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'Thermus thermophilus' 300852 ? ? HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 ? ? HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 ? ? HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 ? ? HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 ? ? HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP RPOA_THET8 Q5SHR6 1 ;MLDSKLKAPVFTVRTQGREYGEFVLEPLERGFGVTLGNPLRRILLSSIPGTAVTSVYIEDVLHEFSTIPGVKEDVVEIIL NLKELVVRFLNPSLQTVTLLLKAEGPKEVKARDFLPVADVEIMNPDLHIATLEEGGRLNMEVRVDRGVGYVPAEKHGIKD RINAIPVDAVFSPVRRVAFQVEDTRLGQRTDLDKLTLRIWTDGSVTPLEALNQAVEILREHLTYFSNPQAAAVAAPEEAK EPEAPPEQEEELDLPLEELGLSTRVLHSLKEEGIESVRALLALNLKDLKNIPGIGERSLEEIKEALEKKGFTLKE ; 1 ? 2 UNP RPOB_THET8 Q8RQE9 2 ;MEIKRFGRIREVIPLPPLTEIQVESYRRALQADVPPEKRENVGIQAAFRETFPIEEEDKGKGGLVLDFLEYRLGEPPFPQ DECREKDLTYQAPLYARLQLIHKDTGLIKEDEVFLGHIPLMTEDGSFIINGADRVIVSQIHRSPGVYFTPDPARPGRYIA SIIPLPKRGPWIDLEVEPNGVVSMKVNKRKFPLVLLLRVLGYDQETLARELGAYGELVQGLMDESVFAMRPEEALIRLFT LLRPGDPPKRDKAVAYVYGLIADPRRYDLGEAGRYKAEEKLGIRLSGRTLARFEDGEFKDEVFLPTLRYLFALTAGVPGH EVDDIDHLGNRRIRTVGELMTDQFRVGLARLARGVRERMLMGSEDSLTPAKLVNSRPLEAAIREFFSRSQLSQFKDETNP LSSLRHKRRISALGPGGLTRERAGFDVRDVHRTHYGRICPVETPEGANIGLITSLAAYARVDELGFIRTPYRRVVGGVVT DEVVYMTATEEDRYTIAQANTPLEGNRIAAERVVARRKGEPVIVSPEEVEFMDVSPKQVFSVNTNLIPFLEHDDANRALM GSNMQTQAVPLIRAQAPVVMTGLEERVVRDSLAALYAEEDGEVAKVDGNRIVVRYEDGRLVEYPLRRFYRSNQGTALDQR PRVVVGQRVRKGDLLADGPASENGFLALGQNVLVAIMPFDGYNFEDAIVISEELLKRDFYTSIHIERYEIEARDTKLGPE RITRDIPHLSEAALRDLDEEGVVRIGAEVKPGDILVGRTSFKGESEPTPEERLLRSIFGEKARDVKDTSLRVPPGEGGIV VRTVRLRRGDPGVELKPGVREVVRVYVAQKRKLQVGDKLANRHGNKGVVAKILPVEDMPHLPDGTPVDVILNPLGVPSRM NLGQILETHLGLAGYFLGQRYISPIFDGAKEPEIKELLAQAFEVYFGKRKGEGFGVDKREVEVLRRAEKLGLVTPGKTPE EQLKELFLQGKVVLYDGRTGEPIEGPIVVGQMFIMKLYHMVEDKMHARSTGPYSLITQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWAL EAYGAAHTLQEMLTLKSDDIEGRNAAYEAIIKGEDVPEPSVPESFRVLVKELQALALDVQTLDEKDNPVDIFEGLASKR ; 1 ? 3 UNP RPOC_THET8 Q8RQE8 3 ;MKKEVRKVRIALASPEKIRSWSYGEVEKPETINYRTLKPERDGLFDERIFGPIKDYECACGKYKRQRFEGKVCERCGVEV TKSIVRRYRMGHIELATPAAHIWFVKDVPSKIGTLLDLSATELEQVLYFSKYIVLDPKGAILNGVPVEKRQLLTDEEYRE LRYGKQETYPLPPGVDALVKDGEEVVKGQELAPGVVSRLDGVALYRFPRRVRVEYVKKERAGLRLPLAAWVEKEAYKPGE ILAELPEPYLFRAEEEGVVELKELEEGAFLVLRREDEPVATYFLPVGMTPLVVHGEIVEKGQPLAEAKGLLRMPRQVRAA QVEAEEEGETVYLTLFLEWTEPKDYRVQPHMNVVVPEGARVEAGDKIVAAIDPEEEVIAEAEGVVHLHEPASILVVKARV YPFEDDVEVSTGDRVAPGDVLADGGKVKSDVYGRVEVDLVRNVVRVVESYDIDARMGAEAIQQLLKELDLEALEKELLEE MKHPSRARRAKARKRLEVVRAFLDSGNRPEWMILEAVPVLPPDLRPMVQVDGGRFATSDLNDLYRRLINRNNRLKKLLAQ GAPEIIIRNEKRMLQEAVDALLDNGRRGAPVTNPGSDRPLRSLTDILSGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPQLKLH QCGLPKRMALELFKPFLLKKMEEKGIAPNVKAARRMLERQRDIKDEVWDALEEVIHGKVVLLNRAPTLHRLGIQAFQPVL VEGQSIQLHPLVCEAFNADFDGDQMAVHVPLSSFAQAEARIQMLSAHNLLSPASGEPLAKPSRDIILGLYYITQVRKEKK GAGLEFATPEEALAAHERGEVALNAPIKVAGRETSVGRLKYVFANPDEALLAVAHGIVDLQDVVTVRYMGKRLETSPGRI LFARIVAEAVEDEKVAWELIQLDVPQEKNSLKDLVYQAFLRLGMEKTARLLDALKYYGFTFSTTSGITIGIDDAVIPEEK KQYLEEADRKLLQIEQAYEMGFLTDRERYDQILQLWTETTEKVTQAVFKNFEENYPFNPLYVMAQSGARGNPQQIRQLCG LRGLMQKPSGETFEVPVRSSFREGLTVLEYFISSHGARKGGADTALRTADSGYLTRKLVDVTHEIVVREADCGTTNYISV PLFQPDEVTRSLRLRKRADIEAGLYGRVLAREVEVLGVRLEEGRYLSMDDVHLLIKAAEAGEIQEVPVRSPLTCQTRYGV CQKCYGYDLSMARPVSIGEAVGIVAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGAADITQGLPRVIELFEARRPKAKAVISEIDGV VRIEETEEKLSVFVESEGFSKEYKLPKEARLLVKDGDYVEAGQPLTRGAIDPHQLLEAKGPEAVERYLVEEIQKVYRAQG VKLHDKHIEIVVRQMMKYVEVTDPGDSRLLEGQVLEKWDVEALNERLIAEGKTPVAWKPLLMGVTKSALSTKSWLSAASF QNTTHVLTEAAIAGKKDELIGLKENVILGRLIPAGTGSDFVRFTQVVDQKTLKAIEEARKEAVEAKERPAARRGVKREQP GKQA ; 1 ? 4 UNP RPOZ_THET8 Q8RQE7 4 ;MAEPGIDKLFGMVDSKYRLTVVVAKRAQQLLRHGFKNTVLEPEERPKMQTLEGLFDDPNAVTWAMKELLTGRLVFGENLV PEDRLQKEMERLYPVEREE ; 1 ? 5 UNP Q5SKW1_THET8 Q5SKW1 5 ;MKKSKRKNAQAQEAQETEVLVQEEAEELPEFPEGEPDPDLEDPDLTLEDDLLDLPEEGEGLDLEEEEEDLPIPKISTSDP VRQYLHEIGQVPLLTLEEEVELARKVEEGMEAIKKLSEITGLDPDLIREVVRAKILGSARVRHIPGLKETLDPKTVEEID QKLKSLPKEHKRYLHIAREGEAARQHLIEANLRLVVSIAKKYTGRGLSFLDLIQEGNQGLIRAVEKFEYKRRFKFSTYAT WWIRQAINRAIADQARTIRIPVHMVETINKLSRTARQLQQELGREPTYEEIAEAMGPGWDAKRVEETLKIAQEPVSLETP IGDEKDSFYGDFIPDEHLPSPVDAATQSLLSEELEKALSKLSEREAMVLKLRKGLIDGREHTLEEVGAFFGVTRERIRQI ENKALRKLKYHESRTRKLRDFLD ; 1 ? 6 UNP A7XX65_9CAUD A7XX65 6 ;MVEGFVEPYIRLFEAIPDAETELATFYDADLDTLPPRMFLPSGDLYTPPGPVRLEEIKRKRRVRLVKVSIYRFEHVGLGL AARPYAYAYAWQGDNGILHLYHAPVVLEDVPEVLELDEVTYNESYVRLMRAMGHVDAFIDL ; 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3WOD A 1 ? 315 ? Q5SHR6 1 ? 315 ? 1 315 2 1 3WOD B 1 ? 315 ? Q5SHR6 1 ? 315 ? 1 315 3 2 3WOD C 1 ? 1119 ? Q8RQE9 1 ? 1119 ? 1 1119 4 3 3WOD D 1 ? 1524 ? Q8RQE8 1 ? 1524 ? 1 1524 5 4 3WOD E 1 ? 99 ? Q8RQE7 1 ? 99 ? 1 99 6 5 3WOD F 1 ? 423 ? Q5SKW1 1 ? 423 ? 1 423 7 6 3WOD G 1 ? 141 ? A7XX65 1 ? 141 ? 1 141 8 6 3WOD H 1 ? 141 ? A7XX65 1 ? 141 ? 1 141 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 5 3WOD GLU E 61 ? UNP Q8RQE7 VAL 61 'SEE REMARK 999' 61 1 5 3WOD ILE E 92 ? UNP Q8RQE7 LEU 92 'SEE REMARK 999' 92 2 5 3WOD GLY E 95 ? UNP Q8RQE7 VAL 95 'SEE REMARK 999' 95 3 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.entry_id 3WOD _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 6.08 _exptl_crystal.density_percent_sol 79.79 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 293 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.7 _exptl_crystal_grow.pdbx_details '45% tacsimate, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'RAYONIX MX225HE' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2011-10-27 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'Rotated-inclined double-crystal monochromator , Si (111)' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.000 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SPRING-8 BEAMLINE BL41XU' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SPring-8 _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline BL41XU _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.000 # _reflns.entry_id 3WOD _reflns.observed_criterion_sigma_I ? _reflns.observed_criterion_sigma_F 2.6 _reflns.d_resolution_low 20 _reflns.d_resolution_high 3.6 _reflns.number_obs 129380 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 99.5 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value 0.218 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 7.1 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 6.0 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 # _refine.entry_id 3WOD _refine.ls_number_reflns_obs 127431 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 1.40 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 19.882 _refine.ls_d_res_high 3.600 _refine.ls_percent_reflns_obs 99.55 _refine.ls_R_factor_obs 0.2510 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.2496 _refine.ls_R_factor_R_free 0.2790 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.00 _refine.ls_number_reflns_R_free 6370 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details 'FLAT BULK SOLVENT MODEL' _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.11 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.90 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model 1IW7 _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ML _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML 0.62 _refine.pdbx_overall_phase_error 28.07 _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 28953 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 1 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 28954 _refine_hist.d_res_high 3.600 _refine_hist.d_res_low 19.882 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function _refine_ls_restr.pdbx_refine_id f_bond_d 0.006 ? ? 29493 ? 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D CYS 58 SG ? ? ? 1_555 D CYS 60 SG ? ? D CYS 58 D CYS 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? ? disulf2 disulf ? ? D CYS 1112 SG ? ? ? 1_555 D CYS 1201 SG ? ? D CYS 1112 D CYS 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? metalc1 metalc ? ? D CYS 1112 SG ? ? ? 1_555 I ZN . ZN ? ? D CYS 1112 D ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? ? metalc2 metalc ? ? D CYS 1201 SG ? ? ? 1_555 I ZN . ZN ? ? D CYS 1201 D ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? ? metalc3 metalc ? ? D CYS 1204 SG ? ? ? 1_555 I ZN . ZN ? ? D CYS 1204 D ZN 1601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLU 26 A . ? GLU 26 A PRO 27 A ? PRO 27 A 1 -4.75 2 GLU 26 B . ? GLU 26 B PRO 27 B ? PRO 27 B 1 -9.37 3 LEU 165 C . ? LEU 165 C PRO 166 C ? PRO 166 C 1 6.47 4 GLU 247 D . ? GLU 247 D PRO 248 D ? PRO 248 D 1 -21.13 5 ALA 416 D . ? ALA 416 D PRO 417 D ? PRO 417 D 1 -8.76 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 3 ? B ? 5 ? C ? 4 ? D ? 2 ? E ? 2 ? F ? 2 ? G ? 4 ? H ? 4 ? I ? 2 ? J ? 2 ? K ? 2 ? L ? 3 ? M ? 4 ? N ? 2 ? O ? 3 ? P ? 3 ? Q ? 2 ? R ? 3 ? S ? 3 ? T ? 6 ? U ? 3 ? V ? 4 ? W ? 2 ? X ? 2 ? Y ? 8 ? Z ? 3 ? AA ? 3 ? AB ? 2 ? AC ? 8 ? AD ? 3 ? AE ? 3 ? AF ? 3 ? AG ? 3 ? AH ? 3 ? AI ? 3 ? AJ ? 3 ? AK ? 2 ? AL ? 2 ? AM ? 2 ? AN ? 3 ? AO ? 3 ? AP ? 3 ? AQ ? 2 ? AR ? 2 ? AS ? 2 ? AT ? 2 ? AU ? 4 ? AV ? 3 ? AW ? 2 ? AX ? 6 ? AY ? 5 ? AZ ? 5 ? BA ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel L 1 2 ? parallel L 2 3 ? parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? parallel Q 1 2 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? parallel T 4 5 ? anti-parallel T 5 6 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? anti-parallel V 3 4 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Y 3 4 ? anti-parallel Y 4 5 ? parallel Y 5 6 ? anti-parallel Y 6 7 ? parallel Y 7 8 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel Z 2 3 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? anti-parallel AC 4 5 ? anti-parallel AC 5 6 ? parallel AC 6 7 ? anti-parallel AC 7 8 ? parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? anti-parallel AE 1 2 ? parallel AE 2 3 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AF 2 3 ? anti-parallel AG 1 2 ? anti-parallel AG 2 3 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AH 2 3 ? anti-parallel AI 1 2 ? anti-parallel AI 2 3 ? anti-parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AK 1 2 ? anti-parallel AL 1 2 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AN 1 2 ? anti-parallel AN 2 3 ? anti-parallel AO 1 2 ? anti-parallel AO 2 3 ? parallel AP 1 2 ? parallel AP 2 3 ? anti-parallel AQ 1 2 ? parallel AR 1 2 ? anti-parallel AS 1 2 ? anti-parallel AT 1 2 ? anti-parallel AU 1 2 ? anti-parallel AU 2 3 ? anti-parallel AU 3 4 ? anti-parallel AV 1 2 ? anti-parallel AV 2 3 ? anti-parallel AW 1 2 ? anti-parallel AX 1 2 ? anti-parallel AX 2 3 ? parallel AX 3 4 ? anti-parallel AX 4 5 ? anti-parallel AX 5 6 ? anti-parallel AY 1 2 ? anti-parallel AY 2 3 ? parallel AY 3 4 ? anti-parallel AY 4 5 ? anti-parallel AZ 1 2 ? parallel AZ 2 3 ? anti-parallel AZ 3 4 ? anti-parallel AZ 4 5 ? anti-parallel BA 1 2 ? parallel BA 2 3 ? anti-parallel BA 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 VAL A 174 ? ALA A 178 ? VAL A 174 ALA A 178 A 2 ASP A 193 ? THR A 201 ? ASP A 193 THR A 201 A 3 VAL A 181 ? ASP A 183 ? VAL A 181 ASP A 183 B 1 VAL A 174 ? ALA A 178 ? VAL A 174 ALA A 178 B 2 ASP A 193 ? THR A 201 ? ASP A 193 THR A 201 B 3 TYR A 20 ? LEU A 28 ? TYR A 20 LEU A 28 B 4 VAL A 10 ? ARG A 14 ? VAL A 10 ARG A 14 B 5 ALA B 230 ? ALA B 231 ? ALA B 230 ALA B 231 C 1 THR A 96 ? GLU A 104 ? THR A 96 GLU A 104 C 2 ARG A 137 ? VAL A 148 ? ARG A 137 VAL A 148 C 3 PRO A 49 ? ILE A 58 ? PRO A 49 ILE A 58 C 4 ILE A 165 ? PRO A 166 ? ILE A 165 PRO A 166 D 1 VAL A 87 ? PHE A 89 ? VAL A 87 PHE A 89 D 2 VAL A 120 ? ILE A 122 ? VAL A 120 ILE A 122 E 1 LYS A 107 ? LYS A 110 ? LYS A 107 LYS A 110 E 2 HIS A 128 ? LEU A 132 ? HIS A 128 LEU A 132 F 1 TYR A 150 ? VAL A 151 ? TYR A 150 VAL A 151 F 2 ALA A 169 ? VAL A 170 ? ALA A 169 VAL A 170 G 1 VAL B 10 ? GLN B 16 ? VAL B 10 GLN B 16 G 2 TYR B 20 ? LEU B 28 ? TYR B 20 LEU B 28 G 3 ARG B 189 ? THR B 201 ? ARG B 189 THR B 201 G 4 VAL B 174 ? LEU B 186 ? VAL B 174 LEU B 186 H 1 THR B 96 ? ALA B 103 ? THR B 96 ALA B 103 H 2 LEU B 138 ? VAL B 148 ? LEU B 138 VAL B 148 H 3 PRO B 49 ? ILE B 58 ? PRO B 49 ILE B 58 H 4 ILE B 165 ? PRO B 166 ? ILE B 165 PRO B 166 I 1 VAL B 87 ? PHE B 89 ? VAL B 87 PHE B 89 I 2 VAL B 120 ? ILE B 122 ? VAL B 120 ILE B 122 J 1 GLU B 108 ? LYS B 110 ? GLU B 108 LYS B 110 J 2 HIS B 128 ? THR B 131 ? HIS B 128 THR B 131 K 1 TYR B 150 ? VAL B 151 ? TYR B 150 VAL B 151 K 2 ALA B 169 ? VAL B 170 ? ALA B 169 VAL B 170 L 1 GLU C 2 ? ARG C 5 ? GLU C 2 ARG C 5 L 2 GLN C 899 ? ILE C 902 ? GLN C 899 ILE C 902 L 3 VAL C 579 ? MET C 580 ? VAL C 579 MET C 580 M 1 ILE C 54 ? GLU C 56 ? ILE C 54 GLU C 56 M 2 LEU C 64 ? ARG C 72 ? LEU C 64 ARG C 72 M 3 TYR C 95 ? ILE C 101 ? TYR C 95 ILE C 101 M 4 LEU C 107 ? ILE C 108 ? LEU C 107 ILE C 108 N 1 GLN C 91 ? PRO C 93 ? GLN C 91 PRO C 93 N 2 HIS C 117 ? PRO C 119 ? HIS C 117 PRO C 119 O 1 PHE C 127 ? ILE C 128 ? PHE C 127 ILE C 128 O 2 ASP C 133 ? ILE C 136 ? ASP C 133 ILE C 136 O 3 SER C 392 ? PHE C 394 ? SER C 392 PHE C 394 P 1 ARG C 332 ? ILE C 333 ? ARG C 332 ILE C 333 P 2 SER C 138 ? HIS C 141 ? SER C 138 HIS C 141 P 3 ILE C 410 ? SER C 411 ? ILE C 410 SER C 411 Q 1 VAL C 146 ? PRO C 150 ? VAL C 146 PRO C 150 Q 2 TYR C 158 ? ILE C 162 ? TYR C 158 ILE C 162 R 1 ILE C 172 ? VAL C 176 ? ILE C 172 VAL C 176 R 2 VAL C 182 ? VAL C 186 ? VAL C 182 VAL C 186 R 3 ARG C 189 ? LYS C 190 ? ARG C 189 LYS C 190 S 1 ARG C 460 ? VAL C 461 ? ARG C 460 VAL C 461 S 2 ILE C 467 ? VAL C 475 ? ILE C 467 VAL C 475 S 3 VAL C 478 ? MET C 486 ? VAL C 478 MET C 486 T 1 ARG C 460 ? VAL C 461 ? ARG C 460 VAL C 461 T 2 ILE C 467 ? VAL C 475 ? ILE C 467 VAL C 475 T 3 PHE C 531 ? MET C 532 ? PHE C 531 MET C 532 T 4 THR C 495 ? ALA C 497 ? THR C 495 ALA C 497 T 5 VAL C 513 ? ARG C 517 ? VAL C 513 ARG C 517 T 6 PRO C 521 ? VAL C 524 ? PRO C 521 VAL C 524 U 1 LEU C 595 ? TYR C 596 ? LEU C 595 TYR C 596 U 2 LEU C 654 ? ASP C 657 ? LEU C 654 ASP C 657 U 3 ARG C 640 ? PRO C 641 ? ARG C 640 PRO C 641 V 1 LEU C 620 ? PRO C 624 ? LEU C 620 PRO C 624 V 2 ARG C 610 ? TYR C 615 ? ARG C 610 TYR C 615 V 3 GLY C 601 ? VAL C 606 ? GLY C 601 VAL C 606 V 4 ARG C 648 ? VAL C 649 ? ARG C 648 VAL C 649 W 1 TYR C 629 ? ARG C 630 ? TYR C 629 ARG C 630 W 2 ALA C 636 ? LEU C 637 ? ALA C 636 LEU C 637 X 1 SER C 661 ? GLU C 662 ? SER C 661 GLU C 662 X 2 PHE C 665 ? LEU C 666 ? PHE C 665 LEU C 666 Y 1 LYS C 971 ? VAL C 972 ? LYS C 971 VAL C 972 Y 2 ILE C 987 ? LYS C 996 ? ILE C 987 LYS C 996 Y 3 LYS C 838 ? ASN C 841 ? LYS C 838 ASN C 841 Y 4 GLY C 847 ? LEU C 853 ? GLY C 847 LEU C 853 Y 5 ILE C 688 ? SER C 691 ? ILE C 688 SER C 691 Y 6 VAL C 869 ? ILE C 870 ? VAL C 869 ILE C 870 Y 7 GLN C 670 ? ALA C 675 ? GLN C 670 ALA C 675 Y 8 ILE C 987 ? LYS C 996 ? ILE C 987 LYS C 996 Z 1 SER C 702 ? ARG C 713 ? SER C 702 ARG C 713 Z 2 VAL C 819 ? ARG C 831 ? VAL C 819 ARG C 831 Z 3 ILE C 799 ? LEU C 806 ? ILE C 799 LEU C 806 AA 1 ARG C 721 ? ILE C 722 ? ARG C 721 ILE C 722 AA 2 ARG C 758 ? PHE C 761 ? ARG C 758 PHE C 761 AA 3 VAL C 785 ? ASP C 787 ? VAL C 785 ASP C 787 AB 1 ILE C 754 ? VAL C 756 ? ILE C 754 VAL C 756 AB 2 LEU C 790 ? ARG C 791 ? LEU C 790 ARG C 791 AC 1 HIS C 1006 ? ARG C 1008 ? HIS C 1006 ARG C 1008 AC 2 SER D 626 ? VAL D 633 ? SER D 626 VAL D 633 AC 3 GLN D 744 ? HIS D 748 ? GLN D 744 HIS D 748 AC 4 VAL D 700 ? ARG D 704 ? VAL D 700 ARG D 704 AC 5 ILE D 713 ? VAL D 721 ? ILE D 713 VAL D 721 AC 6 GLN D 641 ? PRO D 645 ? GLN D 641 PRO D 645 AC 7 ILE D 726 ? LEU D 728 ? ILE D 726 LEU D 728 AC 8 SER D 626 ? VAL D 633 ? SER D 626 VAL D 633 AD 1 LEU C 1097 ? LEU C 1102 ? LEU C 1097 LEU C 1102 AD 2 LYS D 7 ? LEU D 12 ? LYS D 7 LEU D 12 AD 3 LYS D 1456 ? GLU D 1458 ? LYS D 1456 GLU D 1458 AE 1 SER D 22 ? GLU D 25 ? SER D 22 GLU D 25 AE 2 MET D 90 ? ALA D 100 ? MET D 90 ALA D 100 AE 3 ILE D 513 ? VAL D 519 ? ILE D 513 VAL D 519 AF 1 LEU D 152 ? LEU D 153 ? LEU D 152 LEU D 153 AF 2 ILE D 133 ? LEU D 135 ? ILE D 133 LEU D 135 AF 3 ALA D 454 ? ARG D 455 ? ALA D 454 ARG D 455 AG 1 THR D 168 ? PRO D 170 ? THR D 168 PRO D 170 AG 2 SER D 392 ? VAL D 396 ? SER D 392 VAL D 396 AG 3 VAL D 202 ? TYR D 205 ? VAL D 202 TYR D 205 AH 1 PRO D 342 ? ARG D 346 ? PRO D 342 ARG D 346 AH 2 ARG D 210 ? GLU D 214 ? ARG D 210 GLU D 214 AH 3 VAL D 384 ? LEU D 387 ? VAL D 384 LEU D 387 AI 1 LYS D 217 ? GLU D 219 ? LYS D 217 GLU D 219 AI 2 PHE D 336 ? TRP D 339 ? PHE D 336 TRP D 339 AI 3 ARG D 318 ? ALA D 320 ? ARG D 318 ALA D 320 AJ 1 GLU D 260 ? LYS D 262 ? GLU D 260 LYS D 262 AJ 2 ALA D 268 ? LEU D 272 ? ALA D 268 LEU D 272 AJ 3 ALA D 280 ? LEU D 284 ? ALA D 280 LEU D 284 AK 1 ALA D 324 ? GLU D 325 ? ALA D 324 GLU D 325 AK 2 TYR D 332 ? LEU D 333 ? TYR D 332 LEU D 333 AL 1 ASN D 352 ? VAL D 353 ? ASN D 352 VAL D 353 AL 2 VAL D 368 ? ALA D 369 ? VAL D 368 ALA D 369 AM 1 TYR D 401 ? PRO D 402 ? TYR D 401 PRO D 402 AM 2 VAL D 443 ? VAL D 444 ? VAL D 443 VAL D 444 AN 1 ARG D 414 ? VAL D 415 ? 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GLY D 1279 GLU D 1284 AU 4 TYR D 1318 ? VAL D 1319 ? TYR D 1318 VAL D 1319 AV 1 GLN D 1393 ? VAL D 1394 ? GLN D 1393 VAL D 1394 AV 2 TYR D 1378 ? VAL D 1381 ? TYR D 1378 VAL D 1381 AV 3 TRP D 1417 ? LEU D 1420 ? TRP D 1417 LEU D 1420 AW 1 GLN D 1485 ? ASP D 1488 ? GLN D 1485 ASP D 1488 AW 2 LEU E 73 ? GLY E 76 ? LEU E 73 GLY E 76 AX 1 LEU G 45 ? TYR G 46 ? LEU G 45 TYR G 46 AX 2 MET G 38 ? PHE G 39 ? MET G 38 PHE G 39 AX 3 LEU G 98 ? LEU G 100 ? LEU G 98 LEU G 100 AX 4 LEU G 80 ? GLN G 92 ? LEU G 80 GLN G 92 AX 5 ARG G 64 ? HIS G 75 ? ARG G 64 HIS G 75 AX 6 VAL G 52 ? ARG G 59 ? VAL G 52 ARG G 59 AY 1 LEU G 45 ? TYR G 46 ? LEU G 45 TYR G 46 AY 2 MET G 38 ? PHE G 39 ? MET G 38 PHE G 39 AY 3 LEU G 98 ? LEU G 100 ? LEU G 98 LEU G 100 AY 4 LEU G 80 ? GLN G 92 ? LEU G 80 GLN G 92 AY 5 VAL G 105 ? VAL G 106 ? VAL G 105 VAL G 106 AZ 1 MET H 38 ? PHE H 39 ? MET H 38 PHE H 39 AZ 2 LEU H 98 ? LEU H 100 ? LEU H 98 LEU H 100 AZ 3 ALA H 86 ? GLN H 92 ? ALA H 86 GLN H 92 AZ 4 ARG H 64 ? ILE H 70 ? 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H . n # _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id I _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id 7 _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id ZN _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num 1 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num 1601 _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num 2002 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id ZN _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id ZN _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id D _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code . # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 SG ? 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THE EXPERIMENTAL INFO OF UNIPROT (Q8RQE7, RPOZ_THET8) SHOWS THE FOLLOWING CONFLICTS V -> E AT POSITION 61, L -> I AT POSITION 92, V -> G AT POSITION 95 ; _pdbx_entry_details.entry_id 3WOD _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O D LEU 1098 ? ? 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