data_3NZW # _entry.id 3NZW # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.382 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 3NZW pdb_00003nzw 10.2210/pdb3nzw/pdb RCSB RCSB060488 ? ? WWPDB D_1000060488 ? ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.content_type PDB 1JD2 'Crystal structure of the yeast 20S proteasome in complex with the natural product TMC-95A' unspecified PDB 1RYP 'Crystal structure of the native yeast 20S proteasome' unspecified PDB 3NZJ 'Crystal structure of the yeast 20S proteasome in complex with ligand TMC-95A mimic 2a' unspecified PDB 3NZX 'Crystal structure of the yeast 20S proteasome in complex with ligand TMC-95A mimic 2c' unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 3NZW _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2010-07-17 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Groll, M.' 1 'Gallastegui, N.' 2 'Marechal, X.' 3 'Le Ravalec, V.' 4 'Basse, N.' 5 'Richy, N.' 6 'Genin, E.' 7 'Huber, R.' 8 'Moroder, M.' 9 'Vidal, V.' 10 'Reboud-Ravaux, M.' 11 # _citation.id primary _citation.title '20S proteasome inhibition: designing noncovalent linear peptide mimics of the natural product TMC-95A.' _citation.journal_abbrev Chemmedchem _citation.journal_volume 5 _citation.page_first 1701 _citation.page_last 1705 _citation.year 2010 _citation.journal_id_ASTM ? _citation.country DE _citation.journal_id_ISSN 1860-7179 _citation.journal_id_CSD ? _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 20715286 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1002/cmdc.201000293 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Groll, M.' 1 ? primary 'Gallastegui, N.' 2 ? primary 'Marechal, X.' 3 ? primary 'Le Ravalec, V.' 4 ? primary 'Basse, N.' 5 ? primary 'Richy, N.' 6 ? primary 'Genin, E.' 7 ? primary 'Huber, R.' 8 ? primary 'Moroder, L.' 9 ? primary 'Vidal, J.' 10 ? primary 'Reboud-Ravaux, M.' 11 ? # _cell.entry_id 3NZW _cell.length_a 135.300 _cell.length_b 300.010 _cell.length_c 144.510 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 112.92 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 3NZW _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Proteasome component Y7' 27191.828 2 3.4.25.1 ? ? ? 2 polymer nat 'Proteasome component Y13' 28748.230 2 3.4.25.1 ? ? ? 3 polymer nat 'Proteasome component PRE6' 28478.111 2 3.4.25.1 ? ? ? 4 polymer nat 'Proteasome component PUP2' 28649.086 2 3.4.25.1 ? ? ? 5 polymer nat 'Proteasome component PRE5' 25634.000 2 3.4.25.1 ? ? ? 6 polymer nat 'Proteasome component C1' 31575.068 2 3.4.25.1 ? ? ? 7 polymer nat 'Proteasome component C7-alpha' 28033.830 2 3.4.25.1 ? ? ? 8 polymer nat 'Proteasome component PUP1' 28299.889 2 3.4.25.1 ? ? ? 9 polymer nat 'Proteasome component PUP3' 22627.842 2 3.4.25.1 ? ? ? 10 polymer nat 'Proteasome component C11' 22545.676 2 3.4.25.1 ? ? ? 11 polymer nat 'Proteasome component PRE2' 31670.539 2 3.4.25.1 ? ? ? 12 polymer nat 'Proteasome component C5' 26905.076 2 3.4.25.1 ? ? ? 13 polymer nat 'Proteasome component PRE4' 29471.289 2 3.4.25.1 ? ? ? 14 polymer nat 'Proteasome component PRE3' 23573.604 2 3.4.25.1 ? ? ? 15 polymer syn 'TMC-95A mimic ligand 2b' 749.851 2 ? ? ? ? 16 non-polymer syn '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' 195.237 2 ? ? ? ? 17 water nat water 18.015 1358 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Macropain subunit Y7, Multicatalytic endopeptidase complex subunit Y7, Proteinase YSCE subunit 7' 2 'Macropain subunit Y13, Multicatalytic endopeptidase complex subunit Y13, Proteinase YSCE subunit 13' 3 'Macropain subunit PRE6, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE6, Proteinase YSCE subunit PRE6' 4 'Macropain subunit PUP2, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP2, Proteinase YSCE subunit PUP2' 5 'Macropain subunit PRE5, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE5, Proteinase YSCE subunit PRE5' 6 'Macropain subunit C1, Multicatalytic endopeptidase complex subunit C1, Proteinase YSCE subunit 1' 7 ;Macropain subunit C7-alpha, Multicatalytic endopeptidase complex C7, Proteasome component Y8, Proteinase YSCE subunit 7, SCL1 suppressor protein ; 8 'Macropain subunit PUP1, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP1, Proteinase YSCE subunit PUP1' 9 'Macropain subunit PUP3, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PUP3' 10 'Macropain subunit C11, Multicatalytic endopeptidase complex subunit C11, Proteinase YSCE subunit 11' 11 'Macropain subunit PRE2, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE2, Proteinase YSCE subunit PRE2' 12 'Multicatalytic endopeptidase complex subunit C5' 13 'Macropain subunit PRE4, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE4, Proteinase YSCE subunit PRE4' 14 'Macropain subunit PRE3, Multicatalytic endopeptidase complex subunit PRE3, Proteinase YSCE subunit PRE3' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGP DYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWK ATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTS QEINDRLEAL ; ;MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGP DYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWK ATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTS QEINDRLEAL ; A,O ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGL TADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGW KAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILV KTGITKKDEDEEADEDMK ; ;MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGL TADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGW KAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILV KTGITKKDEDEEADEDMK ; B,P ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNA DSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWS AQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEK QEQQEQDKKKKSNH ; ;MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNA DSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWS AQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEK QEQQEQDKKKKSNH ; C,Q ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSG LTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEP SGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELI KELKEKEAAESPEEADVEMS ; ;MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSG LTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEP SGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELI KELKEKEAAESPEEADVEMS ; D,R ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPD ARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTA IGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; ;MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPD ARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTA IGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; E,S ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSG LIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGY KGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAI DFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE ; ;MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSG LIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGY KGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAI DFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE ; F,T ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIG MVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPA GYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAEN IEERLVAIAEQD ; ;MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIG MVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPA GYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAEN IEERLVAIAEQD ; G,U ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MAGLSFDNYQRNNFLAENSHTQPKATSTGTTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAAD TEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGS LAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTA VLKESIVNICDIQEEQVDITA ; ;MAGLSFDNYQRNNFLAENSHTQPKATSTGTTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAAD TEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGS LAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTA VLKESIVNICDIQEEQVDITA ; H,V ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEER AIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEP EDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD ; ;MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEER AIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEP EDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD ; I,W ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAV SSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFSLLDHHYRPDMTTEEGLDL LKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ ; ;MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAV SSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFSLLDHHYRPDMTTEEGLDL LKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ ; J,X ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MQAIADSFSVPNRLVKELQYDNEQNLESDFVTGASQFQRLAPSLTVPPIASPQQFLRAHTDDSRNPDCKIKIAHGTTTLA FRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSN LVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAA HRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG ; ;MQAIADSFSVPNRLVKELQYDNEQNLESDFVTGASQFQRLAPSLTVPPIASPQQFLRAHTDDSRNPDCKIKIAHGTTTLA FRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSN LVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAA HRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG ; K,Y ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MATIASEYSSEASNTPIEHQFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADG DALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGA AASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKR D ; ;MATIASEYSSEASNTPIEHQFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADG DALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGA AASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKR D ; L,Z ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MNHDPFSWGRPADSTYGAYNTQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGD NTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFL RYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLT FKKNLQVENMKWDFAKDIKGYGTQKI ; ;MNHDPFSWGRPADSTYGAYNTQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGD NTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFL RYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLT FKKNLQVENMKWDFAKDIKGYGTQKI ; M,1 ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MNGIQVDINRLKKGEVSLGTSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQY HLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKN FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; ;MNGIQVDINRLKKGEVSLGTSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQY HLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKN FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; N,2 ? 15 'polypeptide(L)' no yes '(BOC)(TY5)A(RE0)(ABN)' XYAWX 3,4 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 THR n 1 3 ASP n 1 4 ARG n 1 5 TYR n 1 6 SER n 1 7 PHE n 1 8 SER n 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FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; 1 ? 15 PDB 3NZJ 3NZJ 15 '(BOC)(TY5)A(RE0)(ABN)' 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3NZW A 1 ? 250 ? 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SER 2 147 ASP 2 166 1 ? 20 HELX_P HELX_P178 178 TYR BA 208 C GLU BA 213 H TYR 2 18 GLU 2 18 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? 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DA RE0 4 C ? ? ? 1_555 DA ABN 5 N ? ? 4 RE0 4 4 ABN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.373 sing ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 5 ? B ? 5 ? C ? 6 ? D ? 5 ? E ? 5 ? F ? 5 ? G ? 5 ? H ? 5 ? I ? 5 ? J ? 5 ? K ? 5 ? L ? 5 ? M ? 5 ? N ? 5 ? O ? 5 ? P ? 2 ? Q ? 5 ? R ? 6 ? S ? 2 ? T ? 5 ? U ? 5 ? V ? 2 ? W ? 5 ? X ? 5 ? Y ? 2 ? Z ? 5 ? AA ? 5 ? AB ? 2 ? AC ? 5 ? AD ? 5 ? AE ? 7 ? AF ? 5 ? AG ? 5 ? AH ? 2 ? AI ? 5 ? AJ ? 5 ? AK ? 5 ? AL ? 6 ? AM ? 5 ? AN ? 5 ? AO ? 5 ? AP ? 5 ? AQ ? 5 ? AR ? 5 ? AS ? 5 ? AT ? 5 ? AU ? 5 ? AV ? 5 ? AW ? 5 ? AX ? 5 ? AY ? 2 ? AZ ? 5 ? BA ? 6 ? BB ? 2 ? BC ? 5 ? BD ? 5 ? BE ? 2 ? BF ? 5 ? BG ? 5 ? BH ? 2 ? BI ? 5 ? BJ ? 5 ? BK ? 2 ? BL ? 5 ? BM ? 5 ? BN ? 7 ? BO ? 5 ? BP ? 5 ? BQ ? 2 ? 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anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel J 4 5 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? anti-parallel L 3 4 ? anti-parallel L 4 5 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel M 4 5 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel N 4 5 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel O 3 4 ? anti-parallel O 4 5 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel Q 4 5 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel R 4 5 ? anti-parallel R 5 6 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? anti-parallel T 4 5 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? anti-parallel U 4 5 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel W 2 3 ? anti-parallel W 3 4 ? anti-parallel W 4 5 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel X 2 3 ? anti-parallel X 3 4 ? anti-parallel X 4 5 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel Z 2 3 ? anti-parallel Z 3 4 ? anti-parallel Z 4 5 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AA 3 4 ? anti-parallel AA 4 5 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? anti-parallel AC 4 5 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? anti-parallel AD 3 4 ? anti-parallel AD 4 5 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel AE 2 3 ? anti-parallel AE 3 4 ? anti-parallel AE 4 5 ? anti-parallel AE 5 6 ? anti-parallel AE 6 7 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AF 2 3 ? anti-parallel AF 3 4 ? anti-parallel AF 4 5 ? anti-parallel AG 1 2 ? anti-parallel AG 2 3 ? anti-parallel AG 3 4 ? anti-parallel AG 4 5 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AI 1 2 ? anti-parallel AI 2 3 ? anti-parallel AI 3 4 ? anti-parallel AI 4 5 ? anti-parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AJ 3 4 ? anti-parallel AJ 4 5 ? anti-parallel AK 1 2 ? anti-parallel AK 2 3 ? anti-parallel AK 3 4 ? anti-parallel AK 4 5 ? anti-parallel AL 1 2 ? parallel AL 2 3 ? anti-parallel AL 3 4 ? anti-parallel AL 4 5 ? anti-parallel AL 5 6 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AM 2 3 ? anti-parallel AM 3 4 ? anti-parallel AM 4 5 ? anti-parallel AN 1 2 ? anti-parallel AN 2 3 ? anti-parallel AN 3 4 ? anti-parallel AN 4 5 ? anti-parallel AO 1 2 ? anti-parallel AO 2 3 ? anti-parallel AO 3 4 ? anti-parallel AO 4 5 ? anti-parallel AP 1 2 ? anti-parallel AP 2 3 ? anti-parallel AP 3 4 ? anti-parallel AP 4 5 ? anti-parallel AQ 1 2 ? anti-parallel AQ 2 3 ? anti-parallel AQ 3 4 ? anti-parallel AQ 4 5 ? anti-parallel AR 1 2 ? anti-parallel AR 2 3 ? anti-parallel AR 3 4 ? anti-parallel AR 4 5 ? anti-parallel AS 1 2 ? anti-parallel AS 2 3 ? anti-parallel AS 3 4 ? anti-parallel AS 4 5 ? anti-parallel AT 1 2 ? anti-parallel AT 2 3 ? anti-parallel AT 3 4 ? anti-parallel AT 4 5 ? anti-parallel AU 1 2 ? anti-parallel AU 2 3 ? 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OA 17 HOH 25 459 459 HOH TIP I . OA 17 HOH 26 468 468 HOH TIP I . OA 17 HOH 27 479 479 HOH TIP I . OA 17 HOH 28 500 500 HOH TIP I . OA 17 HOH 29 501 501 HOH TIP I . OA 17 HOH 30 510 510 HOH TIP I . OA 17 HOH 31 550 550 HOH TIP I . OA 17 HOH 32 602 602 HOH TIP I . OA 17 HOH 33 619 619 HOH TIP I . OA 17 HOH 34 626 626 HOH TIP I . OA 17 HOH 35 627 627 HOH TIP I . OA 17 HOH 36 629 629 HOH TIP I . OA 17 HOH 37 661 661 HOH TIP I . OA 17 HOH 38 678 678 HOH TIP I . OA 17 HOH 39 681 681 HOH TIP I . OA 17 HOH 40 690 690 HOH TIP I . OA 17 HOH 41 693 693 HOH TIP I . OA 17 HOH 42 699 699 HOH TIP I . OA 17 HOH 43 732 732 HOH TIP I . OA 17 HOH 44 741 741 HOH TIP I . OA 17 HOH 45 743 743 HOH TIP I . OA 17 HOH 46 767 767 HOH TIP I . OA 17 HOH 47 793 793 HOH TIP I . OA 17 HOH 48 819 819 HOH TIP I . OA 17 HOH 49 851 851 HOH TIP I . OA 17 HOH 50 858 858 HOH TIP I . OA 17 HOH 51 863 863 HOH TIP I . OA 17 HOH 52 884 884 HOH TIP I . OA 17 HOH 53 894 894 HOH TIP I . OA 17 HOH 54 904 904 HOH TIP I . 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TRP ? # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 30-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 30 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2011-02-16 2 'Structure model' 1 1 2011-07-13 3 'Structure model' 1 2 2012-12-12 4 'Structure model' 1 3 2023-09-06 5 'Structure model' 1 4 2023-12-06 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? 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1 CNS refinement . ? 2 XDS 'data reduction' . ? 3 XSCALE 'data scaling' . ? 4 CNS phasing . ? 5 # _pdbx_entry_details.entry_id 3NZW _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ;THE ENTIRE CHAIN OF 3 OR 4 IS THE POLYMER REPRESENTATION OF THE INHIBITOR COMPOUND UNDER THE FOLLOWING IUPAC NAME, O-BENZYL-N-(TERT-BUTOXYCARBONYL)-L-TYROSYL-L-ALANYL-N-BENZYL-3-[(3R)-3-HYDROXY-2-OXO-2,3-DIHYDRO-1H-INDOL-3-YL]-L-ALANINAMIDE ; _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O J ILE 24 ? ? 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N 250 LYS OXT HXT sing N N 251 MES O1 C2 sing N N 252 MES O1 C6 sing N N 253 MES C2 C3 sing N N 254 MES C2 H21 sing N N 255 MES C2 H22 sing N N 256 MES C3 N4 sing N N 257 MES C3 H31 sing N N 258 MES C3 H32 sing N N 259 MES N4 C5 sing N N 260 MES N4 C7 sing N N 261 MES N4 HN4 sing N N 262 MES C5 C6 sing N N 263 MES C5 H51 sing N N 264 MES C5 H52 sing N N 265 MES C6 H61 sing N N 266 MES C6 H62 sing N N 267 MES C7 C8 sing N N 268 MES C7 H71 sing N N 269 MES C7 H72 sing N N 270 MES C8 S sing N N 271 MES C8 H81 sing N N 272 MES C8 H82 sing N N 273 MES S O1S doub N N 274 MES S O2S doub N N 275 MES S O3S sing N N 276 MET N CA sing N N 277 MET N H sing N N 278 MET N H2 sing N N 279 MET CA C sing N N 280 MET CA CB sing N N 281 MET CA HA sing N N 282 MET C O doub N N 283 MET C OXT sing N N 284 MET CB CG sing N N 285 MET CB HB2 sing N N 286 MET CB HB3 sing N N 287 MET CG SD sing N N 288 MET CG HG2 sing N N 289 MET CG HG3 sing N N 290 MET SD CE sing N N 291 MET CE HE1 sing N N 292 MET CE HE2 sing 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