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'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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_reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 6.89 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy ? _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 # loop_ _reflns_shell.d_res_high _reflns_shell.d_res_low _reflns_shell.percent_possible_all _reflns_shell.Rmerge_I_obs _reflns_shell.pdbx_Rsym_value _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs _reflns_shell.pdbx_redundancy _reflns_shell.percent_possible_obs _reflns_shell.number_unique_all _reflns_shell.number_measured_all _reflns_shell.number_measured_obs _reflns_shell.number_unique_obs _reflns_shell.pdbx_chi_squared _reflns_shell.pdbx_diffrn_id _reflns_shell.pdbx_ordinal 3.00 3.08 95.3 1.79 ? 0.85 ? ? ? ? ? ? ? ? 1 3.16 3.25 99.7 0.922 ? 1.68 ? ? ? ? ? ? ? ? 2 # _refine.entry_id 3OI0 _refine.ls_number_reflns_obs 1034489 _refine.ls_number_reflns_all 1166673 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.00 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 49.803 _refine.ls_d_res_high 3.00 _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all 0.2365 _refine.ls_R_factor_R_work 0.2348 _refine.ls_R_factor_R_free 0.2693 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free 51863 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 19090 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 32329 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 50 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 51469 _refine_hist.d_res_high 3.00 _refine_hist.d_res_low 49.803 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function f_bond_d 0.009 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_angle_deg 1.115 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.number_reflns_obs _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs _refine_ls_shell.pdbx_refine_id . 3.00 3.03 . 0.4122 36 0.4426 . . 680 . . 12876 . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.23 3.28 . 0.3066 100 0.3373 . . 1920 . . 36506 . 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 3OI0 _struct.title ;Structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome complexed with azithromycin. This file contains the 30S subunit of one 70S ribosome. The entire crystal structure contains two 70S ribosomes. ; _struct.pdbx_descriptor ;30S ribosomal protein S2, 30S ribosomal protein S3, 30S ribosomal protein S4, 30S ribosomal protein S5, 30S ribosomal protein S6, 30S ribosomal protein S7, 30S ribosomal protein S8, 30S ribosomal protein S9, 30S ribosomal protein S10, 30S ribosomal protein S11, 30S ribosomal protein S12, 30S ribosomal protein S13, 30S ribosomal protein S14, 30S ribosomal protein S15, 30S ribosomal protein S16, 30S ribosomal protein S17, 30S ribosomal protein S18, 30S ribosomal protein S19, 30S ribosomal protein S20, 30S ribosomal protein Thx/RNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3OI0 _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME/ANTIBIOTIC _struct_keywords.text 'Ribosome, Protein synthesis, Azithromycin, RIBOSOME-ANTIBIOTIC complex' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 22 ? X N N 22 ? Y N N 22 ? Z N N 22 ? AA N N 22 ? BA N N 22 ? CA N N 22 ? DA N N 22 ? EA N N 22 ? FA N N 22 ? GA N N 22 ? HA N N 22 ? IA N N 22 ? JA N N 22 ? KA N N 22 ? LA N N 22 ? MA N N 22 ? NA N N 22 ? OA N N 22 ? PA N N 22 ? QA N N 22 ? RA N N 22 ? SA N N 22 ? TA N N 22 ? UA N N 22 ? VA N N 22 ? WA N N 22 ? XA N N 22 ? YA N N 22 ? ZA N N 22 ? AB N N 22 ? BB N N 22 ? CB N N 22 ? DB N N 22 ? EB N N 22 ? FB N N 22 ? GB N N 22 ? HB N N 22 ? IB N N 22 ? JB N N 22 ? KB N N 22 ? LB N N 22 ? MB N N 22 ? NB N N 22 ? OB N N 22 ? PB N N 22 ? QB N N 22 ? RB N N 23 ? SB N N 23 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;The asymmetric unit contains two copies of the 70S ribosome, each of which is made up of one 30S and one 50S subunit. This file contains the 30S subunit for the second ribosome in the asymmetric unit. ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 LYS B 8 ? HIS B 16 ? LYS B 8 HIS B 16 1 ? 9 HELX_P HELX_P2 2 ASN B 25 ? ILE B 32 ? ASN B 25 ILE B 32 5 ? 8 HELX_P HELX_P3 3 ASP B 43 ? MET B 63 ? ASP B 43 MET B 63 1 ? 21 HELX_P HELX_P4 4 LYS B 74 ? ALA B 77 ? LYS B 74 ALA B 77 5 ? 4 HELX_P HELX_P5 5 GLN B 78 ? ARG B 87 ? GLN B 78 ARG B 87 1 ? 10 HELX_P HELX_P6 6 ASN B 104 ? SER B 109 ? ASN B 104 SER B 109 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 7 GLN B 110 ? VAL B 112 ? GLN B 110 VAL B 112 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 8 ARG B 114 ? ALA B 120 ? ARG B 114 ALA B 120 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 9 PRO B 131 ? SER B 150 ? PRO B 131 SER B 150 1 ? 20 HELX_P HELX_P10 10 GLU B 170 ? PHE B 181 ? GLU B 170 PHE B 181 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 11 ALA B 207 ? GLN B 224 ? ALA B 207 GLN B 224 1 ? 18 HELX_P HELX_P12 12 HIS C 6 ? LEU C 12 ? HIS C 6 LEU C 12 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 13 GLY C 25 ? GLN C 28 ? GLY C 25 GLN C 28 5 ? 4 HELX_P HELX_P14 14 TYR C 29 ? GLU C 44 ? TYR C 29 GLU C 44 1 ? 16 HELX_P HELX_P15 15 GLU C 82 ? THR C 95 ? GLU C 82 THR C 95 1 ? 14 HELX_P HELX_P16 16 SER C 112 ? ARG C 126 ? SER C 112 ARG C 126 1 ? 15 HELX_P HELX_P17 17 ALA C 129 ? SER C 144 ? ALA C 129 SER C 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P18 18 ARG C 156 ? ALA C 160 ? ARG C 156 ALA C 160 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 19 SER D 52 ? GLY D 69 ? SER D 52 GLY D 69 1 ? 18 HELX_P HELX_P20 20 SER D 71 ? LYS D 85 ? SER D 71 LYS D 85 1 ? 15 HELX_P HELX_P21 21 VAL D 88 ? ARG D 100 ? VAL D 88 ARG D 100 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 22 ARG D 100 ? LEU D 108 ? ARG D 100 LEU D 108 1 ? 9 HELX_P HELX_P23 23 SER D 113 ? HIS D 123 ? SER D 113 HIS D 123 1 ? 11 HELX_P HELX_P24 24 ALA D 149 ? ASN D 154 ? ALA D 149 ASN D 154 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 25 LEU D 155 ? ALA D 164 ? LEU D 155 ALA D 164 1 ? 10 HELX_P HELX_P26 26 VAL D 178 ? MET D 181 ? VAL D 178 MET D 181 5 ? 4 HELX_P HELX_P27 27 ASP D 190 ? LEU D 194 ? ASP D 190 LEU D 194 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 28 ASN D 199 ? TYR D 207 ? ASN D 199 TYR D 207 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 29 GLU E 50 ? ASN E 65 ? GLU E 50 ASN E 65 1 ? 16 HELX_P HELX_P30 30 GLY E 103 ? ALA E 113 ? GLY E 103 ALA E 113 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 31 ASN E 127 ? ARG E 140 ? ASN E 127 ARG E 140 1 ? 14 HELX_P HELX_P32 32 THR E 144 ? ARG E 150 ? THR E 144 ARG E 150 1 ? 7 HELX_P HELX_P33 33 SER F 17 ? TYR F 33 ? SER F 17 TYR F 33 1 ? 17 HELX_P HELX_P34 34 ARG F 71 ? ARG F 82 ? ARG F 71 ARG F 82 1 ? 12 HELX_P HELX_P35 35 ASP G 20 ? MET G 31 ? ASP G 20 MET G 31 1 ? 12 HELX_P HELX_P36 36 LYS G 35 ? THR G 54 ? LYS G 35 THR G 54 1 ? 20 HELX_P HELX_P37 37 LYS G 60 ? ASN G 68 ? LYS G 60 ASN G 68 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 38 SER G 92 ? GLN G 110 ? SER G 92 GLN G 110 1 ? 19 HELX_P HELX_P39 39 ARG G 115 ? GLY G 130 ? ARG G 115 GLY G 130 1 ? 16 HELX_P HELX_P40 40 GLY G 132 ? ASN G 148 ? GLY G 132 ASN G 148 1 ? 17 HELX_P HELX_P41 41 ARG G 149 ? ALA G 152 ? ARG G 149 ALA G 152 5 ? 4 HELX_P HELX_P42 42 ASP H 4 ? TYR H 20 ? ASP H 4 TYR H 20 1 ? 17 HELX_P HELX_P43 43 PHE H 31 ? ARG H 41 ? PHE H 31 ARG H 41 1 ? 11 HELX_P HELX_P44 44 GLY H 96 ? ILE H 100 ? GLY H 96 ILE H 100 5 ? 5 HELX_P HELX_P45 45 THR H 120 ? GLY H 128 ? THR H 120 GLY H 128 1 ? 9 HELX_P HELX_P46 46 ASP I 32 ? PHE I 37 ? ASP I 32 PHE I 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P47 47 ARG I 42 ? ALA I 46 ? ARG I 42 ALA I 46 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 48 SER I 71 ? ALA I 84 ? SER I 71 ALA I 84 1 ? 14 HELX_P HELX_P49 49 ALA J 18 ? ALA J 26 ? ALA J 18 ALA J 26 1 ? 9 HELX_P HELX_P50 50 LYS J 80 ? GLN J 84 ? LYS J 80 GLN J 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 51 GLY K 46 ? ILE K 48 ? GLY K 46 ILE K 48 5 ? 3 HELX_P HELX_P52 52 THR K 57 ? ALA K 74 ? THR K 57 ALA K 74 1 ? 18 HELX_P HELX_P53 53 GLY K 88 ? GLY K 90 ? GLY K 88 GLY K 90 5 ? 3 HELX_P HELX_P54 54 ARG K 91 ? ALA K 97 ? ARG K 91 ALA K 97 1 ? 7 HELX_P HELX_P55 55 LYS K 122 ? LYS K 127 ? LYS K 122 LYS K 127 1 ? 6 HELX_P HELX_P56 56 THR L 6 ? LYS L 13 ? THR L 6 LYS L 13 1 ? 8 HELX_P HELX_P57 57 ARG M 14 ? LEU M 19 ? ARG M 14 LEU M 19 1 ? 6 HELX_P HELX_P58 58 THR M 20 ? ILE M 22 ? THR M 20 ILE M 22 5 ? 3 HELX_P HELX_P59 59 LYS M 27 ? GLU M 32 ? LYS M 27 GLU M 32 1 ? 6 HELX_P HELX_P60 60 ALA M 51 ? TRP M 64 ? ALA M 51 TRP M 64 1 ? 14 HELX_P HELX_P61 61 ALA M 72 ? ARG M 80 ? ALA M 72 ARG M 80 1 ? 9 HELX_P HELX_P62 62 ARG N 3 ? ARG N 12 ? ARG N 3 ARG N 12 1 ? 10 HELX_P HELX_P63 63 CYS N 40 ? GLY N 51 ? CYS N 40 GLY N 51 1 ? 12 HELX_P HELX_P64 64 THR O 4 ? ALA O 16 ? THR O 4 ALA O 16 1 ? 13 HELX_P HELX_P65 65 SER O 24 ? HIS O 46 ? SER O 24 HIS O 46 1 ? 23 HELX_P HELX_P66 66 ASP O 49 ? ASP O 74 ? ASP O 49 ASP O 74 1 ? 26 HELX_P HELX_P67 67 PRO O 75 ? GLY O 86 ? PRO O 75 GLY O 86 1 ? 12 HELX_P HELX_P68 68 ASP P 52 ? VAL P 62 ? ASP P 52 VAL P 62 1 ? 11 HELX_P HELX_P69 69 THR P 67 ? GLN P 76 ? THR P 67 GLN P 76 1 ? 10 HELX_P HELX_P70 70 ARG Q 81 ? TYR Q 95 ? ARG Q 81 TYR Q 95 1 ? 15 HELX_P HELX_P71 71 GLU Q 96 ? SER Q 99 ? GLU Q 96 SER Q 99 5 ? 4 HELX_P HELX_P72 72 ASN R 36 ? LYS R 41 ? ASN R 36 LYS R 41 1 ? 6 HELX_P HELX_P73 73 ARG R 42 ? LEU R 44 ? ARG R 42 LEU R 44 5 ? 3 HELX_P HELX_P74 74 PRO R 52 ? GLY R 57 ? PRO R 52 GLY R 57 1 ? 6 HELX_P HELX_P75 75 SER R 59 ? LEU R 76 ? SER R 59 LEU R 76 1 ? 18 HELX_P HELX_P76 76 ALA T 12 ? GLU T 46 ? ALA T 12 GLU T 46 1 ? 35 HELX_P HELX_P77 77 ALA T 49 ? GLY T 69 ? ALA T 49 GLY T 69 1 ? 21 HELX_P HELX_P78 78 HIS T 73 ? GLU T 93 ? HIS T 73 GLU T 93 1 ? 21 HELX_P HELX_P79 79 ARG U 9 ? TRP U 14 ? ARG U 9 TRP U 14 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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O VAL S 58 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software ? ? ? ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1545' AC2 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1547' AC3 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1548' AC4 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1550' AC5 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1551' AC6 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1552' AC7 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1553' AC8 Software ? ? ? ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1554' AC9 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1555' BC1 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1556' BC2 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1557' BC3 Software ? ? ? ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1558' BC4 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1559' BC5 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1560' BC6 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1561' BC7 Software ? ? ? ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1562' BC8 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1563' BC9 Software ? ? ? ? 6 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1565' CC1 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1566' CC2 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1567' CC3 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1568' CC4 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1569' CC5 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1570' CC6 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1571' CC7 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1572' CC8 Software ? ? ? ? 7 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1573' CC9 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1574' DC1 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1577' DC2 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1578' DC3 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1579' DC4 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1580' DC5 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1581' DC6 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1582' DC7 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1583' DC8 Software ? ? ? ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1585' DC9 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1586' EC1 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1587' EC2 Software ? ? ? ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1588' EC3 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1589' EC4 Software ? ? ? ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1590' EC5 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1591' EC6 Software ? ? ? ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1592' EC7 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE ZN D 210' EC8 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE ZN N 62' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 3 A A 556 ? 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U A 1528 . ? 1_555 ? 27 BC2 1 G A 560 ? G A 576 . ? 1_555 ? 28 BC3 3 C A 763 ? C A 779 . ? 1_555 ? 29 BC3 3 A A 764 ? A A 780 . ? 1_555 ? 30 BC3 3 G A 784 ? G A 800 . ? 1_555 ? 31 BC4 1 G A 873 ? G A 895 . ? 1_555 ? 32 BC5 2 G A 490 ? G A 506 . ? 1_555 ? 33 BC5 2 A A 493 ? A A 509 . ? 1_555 ? 34 BC6 1 U A 756 ? U A 772 . ? 1_555 ? 35 BC7 3 G A 22 ? G A 21 . ? 1_555 ? 36 BC7 3 G A 551 ? G A 567 . ? 1_555 ? 37 BC7 3 A A 557 ? A A 573 . ? 1_555 ? 38 BC8 2 G A 561 ? G A 577 . ? 1_555 ? 39 BC8 2 C A 562 ? C A 578 . ? 1_555 ? 40 BC9 6 A A 1478 ? A A 1500 . ? 1_555 ? 41 BC9 6 G A 1482 ? G A 1504 . ? 1_555 ? 42 BC9 6 G A 1483 ? G A 1505 . ? 1_555 ? 43 BC9 6 A A 1485 ? A A 1507 . ? 1_555 ? 44 BC9 6 G A 1486 ? G A 1508 . ? 1_555 ? 45 BC9 6 MG DB . ? MG A 1579 . ? 1_555 ? 46 CC1 2 A A 311 ? A A 315 . ? 1_555 ? 47 CC1 2 G A 313 ? G A 317 . ? 1_555 ? 48 CC2 4 G A 863 ? G A 885 . ? 1_555 ? 49 CC2 4 G A 864 ? G A 886 . ? 1_555 ? 50 CC2 4 G A 865 ? G A 887 . ? 1_555 ? 51 CC2 4 U A 889 ? 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G A 1521 . ? 1_555 ? 77 DC3 5 MG PA . ? MG A 1565 . ? 1_555 ? 78 DC4 1 A A 893 ? A A 915 . ? 1_555 ? 79 DC5 1 G A 320 ? G A 324 . ? 1_555 ? 80 DC6 1 G A 358 ? G A 362 . ? 1_555 ? 81 DC7 2 A A 54 ? A A 53 . ? 1_555 ? 82 DC7 2 A A 349 ? A A 353 . ? 1_555 ? 83 DC8 2 A A 519 ? A A 535 . ? 1_555 ? 84 DC8 2 C A 520 ? C A 536 . ? 1_555 ? 85 DC9 4 G A 293 ? G A 297 . ? 1_555 ? 86 DC9 4 G A 295 ? G A 299 . ? 1_555 ? 87 DC9 4 G A 541 ? G A 557 . ? 1_555 ? 88 DC9 4 G A 542 ? G A 558 . ? 1_555 ? 89 EC1 1 G A 568 ? G A 584 . ? 1_555 ? 90 EC2 3 A A 113 ? A A 119 . ? 1_555 ? 91 EC2 3 G A 281 ? G A 285 . ? 1_555 ? 92 EC2 3 G A 282 ? G A 286 . ? 1_555 ? 93 EC3 4 A A 547 ? A A 563 . ? 1_555 ? 94 EC3 4 C A 548 ? C A 564 . ? 1_555 ? 95 EC3 4 U A 549 ? U A 565 . ? 1_555 ? 96 EC3 4 G A 551 ? G A 567 . ? 1_555 ? 97 EC4 1 A A 294 ? A A 298 . ? 1_555 ? 98 EC5 4 A A 110 ? A A 116 . ? 1_555 ? 99 EC5 4 G A 111 ? G A 117 . ? 1_555 ? 100 EC5 4 U A 112 ? U A 118 . ? 1_555 ? 101 EC5 4 G A 285 ? 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CYS N 43 . ? 1_555 ? # _database_PDB_matrix.entry_id 3OI0 _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _atom_sites.entry_id 3OI0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004757 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.002221 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.001603 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C MG N O P S ZN # loop_ _database_PDB_caveat.text 'The C-N bond distances in few residues are not within the normal range.' # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 U 1 0 ? ? ? 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A . n A 1 6 U 6 5 5 U U A . n A 1 7 G 7 6 6 G G A . n A 1 8 G 8 7 7 G G A . n A 1 9 A 9 8 8 A A A . n A 1 10 G 10 9 9 G G A . n A 1 11 A 11 10 10 A A A . n A 1 12 G 12 11 11 G G A . n A 1 13 U 13 12 12 U U A . n A 1 14 U 14 13 13 U U A . n A 1 15 U 15 14 14 U U A . n A 1 16 G 16 15 15 G G A . n A 1 17 A 17 16 16 A A A . n A 1 18 U 18 17 17 U U A . n A 1 19 C 19 18 18 C C A . n A 1 20 C 20 19 19 C C A . n A 1 21 U 21 20 20 U U A . n A 1 22 G 22 21 21 G G A . n A 1 23 G 23 22 22 G G A . n A 1 24 C 24 23 23 C C A . n A 1 25 U 25 24 24 U U A . n A 1 26 C 26 25 25 C C A . n A 1 27 A 27 26 26 A A A . n A 1 28 G 28 27 27 G G A . n A 1 29 G 29 28 28 G G A . n A 1 30 G 30 29 29 G G A . n A 1 31 U 31 30 30 U U A . n A 1 32 G 32 31 31 G G A . n A 1 33 A 33 32 32 A A A . n A 1 34 A 34 33 33 A A A . n A 1 35 C 35 34 34 C C A . n A 1 36 G 36 35 35 G G A . n A 1 37 C 37 36 36 C C A . n A 1 38 U 38 37 37 U U A . n A 1 39 G 39 38 38 G G A . n A 1 40 G 40 39 39 G G A . n A 1 41 C 41 40 40 C C A . n A 1 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