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? -56.93 -70.74 264 1 LEU C 67 ? ? -95.53 -96.00 265 1 GLN C 76 ? ? -34.92 127.83 266 1 THR C 77 ? ? 55.28 72.08 267 1 GLU C 94 ? ? -68.93 5.12 268 1 LEU C 98 ? ? -106.75 63.00 269 1 HIS C 100 ? ? -169.97 108.88 270 1 TYR C 102 ? ? -104.33 -129.19 271 1 GLU C 115 ? ? -92.47 50.11 272 1 GLU C 117 ? ? -164.32 -8.03 273 1 LEU C 127 ? ? -87.00 34.04 274 1 VAL C 129 ? ? -25.61 134.36 275 1 GLN C 140 ? ? -68.87 13.04 276 1 SER C 144 ? ? 71.51 39.79 277 1 GLU C 146 ? ? 168.42 9.99 278 1 SER C 150 ? ? -172.32 -143.07 279 1 SER C 156 ? ? -81.44 -91.80 280 1 ASN C 157 ? ? 76.20 30.49 281 1 THR C 162 ? ? -63.10 -81.45 282 1 LEU C 163 ? ? -43.91 -18.04 283 1 SER C 165 ? ? -24.54 -79.90 284 1 LEU C 166 ? ? 72.92 108.15 285 1 ASP C 177 ? ? 73.07 76.27 286 1 ARG C 199 ? ? -148.58 28.28 287 1 THR C 200 ? ? -150.62 26.13 288 1 LYS C 201 ? ? -174.40 42.00 289 1 THR C 215 ? ? -47.90 -16.85 290 1 ILE C 226 ? ? -66.73 -77.57 291 1 ASN C 228 ? ? -163.78 10.06 292 1 VAL C 230 ? ? -37.59 149.55 293 1 ASP C 236 ? ? 71.86 33.58 294 1 ALA C 249 ? ? 60.07 -169.66 295 1 ILE C 268 ? ? -59.45 -1.31 296 1 GLN C 270 ? ? -64.08 2.63 297 1 ALA C 271 ? ? 73.06 43.46 298 1 ALA C 293 ? ? 88.43 38.19 299 1 ILE C 294 ? ? 99.79 144.56 300 1 LYS C 322 ? ? -89.47 48.62 301 1 TYR C 323 ? ? -159.43 -44.08 302 1 ASP C 327 ? ? 87.27 169.61 303 1 ALA C 329 ? ? -154.99 19.47 304 1 ARG C 333 ? ? -170.07 -95.74 305 1 GLN C 335 ? ? -173.19 139.17 306 1 HIS C 362 ? ? -6.49 158.12 307 1 ARG C 363 ? ? 102.96 -29.93 308 1 ILE C 366 ? ? 93.68 141.35 309 1 VAL C 375 ? ? -55.99 -76.91 310 1 ILE C 382 ? ? 63.63 98.23 311 1 SER C 383 ? ? -177.81 -127.74 312 1 ALA C 391 ? ? -40.04 -79.48 313 1 SER C 400 ? ? -166.01 -46.10 314 1 THR C 408 ? ? -162.11 -7.30 315 1 PRO C 411 ? ? -12.59 -68.05 316 1 ASN C 412 ? ? -167.71 42.63 317 1 LEU C 413 ? ? -65.65 15.05 318 1 GLU C 422 ? ? -38.11 -37.20 319 1 VAL C 423 ? ? -64.91 -70.56 320 1 LYS C 425 ? ? -40.86 -70.97 321 1 GLN C 434 ? ? 61.12 80.31 322 1 PHE C 436 ? ? -62.98 -76.32 323 1 ALA C 440 ? ? -25.14 -62.90 324 1 VAL C 453 ? ? -56.87 -71.06 325 1 TRP C 460 ? ? -95.77 39.55 326 1 ASN C 468 ? ? -49.86 23.49 327 1 GLU C 470 ? ? -177.07 -48.86 328 1 VAL C 471 ? ? 22.56 80.72 329 1 THR C 472 ? ? -103.48 -167.27 330 1 GLN C 493 ? ? -25.15 -88.58 331 1 THR C 494 ? ? -89.05 34.41 332 1 ILE C 511 ? ? -95.32 34.42 333 1 ASP C 533 ? ? 36.29 64.27 334 1 PRO C 546 ? ? -104.32 -165.68 335 1 VAL C 549 ? ? -149.74 25.30 336 1 LYS C 551 ? ? -57.89 -70.04 337 1 ASP C 565 ? ? 75.05 146.79 338 1 ARG C 571 ? ? -173.83 110.07 339 1 MET C 578 ? ? -99.99 46.87 340 1 LYS C 580 ? ? 154.89 17.17 341 1 SER C 582 ? ? -140.48 -17.36 342 1 SER C 584 ? ? -154.90 -7.30 343 1 LEU C 586 ? ? 66.51 126.05 344 1 SER C 589 ? ? 14.43 77.25 345 1 ALA C 618 ? ? 36.63 66.19 346 1 GLU C 620 ? ? 34.16 -118.28 347 1 SER C 642 ? ? 82.67 -52.92 348 1 LYS C 643 ? ? -167.87 6.21 349 1 ASN C 659 ? ? 174.35 133.95 350 1 VAL C 660 ? ? -166.43 11.43 351 1 ALA C 662 ? ? -21.23 -49.19 352 1 ASN C 668 ? ? 32.88 -147.86 353 1 LYS C 669 ? ? 158.53 20.60 354 1 PHE C 673 ? ? -167.18 5.54 355 1 ASN C 674 ? ? 161.49 163.88 356 1 ASP C 687 ? ? -132.44 -46.43 357 1 MET C 690 ? ? -58.65 -3.92 358 1 ARG C 704 ? ? -106.90 52.54 359 1 HIS C 712 ? ? -113.11 -164.95 360 1 LYS C 716 ? ? -146.29 -10.49 361 1 ASP C 738 ? ? 104.78 119.51 362 1 LEU C 739 ? ? 139.51 142.59 363 1 TYR C 760 ? ? -173.96 112.57 364 1 ALA C 762 ? ? 85.78 -42.03 365 1 PRO C 764 ? ? -58.54 -4.87 366 1 VAL C 773 ? ? -110.34 -72.07 367 1 THR C 806 ? ? -146.08 11.95 368 1 ILE D 68 ? ? -129.40 -88.43 369 1 ARG D 70 ? ? 160.54 84.03 370 1 GLN D 76 ? ? -22.33 116.19 371 1 THR D 77 ? ? 59.45 75.14 372 1 GLU D 94 ? ? -69.67 3.50 373 1 GLU D 115 ? ? -90.72 50.41 374 1 LEU D 127 ? ? -87.14 32.78 375 1 GLN D 140 ? ? -68.78 13.33 376 1 LEU D 141 ? ? -122.27 -94.33 377 1 SER D 144 ? ? -152.18 38.99 378 1 THR D 147 ? ? -29.24 134.88 379 1 ALA D 152 ? ? 48.24 -157.19 380 1 THR D 154 ? ? -119.60 -75.32 381 1 ASN D 155 ? ? 176.61 -166.18 382 1 SER D 156 ? ? 79.60 157.28 383 1 ASN D 157 ? ? -147.88 -27.43 384 1 THR D 160 ? ? -49.44 -71.17 385 1 THR D 162 ? ? -64.32 -82.91 386 1 LEU D 163 ? ? -44.82 -16.05 387 1 SER D 165 ? ? -24.91 -81.99 388 1 LEU D 166 ? ? 68.89 119.39 389 1 ASP D 177 ? ? 64.67 60.03 390 1 VAL D 182 ? ? -96.61 -61.73 391 1 ARG D 199 ? ? -153.16 27.43 392 1 THR D 200 ? ? -150.29 32.58 393 1 LYS D 201 ? ? -174.78 27.16 394 1 ASN D 202 ? ? -29.89 -40.82 395 1 VAL D 212 ? ? -135.29 -31.68 396 1 THR D 215 ? ? -47.39 -16.48 397 1 ILE D 226 ? ? -68.31 -78.71 398 1 ASN D 228 ? ? -150.76 -18.26 399 1 PRO D 231 ? ? -53.03 172.92 400 1 ILE D 268 ? ? -59.64 -2.36 401 1 GLN D 270 ? ? -66.83 1.90 402 1 ALA D 271 ? ? 1.84 112.44 403 1 ILE D 294 ? ? 90.06 111.88 404 1 THR D 315 ? ? -104.34 -138.21 405 1 LYS D 322 ? ? -90.55 47.30 406 1 TYR D 323 ? ? -159.09 -41.66 407 1 ASP D 327 ? ? 73.67 156.23 408 1 ALA D 329 ? ? -146.88 22.80 409 1 ARG D 333 ? ? -110.27 -99.79 410 1 GLN D 335 ? ? -173.06 139.26 411 1 ALA D 360 ? ? -86.57 43.77 412 1 HIS D 361 ? ? -151.80 -17.69 413 1 ARG D 363 ? ? -166.89 4.68 414 1 VAL D 364 ? ? -164.63 66.64 415 1 SER D 365 ? ? 13.33 127.98 416 1 ILE D 366 ? ? 65.61 155.02 417 1 VAL D 375 ? ? -54.71 -76.10 418 1 ILE D 382 ? ? 60.68 70.77 419 1 ASP D 384 ? ? -162.56 7.14 420 1 ARG D 385 ? ? -136.97 -151.03 421 1 LEU D 387 ? ? -36.76 -34.90 422 1 ALA D 391 ? ? -39.47 -77.65 423 1 SER D 400 ? ? -164.99 -45.92 424 1 THR D 409 ? ? -160.92 101.14 425 1 PRO D 410 ? ? -28.55 122.56 426 1 PRO D 411 ? ? -17.85 101.84 427 1 ASN D 412 ? ? -60.22 60.00 428 1 LEU D 413 ? ? -65.54 20.06 429 1 GLU D 422 ? ? -38.97 -37.69 430 1 ARG D 424 ? ? -29.93 -61.77 431 1 LYS D 425 ? ? -42.72 -71.59 432 1 GLN D 434 ? ? 66.87 80.02 433 1 PHE D 436 ? ? -63.23 -74.52 434 1 ALA D 440 ? ? -26.17 -64.17 435 1 TRP D 460 ? ? -93.17 37.76 436 1 ASN D 468 ? ? -43.40 25.98 437 1 GLU D 470 ? ? 172.59 109.85 438 1 VAL D 471 ? ? -150.25 40.37 439 1 VAL D 473 ? ? -10.50 -76.78 440 1 GLN D 493 ? ? -25.10 -83.08 441 1 THR D 494 ? ? -85.19 34.78 442 1 ARG D 509 ? ? -144.88 30.28 443 1 ILE D 511 ? ? -87.21 44.60 444 1 LYS D 532 ? ? 148.45 42.65 445 1 ASP D 533 ? ? 75.66 83.84 446 1 LYS D 551 ? ? -58.91 -70.63 447 1 ARG D 571 ? ? -174.35 109.74 448 1 GLU D 579 ? ? 74.20 40.15 449 1 HIS D 581 ? ? -146.92 48.73 450 1 SER D 582 ? ? 179.82 31.36 451 1 SER D 584 ? ? -164.39 4.47 452 1 PRO D 610 ? ? -105.56 41.27 453 1 TYR D 611 ? ? -154.34 33.26 454 1 ALA D 618 ? ? 31.21 92.49 455 1 PHE D 649 ? ? -107.57 60.74 456 1 ARG D 650 ? ? -95.00 -64.87 457 1 ALA D 662 ? ? -21.62 -49.66 458 1 LYS D 669 ? ? -100.70 77.16 459 1 PHE D 673 ? ? 169.09 -50.15 460 1 ASN D 674 ? ? -157.34 -134.72 461 1 VAL D 675 ? ? -155.88 -12.68 462 1 ASP D 687 ? ? -134.34 -50.66 463 1 MET D 690 ? ? -55.38 -2.13 464 1 ARG D 698 ? ? -24.35 110.51 465 1 ARG D 704 ? ? -96.21 59.31 466 1 HIS D 712 ? ? -58.17 -145.28 467 1 SER D 713 ? ? -149.73 -19.19 468 1 LEU D 714 ? ? 159.94 157.35 469 1 GLU D 715 ? ? -152.22 5.04 470 1 LYS D 716 ? ? 61.11 76.10 471 1 LYS D 717 ? ? 125.55 -55.31 472 1 ASP D 738 ? ? 82.86 59.83 473 1 VAL D 756 ? ? -66.25 -88.47 474 1 ASP D 757 ? ? 102.16 139.59 475 1 GLU D 759 ? ? -147.28 10.18 476 1 ALA D 762 ? ? -155.80 37.61 477 1 PRO D 764 ? ? -58.93 -5.16 478 1 VAL D 773 ? ? -111.23 -70.35 479 1 LYS D 788 ? ? 22.59 84.13 480 1 THR D 806 ? ? -141.16 -19.45 481 1 ALA E 10 ? ? -56.84 -71.00 482 1 LEU E 67 ? ? -100.46 -68.84 483 1 GLN E 76 ? ? -37.56 126.75 484 1 GLU E 94 ? ? -69.88 3.99 485 1 GLU E 115 ? ? -91.22 50.08 486 1 LEU E 127 ? ? -87.48 33.22 487 1 VAL E 129 ? ? 2.42 111.57 488 1 GLN E 140 ? ? -68.77 13.48 489 1 ASN E 157 ? ? -155.90 16.91 490 1 ASN E 159 ? ? -49.75 -15.19 491 1 THR E 160 ? ? -45.47 -70.28 492 1 THR E 162 ? ? -63.08 -80.65 493 1 LEU E 163 ? ? -44.20 -17.67 494 1 SER E 165 ? ? -23.61 -80.25 495 1 LEU E 166 ? ? 68.15 100.80 496 1 ALA E 167 ? ? -152.12 -154.58 497 1 ASP E 169 ? ? 67.33 119.52 498 1 SER E 178 ? ? -161.25 18.11 499 1 VAL E 195 ? ? -59.31 -2.94 500 1 SER E 197 ? ? -147.92 38.96 501 1 ARG E 199 ? ? -144.10 27.36 502 1 THR E 200 ? ? -145.40 -20.49 503 1 VAL E 212 ? ? -137.54 -30.10 504 1 THR E 215 ? ? -48.20 -17.57 505 1 ILE E 226 ? ? -69.19 -78.83 506 1 ASN E 228 ? ? -162.56 22.89 507 1 ILE E 268 ? ? -56.81 -0.83 508 1 GLN E 270 ? ? -66.18 3.28 509 1 ALA E 271 ? ? -26.54 130.61 510 1 ALA E 293 ? ? 61.97 -87.74 511 1 THR E 315 ? ? -120.97 -141.85 512 1 LYS E 322 ? ? -90.29 46.97 513 1 TYR E 323 ? ? -160.43 -43.45 514 1 ALA E 329 ? ? 162.84 -105.34 515 1 ARG E 333 ? ? -155.09 -83.09 516 1 GLN E 335 ? ? -171.54 139.18 517 1 ASP E 356 ? ? -49.57 -15.87 518 1 TYR E 358 ? ? -91.83 31.20 519 1 VAL E 364 ? ? -32.61 127.29 520 1 SER E 365 ? ? 20.42 96.76 521 1 ILE E 366 ? ? 53.71 -171.37 522 1 VAL E 375 ? ? -55.38 -79.44 523 1 ILE E 382 ? ? 30.46 74.42 524 1 SER E 383 ? ? 79.44 -15.06 525 1 ARG E 385 ? ? -100.93 -168.34 526 1 ALA E 391 ? ? -39.12 -79.82 527 1 SER E 400 ? ? -164.74 -48.25 528 1 THR E 408 ? ? -179.31 -52.02 529 1 PRO E 410 ? ? -97.67 -140.61 530 1 LEU E 413 ? ? -64.57 20.11 531 1 GLU E 422 ? ? -38.55 -37.11 532 1 LYS E 425 ? ? -41.41 -70.93 533 1 GLN E 434 ? ? 60.58 77.35 534 1 PHE E 436 ? ? -63.20 -75.53 535 1 ALA E 440 ? ? -24.27 -63.34 536 1 TRP E 460 ? ? -93.25 41.93 537 1 ASN E 468 ? ? -45.11 26.48 538 1 SER E 469 ? ? -162.32 2.39 539 1 VAL E 471 ? ? -157.90 25.25 540 1 THR E 472 ? ? -32.01 156.33 541 1 VAL E 473 ? ? -12.58 -74.82 542 1 GLN E 493 ? ? -25.62 -84.99 543 1 THR E 494 ? ? -87.93 33.40 544 1 GLN E 513 ? ? 60.71 68.60 545 1 LYS E 532 ? ? -86.18 -89.69 546 1 ASP E 533 ? ? -157.66 75.50 547 1 LYS E 551 ? ? -58.80 -71.98 548 1 SER E 568 ? ? -91.91 58.54 549 1 ARG E 571 ? ? -174.99 110.20 550 1 TYR E 577 ? ? -117.87 52.74 551 1 LYS E 580 ? ? -173.29 -1.94 552 1 SER E 582 ? ? -52.30 179.65 553 1 THR E 583 ? ? -62.37 8.92 554 1 SER E 584 ? ? -156.83 7.17 555 1 LEU E 586 ? ? -177.28 132.74 556 1 VAL E 587 ? ? 47.23 -178.73 557 1 SER E 589 ? ? 72.92 148.65 558 1 ALA E 618 ? ? 35.10 103.92 559 1 ILE E 619 ? ? -146.69 19.67 560 1 LYS E 621 ? ? -142.32 13.83 561 1 HIS E 623 ? ? 170.98 118.86 562 1 LYS E 643 ? ? 85.14 -63.05 563 1 SER E 658 ? 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(2008) Flexible fitting of atomic structures into electron microscopy maps using molecular dynamics. ; _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 3PXI _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name PDB _em_3d_fitting_list.type 'experimental model' _em_3d_fitting_list.accession_code 3PXI # _em_3d_reconstruction.entry_id 3J3R _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.5 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'Reference Projections' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.resolution 9.4 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details 'Single particle--Applied symmetry: C6' _em_3d_reconstruction.num_particles 26037 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '50mM kCl, 10mM Tris-HCL, 2mM MgCl2, 2mM ADP' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.details '50mM kCl, 10mM Tris-HCL, 2mM MgCl2, 2mM ADP' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'MecA-ClpC (E280A, E618A) with ADP' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details hexamer _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.entry_id 3J3R _em_imaging.id 1 _em_imaging.date 2010-09-09 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.temperature ? _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.nominal_defocus_min 1500 _em_imaging.nominal_defocus_max 4000 _em_imaging.tilt_angle_min 0.0 _em_imaging.tilt_angle_max 0.0 _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 59000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.detector_distance 0.0 _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.citation_id ? # _em_vitrification.entry_id 3J3R _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.details ? _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.temp 90 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.method 'Blot for 2 seconds before plunging' _em_vitrification.time_resolved_state ? _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.specimen_id 1 # _em_experiment.entry_id 3J3R _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 3J3R _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 1 MET 1 ? 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