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;MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELR IRDNVRRVMVVKSQEPFLANA ; F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRV GGANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; ;MARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRV GGANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTDVPASRFKEEILRILAREGFIKGYERVDVDGKPYLRVYLKYGPRRQGPDPRPEQVI HHIRRISKPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTSKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTDVPASRFKEEILRILAREGFIKGYERVDVDGKPYLRVYLKYGPRRQGPDPRPEQVI HHIRRISKPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTSKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MEQYYGTGRRKEAVARVFLRPGNGKVTVNGQDFNEYFQGLVRAVAALEPLRAVDALGRFDAYITVRGGGKSGQIDAIKLG IARALVQYNPDYRAKLKPLGFLTRDARVVERKKYGKHKARRAPQYSKR ; 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_entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 U n 1 2 U n 1 3 U n 1 4 G n 1 5 U n 1 6 U n 1 7 G n 1 8 G n 1 9 A n 1 10 G n 1 11 A n 1 12 G n 1 13 U n 1 14 U n 1 15 U n 1 16 G n 1 17 A n 1 18 U n 1 19 C n 1 20 C n 1 21 U n 1 22 G n 1 23 G n 1 24 C n 1 25 U n 1 26 C n 1 27 A n 1 28 G n 1 29 G n 1 30 G n 1 31 U n 1 32 G n 1 33 A n 1 34 A n 1 35 C n 1 36 G n 1 37 C n 1 38 U n 1 39 G n 1 40 G n 1 41 C n 1 42 G n 1 43 G n 1 44 C n 1 45 G n 1 46 U n 1 47 G n 1 48 C n 1 49 C n 1 50 U n 1 51 A n 1 52 A n 1 53 G n 1 54 A n 1 55 C n 1 56 A n 1 57 U n 1 58 G n 1 59 C n 1 60 A n 1 61 A n 1 62 G n 1 63 U n 1 64 C n 1 65 G n 1 66 U n 1 67 G n 1 68 C n 1 69 G n 1 70 G n 1 71 G n 1 72 C n 1 73 C n 1 74 G n 1 75 C n 1 76 G n 1 77 G n 1 78 G n 1 79 G n 1 80 U n 1 81 U n 1 82 U n 1 83 U n 1 84 A n 1 85 C n 1 86 C n 1 87 C n 1 88 G n 1 89 U n 1 90 G n 1 91 G n 1 92 U n 1 93 C n 1 94 A n 1 95 G n 1 96 C n 1 97 G n 1 98 G n 1 99 C n 1 100 G n 1 101 G n 1 102 A n 1 103 C n 1 104 G n 1 105 G n 1 106 G n 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_diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.1 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'NSLS BEAMLINE X25' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site NSLS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X25 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.1 # _reflns.entry_id 3UXS _reflns.observed_criterion_sigma_I 0.65 _reflns.observed_criterion_sigma_F 0.65 _reflns.d_resolution_low 50.0 _reflns.d_resolution_high 2.90 _reflns.number_obs 1262956 _reflns.number_all 1262956 _reflns.percent_possible_obs 99.9 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI ? _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy ? _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? 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'X-RAY DIFFRACTION' f_angle_d 1.164 ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 3UXS _struct.title ;The structure of thermorubin in complex with the 70S ribosome from Thermus thermophilus. This file contains the 30S subunit of one 70S ribosome. The entire crystal structure contains two 70S ribosomes. ; _struct.pdbx_descriptor 'PROTEIN/RNA Complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3UXS _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME _struct_keywords.text 'Ribosome, Protein synthesis, Thermorubin' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? 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ASN B 104 GLN B 110 1 ? 7 HELX_P HELX_P6 6 ARG B 111 ? ALA B 123 ? ARG B 111 ALA B 123 1 ? 13 HELX_P HELX_P7 7 LYS B 132 ? SER B 150 ? LYS B 132 SER B 150 1 ? 19 HELX_P HELX_P8 8 GLY B 151 ? ARG B 153 ? GLY B 151 ARG B 153 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 9 ASP B 166 ? LEU B 180 ? ASP B 166 LEU B 180 1 ? 15 HELX_P HELX_P10 10 ALA B 207 ? GLY B 228 ? ALA B 207 GLY B 228 1 ? 22 HELX_P HELX_P11 11 TYR C 29 ? LEU C 47 ? TYR C 29 LEU C 47 1 ? 19 HELX_P HELX_P12 12 PRO C 73 ? GLY C 78 ? PRO C 73 GLY C 78 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 13 GLU C 82 ? THR C 95 ? GLU C 82 THR C 95 1 ? 14 HELX_P HELX_P14 14 SER C 112 ? GLU C 125 ? SER C 112 GLU C 125 1 ? 14 HELX_P HELX_P15 15 ALA C 129 ? SER C 144 ? ALA C 129 SER C 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P16 16 ARG C 156 ? ALA C 160 ? ARG C 156 ALA C 160 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 17 SER D 52 ? TYR D 68 ? SER D 52 TYR D 68 1 ? 17 HELX_P HELX_P18 18 SER D 71 ? LYS D 85 ? SER D 71 LYS D 85 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 19 VAL D 88 ? SER D 99 ? VAL D 88 SER D 99 1 ? 12 HELX_P HELX_P20 20 ARG D 100 ? ARG D 107 ? ARG D 100 ARG D 107 1 ? 8 HELX_P HELX_P21 21 SER D 113 ? HIS D 123 ? SER D 113 HIS D 123 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 22 LEU D 155 ? LYS D 166 ? LEU D 155 LYS D 166 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 23 ASP D 177 ? MET D 181 ? ASP D 177 MET D 181 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 24 ASN D 199 ? TYR D 207 ? ASN D 199 TYR D 207 1 ? 9 HELX_P HELX_P25 25 GLU E 50 ? ARG E 64 ? GLU E 50 ARG E 64 1 ? 15 HELX_P HELX_P26 26 GLY E 103 ? ALA E 113 ? GLY E 103 ALA E 113 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 27 ASN E 127 ? ARG E 140 ? ASN E 127 ARG E 140 1 ? 14 HELX_P HELX_P28 28 THR E 144 ? LEU E 151 ? THR E 144 LEU E 151 1 ? 8 HELX_P HELX_P29 29 ASP F 15 ? TYR F 33 ? ASP F 15 TYR F 33 1 ? 19 HELX_P HELX_P30 30 PRO F 68 ? ASP F 70 ? PRO F 68 ASP F 70 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 31 ARG F 71 ? ILE F 81 ? ARG F 71 ILE F 81 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 32 ASP G 20 ? MET G 31 ? ASP G 20 MET G 31 1 ? 12 HELX_P HELX_P33 33 LYS G 35 ? ASP G 45 ? LYS G 35 ASP G 45 1 ? 11 HELX_P HELX_P34 34 ASP G 45 ? LYS G 53 ? ASP G 45 LYS G 53 1 ? 9 HELX_P HELX_P35 35 PHE G 62 ? GLU G 67 ? PHE G 62 GLU G 67 1 ? 6 HELX_P HELX_P36 36 SER G 92 ? ASN G 109 ? SER G 92 ASN G 109 1 ? 18 HELX_P HELX_P37 37 ARG G 115 ? GLY G 130 ? ARG G 115 GLY G 130 1 ? 16 HELX_P HELX_P38 38 GLY G 132 ? ALA G 145 ? GLY G 132 ALA G 145 1 ? 14 HELX_P HELX_P39 39 ASN G 148 ? ALA G 152 ? ASN G 148 ALA G 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 40 ASP H 4 ? ARG H 18 ? ASP H 4 ARG H 18 1 ? 15 HELX_P HELX_P41 41 PHE H 31 ? GLU H 42 ? PHE H 31 GLU H 42 1 ? 12 HELX_P HELX_P42 42 GLY H 96 ? ILE H 100 ? GLY H 96 ILE H 100 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 43 THR H 120 ? GLY H 128 ? THR H 120 GLY H 128 1 ? 9 HELX_P HELX_P44 44 ASP I 32 ? PHE I 37 ? ASP I 32 PHE I 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 45 PRO I 49 ? VAL I 53 ? PRO I 49 VAL I 53 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 46 GLY I 69 ? ASN I 89 ? GLY I 69 ASN I 89 1 ? 21 HELX_P HELX_P47 47 LEU I 96 ? GLY I 100 ? LEU I 96 GLY I 100 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 48 ASP J 12 ? 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SER O 24 LYS O 44 1 ? 21 HELX_P HELX_P64 64 ASP O 49 ? ASP O 74 ? ASP O 49 ASP O 74 1 ? 26 HELX_P HELX_P65 65 ASP O 74 ? LEU O 85 ? ASP O 74 LEU O 85 1 ? 12 HELX_P HELX_P66 66 VAL P 53 ? GLY P 63 ? VAL P 53 GLY P 63 1 ? 11 HELX_P HELX_P67 67 THR P 67 ? GLN P 76 ? THR P 67 GLN P 76 1 ? 10 HELX_P HELX_P68 68 ARG Q 81 ? TYR Q 95 ? ARG Q 81 TYR Q 95 1 ? 15 HELX_P HELX_P69 69 LYS R 21 ? LEU R 26 ? LYS R 21 LEU R 26 1 ? 6 HELX_P HELX_P70 70 ASN R 36 ? LYS R 41 ? ASN R 36 LYS R 41 1 ? 6 HELX_P HELX_P71 71 ARG R 42 ? LEU R 44 ? ARG R 42 LEU R 44 5 ? 3 HELX_P HELX_P72 72 PRO R 52 ? GLY R 57 ? PRO R 52 GLY R 57 1 ? 6 HELX_P HELX_P73 73 SER R 59 ? GLY R 77 ? SER R 59 GLY R 77 1 ? 19 HELX_P HELX_P74 74 LEU S 15 ? ASN S 23 ? LEU S 15 ASN S 23 1 ? 9 HELX_P HELX_P75 75 VAL S 41 ? VAL S 45 ? VAL S 41 VAL S 45 5 ? 5 HELX_P HELX_P76 76 ALA T 12 ? GLU T 46 ? ALA T 12 GLU T 46 1 ? 35 HELX_P HELX_P77 77 LYS T 48 ? GLY T 69 ? LYS T 48 GLY T 69 1 ? 22 HELX_P HELX_P78 78 ASN T 75 ? ALA T 94 ? ASN T 75 ALA T 94 1 ? 20 HELX_P HELX_P79 79 THR U 8 ? TRP U 14 ? THR U 8 TRP U 14 1 ? 7 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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WATSON-CRICK ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 VAL 44 I . ? VAL 44 I ALA 45 I ? ALA 45 I 1 -2.75 2 ALA 32 J . ? ALA 32 J GLN 33 J ? GLN 33 J 1 -9.94 3 LEU 90 J . ? LEU 90 J PRO 91 J ? PRO 91 J 1 1.70 4 LYS 44 L . ? LYS 47 L PRO 45 L ? 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