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'X-RAY DIFFRACTION' 2 2 POSITIONAL D 3499 0.060 ? 4 ? ? ? ? ? ? # loop_ _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_all _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.number_reflns_obs _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 2.4000 2.4522 16 99.0 5644 . 0.2792 0.3195 . 121 . 5765 5644 . 'X-RAY DIFFRACTION' 2.4522 2.5092 16 100.0 5679 . 0.3035 0.3638 . 130 . 5809 5679 . 'X-RAY DIFFRACTION' 2.5092 2.5720 16 99.0 5698 . 0.2795 0.3392 . 135 . 5833 5698 . 'X-RAY DIFFRACTION' 2.5720 2.6415 16 99.0 5622 . 0.2644 0.2986 . 145 . 5767 5622 . 'X-RAY DIFFRACTION' 2.6415 2.7192 16 100.0 5719 . 0.2663 0.3596 . 130 . 5849 5719 . 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'X-RAY DIFFRACTION' # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? 0.734285 0.678779 -0.009152 0.678751 -0.734341 -0.006385 -0.011055 -0.001523 -0.999938 -33.391998 88.229202 179.884995 2 given ? 0.612464 0.784049 -0.100772 0.783406 -0.619056 -0.055190 -0.105655 -0.045143 -0.993378 -27.986500 82.973900 193.850998 # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details 1 1 A 1 2 B 2 1 C 2 2 D # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 1 A PRO 48 . 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'chain D and (resseq 45:56 or resseq 59:372 or resseq 375:379 or resseq 383:562)' # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? # _struct.entry_id 3V9H _struct.title 'Crystal structure of human 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase mutant S352A' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3V9H _struct_keywords.text ;aldehyde dehydrogenase, Rossmann fold, nucleotide binding, acting on aldehyde or oxo group of donors, NAD or NADP as acceptor, mitochondria, OXIDOREDUCTASE ; _struct_keywords.pdbx_keywords OXIDOREDUCTASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 SER A 47 ? LYS A 61 ? SER A 44 LYS A 58 1 ? 15 HELX_P HELX_P2 2 ASP A 101 ? LYS A 122 ? ASP A 98 LYS A 119 1 ? 22 HELX_P HELX_P3 3 PRO A 123 ? GLY A 140 ? PRO A 120 GLY A 137 1 ? 18 HELX_P HELX_P4 4 ARG A 142 ? GLY A 155 ? ARG A 139 GLY A 152 1 ? 14 HELX_P HELX_P5 5 THR A 157 ? ALA A 166 ? 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PRO 190 D 1 5.95 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 2 ? B ? 3 ? C ? 2 ? D ? 9 ? E ? 5 ? F ? 9 ? G ? 2 ? H ? 2 ? I ? 2 ? J ? 2 ? K ? 3 ? L ? 2 ? M ? 5 ? N ? 2 ? O ? 2 ? P ? 3 ? Q ? 2 ? R ? 9 ? S ? 5 ? T ? 9 ? U ? 2 ? V ? 2 ? W ? 3 ? X ? 2 ? Y ? 5 ? Z ? 2 ? AA ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel B 1 2 ? parallel B 2 3 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? parallel D 3 4 ? parallel D 4 5 ? parallel D 5 6 ? parallel D 6 7 ? parallel D 7 8 ? parallel D 8 9 ? anti-parallel E 1 2 ? parallel E 2 3 ? parallel E 3 4 ? parallel E 4 5 ? parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? parallel F 3 4 ? parallel F 4 5 ? parallel F 5 6 ? parallel F 6 7 ? parallel F 7 8 ? parallel F 8 9 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? parallel K 2 3 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel M 1 2 ? parallel M 2 3 ? parallel M 3 4 ? parallel M 4 5 ? parallel N 1 2 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel P 1 2 ? parallel P 2 3 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? parallel R 3 4 ? parallel R 4 5 ? parallel R 5 6 ? parallel R 6 7 ? parallel R 7 8 ? parallel R 8 9 ? anti-parallel S 1 2 ? parallel S 2 3 ? parallel S 3 4 ? parallel S 4 5 ? parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? parallel T 3 4 ? parallel T 4 5 ? parallel T 5 6 ? parallel T 6 7 ? parallel T 7 8 ? parallel T 8 9 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel W 1 2 ? parallel W 2 3 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel Y 1 2 ? parallel Y 2 3 ? parallel Y 3 4 ? parallel Y 4 5 ? parallel Z 1 2 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 TRP A 27 ? 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N ASP B 422 O PHE B 431 ? O PHE B 428 O 1 2 N GLY B 480 ? N GLY B 477 O ALA B 526 ? O ALA B 523 P 1 2 N ILE C 67 ? N ILE C 64 O LYS C 96 ? O LYS C 93 P 2 3 O PHE C 97 ? O PHE C 94 N GLN C 82 ? N GLN C 79 Q 1 2 N CYS C 69 ? N CYS C 66 O VAL C 76 ? O VAL C 73 R 1 2 N VAL C 199 ? N VAL C 196 O GLN C 548 ? O GLN C 545 R 2 3 N LYS C 551 ? N LYS C 548 O ILE D 509 ? O ILE D 506 R 3 4 O TYR D 508 ? O TYR D 505 N GLY D 483 ? N GLY D 480 R 4 5 O ALA D 484 ? O ALA D 481 N PHE D 325 ? N PHE D 322 R 5 6 N ASN D 322 ? N ASN D 319 O ALA D 355 ? O ALA D 352 R 6 7 N LEU D 357 ? N LEU D 354 O TYR D 459 ? O TYR D 456 R 7 8 O VAL D 458 ? O VAL D 455 N SER D 439 ? N SER D 436 R 8 9 O ILE D 436 ? O ILE D 433 N LEU D 419 ? N LEU D 416 S 1 2 O GLN C 263 ? O GLN C 260 N VAL C 233 ? N VAL C 230 S 2 3 O VAL C 232 ? O VAL C 229 N VAL C 207 ? N VAL C 204 S 3 4 N ALA C 208 ? N ALA C 205 O ASN C 286 ? O ASN C 283 S 4 5 N PHE C 287 ? N PHE C 284 O ALA C 315 ? O ALA C 312 T 1 2 N LEU C 419 ? N LEU C 416 O ILE C 436 ? 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