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GIKQVAFDRGPYKYHGRVKALAEGAREGGLEF ; Q ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MNRGALIKLVESRYVRTDLPEFRPGDTVRVSYKVKEGNRTRIQDFEGIVIRIRRNGFNTTFTVRKVSYGVGVERIFPLHS PLIQKIDIVQRGRARRAKLYFIRNLSDREIRRKLRADRKRIDQDRAAERAAKEEAQKAQEPKASQE ; ;MNRGALIKLVESRYVRTDLPEFRPGDTVRVSYKVKEGNRTRIQDFEGIVIRIRRNGFNTTFTVRKVSYGVGVERIFPLHS PLIQKIDIVQRGRARRAKLYFIRNLSDREIRRKLRADRKRIDQDRAAERAAKEEAQKAQEPKASQE ; R ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MPRAKTGVVRRRKHKKILKLAKGYWGLRSKSFRKARETLFAAGNYAYAHRKRRKRDFRRLWIVRINAACRQHGLNYSTFI HGLKKAGIEVDRKNLADLAVREPQVFAELVERAKAAQG ; ;MPRAKTGVVRRRKHKKILKLAKGYWGLRSKSFRKARETLFAAGNYAYAHRKRRKRDFRRLWIVRINAACRQHGLNYSTFI HGLKKAGIEVDRKNLADLAVREPQVFAELVERAKAAQG ; 1 ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MFAIVKTGGKQYRVEPGLKLRVEKLDAEPGATVELPVLLLGGEKTVVGTPVVEGASVVAEVLGHGRGKKILVSKFKAKVQ YRRKKGHRQPYTELLIKEIRG ; ;MFAIVKTGGKQYRVEPGLKLRVEKLDAEPGATVELPVLLLGGEKTVVGTPVVEGASVVAEVLGHGRGKKILVSKFKAKVQ YRRKKGHRQPYTELLIKEIRG ; 2 ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MEAKAIARYVRISPRKVRLVVDLIRGKSLEEARNILRYTNKRGAYFVAKVLESAAANAVNNHDMLEDRLYVKAAYVDEGP ALKRVLPRARGRADIIKKRTSHITVILGEKHGK ; ;MEAKAIARYVRISPRKVRLVVDLIRGKSLEEARNILRYTNKRGAYFVAKVLESAAANAVNNHDMLEDRLYVKAAYVDEGP ALKRVLPRARGRADIIKKRTSHITVILGEKHGK ; S ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MKTAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAI VQVAPGQKIEALEGLI ; ;MKTAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAI VQVAPGQKIEALEGLI ; T ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MRVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACG KPTRVRKKFLENGKKIRVCAKCGGALDTEE ; ;MRVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACG KPTRVRKKFLENGKKIRVCAKCGGALDTEE ; U ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MEYRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRR RRPEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPG VELAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAAEVAEPEVIKKGKEEEEE ; ;MEYRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRR RRPEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPG VELAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAAEVAEPEVIKKGKEEEEE ; V ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MAHKKGLGSTRNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVH VRPLA ; ;MAHKKGLGSTRNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVH VRPLA ; 3 ? 23 'polypeptide(L)' no no ;MSKVCEISGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGL KLEGLSPKEIKKELLKLL ; ;MSKVCEISGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGL KLEGLSPKEIKKELLKLL ; Z ? 24 'polypeptide(L)' no no MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLTVLNEKRRQNA MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLTVLNEKRRQNA W ? 25 'polypeptide(L)' no no MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVVE MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVVE X ? 26 'polypeptide(L)' no no MKEGIHPKLVPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKCHPFYTGQQRFVDTEGRVERFQRRYGDSYRKGR MKEGIHPKLVPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKCHPFYTGQQRFVDTEGRVERFQRRYGDSYRKGR 4 ? 27 'polypeptide(L)' no no MAKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPTLVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYAGRKVLEV MAKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPTLVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYAGRKVLEV 5 ? 28 'polypeptide(L)' no no MASEVRIKLLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREVKI MASEVRIKLLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREVKI 6 ? 29 'polypeptide(L)' no no MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRKR MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRKR 7 ? 30 'polypeptide(L)' no no MPKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPYE MPKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPYE 8 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 G n 1 2 G n 1 3 U n 1 4 C n 1 5 A n 1 6 A n 1 7 G n 1 8 A n 1 9 U n 1 10 G n 1 11 G n 1 12 U n 1 13 A n 1 14 A n 1 15 G n 1 16 G n 1 17 G n 1 18 C n 1 19 C n 1 20 C n 1 21 A n 1 22 C n 1 23 G n 1 24 G n 1 25 U n 1 26 G n 1 27 G n 1 28 A n 1 29 U n 1 30 G n 1 31 C n 1 32 C n 1 33 U n 1 34 C n 1 35 G n 1 36 G n 1 37 C n 1 38 A n 1 39 C n 1 40 C n 1 41 C n 1 42 G n 1 43 A n 1 44 G n 1 45 C n 1 46 C n 1 47 G n 1 48 A n 1 49 U n 1 50 G n 1 51 A n 1 52 A n 1 53 G n 1 54 G n 1 55 A n 1 56 C n 1 57 G n 1 58 U n 1 59 G n 1 60 G n 1 61 C n 1 62 U n 1 63 A n 1 64 C n 1 65 C n 1 66 U n 1 67 G n 1 68 C n 1 69 G n 1 70 A n 1 71 U n 1 72 A n 1 73 A n 1 74 G n 1 75 C n 1 76 C n 1 77 A n 1 78 G n 1 79 G n 1 80 G n 1 81 G n 1 82 G n 1 83 A n 1 84 G n 1 85 C n 1 86 C n 1 87 G n 1 88 G n 1 89 U n 1 90 A n 1 91 G n 1 92 C n 1 93 G n 1 94 G n 1 95 G n 1 96 C n 1 97 G n 1 98 U n 1 99 G n 1 100 G n 1 101 A n 1 102 U n 1 103 C n 1 104 C n 1 105 C n 1 106 U n 1 107 G n 1 108 G n 1 109 A n 1 110 U n 1 111 G n 1 112 U n 1 113 C n 1 114 C n 1 115 G n 1 116 A n 1 117 A n 1 118 U n 1 119 G n 1 120 G n 1 121 G n 1 122 G n 1 123 G n 1 124 A n 1 125 A n 1 126 C n 1 127 C n 1 128 C n 1 129 G n 1 130 G n 1 131 C n 1 132 C n 1 133 G n 1 134 G n 1 135 C n 1 136 G n 1 137 G n 1 138 G n 1 139 A n 1 140 A n 1 141 C n 1 142 G n 1 143 C n 1 144 C n 1 145 G n 1 146 G n 1 147 U n 1 148 C n 1 149 A n 1 150 C n 1 151 C n 1 152 G n 1 153 C n 1 154 G n 1 155 C n 1 156 U n 1 157 U n 1 158 U n 1 159 U n 1 160 U n 1 161 G n 1 162 C n 1 163 G n 1 164 C n 1 165 G n 1 166 G n 1 167 G n 1 168 G n 1 169 G n 1 170 G n 1 171 A n 1 172 A n 1 173 C n 1 174 C n 1 175 U n 1 176 G n 1 177 G n 1 178 G n 1 179 G n 1 180 A n 1 181 A n 1 182 C n 1 183 U n 1 184 G n 1 185 A n 1 186 A n 1 187 A n 1 188 C n 1 189 A n 1 190 U n 1 191 C n 1 192 U n 1 193 C n 1 194 A n 1 195 G n 1 196 U n 1 197 A n 1 198 C n 1 199 C n 1 200 C n 1 201 A n 1 202 G n 1 203 A n 1 204 G n 1 205 G n 1 206 A n 1 207 G n 1 208 A n 1 209 G n 1 210 G n 1 211 A n 1 212 A n 1 213 A n 1 214 G n 1 215 A n 1 216 G n 1 217 A n 1 218 A n 1 219 A n 1 220 U n 1 221 C n 1 222 G n 1 223 A n 1 224 C n 1 225 U n 1 226 C n 1 227 C n 1 228 C n 1 229 U n 1 230 G n 1 231 A n 1 232 G n 1 233 U n 1 234 A n 1 235 G n 1 236 C n 1 237 G n 1 238 G n 1 239 C n 1 240 G n 1 241 A n 1 242 G n 1 243 C n 1 244 G n 1 245 A n 1 246 A n 1 247 A n 1 248 G n 1 249 G n 1 250 G n 1 251 G n 1 252 A n 1 253 C n 1 254 C n 1 255 A n 1 256 G n 1 257 C n 1 258 C n 1 259 U n 1 260 A n 1 261 A n 1 262 A n 1 263 C n 1 264 C n 1 265 G n 1 266 U n 1 267 C n 1 268 C n 1 269 G n 1 270 G n 1 271 C n 1 272 U n 1 273 U n 1 274 G n 1 275 U n 1 276 C n 1 277 C n 1 278 G n 1 279 G n 1 280 G n 1 281 C n 1 282 G n 1 283 G n 1 284 G n 1 285 G n 1 286 U n 1 287 C n 1 288 G n 1 289 U n 1 290 G n 1 291 G n 1 292 G n 1 293 G n 1 294 C n 1 295 C n 1 296 C n 1 297 U n 1 298 C n 1 299 G n 1 300 G n 1 301 A n 1 302 C n 1 303 A n 1 304 C n 1 305 C n 1 306 G n 1 307 A n 1 308 A n 1 309 U n 1 310 C n 1 311 C n 1 312 C n 1 313 C n 1 314 A n 1 315 G n 1 316 C n 1 317 C n 1 318 U n 1 319 A n 1 320 G n 1 321 C n 1 322 C n 1 323 G n 1 324 A n 1 325 A n 1 326 G n 1 327 C n 1 328 U n 1 329 G n 1 330 U n 1 331 U n 1 332 G n 1 333 G n 1 334 G n 1 335 A n 1 336 A n 1 337 G n 1 338 C n 1 339 A n 1 340 G n 1 341 C n 1 342 G n 1 343 C n 1 344 C n 1 345 A n 1 346 G n 1 347 A n 1 348 G n 1 349 A n 1 350 G n 1 351 G n 1 352 G n 1 353 U n 1 354 G n 1 355 A n 1 356 A n 1 357 A n 1 358 G n 1 359 C n 1 360 C n 1 361 C n 1 362 C n 1 363 G n 1 364 U n 1 365 A n 1 366 G n 1 367 G n 1 368 C n 1 369 G n 1 370 A n 1 371 A n 1 372 A n 1 373 G n 1 374 G n 1 375 U n 1 376 G n 1 377 G n 1 378 G n 1 379 G n 1 380 G n 1 381 G n 1 382 A n 1 383 U n 1 384 A n 1 385 G n 1 386 G n 1 387 U n 1 388 G n 1 389 A n 1 390 G n 1 391 G n 1 392 G n 1 393 U n 1 394 A n 1 395 C n 1 396 C n 1 397 C n 1 398 G n 1 399 A n 1 400 G n 1 401 U n 1 402 A n 1 403 C n 1 404 C n 1 405 C n 1 406 C n 1 407 G n 1 408 U n 1 409 G n 1 410 G n 1 411 U n 1 412 U n 1 413 C n 1 414 G n 1 415 U n 1 416 G n 1 417 G n 1 418 A n 1 419 G n 1 420 C n 1 421 C n 1 422 A n 1 423 U n 1 424 G n 1 425 G n 1 426 G n 1 427 G n 1 428 G n 1 429 A n 1 430 A n 1 431 U n 1 432 C n 1 433 U n 1 434 G n 1 435 G n 1 436 G n 1 437 C n 1 438 G n 1 439 G n 1 440 A n 1 441 C n 1 442 C n 1 443 A n 1 444 C n 1 445 C n 1 446 G n 1 447 C n 1 448 C n 1 449 U n 1 450 A n 1 451 A n 1 452 G n 1 453 G n 1 454 C n 1 455 U n 1 456 A n 1 457 A n 1 458 G n 1 459 U n 1 460 A n 1 461 C n 1 462 U n 1 463 C n 1 464 C n 1 465 G n 1 466 G n 1 467 G n 1 468 U n 1 469 G n 1 470 A n 1 471 C n 1 472 C n 1 473 G n 1 474 A n 1 475 U n 1 476 A n 1 477 G n 1 478 C n 1 479 G n 1 480 C n 1 481 A n 1 482 C n 1 483 C n 1 484 A n 1 485 G n 1 486 U n 1 487 A n 1 488 C n 1 489 C n 1 490 G n 1 491 U n 1 492 G n 1 493 A n 1 494 G n 1 495 G n 1 496 G n 1 497 A n 1 498 A n 1 499 A n 1 500 G n 1 501 G n 1 502 U n 1 503 G n 1 504 A n 1 505 A n 1 506 A n 1 507 A n 1 508 G n 1 509 A n 1 510 A n 1 511 C n 1 512 C n 1 513 C n 1 514 C n 1 515 G n 1 516 G n 1 517 G n 1 518 A n 1 519 G n 1 520 G n 1 521 G n 1 522 G n 1 523 A n 1 524 G n 1 525 U n 1 526 G n 1 527 A n 1 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'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.crystals_number 1 _exptl.entry_id 3UZ1 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.pH 7.5 _exptl_crystal_grow.temp 293 _exptl_crystal_grow.pdbx_details '4% PEG20K, 4% PEGMME 550, 100mM Tris/HAc, 200mM KSCN, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K' _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'PSI PILATUS 6M' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2011-05-11 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.monochromator 'Si 111' _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.000 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SLS BEAMLINE X06SA' _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.000 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SLS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X06SA # _reflns.entry_id 3UZ1 _reflns.d_resolution_high 3.300 _reflns.number_obs 864978 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.280 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 11.000 _reflns.percent_possible_obs 100.000 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 100.576 _reflns.observed_criterion_sigma_I -3.000 _reflns.observed_criterion_sigma_F -3.000 _reflns.d_resolution_low 300.0 _reflns.number_all 864997 _reflns.pdbx_redundancy ? _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_Rsym_value ? # loop_ _reflns_shell.d_res_high _reflns_shell.d_res_low _reflns_shell.number_measured_obs _reflns_shell.number_measured_all _reflns_shell.number_unique_obs _reflns_shell.Rmerge_I_obs _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs _reflns_shell.pdbx_Rsym_value _reflns_shell.pdbx_chi_squared _reflns_shell.pdbx_redundancy _reflns_shell.percent_possible_obs _reflns_shell.number_unique_all _reflns_shell.percent_possible_all _reflns_shell.pdbx_ordinal _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 3.300 3.400 2000601 ? 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_refine.ls_R_factor_obs 0.1993 _refine.ls_R_factor_R_work 0.1992 _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free 0.2373 _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 0.2300 _refine.ls_number_reflns_R_free 2000 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.B_iso_mean 96.6718 _refine.solvent_model_param_bsol 55.1650 _refine.solvent_model_param_ksol 0.2680 _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.aniso_B[1][1] -11.5965 _refine.aniso_B[2][2] 1.3910 _refine.aniso_B[3][3] 10.2055 _refine.aniso_B[1][2] 0.0000 _refine.aniso_B[1][3] 0.0000 _refine.aniso_B[2][3] 0.0000 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML 1.0400 _refine.overall_SU_B ? _refine.solvent_model_details 'FLAT BULK SOLVENT MODEL' _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.1000 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.8300 _refine.ls_number_parameters ? 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? ? 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'X-RAY DIFFRACTION' 3.4740 3.5762 14 100.0000 61213 . 0.2603 0.2938 . 143 . 61356 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 3.5762 3.6917 14 100.0000 61352 . 0.2204 0.2695 . 142 . 61494 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 3.6917 3.8236 14 100.0000 61348 . 0.1996 0.2356 . 142 . 61490 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 3.8236 3.9767 14 100.0000 61337 . 0.1856 0.2584 . 142 . 61479 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 3.9767 4.1577 14 100.0000 61431 . 0.1911 0.2399 . 143 . 61574 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 4.1577 4.3770 14 100.0000 61484 . 0.1733 0.2193 . 142 . 61626 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 4.3770 4.6512 14 100.0000 61490 . 0.1769 0.2254 . 143 . 61633 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 4.6512 5.0104 14 100.0000 61616 . 0.1615 0.1964 . 142 . 61758 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 5.0104 5.5146 14 100.0000 61758 . 0.1591 0.2440 . 144 . 61902 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 5.5146 6.3126 14 100.0000 61837 . 0.1728 0.2128 . 143 . 61980 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 6.3126 7.9533 14 100.0000 62189 . 0.1857 0.2377 . 144 . 62333 . . 'X-RAY DIFFRACTION' 7.9533 190.0486 14 100.0000 63321 . 0.2300 0.2266 . 147 . 63468 . . 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 3UZ1 _struct.title ;Crystal structure analysis of ribosomal decoding. This entry contains the 50S ribosomal subunit of the first 70S molecule in the asymmetric unit for the near-cognate tRNA-leu complex with paromomycin ; _struct.pdbx_descriptor 'PROTEIN/RNA Complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3UZ1 _struct_keywords.text 'RNA, ribosome, tRNA, translation, mRNA, RIBOSOME-ANTIBIOTIC complex' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME/ANTIBIOTIC # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 26 ? AA N N 27 ? BA N N 28 ? CA N N 29 ? DA N N 30 ? # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASP C 20 ? ILE C 24 ? ASP D 20 ILE D 24 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 2 ARG C 69 ? VAL C 73 ? ARG D 69 VAL D 73 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 3 ARG C 134 ? ILE C 136 ? ARG D 134 ILE D 136 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 4 ASN C 198 ? ILE C 204 ? 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A G 176 N1 ? ? ? 1_555 A C 200 N3 ? ? A G 186 A C 210 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog252 hydrog ? ? A G 176 N2 ? ? ? 1_555 A C 200 O2 ? ? A G 186 A C 210 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog253 hydrog ? ? A G 176 O6 ? ? ? 1_555 A C 200 N4 ? ? A G 186 A C 210 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog254 hydrog ? ? A G 177 N1 ? ? ? 1_555 A C 199 N3 ? ? A G 187 A C 209 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog255 hydrog ? ? A G 177 N2 ? ? ? 1_555 A C 199 O2 ? ? A G 187 A C 209 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog256 hydrog ? ? A G 177 O6 ? ? ? 1_555 A C 199 N4 ? ? A G 187 A C 209 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog257 hydrog ? ? A G 177 N2 ? ? ? 1_555 A A 1412 N1 ? ? A G 187 A A 1365 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog258 hydrog ? ? A G 178 N1 ? ? ? 1_555 A C 198 N3 ? ? A G 188 A C 208 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog259 hydrog ? ? A G 178 N2 ? ? ? 1_555 A C 198 O2 ? ? A G 188 A C 208 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog260 hydrog ? ? 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AT ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? anti-parallel B 5 6 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel D 5 6 ? anti-parallel D 6 7 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? parallel F 2 3 ? parallel F 3 4 ? parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel G 4 5 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel N 1 2 ? parallel N 2 3 ? anti-parallel O 1 2 ? parallel O 2 3 ? parallel P 1 2 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel Q 4 5 ? anti-parallel Q 5 6 ? parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel R 4 5 ? anti-parallel R 5 6 ? anti-parallel R 6 7 ? anti-parallel S 1 2 ? parallel T 1 2 ? parallel T 2 3 ? parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel W 2 3 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel X 2 3 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel Z 2 3 ? anti-parallel Z 3 4 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel AE 2 3 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AF 2 3 ? anti-parallel AG 1 2 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AI 1 2 ? parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? parallel AJ 3 4 ? anti-parallel AK 1 2 ? anti-parallel AK 2 3 ? anti-parallel AL 1 2 ? parallel AM 1 2 ? anti-parallel AM 2 3 ? anti-parallel AM 3 4 ? anti-parallel AN 1 2 ? anti-parallel AN 2 3 ? anti-parallel AN 3 4 ? parallel AO 1 2 ? anti-parallel AP 1 2 ? anti-parallel AQ 1 2 ? anti-parallel AQ 2 3 ? anti-parallel AR 1 2 ? anti-parallel AS 1 2 ? anti-parallel AS 2 3 ? anti-parallel AT 1 2 ? anti-parallel AT 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 LYS C 102 ? 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? 179.93 171.33 22 1 ILE E 14 ? ? -105.87 -106.83 23 1 PHE E 15 ? ? 134.93 60.60 24 1 ASP E 17 ? ? 73.15 49.17 25 1 ASP E 18 ? ? 53.95 -122.00 26 1 ARG E 19 ? ? 8.61 125.60 27 1 VAL E 21 ? ? 172.75 107.55 28 1 PRO E 22 ? ? -55.74 -173.18 29 1 VAL E 23 ? ? 160.93 120.64 30 1 ARG E 37 ? ? 60.94 73.18 31 1 PRO E 39 ? ? -72.94 49.68 32 1 GLU E 40 ? ? -108.58 -75.93 33 1 LEU E 49 ? ? -97.30 -65.19 34 1 LEU E 52 ? ? -38.68 129.30 35 1 PRO E 53 ? ? -40.28 -100.62 36 1 GLN E 54 ? ? 70.70 -90.99 37 1 ASN E 55 ? ? -13.81 98.52 38 1 LYS E 57 ? ? 176.10 12.98 39 1 ASN E 60 ? ? 57.15 -117.94 40 1 PRO E 62 ? ? -53.80 -4.33 41 1 LEU E 63 ? ? -29.62 104.78 42 1 LYS E 64 ? ? -97.32 59.69 43 1 VAL E 72 ? ? 60.29 80.01 44 1 ARG E 79 ? ? 87.64 89.00 45 1 ILE E 81 ? ? -31.85 -28.68 46 1 ARG E 82 ? ? 66.00 134.19 47 1 THR E 90 ? ? 45.44 75.49 48 1 MET E 117 ? ? 70.52 83.61 49 1 LYS E 118 ? ? 97.78 -16.26 50 1 HIS E 129 ? ? 62.66 -123.41 51 1 ALA E 131 ? ? 60.78 -98.03 52 1 LYS E 133 ? ? 51.62 12.56 53 1 ASN E 143 ? ? -116.84 -85.52 54 1 ARG E 144 ? ? -162.99 -154.32 55 1 ALA E 204 ? ? -116.46 -71.76 56 1 LEU F 24 ? ? 48.46 83.99 57 1 GLN F 67 ? ? 76.60 -0.08 58 1 HIS F 69 ? ? 66.35 -3.23 59 1 ALA F 73 ? ? -69.75 -179.90 60 1 ALA F 128 ? ? 69.13 -14.43 61 1 PHE F 129 ? ? 61.37 -101.16 62 1 ALA F 198 ? ? 79.85 -18.72 63 1 ASP G 4 ? ? -81.28 -73.04 64 1 VAL G 5 ? ? 57.48 81.46 65 1 GLU G 13 ? ? -117.15 79.58 66 1 GLU G 14 ? ? -151.68 -63.94 67 1 LYS G 36 ? ? 60.50 78.60 68 1 LYS G 47 ? ? -44.30 -70.92 69 1 LEU G 53 ? ? -47.44 -70.53 70 1 SER G 78 ? ? -44.44 -98.81 71 1 ASN G 79 ? ? 4.05 -86.57 72 1 PHE G 80 ? ? -94.14 53.68 73 1 LYS G 81 ? ? 21.77 -150.92 74 1 LEU G 82 ? ? 108.08 46.67 75 1 ARG G 83 ? ? -34.19 157.32 76 1 LYS G 84 ? ? -42.17 -14.18 77 1 MET G 86 ? ? 63.69 88.87 78 1 ASP G 97 ? ? 79.40 -22.83 79 1 VAL G 109 ? ? -129.63 -64.46 80 1 ALA G 110 ? ? -57.70 -70.65 81 1 ASP G 116 ? ? 61.42 -115.95 82 1 PHE G 117 ? ? 66.40 76.39 83 1 ARG G 136 ? ? -91.15 -64.60 84 1 TYR G 146 ? ? 74.36 -16.10 85 1 ARG H 3 ? ? 59.02 74.58 86 1 PRO H 10 ? ? -62.09 -170.64 87 1 PRO H 12 ? ? -76.85 -157.39 88 1 LYS H 13 ? ? 71.05 75.56 89 1 VAL H 26 ? ? -92.19 -60.63 90 1 LYS H 27 ? ? 63.12 82.49 91 1 GLU H 40 ? ? -75.47 -169.10 92 1 MET H 41 ? ? 59.47 72.46 93 1 GLU H 81 ? ? 44.94 74.58 94 1 TYR H 83 ? ? -78.07 -144.46 95 1 SER H 84 ? ? 77.17 -131.33 96 1 LYS H 85 ? ? 60.50 91.91 97 1 LEU H 87 ? ? 69.04 74.07 98 1 VAL H 125 ? ? -119.45 75.06 99 1 GLU H 127 ? ? 83.91 153.45 100 1 LYS H 138 ? ? 80.65 -20.18 101 1 ARG H 152 ? ? 41.25 -129.96 102 1 LYS H 153 ? ? 80.61 167.35 103 1 PRO H 154 ? ? -54.69 -167.88 104 1 SER H 155 ? ? 95.44 0.99 105 1 ALA H 156 ? ? -69.41 -166.70 106 1 GLU H 167 ? ? 68.66 135.70 107 1 VAL H 169 ? ? 56.01 -143.87 108 1 ARG H 170 ? ? -171.13 -168.27 109 1 LEU K 9 ? ? -128.31 -59.71 110 1 GLU K 10 ? ? 64.25 96.85 111 1 ASN K 11 ? ? 83.86 79.99 112 1 LEU K 12 ? ? 70.56 -137.07 113 1 VAL K 15 ? ? 62.25 -24.33 114 1 TYR K 29 ? ? -133.81 -70.44 115 1 ALA K 36 ? ? 179.86 177.27 116 1 ALA K 39 ? ? -61.28 7.57 117 1 SER K 42 ? ? -52.96 -72.03 118 1 LEU K 72 ? ? -105.10 -60.52 119 1 HIS K 105 ? ? 102.89 -2.57 120 1 ALA K 115 ? ? 81.66 2.80 121 1 LYS K 118 ? ? 68.75 144.84 122 1 GLU K 122 ? ? 55.79 -143.49 123 1 HIS K 133 ? ? 62.99 178.09 124 1 PRO K 134 ? ? -38.24 135.03 125 1 SER K 143 ? ? -119.01 -78.32 126 1 VAL K 144 ? ? 174.61 162.55 127 1 VAL K 145 ? ? 50.30 -128.43 128 1 VAL M 9 ? ? 50.70 -143.04 129 1 ALA M 18 ? ? 74.73 -21.00 130 1 THR M 22 ? ? -57.34 -91.15 131 1 LEU M 23 ? ? -152.77 -68.35 132 1 ALA M 47 ? ? 76.35 52.19 133 1 ASN M 56 ? ? 39.30 59.67 134 1 ASP M 58 ? ? 92.96 -13.45 135 1 THR M 93 ? ? -105.42 -61.33 136 1 PRO M 95 ? ? -58.64 -179.63 137 1 GLU M 96 ? ? 59.00 86.75 138 1 ARG M 97 ? ? 109.42 -14.35 139 1 ARG M 114 ? ? -78.33 -168.02 140 1 ARG M 115 ? ? 62.98 -95.33 141 1 LEU M 116 ? ? -36.75 -37.01 142 1 ASP M 127 ? ? 47.08 -160.05 143 1 HIS M 128 ? ? 161.58 174.44 144 1 GLN M 131 ? ? -127.25 -62.87 145 1 ARG M 134 ? ? -150.21 65.68 146 1 PRO M 135 ? ? -64.80 81.49 147 1 GLN N 5 ? ? 93.27 -10.92 148 1 ARG N 49 ? ? 78.48 -2.51 149 1 LEU N 91 ? ? 86.52 0.71 150 1 ARG N 97 ? ? 56.75 76.16 151 1 ASP O 5 ? ? -148.92 -53.20 152 1 LEU O 6 ? ? -46.20 -81.97 153 1 ARG O 7 ? ? 58.10 145.79 154 1 PRO O 10 ? ? -25.48 -78.27 155 1 ALA O 12 ? ? 51.28 -12.05 156 1 ASN O 13 ? ? -150.80 81.15 157 1 ARG O 16 ? ? -33.35 160.85 158 1 VAL O 19 ? ? -60.39 -173.81 159 1 ARG O 21 ? ? -98.54 -63.76 160 1 HIS O 27 ? ? 62.88 -3.35 161 1 LYS O 29 ? ? 52.88 -111.62 162 1 THR O 32 ? ? 69.72 -3.48 163 1 HIS O 35 ? ? 63.24 -111.56 164 1 LYS O 36 ? ? 58.65 -140.52 165 1 SER O 42 ? ? -57.72 -70.18 166 1 ASP O 47 ? ? 77.44 80.70 167 1 ARG O 50 ? ? -124.13 -99.36 168 1 PHE O 51 ? ? -18.96 133.30 169 1 ARG O 55 ? ? -51.47 87.34 170 1 SER O 56 ? ? 3.84 89.15 171 1 THR O 57 ? ? -39.28 166.76 172 1 THR O 58 ? ? -53.58 8.53 173 1 LEU O 59 ? ? -81.84 38.47 174 1 LEU O 62 ? ? 56.47 142.72 175 1 ARG O 65 ? ? -57.75 88.71 176 1 MET O 67 ? ? 18.63 74.40 177 1 GLN O 70 ? ? -108.28 -157.31 178 1 ARG O 77 ? ? -175.79 144.54 179 1 GLU O 92 ? ? -102.68 -67.09 180 1 VAL O 95 ? ? 59.75 78.25 181 1 PRO O 97 ? ? -76.08 46.94 182 1 GLU O 98 ? ? -133.99 -63.32 183 1 LEU O 106 ? ? -148.23 -53.54 184 1 LYS O 107 ? ? 72.36 86.80 185 1 PRO O 122 ? ? -66.76 64.98 186 1 ALA O 141 ? ? 85.30 -16.94 187 1 ARG P 6 ? ? 56.69 74.24 188 1 LYS P 11 ? ? 65.66 83.19 189 1 ARG P 14 ? ? -71.11 -91.55 190 1 ALA P 20 ? ? -103.13 40.18 191 1 THR P 21 ? ? 84.03 102.01 192 1 ASP P 25 ? ? 149.79 -27.41 193 1 VAL P 27 ? ? -7.63 104.29 194 1 PHE P 29 ? ? -147.84 -73.42 195 1 ARG P 59 ? ? -29.07 108.79 196 1 ARG P 60 ? ? 19.50 52.31 197 1 ILE P 64 ? ? -93.94 -107.06 198 1 PHE P 65 ? ? 139.02 -82.16 199 1 ILE P 66 ? ? 97.53 -77.38 200 1 ARG P 67 ? ? 97.24 -69.99 201 1 PRO P 78 ? ? -19.88 -56.39 202 1 LEU P 79 ? ? 137.72 168.89 203 1 GLU P 80 ? ? 35.89 23.33 204 1 LYS P 85 ? ? 76.10 80.13 205 1 ASN P 89 ? ? 163.09 16.59 206 1 VAL P 90 ? ? 45.69 102.81 207 1 PHE P 104 ? ? 61.03 -108.16 208 1 GLU P 105 ? ? 68.97 82.52 209 1 GLN P 113 ? ? -96.76 -68.60 210 1 ARG P 133 ? ? -106.95 -79.73 211 1 ARG P 134 ? ? 172.01 160.36 212 1 GLU P 139 ? ? 50.83 -143.42 213 1 ALA P 140 ? ? -134.58 -68.85 214 1 ARG 0 2 ? ? 61.08 67.06 215 1 HIS 0 3 ? ? -74.01 -166.48 216 1 ASN 0 11 ? ? 33.94 37.08 217 1 SER 0 14 ? ? -54.48 -70.29 218 1 GLN 0 71 ? ? 62.79 -7.55 219 1 LEU 0 75 ? ? 64.65 -21.69 220 1 GLU 0 82 ? ? -99.20 -62.56 221 1 LEU Q 4 ? ? 48.58 -147.52 222 1 THR Q 5 ? ? 176.78 157.33 223 1 ARG Q 9 ? ? -74.43 -73.30 224 1 LYS Q 33 ? ? -99.18 -60.80 225 1 GLU Q 43 ? ? 76.68 -20.67 226 1 LEU Q 48 ? ? -106.92 -60.43 227 1 ASN Q 61 ? ? 75.54 80.88 228 1 LYS Q 83 ? ? -119.11 -78.18 229 1 ALA Q 86 ? ? -132.74 -40.29 230 1 PHE Q 87 ? ? 79.68 117.08 231 1 ASP Q 88 ? ? -84.10 -124.01 232 1 ARG Q 89 ? ? 113.22 -3.27 233 1 LEU Q 110 ? ? 67.86 -123.22 234 1 ARG R 3 ? ? -138.50 -49.53 235 1 LYS R 35 ? ? -76.02 -70.10 236 1 GLU R 36 ? ? 61.57 67.20 237 1 ASN R 38 ? ? 75.36 -18.52 238 1 ASN R 55 ? ? 124.64 89.42 239 1 ASN R 58 ? ? 137.31 -7.00 240 1 THR R 59 ? ? -37.16 144.04 241 1 ARG R 95 ? ? 80.83 -14.83 242 1 ASP R 107 ? ? 179.07 -166.26 243 1 LYS R 113 ? ? -132.02 -61.18 244 1 ALA R 116 ? ? 40.18 74.31 245 1 ASP R 124 ? ? 61.49 -105.53 246 1 GLU R 133 ? ? -90.75 -61.66 247 1 ASN 1 66 ? ? -55.08 -9.81 248 1 ALA 1 86 ? ? -59.41 -7.38 249 1 ARG 1 92 ? ? 42.25 75.59 250 1 LYS 1 93 ? ? -38.48 -23.74 251 1 GLN 1 117 ? ? 50.04 71.50 252 1 LYS 2 44 ? ? 58.41 -143.95 253 1 THR 2 45 ? ? 58.55 -10.02 254 1 VAL 2 47 ? ? -131.56 -78.56 255 1 THR 2 49 ? ? 57.98 166.00 256 1 LYS 2 78 ? ? 66.61 -7.68 257 1 LYS 2 97 ? ? -105.19 -65.70 258 1 VAL S 59 ? ? -49.93 -73.51 259 1 ASN S 61 ? ? -128.76 -58.89 260 1 ASP S 63 ? ? 61.11 74.26 261 1 LEU S 65 ? ? 80.16 88.19 262 1 ALA S 93 ? ? 59.98 77.66 263 1 ALA T 10 ? ? 177.27 159.69 264 1 ARG T 68 ? ? 46.40 -22.97 265 1 VAL U 3 ? ? 47.15 76.20 266 1 MET U 5 ? ? 63.51 77.67 267 1 VAL U 39 ? ? -122.87 -99.35 268 1 VAL U 42 ? ? 38.76 67.09 269 1 VAL U 49 ? ? 44.58 -123.64 270 1 TYR U 55 ? ? 64.18 60.14 271 1 GLN U 57 ? ? 50.37 -113.33 272 1 PRO U 77 ? ? -53.85 71.06 273 1 ALA U 78 ? ? 172.37 -174.05 274 1 CYS U 79 ? ? -73.37 -168.34 275 1 LEU U 90 ? ? -109.17 -78.72 276 1 VAL U 98 ? ? -97.10 -61.11 277 1 CYS U 102 ? ? 58.80 -138.38 278 1 LYS V 6 ? ? 67.01 -157.80 279 1 ALA V 7 ? ? 163.27 175.26 280 1 GLU V 11 ? ? -131.33 -67.06 281 1 GLU V 13 ? ? 63.26 80.99 282 1 ASN V 30 ? ? 177.33 177.56 283 1 HIS V 32 ? ? -91.12 -62.59 284 1 ALA V 51 ? ? -52.41 -71.74 285 1 ILE V 53 ? ? 64.48 -3.35 286 1 GLU V 60 ? ? 35.93 -121.38 287 1 LEU V 61 ? ? 80.95 152.15 288 1 PRO V 62 ? ? -57.76 -177.03 289 1 ARG V 81 ? ? 39.75 69.38 290 1 GLU V 94 ? ? 175.61 134.26 291 1 PRO V 108 ? ? -47.54 -18.25 292 1 ALA V 109 ? ? 60.53 72.48 293 1 VAL V 111 ? ? 49.03 28.54 294 1 HIS V 121 ? ? 59.91 74.39 295 1 ARG V 131 ? ? -55.12 -70.30 296 1 PHE V 136 ? ? 176.46 174.89 297 1 ASP V 140 ? ? -129.44 -63.76 298 1 VAL V 141 ? ? 63.58 -131.19 299 1 LEU V 144 ? ? -172.22 -175.31 300 1 HIS V 151 ? ? -82.32 -82.51 301 1 ALA V 152 ? ? -137.10 -66.40 302 1 LEU V 157 ? ? 58.42 70.31 303 1 PRO V 158 ? ? -58.07 177.54 304 1 PRO V 159 ? ? -92.05 55.00 305 1 VAL V 161 ? ? -142.71 -72.14 306 1 VAL V 165 ? ? 51.12 -116.63 307 1 THR V 170 ? ? -82.29 -76.31 308 1 ILE V 171 ? ? 68.11 -14.37 309 1 ALA V 172 ? ? 175.74 166.57 310 1 ALA V 173 ? ? 178.56 169.05 311 1 ASN 3 12 ? ? -81.66 -157.28 312 1 ASP 3 15 ? ? 176.60 166.21 313 1 ARG 3 20 ? ? 39.37 67.37 314 1 ARG 3 41 ? ? -92.04 -71.72 315 1 PRO 3 83 ? ? -61.42 -161.67 316 1 LEU 3 84 ? ? 97.56 -1.39 317 1 ALA Z 54 ? ? 47.33 -126.70 318 1 LEU Z 82 ? ? -68.51 -175.10 319 1 SER Z 86 ? ? -14.39 -43.05 320 1 LYS Z 91 ? ? -74.27 -164.68 321 1 LEU Z 97 ? ? 67.79 -9.13 322 1 LYS W 15 ? ? 62.71 95.26 323 1 LEU W 16 ? ? 89.47 79.59 324 1 GLN W 43 ? ? 48.99 12.81 325 1 GLN X 32 ? ? 77.18 -15.47 326 1 ILE 4 5 ? ? 65.96 -3.71 327 1 LEU 4 9 ? ? 59.89 75.39 328 1 CYS 4 16 ? ? -163.72 -166.39 329 1 THR 4 24 ? ? 52.46 -113.08 330 1 TYR 4 25 ? ? 62.51 67.69 331 1 GLU 4 30 ? ? 59.11 71.56 332 1 CYS 4 39 ? ? 87.53 -2.37 333 1 PHE 4 42 ? ? 60.06 79.10 334 1 TYR 4 43 ? ? 75.41 -16.76 335 1 GLN 4 47 ? ? -93.04 -64.61 336 1 VAL 4 50 ? ? 84.85 8.32 337 1 GLU 4 53 ? ? 90.98 1.93 338 1 ARG 4 55 ? ? 40.90 -123.23 339 1 TYR 4 63 ? ? -93.71 -63.20 340 1 LYS 5 3 ? ? -147.48 -149.56 341 1 HIS 5 4 ? ? -53.23 -158.32 342 1 GLU 5 35 ? ? -85.57 -72.08 343 1 HIS 5 43 ? ? 43.07 29.58 344 1 PRO 5 47 ? ? -73.29 46.46 345 1 CYS 5 49 ? ? 41.62 71.22 346 1 TYR 5 52 ? ? -124.13 -65.30 347 1 ALA 5 53 ? ? -75.86 -71.12 348 1 ARG 6 19 ? ? 53.95 -152.01 349 1 ASN 6 20 ? ? -142.41 -68.72 350 1 TYR 6 21 ? ? 62.71 67.94 351 1 THR 6 30 ? ? -175.87 131.73 352 1 LYS 6 33 ? ? -75.40 -168.96 353 1 CYS 6 43 ? ? -92.75 -72.04 354 1 ARG 6 44 ? ? -101.22 -78.79 355 1 LYS 6 45 ? ? 177.28 113.84 356 1 HIS 6 46 ? ? 57.77 -161.56 357 1 THR 6 47 ? ? 146.44 -142.55 358 1 HIS 6 49 ? ? 61.65 74.66 359 1 THR 7 15 ? ? -101.54 -60.84 360 1 LYS 7 48 ? ? 65.69 -137.61 361 1 VAL 8 14 ? ? -177.25 132.83 362 1 HIS 8 31 ? ? -149.42 -66.82 363 1 LYS 8 52 ? ? -141.59 42.20 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 THR D 27 ? ? GLU D 28 ? ? -125.38 2 1 GLU D 28 ? ? PRO D 29 ? ? -140.65 3 1 GLY D 47 ? ? ARG D 48 ? ? -144.54 4 1 ASP D 122 ? ? ALA D 123 ? ? 144.47 5 1 GLY D 236 ? ? GLU D 237 ? ? -124.21 6 1 GLU D 237 ? ? GLY D 238 ? ? -146.10 7 1 ALA E 131 ? ? HIS E 132 ? ? -116.29 8 1 GLU G 13 ? ? GLU G 14 ? ? 142.78 9 1 LEU H 7 ? ? PRO H 8 ? ? 150.00 10 1 LYS H 153 ? ? PRO H 154 ? ? -139.36 11 1 GLU K 10 ? ? ASN K 11 ? ? -121.01 12 1 ARG K 82 ? ? ALA K 83 ? ? -149.53 13 1 GLN K 104 ? ? HIS K 105 ? ? -148.45 14 1 LEU K 116 ? ? GLU K 117 ? ? -146.91 15 1 PRO K 134 ? ? GLU K 135 ? ? -139.06 16 1 GLU M 96 ? ? ARG M 97 ? ? -147.16 17 1 GLY O 26 ? ? HIS O 27 ? ? 148.99 18 1 LYS O 36 ? ? GLY O 37 ? ? -127.28 19 1 LEU O 115 ? ? GLY O 116 ? ? 141.10 20 1 ARG Q 89 ? ? GLY Q 90 ? ? 149.79 21 1 LEU Q 110 ? ? GLU Q 111 ? ? -147.52 22 1 ARG R 3 ? ? GLY R 4 ? ? -136.78 23 1 ARG R 115 ? ? ALA R 116 ? ? 144.82 24 1 VAL 1 90 ? ? ASP 1 91 ? ? -142.74 25 1 ARG 1 92 ? ? LYS 1 93 ? ? -146.98 26 1 GLY 2 48 ? ? THR 2 49 ? ? 144.12 27 1 LEU V 5 ? ? LYS V 6 ? ? -145.35 28 1 ASP V 63 ? ? GLY V 64 ? ? -130.62 29 1 GLY V 160 ? ? VAL V 161 ? ? 139.67 30 1 PRO 3 83 ? ? LEU 3 84 ? ? -140.93 31 1 LEU 3 84 ? ? ALA 3 85 ? ? 145.02 32 1 LYS W 15 ? ? LEU W 16 ? ? -123.05 33 1 SER W 17 ? ? PRO W 18 ? ? -132.18 34 1 LYS 4 38 ? ? CYS 4 39 ? ? -145.97 35 1 HIS 4 40 ? ? PRO 4 41 ? ? 141.97 36 1 ASP 4 51 ? ? THR 4 52 ? ? -138.85 37 1 HIS 5 4 ? ? PRO 5 5 ? ? -136.12 38 1 CYS 5 46 ? ? PRO 5 47 ? ? -148.40 39 1 PRO 5 47 ? ? GLU 5 48 ? ? 149.52 40 1 LYS 6 27 ? ? ARG 6 28 ? ? -148.26 41 1 ALA 8 51 ? ? LYS 8 52 ? ? 142.38 42 1 LYS 8 52 ? ? 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DA GLU 65 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 3UZ1 'double helix' 3UZ1 'a-form double helix' 3UZ1 'parallel strands' 3UZ1 'hairpin loop' 3UZ1 tetraloop 3UZ1 'bulge loop' 3UZ1 'mismatched base pair' 3UZ1 'internal loop' 3UZ1 'triple helix' 3UZ1 'quadruple helix' 3UZ1 'three-way junction' 3UZ1 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A C 2912 1_555 -0.883 -0.289 0.153 4.635 8.445 -1.580 1 A_G1:C2902_A A 1 ? 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