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'complete structure' # _pdbx_database_status.entry_id 3V6V _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2011-12-20 _pdbx_database_status.status_code OBS _pdbx_database_status.status_code_sf OBS _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Fagan, C.E.' 1 'Dunkle, J.A.' 2 'Maehigashi, T.' 3 'Dunham, C.M.' 4 # _citation.id primary _citation.title 'Reorganization of an intersubunit bridge induced by disparate 16S ribosomal ambiguity mutations mimics an EF-Tu-bound state.' _citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA _citation.journal_volume 110 _citation.page_first 9716 _citation.page_last 9721 _citation.year 2013 _citation.journal_id_ASTM PNASA6 _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0027-8424 _citation.journal_id_CSD 0040 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 23630274 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.1301585110 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Fagan, C.E.' 1 primary 'Dunkle, J.A.' 2 primary 'Maehigashi, T.' 3 primary 'Dang, M.N.' 4 primary 'Devaraj, A.' 5 primary 'Miles, S.J.' 6 primary 'Qin, D.' 7 primary 'Fredrick, K.' 8 primary 'Dunham, C.M.' 9 # _cell.entry_id 3V6V _cell.length_a 210.197 _cell.length_b 446.163 _cell.length_c 620.953 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 3V6V _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat '16S rRNA' 493919.250 1 ? 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;MPVEITVKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDI VRMEAERAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPD AIFVVDPTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQ EAEATETPEGESEVEA ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MGNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRG GERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGA EQARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE ; ;MGNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRG GERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGA EQARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE ; C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MGRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFE EASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQ NLEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR ; ;MGRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFE EASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQ NLEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR ; D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MPETDFEEKMILIRRTARMQAGGRRFRFGALVVVGDRQGRVGLGFGKAPEVPLAVQKAGYYARRNMVEVPLQNGTIPHEI EVEFGASKIVLKPAAPGTGVIAGAVPRAILELAGVTDILTKELGSRNPINIAYATMEALRQLRTKADVERLRKGEAHAQA QG ; ;MPETDFEEKMILIRRTARMQAGGRRFRFGALVVVGDRQGRVGLGFGKAPEVPLAVQKAGYYARRNMVEVPLQNGTIPHEI EVEFGASKIVLKPAAPGTGVIAGAVPRAILELAGVTDILTKELGSRNPINIAYATMEALRQLRTKADVERLRKGEAHAQA QG ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELR IRDNVRRVMVVKSQEPFLANA ; ;MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELR IRDNVRRVMVVKSQEPFLANA ; F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRV 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;MPKIRIKLRGFDHKTLDASAQKIVEAARRSGAQVSGPIPLPTRVRRFTVIRGPFKHKDSREHFELRTHNRLVDIINPNRK TIEQLMTLDLPTGVEIEIKTVGGGR ; J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MAKKPSKKKVKRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSV DVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS ; ;MAKKPSKKKVKRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSV DVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MPTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEHSVV LIRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEAAKTAAKK ; ;MPTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEHSVV LIRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEAAKTAAKK ; L ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKR LMDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; ;MARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKR LMDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; M ? 14 'polypeptide(L)' no no MARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW MARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW N ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MPITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRA LIEKLGIRG ; ;MPITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRA LIEKLGIRG ; O ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQEAREGA ; ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQEAREGA ; P ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MPKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESG RMDLVEKYLIRRQNYESLSKRGGKA ; ;MPKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESG RMDLVEKYLIRRQNYESLSKRGGKA ; Q ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MSTKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSAKEQRILAKTIKRARILGLLP 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'X-RAY DIFFRACTION' . 7.0810 7.6259 16474 0.2153 96.00 0.2480 . . 541 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 7.6259 8.3900 16428 0.2162 96.00 0.2457 . . 614 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 8.3900 9.5963 16287 0.2174 96.00 0.2421 . . 687 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 9.5963 12.0614 16280 0.2104 95.00 0.2304 . . 770 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 12.0614 49.4719 15941 0.2382 91.00 0.2556 . . 799 . . . . # _struct.entry_id 3V6V _struct.title ;Crystal structure of the bacterial ribosome ram mutation G347U. this entry contains the 30S ribosomal subunit of the second 70S molecule in the asymmetric unit ; _struct.pdbx_descriptor 'PROTEIN/RNA Complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3V6V _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME _struct_keywords.text ;Protein biosynthesis, ribosomes, RNA, tRNA, transfer, ribosomal ambiguity mutations, ram, 30S, 70S, 16S, ribosomal subunit, PAROMOMYCIN as crystallization agent, RIBOSOME ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 22 ? Y N N 24 ? Z N N 25 ? AA N N 25 ? BA N N 25 ? CA N N 25 ? DA N N 25 ? EA N N 25 ? FA N N 25 ? GA N N 25 ? HA N N 25 ? IA N N 25 ? JA N N 25 ? KA N N 25 ? LA N N 25 ? MA N N 25 ? NA N N 25 ? OA N N 25 ? PA N N 25 ? QA N N 25 ? RA N N 25 ? SA N N 25 ? TA N N 25 ? UA N N 25 ? VA N N 25 ? WA N N 25 ? XA N N 25 ? YA N N 25 ? ZA N N 25 ? AB N N 25 ? BB N N 25 ? CB N N 25 ? DB N N 25 ? EB N N 25 ? FB N N 25 ? GB N N 25 ? HB N N 25 ? IB N N 25 ? JB N N 25 ? KB N N 25 ? LB N N 25 ? MB N N 25 ? NB N N 25 ? OB N N 25 ? PB N N 25 ? QB N N 25 ? RB N N 25 ? SB N N 25 ? TB N N 25 ? UB N N 25 ? VB N N 25 ? WB N N 25 ? XB N N 25 ? YB N N 25 ? ZB N N 25 ? AC N N 25 ? BC N N 25 ? CC N N 25 ? DC N N 25 ? EC N N 25 ? FC N N 25 ? GC N N 25 ? HC N N 25 ? IC N N 25 ? JC N N 25 ? KC N N 25 ? LC N N 25 ? MC N N 25 ? NC N N 25 ? OC N N 25 ? PC N N 25 ? QC N N 25 ? RC N N 25 ? SC N N 25 ? TC N N 25 ? UC N N 25 ? VC N N 25 ? WC N N 25 ? XC N N 25 ? YC N N 25 ? ZC N N 25 ? AD N N 25 ? BD N N 25 ? CD N N 25 ? DD N N 25 ? ED N N 25 ? FD N N 25 ? GD N N 25 ? HD N N 25 ? ID N N 25 ? JD N N 25 ? KD N N 25 ? LD N N 25 ? MD N N 25 ? ND N N 25 ? OD N N 25 ? PD N N 25 ? QD N N 25 ? RD N N 25 ? SD N N 25 ? TD N N 25 ? UD N N 25 ? VD N N 25 ? WD N N 25 ? XD N N 25 ? YD N N 25 ? ZD N N 25 ? AE N N 25 ? BE N N 25 ? CE N N 25 ? DE N N 25 ? EE N N 25 ? FE N N 25 ? GE N N 25 ? HE N N 25 ? IE N N 25 ? JE N N 25 ? KE N N 25 ? LE N N 25 ? ME N N 26 ? NE N N 27 ? OE N N 27 ? PE N N 25 ? QE N N 25 ? RE N N 25 ? SE N N 25 ? TE N N 25 ? UE N N 25 ? VE N N 25 ? WE N N 25 ? XE N N 25 ? YE N N 25 ? ZE N N 25 ? AF N N 25 ? BF N N 25 ? CF N N 25 ? DF N N 25 ? EF N N 25 ? FF N N 25 ? GF N N 25 ? HF N N 25 ? IF N N 25 ? JF N N 25 ? KF N N 25 ? LF N N 25 ? MF N N 25 ? NF N N 25 ? OF N N 25 ? PF N N 25 ? QF N N 25 ? RF N N 25 ? SF N N 25 ? TF N N 25 ? UF N N 25 ? VF N N 25 ? WF N N 25 ? XF N N 25 ? YF N N 25 ? ZF N N 25 ? AG N N 25 ? BG N N 25 ? CG N N 25 ? DG N N 25 ? EG N N 25 ? FG N N 25 ? GG N N 25 ? HG N N 25 ? IG N N 25 ? JG N N 25 ? KG N N 25 ? LG N N 25 ? MG N N 25 ? NG N N 25 ? OG N N 25 ? PG N N 25 ? QG N N 25 ? RG N N 25 ? SG N N 25 ? TG N N 25 ? UG N N 25 ? VG N N 25 ? WG N N 25 ? XG N N 25 ? YG N N 25 ? ZG N N 25 ? AH N N 25 ? BH N N 25 ? CH N N 25 ? DH N N 25 ? EH N N 25 ? FH N N 25 ? GH N N 25 ? HH N N 25 ? IH N N 25 ? JH N N 25 ? KH N N 25 ? LH N N 25 ? MH N N 25 ? NH N N 25 ? OH N N 25 ? PH N N 25 ? QH N N 25 ? RH N N 25 ? SH N N 25 ? TH N N 25 ? UH N N 25 ? VH N N 25 ? WH N N 25 ? XH N N 25 ? YH N N 25 ? ZH N N 25 ? AI N N 25 ? BI N N 25 ? CI N N 25 ? DI N N 25 ? EI N N 25 ? FI N N 25 ? GI N N 25 ? HI N N 25 ? II N N 25 ? JI N N 25 ? KI N N 25 ? LI N N 25 ? MI N N 25 ? NI N N 25 ? OI N N 25 ? PI N N 25 ? QI N N 25 ? RI N N 25 ? SI N N 25 ? TI N N 25 ? UI N N 25 ? VI N N 25 ? WI N N 25 ? XI N N 25 ? YI N N 25 ? ZI N N 25 ? AJ N N 25 ? BJ N N 25 ? CJ N N 25 ? DJ N N 25 ? EJ N N 25 ? FJ N N 25 ? GJ N N 25 ? HJ N N 25 ? IJ N N 25 ? JJ N N 25 ? KJ N N 25 ? LJ N N 25 ? MJ N N 25 ? NJ N N 25 ? OJ N N 25 ? PJ N N 25 ? QJ N N 25 ? RJ N N 25 ? SJ N N 25 ? TJ N N 25 ? UJ N N 25 ? VJ N N 25 ? WJ N N 25 ? XJ N N 25 ? YJ N N 25 ? ZJ N N 25 ? AK N N 25 ? BK N N 25 ? CK N N 25 ? DK N N 25 ? EK N N 25 ? FK N N 25 ? GK N N 25 ? HK N N 25 ? IK N N 25 ? JK N N 25 ? KK N N 25 ? LK N N 25 ? MK N N 25 ? NK N N 25 ? OK N N 25 ? PK N N 25 ? QK N N 25 ? RK N N 25 ? SK N N 25 ? TK N N 25 ? UK N N 25 ? VK N N 25 ? WK N N 25 ? XK N N 25 ? YK N N 25 ? ZK N N 25 ? AL N N 25 ? BL N N 25 ? CL N N 25 ? DL N N 25 ? EL N N 25 ? FL N N 25 ? GL N N 25 ? HL N N 25 ? IL N N 25 ? JL N N 25 ? KL N N 25 ? LL N N 25 ? ML N N 25 ? NL N N 25 ? OL N N 25 ? PL N N 25 ? QL N N 25 ? RL N N 25 ? SL N N 25 ? TL N N 25 ? UL N N 25 ? VL N N 25 ? WL N N 25 ? XL N N 25 ? YL N N 25 ? ZL N N 25 ? AM N N 25 ? BM N N 25 ? CM N N 25 ? DM N N 25 ? EM N N 25 ? FM N N 25 ? GM N N 25 ? HM N N 25 ? IM N N 25 ? JM N N 25 ? KM N N 25 ? LM N N 25 ? MM N N 25 ? NM N N 25 ? OM N N 25 ? PM N N 25 ? QM N N 25 ? RM N N 25 ? SM N N 25 ? TM N N 25 ? UM N N 25 ? VM N N 25 ? WM N N 25 ? XM N N 25 ? YM N N 25 ? ZM N N 25 ? AN N N 25 ? BN N N 25 ? CN N N 25 ? DN N N 25 ? EN N N 25 ? FN N N 25 ? GN N N 25 ? HN N N 25 ? IN N N 25 ? JN N N 25 ? KN N N 25 ? LN N N 25 ? MN N N 25 ? NN N N 25 ? ON N N 25 ? PN N N 25 ? QN N N 25 ? RN N N 25 ? SN N N 25 ? TN N N 25 ? UN N N 25 ? VN N N 25 ? WN N N 25 ? XN N N 25 ? YN N N 25 ? ZN N N 25 ? AO N N 25 ? BO N N 25 ? CO N N 25 ? DO N N 25 ? EO N N 25 ? FO N N 25 ? GO N N 25 ? HO N N 25 ? IO N N 25 ? JO N N 25 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details 'HIS ENTRY CONTAINS THE 30S SUBUNIT OF A 70S RIBOSOME IN THE ASU. THE ENTIRE ASU CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES.' # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 LYS B 8 ? GLY B 14 ? LYS B 8 GLY B 14 1 ? 7 HELX_P HELX_P2 2 ASN B 25 ? ARG B 30 ? ASN B 25 ARG B 30 5 ? 6 HELX_P HELX_P3 3 ASP B 43 ? ARG B 64 ? ASP B 43 ARG B 64 1 ? 22 HELX_P HELX_P4 4 ASP B 79 ? ARG B 87 ? ASP B 79 ARG B 87 1 ? 9 HELX_P HELX_P5 5 ASN B 104 ? ALA B 123 ? ASN B 104 ALA B 123 1 ? 20 HELX_P HELX_P6 6 SER B 124 ? GLU B 129 ? SER B 124 GLU B 129 5 ? 6 HELX_P HELX_P7 7 PRO B 131 ? SER B 150 ? PRO B 131 SER B 150 1 ? 20 HELX_P HELX_P8 8 ASP B 166 ? LYS B 179 ? ASP B 166 LYS B 179 1 ? 14 HELX_P HELX_P9 9 ALA B 207 ? ALA B 225 ? ALA B 207 ALA B 225 1 ? 19 HELX_P HELX_P10 10 HIS C 6 ? LEU C 12 ? HIS C 6 LEU C 12 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 11 TYR C 29 ? GLU C 46 ? TYR C 29 GLU C 46 1 ? 18 HELX_P HELX_P12 12 LEU C 47 ? GLY C 51 ? LEU C 47 GLY C 51 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 13 LYS C 72 ? VAL C 76 ? LYS C 72 VAL C 76 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 14 GLU C 82 ? THR C 95 ? GLU C 82 THR C 95 1 ? 14 HELX_P HELX_P15 15 ASN C 108 ? SER C 112 ? ASN C 108 SER C 112 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 16 ALA C 113 ? ARG C 126 ? ALA C 113 ARG C 126 1 ? 14 HELX_P HELX_P17 17 ALA C 129 ? GLU C 143 ? ALA C 129 GLU C 143 1 ? 15 HELX_P HELX_P18 18 ARG C 156 ? ALA C 160 ? ARG C 156 ALA C 160 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 19 ARG D 10 ? GLU D 15 ? ARG D 10 GLU D 15 1 ? 6 HELX_P HELX_P20 20 SER D 52 ? TYR D 68 ? SER D 52 TYR D 68 1 ? 17 HELX_P HELX_P21 21 SER D 71 ? LYS D 85 ? SER D 71 LYS D 85 1 ? 15 HELX_P HELX_P22 22 VAL D 88 ? SER D 99 ? VAL D 88 SER D 99 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 23 ARG D 100 ? LEU D 108 ? ARG D 100 LEU D 108 1 ? 9 HELX_P HELX_P24 24 SER D 113 ? GLY D 124 ? SER D 113 GLY D 124 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 25 GLU D 150 ? ARG D 153 ? GLU D 150 ARG D 153 5 ? 4 HELX_P HELX_P26 26 LEU D 155 ? ALA D 164 ? LEU D 155 ALA D 164 1 ? 10 HELX_P HELX_P27 27 ASN D 199 ? TYR D 207 ? ASN D 199 TYR D 207 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 28 GLU E 50 ? ARG E 64 ? GLU E 50 ARG E 64 1 ? 15 HELX_P HELX_P29 29 GLY E 103 ? GLY E 114 ? GLY E 103 GLY E 114 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 30 ASN E 127 ? ARG E 140 ? ASN E 127 ARG E 140 1 ? 14 HELX_P HELX_P31 31 THR E 144 ? ARG E 150 ? THR E 144 ARG E 150 1 ? 7 HELX_P HELX_P32 32 ASP F 15 ? TYR F 33 ? ASP F 15 TYR F 33 1 ? 19 HELX_P HELX_P33 33 ARG F 71 ? ILE F 81 ? ARG F 71 ILE F 81 1 ? 11 HELX_P HELX_P34 34 ASP G 20 ? LYS G 29 ? ASP G 20 LYS G 29 1 ? 10 HELX_P HELX_P35 35 LYS G 35 ? LYS G 48 ? LYS G 35 LYS G 48 1 ? 14 HELX_P HELX_P36 36 GLU G 57 ? ASN G 68 ? GLU G 57 ASN G 68 1 ? 12 HELX_P HELX_P37 37 SER G 92 ? GLN G 110 ? SER G 92 GLN G 110 1 ? 19 HELX_P HELX_P38 38 ARG G 115 ? GLY G 130 ? ARG G 115 GLY G 130 1 ? 16 HELX_P HELX_P39 39 GLY G 132 ? ASN G 148 ? GLY G 132 ASN G 148 1 ? 17 HELX_P HELX_P40 40 ARG G 149 ? ARG G 155 ? ARG G 149 ARG G 155 5 ? 7 HELX_P HELX_P41 41 ASP H 4 ? ARG H 18 ? ASP H 4 ARG H 18 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 42 SER H 29 ? ARG H 41 ? SER H 29 ARG H 41 1 ? 13 HELX_P HELX_P43 43 GLY H 96 ? ILE H 100 ? GLY H 96 ILE H 100 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 44 ARG H 102 ? LEU H 107 ? ARG H 102 LEU H 107 5 ? 6 HELX_P HELX_P45 45 ARG H 122 ? GLY H 128 ? ARG H 122 GLY H 128 1 ? 7 HELX_P HELX_P46 46 ASP I 32 ? PHE I 37 ? ASP I 32 PHE I 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P47 47 ARG I 42 ? ALA I 46 ? ARG I 42 ALA I 46 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 48 LEU I 47 ? VAL I 53 ? LEU I 47 VAL I 53 1 ? 7 HELX_P HELX_P49 49 GLY I 69 ? TYR I 88 ? GLY I 69 TYR I 88 1 ? 20 HELX_P HELX_P50 50 TYR I 92 ? LYS I 97 ? TYR I 92 LYS I 97 1 ? 6 HELX_P HELX_P51 51 ASN J 78 ? THR J 87 ? ASN J 78 THR J 87 1 ? 10 HELX_P HELX_P52 52 TYR K 59 ? ALA K 74 ? TYR K 59 ALA K 74 1 ? 16 HELX_P HELX_P53 53 GLU K 92 ? ALA K 100 ? GLU K 92 ALA K 100 1 ? 9 HELX_P HELX_P54 54 LYS K 123 ? LYS K 127 ? LYS K 123 LYS K 127 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 55 THR L 3 ? LYS L 10 ? THR L 6 LYS L 13 1 ? 8 HELX_P HELX_P56 56 SER L 115 ? THR L 119 ? SER L 118 THR L 122 5 ? 5 HELX_P HELX_P57 57 ARG M 14 ? LEU M 19 ? ARG M 14 LEU M 19 1 ? 6 HELX_P HELX_P58 58 LYS M 27 ? LYS M 36 ? LYS M 27 LYS M 36 1 ? 10 HELX_P HELX_P59 59 THR M 49 ? TRP M 64 ? THR M 49 TRP M 64 1 ? 16 HELX_P HELX_P60 60 LEU M 70 ? LEU M 81 ? LEU M 70 LEU M 81 1 ? 12 HELX_P HELX_P61 61 ARG N 3 ? ALA N 10 ? ARG N 3 ALA N 10 1 ? 8 HELX_P HELX_P62 62 PHE N 16 ? ALA N 20 ? PHE N 16 ALA N 20 5 ? 5 HELX_P HELX_P63 63 CYS N 40 ? LYS N 50 ? CYS N 40 LYS N 50 1 ? 11 HELX_P HELX_P64 64 THR O 4 ? ALA O 16 ? THR O 4 ALA O 16 1 ? 13 HELX_P HELX_P65 65 SER O 24 ? HIS O 46 ? SER O 24 HIS O 46 1 ? 23 HELX_P HELX_P66 66 ASP O 49 ? ASP O 74 ? ASP O 49 ASP O 74 1 ? 26 HELX_P HELX_P67 67 ASP O 74 ? LEU O 85 ? ASP O 74 LEU O 85 1 ? 12 HELX_P HELX_P68 68 ASP P 52 ? VAL P 62 ? ASP P 52 VAL P 62 1 ? 11 HELX_P HELX_P69 69 THR P 67 ? GLN P 76 ? THR P 67 GLN P 76 1 ? 10 HELX_P HELX_P70 70 ARG Q 81 ? GLU Q 96 ? ARG Q 81 GLU Q 96 1 ? 16 HELX_P HELX_P71 71 VAL R 22 ? LEU R 26 ? VAL R 22 LEU R 26 5 ? 5 HELX_P HELX_P72 72 ASN R 36 ? ARG R 42 ? ASN R 36 ARG R 42 1 ? 7 HELX_P HELX_P73 73 PRO R 52 ? GLY R 57 ? PRO R 52 GLY R 57 1 ? 6 HELX_P HELX_P74 74 SER R 59 ? LEU R 76 ? SER R 59 LEU R 76 1 ? 18 HELX_P HELX_P75 75 ASP S 12 ? ALA S 24 ? ASP S 12 ALA S 24 1 ? 13 HELX_P HELX_P76 76 LEU S 71 ? ALA S 75 ? LEU S 71 ALA S 75 5 ? 5 HELX_P HELX_P77 77 LEU T 13 ? GLU T 46 ? LEU T 13 GLU T 46 1 ? 34 HELX_P HELX_P78 78 ALA T 49 ? GLY T 69 ? ALA T 49 GLY T 69 1 ? 21 HELX_P HELX_P79 79 HIS T 73 ? GLN T 90 ? HIS T 73 GLN T 90 1 ? 18 HELX_P HELX_P80 80 THR U 8 ? GLY U 16 ? THR U 8 GLY U 16 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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A C 753 A MG 1684 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.910 ? metalc9 metalc ? ? A C 1285 OP1 ? ? ? 1_555 KC MG . MG ? ? A C 1284 A MG 1664 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.920 ? metalc10 metalc ? ? A G 1204 O6 ? ? ? 1_555 BC MG . MG ? ? A G 1203 A MG 1655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.929 ? metalc11 metalc ? ? A A 766 OP1 ? ? ? 1_555 ZB MG . MG ? ? A A 765 A MG 1653 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.944 ? metalc12 metalc ? ? A A 556 OP1 ? ? ? 1_555 LA MG . MG ? ? A A 555 A MG 1613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.948 ? metalc13 metalc ? ? A A 942 OP1 ? ? ? 1_555 FD MG . MG ? ? A A 941 A MG 1685 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.966 ? metalc14 metalc ? ? D CYS 31 SG ? ? ? 1_555 NE ZN . ZN ? ? D CYS 31 D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.972 ? metalc15 metalc ? ? A C 912 OP1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? A C 911 A MG 1603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? metalc16 metalc ? ? A G 1286 OP2 ? ? ? 1_555 KC MG . MG ? ? A G 1285 A MG 1664 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? metalc17 metalc ? ? A G 903 O6 ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? A G 902 A MG 1614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? metalc18 metalc ? ? A G 327 OP2 ? ? ? 1_555 CC MG . MG ? ? A G 326 A MG 1656 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? metalc19 metalc ? ? A A 493 OP2 ? ? ? 1_555 WD MG . MG ? ? A A 492 A MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? metalc20 metalc ? ? A A 750 OP2 ? ? ? 1_555 GB MG . MG ? ? A A 749 A MG 1634 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc21 metalc ? ? A G 295 O6 ? ? ? 1_555 OA MG . MG ? ? A G 294 A MG 1616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc22 metalc ? ? A G 1206 OP1 ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? A G 1205 A MG 1615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? metalc23 metalc ? ? A G 1501 O6 ? ? ? 1_555 DC MG . MG ? ? A G 1500 A MG 1657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? metalc24 metalc ? ? A G 1499 OP1 ? ? ? 1_555 FE MG . MG ? ? A G 1498 A MG 1711 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.140 ? metalc25 metalc ? ? D CYS 9 SG ? ? ? 1_555 NE ZN . ZN ? ? D CYS 9 D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? metalc26 metalc ? ? A A 517 OP2 ? ? ? 1_555 PA MG . MG ? ? A A 516 A MG 1617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? metalc27 metalc ? ? A A 110 OP2 ? ? ? 1_555 VA MG . MG ? ? A A 109 A MG 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.160 ? metalc28 metalc ? ? A U 21 OP2 ? ? ? 1_555 IA MG . MG ? ? A U 20 A MG 1610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? metalc29 metalc ? ? A G 1091 O6 ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? A G 1090 A MG 1618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? metalc30 metalc ? ? A U 63 O4 ? ? ? 1_555 JC MG . MG ? ? A U 62 A MG 1663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? metalc31 metalc ? ? A A 1478 OP2 ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? A A 1477 A MG 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.210 ? metalc32 metalc ? ? A A 838 OP2 ? ? ? 1_555 KB MG . MG ? ? A A 837 A MG 1638 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.240 ? metalc33 metalc ? ? A G 572 OP2 ? ? ? 1_555 QB MG . MG ? ? A G 571 A MG 1644 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? metalc34 metalc ? ? A A 103 OP1 ? ? ? 1_555 CC MG . MG ? ? A A 102 A MG 1656 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc35 metalc ? ? A G 466 O6 ? ? ? 1_555 UD MG . MG ? ? A G 465 A MG 1700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc36 metalc ? ? D CYS 26 SG ? ? ? 1_555 NE ZN . ZN ? ? D CYS 26 D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc37 metalc ? ? N CYS 27 SG ? ? ? 1_555 OE ZN . ZN ? ? N CYS 27 N ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc38 metalc ? ? A U 1373 O4 ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? A U 1372 A MG 1614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc39 metalc ? ? A G 905 O6 ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? A G 904 A MG 1614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc40 metalc ? ? A A 778 OP1 ? ? ? 1_555 ZB MG . MG ? ? A A 777 A MG 1653 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc41 metalc ? ? A U 1181 O4 ? ? ? 1_555 OC MG . MG ? ? A U 1180 A MG 1668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc42 metalc ? ? A G 1400 O6 ? ? ? 1_555 YA MG . MG ? ? A G 1399 A MG 1626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc43 metalc ? ? A A 1024 OP2 ? ? ? 1_555 AE MG . MG ? ? A A 1023 A MG 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc44 metalc ? ? A G 923 OP2 ? ? ? 1_555 AC MG . MG ? ? A G 922 A MG 1654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc45 metalc ? ? A G 560 OP1 ? ? ? 1_555 VC MG . MG ? ? A G 559 A MG 1675 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc46 metalc ? ? A U 1181 OP1 ? ? ? 1_555 FD MG . MG ? ? A U 1180 A MG 1685 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc47 metalc ? ? A U 177 OP2 ? ? ? 1_555 VB MG . MG ? ? A U 176 A MG 1649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc48 metalc ? ? A U 582 O4 ? ? ? 1_555 IB MG . MG ? ? A U 581 A MG 1636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? metalc49 metalc ? ? A G 412 O6 ? ? ? 1_555 GE MG . MG ? ? A G 411 A MG 1712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc50 metalc ? ? A U 959 O4 ? ? ? 1_555 BC MG . MG ? ? A U 958 A MG 1655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc51 metalc ? ? A G 1415 O6 ? ? ? 1_555 EB MG . MG ? ? A G 1414 A MG 1632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc52 metalc ? ? A A 1183 OP2 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? A A 1182 A MG 1607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? metalc53 metalc ? ? W A 77 OP1 ? ? ? 1_555 TF MG . MG ? ? V A 77 V MG 121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc54 metalc ? ? A C 733 OP1 ? ? ? 1_555 FB MG . MG ? ? A C 732 A MG 1633 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc55 metalc ? ? A G 922 OP1 ? ? ? 1_555 AC MG . MG ? ? A G 921 A MG 1654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc56 metalc ? ? A G 745 O6 ? ? ? 1_555 CD MG . MG ? ? A G 744 A MG 1682 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? metalc57 metalc ? ? A C 1037 OP2 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? A C 1036 A MG 1605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc58 metalc ? ? A A 1478 OP1 ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? A A 1477 A MG 1604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? metalc59 metalc ? ? A G 579 "O2'" ? ? ? 1_555 IB MG . MG ? ? A G 578 A MG 1636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? metalc60 metalc ? ? A C 444 OP2 ? ? ? 1_555 UD MG . MG ? ? A C 443 A MG 1700 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc61 metalc ? ? A A 752 OP2 ? ? ? 1_555 KA MG . MG ? ? A A 751 A MG 1612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.500 ? metalc62 metalc ? ? A G 1179 OP2 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? A G 1178 A MG 1605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc63 metalc ? ? A A 311 OP1 ? ? ? 1_555 NC MG . MG ? ? A A 310 A MG 1667 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.560 ? metalc64 metalc ? ? A C 548 OP2 ? ? ? 1_555 OB MG . MG ? ? A C 547 A MG 1642 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? metalc65 metalc ? ? A C 733 OP2 ? ? ? 1_555 FB MG . MG ? ? A C 732 A MG 1633 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.580 ? metalc66 metalc ? ? A U 235 O4 ? ? ? 1_555 AD MG . MG ? ? A U 234 A MG 1680 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? metalc67 metalc ? ? A G 563 O6 ? ? ? 1_555 CD MG . MG ? ? A G 562 A MG 1682 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? metalc68 metalc ? ? A U 423 O4 ? ? ? 1_555 GE MG . MG ? ? A U 422 A MG 1712 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? metalc69 metalc ? ? A G 101 OP2 ? ? ? 1_555 GC MG . MG ? ? A G 100 A MG 1660 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? metalc70 metalc ? ? A C 957 OP1 ? ? ? 1_555 DE MG . MG ? ? A C 956 A MG 1709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc71 metalc ? ? A G 22 OP1 ? ? ? 1_555 ZC MG . MG ? ? A G 21 A MG 1679 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? metalc72 metalc ? ? A G 802 OP2 ? ? ? 1_555 LC MG . MG ? ? A G 801 A MG 1665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? metalc73 metalc ? ? A G 734 OP2 ? ? ? 1_555 FB MG . MG ? ? A G 733 A MG 1633 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? metalc74 metalc ? ? A A 778 OP2 ? ? ? 1_555 ZB MG . MG ? ? A A 777 A MG 1653 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.668 ? metalc75 metalc ? ? A U 1500 O4 ? ? ? 1_555 DC MG . MG ? ? A U 1499 A MG 1657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? metalc76 metalc ? ? A G 322 O6 ? ? ? 1_555 GC MG . MG ? ? A G 321 A MG 1660 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc77 metalc ? ? A C 948 OP2 ? ? ? 1_555 DD MG . MG ? ? A C 947 A MG 1683 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? metalc78 metalc ? ? A G 251 OP1 ? ? ? 1_555 XA MG . MG ? ? A G 250 A MG 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? metalc79 metalc ? ? A G 62 O6 ? ? ? 1_555 JC MG . MG ? ? A G 61 A MG 1663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc80 metalc ? ? A U 1506 OP1 ? ? ? 1_555 LC MG . MG ? ? A U 1505 A MG 1665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc81 metalc ? ? A C 488 OP1 ? ? ? 1_555 XB MG . MG ? ? A C 487 A MG 1651 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? metalc82 metalc ? ? A C 115 O2 ? ? ? 1_555 IC MG . MG ? ? A C 114 A MG 1662 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.740 ? metalc83 metalc ? ? A C 801 "O2'" ? ? ? 1_555 LC MG . MG ? ? A C 800 A MG 1665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc84 metalc ? ? A G 118 O6 ? ? ? 1_555 IC MG . MG ? ? A G 117 A MG 1662 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc85 metalc ? ? A A 493 "O3'" ? ? ? 1_555 WD MG . MG ? ? A A 492 A MG 1702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? metalc86 metalc ? ? A G 579 "O3'" ? ? ? 1_555 IB MG . MG ? ? A G 578 A MG 1636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.799 ? metalc87 metalc ? ? A A 1477 "O5'" ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? A A 1476 A MG 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.814 ? metalc88 metalc ? ? A C 348 OP1 ? ? ? 1_555 WA MG . MG ? ? A C 347 A MG 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.822 ? metalc89 metalc ? ? A G 357 OP2 ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? A G 356 A MG 1606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.842 ? metalc90 metalc ? ? A U 1374 O4 ? ? ? 1_555 MA MG . MG ? ? A U 1373 A MG 1614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? metalc91 metalc ? ? A G 1482 "O3'" ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? A G 1481 A MG 1604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.850 ? metalc92 metalc ? ? A C 950 OP1 ? ? ? 1_555 CE MG . MG ? ? A C 949 A MG 1708 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.851 ? metalc93 metalc ? ? A U 970 "O3'" ? ? ? 1_555 AE MG . MG ? ? A U 969 A MG 1706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.856 ? metalc94 metalc ? ? A C 562 OP1 ? ? ? 1_555 EC MG . MG ? ? A C 561 A MG 1658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.859 ? metalc95 metalc ? ? A G 1483 OP2 ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? A G 1482 A MG 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.885 ? metalc96 metalc ? ? A U 1187 O4 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? A U 1186 A MG 1607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.895 ? metalc97 metalc ? ? A G 1204 O6 ? ? ? 1_555 DE MG . MG ? ? A G 1203 A MG 1709 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc98 metalc ? ? A G 726 O6 ? ? ? 1_555 YD MG . MG ? ? A G 725 A MG 1704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.957 ? metalc99 metalc ? ? A U 1476 "O3'" ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? A U 1475 A MG 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.963 ? metalc100 metalc ? ? A G 1180 O6 ? ? ? 1_555 OC MG . MG ? ? A G 1179 A MG 1668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.966 ? metalc101 metalc ? ? Q ILE 65 O ? ? ? 1_555 XA MG . MG ? ? Q ILE 65 A MG 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.972 ? metalc102 metalc ? ? A U 119 O4 ? ? ? 1_555 IC MG . MG ? ? A U 118 A MG 1662 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.998 ? hydrog1 hydrog ? ? A U 6 O2 ? ? ? 1_555 A G 7 N1 ? ? A U 5 A G 6 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 10 N1 ? ? ? 1_555 A C 26 N3 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 10 N2 ? ? ? 1_555 A C 26 O2 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 10 O6 ? ? ? 1_555 A C 26 N4 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog5 hydrog ? ? A A 11 N1 ? ? ? 1_555 A U 25 N3 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? A A 11 N6 ? ? ? 1_555 A U 25 O4 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog7 hydrog ? ? A G 12 N1 ? ? ? 1_555 A C 24 N3 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog8 hydrog ? ? A G 12 N2 ? ? ? 1_555 A C 24 O2 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog9 hydrog ? ? A G 12 O6 ? ? ? 1_555 A C 24 N4 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog10 hydrog ? ? A U 13 N3 ? ? ? 1_555 A G 23 O6 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog11 hydrog ? ? A U 13 O2 ? ? ? 1_555 A G 23 N1 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog12 hydrog ? ? A U 14 O4 ? ? ? 1_555 A U 21 N3 ? ? A U 13 A U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? hydrog13 hydrog ? ? A U 14 N3 ? ? ? 1_555 A A 893 N7 ? ? A U 13 A A 892 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog14 hydrog ? ? A U 14 O4 ? ? ? 1_555 A A 893 N6 ? ? A U 13 A A 892 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog15 hydrog ? ? 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Y A 4 226 1 Y 1 X A 5 ? Y A 5 227 1 Y 1 X G 6 ? Y G 6 228 1 Y 1 X G 7 ? Y G 7 229 1 Y 1 X A 8 ? Y A 8 230 1 Y 1 X G 9 ? Y G 9 231 1 Y 1 X G 10 ? Y G 10 232 1 Y 1 X U 11 ? Y U 11 233 1 Y 1 X A 12 ? Y A 12 234 1 Y 1 X A 23 ? Y A 23 235 1 Y 1 X A 24 ? Y A 24 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 3V6V 'double helix' 3V6V 'a-form double helix' 3V6V 'parallel strands' 3V6V 'hairpin loop' 3V6V tetraloop 3V6V 'bulge loop' 3V6V 'mismatched base pair' 3V6V 'internal loop' 3V6V 'triple helix' 3V6V 'quadruple helix' 3V6V 'three-way junction' 3V6V 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A U 6 1_555 A G 7 1_555 2.351 -4.857 1.649 31.846 -23.793 -18.052 1 A_U5:G6_A A 5 ? 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