data_3NZJ # _entry.id 3NZJ # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.381 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 3NZJ pdb_00003nzj 10.2210/pdb3nzj/pdb RCSB RCSB060475 ? ? WWPDB D_1000060475 ? ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.content_type PDB 1JD2 'Crystal structure of the yeast 20S proteasome in complex with the natural product TMC-95A' unspecified PDB 1RYP 'Crystal structure of the native yeast 20S proteasome' unspecified PDB 3NZW 'Crystal structure of the yeast 20S proteasome in complex with ligand TMC-95A mimic 2b' unspecified PDB 3NZX 'Crystal structure of the yeast 20S proteasome in complex with ligand TMC-95A mimic 2c' unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 3NZJ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2010-07-16 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Groll, M.' 1 'Gallastegui, N.' 2 'Marechal, X.' 3 'Le Ravalec, V.' 4 'Basse, N.' 5 'Richy, N.' 6 'Genin, E.' 7 'Huber, R.' 8 'Moroder, M.' 9 'Vidal, V.' 10 'Reboud-Ravaux, M.' 11 # _citation.id primary _citation.title '20S proteasome inhibition: designing noncovalent linear peptide mimics of the natural product TMC-95A.' _citation.journal_abbrev Chemmedchem _citation.journal_volume 5 _citation.page_first 1701 _citation.page_last 1705 _citation.year 2010 _citation.journal_id_ASTM ? _citation.country DE _citation.journal_id_ISSN 1860-7179 _citation.journal_id_CSD ? _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 20715286 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1002/cmdc.201000293 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Groll, M.' 1 ? primary 'Gallastegui, N.' 2 ? primary 'Marechal, X.' 3 ? primary 'Le Ravalec, V.' 4 ? primary 'Basse, N.' 5 ? primary 'Richy, N.' 6 ? primary 'Genin, E.' 7 ? primary 'Huber, R.' 8 ? primary 'Moroder, L.' 9 ? primary 'Vidal, J.' 10 ? primary 'Reboud-Ravaux, M.' 11 ? # _cell.entry_id 3NZJ _cell.length_a 136.480 _cell.length_b 301.130 _cell.length_c 145.370 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 113.57 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 3NZJ _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Proteasome component Y7' 27191.828 2 3.4.25.1 ? ? ? 2 polymer nat 'Proteasome component Y13' 28748.230 2 3.4.25.1 ? ? ? 3 polymer nat 'Proteasome component PRE6' 28478.111 2 3.4.25.1 ? ? ? 4 polymer nat 'Proteasome component PUP2' 28649.086 2 3.4.25.1 ? ? ? 5 polymer nat 'Proteasome component PRE5' 25634.000 2 3.4.25.1 ? ? ? 6 polymer nat 'Proteasome component C1' 31575.068 2 3.4.25.1 ? ? ? 7 polymer nat 'Proteasome component C7-alpha' 28033.830 2 3.4.25.1 ? ? ? 8 polymer nat 'Proteasome component PUP1' 28299.889 2 3.4.25.1 ? ? ? 9 polymer nat 'Proteasome component PUP3' 22627.842 2 3.4.25.1 ? ? ? 10 polymer nat 'Proteasome component C11' 22545.676 2 3.4.25.1 ? ? ? 11 polymer nat 'Proteasome component PRE2' 31670.539 2 3.4.25.1 ? ? ? 12 polymer nat 'Proteasome component C5' 26905.076 2 3.4.25.1 ? ? ? 13 polymer nat 'Proteasome component PRE4' 29471.289 2 3.4.25.1 ? ? ? 14 polymer nat 'Proteasome component PRE3' 23573.604 2 3.4.25.1 ? ? ? 15 polymer syn 'TMC-95A mimic ligand 2a' 733.852 2 ? ? ? ? 16 non-polymer syn '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' 195.237 2 ? ? ? ? 17 water nat water 18.015 1336 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Macropain subunit Y7, Multicatalytic endopeptidase complex subunit Y7, Proteinase YSCE subunit 7' 2 'Macropain subunit Y13, Multicatalytic endopeptidase complex subunit Y13, Proteinase YSCE subunit 13' 3 'Macropain subunit PRE6, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE6, Proteinase YSCE subunit PRE6' 4 'Macropain subunit PUP2, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP2, Proteinase YSCE subunit PUP2' 5 'Macropain subunit PRE5, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE5, Proteinase YSCE subunit PRE5' 6 'Macropain subunit C1, Multicatalytic endopeptidase complex subunit C1, Proteinase YSCE subunit 1' 7 ;Macropain subunit C7-alpha, Multicatalytic endopeptidase complex C7, Proteasome component Y8, Proteinase YSCE subunit 7, SCL1 suppressor protein ; 8 'Macropain subunit PUP1, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP1, Proteinase YSCE subunit PUP1' 9 'Macropain subunit PUP3, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP3' 10 'Macropain subunit C11, Multicatalytic endopeptidase complex subunit C11, Proteinase YSCE subunit 11' 11 'Macropain subunit PRE2, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE2, Proteinase YSCE subunit PRE2' 12 'Multicatalytic endopeptidase complex subunit C5' 13 'Macropain subunit PRE4, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE4, Proteinase YSCE subunit PRE4' 14 'Macropain subunit PRE3, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE3, Proteinase YSCE subunit PRE3' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGP DYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWK ATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTS QEINDRLEAL ; ;MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGP DYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWK ATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTS QEINDRLEAL ; A,O ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGL TADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGW KAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILV KTGITKKDEDEEADEDMK ; ;MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGL TADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGW KAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILV KTGITKKDEDEEADEDMK ; B,P ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNA DSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWS AQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEK QEQQEQDKKKKSNH ; ;MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNA DSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWS AQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEK QEQQEQDKKKKSNH ; C,Q ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSG LTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEP SGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELI KELKEKEAAESPEEADVEMS ; ;MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSG LTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEP SGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELI KELKEKEAAESPEEADVEMS ; D,R ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPD ARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTA IGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; ;MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPD ARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTA IGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; E,S ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSG LIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGY KGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAI DFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE ; ;MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSG LIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGY KGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAI DFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE ; F,T ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIG MVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPA GYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAEN IEERLVAIAEQD ; ;MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIG MVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPA GYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAEN IEERLVAIAEQD ; G,U ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MAGLSFDNYQRNNFLAENSHTQPKATSTGTTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAAD TEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGS LAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTA VLKESIVNICDIQEEQVDITA ; ;MAGLSFDNYQRNNFLAENSHTQPKATSTGTTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAAD TEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGS LAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTA VLKESIVNICDIQEEQVDITA ; H,V ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEER AIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEP EDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD ; ;MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEER AIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEP EDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD ; I,W ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAV SSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFSLLDHHYRPDMTTEEGLDL LKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ ; ;MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAV SSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFSLLDHHYRPDMTTEEGLDL LKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ ; J,X ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MQAIADSFSVPNRLVKELQYDNEQNLESDFVTGASQFQRLAPSLTVPPIASPQQFLRAHTDDSRNPDCKIKIAHGTTTLA FRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSN LVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAA HRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG ; ;MQAIADSFSVPNRLVKELQYDNEQNLESDFVTGASQFQRLAPSLTVPPIASPQQFLRAHTDDSRNPDCKIKIAHGTTTLA FRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSN LVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAA HRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG ; K,Y ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MATIASEYSSEASNTPIEHQFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADG DALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGA AASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKR D ; ;MATIASEYSSEASNTPIEHQFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADG DALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGA AASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKR D ; L,Z ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MNHDPFSWGRPADSTYGAYNTQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGD NTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFL RYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLT FKKNLQVENMKWDFAKDIKGYGTQKI ; ;MNHDPFSWGRPADSTYGAYNTQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGD NTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFL RYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLT FKKNLQVENMKWDFAKDIKGYGTQKI ; M,1 ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MNGIQVDINRLKKGEVSLGTSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQY HLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKN FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; ;MNGIQVDINRLKKGEVSLGTSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQY HLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKN FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; N,2 ? 15 'polypeptide(L)' no yes '(BOC)(TY5)A(TRO)(ABN)' XYAWX 3,4 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 THR n 1 3 ASP n 1 4 ARG n 1 5 TYR n 1 6 SER n 1 7 PHE n 1 8 SER n 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FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; 1 ? 15 PDB 3NZJ 3NZJ 15 '(BOC)(TY5)A(TRO)(ABN)' 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3NZJ A 1 ? 250 ? 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O N N 1 ? P N N 2 ? Q N N 3 ? R N N 4 ? S N N 5 ? T N N 6 ? U N N 7 ? V N N 8 ? W N N 9 ? X N N 10 ? Y N N 11 ? Z N N 12 ? AA N N 13 ? BA N N 14 ? CA N N 15 ? DA N N 15 ? EA N N 16 ? FA N N 16 ? GA N N 17 ? HA N N 17 ? IA N N 17 ? JA N N 17 ? KA N N 17 ? LA N N 17 ? MA N N 17 ? NA N N 17 ? OA N N 17 ? PA N N 17 ? QA N N 17 ? RA N N 17 ? SA N N 17 ? TA N N 17 ? UA N N 17 ? VA N N 17 ? WA N N 17 ? XA N N 17 ? YA N N 17 ? ZA N N 17 ? AB N N 17 ? BB N N 17 ? CB N N 17 ? DB N N 17 ? EB N N 17 ? FB N N 17 ? GB N N 17 ? HB N N 17 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;The asymmetric unit contains the dimeric 20S proteasome, composed of 28 subunits with 7 different alpha- and seven different beta-type subunits ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 LEU A 18 ? GLY A 31 ? LEU A 21 GLY A 34 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 2 MET A 57 ? LEU A 61 ? MET A 60 LEU A 64 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 3 MET A 78 ? SER A 96 ? 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DA TRO 4 C ? ? ? 1_555 DA ABN 5 N ? ? 4 TRO 4 4 ABN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.361 sing ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 5 ? B ? 5 ? C ? 6 ? D ? 5 ? E ? 5 ? F ? 5 ? G ? 5 ? H ? 5 ? I ? 5 ? J ? 5 ? K ? 5 ? L ? 5 ? M ? 5 ? N ? 5 ? O ? 5 ? P ? 2 ? Q ? 5 ? R ? 6 ? S ? 2 ? T ? 5 ? U ? 5 ? V ? 2 ? W ? 5 ? X ? 5 ? Y ? 2 ? Z ? 4 ? AA ? 5 ? AB ? 5 ? AC ? 2 ? AD ? 5 ? AE ? 5 ? AF ? 7 ? AG ? 5 ? AH ? 5 ? AI ? 2 ? AJ ? 5 ? AK ? 5 ? AL ? 6 ? AM ? 5 ? AN ? 6 ? AO ? 5 ? AP ? 5 ? AQ ? 5 ? AR ? 5 ? AS ? 5 ? AT ? 5 ? AU ? 5 ? AV ? 5 ? AW ? 5 ? AX ? 5 ? AY ? 5 ? AZ ? 2 ? BA ? 5 ? BB ? 6 ? BC ? 2 ? BD ? 5 ? BE ? 5 ? BF ? 2 ? BG ? 5 ? BH ? 5 ? BI ? 2 ? BJ ? 5 ? BK ? 5 ? BL ? 2 ? BM ? 5 ? BN ? 5 ? BO ? 7 ? BP ? 5 ? BQ ? 5 ? BR ? 2 ? 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anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel J 4 5 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? anti-parallel L 3 4 ? anti-parallel L 4 5 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel M 4 5 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel N 4 5 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel O 3 4 ? anti-parallel O 4 5 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel Q 4 5 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel R 4 5 ? anti-parallel R 5 6 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? anti-parallel T 4 5 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? anti-parallel U 4 5 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel W 2 3 ? anti-parallel W 3 4 ? anti-parallel W 4 5 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel X 2 3 ? anti-parallel X 3 4 ? anti-parallel X 4 5 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel Z 2 3 ? anti-parallel Z 3 4 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AA 3 4 ? anti-parallel AA 4 5 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? anti-parallel AB 3 4 ? anti-parallel AB 4 5 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? anti-parallel AD 3 4 ? anti-parallel AD 4 5 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel AE 2 3 ? anti-parallel AE 3 4 ? anti-parallel AE 4 5 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AF 2 3 ? anti-parallel AF 3 4 ? anti-parallel AF 4 5 ? anti-parallel AF 5 6 ? anti-parallel AF 6 7 ? anti-parallel AG 1 2 ? anti-parallel AG 2 3 ? anti-parallel AG 3 4 ? anti-parallel AG 4 5 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AH 2 3 ? anti-parallel AH 3 4 ? anti-parallel AH 4 5 ? anti-parallel AI 1 2 ? anti-parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AJ 3 4 ? anti-parallel AJ 4 5 ? anti-parallel AK 1 2 ? anti-parallel AK 2 3 ? anti-parallel AK 3 4 ? anti-parallel AK 4 5 ? anti-parallel AL 1 2 ? anti-parallel AL 2 3 ? anti-parallel AL 3 4 ? anti-parallel AL 4 5 ? anti-parallel AL 5 6 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AM 2 3 ? anti-parallel AM 3 4 ? anti-parallel AM 4 5 ? anti-parallel AN 1 2 ? parallel AN 2 3 ? anti-parallel AN 3 4 ? anti-parallel AN 4 5 ? anti-parallel AN 5 6 ? anti-parallel AO 1 2 ? anti-parallel AO 2 3 ? anti-parallel AO 3 4 ? anti-parallel AO 4 5 ? anti-parallel AP 1 2 ? anti-parallel AP 2 3 ? anti-parallel AP 3 4 ? anti-parallel AP 4 5 ? anti-parallel AQ 1 2 ? anti-parallel AQ 2 3 ? anti-parallel AQ 3 4 ? anti-parallel AQ 4 5 ? anti-parallel AR 1 2 ? anti-parallel AR 2 3 ? anti-parallel AR 3 4 ? anti-parallel AR 4 5 ? anti-parallel AS 1 2 ? anti-parallel AS 2 3 ? anti-parallel AS 3 4 ? anti-parallel AS 4 5 ? anti-parallel AT 1 2 ? anti-parallel AT 2 3 ? anti-parallel AT 3 4 ? anti-parallel AT 4 5 ? anti-parallel AU 1 2 ? anti-parallel AU 2 3 ? anti-parallel AU 3 4 ? anti-parallel AU 4 5 ? anti-parallel AV 1 2 ? anti-parallel AV 2 3 ? anti-parallel AV 3 4 ? anti-parallel AV 4 5 ? anti-parallel AW 1 2 ? anti-parallel AW 2 3 ? anti-parallel AW 3 4 ? anti-parallel AW 4 5 ? anti-parallel AX 1 2 ? anti-parallel AX 2 3 ? anti-parallel AX 3 4 ? anti-parallel AX 4 5 ? anti-parallel AY 1 2 ? anti-parallel AY 2 3 ? anti-parallel AY 3 4 ? anti-parallel AY 4 5 ? anti-parallel AZ 1 2 ? anti-parallel BA 1 2 ? anti-parallel BA 2 3 ? anti-parallel BA 3 4 ? anti-parallel BA 4 5 ? anti-parallel BB 1 2 ? anti-parallel BB 2 3 ? anti-parallel BB 3 4 ? anti-parallel BB 4 5 ? anti-parallel BB 5 6 ? anti-parallel BC 1 2 ? anti-parallel BD 1 2 ? anti-parallel BD 2 3 ? anti-parallel BD 3 4 ? anti-parallel BD 4 5 ? anti-parallel BE 1 2 ? anti-parallel BE 2 3 ? anti-parallel BE 3 4 ? anti-parallel BE 4 5 ? anti-parallel BF 1 2 ? anti-parallel BG 1 2 ? anti-parallel BG 2 3 ? anti-parallel BG 3 4 ? anti-parallel BG 4 5 ? anti-parallel BH 1 2 ? anti-parallel BH 2 3 ? anti-parallel BH 3 4 ? anti-parallel BH 4 5 ? anti-parallel BI 1 2 ? anti-parallel BJ 1 2 ? anti-parallel BJ 2 3 ? anti-parallel BJ 3 4 ? anti-parallel BJ 4 5 ? anti-parallel BK 1 2 ? anti-parallel BK 2 3 ? anti-parallel BK 3 4 ? anti-parallel BK 4 5 ? anti-parallel BL 1 2 ? anti-parallel BM 1 2 ? anti-parallel BM 2 3 ? anti-parallel BM 3 4 ? anti-parallel BM 4 5 ? anti-parallel BN 1 2 ? anti-parallel BN 2 3 ? anti-parallel BN 3 4 ? anti-parallel BN 4 5 ? anti-parallel BO 1 2 ? anti-parallel BO 2 3 ? anti-parallel BO 3 4 ? anti-parallel BO 4 5 ? anti-parallel BO 5 6 ? anti-parallel BO 6 7 ? anti-parallel BP 1 2 ? anti-parallel BP 2 3 ? anti-parallel BP 3 4 ? anti-parallel BP 4 5 ? anti-parallel BQ 1 2 ? anti-parallel BQ 2 3 ? anti-parallel BQ 3 4 ? anti-parallel BQ 4 5 ? anti-parallel BR 1 2 ? anti-parallel BS 1 2 ? anti-parallel BS 2 3 ? anti-parallel BS 3 4 ? anti-parallel BS 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 ALA A 161 ? 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1 CNS refinement . ? 2 XDS 'data reduction' . ? 3 XSCALE 'data scaling' . ? 4 CNS phasing . ? 5 # _pdbx_entry_details.entry_id 3NZJ _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ;THE ENTIRE CHAIN OF 3 OR 4 IS THE POLYMER REPRESENTATION OF THE INHIBITOR COMPOUND UNDER THE FOLLOWING IUPAC NAME, O-BENZYL-N-(TERT-BUTOXYCARBONYL)-L-TYROSYL-L-ALANYL-N-BENZYL-3-[(3S)-2-OXO-2,3-DIHYDRO-1H-INDOL-3-YL]-L-ALANINAMIDE ; _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 C 3 TY5 2 ? 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