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'Specific DNA structural attributes modulate platinum anticancer drug site selection and cross-link generation.' _citation.journal_abbrev 'Nucleic Acids Res.' _citation.journal_volume 39 _citation.page_first 8200 _citation.page_last 8212 _citation.year 2011 _citation.journal_id_ASTM NARHAD _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0305-1048 _citation.journal_id_CSD 0389 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 21724603 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1093/nar/gkr491 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Wu, B.' 1 ? primary 'Davey, G.E.' 2 ? primary 'Nazarov, A.A.' 3 ? primary 'Dyson, P.J.' 4 ? primary 'Davey, C.A.' 5 ? # _cell.entry_id 3REI _cell.length_a 105.877 _cell.length_b 109.904 _cell.length_c 181.701 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample ? ? ? 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 5 1 sample ? ? 'Homo sapiens' ? 9606 ? 6 1 sample ? ? 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'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MN non-polymer . 'MANGANESE (II) ION' ? 'Mn 2' 54.938 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 PT non-polymer . 'PLATINUM (II) ION' ? 'Pt 2' 195.078 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SO4 non-polymer . 'SULFATE ION' ? 'O4 S -2' 96.063 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 3REI _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.66 _exptl_crystal.density_percent_sol 53.78 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp ? _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'MARMOSAIC 225 mm CCD' _diffrn_detector.pdbx_collection_date ? _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.07 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SLS BEAMLINE X06SA' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SLS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X06SA _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.07 # _reflns.entry_id 3REI _reflns.observed_criterion_sigma_I ? _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 58 _reflns.d_resolution_high 2.65 _reflns.number_obs 53670 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 88.4 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.048 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 26.0 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 5.3 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 # _refine.entry_id 3REI _refine.ls_number_reflns_obs 53670 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F . _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 58 _refine.ls_d_res_high 2.65 _refine.ls_percent_reflns_obs 87.96 _refine.ls_R_factor_obs 0.26014 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.25980 _refine.ls_R_factor_R_free 0.27581 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 2.1 _refine.ls_number_reflns_R_free 1124 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.909 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free 0.908 _refine.B_iso_mean 95.354 _refine.aniso_B[1][1] 1.71 _refine.aniso_B[2][2] -3.61 _refine.aniso_B[3][3] 1.90 _refine.aniso_B[1][2] 0.00 _refine.aniso_B[1][3] 0.00 _refine.aniso_B[2][3] 0.00 _refine.solvent_model_details MASK _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.20 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii 0.80 _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.80 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details 'HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS' _refine.pdbx_starting_model 2NZD _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 0.364 _refine.overall_SU_ML 0.274 _refine.overall_SU_B 12.721 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 6086 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 5939 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 66 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 12091 _refine_hist.d_res_high 2.65 _refine_hist.d_res_low 58 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function _refine_ls_restr.pdbx_refine_id r_bond_refined_d 0.010 0.021 ? 12841 ? 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THR B 80 VAL B 81 B 1 THR A 118 ? ILE A 119 ? THR A 118 ILE A 119 B 2 ARG B 45 ? ILE B 46 ? ARG B 45 ILE B 46 C 1 THR B 96 ? TYR B 98 ? THR B 96 TYR B 98 C 2 VAL G 100 ? ILE G 102 ? VAL G 100 ILE G 102 D 1 ARG C 42 ? VAL C 43 ? ARG C 42 VAL C 43 D 2 THR D 85 ? ILE D 86 ? THR D 85 ILE D 86 E 1 ARG C 77 ? ILE C 78 ? ARG C 77 ILE C 78 E 2 GLY D 50 ? ILE D 51 ? GLY D 50 ILE D 51 F 1 VAL C 100 ? ILE C 102 ? VAL C 100 ILE C 102 F 2 THR F 96 ? TYR F 98 ? THR F 96 TYR F 98 G 1 ARG E 83 ? PHE E 84 ? ARG E 83 PHE E 84 G 2 THR F 80 ? VAL F 81 ? THR F 80 VAL F 81 H 1 THR E 118 ? ILE E 119 ? THR E 118 ILE E 119 H 2 ARG F 45 ? ILE F 46 ? ARG F 45 ILE F 46 I 1 ARG G 42 ? VAL G 43 ? ARG G 42 VAL G 43 I 2 THR H 85 ? ILE H 86 ? THR H 85 ILE H 86 J 1 ARG G 77 ? ILE G 78 ? ARG G 77 ILE G 78 J 2 GLY H 50 ? ILE H 51 ? GLY H 50 ILE H 51 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 N ARG A 83 ? N ARG A 83 O VAL B 81 ? O VAL B 81 B 1 2 N ILE A 119 ? N ILE A 119 O ARG B 45 ? O ARG B 45 C 1 2 N TYR B 98 ? N TYR B 98 O THR G 101 ? O THR G 101 D 1 2 N ARG C 42 ? N ARG C 42 O ILE D 86 ? O ILE D 86 E 1 2 N ILE C 78 ? N ILE C 78 O GLY D 50 ? O GLY D 50 F 1 2 N THR C 101 ? N THR C 101 O TYR F 98 ? O TYR F 98 G 1 2 N ARG E 83 ? N ARG E 83 O VAL F 81 ? O VAL F 81 H 1 2 N ILE E 119 ? N ILE E 119 O ARG F 45 ? O ARG F 45 I 1 2 N ARG G 42 ? N ARG G 42 O ILE H 86 ? O ILE H 86 J 1 2 N ILE G 78 ? N ILE G 78 O GLY H 50 ? O GLY H 50 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software E MN 1001 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE MN E 1001' AC2 Software H MN 1013 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE MN H 1013' AC3 Software D SO4 1101 ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 D 1101' AC4 Software H SO4 1102 ? 6 'BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 H 1102' AC5 Software H SO4 1103 ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 H 1103' AC6 Software I PT 73 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 73' AC7 Software J PT 73 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 73' AC8 Software I PT 74 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 74' AC9 Software J PT 74 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 74' BC1 Software J PT 75 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 75' BC2 Software J PT 76 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 76' BC3 Software J PT 77 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 77' BC4 Software I PT 75 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 75' BC5 Software I PT 76 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 76' BC6 Software I PT 77 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 77' BC7 Software I PT 78 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 78' BC8 Software J PT 78 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 78' BC9 Software J PT 79 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 79' CC1 Software I PT 79 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 79' CC2 Software B PT 103 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT B 103' CC3 Software I PT 80 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 80' CC4 Software J PT 80 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 80' CC5 Software I PT 81 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 81' CC6 Software I PT 82 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 82' CC7 Software I PT 83 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 83' CC8 Software F PT 103 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT F 103' CC9 Software J PT 82 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 82' DC1 Software J PT 83 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 83' DC2 Software I PT 84 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 84' DC3 Software J PT 84 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 84' DC4 Software I PT 85 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 85' DC5 Software I PT 86 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 86' DC6 Software J PT 85 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 85' DC7 Software I PT 87 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 87' DC8 Software J PT 86 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 86' DC9 Software E PT 136 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT E 136' EC1 Software A PT 136 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT A 136' EC2 Software E PT 137 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT E 137' EC3 Software I PT 88 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 88' EC4 Software A PT 137 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT A 137' EC5 Software J PT 87 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 87' EC6 Software I PT 89 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 89' EC7 Software J PT 88 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 88' EC8 Software J PT 89 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 89' EC9 Software J PT 90 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 90' FC1 Software J PT 91 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 91' FC2 Software I PT 90 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 90' FC3 Software J PT 92 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 92' FC4 Software J PT 93 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 93' FC5 Software C PT 130 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT C 130' FC6 Software I PT 91 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT I 91' FC7 Software J PT 128 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 128' FC8 Software J PT 133 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE PT J 133' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 2 VAL D 45 ? VAL D 45 . ? 3_545 ? 2 AC1 2 ASP E 77 ? ASP E 77 . ? 1_555 ? 3 AC2 1 VAL H 45 ? VAL H 45 . ? 1_555 ? 4 AC3 5 GLY C 44 ? GLY C 44 . ? 1_555 ? 5 AC3 5 ALA C 45 ? ALA C 45 . ? 1_555 ? 6 AC3 5 GLY C 46 ? GLY C 46 . ? 1_555 ? 7 AC3 5 THR D 87 ? THR D 87 . ? 1_555 ? 8 AC3 5 SER D 88 ? SER D 88 . ? 1_555 ? 9 AC4 6 GLY G 44 ? GLY G 44 . ? 1_555 ? 10 AC4 6 ALA G 45 ? ALA G 45 . ? 1_555 ? 11 AC4 6 GLY G 46 ? GLY G 46 . ? 1_555 ? 12 AC4 6 ALA G 47 ? ALA G 47 . ? 1_555 ? 13 AC4 6 THR H 87 ? THR H 87 . ? 1_555 ? 14 AC4 6 SER H 88 ? SER H 88 . ? 1_555 ? 15 AC5 4 HIS H 46 ? HIS H 46 . ? 1_555 ? 16 AC5 4 PRO H 47 ? PRO H 47 . ? 1_555 ? 17 AC5 4 ASP H 48 ? ASP H 48 . ? 1_555 ? 18 AC5 4 THR H 49 ? THR H 49 . ? 1_555 ? 19 AC6 1 DG I 133 ? DG I 60 . ? 1_555 ? 20 AC7 2 DG J 133 ? DG J 60 . ? 1_555 ? 21 AC7 2 DG J 134 ? DG J 61 . ? 1_555 ? 22 AC8 1 DG I 80 ? DG I 7 . ? 1_555 ? 23 AC9 1 DG J 80 ? DG J 7 . ? 1_555 ? 24 BC1 2 DA J 19 ? DA J -54 . ? 1_555 ? 25 BC1 2 DG J 18 ? 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DG I 63 . ? 1_555 ? 51 DC2 3 DG I 137 ? DG I 64 . ? 1_555 ? 52 DC2 3 PT CA . ? PT I 79 . ? 1_555 ? 53 DC3 3 DG J 136 ? DG J 63 . ? 1_555 ? 54 DC3 3 DG J 137 ? DG J 64 . ? 1_555 ? 55 DC3 3 PT LB . ? PT J 133 . ? 1_555 ? 56 DC4 1 DG I 96 ? DG I 23 . ? 1_555 ? 57 DC5 1 DG I 120 ? DG I 47 . ? 1_555 ? 58 DC6 2 DG J 99 ? DG J 26 . ? 1_555 ? 59 DC6 2 PT DB . ? PT J 87 . ? 1_555 ? 60 DC7 1 DT I 119 ? DT I 46 . ? 1_555 ? 61 DC8 1 DA J 101 ? DA J 28 . ? 1_555 ? 62 DC9 2 MET E 120 ? MET E 120 . ? 1_555 ? 63 DC9 2 DG J 71 ? DG J -2 . ? 1_555 ? 64 EC1 2 LYS A 64 ? LYS A 64 . ? 1_555 ? 65 EC1 2 MET A 90 ? MET A 90 . ? 1_555 ? 66 EC2 2 LYS E 64 ? LYS E 64 . ? 1_555 ? 67 EC2 2 MET E 90 ? MET E 90 . ? 1_555 ? 68 EC3 3 DT I 118 ? DT I 45 . ? 1_555 ? 69 EC3 3 DA J 30 ? DA J -43 . ? 1_555 ? 70 EC3 3 DA J 29 ? DA J -44 . ? 1_555 ? 71 EC4 2 MET A 120 ? MET A 120 . ? 1_555 ? 72 EC4 2 DG I 71 ? DG I -2 . ? 1_555 ? 73 EC5 2 DA I 140 ? DA I 67 . ? 3_455 ? 74 EC5 2 PT BB . ? 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sing N N 457 TYR N H sing N N 458 TYR N H2 sing N N 459 TYR CA C sing N N 460 TYR CA CB sing N N 461 TYR CA HA sing N N 462 TYR C O doub N N 463 TYR C OXT sing N N 464 TYR CB CG sing N N 465 TYR CB HB2 sing N N 466 TYR CB HB3 sing N N 467 TYR CG CD1 doub Y N 468 TYR CG CD2 sing Y N 469 TYR CD1 CE1 sing Y N 470 TYR CD1 HD1 sing N N 471 TYR CD2 CE2 doub Y N 472 TYR CD2 HD2 sing N N 473 TYR CE1 CZ doub Y N 474 TYR CE1 HE1 sing N N 475 TYR CE2 CZ sing Y N 476 TYR CE2 HE2 sing N N 477 TYR CZ OH sing N N 478 TYR OH HH sing N N 479 TYR OXT HXT sing N N 480 VAL N CA sing N N 481 VAL N H sing N N 482 VAL N H2 sing N N 483 VAL CA C sing N N 484 VAL CA CB sing N N 485 VAL CA HA sing N N 486 VAL C O doub N N 487 VAL C OXT sing N N 488 VAL CB CG1 sing N N 489 VAL CB CG2 sing N N 490 VAL CB HB sing N N 491 VAL CG1 HG11 sing N N 492 VAL CG1 HG12 sing N N 493 VAL CG1 HG13 sing N N 494 VAL CG2 HG21 sing N N 495 VAL CG2 HG22 sing N N 496 VAL CG2 HG23 sing N N 497 VAL OXT HXT sing N N 498 # loop_ 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J -72 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DA 1 1_555 J DT 145 1_555 I DT 2 1_555 J DA 144 1_555 -1.066 -0.369 2.896 3.025 2.758 34.041 -1.002 2.220 2.756 4.691 -5.144 34.279 1 II_DA-72DT-71:DA71DT72_JJ I -72 ? 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J 54 ? 1 I DA 19 1_555 J DT 127 1_555 I DT 20 1_555 J DA 126 1_555 0.803 -0.612 2.874 -7.687 -9.870 31.161 0.368 -2.506 2.673 -17.514 13.641 33.521 17 II_DA-54DT-53:DA53DT54_JJ I -54 ? J 54 ? I -53 ? J 53 ? 1 I DT 20 1_555 J DA 126 1_555 I DA 21 1_555 J DT 125 1_555 0.150 -1.735 3.233 3.081 8.091 27.654 -5.113 0.326 2.631 16.425 -6.253 28.953 18 II_DT-53DA-52:DT52DA53_JJ I -53 ? J 53 ? I -52 ? J 52 ? 1 I DA 21 1_555 J DT 125 1_555 I DC 22 1_555 J DG 124 1_555 -0.850 -0.636 3.025 -3.446 13.918 34.921 -2.619 0.912 2.659 22.078 5.465 37.665 19 II_DA-52DC-51:DG51DT52_JJ I -52 ? J 52 ? I -51 ? J 51 ? 1 I DC 22 1_555 J DG 124 1_555 I DA 24 1_555 J DT 122 1_555 0.283 -0.049 6.293 4.117 6.374 62.624 -0.594 0.083 6.268 6.108 -3.945 63.035 20 II_DC-51DA-49:DT49DG51_JJ I -51 ? J 51 ? I -49 ? J 49 ? 1 I DA 24 1_555 J DT 122 1_555 I DC 25 1_555 J DG 121 1_555 0.184 -0.504 3.488 -7.472 13.159 30.560 -3.035 -1.548 2.913 23.261 13.208 34.022 21 II_DA-49DC-48:DG48DT49_JJ I -49 ? J 49 ? I -48 ? J 48 ? 1 I DC 25 1_555 J DG 121 1_555 I DC 26 1_555 J DG 120 1_555 0.644 0.283 2.622 8.545 2.703 33.048 0.127 0.026 2.713 4.646 -14.689 34.209 22 II_DC-48DC-47:DG47DG48_JJ I -48 ? J 48 ? I -47 ? J 47 ? 1 I DC 26 1_555 J DG 120 1_555 I DA 27 1_555 J DT 119 1_555 -0.418 2.442 3.200 -1.810 -12.788 42.387 4.294 0.407 2.416 -17.214 2.436 44.224 23 II_DC-47DA-46:DT46DG47_JJ I -47 ? J 47 ? I -46 ? J 46 ? 1 I DA 27 1_555 J DT 119 1_555 I DA 28 1_555 J DT 118 1_555 1.100 0.138 3.334 1.567 -7.101 36.642 1.174 -1.506 3.293 -11.160 -2.462 37.332 24 II_DA-46DA-45:DT45DT46_JJ I -46 ? J 46 ? I -45 ? J 45 ? 1 I DA 28 1_555 J DT 118 1_555 I DA 29 1_555 J DT 117 1_555 0.606 -0.139 3.515 3.858 -3.269 35.740 0.278 -0.386 3.557 -5.294 -6.248 36.084 25 II_DA-45DA-44:DT44DT45_JJ I -45 ? J 45 ? I -44 ? J 44 ? 1 I DA 29 1_555 J DT 117 1_555 I DA 30 1_555 J DT 116 1_555 0.257 -0.048 3.089 1.444 -0.264 37.308 -0.042 -0.221 3.097 -0.413 -2.256 37.336 26 II_DA-44DA-43:DT43DT44_JJ I -44 ? J 44 ? I -43 ? 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J 38 ? 1 I DA 35 1_555 J DT 111 1_555 I DT 36 1_555 J DA 110 1_555 0.387 -1.343 3.348 -9.271 1.233 37.788 -2.167 -1.713 3.127 1.869 14.052 38.887 32 II_DA-38DT-37:DA37DT38_JJ I -38 ? J 38 ? I -37 ? J 37 ? 1 I DT 36 1_555 J DA 110 1_555 I DT 37 1_555 J DA 109 1_555 -0.479 -0.567 3.322 5.453 -11.145 40.829 0.379 1.227 3.274 -15.547 -7.608 42.596 33 II_DT-37DT-36:DA36DA37_JJ I -37 ? J 37 ? I -36 ? J 36 ? 1 I DT 37 1_555 J DA 109 1_555 I DT 38 1_555 J DA 108 1_555 -0.260 -0.590 3.124 1.335 -0.080 29.718 -1.133 0.773 3.111 -0.155 -2.602 29.747 34 II_DT-36DT-35:DA35DA36_JJ I -36 ? J 36 ? I -35 ? J 35 ? 1 I DT 38 1_555 J DA 108 1_555 I DG 39 1_555 J DC 107 1_555 -0.297 2.863 3.620 -4.241 -27.576 48.706 4.518 0.094 1.886 -30.704 4.722 55.705 35 II_DT-35DG-34:DC34DA35_JJ I -35 ? J 35 ? I -34 ? J 34 ? 1 I DG 39 1_555 J DC 107 1_555 I DG 40 1_555 J DC 106 1_555 1.326 0.682 2.715 -5.365 -1.955 29.851 1.610 -3.380 2.397 -3.752 10.297 30.380 36 II_DG-34DG-33:DC33DC34_JJ I -34 ? J 34 ? I -33 ? 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