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;MARLTAYERRKFRVRNRIKRTGRLRLSVFRSLKHIYAQIIDDEKGVTLVSASSLALKLKGNKTEVARQVGRALAEKALAL GIKQVAFDRGPYKYHGRVKALAEGAREGGLEF ; ;MARLTAYERRKFRVRNRIKRTGRLRLSVFRSLKHIYAQIIDDEKGVTLVSASSLALKLKGNKTEVARQVGRALAEKALAL GIKQVAFDRGPYKYHGRVKALAEGAREGGLEF ; S ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MNRGALIKLVESRYVRTDLPEFRPGDTVRVSYKVKEGNRTRIQDFEGIVIRIRRNGFNTTFTVRKVSYGVGVERIFPLHS PLIQKIDIVQRGRARRAKLYFIRNLSDREIRRKLRADRKRIDQDRAAERAAKEEAQKAQEPKASQE ; ;MNRGALIKLVESRYVRTDLPEFRPGDTVRVSYKVKEGNRTRIQDFEGIVIRIRRNGFNTTFTVRKVSYGVGVERIFPLHS PLIQKIDIVQRGRARRAKLYFIRNLSDREIRRKLRADRKRIDQDRAAERAAKEEAQKAQEPKASQE ; T ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MPRAKTGVVRRRKHKKILKLAKGYWGLRSKSFRKARETLFAAGNYAYAHRKRRKRDFRRLWIVRINAACRQHGLNYSTFI HGLKKAGIEVDRKNLADLAVREPQVFAELVERAKAAQG ; ;MPRAKTGVVRRRKHKKILKLAKGYWGLRSKSFRKARETLFAAGNYAYAHRKRRKRDFRRLWIVRINAACRQHGLNYSTFI HGLKKAGIEVDRKNLADLAVREPQVFAELVERAKAAQG ; U ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MFAIVKTGGKQYRVEPGLKLRVEKLDAEPGATVELPVLLLGGEKTVVGTPVVEGASVVAEVLGHGRGKKILVSKFKAKVQ YRRKKGHRQPYTELLIKEIRG ; ;MFAIVKTGGKQYRVEPGLKLRVEKLDAEPGATVELPVLLLGGEKTVVGTPVVEGASVVAEVLGHGRGKKILVSKFKAKVQ YRRKKGHRQPYTELLIKEIRG ; V ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MEAKAIARYVRISPRKVRLVVDLIRGKSLEEARNILRYTNKRGAYFVAKVLESAAANAVNNHDMLEDRLYVKAAYVDEGP ALKRVLPRARGRADIIKKRTSHITVILGEKHGK ; ;MEAKAIARYVRISPRKVRLVVDLIRGKSLEEARNILRYTNKRGAYFVAKVLESAAANAVNNHDMLEDRLYVKAAYVDEGP ALKRVLPRARGRADIIKKRTSHITVILGEKHGK ; W ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MKTAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAI VQVAPGQKIEALEGLI ; ;MKTAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAI VQVAPGQKIEALEGLI ; X ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MRVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACG KPTRVRKKFLENGKKIRVCAKCGGALDTEE ; ;MRVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACG KPTRVRKKFLENGKKIRVCAKCGGALDTEE ; Y ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MEYRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRR RRPEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPG VELAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAAEVAEPEVIKKGKEEEEE ; ;MEYRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRR RRPEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPG VELAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAAEVAEPEVIKKGKEEEEE ; Z ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MAHKKGLGSTRNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVH VRPLA ; ;MAHKKGLGSTRNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVH VRPLA ; 0 ? 23 'polypeptide(L)' no no ;MSKVCEISGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGL KLEGLSPKEIKKELLKLL ; ;MSKVCEISGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGL KLEGLSPKEIKKELLKLL ; 1 ? 24 'polypeptide(L)' no no MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLTVLNEKRRQNA MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLTVLNEKRRQNA 2 ? 25 'polypeptide(L)' no no MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVVE MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVVE 3 ? 26 'polypeptide(L)' no no MKEGIHPKLVPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKCHPFYTGQQRFVDTEGRVERFQRRYGDSYRKGR MKEGIHPKLVPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKCHPFYTGQQRFVDTEGRVERFQRRYGDSYRKGR 4 ? 27 'polypeptide(L)' no no MAKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPTLVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYAGRKVLEV MAKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPTLVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYAGRKVLEV 5 ? 28 'polypeptide(L)' no no MASEVRIKLLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREVKI MASEVRIKLLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREVKI 6 ? 29 'polypeptide(L)' no no MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRKR MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRKR 7 ? 30 'polypeptide(L)' no no MPKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPYE MPKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPYE 8 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 G n 1 2 U n 1 3 C n 1 4 A n 1 5 A n 1 6 G n 1 7 A n 1 8 U n 1 9 G n 1 10 G n 1 11 U n 1 12 A n 1 13 A n 1 14 G n 1 15 G n 1 16 G n 1 17 C n 1 18 C n 1 19 C n 1 20 A n 1 21 C n 1 22 G n 1 23 G n 1 24 U n 1 25 G n 1 26 G n 1 27 A n 1 28 U n 1 29 G n 1 30 C n 1 31 C n 1 32 U n 1 33 C n 1 34 G n 1 35 G n 1 36 C n 1 37 A n 1 38 C n 1 39 C n 1 40 C n 1 41 G n 1 42 A n 1 43 G n 1 44 C n 1 45 C n 1 46 G n 1 47 A n 1 48 U n 1 49 G n 1 50 A n 1 51 A n 1 52 G n 1 53 G n 1 54 A n 1 55 C n 1 56 G n 1 57 U n 1 58 G n 1 59 G n 1 60 C n 1 61 U n 1 62 A n 1 63 C n 1 64 C n 1 65 U n 1 66 G n 1 67 C n 1 68 G n 1 69 A n 1 70 U n 1 71 A n 1 72 A n 1 73 G n 1 74 C n 1 75 C n 1 76 A n 1 77 G n 1 78 G n 1 79 G n 1 80 G n 1 81 G n 1 82 A n 1 83 G n 1 84 C n 1 85 C n 1 86 G n 1 87 G n 1 88 U n 1 89 A n 1 90 G n 1 91 C n 1 92 G n 1 93 G n 1 94 G n 1 95 C n 1 96 G n 1 97 U n 1 98 G n 1 99 G n 1 100 A n 1 101 U n 1 102 C n 1 103 C n 1 104 C n 1 105 U n 1 106 G n 1 107 G n 1 108 A n 1 109 U n 1 110 G n 1 111 U n 1 112 C n 1 113 C n 1 114 G n 1 115 A n 1 116 A n 1 117 U n 1 118 G n 1 119 G n 1 120 G n 1 121 G n 1 122 G n 1 123 A n 1 124 A n 1 125 C n 1 126 C n 1 127 C n 1 128 G n 1 129 G n 1 130 C n 1 131 C n 1 132 G n 1 133 G n 1 134 C n 1 135 G n 1 136 G n 1 137 G n 1 138 A n 1 139 A n 1 140 C n 1 141 G n 1 142 C n 1 143 C n 1 144 G n 1 145 G n 1 146 U n 1 147 C n 1 148 A n 1 149 C n 1 150 C n 1 151 G n 1 152 C n 1 153 G n 1 154 C n 1 155 U n 1 156 U n 1 157 U n 1 158 U n 1 159 G n 1 160 C n 1 161 G n 1 162 C n 1 163 G n 1 164 G n 1 165 G n 1 166 G n 1 167 G n 1 168 G n 1 169 A n 1 170 A n 1 171 C n 1 172 C n 1 173 U n 1 174 G n 1 175 G n 1 176 G n 1 177 G n 1 178 A n 1 179 A n 1 180 C n 1 181 U n 1 182 G n 1 183 A n 1 184 A n 1 185 A n 1 186 C n 1 187 A n 1 188 U n 1 189 C n 1 190 U n 1 191 C n 1 192 A n 1 193 G n 1 194 U n 1 195 A n 1 196 C n 1 197 C n 1 198 C n 1 199 A n 1 200 G n 1 201 A n 1 202 G n 1 203 G n 1 204 A n 1 205 G n 1 206 A n 1 207 G n 1 208 G n 1 209 A n 1 210 A n 1 211 A n 1 212 G n 1 213 A n 1 214 G n 1 215 A n 1 216 A n 1 217 A n 1 218 U n 1 219 C n 1 220 G n 1 221 A n 1 222 C n 1 223 U n 1 224 C n 1 225 C n 1 226 C n 1 227 U n 1 228 G n 1 229 A n 1 230 G n 1 231 U n 1 232 A n 1 233 G n 1 234 C n 1 235 G n 1 236 G n 1 237 C n 1 238 G n 1 239 A n 1 240 G n 1 241 C n 1 242 G n 1 243 A n 1 244 A n 1 245 A n 1 246 G n 1 247 G n 1 248 G n 1 249 G n 1 250 A n 1 251 C n 1 252 C n 1 253 A n 1 254 G n 1 255 C n 1 256 C n 1 257 U n 1 258 A n 1 259 A n 1 260 A n 1 261 C n 1 262 C n 1 263 G n 1 264 U n 1 265 C n 1 266 C n 1 267 G n 1 268 G n 1 269 C n 1 270 U n 1 271 U n 1 272 G n 1 273 U n 1 274 C n 1 275 C n 1 276 G n 1 277 G n 1 278 G n 1 279 C n 1 280 G n 1 281 G n 1 282 G n 1 283 G n 1 284 U n 1 285 C n 1 286 G n 1 287 G n 1 288 G n 1 289 G n 1 290 G n 1 291 G n 1 292 C n 1 293 C n 1 294 C n 1 295 U n 1 296 C n 1 297 G n 1 298 G n 1 299 A n 1 300 C n 1 301 A n 1 302 C n 1 303 C n 1 304 G n 1 305 A n 1 306 A n 1 307 U n 1 308 C n 1 309 C n 1 310 C n 1 311 C n 1 312 A n 1 313 G n 1 314 C n 1 315 C n 1 316 U n 1 317 A n 1 318 G n 1 319 C n 1 320 C n 1 321 G n 1 322 A n 1 323 A n 1 324 G n 1 325 C n 1 326 U n 1 327 G n 1 328 U n 1 329 U n 1 330 G n 1 331 G n 1 332 G n 1 333 A n 1 334 A n 1 335 G n 1 336 C n 1 337 A n 1 338 G n 1 339 C n 1 340 G n 1 341 C n 1 342 C n 1 343 A n 1 344 G n 1 345 A n 1 346 G n 1 347 A n 1 348 G n 1 349 G n 1 350 G n 1 351 U n 1 352 G n 1 353 A n 1 354 A n 1 355 A n 1 356 G n 1 357 C n 1 358 C n 1 359 C n 1 360 C n 1 361 G n 1 362 U n 1 363 A n 1 364 G n 1 365 G n 1 366 C n 1 367 G n 1 368 A n 1 369 A n 1 370 A n 1 371 G n 1 372 G n 1 373 U n 1 374 G n 1 375 G n 1 376 G n 1 377 G n 1 378 G n 1 379 G n 1 380 A n 1 381 U n 1 382 A n 1 383 G n 1 384 G n 1 385 U n 1 386 G n 1 387 A n 1 388 G n 1 389 G n 1 390 G n 1 391 U n 1 392 A n 1 393 C n 1 394 C n 1 395 C n 1 396 G n 1 397 A n 1 398 G n 1 399 U n 1 400 A n 1 401 C n 1 402 C n 1 403 C n 1 404 C n 1 405 G n 1 406 U n 1 407 G n 1 408 G n 1 409 U n 1 410 U n 1 411 C n 1 412 G n 1 413 U n 1 414 G n 1 415 G n 1 416 A n 1 417 G n 1 418 C n 1 419 C n 1 420 A n 1 421 U n 1 422 G n 1 423 G n 1 424 G n 1 425 G n 1 426 G n 1 427 A n 1 428 A n 1 429 U n 1 430 C n 1 431 U n 1 432 G n 1 433 G n 1 434 G n 1 435 C n 1 436 G n 1 437 G n 1 438 A n 1 439 C n 1 440 C n 1 441 A n 1 442 C n 1 443 C n 1 444 G n 1 445 C n 1 446 C n 1 447 U n 1 448 A n 1 449 A n 1 450 G n 1 451 G n 1 452 C n 1 453 U n 1 454 A n 1 455 A n 1 456 G n 1 457 U n 1 458 A n 1 459 C n 1 460 U n 1 461 C n 1 462 C n 1 463 G n 1 464 G n 1 465 G n 1 466 U n 1 467 G n 1 468 A n 1 469 C n 1 470 C n 1 471 G n 1 472 A n 1 473 U n 1 474 A n 1 475 G n 1 476 C n 1 477 G n 1 478 C n 1 479 A n 1 480 C n 1 481 C n 1 482 A n 1 483 G n 1 484 U n 1 485 A n 1 486 C n 1 487 C n 1 488 G n 1 489 U n 1 490 G n 1 491 A n 1 492 G n 1 493 G n 1 494 G n 1 495 A n 1 496 A n 1 497 A n 1 498 G n 1 499 G n 1 500 U n 1 501 G n 1 502 A n 1 503 A n 1 504 A n 1 505 A n 1 506 G n 1 507 A n 1 508 A n 1 509 C n 1 510 C n 1 511 C n 1 512 C n 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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 3UXR _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 293 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 7.6 _exptl_crystal_grow.pdbx_details '2.9% PEG 20K, 9% MPD, 0.1M Tris-HCl pH 7.6, 175 mM L-Arginine, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector 'AREA DETECTOR' _diffrn_detector.type 'DECTRIS PILATUS 6M' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2011-04-17 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? 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? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' f_angle_d 1.164 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 3UXR _struct.title ;The structure of thermorubin in complex with the 70S ribosome from Thermus thermophilus. This file contains the 50S subunit of one 70S ribosome. The entire crystal structure contains two 70S ribosomes. ; _struct.pdbx_descriptor 'PROTEIN/RNA Complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3UXR _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME/antibiotic _struct_keywords.text 'Ribosome, Protein synthesis, Thermorubin, RIBOSOME-antibiotic complex' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? 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'G-A MISPAIR' ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ARG 274 C . ? ARG 274 D LYS 275 C ? LYS 275 D 1 12.98 2 GLY 29 D . ? GLY 29 E PRO 30 D ? PRO 30 E 1 -17.22 3 GLY 71 D . ? GLY 71 E VAL 72 D ? VAL 72 E 1 -1.66 4 VAL 72 D . ? 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AY ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel D 5 6 ? anti-parallel D 6 7 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel F 3 4 ? anti-parallel F 4 5 ? anti-parallel F 5 6 ? anti-parallel F 6 7 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel I 1 2 ? parallel I 2 3 ? parallel I 3 4 ? parallel I 4 5 ? parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? anti-parallel Q 1 2 ? parallel Q 2 3 ? anti-parallel R 1 2 ? parallel R 2 3 ? parallel R 3 4 ? parallel S 1 2 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? anti-parallel T 4 5 ? anti-parallel T 5 6 ? parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? anti-parallel U 4 5 ? anti-parallel U 5 6 ? anti-parallel U 6 7 ? anti-parallel V 1 2 ? parallel W 1 2 ? parallel W 2 3 ? parallel X 1 2 ? parallel X 2 3 ? parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Y 3 4 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel Z 2 3 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? anti-parallel AD 3 4 ? anti-parallel AD 4 5 ? anti-parallel AD 5 6 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel AE 2 3 ? anti-parallel AE 3 4 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AG 1 2 ? anti-parallel AG 2 3 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AH 2 3 ? anti-parallel AH 3 4 ? anti-parallel AI 1 2 ? anti-parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AJ 3 4 ? anti-parallel AJ 4 5 ? anti-parallel AK 1 2 ? anti-parallel AL 1 2 ? anti-parallel AL 2 3 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AM 2 3 ? anti-parallel AM 3 4 ? parallel AM 4 5 ? anti-parallel AM 5 6 ? anti-parallel AM 6 7 ? parallel AN 1 2 ? anti-parallel AO 1 2 ? parallel AP 1 2 ? anti-parallel AP 2 3 ? anti-parallel AQ 1 2 ? anti-parallel AQ 2 3 ? anti-parallel AQ 3 4 ? anti-parallel AR 1 2 ? anti-parallel AR 2 3 ? anti-parallel AR 3 4 ? parallel AS 1 2 ? anti-parallel AT 1 2 ? anti-parallel AU 1 2 ? anti-parallel AU 2 3 ? anti-parallel AV 1 2 ? anti-parallel AV 2 3 ? parallel AW 1 2 ? anti-parallel AX 1 2 ? anti-parallel AX 2 3 ? anti-parallel AX 3 4 ? anti-parallel AY 1 2 ? anti-parallel AY 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 LYS C 4 ? 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"C1'" A U 1263 ? ? 126.55 117.70 8.85 1.20 N 204 1 N1 A A 1275 ? ? C6 A A 1275 ? ? N6 A A 1275 ? ? 122.32 118.60 3.72 0.60 N 205 1 C6 A C 1290 ? ? N1 A C 1290 ? ? C2 A C 1290 ? ? 117.77 120.30 -2.53 0.40 N 206 1 N3 A C 1290 ? ? C4 A C 1290 ? ? C5 A C 1290 ? ? 119.08 121.90 -2.82 0.40 N 207 1 N1 A C 1298 ? ? C2 A C 1298 ? ? O2 A C 1298 ? ? 122.91 118.90 4.01 0.60 N 208 1 N3 A U 1313 ? ? C2 A U 1313 ? ? O2 A U 1313 ? ? 117.81 122.20 -4.39 0.70 N 209 1 C2 A U 1313 ? ? N1 A U 1313 ? ? "C1'" A U 1313 ? ? 127.70 117.70 10.00 1.20 N 210 1 N1 A G 1324 ? ? C6 A G 1324 ? ? O6 A G 1324 ? ? 124.13 119.90 4.23 0.60 N 211 1 C5 A U 1326 ? ? C6 A U 1326 ? ? N1 A U 1326 ? ? 119.18 122.70 -3.52 0.50 N 212 1 N1 A G 1332 ? ? C2 A G 1332 ? ? N3 A G 1332 ? ? 128.30 123.90 4.40 0.60 N 213 1 C2 A G 1332 ? ? N3 A G 1332 ? ? C4 A G 1332 ? ? 102.08 111.90 -9.82 0.50 N 214 1 N3 A G 1332 ? ? C4 A G 1332 ? ? C5 A G 1332 ? ? 137.59 128.60 8.99 0.50 N 215 1 C5 A G 1332 ? ? C6 A G 1332 ? ? N1 A G 1332 ? ? 107.56 111.50 -3.94 0.50 N 216 1 C4 A G 1332 ? ? C5 A G 1332 ? ? N7 A G 1332 ? ? 114.46 110.80 3.66 0.40 N 217 1 C5 A G 1332 ? ? N7 A G 1332 ? ? C8 A G 1332 ? ? 97.40 104.30 -6.90 0.50 N 218 1 N7 A G 1332 ? ? C8 A G 1332 ? ? N9 A G 1332 ? ? 118.09 113.10 4.99 0.50 N 219 1 C8 A G 1332 ? ? N9 A G 1332 ? ? C4 A G 1332 ? ? 103.58 106.40 -2.82 0.40 N 220 1 N3 A G 1332 ? ? C4 A G 1332 ? ? N9 A G 1332 ? ? 115.94 126.00 -10.06 0.60 N 221 1 N3 A G 1332 ? ? C2 A G 1332 ? ? N2 A G 1332 ? ? 112.72 119.90 -7.18 0.70 N 222 1 N1 A G 1332 ? ? C6 A G 1332 ? ? O6 A G 1332 ? ? 126.51 119.90 6.61 0.60 N 223 1 C4 A G 1343 ? ? N9 A G 1343 ? ? "C1'" A G 1343 ? ? 134.46 126.50 7.96 1.30 N 224 1 N1 A A 1359 ? ? C2 A A 1359 ? ? N3 A A 1359 ? ? 125.80 129.30 -3.50 0.50 N 225 1 C5 A U 1372 ? ? C6 A U 1372 ? ? N1 A U 1372 ? ? 127.02 122.70 4.32 0.50 N 226 1 C5 A U 1372 ? ? C4 A U 1372 ? ? O4 A U 1372 ? ? 121.98 125.90 -3.92 0.60 N 227 1 N3 A C 1383 ? ? C2 A C 1383 ? ? O2 A C 1383 ? ? 127.12 121.90 5.22 0.70 N 228 1 C6 A C 1506 ? ? N1 A C 1506 ? ? C2 A C 1506 ? ? 117.47 120.30 -2.83 0.40 N 229 1 C6 A U 1602 ? ? N1 A U 1602 ? ? C2 A U 1602 ? ? 116.84 121.00 -4.16 0.60 N 230 1 N3 A U 1602 ? ? C4 A U 1602 ? ? C5 A U 1602 ? ? 106.79 114.60 -7.81 0.60 N 231 1 C4 A U 1602 ? ? C5 A U 1602 ? ? C6 A U 1602 ? ? 124.03 119.70 4.33 0.60 N 232 1 N3 A U 1602 ? ? C4 A U 1602 ? ? O4 A U 1602 ? ? 123.76 119.40 4.36 0.70 N 233 1 C5 A G 1613 ? ? C6 A G 1613 ? ? O6 A G 1613 ? ? 132.80 128.60 4.20 0.60 N 234 1 N1 A C 1617 ? ? C2 A C 1617 ? ? O2 A C 1617 ? ? 114.74 118.90 -4.16 0.60 N 235 1 C5 A G 1633 ? ? C6 A G 1633 ? ? N1 A G 1633 ? ? 108.36 111.50 -3.14 0.50 N 236 1 C6 A C 1638 ? ? N1 A C 1638 ? ? C2 A C 1638 ? ? 122.97 120.30 2.67 0.40 N 237 1 N3 A G 1653 ? ? C4 A G 1653 ? ? C5 A G 1653 ? ? 125.43 128.60 -3.17 0.50 N 238 1 N3 A C 1656 ? ? C4 A C 1656 ? ? C5 A C 1656 ? ? 119.05 121.90 -2.85 0.40 N 239 1 N3 A U 1671 ? ? C4 A U 1671 ? ? C5 A U 1671 ? ? 109.02 114.60 -5.58 0.60 N 240 1 N3 A U 1671 ? ? C4 A U 1671 ? ? O4 A U 1671 ? ? 126.78 119.40 7.38 0.70 N 241 1 C2 A A 1698 ? ? N3 A A 1698 ? ? C4 A A 1698 ? ? 106.88 110.60 -3.72 0.50 N 242 1 C4 A G 1699 ? ? C5 A G 1699 ? ? N7 A G 1699 ? ? 107.94 110.80 -2.86 0.40 N 243 1 C8 A G 1699 ? ? N9 A G 1699 ? ? C4 A G 1699 ? ? 103.82 106.40 -2.58 0.40 N 244 1 N9 A G 1699 ? ? C4 A G 1699 ? ? C5 A G 1699 ? ? 108.80 105.40 3.40 0.40 N 245 1 N1 A G 1699 ? ? C6 A G 1699 ? ? O6 A G 1699 ? ? 116.25 119.90 -3.65 0.60 N 246 1 C5 A G 1699 ? ? C6 A G 1699 ? ? O6 A G 1699 ? ? 132.93 128.60 4.33 0.60 N 247 1 C4 A G 1772 ? ? C5 A G 1772 ? ? N7 A G 1772 ? ? 108.26 110.80 -2.54 0.40 N 248 1 N1 A G 1772 ? ? C6 A G 1772 ? ? O6 A G 1772 ? ? 115.54 119.90 -4.36 0.60 N 249 1 C5 A G 1772 ? ? C6 A G 1772 ? ? O6 A G 1772 ? ? 132.51 128.60 3.91 0.60 N 250 1 C4 A U 1779 ? ? C5 A U 1779 ? ? C6 A U 1779 ? ? 124.81 119.70 5.11 0.60 N 251 1 C5 A U 1779 ? ? C6 A U 1779 ? ? N1 A U 1779 ? ? 115.22 122.70 -7.48 0.50 N 252 1 C5 A U 1779 ? ? C4 A U 1779 ? ? O4 A U 1779 ? ? 129.59 125.90 3.69 0.60 N 253 1 C2 A U 1779 ? ? N1 A U 1779 ? ? "C1'" A U 1779 ? ? 106.96 117.70 -10.74 1.20 N 254 1 C5 A A 1784 ? ? N7 A A 1784 ? ? C8 A A 1784 ? ? 107.65 103.90 3.75 0.50 N 255 1 N7 A A 1784 ? ? C8 A A 1784 ? ? N9 A A 1784 ? ? 109.57 113.80 -4.23 0.50 N 256 1 C8 A A 1784 ? ? N9 A A 1784 ? ? C4 A A 1784 ? ? 108.95 105.80 3.15 0.40 N 257 1 C6 A A 1791 ? ? C5 A A 1791 ? ? N7 A A 1791 ? ? 127.99 132.30 -4.31 0.70 N 258 1 N1 A A 1791 ? ? C6 A A 1791 ? ? N6 A A 1791 ? ? 123.26 118.60 4.66 0.60 N 259 1 N1 A A 1819 ? ? C6 A A 1819 ? ? N6 A A 1819 ? ? 114.87 118.60 -3.73 0.60 N 260 1 C6 A C 1827 ? ? N1 A C 1827 ? ? C2 A C 1827 ? ? 117.67 120.30 -2.63 0.40 N 261 1 N3 A C 1827 ? ? C2 A C 1827 ? ? O2 A C 1827 ? ? 117.04 121.90 -4.86 0.70 N 262 1 N1 A G 1828 ? ? C6 A G 1828 ? ? O6 A G 1828 ? ? 116.17 119.90 -3.73 0.60 N 263 1 C5 A G 1828 ? ? C6 A G 1828 ? ? O6 A G 1828 ? ? 134.81 128.60 6.21 0.60 N 264 1 C4 A G 1840 ? ? C5 A G 1840 ? ? C6 A G 1840 ? ? 122.60 118.80 3.80 0.60 N 265 1 C6 A G 1840 ? ? C5 A G 1840 ? ? N7 A G 1840 ? ? 126.70 130.40 -3.70 0.60 N 266 1 N1 A G 1840 ? ? C6 A G 1840 ? ? O6 A G 1840 ? ? 123.88 119.90 3.98 0.60 N 267 1 C4 A G 1840 ? ? N9 A G 1840 ? ? "C1'" A G 1840 ? ? 134.73 126.50 8.23 1.30 N 268 1 C2 A C 1882 ? ? N1 A C 1882 ? ? "C1'" A C 1882 ? ? 125.52 118.80 6.72 1.10 N 269 1 "C3'" A A 1913 ? ? "C2'" A A 1913 ? ? "C1'" A A 1913 ? ? 96.41 101.30 -4.89 0.70 N 270 1 "O4'" A A 1913 ? ? "C1'" A A 1913 ? ? N9 A A 1913 ? ? 101.95 108.20 -6.25 0.80 N 271 1 "C4'" A U 1915 ? ? "C3'" A U 1915 ? ? "C2'" A U 1915 ? ? 91.50 102.60 -11.10 1.00 N 272 1 "O4'" A U 1915 ? ? "C1'" A U 1915 ? ? N1 A U 1915 ? ? 113.50 108.50 5.00 0.70 N 273 1 C6 A U 1951 ? ? N1 A U 1951 ? ? C2 A U 1951 ? ? 117.25 121.00 -3.75 0.60 N 274 1 N3 A U 1951 ? ? C4 A U 1951 ? ? C5 A U 1951 ? ? 110.34 114.60 -4.26 0.60 N 275 1 C5 A U 1955 ? ? C6 A U 1955 ? ? N1 A U 1955 ? ? 119.46 122.70 -3.24 0.50 N 276 1 C2 A U 1963 ? ? N1 A U 1963 ? ? "C1'" A U 1963 ? ? 127.09 117.70 9.39 1.20 N 277 1 C6 A C 1979 ? ? N1 A C 1979 ? ? C2 A C 1979 ? ? 117.65 120.30 -2.65 0.40 N 278 1 C6 A C 1982 ? ? N1 A C 1982 ? ? C2 A C 1982 ? ? 117.39 120.30 -2.91 0.40 N 279 1 N3 A C 1982 ? ? C4 A C 1982 ? ? C5 A C 1982 ? ? 119.33 121.90 -2.57 0.40 N 280 1 C2 A C 1982 ? ? N1 A C 1982 ? ? "C1'" A C 1982 ? ? 125.43 118.80 6.63 1.10 N 281 1 C4 A G 1997 ? ? N9 A G 1997 ? ? "C1'" A G 1997 ? ? 118.26 126.50 -8.24 1.30 N 282 1 N1 A U 2022 ? ? C2 A U 2022 ? ? N3 A U 2022 ? ? 111.22 114.90 -3.68 0.60 N 283 1 C5 A U 2022 ? ? C4 A U 2022 ? ? O4 A U 2022 ? ? 121.12 125.90 -4.78 0.60 N 284 1 C6 A U 2028 ? ? N1 A U 2028 ? ? C2 A U 2028 ? ? 116.38 121.00 -4.62 0.60 N 285 1 C2 A U 2028 ? ? N3 A U 2028 ? ? C4 A U 2028 ? ? 131.50 127.00 4.50 0.60 N 286 1 N3 A U 2028 ? ? C4 A U 2028 ? ? C5 A U 2028 ? ? 106.31 114.60 -8.29 0.60 N 287 1 C4 A U 2028 ? ? C5 A U 2028 ? ? 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A G 1134 53 1 Y 1 A U 1093 ? A U 1135 54 1 Y 1 A G 1094 ? A G 1136 55 1 Y 1 A C 1095 ? A C 1137 56 1 Y 1 A G 1096 ? A G 1138 57 1 Y 1 A U 1097 ? A U 1139 58 1 Y 1 A A 1098 ? A A 1140 59 1 Y 1 A A 1099 ? A A 1141 60 1 Y 1 A U 1100 ? A U 1142 61 1 Y 1 A A 1101 ? A A 1143 62 1 Y 1 A G 1102 ? A G 1144 63 1 Y 1 A C 1103 ? A C 1145 64 1 Y 1 A U 1104 ? A U 1146 65 1 Y 1 A C 1105 ? A C 1147 66 1 Y 1 A C 1106 A A C 1149 67 1 Y 1 A U 1106 B A U 1150 68 1 Y 1 A G 1106 C A G 1151 69 1 Y 1 A G 1533 ? A G 1579 70 1 Y 1 A U 1534 ? A U 1580 71 1 Y 1 A A 1535 ? A A 1581 72 1 Y 1 A C 1536 ? A C 1582 73 1 Y 1 A A 2602 ? A A 2613 74 1 Y 1 A G 2797 ? A G 2807 75 1 Y 1 A U 2798 ? A U 2808 76 1 Y 1 A C 2799 ? A C 2809 77 1 Y 1 A A 2800 ? A A 2810 78 1 Y 1 A G 2893 ? A G 2901 79 1 Y 1 A U 2898 ? A U 2906 80 1 Y 1 A G 2899 ? A G 2907 81 1 Y 1 A A 2900 ? A A 2908 82 1 Y 1 A C 2901 ? A C 2909 83 1 Y 1 A C 2902 ? A C 2910 84 1 Y 1 A C 2903 ? A C 2911 85 1 Y 1 A C 2904 ? A C 2912 86 1 Y 1 A U 2905 ? A U 2913 87 1 Y 1 A C 2906 ? A C 2914 88 1 Y 1 A C 2907 ? A C 2915 89 1 Y 1 B U 121 ? B U 121 90 1 Y 1 B U 122 ? B U 122 91 1 Y 1 D MET 1 ? C MET 1 92 1 Y 1 E ALA 205 ? D ALA 205 93 1 Y 1 E LYS 206 ? D LYS 206 94 1 Y 1 F GLU 209 ? E GLU 204 95 1 Y 1 F ALA 210 ? E ALA 205 96 1 Y 1 G MET 1 ? F MET 1 97 1 Y 1 H MET 1 ? G MET 1 98 1 Y 1 H ALA 176 ? G ALA 176 99 1 Y 1 H GLY 177 ? G GLY 177 100 1 Y 1 H ALA 178 ? G ALA 178 101 1 Y 1 H LYS 179 ? G LYS 179 102 1 Y 1 H LYS 180 ? G LYS 180 103 1 Y 1 I ARG 113 ? H ARG 113 104 1 Y 1 I GLN 147 ? H GLN 147 105 1 Y 1 I GLU 148 ? H GLU 148 106 1 Y 1 P GLY 44 ? K GLY 44 107 1 Y 1 P LEU 45 ? K LEU 45 108 1 Y 1 P ALA 150 ? K ALA 150 109 1 Y 1 S MET 1 ? N MET 1 110 1 Y 1 S ALA 2 ? N ALA 2 111 1 Y 1 T LYS 132 ? O LYS 132 112 1 Y 1 T GLU 133 ? O GLU 133 113 1 Y 1 T GLU 134 ? O GLU 134 114 1 Y 1 T ALA 135 ? O ALA 135 115 1 Y 1 T GLN 136 ? O GLN 136 116 1 Y 1 T LYS 137 ? O LYS 137 117 1 Y 1 T ALA 138 ? O ALA 138 118 1 Y 1 T GLN 139 ? O GLN 139 119 1 Y 1 T GLU 140 ? O GLU 140 120 1 Y 1 T PRO 141 ? O PRO 141 121 1 Y 1 T LYS 142 ? O LYS 142 122 1 Y 1 T ALA 143 ? O ALA 143 123 1 Y 1 T SER 144 ? O SER 144 124 1 Y 1 T GLN 145 ? O GLN 145 125 1 Y 1 T GLU 146 ? O GLU 146 126 1 Y 1 U MET 1 ? P MET 1 127 1 Y 1 U GLY 118 ? P GLY 118 128 1 Y 1 W LYS 113 ? R LYS 113 129 1 Y 1 X ILE 96 ? S ILE 96 130 1 Y 1 Y THR 108 ? T THR 108 131 1 Y 1 Y GLU 109 ? T GLU 109 132 1 Y 1 Y GLU 110 ? T GLU 110 133 1 Y 1 Z LYS 199 ? U LYS 199 134 1 Y 1 Z GLY 200 ? U GLY 200 135 1 Y 1 Z LYS 201 ? U LYS 201 136 1 Y 1 Z GLU 202 ? U GLU 202 137 1 Y 1 Z GLU 203 ? U GLU 203 138 1 Y 1 Z GLU 204 ? U GLU 204 139 1 Y 1 Z GLU 205 ? U GLU 205 140 1 Y 1 Z GLU 206 ? U GLU 206 141 1 Y 1 0 MET 1 ? V MET 1 142 1 Y 1 0 ALA 2 ? V ALA 2 143 1 Y 1 0 HIS 3 ? V HIS 3 144 1 Y 1 0 LYS 4 ? V LYS 4 145 1 Y 1 0 LYS 5 ? V LYS 5 146 1 Y 1 0 GLY 6 ? V GLY 6 147 1 Y 1 0 LEU 7 ? V LEU 7 148 1 Y 1 0 GLY 8 ? V GLY 8 149 1 Y 1 0 ALA 85 ? V ALA 85 150 1 Y 1 1 MET 1 ? W MET 1 151 1 Y 1 2 ASN 71 ? X ASN 71 152 1 Y 1 2 ALA 72 ? X ALA 72 153 1 Y 1 3 MET 1 ? Y MET 1 154 1 Y 1 4 GLN 47 ? Z GLN 47 155 1 Y 1 4 ARG 48 ? Z ARG 48 156 1 Y 1 4 PHE 49 ? Z PHE 49 157 1 Y 1 4 VAL 50 ? Z VAL 50 158 1 Y 1 4 ASP 51 ? Z ASP 51 159 1 Y 1 4 THR 52 ? Z THR 52 160 1 Y 1 4 GLU 53 ? Z GLU 53 161 1 Y 1 4 GLY 54 ? Z GLY 54 162 1 Y 1 4 ARG 55 ? Z ARG 55 163 1 Y 1 4 VAL 56 ? Z VAL 56 164 1 Y 1 4 GLU 57 ? Z GLU 57 165 1 Y 1 4 ARG 58 ? Z ARG 58 166 1 Y 1 4 PHE 59 ? Z PHE 59 167 1 Y 1 4 GLN 60 ? Z GLN 60 168 1 Y 1 4 ARG 61 ? Z ARG 61 169 1 Y 1 4 ARG 62 ? Z ARG 62 170 1 Y 1 4 TYR 63 ? Z TYR 63 171 1 Y 1 4 GLY 64 ? Z GLY 64 172 1 Y 1 4 ASP 65 ? Z ASP 65 173 1 Y 1 4 SER 66 ? Z SER 66 174 1 Y 1 4 TYR 67 ? Z TYR 67 175 1 Y 1 4 ARG 68 ? Z ARG 68 176 1 Y 1 4 LYS 69 ? Z LYS 69 177 1 Y 1 4 GLY 70 ? Z GLY 70 178 1 Y 1 4 ARG 71 ? Z ARG 71 179 1 Y 1 5 MET 1 ? AA MET 1 180 1 Y 1 6 MET 1 ? BA MET 1 181 1 Y 1 7 ARG 49 ? CA ARG 49 182 1 Y 1 8 MET 1 ? DA MET 1 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 3UXR 'double helix' 3UXR 'a-form double helix' 3UXR 'parallel strands' 3UXR 'hairpin loop' 3UXR tetraloop 3UXR 'bulge loop' 3UXR 'mismatched base pair' 3UXR 'internal loop' 3UXR 'triple helix' 3UXR 'quadruple helix' 3UXR 'three-way junction' 3UXR 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A A 5 1_555 A U 2905 1_555 -0.532 0.130 -0.701 -8.350 -5.600 -5.803 1 A_A6:U2897_A A 6 ? 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