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Q9X2I8 1 ? 487 ? 1 487 2 1 3AKZ D 1 ? 487 ? Q9X2I8 1 ? 487 ? 1 487 3 1 3AKZ C 1 ? 487 ? Q9X2I8 1 ? 487 ? 1 487 4 1 3AKZ A 1 ? 487 ? Q9X2I8 1 ? 487 ? 1 487 5 2 3AKZ F 1 ? 74 ? 3AKZ 1 ? 76 ? 1 76 6 2 3AKZ H 1 ? 74 ? 3AKZ 1 ? 76 ? 1 76 7 2 3AKZ G 1 ? 74 ? 3AKZ 1 ? 76 ? 1 76 8 2 3AKZ E 1 ? 74 ? 3AKZ 1 ? 76 ? 1 76 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 GSU 'L-peptide linking' n "O5'-(L-GLUTAMYL-SULFAMOYL)-ADENOSINE" ? 'C15 H21 N7 O9 S' 475.434 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 3AKZ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.43 _exptl_crystal.density_percent_sol 49.29 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 293 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 7.5 _exptl_crystal_grow.pdbx_details '22% 2-propanol, 0.2M magnesium chloride, 0.1M HEPES-NaOH, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'MARMOSAIC 225 mm CCD' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2009-04-10 _diffrn_detector.details mirrors # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'Rotated-inclined Si(111) double-crystal monochromator' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.0 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SPRING-8 BEAMLINE BL41XU' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SPring-8 _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline BL41XU _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.0 # _reflns.entry_id 3AKZ _reflns.observed_criterion_sigma_I -3.0 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 50.0 _reflns.d_resolution_high 2.9 _reflns.number_obs 59965 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 88.0 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value 0.109 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 3.5 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 11.7 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 # _reflns_shell.d_res_high 2.90 _reflns_shell.d_res_low 3.00 _reflns_shell.percent_possible_all 75.3 _reflns_shell.Rmerge_I_obs ? _reflns_shell.pdbx_Rsym_value 0.470 _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 2.0 _reflns_shell.pdbx_redundancy 2.8 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all 5139 _reflns_shell.number_measured_all ? _reflns_shell.number_measured_obs ? _reflns_shell.number_unique_obs ? _reflns_shell.pdbx_chi_squared ? _reflns_shell.pdbx_diffrn_id ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 # _refine.entry_id 3AKZ _refine.ls_number_reflns_obs 56044 _refine.ls_number_reflns_all 59965 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 50.0 _refine.ls_d_res_high 2.9 _refine.ls_percent_reflns_obs 81.6 _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.200 _refine.ls_R_factor_R_free 0.282 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free 2692 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] -8.772 _refine.aniso_B[2][2] 19.940 _refine.aniso_B[3][3] -11.168 _refine.aniso_B[1][2] 0.00 _refine.aniso_B[1][3] -5.637 _refine.aniso_B[2][3] 0.000 _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ;The crystal harbors twinning, and all refinement processes were performed with the twinning operator (h, -k, -l) with the twinning fraction of 0.5 ; _refine.pdbx_starting_model '3AFH, 1N78' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model anisotropic _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details Random _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 15420 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 6324 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 128 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 21872 _refine_hist.d_res_high 2.9 _refine_hist.d_res_low 50.0 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function c_bond_d 0.003 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg 0.61 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _struct.entry_id 3AKZ _struct.title ;Crystal structure of Thermotoga maritima nondiscriminating glutamyl-tRNA synthetase in complex with tRNAGln and a glutamyl-AMP analog ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3AKZ _struct_keywords.pdbx_keywords LIGASE/RNA _struct_keywords.text 'Protein-rna complex, LIGASE-RNA complex' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 HIS A 38 ? GLU A 55 ? HIS B 38 GLU B 55 1 ? 18 HELX_P HELX_P2 2 GLN A 77 ? CYS A 86 ? GLN B 77 CYS B 86 1 ? 10 HELX_P HELX_P3 3 GLU A 110 ? LEU A 119 ? GLU B 110 LEU B 119 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 4 PRO A 146 ? GLU A 151 ? PRO B 146 GLU B 151 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 5 ASP A 180 ? LEU A 184 ? ASP B 180 LEU B 184 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 6 TYR A 198 ? MET A 209 ? TYR B 198 MET B 209 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 7 SER A 222 ? GLY A 235 ? SER B 222 GLY B 235 1 ? 14 HELX_P HELX_P8 8 SER A 263 ? GLY A 271 ? SER B 263 GLY B 271 1 ? 9 HELX_P HELX_P9 9 LEU A 273 ? GLY A 285 ? LEU B 273 GLY B 285 1 ? 13 HELX_P HELX_P10 10 ILE A 296 ? LEU A 300 ? ILE B 296 LEU B 300 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 11 ASP A 316 ? ILE A 331 ? ASP B 316 ILE B 331 1 ? 16 HELX_P HELX_P12 12 ASP A 332 ? ALA A 347 ? ASP B 332 ALA B 347 1 ? 16 HELX_P HELX_P13 13 ASP A 355 ? CYS A 366 ? ASP B 355 CYS B 366 1 ? 12 HELX_P HELX_P14 14 THR A 372 ? ASN A 385 ? THR B 372 ASN B 385 1 ? 14 HELX_P HELX_P15 15 GLU A 391 ? PHE A 398 ? GLU B 391 PHE B 398 1 ? 8 HELX_P HELX_P16 16 ARG A 401 ? GLU A 405 ? ARG B 401 GLU B 405 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 17 ARG A 406 ? LEU A 418 ? ARG B 406 LEU B 418 1 ? 13 HELX_P HELX_P18 18 ASN A 422 ? GLU A 435 ? ASN B 422 GLU B 435 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 19 SER A 440 ? GLY A 454 ? SER B 440 GLY B 454 1 ? 15 HELX_P HELX_P20 20 GLY A 460 ? LEU A 468 ? GLY B 460 LEU B 468 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 21 LYS A 470 ? LYS A 485 ? LYS B 470 LYS B 485 1 ? 16 HELX_P HELX_P22 22 GLY B 40 ? ARG B 53 ? GLY D 40 ARG D 53 1 ? 14 HELX_P HELX_P23 23 GLU B 74 ? GLU B 81 ? GLU D 74 GLU D 81 1 ? 8 HELX_P HELX_P24 24 SER B 82 ? ARG B 84 ? SER D 82 ARG D 84 5 ? 3 HELX_P HELX_P25 25 GLU B 107 ? GLU B 110 ? GLU D 107 GLU D 110 5 ? 4 HELX_P HELX_P26 26 ILE B 111 ? ASP B 122 ? ILE D 111 ASP D 122 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 27 PRO B 146 ? GLU B 151 ? PRO D 146 GLU D 151 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 28 THR B 197 ? MET B 209 ? THR D 197 MET D 209 1 ? 13 HELX_P HELX_P29 29 GLY B 217 ? LEU B 221 ? GLY D 217 LEU D 221 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 30 ASN B 223 ? PHE B 234 ? ASN D 223 PHE D 234 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 31 SER B 256 ? GLY B 260 ? SER D 256 GLY D 260 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 32 PHE B 267 ? GLY B 271 ? PHE D 267 GLY D 271 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 33 LEU B 273 ? ALA B 282 ? LEU D 273 ALA D 282 1 ? 10 HELX_P HELX_P34 34 ASP B 316 ? ARG B 329 ? ASP D 316 ARG D 329 1 ? 14 HELX_P HELX_P35 35 ASP B 332 ? ALA B 347 ? ASP D 332 ALA D 347 1 ? 16 HELX_P HELX_P36 36 ARG B 357 ? ARG B 367 ? ARG D 357 ARG D 367 1 ? 11 HELX_P HELX_P37 37 GLU B 368 ? VAL B 370 ? GLU D 368 VAL D 370 5 ? 3 HELX_P HELX_P38 38 THR B 372 ? MET B 380 ? THR D 372 MET D 380 1 ? 9 HELX_P HELX_P39 39 MET B 380 ? ASN B 385 ? MET D 380 ASN D 385 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 40 GLU B 391 ? PHE B 398 ? GLU D 391 PHE D 398 1 ? 8 HELX_P HELX_P41 41 ARG B 401 ? GLU B 405 ? ARG D 401 GLU D 405 5 ? 5 HELX_P HELX_P42 42 GLU B 409 ? ASP B 417 ? GLU D 409 ASP D 417 1 ? 9 HELX_P HELX_P43 43 ASN B 422 ? SER B 434 ? ASN D 422 SER D 434 1 ? 13 HELX_P HELX_P44 44 LYS B 442 ? GLY B 454 ? LYS D 442 GLY D 454 1 ? 13 HELX_P HELX_P45 45 GLY B 460 ? ILE B 465 ? GLY D 460 ILE D 465 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 46 LYS B 470 ? LYS B 485 ? LYS D 470 LYS D 485 1 ? 16 HELX_P HELX_P47 47 HIS C 38 ? GLY C 56 ? 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'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 101 A . ? GLY 101 B PRO 102 A ? PRO 102 B 1 0.06 2 GLY 101 B . ? GLY 101 D PRO 102 B ? PRO 102 D 1 0.06 3 GLY 101 C . ? GLY 101 C PRO 102 C ? PRO 102 C 1 0.04 4 GLY 101 D . ? GLY 101 A PRO 102 D ? 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T ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? parallel E 1 2 ? parallel F 1 2 ? parallel G 1 2 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? parallel K 1 2 ? parallel L 1 2 ? parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel O 1 2 ? parallel P 1 2 ? parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel S 1 2 ? parallel T 1 2 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 ARG A 26 ? PHE A 29 ? ARG B 26 PHE B 29 A 2 LYS A 58 ? LEU A 61 ? LYS B 58 LEU B 61 B 1 GLU A 138 ? THR A 142 ? GLU B 138 THR B 142 B 2 ALA A 125 ? TYR A 130 ? ALA B 125 TYR B 130 B 3 VAL A 156 ? PHE A 160 ? VAL B 156 PHE B 160 B 4 PHE A 187 ? MET A 190 ? PHE B 187 MET B 190 C 1 PHE A 169 ? ASP A 171 ? PHE B 169 ASP B 171 C 2 GLY A 175 ? MET A 177 ? GLY B 175 MET B 177 D 1 HIS A 213 ? ARG A 216 ? HIS B 213 ARG B 216 D 2 VAL A 240 ? HIS A 243 ? VAL B 240 HIS B 243 E 1 ILE A 247 ? LEU A 248 ? ILE B 247 LEU B 248 E 2 VAL A 313 ? ILE A 314 ? VAL B 313 ILE B 314 F 1 ARG B 26 ? PHE B 29 ? ARG D 26 PHE D 29 F 2 LYS B 58 ? LEU B 61 ? LYS D 58 LEU D 61 G 1 ILE B 63 ? GLU B 64 ? ILE D 63 GLU D 64 G 2 ARG B 104 ? GLN B 105 ? ARG D 104 GLN D 105 H 1 ILE B 158 ? LYS B 159 ? ILE D 158 LYS D 159 H 2 ILE B 188 ? MET B 190 ? ILE D 188 MET D 190 I 1 LYS B 166 ? ASP B 171 ? LYS D 166 ASP D 171 I 2 GLY B 175 ? ASP B 180 ? GLY D 175 ASP D 180 J 1 HIS B 213 ? VAL B 214 ? HIS D 213 VAL D 214 J 2 VAL B 240 ? PHE B 241 ? VAL D 240 PHE D 241 K 1 ILE B 247 ? LEU B 248 ? ILE D 247 LEU D 248 K 2 VAL B 313 ? ILE B 314 ? VAL D 313 ILE D 314 L 1 ARG C 26 ? ARG C 28 ? ARG C 26 ARG C 28 L 2 LYS C 58 ? ILE C 60 ? LYS C 58 ILE C 60 M 1 GLU C 138 ? THR C 142 ? GLU C 138 THR C 142 M 2 ALA C 125 ? TYR C 130 ? ALA C 125 TYR C 130 M 3 VAL C 156 ? PHE C 160 ? VAL C 156 PHE C 160 M 4 ILE C 188 ? MET C 190 ? ILE C 188 MET C 190 N 1 SER C 168 ? GLU C 170 ? SER C 168 GLU C 170 N 2 TYR C 176 ? GLU C 178 ? TYR C 176 GLU C 178 O 1 HIS C 213 ? GLY C 217 ? HIS C 213 GLY C 217 O 2 VAL C 240 ? ILE C 244 ? VAL C 240 ILE C 244 P 1 ARG D 28 ? PHE D 29 ? ARG A 28 PHE A 29 P 2 ILE D 60 ? LEU D 61 ? ILE A 60 LEU A 61 Q 1 GLU D 138 ? THR D 142 ? GLU A 138 THR A 142 Q 2 ALA D 125 ? TYR D 130 ? ALA A 125 TYR A 130 Q 3 VAL D 156 ? PHE D 160 ? VAL A 156 PHE A 160 Q 4 PHE D 187 ? MET D 190 ? PHE A 187 MET A 190 R 1 THR D 167 ? ASP D 171 ? THR A 167 ASP A 171 R 2 GLY D 175 ? PHE D 179 ? GLY A 175 PHE A 179 S 1 HIS D 213 ? GLY D 217 ? HIS A 213 GLY A 217 S 2 VAL D 240 ? ILE D 244 ? VAL A 240 ILE A 244 T 1 ILE D 247 ? LEU D 248 ? ILE A 247 LEU A 248 T 2 VAL D 313 ? ILE D 314 ? VAL A 313 ILE A 314 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 N PHE A 29 ? N PHE B 29 O ILE A 60 ? O ILE B 60 B 1 2 O LEU A 139 ? O LEU B 139 N VAL A 129 ? N VAL B 129 B 2 3 N TYR A 126 ? N TYR B 126 O LYS A 159 ? O LYS B 159 B 3 4 N ILE A 158 ? N ILE B 158 O ILE A 189 ? O ILE B 189 C 1 2 N PHE A 169 ? N PHE B 169 O MET A 177 ? O MET B 177 D 1 2 N VAL A 214 ? N VAL B 214 O VAL A 240 ? O VAL B 240 E 1 2 N LEU A 248 ? N LEU B 248 O VAL A 313 ? O VAL B 313 F 1 2 N VAL B 27 ? N VAL D 27 O ILE B 60 ? O ILE D 60 G 1 2 N ILE B 63 ? N ILE D 63 O GLN B 105 ? O GLN D 105 H 1 2 N ILE B 158 ? N ILE D 158 O ILE B 189 ? O ILE D 189 I 1 2 N ASP B 171 ? N ASP D 171 O GLY B 175 ? O GLY D 175 J 1 2 N VAL B 214 ? N VAL D 214 O VAL B 240 ? O VAL D 240 K 1 2 O LEU B 248 ? O LEU D 248 N VAL B 313 ? N VAL D 313 L 1 2 N VAL C 27 ? N VAL C 27 O ILE C 60 ? O ILE C 60 M 1 2 O LEU C 139 ? O LEU C 139 N VAL C 129 ? N VAL C 129 M 2 3 N VAL C 128 ? N VAL C 128 O THR C 157 ? O THR C 157 M 3 4 N ILE C 158 ? N ILE C 158 O ILE C 189 ? O ILE C 189 N 1 2 N PHE C 169 ? N PHE C 169 O MET C 177 ? O MET C 177 O 1 2 N VAL C 214 ? N VAL C 214 O VAL C 240 ? O VAL C 240 P 1 2 N PHE D 29 ? N PHE A 29 O ILE D 60 ? O ILE A 60 Q 1 2 O THR D 142 ? O THR A 142 N TYR D 127 ? N TYR A 127 Q 2 3 N VAL D 128 ? N VAL A 128 O THR D 157 ? O THR A 157 Q 3 4 N PHE D 160 ? N PHE A 160 O PHE D 187 ? O PHE A 187 R 1 2 N PHE D 169 ? N PHE A 169 O MET D 177 ? O MET A 177 S 1 2 N VAL D 214 ? N VAL A 214 O VAL D 240 ? O VAL A 240 T 1 2 O LEU D 248 ? O LEU A 248 N VAL D 313 ? N VAL A 313 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software B GSU 1001 ? 18 'BINDING SITE FOR RESIDUE GSU B 1001' AC2 Software D GSU 1001 ? 15 'BINDING SITE FOR RESIDUE GSU D 1001' AC3 Software C GSU 1001 ? 16 'BINDING SITE FOR RESIDUE GSU C 1001' AC4 Software A GSU 1001 ? 17 'BINDING SITE FOR RESIDUE GSU A 1001' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 18 ARG A 28 ? ARG B 28 . ? 1_555 ? 2 AC1 18 PHE A 29 ? PHE B 29 . ? 1_555 ? 3 AC1 18 ALA A 30 ? ALA B 30 . ? 1_555 ? 4 AC1 18 PRO A 31 ? PRO B 31 . ? 1_555 ? 5 AC1 18 SER A 32 ? SER B 32 . ? 1_555 ? 6 AC1 18 GLY A 40 ? GLY B 40 . ? 1_555 ? 7 AC1 18 GLY A 41 ? GLY B 41 . ? 1_555 ? 8 AC1 18 GLU A 64 ? GLU B 64 . ? 1_555 ? 9 AC1 18 TYR A 198 ? TYR B 198 . ? 1_555 ? 10 AC1 18 ARG A 216 ? ARG B 216 . ? 1_555 ? 11 AC1 18 GLY A 217 ? GLY B 217 . ? 1_555 ? 12 AC1 18 ASP A 219 ? ASP B 219 . ? 1_555 ? 13 AC1 18 HIS A 220 ? HIS B 220 . ? 1_555 ? 14 AC1 18 LEU A 246 ? LEU B 246 . ? 1_555 ? 15 AC1 18 ILE A 247 ? ILE B 247 . ? 1_555 ? 16 AC1 18 PRO A 254 ? PRO B 254 . ? 1_555 ? 17 AC1 18 LEU A 255 ? LEU B 255 . ? 1_555 ? 18 AC1 18 A E 74 ? A F 76 . ? 1_555 ? 19 AC2 15 ARG B 28 ? ARG D 28 . ? 1_555 ? 20 AC2 15 PHE B 29 ? PHE D 29 . ? 1_555 ? 21 AC2 15 ALA B 30 ? ALA D 30 . ? 1_555 ? 22 AC2 15 PRO B 31 ? PRO D 31 . ? 1_555 ? 23 AC2 15 SER B 32 ? SER D 32 . ? 1_555 ? 24 AC2 15 HIS B 38 ? HIS D 38 . ? 1_555 ? 25 AC2 15 GLY B 40 ? GLY D 40 . ? 1_555 ? 26 AC2 15 THR B 44 ? THR D 44 . ? 1_555 ? 27 AC2 15 GLU B 64 ? GLU D 64 . ? 1_555 ? 28 AC2 15 TYR B 198 ? TYR D 198 . ? 1_555 ? 29 AC2 15 GLY B 217 ? GLY D 217 . ? 1_555 ? 30 AC2 15 HIS B 220 ? HIS D 220 . ? 1_555 ? 31 AC2 15 LEU B 246 ? LEU D 246 . ? 1_555 ? 32 AC2 15 ILE B 247 ? ILE D 247 . ? 1_555 ? 33 AC2 15 A F 74 ? A H 76 . ? 1_555 ? 34 AC3 16 ARG C 28 ? ARG C 28 . ? 1_555 ? 35 AC3 16 PHE C 29 ? PHE C 29 . ? 1_555 ? 36 AC3 16 ALA C 30 ? ALA C 30 . ? 1_555 ? 37 AC3 16 PRO C 31 ? PRO C 31 . ? 1_555 ? 38 AC3 16 SER C 32 ? SER C 32 . ? 1_555 ? 39 AC3 16 GLY C 40 ? GLY C 40 . ? 1_555 ? 40 AC3 16 THR C 44 ? THR C 44 . ? 1_555 ? 41 AC3 16 GLU C 64 ? GLU C 64 . ? 1_555 ? 42 AC3 16 TYR C 198 ? TYR C 198 . ? 1_555 ? 43 AC3 16 ARG C 216 ? ARG C 216 . ? 1_555 ? 44 AC3 16 GLY C 217 ? GLY C 217 . ? 1_555 ? 45 AC3 16 ASP C 219 ? ASP C 219 . ? 1_555 ? 46 AC3 16 HIS C 220 ? HIS C 220 . ? 1_555 ? 47 AC3 16 ILE C 247 ? ILE C 247 . ? 1_555 ? 48 AC3 16 PRO C 254 ? PRO C 254 . ? 1_555 ? 49 AC3 16 A G 74 ? A G 76 . ? 1_555 ? 50 AC4 17 ARG D 28 ? ARG A 28 . ? 1_555 ? 51 AC4 17 PHE D 29 ? PHE A 29 . ? 1_555 ? 52 AC4 17 ALA D 30 ? ALA A 30 . ? 1_555 ? 53 AC4 17 PRO D 31 ? PRO A 31 . ? 1_555 ? 54 AC4 17 SER D 32 ? SER A 32 . ? 1_555 ? 55 AC4 17 HIS D 38 ? HIS A 38 . ? 1_555 ? 56 AC4 17 THR D 44 ? THR A 44 . ? 1_555 ? 57 AC4 17 GLU D 64 ? GLU A 64 . ? 1_555 ? 58 AC4 17 TYR D 198 ? TYR A 198 . ? 1_555 ? 59 AC4 17 ARG D 216 ? ARG A 216 . ? 1_555 ? 60 AC4 17 GLY D 217 ? GLY A 217 . ? 1_555 ? 61 AC4 17 ASP D 219 ? ASP A 219 . ? 1_555 ? 62 AC4 17 HIS D 220 ? HIS A 220 . ? 1_555 ? 63 AC4 17 LEU D 246 ? LEU A 246 . ? 1_555 ? 64 AC4 17 ILE D 247 ? ILE A 247 . ? 1_555 ? 65 AC4 17 LEU D 255 ? LEU A 255 . ? 1_555 ? 66 AC4 17 A H 74 ? A E 76 . ? 1_555 ? # _database_PDB_matrix.entry_id 3AKZ _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _atom_sites.entry_id 3AKZ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.015822 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000017 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006254 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006403 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C N O P S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? 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L 3 GSU 1 1001 1001 GSU GSU A . # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 3 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 4 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,E,I 2 1 B,F,J 3 1 C,G,K 4 1 D,H,L # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 4590 ? 1 MORE -33 ? 1 'SSA (A^2)' 30390 ? 2 'ABSA (A^2)' 4650 ? 2 MORE -37 ? 2 'SSA (A^2)' 31470 ? 3 'ABSA (A^2)' 4750 ? 3 MORE -30 ? 3 'SSA (A^2)' 31280 ? 4 'ABSA (A^2)' 4690 ? 4 MORE -36 ? 4 'SSA (A^2)' 30480 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2010-09-29 2 'Structure model' 1 1 2011-07-13 3 'Structure model' 1 2 2023-11-01 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Data collection' 3 3 'Structure model' 'Database references' 4 3 'Structure model' 'Derived calculations' 5 3 'Structure model' 'Refinement description' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 3 'Structure model' chem_comp_atom 2 3 'Structure model' chem_comp_bond 3 3 'Structure model' database_2 4 3 'Structure model' pdbx_initial_refinement_model 5 3 'Structure model' struct_site # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_asym_id' 4 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_comp_id' 5 3 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_seq_id' # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal PHASER phasing . ? 1 CNS refinement 1.2 ? 2 HKL-2000 'data reduction' . ? 3 HKL-2000 'data scaling' . ? 4 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 P F U 1 ? ? 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OP3 E U 1 ? ? 1.520 1.607 -0.087 0.012 N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 PRO B 31 ? ? -71.03 -161.27 2 1 SER B 32 ? ? -167.24 119.21 3 1 PRO B 33 ? ? -62.31 96.72 4 1 THR B 34 ? ? -156.01 74.15 5 1 ARG B 70 ? ? -97.52 33.03 6 1 ARG B 73 ? ? -134.94 -41.26 7 1 GLN B 77 ? ? -131.48 -37.19 8 1 ILE B 96 ? ? -124.02 -157.29 9 1 PHE B 100 ? ? -74.72 35.68 10 1 GLN B 105 ? ? -71.14 22.82 11 1 SER B 106 ? ? -130.46 -34.94 12 1 ARG B 113 ? ? -74.71 -73.30 13 1 ASP B 122 ? ? -74.94 20.27 14 1 PRO B 135 ? ? -73.53 21.42 15 1 SER B 136 ? ? -142.10 39.41 16 1 LEU B 139 ? ? -95.97 -79.08 17 1 THR B 142 ? ? -173.00 135.60 18 1 PRO B 146 ? ? -69.86 63.59 19 1 TYR B 149 ? ? -133.06 -48.90 20 1 THR B 157 ? ? -128.50 -162.45 21 1 PRO B 164 ? 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? 178.75 155.53 84 1 VAL D 354 ? ? -142.89 -16.63 85 1 GLU D 409 ? ? -120.86 -51.98 86 1 TRP D 421 ? ? -166.72 101.31 87 1 ASN D 422 ? ? -144.37 -143.30 88 1 MET D 423 ? ? -95.49 -63.60 89 1 ALA D 439 ? ? -168.94 -114.14 90 1 LYS D 441 ? ? -74.18 46.85 91 1 LYS D 442 ? ? -149.45 -45.13 92 1 PRO D 459 ? ? -67.83 -154.25 93 1 LYS D 470 ? ? -155.60 -33.45 94 1 THR D 473 ? ? -57.99 -71.01 95 1 ALA C 30 ? ? -108.77 75.96 96 1 GLU C 64 ? ? -92.58 53.52 97 1 ASP C 65 ? ? -77.98 40.54 98 1 ARG C 70 ? ? -150.42 -23.82 99 1 LEU C 83 ? ? -58.95 -78.60 100 1 ASP C 99 ? ? -94.90 30.83 101 1 PHE C 100 ? ? -151.33 37.64 102 1 TYR C 103 ? ? -113.10 53.61 103 1 ARG C 108 ? ? -145.03 20.72 104 1 ILE C 111 ? ? -56.62 -72.93 105 1 GLU C 121 ? ? -89.84 49.49 106 1 ASP C 122 ? ? -175.18 29.06 107 1 LYS C 123 ? ? 47.28 23.89 108 1 ASP C 131 ? ? -66.35 -167.95 109 1 SER C 136 ? ? -117.38 75.33 110 1 LYS C 137 ? ? -116.49 76.08 111 1 PRO C 146 ? ? -67.06 96.89 112 1 GLU C 151 ? ? -86.22 44.23 113 1 LYS C 152 ? 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"O4'" sing N N 536 U "C4'" "C3'" sing N N 537 U "C4'" "H4'" sing N N 538 U "O4'" "C1'" sing N N 539 U "C3'" "O3'" sing N N 540 U "C3'" "C2'" sing N N 541 U "C3'" "H3'" sing N N 542 U "O3'" "HO3'" sing N N 543 U "C2'" "O2'" sing N N 544 U "C2'" "C1'" sing N N 545 U "C2'" "H2'" sing N N 546 U "O2'" "HO2'" sing N N 547 U "C1'" N1 sing N N 548 U "C1'" "H1'" sing N N 549 U N1 C2 sing N N 550 U N1 C6 sing N N 551 U C2 O2 doub N N 552 U C2 N3 sing N N 553 U N3 C4 sing N N 554 U N3 H3 sing N N 555 U C4 O4 doub N N 556 U C4 C5 sing N N 557 U C5 C6 doub N N 558 U C5 H5 sing N N 559 U C6 H6 sing N N 560 VAL N CA sing N N 561 VAL N H sing N N 562 VAL N H2 sing N N 563 VAL CA C sing N N 564 VAL CA CB sing N N 565 VAL CA HA sing N N 566 VAL C O doub N N 567 VAL C OXT sing N N 568 VAL CB CG1 sing N N 569 VAL CB CG2 sing N N 570 VAL CB HB sing N N 571 VAL CG1 HG11 sing N N 572 VAL CG1 HG12 sing N N 573 VAL CG1 HG13 sing N N 574 VAL CG2 HG21 sing N N 575 VAL CG2 HG22 sing N N 576 VAL CG2 HG23 sing N N 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