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'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.entry_id 3OHD _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100.0 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC QUANTUM 315' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2010-03-10 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.979490 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'APS BEAMLINE 24-ID-C' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site APS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 24-ID-C _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 0.979490 # _reflns.entry_id 3OHD _reflns.observed_criterion_sigma_I -3.0 _reflns.observed_criterion_sigma_F -3.0 _reflns.d_resolution_low 50.0 _reflns.d_resolution_high 3.00 _reflns.number_obs 1153494 _reflns.number_all 1155735 _reflns.percent_possible_obs 0.998 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs .267 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 8.08 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy ? _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 # loop_ _reflns_shell.d_res_high _reflns_shell.d_res_low _reflns_shell.percent_possible_all _reflns_shell.Rmerge_I_obs _reflns_shell.pdbx_Rsym_value _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs _reflns_shell.pdbx_redundancy _reflns_shell.percent_possible_obs _reflns_shell.number_unique_all _reflns_shell.number_measured_all _reflns_shell.number_measured_obs _reflns_shell.number_unique_obs _reflns_shell.pdbx_chi_squared _reflns_shell.pdbx_diffrn_id _reflns_shell.pdbx_ordinal 3.00 3.08 98.1 1.84 ? 0.89 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 3.16 3.25 100.0 0.891 ? 1.79 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 # _refine.entry_id 3OHD _refine.ls_number_reflns_obs 1076336 _refine.ls_number_reflns_all 1155363 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.00 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 49.61 _refine.ls_d_res_high 3.00 _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all 0.2446 _refine.ls_R_factor_R_work 0.2428 _refine.ls_R_factor_R_free 0.2779 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free 53887 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 19090 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 32329 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 52 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 51471 _refine_hist.d_res_high 3.00 _refine_hist.d_res_low 49.61 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function f_bond_d 0.009 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_angle_deg 1.110 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.number_reflns_obs _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs _refine_ls_shell.pdbx_refine_id . 3.00 3.03 . 0.4226 . 0.4403 . . 1352 . . 25625 . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.11 3.15 . 0.3442 . 0.3787 . . 1534 . . 30096 . 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 3OHD _struct.title ;Structure of the Thermus thermophilus ribosome complexed with erythromycin. This file contains the 30S subunit of one 70S ribosome. The entire crystal structure contains two 70S ribosomes. ; _struct.pdbx_descriptor 'PROTEIN/RNA Complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3OHD _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME/ANTIBIOTIC _struct_keywords.text 'Ribosome, Protein synthesis, Erythromycin, RIBOSOME-ANTIBIOTIC complex' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 22 ? X N N 22 ? Y N N 22 ? Z N N 22 ? AA N N 22 ? BA N N 22 ? CA N N 22 ? DA N N 22 ? EA N N 22 ? FA N N 22 ? GA N N 22 ? HA N N 22 ? IA N N 22 ? JA N N 22 ? KA N N 22 ? LA N N 22 ? MA N N 22 ? NA N N 22 ? OA N N 22 ? PA N N 22 ? QA N N 22 ? RA N N 22 ? SA N N 22 ? TA N N 22 ? UA N N 22 ? VA N N 22 ? WA N N 22 ? XA N N 22 ? YA N N 22 ? ZA N N 22 ? AB N N 22 ? BB N N 22 ? CB N N 22 ? DB N N 22 ? EB N N 22 ? FB N N 22 ? GB N N 22 ? HB N N 22 ? IB N N 22 ? JB N N 22 ? KB N N 22 ? LB N N 22 ? MB N N 22 ? NB N N 22 ? OB N N 22 ? PB N N 22 ? QB N N 22 ? RB N N 22 ? SB N N 22 ? TB N N 23 ? UB N N 23 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;Each asymmetric unit contains two 70S ribosomes, each of which is composed of one 30S subunit and one 50S subunit. This file contains the 30S subunit for the second 70S ribosome in the asymmetric unit. ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 VAL B 7 ? HIS B 16 ? VAL B 7 HIS B 16 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 2 ASN B 25 ? ARG B 30 ? ASN B 25 ARG B 30 5 ? 6 HELX_P HELX_P3 3 GLU B 35 ? ILE B 39 ? GLU B 35 ILE B 39 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 4 ASP B 43 ? MET B 63 ? ASP B 43 MET B 63 1 ? 21 HELX_P HELX_P5 5 LYS B 74 ? ALA B 77 ? LYS B 74 ALA B 77 5 ? 4 HELX_P HELX_P6 6 GLN B 78 ? ARG B 87 ? GLN B 78 ARG B 87 1 ? 10 HELX_P HELX_P7 7 ASN B 104 ? HIS B 113 ? ASN B 104 HIS B 113 1 ? 10 HELX_P HELX_P8 8 ARG B 114 ? ALA B 123 ? ARG B 114 ALA B 123 1 ? 10 HELX_P HELX_P9 9 PRO B 131 ? LEU B 149 ? PRO B 131 LEU B 149 1 ? 19 HELX_P HELX_P10 10 GLU B 170 ? LEU B 180 ? GLU B 170 LEU B 180 1 ? 11 HELX_P HELX_P11 11 ALA B 207 ? ILE B 223 ? ALA B 207 ILE B 223 1 ? 17 HELX_P HELX_P12 12 HIS C 6 ? LEU C 12 ? HIS C 6 LEU C 12 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 13 TYR C 29 ? GLU C 44 ? TYR C 29 GLU C 44 1 ? 16 HELX_P HELX_P14 14 LEU C 47 ? ALA C 50 ? LEU C 47 ALA C 50 5 ? 4 HELX_P HELX_P15 15 GLU C 82 ? ALA C 92 ? GLU C 82 ALA C 92 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 16 ASN C 108 ? LEU C 111 ? ASN C 108 LEU C 111 5 ? 4 HELX_P HELX_P17 17 SER C 112 ? ARG C 126 ? SER C 112 ARG C 126 1 ? 15 HELX_P HELX_P18 18 ALA C 129 ? SER C 144 ? ALA C 129 SER C 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P19 19 ARG C 156 ? ALA C 160 ? ARG C 156 ALA C 160 5 ? 5 HELX_P HELX_P20 20 ARG D 10 ? GLU D 15 ? ARG D 10 GLU D 15 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 21 SER D 52 ? TYR D 68 ? SER D 52 TYR D 68 1 ? 17 HELX_P HELX_P22 22 SER D 71 ? LYS D 85 ? SER D 71 LYS D 85 1 ? 15 HELX_P HELX_P23 23 VAL D 88 ? ARG D 100 ? VAL D 88 ARG D 100 1 ? 13 HELX_P HELX_P24 24 ARG D 100 ? LEU D 108 ? ARG D 100 LEU D 108 1 ? 9 HELX_P HELX_P25 25 SER D 113 ? HIS D 123 ? SER D 113 HIS D 123 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 26 ALA D 149 ? ASN D 154 ? ALA D 149 ASN D 154 1 ? 6 HELX_P HELX_P27 27 LEU D 155 ? LYS D 166 ? LEU D 155 LYS D 166 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 28 ASP D 190 ? LEU D 194 ? ASP D 190 LEU D 194 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 29 ASN D 199 ? TYR D 207 ? ASN D 199 TYR D 207 1 ? 9 HELX_P HELX_P30 30 GLU E 50 ? ASN E 65 ? GLU E 50 ASN E 65 1 ? 16 HELX_P HELX_P31 31 GLY E 103 ? ALA E 113 ? GLY E 103 ALA E 113 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 32 ASN E 127 ? GLN E 141 ? ASN E 127 GLN E 141 1 ? 15 HELX_P HELX_P33 33 THR E 144 ? ARG E 150 ? THR E 144 ARG E 150 1 ? 7 HELX_P HELX_P34 34 SER F 17 ? GLY F 34 ? SER F 17 GLY F 34 1 ? 18 HELX_P HELX_P35 35 PRO F 68 ? ASP F 70 ? PRO F 68 ASP F 70 5 ? 3 HELX_P HELX_P36 36 ARG F 71 ? ILE F 81 ? ARG F 71 ILE F 81 1 ? 11 HELX_P HELX_P37 37 ASP G 20 ? MET G 31 ? ASP G 20 MET G 31 1 ? 12 HELX_P HELX_P38 38 LYS G 35 ? ILE G 49 ? LYS G 35 ILE G 49 1 ? 15 HELX_P HELX_P39 39 ILE G 49 ? THR G 54 ? ILE G 49 THR G 54 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 40 GLU G 57 ? ASN G 68 ? GLU G 57 ASN G 68 1 ? 12 HELX_P HELX_P41 41 SER G 92 ? ARG G 111 ? SER G 92 ARG G 111 1 ? 20 HELX_P HELX_P42 42 ARG G 115 ? GLY G 130 ? ARG G 115 GLY G 130 1 ? 16 HELX_P HELX_P43 43 GLY G 132 ? ASN G 148 ? GLY G 132 ASN G 148 1 ? 17 HELX_P HELX_P44 44 ARG G 149 ? ALA G 152 ? ARG G 149 ALA G 152 5 ? 4 HELX_P HELX_P45 45 ASP H 4 ? ARG H 18 ? ASP H 4 ARG H 18 1 ? 15 HELX_P HELX_P46 46 SER H 29 ? ARG H 41 ? SER H 29 ARG H 41 1 ? 13 HELX_P HELX_P47 47 THR H 120 ? GLY H 128 ? THR H 120 GLY H 128 1 ? 9 HELX_P HELX_P48 48 PHE I 33 ? PHE I 37 ? PHE I 33 PHE I 37 1 ? 5 HELX_P HELX_P49 49 ARG I 42 ? ALA I 46 ? ARG I 42 ALA I 46 5 ? 5 HELX_P HELX_P50 50 GLU I 48 ? VAL I 53 ? GLU I 48 VAL I 53 5 ? 6 HELX_P HELX_P51 51 SER I 71 ? LEU I 85 ? SER I 71 LEU I 85 1 ? 15 HELX_P HELX_P52 52 GLN J 21 ? ALA J 26 ? GLN J 21 ALA J 26 1 ? 6 HELX_P HELX_P53 53 LYS J 80 ? LEU J 85 ? LYS J 80 LEU J 85 1 ? 6 HELX_P HELX_P54 54 GLY K 46 ? ILE K 48 ? GLY K 46 ILE K 48 5 ? 3 HELX_P HELX_P55 55 THR K 57 ? ALA K 74 ? THR K 57 ALA K 74 1 ? 18 HELX_P HELX_P56 56 GLY K 90 ? LEU K 98 ? GLY K 90 LEU K 98 1 ? 9 HELX_P HELX_P57 57 LYS K 122 ? LYS K 127 ? LYS K 122 LYS K 127 1 ? 6 HELX_P HELX_P58 58 THR L 6 ? LYS L 13 ? THR L 6 LYS L 13 1 ? 8 HELX_P HELX_P59 59 ARG M 14 ? LEU M 19 ? ARG M 14 LEU M 19 1 ? 6 HELX_P HELX_P60 60 THR M 20 ? ILE M 22 ? THR M 20 ILE M 22 5 ? 3 HELX_P HELX_P61 61 VAL M 53 ? THR M 63 ? VAL M 53 THR M 63 1 ? 11 HELX_P HELX_P62 62 ALA M 72 ? LEU M 81 ? ALA M 72 LEU M 81 1 ? 10 HELX_P HELX_P63 63 LEU N 6 ? ARG N 12 ? LEU N 6 ARG N 12 1 ? 7 HELX_P HELX_P64 64 CYS N 40 ? GLY N 51 ? CYS N 40 GLY N 51 1 ? 12 HELX_P HELX_P65 65 THR O 4 ? ALA O 16 ? THR O 4 ALA O 16 1 ? 13 HELX_P HELX_P66 66 GLY O 23 ? HIS O 46 ? GLY O 23 HIS O 46 1 ? 24 HELX_P HELX_P67 67 HIS O 50 ? ASP O 74 ? HIS O 50 ASP O 74 1 ? 25 HELX_P HELX_P68 68 ASP O 74 ? GLY O 86 ? ASP O 74 GLY O 86 1 ? 13 HELX_P HELX_P69 69 ASP P 52 ? VAL P 62 ? ASP P 52 VAL P 62 1 ? 11 HELX_P HELX_P70 70 THR P 67 ? GLN P 76 ? THR P 67 GLN P 76 1 ? 10 HELX_P HELX_P71 71 ARG Q 81 ? ASN Q 94 ? ARG Q 81 ASN Q 94 1 ? 14 HELX_P HELX_P72 72 TYR Q 95 ? SER Q 99 ? TYR Q 95 SER Q 99 5 ? 5 HELX_P HELX_P73 73 ASN R 36 ? LYS R 41 ? ASN R 36 LYS R 41 1 ? 6 HELX_P HELX_P74 74 ARG R 42 ? LEU R 44 ? ARG R 42 LEU R 44 5 ? 3 HELX_P HELX_P75 75 PRO R 52 ? GLY R 57 ? PRO R 52 GLY R 57 1 ? 6 HELX_P HELX_P76 76 SER R 59 ? LEU R 76 ? SER R 59 LEU R 76 1 ? 18 HELX_P HELX_P77 77 ASP S 12 ? LEU S 20 ? ASP S 12 LEU S 20 1 ? 9 HELX_P HELX_P78 78 ALA T 12 ? GLU T 46 ? ALA T 12 GLU T 46 1 ? 35 HELX_P HELX_P79 79 ALA T 49 ? GLY T 69 ? ALA T 49 GLY T 69 1 ? 21 HELX_P HELX_P80 80 HIS T 73 ? GLU T 93 ? HIS T 73 GLU T 93 1 ? 21 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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D CYS 9 D ZN 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc10 metalc ? ? A A 556 OP2 ? ? ? 1_555 V MG . MG ? ? A A 572 A MG 1545 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.330 ? metalc11 metalc ? ? A U 582 O4 ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? A U 598 A MG 1554 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc12 metalc ? ? A G 22 OP1 ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? A G 21 A MG 1564 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc13 metalc ? ? A G 881 OP1 ? ? ? 1_555 AB MG . MG ? ? A G 903 A MG 1576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc14 metalc ? ? A A 750 OP2 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? A A 766 A MG 1553 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc15 metalc ? ? A C 562 OP1 ? ? ? 1_555 PA MG . MG ? ? A C 578 A MG 1565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc16 metalc ? ? A A 752 OP2 ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? A A 768 A MG 1547 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc17 metalc ? ? A A 493 OP2 ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? A A 509 A MG 1562 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc18 metalc ? ? A C 548 OP2 ? ? ? 1_555 PB MG . MG ? ? A C 564 A MG 1591 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc19 metalc ? ? A A 54 OP2 ? ? ? 1_555 JB MG . MG ? ? A A 53 A MG 1585 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc20 metalc ? ? A C 348 OP2 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? A C 352 A MG 1551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? metalc21 metalc ? ? A G 109 OP1 ? ? ? 1_555 SB MG . MG ? ? A G 115 A MG 1594 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? metalc22 metalc ? ? A G 551 OP2 ? ? ? 1_555 PB MG . MG ? ? A G 567 A MG 1591 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc23 metalc ? ? N CYS 40 SG ? ? ? 1_555 UB ZN . ZN ? ? N CYS 40 N ZN 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? metalc24 metalc ? ? N CYS 27 SG ? ? ? 1_555 UB ZN . ZN ? ? N CYS 27 N ZN 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? metalc25 metalc ? ? A G 1400 O6 ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? A G 1417 A MG 1552 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? metalc26 metalc ? ? N CYS 24 SG ? ? ? 1_555 UB ZN . ZN ? ? N CYS 24 N ZN 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc27 metalc ? ? A U 544 OP2 ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? 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A U 1528 A MG 1558 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc55 metalc ? ? A C 326 O2 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? A C 330 A MG 1551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.936 ? metalc56 metalc ? ? A C 1505 "O3'" ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A C 1527 A MG 1558 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.950 ? metalc57 metalc ? ? A C 801 "O2'" ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A C 817 A MG 1558 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.959 ? metalc58 metalc ? ? A G 594 O6 ? ? ? 1_555 Z MG . MG ? ? A G 610 A MG 1549 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.986 ? metalc59 metalc ? ? A U 1476 "O2'" ? ? ? 1_555 XA MG . MG ? ? A U 1498 A MG 1573 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.997 ? hydrog1 hydrog ? ? A G 10 N1 ? ? ? 1_555 A C 26 N3 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 10 N2 ? ? ? 1_555 A C 26 O2 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 10 O6 ? ? ? 1_555 A C 26 N4 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? A A 11 N1 ? ? ? 1_555 A U 25 N3 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-U PAIR' ? ? hydrog5 hydrog ? ? A G 12 N1 ? ? ? 1_555 A C 24 N3 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? A G 12 N2 ? ? ? 1_555 A C 24 O2 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog7 hydrog ? ? A G 12 O6 ? ? ? 1_555 A C 24 N4 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog8 hydrog ? ? A U 13 N3 ? ? ? 1_555 A G 23 O6 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog9 hydrog ? ? A U 13 O2 ? ? ? 1_555 A G 23 N1 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog10 hydrog ? ? A U 14 O4 ? ? ? 1_555 A U 21 N3 ? ? A U 13 A U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? hydrog11 hydrog ? ? A U 14 N3 ? ? ? 1_555 A A 893 N7 ? ? A U 13 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog12 hydrog ? ? A U 14 O4 ? ? ? 1_555 A A 893 N6 ? ? A U 13 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog13 hydrog ? ? A G 16 N1 ? ? ? 1_555 A U 898 O2 ? ? A G 15 A U 920 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog14 hydrog ? ? 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