog2932 hydrog ? ? B C 79 N3 ? ? ? 1_555 B G 98 N1 ? ? B C 79 B G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog2933 hydrog ? ? B C 79 N4 ? ? ? 1_555 B G 98 O6 ? ? B C 79 B G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog2934 hydrog ? ? B C 79 O2 ? ? ? 1_555 B G 98 N2 ? ? B C 79 B G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog2935 hydrog ? ? B U 80 N3 ? ? ? 1_555 B G 97 O6 ? ? B U 80 B G 96 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog2936 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 146 D . ? THR 146 D PRO 147 D ? PRO 147 D 1 3.06 2 GLY 124 J . ? GLY 148 J PRO 125 J ? PRO 149 J 1 0.25 3 ASP 47 L . ? ASP 47 L PRO 48 L ? 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THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT CAN BE FOUND IN PDB ENTRY 3MR8. ; _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 N1 A C 34 ? ? 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EA GLU 64 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 3MS1 'double helix' 3MS1 'a-form double helix' 3MS1 'parallel strands' 3MS1 'hairpin loop' 3MS1 tetraloop 3MS1 'bulge loop' 3MS1 'mismatched base pair' 3MS1 'internal loop' 3MS1 'triple helix' 3MS1 'quadruple helix' 3MS1 'three-way junction' 3MS1 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A A 1 1_555 A U 2879 1_555 -0.331 0.556 -0.208 -8.531 -7.835 -9.916 1 A_A6:U2897_A A 6 ? 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