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'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 3HVR _struct.title ;Crystal structure of T. thermophilus Argonaute complexed with DNA guide strand and 19-nt RNA target strand with two Mg2+ at the cleavage site ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3HVR _struct_keywords.pdbx_keywords 'NUCLEIC ACID BINDING PROTEIN/DNA/RNA' _struct_keywords.text 'argonaute, protein-DNA-RNA complex, NUCLEIC ACID BINDING PROTEIN-DNA-RNA COMPLEX' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 4 ? J N N 5 ? K N N 4 ? L N N 4 ? M N N 4 ? 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'DG-DT MISPAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 34 A . ? ASP 34 A PRO 35 A ? PRO 35 A 1 5.34 2 ASP 34 B . ? ASP 34 B PRO 35 B ? PRO 35 B 1 5.92 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 5 ? B ? 5 ? C ? 5 ? D ? 3 ? E ? 2 ? F ? 4 ? G ? 3 ? H ? 7 ? I ? 5 ? J ? 5 ? K ? 4 ? L ? 2 ? M ? 3 ? N ? 2 ? O ? 2 ? P ? 4 ? Q ? 3 ? R ? 8 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel A 4 5 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel C 4 5 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? parallel F 2 3 ? parallel F 3 4 ? parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? parallel H 4 5 ? parallel H 5 6 ? anti-parallel H 6 7 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel I 3 4 ? anti-parallel I 4 5 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel J 4 5 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel P 1 2 ? parallel P 2 3 ? parallel P 3 4 ? parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? parallel R 4 5 ? parallel R 5 6 ? anti-parallel R 6 7 ? anti-parallel R 7 8 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 ALA A 133 ? ALA A 140 ? ALA A 133 ALA A 140 A 2 TRP A 145 ? VAL A 157 ? TRP A 145 VAL A 157 A 3 ALA A 162 ? CYS A 175 ? ALA A 162 CYS A 175 A 4 GLY A 5 ? PRO A 18 ? GLY A 5 PRO A 18 A 5 GLU A 307 ? ARG A 315 ? GLU A 307 ARG A 315 B 1 ALA A 133 ? ALA A 140 ? ALA A 133 ALA A 140 B 2 TRP A 145 ? VAL A 157 ? TRP A 145 VAL A 157 B 3 ALA A 162 ? CYS A 175 ? ALA A 162 CYS A 175 B 4 GLY A 5 ? PRO A 18 ? GLY A 5 PRO A 18 B 5 VAL A 581 ? PRO A 583 ? VAL A 581 PRO A 583 C 1 THR A 57 ? MET A 60 ? THR A 57 MET A 60 C 2 GLY A 63 ? SER A 66 ? GLY A 63 SER A 66 C 3 TRP A 27 ? VAL A 31 ? TRP A 27 VAL A 31 C 4 ALA A 87 ? ARG A 95 ? ALA A 87 ARG A 95 C 5 GLU A 76 ? THR A 78 ? GLU A 76 THR A 78 D 1 THR A 201 ? TRP A 202 ? THR A 201 TRP A 202 D 2 VAL A 193 ? ASN A 195 ? VAL A 193 ASN A 195 D 3 LEU A 261 ? PRO A 263 ? LEU A 261 PRO A 263 E 1 LEU A 321 ? MET A 322 ? LEU A 321 MET A 322 E 2 ALA A 464 ? LEU A 465 ? ALA A 464 LEU A 465 F 1 LEU A 376 ? LEU A 378 ? LEU A 376 LEU A 378 F 2 THR A 344 ? ARG A 350 ? THR A 344 ARG A 350 F 3 VAL A 403 ? LEU A 409 ? VAL A 403 LEU A 409 F 4 SER A 432 ? LEU A 435 ? SER A 432 LEU A 435 G 1 LEU A 501 ? TRP A 503 ? LEU A 501 TRP A 503 G 2 ARG A 486 ? VAL A 494 ? ARG A 486 VAL A 494 G 3 GLU A 507 ? GLN A 509 ? GLU A 507 GLN A 509 H 1 LEU A 501 ? TRP A 503 ? LEU A 501 TRP A 503 H 2 ARG A 486 ? VAL A 494 ? ARG A 486 VAL A 494 H 3 LEU A 473 ? ALA A 479 ? LEU A 473 ALA A 479 H 4 ARG A 540 ? ASP A 546 ? ARG A 540 ASP A 546 H 5 ALA A 567 ? ARG A 574 ? ALA A 567 ARG A 574 H 6 LEU A 617 ? ALA A 623 ? LEU A 617 ALA A 623 H 7 PHE A 601 ? LEU A 603 ? PHE A 601 LEU A 603 I 1 ALA B 133 ? ALA B 140 ? ALA B 133 ALA B 140 I 2 TRP B 145 ? VAL B 157 ? TRP B 145 VAL B 157 I 3 ALA B 162 ? TYR B 171 ? ALA B 162 TYR B 171 I 4 LYS B 6 ? PRO B 18 ? LYS B 6 PRO B 18 I 5 GLU B 307 ? TYR B 314 ? GLU B 307 TYR B 314 J 1 LEU B 174 ? CYS B 175 ? LEU B 174 CYS B 175 J 2 TRP B 145 ? VAL B 157 ? TRP B 145 VAL B 157 J 3 ALA B 162 ? TYR B 171 ? ALA B 162 TYR B 171 J 4 LYS B 6 ? PRO B 18 ? LYS B 6 PRO B 18 J 5 VAL B 581 ? PRO B 583 ? VAL B 581 PRO B 583 K 1 THR B 57 ? MET B 60 ? THR B 57 MET B 60 K 2 GLY B 63 ? SER B 66 ? GLY B 63 SER B 66 K 3 TRP B 27 ? GLU B 30 ? TRP B 27 GLU B 30 K 4 TYR B 91 ? ARG B 95 ? TYR B 91 ARG B 95 L 1 GLU B 76 ? THR B 78 ? GLU B 76 THR B 78 L 2 ALA B 87 ? ARG B 89 ? ALA B 87 ARG B 89 M 1 THR B 201 ? TRP B 202 ? THR B 201 TRP B 202 M 2 VAL B 193 ? ASN B 195 ? VAL B 193 ASN B 195 M 3 LEU B 261 ? PRO B 263 ? LEU B 261 PRO B 263 N 1 VAL B 241 ? TRP B 243 ? VAL B 241 TRP B 243 N 2 PRO B 255 ? LEU B 257 ? PRO B 255 LEU B 257 O 1 LEU B 321 ? MET B 322 ? LEU B 321 MET B 322 O 2 ALA B 464 ? LEU B 465 ? ALA B 464 LEU B 465 P 1 LEU B 376 ? LEU B 378 ? LEU B 376 LEU B 378 P 2 THR B 344 ? ARG B 350 ? THR B 344 ARG B 350 P 3 VAL B 403 ? THR B 410 ? VAL B 403 THR B 410 P 4 SER B 432 ? ASN B 436 ? SER B 432 ASN B 436 Q 1 HIS B 500 ? TRP B 503 ? HIS B 500 TRP B 503 Q 2 ARG B 486 ? GLY B 495 ? ARG B 486 GLY B 495 Q 3 GLU B 507 ? GLN B 509 ? GLU B 507 GLN B 509 R 1 HIS B 500 ? TRP B 503 ? HIS B 500 TRP B 503 R 2 ARG B 486 ? GLY B 495 ? ARG B 486 GLY B 495 R 3 LEU B 473 ? ALA B 479 ? LEU B 473 ALA B 479 R 4 ARG B 540 ? ASP B 546 ? ARG B 540 ASP B 546 R 5 ALA B 567 ? ARG B 574 ? ALA B 567 ARG B 574 R 6 LEU B 617 ? ALA B 623 ? LEU B 617 ALA B 623 R 7 THR B 600 ? LEU B 603 ? THR B 600 LEU B 603 R 8 TYR B 593 ? PRO B 595 ? TYR B 593 PRO B 595 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 N ALA A 140 ? N ALA A 140 O VAL A 147 ? O VAL A 147 A 2 3 N TRP A 156 ? N TRP A 156 O LEU A 164 ? O LEU A 164 A 3 4 O LEU A 165 ? O LEU A 165 N PHE A 14 ? N PHE A 14 A 4 5 N VAL A 9 ? N VAL A 9 O ALA A 311 ? O ALA A 311 B 1 2 N ALA A 140 ? N ALA A 140 O VAL A 147 ? O VAL A 147 B 2 3 N TRP A 156 ? N TRP A 156 O LEU A 164 ? O LEU A 164 B 3 4 O LEU A 165 ? O LEU A 165 N PHE A 14 ? N PHE A 14 B 4 5 N PHE A 10 ? N PHE A 10 O TYR A 582 ? O TYR A 582 C 1 2 N MET A 60 ? N MET A 60 O GLY A 63 ? O GLY A 63 C 2 3 O SER A 66 ? O SER A 66 N TRP A 27 ? N TRP A 27 C 3 4 N ARG A 28 ? N ARG A 28 O LYS A 93 ? O LYS A 93 C 4 5 O TYR A 88 ? O TYR A 88 N GLY A 77 ? N GLY A 77 D 1 2 O TRP A 202 ? O TRP A 202 N VAL A 193 ? N VAL A 193 D 2 3 N ARG A 194 ? N ARG A 194 O VAL A 262 ? O VAL A 262 E 1 2 N MET A 322 ? N MET A 322 O ALA A 464 ? O ALA A 464 F 1 2 O ARG A 377 ? O ARG A 377 N THR A 344 ? N THR A 344 F 2 3 N ALA A 347 ? N ALA A 347 O LEU A 407 ? O LEU A 407 F 3 4 N VAL A 408 ? N VAL A 408 O LEU A 435 ? O LEU A 435 G 1 2 O LEU A 502 ? O LEU A 502 N ALA A 493 ? N ALA A 493 G 2 3 N ARG A 486 ? N ARG A 486 O GLN A 509 ? O GLN A 509 H 1 2 O LEU A 502 ? O LEU A 502 N ALA A 493 ? N ALA A 493 H 2 3 O ALA A 490 ? O ALA A 490 N ASP A 478 ? N ASP A 478 H 3 4 N LEU A 473 ? N LEU A 473 O LEU A 542 ? O LEU A 542 H 4 5 N LEU A 543 ? N LEU A 543 O ASP A 569 ? O ASP A 569 H 5 6 N ARG A 574 ? N ARG A 574 O LYS A 618 ? O LYS A 618 H 6 7 O LEU A 617 ? O LEU A 617 N LEU A 603 ? N LEU A 603 I 1 2 N ALA B 140 ? N ALA B 140 O VAL B 147 ? O VAL B 147 I 2 3 N TRP B 156 ? N TRP B 156 O LEU B 164 ? O LEU B 164 I 3 4 O PHE B 163 ? O PHE B 163 N LEU B 16 ? N LEU B 16 I 4 5 N THR B 7 ? N THR B 7 O ALA B 313 ? O ALA B 313 J 1 2 O LEU B 174 ? O LEU B 174 N ARG B 146 ? N ARG B 146 J 2 3 N TRP B 156 ? N TRP B 156 O LEU B 164 ? O LEU B 164 J 3 4 O PHE B 163 ? O PHE B 163 N LEU B 16 ? N LEU B 16 J 4 5 N PHE B 10 ? N PHE B 10 O TYR B 582 ? O TYR B 582 K 1 2 N MET B 60 ? N MET B 60 O GLY B 63 ? O GLY B 63 K 2 3 O LEU B 64 ? O LEU B 64 N LEU B 29 ? N LEU B 29 K 3 4 N ARG B 28 ? N ARG B 28 O GLY B 94 ? O GLY B 94 L 1 2 N GLY B 77 ? N GLY B 77 O TYR B 88 ? O TYR B 88 M 1 2 O TRP B 202 ? O TRP B 202 N VAL B 193 ? N VAL B 193 M 2 3 N ARG B 194 ? N ARG B 194 O VAL B 262 ? O VAL B 262 N 1 2 N ALA B 242 ? N ALA B 242 O HIS B 256 ? O HIS B 256 O 1 2 N MET B 322 ? N MET B 322 O ALA B 464 ? O ALA B 464 P 1 2 O ARG B 377 ? O ARG B 377 N LEU B 346 ? N LEU B 346 P 2 3 N ALA B 347 ? N ALA B 347 O LEU B 407 ? O LEU B 407 P 3 4 N VAL B 408 ? N VAL B 408 O GLN B 433 ? O GLN B 433 Q 1 2 O LEU B 502 ? O LEU B 502 N ALA B 493 ? N ALA B 493 Q 2 3 N ARG B 486 ? N ARG B 486 O GLN B 509 ? O GLN B 509 R 1 2 O LEU B 502 ? O LEU B 502 N ALA B 493 ? N ALA B 493 R 2 3 O ALA B 490 ? O ALA B 490 N ASP B 478 ? N ASP B 478 R 3 4 N LEU B 473 ? N LEU B 473 O LEU B 542 ? O LEU B 542 R 4 5 N LEU B 543 ? N LEU B 543 O ASP B 569 ? O ASP B 569 R 5 6 N LEU B 570 ? N LEU B 570 O ALA B 623 ? O ALA B 623 R 6 7 O LEU B 619 ? O LEU B 619 N PHE B 601 ? N PHE B 601 R 7 8 O LEU B 602 ? O LEU B 602 N VAL B 594 ? N VAL B 594 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A MG 686 ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 686' AC2 Software B MG 686 ? 3 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG B 686' AC3 Software A MG 687 ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 687' AC4 Software A MG 688 ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 688' AC5 Software B MG 687 ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG B 687' AC6 Software B MG 688 ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG B 688' AC7 Software B PO4 689 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE PO4 B 689' AC8 Software A PO4 689 ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE PO4 A 689' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 4 GLN A 433 ? GLN A 433 . ? 1_555 ? 2 AC1 4 VAL A 685 ? VAL A 685 . ? 1_555 ? 3 AC1 4 DT C 1 ? DT C 1 . ? 1_555 ? 4 AC1 4 DA C 3 ? DA C 3 . ? 1_555 ? 5 AC2 3 VAL B 685 ? VAL B 685 . ? 1_555 ? 6 AC2 3 DT D 1 ? DT M 1 . ? 1_555 ? 7 AC2 3 DA D 3 ? DA M 3 . ? 1_555 ? 8 AC3 4 ASP A 478 ? ASP A 478 . ? 1_555 ? 9 AC3 4 ASP A 546 ? ASP A 546 . ? 1_555 ? 10 AC3 4 C E 9 ? C D 9 . ? 1_555 ? 11 AC3 4 U E 10 ? U D 10 . ? 1_555 ? 12 AC4 5 ASP A 478 ? ASP A 478 . ? 1_555 ? 13 AC4 5 ASP A 546 ? ASP A 546 . ? 1_555 ? 14 AC4 5 LYS A 575 ? LYS A 575 . ? 1_555 ? 15 AC4 5 ASP A 660 ? ASP A 660 . ? 1_555 ? 16 AC4 5 U E 10 ? U D 10 . ? 1_555 ? 17 AC5 4 ASP B 478 ? ASP B 478 . ? 1_555 ? 18 AC5 4 ASP B 546 ? ASP B 546 . ? 1_555 ? 19 AC5 4 C F 9 ? C N 9 . ? 1_555 ? 20 AC5 4 U F 10 ? U N 10 . ? 1_555 ? 21 AC6 5 ASP B 478 ? ASP B 478 . ? 1_555 ? 22 AC6 5 ASP B 546 ? ASP B 546 . ? 1_555 ? 23 AC6 5 ASP B 660 ? ASP B 660 . ? 1_555 ? 24 AC6 5 LYS B 664 ? LYS B 664 . ? 1_555 ? 25 AC6 5 U F 10 ? 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Adams' PDAdams@lbl.gov refinement http://www.phenix-online.org/ C++ ? 2 PDB_EXTRACT 3.005 'June 11, 2008' package PDB help@deposit.rcsb.org 'data extraction' http://sw-tools.pdb.org/apps/PDB_EXTRACT/ C++ ? 3 HKL-2000 . ? ? ? ? 'data collection' ? ? ? 4 HKL-2000 . ? ? ? ? 'data reduction' ? ? ? 5 HKL-2000 . ? ? ? ? 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N 70 ARG CZ NH1 sing N N 71 ARG CZ NH2 doub N N 72 ARG NH1 HH11 sing N N 73 ARG NH1 HH12 sing N N 74 ARG NH2 HH21 sing N N 75 ARG NH2 HH22 sing N N 76 ARG OXT HXT sing N N 77 ASN N CA sing N N 78 ASN N H sing N N 79 ASN N H2 sing N N 80 ASN CA C sing N N 81 ASN CA CB sing N N 82 ASN CA HA sing N N 83 ASN C O doub N N 84 ASN C OXT sing N N 85 ASN CB CG sing N N 86 ASN CB HB2 sing N N 87 ASN CB HB3 sing N N 88 ASN CG OD1 doub N N 89 ASN CG ND2 sing N N 90 ASN ND2 HD21 sing N N 91 ASN ND2 HD22 sing N N 92 ASN OXT HXT sing N N 93 ASP N CA sing N N 94 ASP N H sing N N 95 ASP N H2 sing N N 96 ASP CA C sing N N 97 ASP CA CB sing N N 98 ASP CA HA sing N N 99 ASP C O doub N N 100 ASP C OXT sing N N 101 ASP CB CG sing N N 102 ASP CB HB2 sing N N 103 ASP CB HB3 sing N N 104 ASP CG OD1 doub N N 105 ASP CG OD2 sing N N 106 ASP OD2 HD2 sing N N 107 ASP OXT HXT sing N N 108 C OP3 P sing N N 109 C OP3 HOP3 sing N N 110 C P OP1 doub N N 111 C P OP2 sing N N 112 C P "O5'" sing N N 113 C OP2 HOP2 sing N 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N N 236 DT P OP1 doub N N 237 DT P OP2 sing N N 238 DT P "O5'" sing N N 239 DT OP2 HOP2 sing N N 240 DT "O5'" "C5'" sing N N 241 DT "C5'" "C4'" sing N N 242 DT "C5'" "H5'" sing N N 243 DT "C5'" "H5''" sing N N 244 DT "C4'" "O4'" sing N N 245 DT "C4'" "C3'" sing N N 246 DT "C4'" "H4'" sing N N 247 DT "O4'" "C1'" sing N N 248 DT "C3'" "O3'" sing N N 249 DT "C3'" "C2'" sing N N 250 DT "C3'" "H3'" sing N N 251 DT "O3'" "HO3'" sing N N 252 DT "C2'" "C1'" sing N N 253 DT "C2'" "H2'" sing N N 254 DT "C2'" "H2''" sing N N 255 DT "C1'" N1 sing N N 256 DT "C1'" "H1'" sing N N 257 DT N1 C2 sing N N 258 DT N1 C6 sing N N 259 DT C2 O2 doub N N 260 DT C2 N3 sing N N 261 DT N3 C4 sing N N 262 DT N3 H3 sing N N 263 DT C4 O4 doub N N 264 DT C4 C5 sing N N 265 DT C5 C7 sing N N 266 DT C5 C6 doub N N 267 DT C7 H71 sing N N 268 DT C7 H72 sing N N 269 DT C7 H73 sing N N 270 DT C6 H6 sing N N 271 G OP3 P sing N N 272 G OP3 HOP3 sing N N 273 G P OP1 doub N N 274 G P OP2 sing N N 275 G P "O5'" sing N N 276 G 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N 614 U C2 O2 doub N N 615 U C2 N3 sing N N 616 U N3 C4 sing N N 617 U N3 H3 sing N N 618 U C4 O4 doub N N 619 U C4 C5 sing N N 620 U C5 C6 doub N N 621 U C5 H5 sing N N 622 U C6 H6 sing N N 623 VAL N CA sing N N 624 VAL N H sing N N 625 VAL N H2 sing N N 626 VAL CA C sing N N 627 VAL CA CB sing N N 628 VAL CA HA sing N N 629 VAL C O doub N N 630 VAL C OXT sing N N 631 VAL CB CG1 sing N N 632 VAL CB CG2 sing N N 633 VAL CB HB sing N N 634 VAL CG1 HG11 sing N N 635 VAL CG1 HG12 sing N N 636 VAL CG1 HG13 sing N N 637 VAL CG2 HG21 sing N N 638 VAL CG2 HG22 sing N N 639 VAL CG2 HG23 sing N N 640 VAL OXT HXT sing N N 641 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 3HVR 'double helix' 3HVR 'a-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id 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