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A Model for the Presumed Catalytic Transition State and for the Binding of Extended Substrates ; J.Mol.Biol. 114 119 ? 1977 JMOBAK UK 0022-2836 070 ? ? ? 6 'Crystallographic Study of the Binding of Dipeptide Inhibitors to Thermolysin. Implications for the Mechanism of Catalysis' Biochemistry 16 2506 ? 1977 BICHAW US 0006-2960 033 ? ? ? 7 'Role of Calcium in the Thermal Stability of Thermolysin' Biochemistry 15 1103 ? 1976 BICHAW US 0006-2960 033 ? ? ? 8 'Evidence of Homologous Relationship between Thermolysin and Neutral Protease a of Bacillus Subtilis' Proc.Natl.Acad.Sci.USA 72 4341 ? 1975 PNASA6 US 0027-8424 040 ? ? ? 9 'The Conformation of Thermolysin' J.Biol.Chem. 249 8030 ? 1974 JBCHA3 US 0021-9258 071 ? ? ? 10 'Binding of Lanthanide Ions to Thermolysin' Biochemistry 13 1719 ? 1974 BICHAW US 0006-2960 033 ? ? ? 11 'The Structure of Thermolysin,an Electron Density Map at 2.3 Angstroms Resolution' J.Mol.Biol. 70 701 ? 1972 JMOBAK UK 0022-2836 070 ? ? ? 12 'Amino-Acid Sequence of Thermolysin' 'Nature New Biol.' 238 35 ? 1972 NNBYA7 UK 0369-4887 192 ? ? ? 13 'Three Dimensional Structure of Thermolysin' 'Nature New Biol.' 238 37 ? 1972 NNBYA7 UK 0369-4887 192 ? ? ? 14 'Structure of Thermolysin' 'Nature New Biol.' 238 41 ? 1972 NNBYA7 UK 0369-4887 192 ? ? ? 15 ? 'Atlas of Protein Sequence and Structure,Supplement 2' 5 98 ? 1976 ? ? 0-912466-05-7 435 'National Biomedical Research Foundation, Silver Spring,Md.' ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Holmes, M.A.' 1 primary 'Matthews, B.W.' 2 1 'Monzingo, A.F.' 3 1 'Matthews, B.W.' 4 2 'Holmes, M.A.' 5 2 'Matthews, B.W.' 6 3 'Bolognesi, M.C.' 7 3 'Matthews, B.W.' 8 4 'Kester, W.R.' 9 4 'Matthews, B.W.' 10 5 'Weaver, L.H.' 11 5 'Kester, W.R.' 12 5 'Matthews, B.W.' 13 6 'Kester, W.R.' 14 6 'Matthews, B.W.' 15 7 'Dahlquist, F.W.' 16 7 'Long, J.W.' 17 7 'Bigbee, W.L.' 18 8 'Levy, P.L.' 19 8 'Pangburn, M.K.' 20 8 'Burstein, Y.' 21 8 'Ericsson, L.H.' 22 8 'Neurath, H.' 23 8 'Walsh, K.A.' 24 9 'Matthews, B.W.' 25 9 'Weaver, L.H.' 26 9 'Kester, W.R.' 27 10 'Matthews, B.W.' 28 10 'Weaver, L.H.' 29 11 'Colman, P.M.' 30 11 'Jansonius, J.N.' 31 11 'Matthews, B.W.' 32 12 'Titani, K.' 33 12 'Hermodson, M.A.' 34 12 'Ericsson, L.H.' 35 12 'Walsh, K.A.' 36 12 'Neurath, H.' 37 13 'Matthews, B.W.' 38 13 'Jansonius, J.N.' 39 13 'Colman, P.M.' 40 13 'Schoenborn, B.P.' 41 13 'Duporque, D.' 42 14 'Matthews, B.W.' 43 14 'Colman, P.M.' 44 14 'Jansonius, J.N.' 45 14 'Titani, K.' 46 14 'Walsh, K.A.' 47 14 'Neurath, H.' 48 # _citation_editor.citation_id 15 _citation_editor.name 'Dayhoff, M.O.' _citation_editor.ordinal 1 # _cell.entry_id 3TLN _cell.length_a 94.200 _cell.length_b 94.200 _cell.length_c 131.400 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 120.00 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3TLN _symmetry.space_group_name_H-M 'P 61 2 2' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 178 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 non-polymer man ISOLEUCINE 34362.305 1 ? ? ? ? 2 non-polymer syn 'CALCIUM ION' 40.078 4 ? ? ? ? 3 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 1 ? ? ? ? 4 water nat water 18.015 173 ? ? ? ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 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PRO 214 ? ? 1.31 74 1 C . LEU 54 ? ? N . TRP 55 ? ? 1.31 75 1 C . ARG 47 ? ? N . THR 48 ? ? 1.31 76 1 C . ASP 67 ? ? N . ALA 68 ? ? 1.31 77 1 C . GLY 8 ? ? N . VAL 9 ? ? 1.31 78 1 C . LEU 295 ? ? N . TYR 296 ? ? 1.31 79 1 C . GLN 290 ? ? N . SER 291 ? ? 1.31 80 1 C . VAL 87 ? ? N . HIS 88 ? ? 1.31 81 1 C . THR 293 ? ? N . ASP 294 ? ? 1.31 82 1 C . GLY 78 ? ? N . VAL 79 ? ? 1.31 83 1 C . ASN 19 ? ? N . ILE 20 ? ? 1.31 84 1 C . ILE 131 ? ? N . PRO 132 ? ? 1.31 85 1 C . SER 218 ? ? N . LYS 219 ? ? 1.31 86 1 C . ASN 183 ? ? N . PRO 184 ? ? 1.31 87 1 C . LEU 202 ? ? N . ARG 203 ? ? 1.31 88 1 C . THR 26 ? ? N . TYR 27 ? ? 1.31 89 1 C . ASP 226 ? ? N . ASN 227 ? ? 1.31 90 1 C . ASP 170 ? ? N . ILE 171 ? ? 1.31 91 1 C . ILE 232 ? ? N . ASN 233 ? ? 1.31 92 1 C . VAL 192 ? ? N . TYR 193 ? ? 1.31 93 1 C . GLY 95 ? ? N . ASN 96 ? ? 1.31 94 1 C . SER 245 ? ? N . GLN 246 ? ? 1.31 95 1 C . SER 103 ? ? N . VAL 104 ? ? 1.31 96 1 C . GLN 308 ? ? N . ALA 309 ? ? 1.31 97 1 C . ARG 11 ? ? N . GLY 12 ? ? 1.31 98 1 C . GLN 61 ? ? N . PHE 62 ? ? 1.31 99 1 C . TYR 76 ? ? N . ALA 77 ? ? 1.31 100 1 C . VAL 13 ? ? N . LEU 14 ? ? 1.31 101 1 C . ASP 16 ? ? N . GLN 17 ? ? 1.31 102 1 C . THR 22 ? ? N . THR 23 ? ? 1.31 103 1 C . ASN 159 ? ? N . GLU 160 ? ? 1.31 104 1 C . ILE 100 ? ? N . ARG 101 ? ? 1.32 105 1 C . GLY 36 ? ? N . ASP 37 ? ? 1.32 106 1 C . GLY 212 ? ? N . ASP 213 ? ? 1.32 107 1 C . ASP 185 ? ? N . TRP 186 ? ? 1.32 108 1 C . GLY 196 ? ? N . ILE 197 ? ? 1.32 109 1 C . PHE 267 ? ? N . TYR 268 ? ? 1.32 110 1 C . ASP 94 ? ? N . GLY 95 ? ? 1.32 111 1 C . LEU 275 ? ? N . THR 276 ? ? 1.32 112 1 C . ARG 285 ? ? N . ALA 286 ? ? 1.32 113 1 C . ALA 309 ? ? N . PHE 310 ? ? 1.32 114 1 C . GLY 154 ? ? N . LEU 155 ? ? 1.32 115 1 C . THR 48 ? ? N . THR 49 ? ? 1.32 116 1 C . ARG 220 ? ? N . TYR 221 ? ? 1.32 117 1 C . HIS 105 ? ? N . TYR 106 ? ? 1.32 118 1 C . ALA 58 ? ? N . ASP 59 ? ? 1.32 119 1 C . ASN 60 ? ? N . GLN 61 ? ? 1.32 120 1 C . THR 2 ? ? N . GLY 3 ? ? 1.32 121 1 C . THR 174 ? ? N . LEU 175 ? ? 1.32 122 1 C . SER 298 ? ? N . THR 299 ? ? 1.32 123 1 C . GLY 3 ? ? N . THR 4 ? ? 1.32 124 1 C . GLY 189 ? ? N . GLU 190 ? ? 1.32 125 1 C . GLU 166 ? ? N . ALA 167 ? ? 1.32 126 1 C . HIS 231 ? ? N . ILE 232 ? ? 1.32 127 1 C . GLU 187 ? ? N . ILE 188 ? ? 1.32 128 1 C . PHE 130 ? ? N . ILE 131 ? ? 1.32 129 1 C . LYS 210 ? ? N . TYR 211 ? ? 1.32 130 1 C . GLY 127 ? ? N . GLN 128 ? ? 1.32 131 1 C . ALA 292 ? ? N . THR 293 ? ? 1.32 132 1 C . SER 107 ? ? N . GLN 108 ? ? 1.32 133 1 C . ASP 207 ? ? N . PRO 208 ? ? 1.32 134 1 C . GLY 252 ? ? N . VAL 253 ? ? 1.32 135 1 C . GLY 248 ? ? N . THR 249 ? ? 1.32 136 1 C . ASP 200 ? ? N . SER 201 ? ? 1.32 137 1 C . MET 205 ? ? N . SER 206 ? ? 1.32 138 1 C . ALA 141 ? ? N . HIS 142 ? ? 1.32 139 1 C . TYR 84 ? ? N . LYS 85 ? ? 1.32 140 1 C . VAL 140 ? ? N . ALA 141 ? ? 1.32 141 1 C . PRO 214 ? ? N . ASP 215 ? ? 1.32 142 1 C . SER 201 ? ? N . LEU 202 ? ? 1.32 143 1 C . ASN 21 ? ? N . THR 22 ? ? 1.32 144 1 C . VAL 139 ? ? N . VAL 140 ? ? 1.32 145 1 C . ALA 288 ? ? N . VAL 289 ? ? 1.32 146 1 C . ALA 73 ? ? N . HIS 74 ? ? 1.32 147 1 C . VAL 303 ? ? N . ALA 304 ? ? 1.32 148 1 C . ILE 164 ? ? N . ASN 165 ? ? 1.32 149 1 C . ASP 82 ? ? N . TYR 83 ? ? 1.32 150 1 C . ASN 111 ? ? N . ASN 112 ? ? 1.32 151 1 C . PHE 310 ? ? N . ASP 311 ? ? 1.32 152 1 C . GLN 246 ? ? N . GLY 247 ? ? 1.32 153 1 C . GLY 52 ? ? N . SER 53 ? ? 1.32 154 1 C . LYS 85 ? ? N . ASN 86 ? ? 1.32 155 1 C . TYR 179 ? ? N . ALA 180 ? ? 1.32 156 1 C . ASP 294 ? ? N . LEU 295 ? ? 1.32 157 1 C . HIS 250 ? ? N . TYR 251 ? ? 1.32 158 1 C . ILE 236 ? ? N . ILE 237 ? ? 1.32 159 1 C . GLN 225 ? ? N . ASP 226 ? ? 1.32 160 1 C . ALA 240 ? ? N . ALA 241 ? ? 1.32 161 1 C . LYS 307 ? ? N . GLN 308 ? ? 1.32 162 1 C . TRP 186 ? ? N . GLU 187 ? ? 1.32 163 1 C . PRO 208 ? ? N . ALA 209 ? ? 1.32 164 1 C . ALA 44 ? ? N . LYS 45 ? ? 1.32 165 1 C . TYR 221 ? ? N . THR 222 ? ? 1.32 166 1 C . GLN 128 ? ? N . THR 129 ? ? 1.32 167 1 C . HIS 74 ? ? N . TYR 75 ? ? 1.32 168 1 C . VAL 313 ? ? N . GLY 314 ? ? 1.32 169 1 C . THR 222 ? ? N . GLY 223 ? ? 1.33 170 1 C . ARG 90 ? ? N . LEU 91 ? ? 1.33 171 1 C . VAL 253 ? ? N . SER 254 ? ? 1.33 172 1 C . SER 234 ? ? N . GLY 235 ? ? 1.33 173 1 C . GLN 301 ? ? N . GLU 302 ? ? 1.33 174 1 C . ALA 113 ? ? N . PHE 114 ? ? 1.33 175 1 C . GLU 119 ? ? N . MET 120 ? ? 1.33 176 1 C . PHE 63 ? ? N . ALA 64 ? ? 1.33 177 1 C . THR 34 ? ? N . ARG 35 ? ? 1.33 178 1 C . THR 299 ? ? N . SER 300 ? ? 1.33 179 1 C . SER 279 ? ? N . ASN 280 ? ? 1.33 180 1 C . TYR 42 ? ? N . ASP 43 ? ? 1.33 181 1 C . PRO 184 ? ? N . ASP 185 ? ? 1.33 182 1 C . ASN 280 ? ? N . PHE 281 ? ? 1.33 183 1 C . ALA 167 ? ? N . ILE 168 ? ? 1.33 184 1 C . TYR 83 ? ? N . TYR 84 ? ? 1.33 185 1 C . ALA 241 ? ? N . TYR 242 ? ? 1.33 186 1 C . GLY 109 ? ? N . TYR 110 ? ? 1.33 187 1 C . ALA 270 ? ? N . LEU 271 ? ? 1.33 188 1 C . ALA 180 ? ? N . ASN 181 ? ? 1.33 189 1 C . VAL 289 ? ? N . GLN 290 ? ? 1.33 190 1 C . GLY 247 ? ? N . GLY 248 ? ? 1.33 191 1 C . THR 249 ? ? N . HIS 250 ? ? 1.33 192 1 C . ILE 137 ? ? N . ASP 138 ? ? 1.33 193 1 C . SER 198 ? ? N . GLY 199 ? ? 1.33 194 1 C . SER 254 ? ? N . VAL 255 ? ? 1.33 195 1 C . GLN 283 ? ? N . LEU 284 ? ? 1.33 196 1 C . THR 224 ? ? N . GLN 225 ? ? 1.33 197 1 C . ILE 244 ? ? N . SER 245 ? ? 1.33 198 1 C . THR 145 ? ? N . HIS 146 ? ? 1.33 199 1 C . ALA 163 ? ? N . ILE 164 ? ? 1.33 200 1 C . GLY 314 ? ? N . VAL 315 ? ? 1.33 201 1 C . LYS 45 ? ? N . TYR 46 ? ? 1.33 202 1 C . TYR 110 ? ? N . ASN 111 ? ? 1.33 203 1 C . SER 53 ? ? N . LEU 54 ? ? 1.33 204 1 C . GLU 143 ? ? N . LEU 144 ? ? 1.33 205 1 C . GLY 297 ? ? N . SER 298 ? ? 1.33 206 1 C . GLY 199 ? ? N . ASP 200 ? ? 1.33 207 1 C . ASP 150 ? ? N . TYR 151 ? ? 1.33 208 1 C . ALA 56 ? ? N . ASP 57 ? ? 1.33 209 1 C . TYR 75 ? ? N . TYR 76 ? ? 1.33 210 1 C . ASP 311 ? ? N . ALA 312 ? ? 1.33 211 1 C . VAL 7 ? ? N . GLY 8 ? ? 1.33 212 1 C . GLY 136 ? ? N . ILE 137 ? ? 1.33 213 1 C . PRO 195 ? ? N . GLY 196 ? ? 1.33 214 1 C . HIS 142 ? ? N . GLU 143 ? ? 1.33 215 1 C . ILE 258 ? ? N . GLY 259 ? ? 1.33 216 1 C . SER 161 ? ? N . GLY 162 ? ? 1.33 217 1 C . THR 276 ? ? N . PRO 277 ? ? 1.33 218 1 C . GLY 257 ? ? N . ILE 258 ? ? 1.33 219 1 C . ASP 32 ? ? N . ASN 33 ? ? 1.33 220 1 C . TYR 93 ? ? N . ASP 94 ? ? 1.33 221 1 C . SER 204 ? ? N . MET 205 ? ? 1.33 222 1 C . ALA 70 ? ? N . VAL 71 ? ? 1.33 223 1 C . SER 65 ? ? N . TYR 66 ? ? 1.33 224 1 C . TYR 217 ? ? N . SER 218 ? ? 1.33 225 1 C . ALA 153 ? ? N . GLY 154 ? ? 1.33 226 1 C . THR 272 ? ? N . GLN 273 ? ? 1.33 227 1 C . PRO 132 ? ? N . LEU 133 ? ? 1.33 228 1 C . ASP 138 ? ? N . VAL 139 ? ? 1.33 229 1 C . ASN 233 ? ? N . SER 234 ? ? 1.33 230 1 C . THR 80 ? ? N . TYR 81 ? ? 1.33 231 1 C . HIS 88 ? ? N . ASN 89 ? ? 1.33 232 1 C . GLY 123 ? ? N . ASP 124 ? ? 1.33 233 1 C . VAL 176 ? ? N . GLU 177 ? ? 1.33 234 1 C . GLU 177 ? ? N . PHE 178 ? ? 1.33 235 1 C . VAL 306 ? ? N . LYS 307 ? ? 1.33 236 1 C . VAL 71 ? ? N . ASP 72 ? ? 1.33 237 1 C . SER 282 ? ? N . GLN 283 ? ? 1.33 238 1 C . LEU 284 ? ? N . ARG 285 ? ? 1.33 239 1 C . LYS 262 ? ? N . LEU 263 ? ? 1.33 240 1 C . LYS 265 ? ? N . ILE 266 ? ? 1.33 241 1 C . VAL 255 ? ? N . VAL 256 ? ? 1.33 242 1 C . TYR 157 ? ? N . GLN 158 ? ? 1.33 243 1 C . SER 134 ? ? N . GLY 135 ? ? 1.33 244 1 C . THR 152 ? ? N . ALA 153 ? ? 1.33 245 1 C . LEU 243 ? ? N . ILE 244 ? ? 1.33 246 1 C . ASP 261 ? ? N . LYS 262 ? ? 1.33 247 1 C . ASP 43 ? ? N . ALA 44 ? ? 1.33 248 1 C . VAL 230 ? ? N . HIS 231 ? ? 1.34 249 1 C . SER 206 ? ? N . ASP 207 ? ? 1.34 250 1 C . LEU 91 ? ? N . SER 92 ? ? 1.34 251 1 C . SER 305 ? ? N . VAL 306 ? ? 1.34 252 1 C . ASN 97 ? ? N . ALA 98 ? ? 1.34 253 1 C . ALA 286 ? ? N . ALA 287 ? ? 1.34 254 1 C . ASN 181 ? ? N . LYS 182 ? ? 1.34 255 1 C . ILE 1 ? ? N . THR 2 ? ? 1.34 256 1 C . ASP 59 ? ? N . ASN 60 ? ? 1.34 257 1 C . THR 4 ? ? N . SER 5 ? ? 1.34 258 1 C . ARG 269 ? ? N . ALA 270 ? ? 1.34 259 1 C . ALA 77 ? ? N . GLY 78 ? ? 1.34 260 1 C . 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