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_pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 3 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id' 4 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id' 5 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id' 6 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id' 7 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id' 8 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id' 9 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id' 10 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id' 11 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id' 12 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id' 13 3 'Structure model' '_pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id' 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_pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 3H0M _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2009-04-09 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.content_type PDB 2G5I 'STRUCTURE OF TRNA-DEPENDENT AMIDOTRANSFERASE GATCAB FROM STAPHYLOCOCCUS AUREUS WITH ADP' unspecified PDB 2G5H 'STRUCTURE OF TRNA-DEPENDENT AMIDOTRANSFERASE GATCAB FROM STAPHYLOCOCCUS AUREUS WITH Mg2+' unspecified PDB 2F2A 'STRUCTURE OF TRNA-DEPENDENT AMIDOTRANSFERASE GATCAB FROM STAPHYLOCOCCUS AUREUS WITH Mg2+ AND GLN' unspecified PDB 2DF4 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_citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Wu, J.' 1 ? primary 'Bu, W.' 2 ? primary 'Sheppard, K.' 3 ? primary 'Kitabatake, M.' 4 ? primary 'Kwon, S.T.' 5 ? primary 'Soll, D.' 6 ? primary 'Smith, J.L.' 7 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A' 53589.160 8 6.3.5.- ? ? ? 2 polymer man 'Aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B' 55128.535 8 6.3.5.- ? ? ? 3 polymer man 'Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C' 11228.740 8 6.3.5.- ? ? ? 4 non-polymer syn GLUTAMINE 146.144 8 ? ? ? ? 5 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 7 ? ? ? ? 6 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 8 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Glu-ADT subunit A' 2 'Asp/Glu-ADT subunit B' 3 'Glu-ADT 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SER D 86 GLU D 90 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 44 ALA D 98 ? ALA D 107 ? ALA D 98 ALA D 107 1 ? 10 HELX_P HELX_P45 45 ASP D 118 ? MET D 122 ? ASP D 118 MET D 122 5 ? 5 HELX_P HELX_P46 46 SER D 148 ? VAL D 157 ? SER D 148 VAL D 157 1 ? 10 HELX_P HELX_P47 47 ILE D 172 ? GLY D 180 ? ILE D 172 GLY D 180 1 ? 9 HELX_P HELX_P48 48 ARG D 212 ? SER D 224 ? ARG D 212 SER D 224 1 ? 13 HELX_P HELX_P49 49 GLU D 240 ? GLU D 244 ? GLU D 240 GLU D 244 5 ? 5 HELX_P HELX_P50 50 GLU D 259 ? TYR D 263 ? GLU D 259 TYR D 263 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 51 GLN D 266 ? GLY D 284 ? GLN D 266 GLY D 284 1 ? 19 HELX_P HELX_P52 52 HIS D 294 ? LYS D 296 ? HIS D 294 LYS D 296 5 ? 3 HELX_P HELX_P53 53 TYR D 297 ? LEU D 314 ? TYR D 297 LEU D 314 1 ? 18 HELX_P HELX_P54 54 ASP D 331 ? PHE D 344 ? ASP D 331 PHE D 344 1 ? 14 HELX_P HELX_P55 55 GLY D 345 ? LEU D 359 ? GLY D 345 LEU D 359 1 ? 15 HELX_P HELX_P56 56 TYR D 367 ? VAL D 389 ? TYR D 367 VAL D 389 1 ? 23 HELX_P HELX_P57 57 ASN D 410 ? LEU D 416 ? ASN D 410 LEU D 416 1 ? 7 HELX_P HELX_P58 58 SER D 417 ? ILE D 419 ? SER D 417 ILE D 419 5 ? 3 HELX_P HELX_P59 59 THR D 421 ? ALA D 427 ? THR D 421 ALA D 427 1 ? 7 HELX_P HELX_P60 60 ASP D 454 ? PHE D 469 ? ASP D 454 PHE D 469 1 ? 16 HELX_P HELX_P61 61 LYS D 470 ? LYS D 474 ? LYS D 470 LYS D 474 5 ? 5 HELX_P HELX_P62 62 CYS E 40 ? GLY E 45 ? CYS E 40 GLY E 45 1 ? 6 HELX_P HELX_P63 63 ASN E 54 ? LEU E 68 ? ASN E 54 LEU E 68 1 ? 15 HELX_P HELX_P64 64 THR E 162 ? GLY E 181 ? THR E 162 GLY E 181 1 ? 20 HELX_P HELX_P65 65 ASP E 186 ? GLY E 190 ? ASP E 186 GLY E 190 5 ? 5 HELX_P HELX_P66 66 SER E 219 ? GLU E 240 ? SER E 219 GLU E 240 1 ? 22 HELX_P HELX_P67 67 LYS E 284 ? ASN E 294 ? LYS E 284 ASN E 294 1 ? 11 HELX_P HELX_P68 68 LEU E 298 ? GLY E 311 ? LEU E 298 GLY E 311 1 ? 14 HELX_P HELX_P69 69 SER E 313 ? HIS E 323 ? SER E 313 HIS E 323 1 ? 11 HELX_P HELX_P70 70 HIS E 323 ? PHE E 337 ? HIS E 323 PHE E 337 1 ? 15 HELX_P HELX_P71 71 GLU E 339 ? ASP E 350 ? 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W CYS 43 ? 1_555 99.0 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 146 A . ? GLY 146 A SER 147 A ? SER 147 A 1 8.89 2 GLY 146 D . ? GLY 146 D SER 147 D ? SER 147 D 1 6.33 3 GLY 146 G . ? GLY 146 G SER 147 G ? SER 147 G 1 9.06 4 GLY 146 J . ? GLY 146 J SER 147 J ? SER 147 J 1 8.44 5 GLY 146 M . ? GLY 146 M SER 147 M ? SER 147 M 1 6.86 6 GLY 146 P . ? GLY 146 P SER 147 P ? SER 147 P 1 8.65 7 GLY 146 S . ? GLY 146 S SER 147 S ? SER 147 S 1 7.60 8 GLY 146 V . ? GLY 146 V SER 147 V ? SER 147 V 1 10.49 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 11 ? B ? 9 ? C ? 2 ? D ? 2 ? E ? 3 ? F ? 4 ? G ? 11 ? H ? 9 ? I ? 2 ? J ? 2 ? K ? 4 ? L ? 11 ? M ? 9 ? N ? 2 ? O ? 2 ? P ? 2 ? Q ? 4 ? R ? 11 ? S ? 9 ? T ? 2 ? U ? 2 ? V ? 2 ? W ? 4 ? X ? 11 ? Y ? 9 ? Z ? 2 ? AA ? 2 ? AB ? 2 ? AC ? 4 ? AD ? 11 ? AE ? 9 ? AF ? 2 ? AG ? 2 ? AH ? 2 ? AI ? 4 ? AJ ? 11 ? AK ? 9 ? AL ? 2 ? AM ? 2 ? AN ? 4 ? AO ? 11 ? AP ? 9 ? AQ ? 2 ? AR ? 3 ? AS ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? parallel A 3 4 ? parallel A 4 5 ? anti-parallel A 5 6 ? anti-parallel A 6 7 ? anti-parallel A 7 8 ? anti-parallel A 8 9 ? anti-parallel A 9 10 ? parallel A 10 11 ? parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? anti-parallel B 5 6 ? anti-parallel B 6 7 ? anti-parallel B 7 8 ? parallel B 8 9 ? anti-parallel C 1 2 ? parallel D 1 2 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel F 3 4 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? parallel G 3 4 ? parallel G 4 5 ? anti-parallel G 5 6 ? anti-parallel G 6 7 ? anti-parallel G 7 8 ? anti-parallel G 8 9 ? anti-parallel G 9 10 ? parallel G 10 11 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? anti-parallel H 5 6 ? anti-parallel H 6 7 ? anti-parallel H 7 8 ? parallel H 8 9 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? parallel L 3 4 ? parallel L 4 5 ? anti-parallel L 5 6 ? anti-parallel L 6 7 ? anti-parallel L 7 8 ? anti-parallel L 8 9 ? anti-parallel L 9 10 ? parallel L 10 11 ? parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel M 4 5 ? anti-parallel M 5 6 ? anti-parallel M 6 7 ? anti-parallel M 7 8 ? parallel M 8 9 ? anti-parallel N 1 2 ? parallel O 1 2 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? parallel R 3 4 ? parallel R 4 5 ? anti-parallel R 5 6 ? anti-parallel R 6 7 ? anti-parallel R 7 8 ? anti-parallel R 8 9 ? anti-parallel R 9 10 ? parallel R 10 11 ? parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel S 3 4 ? anti-parallel S 4 5 ? anti-parallel S 5 6 ? anti-parallel S 6 7 ? anti-parallel S 7 8 ? parallel S 8 9 ? anti-parallel T 1 2 ? parallel U 1 2 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel W 2 3 ? anti-parallel W 3 4 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel X 2 3 ? parallel X 3 4 ? parallel X 4 5 ? anti-parallel X 5 6 ? anti-parallel X 6 7 ? anti-parallel X 7 8 ? anti-parallel X 8 9 ? anti-parallel X 9 10 ? parallel X 10 11 ? parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Y 3 4 ? anti-parallel Y 4 5 ? anti-parallel Y 5 6 ? anti-parallel Y 6 7 ? anti-parallel Y 7 8 ? parallel Y 8 9 ? anti-parallel Z 1 2 ? parallel AA 1 2 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? parallel AD 3 4 ? parallel AD 4 5 ? anti-parallel AD 5 6 ? anti-parallel AD 6 7 ? anti-parallel AD 7 8 ? anti-parallel AD 8 9 ? anti-parallel AD 9 10 ? parallel AD 10 11 ? parallel AE 1 2 ? anti-parallel AE 2 3 ? anti-parallel AE 3 4 ? anti-parallel AE 4 5 ? anti-parallel AE 5 6 ? anti-parallel AE 6 7 ? anti-parallel AE 7 8 ? parallel AE 8 9 ? anti-parallel AF 1 2 ? parallel AG 1 2 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AI 1 2 ? anti-parallel AI 2 3 ? anti-parallel AI 3 4 ? anti-parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? parallel AJ 3 4 ? parallel AJ 4 5 ? anti-parallel AJ 5 6 ? anti-parallel AJ 6 7 ? anti-parallel AJ 7 8 ? anti-parallel AJ 8 9 ? anti-parallel AJ 9 10 ? parallel AJ 10 11 ? parallel AK 1 2 ? anti-parallel AK 2 3 ? anti-parallel AK 3 4 ? anti-parallel AK 4 5 ? anti-parallel AK 5 6 ? anti-parallel AK 6 7 ? anti-parallel AK 7 8 ? parallel AK 8 9 ? anti-parallel AL 1 2 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AN 1 2 ? anti-parallel AN 2 3 ? anti-parallel AN 3 4 ? anti-parallel AO 1 2 ? anti-parallel AO 2 3 ? parallel AO 3 4 ? parallel AO 4 5 ? anti-parallel AO 5 6 ? anti-parallel AO 6 7 ? anti-parallel AO 7 8 ? anti-parallel AO 8 9 ? anti-parallel AO 9 10 ? parallel AO 10 11 ? parallel AP 1 2 ? anti-parallel AP 2 3 ? anti-parallel AP 3 4 ? anti-parallel AP 4 5 ? anti-parallel AP 5 6 ? anti-parallel AP 6 7 ? anti-parallel AP 7 8 ? parallel AP 8 9 ? anti-parallel AQ 1 2 ? anti-parallel AR 1 2 ? anti-parallel AR 2 3 ? anti-parallel AS 1 2 ? anti-parallel AS 2 3 ? anti-parallel AS 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 TYR A 42 ? PRO A 45 ? TYR A 42 PRO A 45 A 2 LEU A 110 ? THR A 115 ? LEU A 110 THR A 115 A 3 PRO A 68 ? LYS A 72 ? PRO A 68 LYS A 72 A 4 SER A 163 ? SER A 166 ? SER A 163 SER A 166 A 5 ILE A 206 ? GLY A 210 ? ILE A 206 GLY A 210 A 6 ILE A 182 ? LYS A 185 ? ILE A 182 LYS A 185 A 7 ALA A 431 ? LYS A 439 ? ALA A 431 LYS A 439 A 8 LEU A 442 ? ILE A 449 ? LEU A 442 ILE A 449 A 9 VAL A 391 ? PRO A 395 ? VAL A 391 PRO A 395 A 10 LYS A 253 ? PRO A 257 ? LYS A 253 PRO A 257 A 11 GLU A 286 ? VAL A 290 ? GLU A 286 VAL A 290 B 1 GLU B 71 ? VAL B 72 ? GLU B 71 VAL B 72 B 2 ALA B 102 ? ASN B 110 ? ALA B 102 ASN B 110 B 3 LYS B 116 ? GLU B 128 ? LYS B 116 GLU B 128 B 4 PRO B 150 ? THR B 156 ? PRO B 150 THR B 156 B 5 TYR B 5 ? GLN B 16 ? TYR B 5 GLN B 16 B 6 LEU B 192 ? PRO B 202 ? LEU B 192 PRO B 202 B 7 VAL B 212 ? LYS B 215 ? VAL B 212 LYS B 215 B 8 THR B 248 ? ASP B 252 ? THR B 248 ASP B 252 B 9 LYS B 257 ? TYR B 259 ? LYS B 257 TYR B 259 C 1 VAL B 53 ? ASN B 54 ? VAL B 53 ASN B 54 C 2 MET C 60 ? ARG C 61 ? MET C 60 ARG C 61 D 1 GLU B 75 ? SER B 76 ? GLU B 75 SER B 76 D 2 LEU B 281 ? LYS B 282 ? LEU B 281 LYS B 282 E 1 TYR B 92 ? GLN B 96 ? TYR B 92 GLN B 96 E 2 PHE B 78 ? HIS B 82 ? PHE B 78 HIS B 82 E 3 PHE B 273 ? PRO B 274 ? PHE B 273 PRO B 274 F 1 LYS B 132 ? GLU B 136 ? LYS B 132 GLU B 136 F 2 LYS B 139 ? ASP B 143 ? LYS B 139 ASP B 143 F 3 PHE C 85 ? PRO C 89 ? PHE C 85 PRO C 89 F 4 ARG C 81 ? LYS C 82 ? ARG C 81 LYS C 82 G 1 TYR D 42 ? PRO D 45 ? TYR D 42 PRO D 45 G 2 LEU D 110 ? THR D 115 ? LEU D 110 THR D 115 G 3 PRO D 68 ? LYS D 72 ? PRO D 68 LYS D 72 G 4 SER D 163 ? SER D 166 ? SER D 163 SER D 166 G 5 ILE D 206 ? GLY D 210 ? ILE D 206 GLY D 210 G 6 ILE D 182 ? LYS D 185 ? ILE D 182 LYS D 185 G 7 ALA D 431 ? LYS D 439 ? ALA D 431 LYS D 439 G 8 LEU D 442 ? ILE D 449 ? LEU D 442 ILE D 449 G 9 VAL D 391 ? PRO D 395 ? VAL D 391 PRO D 395 G 10 LYS D 253 ? PRO D 257 ? LYS D 253 PRO D 257 G 11 GLU D 286 ? VAL D 290 ? GLU D 286 VAL D 290 H 1 GLU E 71 ? VAL E 72 ? GLU E 71 VAL E 72 H 2 ALA E 102 ? ASN E 110 ? ALA E 102 ASN E 110 H 3 LYS E 116 ? GLU E 128 ? LYS E 116 GLU E 128 H 4 PRO E 150 ? THR E 156 ? PRO E 150 THR E 156 H 5 TYR E 5 ? GLN E 16 ? TYR E 5 GLN E 16 H 6 LEU E 192 ? PRO E 202 ? LEU E 192 PRO E 202 H 7 VAL E 212 ? LYS E 215 ? VAL E 212 LYS E 215 H 8 THR E 248 ? ASP E 252 ? THR E 248 ASP E 252 H 9 LYS E 257 ? TYR E 259 ? LYS E 257 TYR E 259 I 1 GLU E 75 ? SER E 76 ? GLU E 75 SER E 76 I 2 LEU E 281 ? LYS E 282 ? LEU E 281 LYS E 282 J 1 PHE E 78 ? HIS E 82 ? PHE E 78 HIS E 82 J 2 TYR E 92 ? GLN E 96 ? TYR E 92 GLN E 96 K 1 LYS E 132 ? GLU E 136 ? LYS E 132 GLU E 136 K 2 LYS E 139 ? ASP E 143 ? LYS E 139 ASP E 143 K 3 PHE F 85 ? PRO F 89 ? PHE F 85 PRO F 89 K 4 ARG F 81 ? LYS F 82 ? ARG F 81 LYS F 82 L 1 TYR G 42 ? PRO G 45 ? TYR G 42 PRO G 45 L 2 LEU G 110 ? THR G 115 ? LEU G 110 THR G 115 L 3 PRO G 68 ? LYS G 72 ? PRO G 68 LYS G 72 L 4 SER G 163 ? SER G 166 ? SER G 163 SER G 166 L 5 ILE G 206 ? GLY G 210 ? 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