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A MG 101 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 141 ? 1_555 90.2 ? 39 O ? KA HOH . ? A HOH 140 ? 1_555 MG ? K MG . ? A MG 101 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 141 ? 1_555 90.3 ? 40 O ? KA HOH . ? A HOH 138 ? 1_555 MG ? K MG . ? A MG 101 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 142 ? 1_555 89.3 ? 41 O ? KA HOH . ? A HOH 139 ? 1_555 MG ? K MG . ? A MG 101 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 142 ? 1_555 90.6 ? 42 O ? KA HOH . ? A HOH 140 ? 1_555 MG ? K MG . ? A MG 101 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 142 ? 1_555 89.2 ? 43 O ? KA HOH . ? A HOH 141 ? 1_555 MG ? K MG . ? A MG 101 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 142 ? 1_555 179.0 ? 44 O ? KA HOH . ? A HOH 138 ? 1_555 MG ? K MG . ? A MG 101 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 143 ? 1_555 90.4 ? 45 O ? KA HOH . ? A HOH 139 ? 1_555 MG ? K MG . ? A MG 101 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 143 ? 1_555 90.1 ? 46 O ? KA HOH . ? A HOH 140 ? 1_555 MG ? K MG . ? A MG 101 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 143 ? 1_555 179.9 ? 47 O ? KA HOH . ? A HOH 141 ? 1_555 MG ? K MG . ? A MG 101 ? 1_555 O ? KA HOH . ? 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E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 159 ? 1_555 90.0 ? 67 O ? KA HOH . ? A HOH 157 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 160 ? 1_555 90.1 ? 68 O ? KA HOH . ? A HOH 158 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 160 ? 1_555 89.8 ? 69 O ? KA HOH . ? A HOH 159 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 160 ? 1_555 90.0 ? 70 O ? KA HOH . ? A HOH 157 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 161 ? 1_555 89.9 ? 71 O ? KA HOH . ? A HOH 158 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 161 ? 1_555 90.2 ? 72 O ? KA HOH . ? A HOH 159 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 161 ? 1_555 90.0 ? 73 O ? KA HOH . ? A HOH 160 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 161 ? 1_555 179.9 ? 74 O ? KA HOH . ? A HOH 157 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 162 ? 1_555 90.0 ? 75 O ? KA HOH . ? A HOH 158 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 162 ? 1_555 90.1 ? 76 O ? KA HOH . ? A HOH 159 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 162 ? 1_555 180.0 ? 77 O ? KA HOH . ? A HOH 160 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 162 ? 1_555 90.1 ? 78 O ? KA HOH . ? A HOH 161 ? 1_555 MG ? E MG . ? A MG 111 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 162 ? 1_555 90.0 ? 79 O ? KA HOH . ? A HOH 168 ? 1_555 MG ? G MG . ? A MG 130 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 169 ? 1_555 178.5 ? 80 O ? KA HOH . ? A HOH 168 ? 1_555 MG ? G MG . ? A MG 130 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 170 ? 1_555 89.2 ? 81 O ? KA HOH . ? A HOH 169 ? 1_555 MG ? G MG . ? A MG 130 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 170 ? 1_555 90.5 ? 82 O ? KA HOH . ? A HOH 168 ? 1_555 MG ? G MG . ? A MG 130 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 171 ? 1_555 89.3 ? 83 O ? KA HOH . ? A HOH 169 ? 1_555 MG ? G MG . ? A MG 130 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 171 ? 1_555 89.2 ? 84 O ? KA HOH . ? A HOH 170 ? 1_555 MG ? G MG . ? A MG 130 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 171 ? 1_555 89.9 ? 85 O ? KA HOH . ? A HOH 168 ? 1_555 MG ? G MG . ? A MG 130 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 172 ? 1_555 90.9 ? 86 O ? KA HOH . ? A HOH 169 ? 1_555 MG ? G MG . ? A MG 130 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 172 ? 1_555 89.4 ? 87 O ? KA HOH . ? A HOH 170 ? 1_555 MG ? G MG . ? A MG 130 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 172 ? 1_555 179.0 ? 88 O ? KA HOH . ? A HOH 171 ? 1_555 MG ? G MG . ? A MG 130 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 172 ? 1_555 89.1 ? 89 O ? KA HOH . ? A HOH 144 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? KA HOH . ? A HOH 145 ? 1_555 90.9 ? 90 O ? KA HOH . ? A HOH 144 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 137 ? 1_555 179.0 ? 91 O ? KA HOH . ? A HOH 145 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 137 ? 1_555 88.2 ? 92 O ? KA HOH . ? A HOH 144 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 138 ? 1_555 89.6 ? 93 O ? KA HOH . ? A HOH 145 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 138 ? 1_555 88.9 ? 94 O ? LA HOH . ? B HOH 137 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 138 ? 1_555 89.9 ? 95 O ? KA HOH . ? A HOH 144 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 139 ? 1_555 89.9 ? 96 O ? KA HOH . ? A HOH 145 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 139 ? 1_555 178.8 ? 97 O ? LA HOH . ? B HOH 137 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 139 ? 1_555 90.9 ? 98 O ? LA HOH . ? B HOH 138 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 139 ? 1_555 90.3 ? 99 O ? KA HOH . ? A HOH 144 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 140 ? 1_555 90.9 ? 100 O ? KA HOH . ? A HOH 145 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 140 ? 1_555 89.8 ? 101 O ? LA HOH . ? B HOH 137 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 140 ? 1_555 89.5 ? 102 O ? LA HOH . ? B HOH 138 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 140 ? 1_555 178.6 ? 103 O ? LA HOH . ? B HOH 139 ? 1_555 MG ? V MG . ? B MG 106 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 140 ? 1_555 91.1 ? 104 O6 ? B G 17 ? B G 17 ? 1_555 MG ? FA MG . ? B MG 128 ? 1_555 "O5'" ? B A 21 ? B A 21 ? 1_555 143.2 ? 105 OP2 ? B U 18 ? B U 18 ? 1_555 MG ? BA MG . ? B MG 115 ? 1_555 OP2 ? B U 20 ? B U 20 ? 1_555 79.8 ? 106 OP1 ? B C 74 ? B C 74 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 OP1 ? B A 75 ? B A 75 ? 1_555 71.3 ? 107 OP1 ? B C 74 ? B C 74 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 OP2 ? B A 76 ? B A 76 ? 1_555 167.2 ? 108 OP1 ? B A 75 ? B A 75 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 OP2 ? B A 76 ? B A 76 ? 1_555 101.9 ? 109 OP1 ? B C 74 ? B C 74 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 146 ? 1_555 87.1 ? 110 OP1 ? B A 75 ? B A 75 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 146 ? 1_555 150.9 ? 111 OP2 ? B A 76 ? B A 76 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 146 ? 1_555 95.1 ? 112 OP1 ? B C 74 ? B C 74 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 147 ? 1_555 87.6 ? 113 OP1 ? B A 75 ? B A 75 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 147 ? 1_555 106.9 ? 114 OP2 ? B A 76 ? B A 76 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 147 ? 1_555 104.9 ? 115 O ? LA HOH . ? B HOH 146 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 147 ? 1_555 91.0 ? 116 OP1 ? B C 74 ? B C 74 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 148 ? 1_555 89.4 ? 117 OP1 ? B A 75 ? B A 75 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 148 ? 1_555 72.4 ? 118 OP2 ? B A 76 ? B A 76 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 148 ? 1_555 78.1 ? 119 O ? LA HOH . ? B HOH 146 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 148 ? 1_555 88.6 ? 120 O ? LA HOH . ? B HOH 147 ? 1_555 MG ? X MG . ? B MG 114 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 148 ? 1_555 177.0 ? 121 O ? LA HOH . ? B HOH 141 ? 1_555 MG ? W MG . ? B MG 113 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 142 ? 1_555 90.2 ? 122 O ? LA HOH . ? B HOH 141 ? 1_555 MG ? W MG . ? B MG 113 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 143 ? 1_555 89.2 ? 123 O ? LA HOH . ? B HOH 142 ? 1_555 MG ? W MG . ? B MG 113 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 143 ? 1_555 89.2 ? 124 O ? LA HOH . ? B HOH 141 ? 1_555 MG ? W MG . ? B MG 113 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 144 ? 1_555 89.5 ? 125 O ? LA HOH . ? B HOH 142 ? 1_555 MG ? W MG . ? B MG 113 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 144 ? 1_555 91.0 ? 126 O ? LA HOH . ? B HOH 143 ? 1_555 MG ? W MG . ? B MG 113 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 144 ? 1_555 178.8 ? 127 O ? LA HOH . ? B HOH 141 ? 1_555 MG ? W MG . ? B MG 113 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 145 ? 1_555 88.8 ? 128 O ? LA HOH . ? B HOH 142 ? 1_555 MG ? W MG . ? B MG 113 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 145 ? 1_555 179.0 ? 129 O ? LA HOH . ? B HOH 143 ? 1_555 MG ? W MG . ? B MG 113 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 145 ? 1_555 90.8 ? 130 O ? LA HOH . ? B HOH 144 ? 1_555 MG ? W MG . ? B MG 113 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 145 ? 1_555 89.0 ? 131 O ? LA HOH . ? B HOH 149 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 150 ? 1_555 178.7 ? 132 O ? LA HOH . ? B HOH 149 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 151 ? 1_555 89.3 ? 133 O ? LA HOH . ? B HOH 150 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 151 ? 1_555 90.8 ? 134 O ? LA HOH . ? B HOH 149 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 152 ? 1_555 89.4 ? 135 O ? LA HOH . ? B HOH 150 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 152 ? 1_555 89.3 ? 136 O ? LA HOH . ? B HOH 151 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 152 ? 1_555 90.3 ? 137 O ? LA HOH . ? B HOH 149 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 153 ? 1_555 90.5 ? 138 O ? LA HOH . ? B HOH 150 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 153 ? 1_555 90.8 ? 139 O ? LA HOH . ? B HOH 151 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 153 ? 1_555 89.7 ? 140 O ? LA HOH . ? B HOH 152 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 153 ? 1_555 179.8 ? 141 O ? LA HOH . ? B HOH 149 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 154 ? 1_555 90.1 ? 142 O ? LA HOH . ? B HOH 150 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 154 ? 1_555 89.8 ? 143 O ? LA HOH . ? B HOH 151 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 154 ? 1_555 179.3 ? 144 O ? LA HOH . ? B HOH 152 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 154 ? 1_555 90.2 ? 145 O ? LA HOH . ? B HOH 153 ? 1_555 MG ? Y MG . ? B MG 131 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 154 ? 1_555 89.8 ? 146 O ? LA HOH . ? B HOH 155 ? 1_555 MG ? Z MG . ? B MG 132 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 156 ? 1_555 179.2 ? 147 O ? LA HOH . ? B HOH 155 ? 1_555 MG ? Z MG . ? B MG 132 ? 1_555 O ? LA HOH . ? B HOH 157 ? 1_555 90.0 ? 148 O ? LA HOH . ? B HOH 156 ? 1_555 MG ? Z MG . ? B MG 132 ? 1_555 O ? LA HOH . ? 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HOH H2 H N N 193 MG MG MG N N 194 U OP3 O N N 195 U P P N N 196 U OP1 O N N 197 U OP2 O N N 198 U "O5'" O N N 199 U "C5'" C N N 200 U "C4'" C N R 201 U "O4'" O N N 202 U "C3'" C N S 203 U "O3'" O N N 204 U "C2'" C N R 205 U "O2'" O N N 206 U "C1'" C N R 207 U N1 N N N 208 U C2 C N N 209 U O2 O N N 210 U N3 N N N 211 U C4 C N N 212 U O4 O N N 213 U C5 C N N 214 U C6 C N N 215 U HOP3 H N N 216 U HOP2 H N N 217 U "H5'" H N N 218 U "H5''" H N N 219 U "H4'" H N N 220 U "H3'" H N N 221 U "HO3'" H N N 222 U "H2'" H N N 223 U "HO2'" H N N 224 U "H1'" H N N 225 U H3 H N N 226 U H5 H N N 227 U H6 H N N 228 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal A OP3 P sing N N 1 A OP3 HOP3 sing N N 2 A P OP1 doub N N 3 A P OP2 sing N N 4 A P "O5'" sing N N 5 A OP2 HOP2 sing N N 6 A "O5'" "C5'" sing N N 7 A "C5'" "C4'" sing N N 8 A "C5'" "H5'" 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93 CCC "O4'" "C1'" sing N N 94 CCC "C3'" "O3'" sing N N 95 CCC "C3'" "C2'" sing N N 96 CCC "C3'" "H3'" sing N N 97 CCC "C2'" "O2'" sing N N 98 CCC "C2'" "C1'" sing N N 99 CCC "C2'" "H2'" sing N N 100 CCC "C1'" N1 sing N N 101 CCC "C1'" "H1'" sing N N 102 CCC N1 C2 sing N N 103 CCC N1 C6 sing N N 104 CCC C2 O2 doub N N 105 CCC C2 N3 sing N N 106 CCC N3 C4 doub N N 107 CCC C4 N4 sing N N 108 CCC C4 C5 sing N N 109 CCC N4 H41 sing N N 110 CCC N4 H42 sing N N 111 CCC C5 C6 doub N N 112 CCC C5 H5 sing N N 113 CCC C6 H6 sing N N 114 G OP3 P sing N N 115 G OP3 HOP3 sing N N 116 G P OP1 doub N N 117 G P OP2 sing N N 118 G P "O5'" sing N N 119 G OP2 HOP2 sing N N 120 G "O5'" "C5'" sing N N 121 G "C5'" "C4'" sing N N 122 G "C5'" "H5'" sing N N 123 G "C5'" "H5''" sing N N 124 G "C4'" "O4'" sing N N 125 G "C4'" "C3'" sing N N 126 G "C4'" "H4'" sing N N 127 G "O4'" "C1'" sing N N 128 G "C3'" "O3'" sing N N 129 G "C3'" "C2'" sing N N 130 G "C3'" "H3'" sing N N 131 G "O3'" "HO3'" sing N N 132 G "C2'" 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"C4'" "H4'" sing N N 214 U "O4'" "C1'" sing N N 215 U "C3'" "O3'" sing N N 216 U "C3'" "C2'" sing N N 217 U "C3'" "H3'" sing N N 218 U "O3'" "HO3'" sing N N 219 U "C2'" "O2'" sing N N 220 U "C2'" "C1'" sing N N 221 U "C2'" "H2'" sing N N 222 U "O2'" "HO2'" sing N N 223 U "C1'" N1 sing N N 224 U "C1'" "H1'" sing N N 225 U N1 C2 sing N N 226 U N1 C6 sing N N 227 U C2 O2 doub N N 228 U C2 N3 sing N N 229 U N3 C4 sing N N 230 U N3 H3 sing N N 231 U C4 O4 doub N N 232 U C4 C5 sing N N 233 U C5 C6 doub N N 234 U C5 H5 sing N N 235 U C6 H6 sing N N 236 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 3OXD 'double helix' 3OXD 'a-form double helix' 3OXD 'hairpin loop' 3OXD tetraloop 3OXD 'bulge loop' 3OXD 'mismatched base pair' 3OXD 'internal loop' 3OXD 'triple helix' 3OXD 'three-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id 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