data_3VI3 # _entry.id 3VI3 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.398 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 3VI3 pdb_00003vi3 10.2210/pdb3vi3/pdb RCSB RCSB095071 ? ? WWPDB D_1000095071 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2012-02-22 2 'Structure model' 1 1 2012-04-18 3 'Structure model' 1 2 2014-11-12 4 'Structure model' 1 3 2017-11-22 5 'Structure model' 2 0 2020-07-29 6 'Structure model' 2 1 2024-11-06 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 5 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Structure summary' 3 4 'Structure model' 'Refinement description' 4 5 'Structure model' 'Atomic model' 5 5 'Structure model' 'Data collection' 6 5 'Structure model' 'Database references' 7 5 'Structure model' 'Derived calculations' 8 5 'Structure model' 'Structure summary' 9 6 'Structure model' 'Data collection' 10 6 'Structure model' 'Database references' 11 6 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' software 2 5 'Structure model' atom_site 3 5 'Structure model' chem_comp 4 5 'Structure model' entity 5 5 'Structure model' pdbx_branch_scheme 6 5 'Structure model' pdbx_chem_comp_identifier 7 5 'Structure model' pdbx_entity_branch 8 5 'Structure model' pdbx_entity_branch_descriptor 9 5 'Structure model' pdbx_entity_branch_link 10 5 'Structure model' pdbx_entity_branch_list 11 5 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly 12 5 'Structure model' pdbx_nonpoly_scheme 13 5 'Structure model' pdbx_struct_assembly_gen 14 5 'Structure model' pdbx_struct_conn_angle 15 5 'Structure model' struct_asym 16 5 'Structure model' struct_conn 17 5 'Structure model' struct_ref_seq_dif 18 5 'Structure model' struct_site 19 5 'Structure model' struct_site_gen 20 6 'Structure model' chem_comp 21 6 'Structure model' chem_comp_atom 22 6 'Structure model' chem_comp_bond 23 6 'Structure model' database_2 24 6 'Structure model' pdbx_entry_details 25 6 'Structure model' pdbx_modification_feature # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_software.name' 2 5 'Structure model' '_atom_site.B_iso_or_equiv' 3 5 'Structure model' '_atom_site.Cartn_x' 4 5 'Structure model' '_atom_site.Cartn_y' 5 5 'Structure model' '_atom_site.Cartn_z' 6 5 'Structure model' '_atom_site.auth_asym_id' 7 5 'Structure model' '_atom_site.auth_atom_id' 8 5 'Structure model' '_atom_site.auth_comp_id' 9 5 'Structure model' '_atom_site.auth_seq_id' 10 5 'Structure model' '_atom_site.label_asym_id' 11 5 'Structure model' '_atom_site.label_atom_id' 12 5 'Structure model' '_atom_site.label_comp_id' 13 5 'Structure model' '_atom_site.label_entity_id' 14 5 'Structure model' '_atom_site.type_symbol' 15 5 'Structure model' '_chem_comp.name' 16 5 'Structure model' '_chem_comp.type' 17 5 'Structure model' '_entity.formula_weight' 18 5 'Structure model' '_entity.pdbx_description' 19 5 'Structure model' '_entity.pdbx_number_of_molecules' 20 5 'Structure model' '_entity.src_method' 21 5 'Structure model' '_entity.type' 22 5 'Structure model' '_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list' 23 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id' 24 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id' 25 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id' 26 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id' 27 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id' 28 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id' 29 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id' 30 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id' 31 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id' 32 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id' 33 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id' 34 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id' 35 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id' 36 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id' 37 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id' 38 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id' 39 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id' 40 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id' 41 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id' 42 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id' 43 5 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.value' 44 5 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_dist_value' 45 5 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag' 46 5 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_role' 47 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id' 48 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id' 49 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id' 50 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_asym_id' 51 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_atom_id' 52 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_comp_id' 53 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_seq_id' 54 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id' 55 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id' 56 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id' 57 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_asym_id' 58 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_atom_id' 59 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_comp_id' 60 5 'Structure model' '_struct_ref_seq_dif.details' 61 6 'Structure model' '_chem_comp.pdbx_synonyms' 62 6 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 63 6 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 64 6 'Structure model' '_pdbx_entry_details.has_protein_modification' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 3VI3 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2011-09-21 _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # _pdbx_database_related.db_name PDB _pdbx_database_related.db_id 3VI4 _pdbx_database_related.details . _pdbx_database_related.content_type unspecified # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Nagae, M.' 1 'Nogi, T.' 2 'Takagi, J.' 3 # _citation.id primary _citation.title 'Crystal structure of alpha5beta1 integrin ectodomain: Atomic details of the fibronectin receptor' _citation.journal_abbrev 'J.Cell Biol.' _citation.journal_volume 197 _citation.page_first 131 _citation.page_last 140 _citation.year 2012 _citation.journal_id_ASTM JCLBA3 _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0021-9525 _citation.journal_id_CSD 2019 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 22451694 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1083/jcb.201111077 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Nagae, M.' 1 ? primary 'Re, S.' 2 ? primary 'Mihara, E.' 3 ? primary 'Nogi, T.' 4 ? primary 'Sugita, Y.' 5 ? primary 'Takagi, J.' 6 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Integrin alpha-5' 68188.523 2 ? ? 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'UNP residues 21-465' ? 3 polymer man 'SG/19 Fab fragment (Light chain)' 24216.033 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'SG/19 Fab fragment (Heavy chain)' 23478.367 2 ? ? ? ? 5 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1072.964 2 ? ? ? ? 6 branched man '2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 424.401 2 ? ? ? ? 7 non-polymer syn 'CALCIUM ION' 40.078 12 ? ? ? ? 8 non-polymer man 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 11 ? ? ? ? 9 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 ;CD49 antigen-like family member E, Fibronectin receptor subunit alpha, Integrin alpha-F, VLA-5, Integrin alpha-5 heavy chain, Integrin alpha-5 light chain ; 2 'Fibronectin receptor subunit beta, VLA-4 subunit beta' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;FNLDAEAPAVLSGPPGSFFGFSVEFYRPGTDGVSVLVGAPKANTSQPGVLQGGAVYLCPWGASPTQCTPIEFDSKGSRLL ESSLSSSEGEEPVEYKSLQWFGATVRAHGSSILACAPLYSWRTEKEPLSDPVGTCYLSTDNFTRILEYAPCRSDFSWAAG QGYCQGGFSAEFTKTGRVVLGGPGSYFWQGQILSATQEQIAESYYPEYLINLVQGQLQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEF SGDDTEDFVAGVPKGNLTYGYVTILNGSDIRSLYNFSGEQMASYFGYAVAATDVNGDGLDDLLVGAPLLMDRTPDGRPQE VGRVYVYLQHPAGIEPTPTLTLTGHDEFGRFGSSLTPLGDLDQDGYNDVAIGAPFGGETQQGVVFVFPGGPGGLGSKPSQ VLQPLWAASHTPDFFGSALRGGRDLDGNGYPDLIVGSFGVDKAVVYRGRPIVSASASLTIFPAMFNPEERSCSLEGNPVA CINLSFCLNASGKHVADSIGFTVELQLDWQKQKGGVRRALFLASRQATLTQTLLIQNGAREDCREMKIYLRNESEFRDKL SPIHIALNFSLDPQAPVDSHGLRPALHYQSKSRIEDKAQILLDCGEDNICVPDLQLEVFGEQNGGLENLYFQ ; ;FNLDAEAPAVLSGPPGSFFGFSVEFYRPGTDGVSVLVGAPKANTSQPGVLQGGAVYLCPWGASPTQCTPIEFDSKGSRLL ESSLSSSEGEEPVEYKSLQWFGATVRAHGSSILACAPLYSWRTEKEPLSDPVGTCYLSTDNFTRILEYAPCRSDFSWAAG QGYCQGGFSAEFTKTGRVVLGGPGSYFWQGQILSATQEQIAESYYPEYLINLVQGQLQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEF SGDDTEDFVAGVPKGNLTYGYVTILNGSDIRSLYNFSGEQMASYFGYAVAATDVNGDGLDDLLVGAPLLMDRTPDGRPQE VGRVYVYLQHPAGIEPTPTLTLTGHDEFGRFGSSLTPLGDLDQDGYNDVAIGAPFGGETQQGVVFVFPGGPGGLGSKPSQ VLQPLWAASHTPDFFGSALRGGRDLDGNGYPDLIVGSFGVDKAVVYRGRPIVSASASLTIFPAMFNPEERSCSLEGNPVA CINLSFCLNASGKHVADSIGFTVELQLDWQKQKGGVRRALFLASRQATLTQTLLIQNGAREDCREMKIYLRNESEFRDKL SPIHIALNFSLDPQAPVDSHGLRPALHYQSKSRIEDKAQILLDCGEDNICVPDLQLEVFGEQNGGLENLYFQ ; A,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;QTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPTSARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSK GTAEKLKPEDIHQIQPQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDF RIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQNCTTPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAV CGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQCHLENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEE FQPVYKELKNLIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISI GDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECEGGLENLYFQ ; ;QTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPTSARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSK GTAEKLKPEDIHQIQPQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDF RIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQNCTTPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAV CGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQCHLENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEE FQPVYKELKNLIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISI GDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECEGGLENLYFQ ; B,D ? 3 'polypeptide(L)' no no ;DIVMTQATPSIPVTPGESVSISCRSNKSLLHSNGNTYLYWFLQRPGQSPRLLIFRMSNLASGVPDRFSGSGSGTAFTLRI SRVEAADVGIYFCLQHLEYPFTFGAGTKLELKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSER QNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC ; ;DIVMTQATPSIPVTPGESVSISCRSNKSLLHSNGNTYLYWFLQRPGQSPRLLIFRMSNLASGVPDRFSGSGSGTAFTLRI SRVEAADVGIYFCLQHLEYPFTFGAGTKLELKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSER QNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC ; L,E ? 4 'polypeptide(L)' no no ;QVHLQQSGAELMKPGASVKISCKATGYTFTSYWIEWVKQRPGHGLEWLGEILPGSGYIHYNEKFKGKATFTTDTSSNTAY MQLSSLTSEDSAVYYCSRALALYAMDYWGQGTSVTVSSAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWN SGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPR ; ;QVHLQQSGAELMKPGASVKISCKATGYTFTSYWIEWVKQRPGHGLEWLGEILPGSGYIHYNEKFKGKATFTTDTSSNTAY MQLSSLTSEDSAVYYCSRALALYAMDYWGQGTSVTVSSAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWN SGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPR ; H,F ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 7 'CALCIUM ION' CA 8 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 9 'MAGNESIUM ION' MG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 PHE n 1 2 ASN n 1 3 LEU n 1 4 ASP n 1 5 ALA n 1 6 GLU n 1 7 ALA n 1 8 PRO n 1 9 ALA n 1 10 VAL n 1 11 LEU n 1 12 SER n 1 13 GLY n 1 14 PRO n 1 15 PRO n 1 16 GLY n 1 17 SER n 1 18 PHE n 1 19 PHE n 1 20 GLY n 1 21 PHE n 1 22 SER 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C1 ? ? A ASN 141 A NAG 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 256 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 256 A NAG 2007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 266 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 266 A NAG 2008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 275 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 275 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 568 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 568 A NAG 2015 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 249 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B ASN 249 B NAG 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 386 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? B ASN 386 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? C ASN 43 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? C ASN 43 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? C ASN 141 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? C ASN 141 C NAG 2007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? C ASN 256 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? C ASN 256 C NAG 2008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? C ASN 266 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? C ASN 266 C NAG 2009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? C ASN 275 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? C ASN 275 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? C ASN 568 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? C ASN 568 C NAG 2016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? D ASN 386 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? D ASN 386 D NAG 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale16 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? ? covale17 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I BMA . C1 ? ? G NAG 2 G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale18 covale both ? I BMA . O6 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? G BMA 3 G MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale19 covale both ? I BMA . O3 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? G BMA 3 G MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale20 covale both ? I MAN . O3 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? G MAN 4 G MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale21 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale22 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale23 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale24 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? K NAG 2 K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale25 covale both ? L BMA . O6 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? K BMA 3 K MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? ? covale26 covale both ? L BMA . O3 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? K BMA 3 K MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale27 covale both ? L MAN . O3 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? K MAN 4 K MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? metalc1 metalc ? ? A GLU 239 OE2 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A GLU 239 A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? ? metalc2 metalc ? ? A GLU 239 OE1 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A GLU 239 A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.124 ? ? metalc3 metalc ? ? A SER 241 OG ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A SER 241 A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc4 metalc ? ? A ASP 243 OD1 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A ASP 243 A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.320 ? ? metalc5 metalc ? ? A THR 245 O ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A THR 245 A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? ? metalc6 metalc ? ? A ASP 247 OD2 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A ASP 247 A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? ? metalc7 metalc ? ? A ASP 247 OD1 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? A ASP 247 A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.837 ? ? metalc8 metalc ? ? A ASP 293 OD2 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? A ASP 293 A CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? ? metalc9 metalc ? ? A ASN 295 OD1 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? A ASN 295 A CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? ? metalc10 metalc ? ? A ASP 297 OD1 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? A ASP 297 A CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? ? metalc11 metalc ? ? A LEU 299 O ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? A LEU 299 A CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? ? metalc12 metalc ? ? A ASP 301 OD1 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? A ASP 301 A CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.330 ? ? metalc13 metalc ? ? A ASP 301 OD2 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? A ASP 301 A CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.985 ? ? metalc14 metalc ? ? A ASP 360 OD2 ? ? ? 1_555 O CA . CA ? ? A ASP 360 A CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? ? metalc15 metalc ? ? A ASP 362 OD1 ? ? ? 1_555 O CA . CA ? ? A ASP 362 A CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc16 metalc ? ? A ASP 364 OD2 ? ? ? 1_555 O CA . CA ? ? A ASP 364 A CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? ? metalc17 metalc ? ? A TYR 366 O ? ? ? 1_555 O CA . CA ? ? A TYR 366 A CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? ? metalc18 metalc ? ? A ASP 368 OD2 ? ? ? 1_555 O CA . CA ? ? A ASP 368 A CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? ? metalc19 metalc ? ? A ASP 368 OD1 ? ? ? 1_555 O CA . CA ? ? A ASP 368 A CA 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.887 ? ? metalc20 metalc ? ? A ASP 424 OD1 ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? A ASP 424 A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? ? metalc21 metalc ? ? A ASP 426 OD1 ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? A ASP 426 A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? ? metalc22 metalc ? ? A ASN 428 OD1 ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? A ASN 428 A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.330 ? ? metalc23 metalc ? ? A TYR 430 O ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? A TYR 430 A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? ? metalc24 metalc ? ? A ASP 432 OD2 ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? A ASP 432 A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? ? metalc25 metalc ? ? A ASP 432 OD1 ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? A ASP 432 A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.921 ? ? metalc26 metalc ? ? B SER 132 OG ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? B SER 132 B MG 2003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? ? metalc27 metalc ? ? B SER 134 O ? ? ? 1_555 V CA . CA ? ? B SER 134 B CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? ? metalc28 metalc ? ? B ASP 137 OD2 ? ? ? 1_555 V CA . CA ? ? B ASP 137 B CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? ? metalc29 metalc ? ? B ASP 137 OD1 ? ? ? 1_555 V CA . CA ? ? B ASP 137 B CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? ? metalc30 metalc ? ? B ASP 138 OD1 ? ? ? 1_555 V CA . CA ? ? B ASP 138 B CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? ? metalc31 metalc ? ? B GLU 169 OE1 ? ? ? 1_555 W CA . CA ? ? B GLU 169 B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? ? metalc32 metalc ? ? B ASN 224 OD1 ? ? ? 1_555 W CA . CA ? ? B ASN 224 B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? ? metalc33 metalc ? ? B ASP 226 O ? ? ? 1_555 W CA . CA ? ? B ASP 226 B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? ? metalc34 metalc ? ? B ASP 226 OD1 ? ? ? 1_555 W CA . CA ? ? B ASP 226 B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? ? metalc35 metalc ? ? B PRO 228 O ? ? ? 1_555 W CA . CA ? ? B PRO 228 B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? ? metalc36 metalc ? ? B GLU 229 OE2 ? ? ? 1_555 W CA . CA ? ? 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O ILE B 437 N 3 4 O VAL B 434 ? O VAL B 434 N ILE B 425 ? N ILE B 425 N 4 5 O ARG B 426 ? O ARG B 426 N GLU B 365 ? N GLU B 365 N 5 6 N VAL B 362 ? N VAL B 362 O CYS B 395 ? O CYS B 395 O 1 2 N GLN B 95 ? N GLN B 95 O LYS B 114 ? O LYS B 114 O 2 3 N PHE B 115 ? N PHE B 115 O VAL B 404 ? O VAL B 404 O 3 4 O GLU B 407 ? O GLU B 407 N LYS B 378 ? N LYS B 378 O 4 5 N SER B 379 ? N SER B 379 O GLY B 387 ? O GLY B 387 P 1 2 O THR B 206 ? O THR B 206 N ILE B 162 ? N ILE B 162 P 2 3 O GLY B 165 ? O GLY B 165 N TYR B 127 ? N TYR B 127 P 3 4 N TYR B 126 ? N TYR B 126 O LEU B 253 ? O LEU B 253 P 4 5 N LEU B 254 ? N LEU B 254 O ILE B 314 ? O ILE B 314 P 5 6 N PHE B 315 ? N PHE B 315 O ALA B 336 ? O ALA B 336 Q 1 2 N GLU B 284 ? N GLU B 284 O MET B 287 ? O MET B 287 R 1 2 N LEU C 11 ? N LEU C 11 O ALA C 443 ? O ALA C 443 R 2 3 O TYR C 446 ? O TYR C 446 N LEU C 433 ? N LEU C 433 R 3 4 O ILE C 434 ? O ILE C 434 N ARG C 420 ? N ARG C 420 S 1 2 N GLU C 24 ? N GLU C 24 O LEU C 36 ? 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THE SEQUENCE OF SG/19 LIGHT CHAIN HAS BEEN DEPOSITED TO EMBL WITH ACCESSION NUMBER HE578878, AND SG/19 HEAVY CHAIN SG/19 HAS BEEN DEPOSITED TO EMBL WITH ACCESSION NUMBER HE578877. ; _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # _pdbx_validate_close_contact.id 1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 ND2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 C _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 ASN _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 256 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 C2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 C _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 NAG _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 2008 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_close_contact.dist 1.82 # _pdbx_validate_rmsd_angle.id 1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 CA _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 L _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 LEU _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 94 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 ? 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