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;MFAIVKTGGKQYRVEPGLKLRVEKLDAEPGATVELPVLLLGGEKTVVGTPVVEGASVVAEVLGHGRGKKILVSKFKAKVQ YRRKKGHRQPYTELLIKEIRG ; 2 ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MEAKAIARYVRISPRKVRLVVDLIRGKSLEEARNILRYTNKRGAYFVAKVLESAAANAVNNHDMLEDRLYVKAAYVDEGP ALKRVLPRARGRADIIKKRTSHITVILGEKHGK ; ;MEAKAIARYVRISPRKVRLVVDLIRGKSLEEARNILRYTNKRGAYFVAKVLESAAANAVNNHDMLEDRLYVKAAYVDEGP ALKRVLPRARGRADIIKKRTSHITVILGEKHGK ; S ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MKTAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAI VQVAPGQKIEALEGLI ; ;MKTAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAI VQVAPGQKIEALEGLI ; T ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MRVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACG KPTRVRKKFLENGKKIRVCAKCGGALDTEE ; ;MRVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACG KPTRVRKKFLENGKKIRVCAKCGGALDTEE ; U ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MEYRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRR RRPEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPG VELAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAAEVAEPEVIKKGKEEEEE ; ;MEYRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRR RRPEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPG VELAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAAEVAEPEVIKKGKEEEEE ; V ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MAHKKGLGSTRNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVH VRPLA ; ;MAHKKGLGSTRNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVH VRPLA ; 3 ? 23 'polypeptide(L)' no no ;MSKVCEISGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGL KLEGLSPKEIKKELLKLL ; ;MSKVCEISGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGL KLEGLSPKEIKKELLKLL ; Z ? 24 'polypeptide(L)' no no MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLTVLNEKRRQNA MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLTVLNEKRRQNA W ? 25 'polypeptide(L)' no no MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVVE MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVVE X ? 26 'polypeptide(L)' no no MKEGIHPKLVPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKCHPFYTGQQRFVDTEGRVERFQRRYGDSYRKGR MKEGIHPKLVPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKCHPFYTGQQRFVDTEGRVERFQRRYGDSYRKGR 4 ? 27 'polypeptide(L)' no no MAKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPTLVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYAGRKVLEV MAKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPTLVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYAGRKVLEV 5 ? 28 'polypeptide(L)' no no MASEVRIKLLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREVKI MASEVRIKLLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREVKI 6 ? 29 'polypeptide(L)' no no MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRKR MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRKR 7 ? 30 'polypeptide(L)' no no MPKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPYE MPKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPYE 8 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 G n 1 2 G n 1 3 U n 1 4 C n 1 5 A n 1 6 A n 1 7 G n 1 8 A n 1 9 U n 1 10 G n 1 11 G n 1 12 U n 1 13 A n 1 14 A n 1 15 G n 1 16 G n 1 17 G n 1 18 C n 1 19 C n 1 20 C n 1 21 A n 1 22 C n 1 23 G n 1 24 G n 1 25 U n 1 26 G n 1 27 G n 1 28 A n 1 29 U n 1 30 G n 1 31 C n 1 32 C n 1 33 U n 1 34 C n 1 35 G n 1 36 G n 1 37 C n 1 38 A n 1 39 C n 1 40 C n 1 41 C n 1 42 G n 1 43 A n 1 44 G n 1 45 C n 1 46 C n 1 47 G n 1 48 A n 1 49 U n 1 50 G n 1 51 A n 1 52 A n 1 53 G n 1 54 G n 1 55 A n 1 56 C n 1 57 G n 1 58 U n 1 59 G n 1 60 G n 1 61 C n 1 62 U n 1 63 A n 1 64 C n 1 65 C n 1 66 U n 1 67 G n 1 68 C n 1 69 G n 1 70 A n 1 71 U n 1 72 A n 1 73 A n 1 74 G n 1 75 C n 1 76 C n 1 77 A n 1 78 G n 1 79 G n 1 80 G n 1 81 G n 1 82 G n 1 83 A n 1 84 G n 1 85 C n 1 86 C n 1 87 G n 1 88 G n 1 89 U n 1 90 A n 1 91 G n 1 92 C n 1 93 G n 1 94 G n 1 95 G n 1 96 C n 1 97 G n 1 98 U n 1 99 G n 1 100 G n 1 101 A n 1 102 U n 1 103 C n 1 104 C n 1 105 C n 1 106 U n 1 107 G n 1 108 G n 1 109 A n 1 110 U n 1 111 G n 1 112 U n 1 113 C n 1 114 C n 1 115 G n 1 116 A n 1 117 A n 1 118 U n 1 119 G n 1 120 G n 1 121 G n 1 122 G n 1 123 G n 1 124 A n 1 125 A n 1 126 C n 1 127 C n 1 128 C n 1 129 G n 1 130 G n 1 131 C n 1 132 C n 1 133 G n 1 134 G n 1 135 C n 1 136 G n 1 137 G n 1 138 G n 1 139 A n 1 140 A n 1 141 C n 1 142 G n 1 143 C n 1 144 C n 1 145 G n 1 146 G n 1 147 U n 1 148 C n 1 149 A n 1 150 C n 1 151 C n 1 152 G n 1 153 C n 1 154 G n 1 155 C n 1 156 U n 1 157 U n 1 158 U n 1 159 U n 1 160 U n 1 161 G n 1 162 C n 1 163 G n 1 164 C n 1 165 G n 1 166 G n 1 167 G n 1 168 G n 1 169 G n 1 170 G n 1 171 A n 1 172 A n 1 173 C n 1 174 C n 1 175 U n 1 176 G n 1 177 G n 1 178 G n 1 179 G n 1 180 A n 1 181 A n 1 182 C n 1 183 U n 1 184 G n 1 185 A n 1 186 A n 1 187 A n 1 188 C n 1 189 A n 1 190 U n 1 191 C n 1 192 U n 1 193 C n 1 194 A n 1 195 G n 1 196 U n 1 197 A n 1 198 C n 1 199 C n 1 200 C n 1 201 A n 1 202 G n 1 203 A n 1 204 G n 1 205 G n 1 206 A n 1 207 G n 1 208 A n 1 209 G n 1 210 G n 1 211 A n 1 212 A n 1 213 A n 1 214 G n 1 215 A n 1 216 G n 1 217 A n 1 218 A n 1 219 A n 1 220 U n 1 221 C n 1 222 G n 1 223 A n 1 224 C n 1 225 U n 1 226 C n 1 227 C n 1 228 C n 1 229 U n 1 230 G n 1 231 A n 1 232 G n 1 233 U n 1 234 A n 1 235 G n 1 236 C n 1 237 G n 1 238 G n 1 239 C n 1 240 G n 1 241 A n 1 242 G n 1 243 C n 1 244 G n 1 245 A n 1 246 A n 1 247 A n 1 248 G n 1 249 G n 1 250 G n 1 251 G n 1 252 A n 1 253 C n 1 254 C n 1 255 A n 1 256 G n 1 257 C n 1 258 C n 1 259 U n 1 260 A n 1 261 A n 1 262 A n 1 263 C n 1 264 C n 1 265 G n 1 266 U n 1 267 C n 1 268 C n 1 269 G n 1 270 G n 1 271 C n 1 272 U n 1 273 U n 1 274 G n 1 275 U n 1 276 C n 1 277 C n 1 278 G n 1 279 G n 1 280 G n 1 281 C n 1 282 G n 1 283 G n 1 284 G n 1 285 G n 1 286 U n 1 287 C n 1 288 G n 1 289 U n 1 290 G n 1 291 G n 1 292 G n 1 293 G n 1 294 C n 1 295 C n 1 296 C n 1 297 U n 1 298 C n 1 299 G n 1 300 G n 1 301 A n 1 302 C n 1 303 A n 1 304 C n 1 305 C n 1 306 G n 1 307 A n 1 308 A n 1 309 U n 1 310 C n 1 311 C n 1 312 C n 1 313 C n 1 314 A n 1 315 G n 1 316 C n 1 317 C n 1 318 U n 1 319 A n 1 320 G n 1 321 C n 1 322 C n 1 323 G n 1 324 A n 1 325 A n 1 326 G n 1 327 C n 1 328 U n 1 329 G n 1 330 U n 1 331 U n 1 332 G n 1 333 G n 1 334 G n 1 335 A n 1 336 A n 1 337 G n 1 338 C n 1 339 A n 1 340 G n 1 341 C n 1 342 G n 1 343 C n 1 344 C n 1 345 A n 1 346 G n 1 347 A n 1 348 G n 1 349 A n 1 350 G n 1 351 G n 1 352 G n 1 353 U n 1 354 G n 1 355 A n 1 356 A n 1 357 A n 1 358 G n 1 359 C n 1 360 C n 1 361 C n 1 362 C n 1 363 G n 1 364 U n 1 365 A n 1 366 G n 1 367 G n 1 368 C n 1 369 G n 1 370 A n 1 371 A n 1 372 A n 1 373 G n 1 374 G n 1 375 U n 1 376 G n 1 377 G n 1 378 G n 1 379 G n 1 380 G n 1 381 G n 1 382 A n 1 383 U n 1 384 A n 1 385 G n 1 386 G n 1 387 U n 1 388 G n 1 389 A n 1 390 G n 1 391 G n 1 392 G n 1 393 U n 1 394 A n 1 395 C n 1 396 C n 1 397 C n 1 398 G n 1 399 A n 1 400 G n 1 401 U n 1 402 A n 1 403 C n 1 404 C n 1 405 C n 1 406 C n 1 407 G n 1 408 U n 1 409 G n 1 410 G n 1 411 U n 1 412 U n 1 413 C n 1 414 G n 1 415 U n 1 416 G n 1 417 G n 1 418 A n 1 419 G n 1 420 C n 1 421 C n 1 422 A n 1 423 U n 1 424 G n 1 425 G n 1 426 G n 1 427 G n 1 428 G n 1 429 A n 1 430 A n 1 431 U n 1 432 C n 1 433 U n 1 434 G n 1 435 G n 1 436 G n 1 437 C n 1 438 G n 1 439 G n 1 440 A n 1 441 C n 1 442 C n 1 443 A n 1 444 C n 1 445 C n 1 446 G n 1 447 C n 1 448 C n 1 449 U n 1 450 A n 1 451 A n 1 452 G n 1 453 G n 1 454 C n 1 455 U n 1 456 A n 1 457 A n 1 458 G n 1 459 U n 1 460 A n 1 461 C n 1 462 U n 1 463 C n 1 464 C n 1 465 G n 1 466 G n 1 467 G n 1 468 U n 1 469 G n 1 470 A n 1 471 C n 1 472 C n 1 473 G n 1 474 A n 1 475 U n 1 476 A n 1 477 G n 1 478 C n 1 479 G n 1 480 C n 1 481 A n 1 482 C n 1 483 C n 1 484 A n 1 485 G n 1 486 U n 1 487 A n 1 488 C n 1 489 C n 1 490 G n 1 491 U n 1 492 G n 1 493 A n 1 494 G n 1 495 G n 1 496 G n 1 497 A n 1 498 A n 1 499 A n 1 500 G n 1 501 G n 1 502 U n 1 503 G n 1 504 A n 1 505 A n 1 506 A n 1 507 A n 1 508 G n 1 509 A n 1 510 A n 1 511 C n 1 512 C n 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'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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'X-RAY DIFFRACTION' 7.2301 154.2648 14 100.0000 85901 . 0.2219 0.2398 . 146 . 86047 . . 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 3UZ9 _struct.title ;Crystal structure analysis of ribosomal decoding. This entry contains the 50S ribosomal subunit of the first 70S molecule in the asymmetric unit for the cognate tRNA-tyr complex. ; _struct.pdbx_descriptor 'PROTEIN/RNA Complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3UZ9 _struct_keywords.text 'RNA, ribosome, tRNA, translation, mRNA' _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 26 ? AA N N 27 ? BA N N 28 ? CA N N 29 ? DA N N 30 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details 'THERE ARE 2 BIOLOGICAL UNITS IN THE ASSYMETRIC UNIT.' # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 LYS C 68 ? VAL C 73 ? LYS D 68 VAL D 73 5 ? 6 HELX_P HELX_P2 2 ARG C 134 ? ILE C 136 ? ARG D 134 ILE D 136 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 3 ASP C 200 ? ILE C 204 ? ASP D 200 ILE D 204 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 4 LYS C 208 ? LEU C 215 ? 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ALA N 79 ? ASN Q 61 ALA Q 79 1 ? 19 HELX_P HELX_P49 49 HIS N 95 ? GLU N 103 ? HIS Q 95 GLU Q 103 1 ? 9 HELX_P HELX_P50 50 ARG O 3 ? SER O 12 ? ARG R 3 SER R 12 1 ? 10 HELX_P HELX_P51 51 LEU O 99 ? LEU O 105 ? LEU R 99 LEU R 105 5 ? 7 HELX_P HELX_P52 52 GLU O 109 ? LYS O 113 ? GLU R 109 LYS R 113 5 ? 5 HELX_P HELX_P53 53 ASP O 117 ? GLU O 133 ? ASP R 117 GLU R 133 1 ? 17 HELX_P HELX_P54 54 VAL P 8 ? ALA P 21 ? VAL 1 8 ALA 1 21 1 ? 14 HELX_P HELX_P55 55 GLY P 26 ? SER P 31 ? GLY 1 26 SER 1 31 1 ? 6 HELX_P HELX_P56 56 SER P 31 ? ARG P 52 ? SER 1 31 ARG 1 52 1 ? 22 HELX_P HELX_P57 57 ARG P 52 ? GLN P 71 ? ARG 1 52 GLN 1 71 1 ? 20 HELX_P HELX_P58 58 ASN P 75 ? GLY P 87 ? ASN 1 75 GLY 1 87 1 ? 13 HELX_P HELX_P59 59 ASP P 97 ? GLU P 102 ? ASP 1 97 GLU 1 102 1 ? 6 HELX_P HELX_P60 60 GLU P 102 ? ALA P 115 ? GLU 1 102 ALA 1 115 1 ? 14 HELX_P HELX_P61 61 SER R 13 ? ASP R 22 ? SER S 13 ASP S 22 1 ? 10 HELX_P HELX_P62 62 SER R 28 ? TYR R 38 ? SER S 28 TYR S 38 1 ? 11 HELX_P HELX_P63 63 LYS R 41 ? 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-14.54 85.51 147 1 ALA H 156 ? ? -132.16 -152.43 148 1 GLU H 159 ? ? -46.74 81.07 149 1 ALA H 165 ? ? -58.16 101.75 150 1 GLU H 167 ? ? 40.30 107.92 151 1 PRO H 168 ? ? -71.32 -74.20 152 1 VAL H 169 ? ? 95.43 166.59 153 1 ARG H 170 ? ? -143.92 -137.64 154 1 GLU K 7 ? ? 170.60 131.57 155 1 LEU K 9 ? ? -171.00 138.43 156 1 GLU K 10 ? ? -34.36 124.91 157 1 ASN K 11 ? ? 61.36 126.58 158 1 LEU K 12 ? ? 81.09 119.85 159 1 TYR K 29 ? ? -130.96 -77.14 160 1 LEU K 30 ? ? -51.45 -70.35 161 1 LEU K 35 ? ? -95.15 34.22 162 1 ALA K 36 ? ? 176.65 163.28 163 1 ALA K 65 ? ? -74.18 30.73 164 1 GLU K 66 ? ? -150.66 -19.85 165 1 GLU K 70 ? ? -91.43 42.01 166 1 ILE K 71 ? ? -154.52 -24.56 167 1 ASN K 74 ? ? -135.85 -47.61 168 1 ARG K 82 ? ? -64.14 94.87 169 1 LYS K 87 ? ? 174.04 87.50 170 1 SER K 91 ? ? -178.56 140.03 171 1 THR K 93 ? ? -107.67 -169.53 172 1 SER K 102 ? ? -58.19 -72.51 173 1 ARG K 103 ? ? -91.52 53.00 174 1 GLN K 104 ? ? -169.35 21.84 175 1 HIS K 105 ? ? 177.08 -10.88 176 1 ASP K 110 ? ? -91.01 -62.04 177 1 LYS K 112 ? ? -38.24 128.10 178 1 ARG K 113 ? ? 66.21 94.09 179 1 LEU K 114 ? ? -158.47 -66.32 180 1 ALA K 115 ? ? 178.90 50.31 181 1 LEU K 116 ? ? -55.39 3.12 182 1 GLU K 117 ? ? -49.26 65.08 183 1 LYS K 118 ? ? 67.14 122.91 184 1 HIS K 133 ? ? 51.63 -179.45 185 1 PRO K 134 ? ? -12.44 103.73 186 1 GLU K 135 ? ? -130.70 -139.14 187 1 SER K 143 ? ? -96.33 -127.25 188 1 VAL K 145 ? ? 79.36 162.89 189 1 VAL M 9 ? ? -105.00 -149.90 190 1 ALA M 18 ? ? 83.38 -37.30 191 1 THR M 22 ? ? -48.20 -91.58 192 1 LEU M 23 ? ? 169.27 -78.22 193 1 TRP M 42 ? ? -36.18 146.09 194 1 ALA M 47 ? ? 76.69 67.23 195 1 MET M 48 ? ? -118.31 58.28 196 1 ASN M 56 ? ? 34.90 48.07 197 1 ASP M 58 ? ? 149.93 -5.91 198 1 THR M 63 ? ? -69.77 -177.07 199 1 HIS M 94 ? ? -141.97 57.49 200 1 PRO M 95 ? ? -47.21 150.07 201 1 GLU M 96 ? ? 74.50 -164.81 202 1 ARG M 97 ? ? 65.35 -65.54 203 1 ARG M 119 ? ? -98.74 32.46 204 1 PRO M 126 ? ? -77.82 -165.99 205 1 ASP M 127 ? ? 74.22 161.15 206 1 HIS M 128 ? ? 164.20 153.73 207 1 GLN M 131 ? ? 33.50 -69.08 208 1 GLU M 136 ? ? -44.99 154.00 209 1 GLN N 5 ? ? 109.65 -23.47 210 1 ALA N 11 ? ? -100.50 52.97 211 1 ARG N 23 ? ? -170.16 143.46 212 1 LYS N 26 ? ? -126.44 -93.66 213 1 ASN N 29 ? ? -156.32 43.00 214 1 LEU N 91 ? ? 72.35 39.74 215 1 ARG N 97 ? ? 64.90 125.42 216 1 LEU O 6 ? ? -60.24 -94.07 217 1 ARG O 7 ? ? 59.63 131.78 218 1 PRO O 10 ? ? -24.23 -81.81 219 1 ALA O 12 ? ? 52.52 -8.82 220 1 ASN O 13 ? ? -152.45 77.76 221 1 ARG O 16 ? ? -33.47 160.71 222 1 ARG O 21 ? ? -97.46 -99.52 223 1 SER O 25 ? ? -167.31 3.96 224 1 HIS O 27 ? ? 50.41 -4.01 225 1 LYS O 29 ? ? 48.32 -101.38 226 1 THR O 30 ? ? -63.75 2.68 227 1 HIS O 35 ? ? 66.74 -95.83 228 1 LYS O 36 ? ? 58.70 -175.74 229 1 SER O 42 ? ? -50.59 -90.36 230 1 ASP O 47 ? ? 118.22 88.31 231 1 PRO O 48 ? ? -78.04 21.02 232 1 ARG O 50 ? ? -143.65 -59.15 233 1 THR O 57 ? ? -76.22 -168.07 234 1 THR O 58 ? ? -82.22 48.68 235 1 MET O 60 ? ? -102.17 40.73 236 1 LEU O 62 ? ? 64.86 120.19 237 1 LYS O 64 ? ? -134.45 -39.14 238 1 ARG O 65 ? ? -49.22 16.53 239 1 MET O 67 ? ? 100.95 73.77 240 1 GLN O 70 ? ? -115.91 -167.63 241 1 LEU O 88 ? ? -78.78 20.66 242 1 ARG O 90 ? ? -49.68 -18.57 243 1 GLU O 94 ? ? -77.82 -80.56 244 1 VAL O 95 ? ? 87.84 84.09 245 1 LEU O 106 ? ? 129.24 -47.99 246 1 LYS O 107 ? ? 72.92 150.52 247 1 GLU O 117 ? ? -24.88 108.59 248 1 PRO O 122 ? ? -68.50 63.64 249 1 ALA O 140 ? ? -68.00 53.40 250 1 ALA O 141 ? ? 160.59 -70.50 251 1 LEU O 148 ? ? 159.85 61.51 252 1 LEU P 2 ? ? 126.48 101.32 253 1 ARG P 6 ? ? 62.37 136.32 254 1 MET P 7 ? ? -166.14 118.55 255 1 LYS P 11 ? ? 62.78 107.23 256 1 GLN P 13 ? ? -47.78 163.95 257 1 THR P 21 ? ? 75.13 103.35 258 1 ASP P 25 ? ? 149.77 19.46 259 1 TYR P 26 ? ? 166.19 31.58 260 1 VAL P 27 ? ? 56.03 145.64 261 1 ALA P 28 ? ? -158.63 1.90 262 1 PHE P 29 ? ? -139.51 -38.37 263 1 ARG P 59 ? ? -11.38 92.89 264 1 ARG P 60 ? ? 51.47 -31.07 265 1 ILE P 66 ? ? 54.03 -75.98 266 1 ARG P 67 ? ? 72.75 -1.28 267 1 LYS P 76 ? ? -170.14 122.09 268 1 PRO P 78 ? ? -47.52 -179.37 269 1 GLU P 80 ? ? 89.95 41.01 270 1 LYS P 85 ? ? 76.07 80.16 271 1 ASN P 89 ? ? 168.44 -11.70 272 1 VAL P 90 ? ? 77.03 109.79 273 1 PHE P 104 ? ? 78.10 -89.77 274 1 GLU P 105 ? ? 71.50 121.02 275 1 GLU P 112 ? ? -55.44 -4.31 276 1 GLN P 113 ? ? -97.50 -63.20 277 1 ARG P 133 ? ? -91.68 -78.50 278 1 ARG P 134 ? ? 153.23 94.12 279 1 GLU P 139 ? ? -6.81 -120.32 280 1 ALA P 140 ? ? -150.39 -94.96 281 1 ARG 0 2 ? ? 134.94 49.19 282 1 HIS 0 3 ? ? -68.48 -151.22 283 1 LEU 0 4 ? ? -33.27 53.95 284 1 LEU 0 10 ? ? -112.60 57.97 285 1 LEU 0 29 ? ? -62.87 16.32 286 1 ARG 0 45 ? ? -33.60 -79.03 287 1 ASP 0 59 ? ? -45.46 151.27 288 1 GLN 0 71 ? ? 59.10 -9.48 289 1 ARG 0 86 ? ? -42.76 -6.41 290 1 ASP 0 107 ? ? 163.19 -28.13 291 1 LEU Q 4 ? ? 36.24 106.93 292 1 HIS Q 34 ? ? -112.06 -164.65 293 1 ILE Q 35 ? ? -168.72 113.27 294 1 GLU Q 43 ? ? 68.86 -44.09 295 1 ALA Q 51 ? ? -172.31 115.34 296 1 LYS Q 57 ? ? 26.51 60.15 297 1 ASN Q 61 ? ? 42.89 91.00 298 1 LYS Q 83 ? ? -116.96 -88.72 299 1 ASP Q 88 ? ? -44.07 -92.80 300 1 ARG Q 89 ? ? 90.23 -6.48 301 1 TYR Q 94 ? ? -61.48 99.42 302 1 GLU Q 107 ? ? 62.20 62.63 303 1 LEU Q 110 ? ? 81.17 -161.66 304 1 GLU Q 111 ? ? 60.39 69.04 305 1 ASN R 2 ? ? 45.44 -176.22 306 1 ARG R 3 ? ? 47.47 19.72 307 1 SER R 12 ? ? -63.17 91.38 308 1 LYS R 35 ? ? -79.80 -79.40 309 1 GLU R 36 ? ? 75.50 53.12 310 1 ASN R 38 ? ? 76.90 -60.43 311 1 ARG R 39 ? ? -65.52 -162.37 312 1 THR R 40 ? ? -172.54 107.02 313 1 ASN R 55 ? ? -161.38 51.49 314 1 PHE R 57 ? ? -61.15 -176.66 315 1 ASN R 58 ? ? 24.89 42.71 316 1 HIS R 79 ? ? -103.79 42.72 317 1 LEU R 82 ? ? -69.70 1.73 318 1 ILE R 86 ? ? -160.90 94.53 319 1 ALA R 94 ? ? -57.23 -76.16 320 1 ARG R 95 ? ? 91.41 0.83 321 1 LEU R 99 ? ? -113.87 71.11 322 1 LEU R 105 ? ? -145.81 27.38 323 1 SER R 106 ? ? -48.33 32.62 324 1 ASP R 107 ? ? -112.65 -163.04 325 1 ARG R 111 ? ? -85.13 33.42 326 1 ARG R 112 ? ? -161.22 3.44 327 1 ALA R 135 ? ? -145.27 -60.48 328 1 GLN R 136 ? ? -49.83 -77.55 329 1 ARG 1 55 ? ? -93.18 -61.98 330 1 ASN 1 66 ? ? -49.50 -16.60 331 1 ILE 1 88 ? ? -65.49 78.81 332 1 VAL 1 90 ? ? -74.22 -101.26 333 1 ASP 1 91 ? ? 15.94 -49.50 334 1 LYS 1 93 ? ? 27.18 -43.07 335 1 ALA 1 116 ? ? 76.60 123.10 336 1 LYS 2 24 ? ? -37.52 127.10 337 1 ASP 2 26 ? ? -74.87 33.03 338 1 PRO 2 29 ? ? -47.75 156.72 339 1 PRO 2 36 ? ? -44.10 3.84 340 1 GLU 2 43 ? ? -99.50 44.81 341 1 LYS 2 44 ? ? 43.12 -155.97 342 1 THR 2 45 ? ? 38.63 -10.14 343 1 VAL 2 47 ? ? -132.17 -54.19 344 1 THR 2 49 ? ? 42.90 -167.16 345 1 PRO 2 50 ? ? -49.39 -81.43 346 1 VAL 2 79 ? ? -146.48 -1.29 347 1 LYS 2 97 ? ? -98.54 -76.69 348 1 VAL S 59 ? ? -76.82 -74.20 349 1 ASN S 60 ? ? -73.59 24.62 350 1 ASN S 61 ? ? -152.10 -29.14 351 1 ASP S 63 ? ? 54.14 86.99 352 1 LEU S 65 ? ? 87.48 102.61 353 1 GLU S 66 ? ? -47.63 5.55 354 1 ALA S 93 ? ? 73.24 105.31 355 1 HIS S 111 ? ? -12.95 -49.24 356 1 ALA T 19 ? ? -35.84 -19.21 357 1 LYS T 40 ? ? -48.84 -80.03 358 1 LYS T 48 ? ? 38.75 61.05 359 1 ARG T 68 ? ? 60.09 -53.54 360 1 ALA T 91 ? ? -63.30 10.80 361 1 VAL U 3 ? ? 63.02 99.77 362 1 MET U 5 ? ? 77.13 -140.92 363 1 HIS U 6 ? ? 168.58 4.59 364 1 ASP U 11 ? ? -32.42 156.17 365 1 TYR U 20 ? ? -84.09 30.21 366 1 ARG U 23 ? ? -47.98 155.74 367 1 VAL U 27 ? ? -59.92 104.79 368 1 VAL U 39 ? ? -112.24 -94.94 369 1 GLU U 40 ? ? -158.84 -10.42 370 1 VAL U 42 ? ? -11.79 108.42 371 1 LYS U 47 ? ? -39.90 120.40 372 1 ARG U 50 ? ? -9.37 11.75 373 1 SER U 52 ? ? -80.76 -72.58 374 1 PRO U 53 ? ? -77.82 -147.78 375 1 TYR U 55 ? ? 63.10 61.54 376 1 PRO U 56 ? ? -83.25 -147.24 377 1 GLN U 57 ? ? 39.54 -71.73 378 1 PRO U 77 ? ? 3.49 60.34 379 1 ALA U 78 ? ? 162.22 -137.37 380 1 CYS U 79 ? ? -100.07 -153.42 381 1 LYS U 88 ? ? -124.37 -109.49 382 1 LEU U 90 ? ? -156.27 -124.55 383 1 ILE U 96 ? ? -58.87 175.66 384 1 VAL U 98 ? ? -152.95 -33.74 385 1 CYS U 99 ? ? -133.48 -101.89 386 1 LYS U 101 ? ? -101.09 66.94 387 1 CYS U 102 ? ? 63.50 -179.65 388 1 LEU V 5 ? ? -94.59 -113.73 389 1 LYS V 6 ? ? 151.03 80.29 390 1 GLU V 11 ? ? -144.89 -77.29 391 1 GLU V 13 ? ? 51.47 102.36 392 1 PRO V 25 ? ? -49.96 152.03 393 1 ALA V 51 ? ? -57.78 -96.57 394 1 SER V 52 ? ? 74.31 72.23 395 1 ILE V 53 ? ? 47.86 -1.71 396 1 LEU V 59 ? ? 62.92 -54.92 397 1 GLU V 60 ? ? 77.93 -79.75 398 1 LEU V 61 ? ? 51.91 145.01 399 1 ASP V 63 ? ? 148.48 -53.25 400 1 GLN V 65 ? ? -73.33 -162.64 401 1 SER V 66 ? ? -160.33 100.90 402 1 ARG V 81 ? ? 12.38 61.35 403 1 HIS V 85 ? ? -173.07 132.67 404 1 SER V 92 ? ? -122.35 -149.61 405 1 PRO V 95 ? ? -58.39 101.21 406 1 PRO V 108 ? ? -55.48 53.37 407 1 VAL V 111 ? ? 49.30 27.54 408 1 ARG V 112 ? ? -25.40 128.94 409 1 GLN V 118 ? ? 36.77 98.45 410 1 ILE V 124 ? ? 176.38 141.44 411 1 LYS V 127 ? ? -112.06 77.17 412 1 PRO V 134 ? ? -56.70 92.03 413 1 GLU V 135 ? ? -55.50 10.97 414 1 PHE V 136 ? ? 168.94 179.97 415 1 ASP V 140 ? ? -100.15 -95.09 416 1 VAL V 141 ? ? 58.98 103.78 417 1 LEU V 144 ? ? 63.59 82.95 418 1 GLU V 145 ? ? -141.97 -132.93 419 1 SER V 149 ? ? -163.59 97.30 420 1 HIS V 151 ? ? -74.58 -96.41 421 1 ALA V 152 ? ? -163.12 -10.68 422 1 LYS V 156 ? ? -48.83 -13.10 423 1 LEU V 157 ? ? 25.45 66.29 424 1 PRO V 158 ? ? -46.53 164.95 425 1 PRO V 159 ? ? -55.33 11.94 426 1 VAL V 161 ? ? 178.75 -150.77 427 1 ALA V 164 ? ? -105.87 58.88 428 1 VAL V 165 ? ? 50.15 155.53 429 1 GLU V 168 ? ? -64.59 64.67 430 1 THR V 170 ? ? -68.31 -163.55 431 1 ILE V 171 ? ? -173.92 -24.31 432 1 ALA V 173 ? ? 175.87 177.82 433 1 ASN 3 12 ? ? -96.12 -130.41 434 1 THR 3 43 ? ? -106.64 53.02 435 1 PRO 3 83 ? ? -61.45 -150.41 436 1 LEU 3 84 ? ? 87.36 65.33 437 1 ALA Z 54 ? ? 57.64 -108.90 438 1 ALA Z 64 ? ? -39.13 -38.20 439 1 LYS Z 78 ? ? -169.99 84.47 440 1 LYS Z 81 ? ? -111.61 54.39 441 1 LEU Z 82 ? ? -104.40 -155.98 442 1 LEU Z 85 ? ? -93.38 59.61 443 1 LYS Z 88 ? ? -36.34 -35.05 444 1 LYS Z 91 ? ? -59.54 -166.39 445 1 LYS Z 92 ? ? -20.62 -36.24 446 1 LYS Z 96 ? ? -154.51 -25.56 447 1 LEU Z 97 ? ? 49.98 -105.56 448 1 LYS W 15 ? ? 60.03 91.06 449 1 LEU W 16 ? ? 127.87 99.44 450 1 SER W 17 ? ? 171.99 -178.46 451 1 GLN W 43 ? ? 36.26 11.34 452 1 GLN W 46 ? ? -117.19 76.22 453 1 ASN W 47 ? ? -9.07 -127.68 454 1 HIS W 48 ? 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O LYS 142 35 1 Y 1 R ALA 143 ? O ALA 143 36 1 Y 1 R SER 144 ? O SER 144 37 1 Y 1 R GLN 145 ? O GLN 145 38 1 Y 1 R GLU 146 ? O GLU 146 39 1 Y 1 1 MET 1 ? P MET 1 40 1 Y 1 T MET 1 ? S MET 1 41 1 Y 1 T LYS 2 ? S LYS 2 42 1 Y 1 T LEU 95 ? S LEU 95 43 1 Y 1 T ILE 96 ? S ILE 96 44 1 Y 1 U MET 1 ? T MET 1 45 1 Y 1 U GLY 104 ? T GLY 104 46 1 Y 1 U ALA 105 ? T ALA 105 47 1 Y 1 U LEU 106 ? T LEU 106 48 1 Y 1 U ASP 107 ? T ASP 107 49 1 Y 1 U THR 108 ? T THR 108 50 1 Y 1 U GLU 109 ? T GLU 109 51 1 Y 1 U GLU 110 ? T GLU 110 52 1 Y 1 V PRO 176 ? U PRO 176 53 1 Y 1 V PRO 177 ? U PRO 177 54 1 Y 1 V GLU 178 ? U GLU 178 55 1 Y 1 V ASP 179 ? U ASP 179 56 1 Y 1 V VAL 180 ? U VAL 180 57 1 Y 1 V GLU 181 ? U GLU 181 58 1 Y 1 V LYS 182 ? U LYS 182 59 1 Y 1 V LEU 183 ? U LEU 183 60 1 Y 1 V ALA 184 ? U ALA 184 61 1 Y 1 V GLU 185 ? U GLU 185 62 1 Y 1 V GLU 186 ? U GLU 186 63 1 Y 1 V ALA 187 ? U ALA 187 64 1 Y 1 V ALA 188 ? U ALA 188 65 1 Y 1 V ALA 189 ? U ALA 189 66 1 Y 1 V GLU 190 ? 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DA GLU 65 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 3UZ9 'double helix' 3UZ9 'a-form double helix' 3UZ9 'b-form double helix' 3UZ9 'parallel strands' 3UZ9 'hairpin loop' 3UZ9 tetraloop 3UZ9 'bulge loop' 3UZ9 'mismatched base pair' 3UZ9 'internal loop' 3UZ9 'triple helix' 3UZ9 'quadruple helix' 3UZ9 'three-way junction' 3UZ9 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A C 2912 1_555 -0.709 -0.279 0.213 3.146 2.180 -2.582 1 A_G1:C2902_A A 1 ? 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