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(N.Y.)' _citation.journal_volume 18 _citation.page_first 143 _citation.page_last 147 _citation.year 2012 _citation.journal_id_ASTM NAMEFI _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 1078-8956 _citation.journal_id_CSD 2148 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 22198278 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/nm.2582 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Sela-Passwell, N.' 1 primary 'Kikkeri, R.' 2 primary 'Dym, O.' 3 primary 'Rozenberg, H.' 4 primary 'Margalit, R.' 5 primary 'Arad-Yellin, R.' 6 primary 'Eisenstein, M.' 7 primary 'Brenner, O.' 8 primary 'Shoham, T.' 9 primary 'Danon, T.' 10 primary 'Shanzer, A.' 11 primary 'Sagi, I.' 12 # _cell.entry_id 3UTZ _cell.length_a 83.095 _cell.length_b 108.369 _cell.length_c 86.466 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 111.91 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 PDB 3UTZ 3UTZ 1 ? ? ? 2 PDB 3UTZ 3UTZ 2 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3UTZ A 1 ? 219 ? 3UTZ 1 ? 219 ? 1 219 2 1 3UTZ D 1 ? 219 ? 3UTZ 1 ? 219 ? 1 219 3 1 3UTZ E 1 ? 219 ? 3UTZ 1 ? 219 ? 1 219 4 2 3UTZ B 1 ? 225 ? 3UTZ 1 ? 225 ? 1 225 5 2 3UTZ C 1 ? 225 ? 3UTZ 1 ? 225 ? 1 225 6 2 3UTZ F 1 ? 225 ? 3UTZ 1 ? 225 ? 1 225 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 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LYS F 207 ASN F 210 5 ? 4 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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PRO 8 A 1 -2.46 2 VAL 99 A . ? VAL 99 A PRO 100 A ? PRO 100 A 1 -0.10 3 TYR 145 A . ? TYR 145 A PRO 146 A ? PRO 146 A 1 -2.05 4 PHE 152 B . ? PHE 152 B PRO 153 B ? PRO 153 B 1 -6.57 5 GLU 154 B . ? GLU 154 B PRO 155 B ? PRO 155 B 1 4.22 6 THR 7 C . ? THR 7 D PRO 8 C ? PRO 8 D 1 -7.88 7 VAL 99 C . ? VAL 99 D PRO 100 C ? PRO 100 D 1 -0.92 8 TYR 145 C . ? TYR 145 D PRO 146 C ? PRO 146 D 1 4.93 9 PHE 152 D . ? PHE 152 C PRO 153 D ? PRO 153 C 1 -11.45 10 GLU 154 D . ? GLU 154 C PRO 155 D ? PRO 155 C 1 -1.05 11 THR 7 E . ? THR 7 E PRO 8 E ? PRO 8 E 1 0.71 12 VAL 99 E . ? VAL 99 E PRO 100 E ? PRO 100 E 1 -5.25 13 TYR 145 E . ? TYR 145 E PRO 146 E ? PRO 146 E 1 6.91 14 PHE 152 F . ? PHE 152 F PRO 153 F ? PRO 153 F 1 -5.93 15 GLU 154 F . ? GLU 154 F PRO 155 F ? PRO 155 F 1 8.15 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 4 ? B ? 6 ? C ? 4 ? D ? 4 ? E ? 4 ? F ? 4 ? G ? 6 ? H ? 4 ? I ? 4 ? J ? 4 ? K ? 3 ? L ? 4 ? M ? 6 ? N ? 4 ? O ? 4 ? P ? 4 ? Q ? 4 ? R ? 6 ? S ? 4 ? T ? 4 ? U ? 4 ? V ? 3 ? W ? 4 ? X ? 6 ? Y ? 4 ? Z ? 4 ? AA ? 4 ? AB ? 4 ? AC ? 6 ? AD ? 4 ? AE ? 4 ? AF ? 4 ? 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F . n # _pdbx_SG_project.id 1 _pdbx_SG_project.project_name ? _pdbx_SG_project.full_name_of_center 'Israel Structural Proteomics Center' _pdbx_SG_project.initial_of_center ISPC # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 3 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 4 software_defined_assembly PISA hexameric 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,G,H,I,J,K,Q 2 1 C,D,L,M,N,R 3 1 E,F,O,P,S,T 4 2 A,B,G,H,I,J,K,Q 4 1 C,D,E,F,L,M,N,O,P,R,S,T # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 3950 ? 1 MORE -66 ? 1 'SSA (A^2)' 18430 ? 2 'ABSA (A^2)' 3610 ? 2 MORE -55 ? 2 'SSA (A^2)' 18320 ? 3 'ABSA (A^2)' 3850 ? 3 MORE -73 ? 3 'SSA (A^2)' 19330 ? 4 'ABSA (A^2)' 13590 ? 4 MORE -238 ? 4 'SSA (A^2)' 53900 ? # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 2 'crystal symmetry operation' 2_656 -x+1,y+1/2,-z+1 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 50.8302367541 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 54.1845000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 80.2206594880 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2011-12-14 2 'Structure model' 1 1 2012-03-21 3 'Structure model' 1 2 2013-10-02 4 'Structure model' 1 3 2014-03-26 5 'Structure model' 1 4 2017-03-15 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Source and taxonomy' 3 4 'Structure model' 'Database references' 4 5 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal DNA 'data collection' . ? 1 PHASER phasing . ? 2 REFMAC refinement 5.5.0102 ? 3 HKL-2000 'data reduction' . ? 4 SCALEPACK 'data scaling' . ? 5 # _pdbx_validate_close_contact.id 1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 SG _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 B _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 CYS _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 146 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 SG _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 B _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 CYS _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 202 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_close_contact.dist 1.16 # _pdbx_validate_rmsd_angle.id 1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 CA _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 B _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 CYS _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 146 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 CB _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 B _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 CYS _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 146 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 SG _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 B _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 CYS _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 146 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 ? _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value 125.84 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value 114.20 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation 11.64 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation 1.10 _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ASN A 33 ? 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