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PDB 3JBH pdb_00003jbh 10.2210/pdb3jbh/pdb WWPDB D_1000160491 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2016-03-09 2 'Structure model' 1 1 2016-12-14 3 'Structure model' 1 2 2018-07-18 4 'Structure model' 1 3 2024-02-21 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' 'Author supporting evidence' 3 3 'Structure model' 'Data collection' 4 4 'Structure model' 'Data collection' 5 4 'Structure model' 'Database references' 6 4 'Structure model' 'Derived calculations' 7 4 'Structure model' 'Refinement description' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 3 'Structure model' em_single_particle_entity 2 3 'Structure model' em_software 3 4 'Structure model' chem_comp_atom 4 4 'Structure model' chem_comp_bond 5 4 'Structure model' database_2 6 4 'Structure model' em_3d_fitting_list 7 4 'Structure model' pdbx_initial_refinement_model 8 4 'Structure model' pdbx_struct_oper_list # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 3 'Structure model' '_em_software.image_processing_id' 2 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 3 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 4 4 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.accession_code' 5 4 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id' 6 4 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.source_name' 7 4 'Structure model' '_em_3d_fitting_list.type' 8 4 'Structure model' '_pdbx_struct_oper_list.name' 9 4 'Structure model' '_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation' 10 4 'Structure model' '_pdbx_struct_oper_list.type' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 3JBH _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2015-09-01 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type _pdbx_database_related.details EMDB EMD-1950 'associated EM volume' '3D-STRUCTURE OF TARANTULA MYOSIN FILAMENT OBTAINED BY CRYO-ELECTRON MICROSCOPY' PDB 3DTP unspecified ;TARANTULA HEAVY MEROMYOSIN HYBRID OBTAINED BY HOMOLOGY MODELING OF SEQUENCES FROM DIFFERENT SOURCES AND FLEXIBLE DOCKING TO TARANTULA MUSCLE THICK FILAMENT CRYO-EM 3D-MAP ; # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Alamo, L.' 1 'Qi, D.' 2 'Wriggers, W.' 3 'Pinto, A.' 4 'Zhu, J.' 5 'Bilbao, A.' 6 'Gillilan, R.E.' 7 'Hu, S.' 8 'Padron, R.' 9 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.journal_id_ASTM _citation.country _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_id_CSD _citation.book_publisher _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary ;Conserved Intramolecular Interactions Maintain Myosin Interacting-Heads Motifs Explaining Tarantula Muscle Super-Relaxed State Structural Basis. ; 'J. Mol. Biol.' 428 1142 1164 2016 JMOBAK UK 1089-8638 0070 ? 26851071 10.1016/j.jmb.2016.01.027 1 'Three-dimensional reconstruction of tarantula myosin filaments suggests how phosphorylation may regulate myosin activity.' J.Mol.Biol. 384 780 797 2008 JMOBAK UK 0022-2836 0070 ? 18951904 10.1016/j.jmb.2008.10.013 2 'Analysis of tarantula skeletal muscle protein sequences and identification of transcriptional isoforms.' 'BMC Genomics' 10 117 117 2009 ? UK 1471-2164 ? ? 19298669 10.1186/1471-2164-10-117 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Alamo, L.' 1 ? primary 'Qi, D.' 2 ? primary 'Wriggers, W.' 3 ? primary 'Pinto, A.' 4 ? primary 'Zhu, J.' 5 ? primary 'Bilbao, A.' 6 ? primary 'Gillilan, R.E.' 7 ? primary 'Hu, S.' 8 ? primary 'Padron, R.' 9 ? 1 'Alamo, L.' 10 ? 1 'Wriggers, W.' 11 ? 1 'Pinto, A.' 12 ? 1 'Bartoli, F.' 13 ? 1 'Salazar, L.' 14 ? 1 'Zhao, F.Q.' 15 ? 1 'Craig, R.' 16 ? 1 'Padron, R.' 17 ? 2 'Zhu, J.' 18 ? 2 'Sun, Y.' 19 ? 2 'Zhao, F.Q.' 20 ? 2 'Yu, J.' 21 ? 2 'Craig, R.' 22 ? 2 'Hu, S.' 23 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'MYOSIN 2 HEAVY CHAIN STRIATED MUSCLE' 224542.281 4 ? ? 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143 143 143 LYS LYS L . n L 3 144 GLU 144 144 144 GLU GLU L . n L 3 145 GLU 145 145 145 GLU GLU L . n L 3 146 THR 146 146 146 THR THR L . n L 3 147 LEU 147 147 147 LEU LEU L . n L 3 148 LYS 148 148 148 LYS LYS L . n L 3 149 ARG 149 149 149 ARG ARG L . n L 3 150 SER 150 150 150 SER SER L . n L 3 151 LEU 151 151 151 LEU LEU L . n L 3 152 THR 152 152 152 THR THR L . n L 3 153 THR 153 153 153 THR THR L . n L 3 154 TRP 154 154 154 TRP TRP L . n L 3 155 GLY 155 155 155 GLY GLY L . n L 3 156 GLU 156 156 156 GLU GLU L . n L 3 157 LYS 157 157 157 LYS LYS L . n L 3 158 PHE 158 158 158 PHE PHE L . n L 3 159 SER 159 159 159 SER SER L . n L 3 160 GLN 160 160 160 GLN GLN L . n L 3 161 ASP 161 161 161 ASP ASP L . n L 3 162 GLU 162 162 162 GLU GLU L . n L 3 163 VAL 163 163 163 VAL VAL L . n L 3 164 GLU 164 164 164 GLU GLU L . n L 3 165 GLU 165 165 165 GLU GLU L . n L 3 166 ALA 166 166 166 ALA ALA L . n L 3 167 LEU 167 167 167 LEU LEU L . n L 3 168 SER 168 168 168 SER SER L . n L 3 169 GLU 169 169 169 GLU GLU L . n L 3 170 ALA 170 170 170 ALA ALA L . n L 3 171 PRO 171 171 171 PRO PRO L . n L 3 172 ILE 172 172 172 ILE ILE L . n L 3 173 ASP 173 173 173 ASP ASP L . n L 3 174 GLY 174 174 174 GLY GLY L . n L 3 175 ASN 175 175 175 ASN ASN L . n L 3 176 GLY 176 176 176 GLY GLY L . n L 3 177 LEU 177 177 177 LEU LEU L . n L 3 178 ILE 178 178 178 ILE ILE L . n L 3 179 ASP 179 179 179 ASP ASP L . n L 3 180 ILE 180 180 180 ILE ILE L . n L 3 181 LYS 181 181 181 LYS LYS L . n L 3 182 LYS 182 182 182 LYS LYS L . n L 3 183 PHE 183 183 183 PHE PHE L . n L 3 184 ALA 184 184 184 ALA ALA L . n L 3 185 GLN 185 185 185 GLN GLN L . n L 3 186 ILE 186 186 186 ILE ILE L . n L 3 187 LEU 187 187 187 LEU LEU L . n L 3 188 THR 188 188 188 THR THR L . n L 3 189 LYS 189 189 189 LYS LYS L . n L 3 190 GLY 190 190 190 GLY GLY L . n L 3 191 ALA 191 191 191 ALA ALA L . n L 3 192 GLU 192 192 192 GLU GLU L . n L 3 193 GLU 193 193 193 GLU GLU L . n L 3 194 GLU 194 194 194 GLU GLU L . n L 3 195 GLY 195 195 195 GLY GLY L . n L 3 196 ALA 196 196 196 ALA ALA L . n # _cell.entry_id 3JBH _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1.000 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 1 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 3JBH _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? # _exptl.entry_id 3JBH _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.crystals_number ? # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp ? _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength . _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _refine_hist.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 41968 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 41968 _refine_hist.d_res_high . _refine_hist.d_res_low . # _database_PDB_matrix.entry_id 3JBH _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 3JBH _struct.title ;TWO HEAVY MEROMYOSIN INTERACTING-HEADS MOTIFS FLEXIBLE DOCKED INTO TARANTULA THICK FILAMENT 3D-MAP ALLOWS IN DEPTH STUDY OF INTRA- AND INTERMOLECULAR INTERACTIONS ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3JBH _struct_keywords.pdbx_keywords 'CONTRACTILE PROTEIN' _struct_keywords.text ;MYOSIN INTERACTING-HEADS MOTIF, CRYO-EM, THICK FILAMENT, FLEXIBLE DOCKING, SINGLE PARTICLE RECONSTRUCTION, ITERATIVE HELICAL REAL SPACE RECONSTRUCTION (IHRSR), INTER- AND INTRAMOLECULAR INTERACTIONS, MYOSIN REGULATION, SUPER-RELAXATION, STRIATED MUSCLE, TARANTULA, CONTRACTILE PROTEIN ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 3 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 PDB 3JBH 3JBH 1 ? ? ? 2 PDB 3JBH 3JBH 2 ? ? ? 3 PDB 3JBH 3JBH 3 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3JBH A 1 ? 1953 ? 3JBH 1 ? 1953 ? 1 1953 2 1 3JBH B 1 ? 1953 ? 3JBH 1 ? 1953 ? 1 1953 3 1 3JBH G 1 ? 1953 ? 3JBH 1 ? 1953 ? 1 1953 4 1 3JBH H 1 ? 1953 ? 3JBH 1 ? 1953 ? 1 1953 5 2 3JBH C 1 ? 156 ? 3JBH 1 ? 156 ? 1 156 6 2 3JBH D 1 ? 156 ? 3JBH 1 ? 156 ? 1 156 7 2 3JBH I 1 ? 156 ? 3JBH 1 ? 156 ? 1 156 8 2 3JBH J 1 ? 156 ? 3JBH 1 ? 156 ? 1 156 9 3 3JBH E 1 ? 196 ? 3JBH 1 ? 196 ? 1 196 10 3 3JBH F 1 ? 196 ? 3JBH 1 ? 196 ? 1 196 11 3 3JBH K 1 ? 196 ? 3JBH 1 ? 196 ? 1 196 12 3 3JBH L 1 ? 196 ? 3JBH 1 ? 196 ? 1 196 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'representative helical assembly' ? 240-meric 240 2 'helical asymmetric unit' ? dodecameric 12 3 'helical asymmetric unit, std helical frame' ? dodecameric 12 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-20)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 2 9 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 3 H A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] H 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 1 'helical symmetry operation' ? ? -0.50000000 0.86602500 -0.00000000 0.78613 -0.86602500 -0.50000000 -0.00000000 2.93387 -0.00000000 0.00000000 1.00000000 -580.00000 2 'helical symmetry operation' ? ? 0.86602500 0.50000000 -0.00000000 -0.45387 -0.50000000 0.86602500 -0.00000000 0.78613 -0.00000000 0.00000000 1.00000000 -580.00000 3 'helical symmetry operation' ? ? 0.50000000 -0.86602500 -0.00000000 1.69387 0.86602500 0.50000000 0.00000000 -0.45387 -0.00000000 -0.00000000 1.00000000 -580.00000 4 'helical symmetry operation' ? ? -0.86602500 -0.50000000 -0.00000000 2.93387 0.50000000 -0.86602500 0.00000000 1.69387 -0.00000000 -0.00000000 1.00000000 -580.00000 5 'helical symmetry operation' ? ? 0.50000000 0.86602500 -0.00000000 -0.45387 -0.86602500 0.50000000 -0.00000000 1.69387 -0.00000000 0.00000000 1.00000000 -290.00000 6 'helical symmetry operation' ? ? 0.86602500 -0.50000000 -0.00000000 0.78613 0.50000000 0.86602500 0.00000000 -0.45387 -0.00000000 -0.00000000 1.00000000 -290.00000 7 'helical symmetry operation' ? ? 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? -69.72 13.20 235 1 ALA E 40 ? ? -151.94 22.25 236 1 SER E 45 ? ? -151.27 -78.05 237 1 ASN E 46 ? ? -69.64 98.14 238 1 VAL E 47 ? ? -68.25 -94.17 239 1 PHE E 48 ? ? -115.42 -139.40 240 1 MET E 50 ? ? -58.79 -88.97 241 1 GLN E 55 ? ? 173.51 -58.54 242 1 GLU E 58 ? ? -63.01 76.58 243 1 PHE E 59 ? ? -174.57 -55.42 244 1 ASP E 67 ? ? -57.22 99.95 245 1 LYS E 70 ? ? 73.92 59.77 246 1 PRO E 105 ? ? -63.43 90.56 247 1 ILE E 106 ? ? -61.74 85.91 248 1 PHE E 135 ? ? -134.05 -41.43 249 1 GLU E 139 ? ? 94.96 92.20 250 1 LYS E 141 ? ? -175.83 140.98 251 1 THR E 153 ? ? -120.52 -62.77 252 1 GLU E 169 ? ? -59.39 91.45 253 1 PRO E 171 ? ? -67.24 77.44 254 1 ASN E 175 ? ? 68.30 -17.46 255 1 THR E 188 ? ? -174.01 -177.09 256 1 SER F 13 ? ? -172.48 83.42 257 1 LYS F 14 ? ? 40.70 -75.00 258 1 LYS F 15 ? ? -47.46 90.68 259 1 LYS F 16 ? ? 72.16 105.35 260 1 SER F 17 ? ? -163.98 75.78 261 1 PRO F 28 ? ? -42.15 98.82 262 1 GLN F 41 ? ? -65.95 94.98 263 1 ARG F 42 ? ? -113.25 -161.78 264 1 PHE F 48 ? ? -119.33 -166.25 265 1 GLN F 53 ? ? 13.04 -74.11 266 1 GLN F 55 ? ? -124.32 -68.42 267 1 GLN F 57 ? ? -31.99 -38.69 268 1 PHE F 63 ? ? -17.08 -55.47 269 1 GLN F 68 ? ? -114.81 -106.56 270 1 ARG F 88 ? ? -41.96 156.07 271 1 LEU F 95 ? ? -52.29 -76.10 272 1 ALA F 102 ? ? -142.45 44.80 273 1 PRO F 103 ? ? -64.74 10.03 274 1 PRO F 105 ? ? -24.73 86.39 275 1 THR F 113 ? ? -102.51 52.31 276 1 ALA F 120 ? ? -101.20 -74.91 277 1 GLU F 125 ? ? 46.22 -80.58 278 1 VAL F 127 ? ? -94.74 -69.02 279 1 LYS F 141 ? ? -170.80 148.09 280 1 GLU F 144 ? ? -4.46 -68.35 281 1 PHE F 183 ? ? -90.09 -62.75 282 1 LEU F 187 ? ? -129.00 -115.87 283 1 THR F 188 ? ? 55.51 -144.02 284 1 LYS F 189 ? ? -168.30 95.50 285 1 ALA F 191 ? ? 178.41 -179.32 286 1 GLU F 192 ? ? -175.81 85.01 287 1 GLU G 9 ? ? -45.73 -16.36 288 1 TYR G 10 ? ? -88.44 33.73 289 1 LEU G 11 ? ? -173.70 -57.47 290 1 GLN G 17 ? ? 177.19 -174.34 291 1 GLN G 22 ? ? -2.56 -54.29 292 1 TYR G 26 ? ? -95.51 55.37 293 1 LYS G 38 ? ? -126.38 -57.53 294 1 GLU G 59 ? ? -64.83 97.38 295 1 GLN G 61 ? ? -133.28 -112.91 296 1 GLU G 62 ? ? -115.18 -146.40 297 1 VAL G 66 ? ? -108.11 -154.30 298 1 LEU G 71 ? ? -59.43 107.83 299 1 LYS G 78 ? ? -67.70 6.74 300 1 ASN G 107 ? ? 80.02 -14.39 301 1 LEU G 108 ? ? -56.67 96.48 302 1 SER G 113 ? ? -154.58 69.76 303 1 TYR G 123 ? ? 59.45 18.71 304 1 LYS G 138 ? ? -51.61 88.09 305 1 GLU G 144 ? ? -170.90 -35.21 306 1 ARG G 164 ? ? 76.60 -5.17 307 1 GLU G 174 ? ? -101.82 -169.40 308 1 ALA G 177 ? ? -68.72 -113.16 309 1 LYS G 179 ? ? -96.89 -79.17 310 1 PRO G 198 ? ? -67.11 64.40 311 1 LYS G 199 ? ? 13.65 74.98 312 1 PRO G 205 ? ? -96.99 48.13 313 1 THR G 206 ? ? -142.04 -63.22 314 1 LYS G 207 ? ? 64.30 128.38 315 1 ALA G 211 ? ? -93.89 -153.76 316 1 PHE G 227 ? ? -79.96 31.72 317 1 LEU G 264 ? ? 5.00 107.70 318 1 GLU G 266 ? ? -69.85 82.13 319 1 LYS G 267 ? ? -84.13 38.80 320 1 ARG G 269 ? ? 171.04 -48.84 321 1 VAL G 270 ? ? -65.04 8.27 322 1 ILE G 271 ? ? -132.08 -119.67 323 1 GLN G 274 ? ? -109.40 -149.62 324 1 LEU G 276 ? ? 77.99 34.28 325 1 ARG G 278 ? ? -122.67 -142.49 326 1 SER G 279 ? ? -118.69 -92.32 327 1 ILE G 282 ? ? -63.29 40.66 328 1 PHE G 283 ? ? -132.98 -62.32 329 1 LEU G 299 ? ? 56.98 90.26 330 1 SER G 301 ? ? -73.99 -155.95 331 1 ASP G 302 ? ? -164.40 81.76 332 1 TYR G 305 ? ? -156.56 2.55 333 1 TYR G 307 ? ? 82.11 142.12 334 1 HIS G 308 ? ? -60.97 74.33 335 1 PHE G 309 ? ? -135.82 -102.52 336 1 VAL G 310 ? ? -123.72 -121.53 337 1 SER G 311 ? ? -154.37 -143.71 338 1 GLN G 312 ? ? -100.58 -123.68 339 1 GLU G 316 ? ? -68.81 -175.74 340 1 PRO G 318 ? ? -58.03 101.24 341 1 SER G 339 ? ? -58.82 172.75 342 1 GLU G 358 ? ? 91.35 55.27 343 1 GLU G 367 ? ? -90.79 -118.75 344 1 GLU G 368 ? ? 75.91 -66.81 345 1 THR G 375 ? ? 71.94 -133.74 346 1 GLU G 376 ? ? 73.57 -63.77 347 1 GLU G 377 ? ? 43.62 -133.64 348 1 LEU G 392 ? ? -67.37 -81.75 349 1 GLN G 410 ? ? -166.32 107.15 350 1 ARG G 412 ? ? -119.36 -169.10 351 1 TYR G 419 ? ? -105.33 -70.50 352 1 ALA G 460 ? ? -67.42 -161.85 353 1 GLU G 471 ? ? -79.66 -81.69 354 1 VAL G 492 ? ? -76.81 -77.61 355 1 LEU G 514 ? ? -144.31 23.09 356 1 ALA G 516 ? ? -62.48 21.11 357 1 MET G 525 ? ? 69.47 -58.31 358 1 ASP G 542 ? ? -34.75 -39.81 359 1 LEU G 554 ? ? -113.52 -143.81 360 1 PRO G 558 ? ? -38.81 -34.09 361 1 PRO G 568 ? ? 37.03 16.34 362 1 GLN G 570 ? ? -156.88 -68.64 363 1 GLU G 572 ? ? 73.98 -169.25 364 1 ASP G 597 ? ? 23.33 91.32 365 1 ASP G 601 ? ? 27.09 11.32 366 1 THR G 602 ? ? -101.10 -116.24 367 1 VAL G 603 ? ? -6.92 51.37 368 1 VAL G 604 ? ? -123.69 -62.39 369 1 PHE G 619 ? ? -99.85 30.46 370 1 ASP G 621 ? ? -31.01 91.57 371 1 LYS G 641 ? ? -151.16 -58.55 372 1 ALA G 644 ? ? -144.50 -146.52 373 1 SER G 645 ? ? -86.33 -134.25 374 1 PHE G 711 ? ? -141.25 49.39 375 1 PRO G 712 ? ? -28.90 -25.33 376 1 MET G 715 ? ? -99.04 -156.41 377 1 PHE G 720 ? ? -68.12 -75.03 378 1 SER G 730 ? ? -97.17 33.40 379 1 VAL G 737 ? ? -146.39 -112.52 380 1 ASN G 755 ? ? -142.25 -15.77 381 1 ASN G 761 ? ? -148.75 -77.02 382 1 LYS G 784 ? ? -69.41 22.06 383 1 VAL G 786 ? ? -160.54 111.80 384 1 TRP G 795 ? ? -44.65 -70.84 385 1 PHE G 802 ? ? -47.43 -17.74 386 1 LEU G 825 ? ? -89.15 39.89 387 1 ASN G 827 ? ? -171.74 57.45 388 1 TYR G 831 ? ? 175.17 -68.44 389 1 TYR G 834 ? ? -158.49 -78.21 390 1 LYS G 836 ? ? -63.33 -75.17 391 1 PRO G 839 ? ? -64.24 23.68 392 1 THR G 842 ? ? -103.76 -99.87 393 1 MET G 843 ? ? 49.07 -70.87 394 1 LYS G 845 ? ? -25.95 -58.73 395 1 LEU G 864 ? ? -64.21 0.99 396 1 GLU H 3 ? ? 100.03 -40.16 397 1 PRO H 5 ? ? -80.80 -150.93 398 1 THR H 8 ? ? -134.11 -154.55 399 1 GLU H 9 ? ? -105.95 -165.10 400 1 TYR H 10 ? ? -65.32 99.56 401 1 LEU H 11 ? ? 172.10 -48.81 402 1 SER H 14 ? ? -63.73 49.22 403 1 GLU H 16 ? ? -100.79 58.41 404 1 LYS H 20 ? ? -64.28 94.33 405 1 ASP H 21 ? ? -14.69 -37.94 406 1 LYS H 29 ? ? -155.98 17.62 407 1 ASP H 57 ? ? -79.36 -136.50 408 1 LYS H 68 ? ? 1.81 -59.97 409 1 LEU H 71 ? ? -69.13 89.08 410 1 PRO H 77 ? ? -63.63 52.87 411 1 LYS H 81 ? ? 72.07 40.87 412 1 SER H 86 ? ? -15.02 -44.54 413 1 THR H 89 ? ? -87.70 -82.51 414 1 TYR H 90 ? ? -64.98 84.45 415 1 ALA H 106 ? ? -89.98 45.18 416 1 ASN H 107 ? ? 64.94 -25.15 417 1 ILE H 109 ? ? -71.36 -82.97 418 1 PRO H 127 ? ? -70.68 39.12 419 1 TYR H 129 ? ? -95.57 32.44 420 1 GLN H 135 ? ? -130.57 -48.27 421 1 TYR H 137 ? ? -69.88 23.96 422 1 ARG H 142 ? ? -48.34 72.35 423 1 THR H 143 ? ? -137.16 -44.49 424 1 PRO H 147 ? ? -61.93 60.62 425 1 ARG H 164 ? ? 68.85 -0.24 426 1 SER H 175 ? ? -46.36 103.97 427 1 VAL H 193 ? ? -113.75 -79.57 428 1 PRO H 198 ? ? -58.19 95.33 429 1 PRO H 200 ? ? -53.79 5.73 430 1 PRO H 205 ? ? -70.47 -112.77 431 1 LYS H 207 ? ? -84.75 -82.49 432 1 LYS H 210 ? ? 80.00 160.69 433 1 ALA H 230 ? ? -143.68 -154.57 434 1 ARG H 240 ? ? -96.93 50.28 435 1 TYR H 263 ? ? -91.25 -79.88 436 1 GLN H 274 ? ? -87.24 -76.89 437 1 LEU H 276 ? ? 66.51 -7.54 438 1 TYR H 280 ? ? -37.82 113.32 439 1 ILE H 304 ? ? -101.62 -165.69 440 1 TYR H 305 ? ? 60.06 -7.45 441 1 TYR H 307 ? ? -38.32 88.96 442 1 GLN H 312 ? ? 60.20 -59.65 443 1 HIS H 355 ? ? -59.62 -74.97 444 1 LEU H 356 ? ? -21.06 -49.22 445 1 MET H 359 ? ? -66.84 97.51 446 1 ARG H 364 ? ? -119.45 76.56 447 1 GLU H 367 ? ? 159.45 -37.15 448 1 THR H 375 ? ? -164.71 -37.41 449 1 LYS H 394 ? ? -90.47 -62.24 450 1 ASN H 405 ? ? -145.74 -13.09 451 1 THR H 446 ? ? -62.59 85.76 452 1 LYS H 449 ? ? -133.42 -97.52 453 1 ARG H 450 ? ? -174.92 138.99 454 1 PHE H 462 ? ? 63.03 70.61 455 1 PHE H 491 ? ? -73.92 -84.32 456 1 VAL H 492 ? ? -62.08 -74.85 457 1 CYS H 517 ? ? -141.59 -61.52 458 1 SER H 529 ? ? -158.13 -117.06 459 1 LEU H 531 ? ? -142.08 -52.09 460 1 HIS H 553 ? ? -136.29 -30.59 461 1 PRO H 565 ? ? 37.64 18.24 462 1 PRO H 566 ? ? -80.23 49.20 463 1 LYS H 567 ? ? -143.10 -52.37 464 1 PRO H 568 ? ? -51.76 109.76 465 1 ALA H 573 ? ? 60.93 110.10 466 1 TYR H 580 ? ? -17.24 -68.12 467 1 THR H 589 ? ? -55.80 102.82 468 1 ASP H 597 ? ? 77.12 33.99 469 1 VAL H 599 ? ? -104.41 -150.85 470 1 SER H 611 ? ? -133.43 -154.95 471 1 LYS H 613 ? ? 53.33 -72.31 472 1 VAL H 615 ? ? -36.45 -39.34 473 1 ILE H 618 ? ? -58.65 5.64 474 1 GLU H 620 ? ? -108.73 -162.76 475 1 ASP H 621 ? ? -70.68 -97.39 476 1 HIS H 622 ? ? -4.89 -57.23 477 1 LEU H 625 ? ? -134.88 -70.57 478 1 GLU H 629 ? ? -155.25 -137.15 479 1 LYS H 630 ? ? 60.11 -63.70 480 1 LYS H 642 ? ? -112.55 -126.03 481 1 SER H 645 ? ? 159.96 -26.30 482 1 PHE H 646 ? ? 131.32 -31.98 483 1 GLN H 647 ? ? -138.79 -53.96 484 1 THR H 648 ? ? -44.01 97.85 485 1 LEU H 680 ? ? -56.85 19.95 486 1 ILE H 706 ? ? -104.21 -67.90 487 1 CYS H 707 ? ? -52.18 -5.68 488 1 ARG H 714 ? ? -166.82 119.36 489 1 MET H 715 ? ? -146.42 -136.29 490 1 THR H 725 ? ? 0.47 -74.17 491 1 ALA H 728 ? ? -106.92 47.70 492 1 PRO H 733 ? ? -136.27 -159.12 493 1 LYS H 734 ? ? 78.52 75.75 494 1 ASP H 738 ? ? -37.80 155.26 495 1 ILE H 750 ? ? -90.13 50.58 496 1 GLN H 751 ? ? 59.43 -74.52 497 1 LEU H 752 ? ? 50.11 122.56 498 1 ASP H 756 ? ? -98.92 42.52 499 1 LEU H 771 ? ? -74.95 -70.73 500 1 LEU H 782 ? ? -66.18 82.65 501 1 LYS H 784 ? ? 33.94 -126.21 502 1 LYS H 803 ? ? 45.31 -157.59 503 1 LYS H 804 ? ? 54.93 -73.04 504 1 LEU H 829 ? ? -100.43 -65.45 505 1 TYR H 831 ? ? -124.62 -102.06 506 1 LEU H 833 ? ? -62.33 93.25 507 1 TYR H 834 ? ? -177.16 -3.18 508 1 ILE H 835 ? ? -105.07 -68.45 509 1 THR H 842 ? ? -32.66 -86.87 510 1 ALA H 844 ? ? -51.96 -78.70 511 1 ASP I 20 ? ? -66.70 90.66 512 1 ASP I 40 ? ? 90.00 13.77 513 1 GLU I 59 ? ? -143.66 -73.03 514 1 ALA I 96 ? ? -167.80 88.89 515 1 GLU I 97 ? ? -15.69 80.78 516 1 ARG I 116 ? ? 87.37 128.61 517 1 ASP I 130 ? ? -66.39 83.76 518 1 PHE I 136 ? ? -101.88 79.51 519 1 PRO I 152 ? ? -78.79 -153.73 520 1 ASP J 3 ? ? -137.37 -157.85 521 1 ALA J 6 ? ? -28.41 -69.55 522 1 GLU J 24 ? ? -127.46 -53.26 523 1 ASP J 40 ? ? 74.11 37.01 524 1 PRO J 69 ? ? -59.19 -3.49 525 1 LYS J 75 ? ? -68.52 16.90 526 1 THR J 82 ? ? -121.18 -159.97 527 1 ALA J 96 ? ? -145.78 14.59 528 1 ARG J 116 ? ? 81.37 158.77 529 1 ASP J 130 ? ? -61.98 90.98 530 1 GLU J 131 ? ? -74.40 -155.54 531 1 ASP J 132 ? ? -171.88 -162.73 532 1 ASP J 153 ? ? -127.12 -63.24 533 1 ASP K 3 ? ? -147.64 -37.06 534 1 LYS K 12 ? ? -29.59 -64.63 535 1 SER K 13 ? ? -48.21 -18.92 536 1 SER K 17 ? ? -29.03 -30.00 537 1 LYS K 37 ? ? -66.34 1.60 538 1 ARG K 38 ? ? -67.84 15.02 539 1 ALA K 40 ? ? -148.90 10.89 540 1 SER K 45 ? ? -139.28 -105.28 541 1 VAL K 47 ? ? -87.04 -83.00 542 1 PHE K 48 ? ? -133.31 -128.90 543 1 MET K 50 ? ? -62.49 -72.36 544 1 THR K 52 ? ? -50.04 105.60 545 1 GLN K 55 ? ? 173.23 -50.22 546 1 GLU K 58 ? ? -65.98 75.38 547 1 PHE K 59 ? ? -175.15 -57.81 548 1 ASP K 67 ? ? -60.05 99.81 549 1 LYS K 70 ? ? 73.39 63.09 550 1 PRO K 105 ? ? -68.58 92.36 551 1 ILE K 106 ? ? -64.51 87.06 552 1 GLU K 139 ? ? 90.09 92.01 553 1 LYS K 141 ? ? -177.87 137.67 554 1 THR K 153 ? ? -140.39 -63.83 555 1 GLU K 169 ? ? -58.65 87.94 556 1 PRO K 171 ? ? -66.07 81.13 557 1 ASN K 175 ? ? 68.88 -18.19 558 1 THR K 188 ? ? -173.01 -168.92 559 1 LYS L 12 ? ? -72.10 48.72 560 1 SER L 13 ? ? 170.37 80.59 561 1 LYS L 14 ? ? 82.50 -72.82 562 1 LYS L 16 ? ? 114.95 71.87 563 1 SER L 17 ? ? 76.48 37.10 564 1 GLU L 19 ? ? -94.64 49.54 565 1 PRO L 30 ? ? -68.69 -177.88 566 1 PRO L 31 ? ? -154.14 -104.66 567 1 LYS L 32 ? ? -123.17 -104.49 568 1 GLN L 36 ? ? -83.81 45.63 569 1 GLN L 41 ? ? -54.17 103.42 570 1 ARG L 42 ? ? -114.55 -163.42 571 1 ASN L 46 ? ? -171.09 142.56 572 1 GLN L 53 ? ? 44.72 -77.60 573 1 HIS L 54 ? ? -145.87 26.08 574 1 GLU L 58 ? ? -26.27 -27.27 575 1 ASP L 67 ? ? -32.39 153.44 576 1 GLN L 68 ? ? -127.76 -94.12 577 1 LYS L 70 ? ? -45.89 -15.76 578 1 ARG L 80 ? ? -60.74 7.02 579 1 ALA L 81 ? ? -148.18 -40.08 580 1 PRO L 103 ? ? -85.51 46.50 581 1 PRO L 105 ? ? -67.58 87.91 582 1 THR L 113 ? ? -92.97 34.17 583 1 ALA L 120 ? ? -108.20 -66.09 584 1 THR L 122 ? ? -106.16 75.14 585 1 ASP L 123 ? ? 61.66 65.53 586 1 GLU L 125 ? ? 23.46 -74.27 587 1 VAL L 127 ? ? -93.67 -66.97 588 1 LYS L 143 ? ? -66.68 75.15 589 1 GLU L 144 ? ? -10.92 -61.66 590 1 ILE L 178 ? ? -69.79 74.24 591 1 ILE L 186 ? ? -66.61 3.10 592 1 LEU L 187 ? ? -145.94 -89.22 593 1 THR L 188 ? ? 29.45 -123.99 594 1 ALA L 191 ? ? 177.69 -173.01 595 1 GLU L 192 ? ? -177.39 76.99 596 1 GLU L 193 ? ? -121.63 -109.24 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 SER A 272 ? ? GLN A 273 ? ? -146.37 2 1 TYR A 307 ? ? HIS A 308 ? ? -114.14 3 1 VAL A 310 ? ? SER A 311 ? ? -123.38 4 1 GLN A 363 ? ? ARG A 364 ? ? -107.61 5 1 ARG A 366 ? ? GLU A 367 ? ? 149.42 6 1 GLN A 410 ? ? GLY A 411 ? ? 135.71 7 1 SER A 418 ? ? TYR A 419 ? ? 143.40 8 1 LYS A 567 ? ? PRO A 568 ? ? -138.34 9 1 GLY B 526 ? ? ILE B 527 ? ? 149.41 10 1 ASP B 621 ? ? HIS B 622 ? ? -105.37 11 1 ALA B 627 ? ? GLU B 628 ? ? -147.59 12 1 GLY B 639 ? ? ARG B 640 ? ? 145.70 13 1 SER B 645 ? ? PHE B 646 ? ? -144.93 14 1 GLU B 867 ? ? GLU B 868 ? ? 138.14 15 1 LEU D 111 ? ? SER D 112 ? ? -144.19 16 1 LYS F 9 ? ? LYS F 10 ? ? 144.46 17 1 THR F 113 ? ? ILE F 114 ? ? 132.62 18 1 SER G 272 ? ? GLN G 273 ? ? -149.84 19 1 GLN G 273 ? ? GLN G 274 ? ? 147.15 20 1 TYR G 305 ? ? ASP G 306 ? ? -128.11 21 1 ARG G 366 ? ? GLU G 367 ? ? 139.37 22 1 GLN G 410 ? ? GLY G 411 ? ? 142.55 23 1 SER G 418 ? ? TYR G 419 ? ? 143.52 24 1 GLN H 571 ? ? GLU H 572 ? ? 146.94 25 1 ASP H 621 ? ? HIS H 622 ? ? -134.66 26 1 ALA H 627 ? ? GLU H 628 ? ? -134.25 27 1 GLN H 647 ? ? THR H 648 ? ? -118.17 28 1 LEU J 111 ? ? SER J 112 ? ? -147.98 29 1 PHE J 136 ? ? LEU J 137 ? ? 148.83 30 1 PRO L 29 ? ? PRO L 30 ? ? 145.64 31 1 PRO L 31 ? ? LYS L 32 ? ? -145.32 32 1 LYS L 32 ? ? PRO L 33 ? ? -145.99 33 1 ARG L 39 ? ? ALA L 40 ? ? 147.98 34 1 THR L 113 ? ? ILE L 114 ? ? 144.41 # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 TYR A 41 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 2 1 ARG A 64 ? ? 0.151 'SIDE CHAIN' 3 1 TYR A 110 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 4 1 ARG A 142 ? ? 0.140 'SIDE CHAIN' 5 1 TYR A 157 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 6 1 TYR A 190 ? ? 0.117 'SIDE CHAIN' 7 1 ARG A 269 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 8 1 TYR A 280 ? ? 0.093 'SIDE CHAIN' 9 1 TYR A 307 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 10 1 PHE A 361 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 11 1 GLN A 363 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN' 12 1 ARG A 364 ? ? 0.340 'SIDE CHAIN' 13 1 ARG A 366 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 14 1 TYR A 393 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 15 1 ARG A 412 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 16 1 TYR A 586 ? ? 0.167 'SIDE CHAIN' 17 1 ARG A 640 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 18 1 ARG A 708 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 19 1 TYR A 724 ? ? 0.159 'SIDE CHAIN' 20 1 TYR A 757 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 21 1 TYR A 796 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 22 1 TYR A 831 ? ? 0.096 'SIDE CHAIN' 23 1 ARG A 871 ? ? 0.155 'SIDE CHAIN' 24 1 TYR B 26 ? ? 0.102 'SIDE CHAIN' 25 1 TYR B 41 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 26 1 ARG B 103 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 27 1 TYR B 190 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 28 1 ARG B 278 ? ? 0.112 'SIDE CHAIN' 29 1 ARG B 366 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 30 1 TYR B 419 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 31 1 ARG B 450 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 32 1 ARG B 654 ? ? 0.126 'SIDE CHAIN' 33 1 ARG B 659 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 34 1 ARG B 673 ? ? 0.150 'SIDE CHAIN' 35 1 ARG B 708 ? ? 0.096 'SIDE CHAIN' 36 1 ARG B 714 ? ? 0.100 'SIDE CHAIN' 37 1 ARG B 941 ? ? 0.114 'SIDE CHAIN' 38 1 ARG E 80 ? ? 0.089 'SIDE CHAIN' 39 1 ARG F 80 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 40 1 TYR G 10 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 41 1 TYR G 41 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 42 1 ARG G 64 ? ? 0.130 'SIDE CHAIN' 43 1 TYR G 123 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 44 1 TYR G 157 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' 45 1 ARG G 164 ? ? 0.099 'SIDE CHAIN' 46 1 TYR G 190 ? ? 0.151 'SIDE CHAIN' 47 1 TYR G 305 ? ? 0.121 'SIDE CHAIN' 48 1 TYR G 307 ? ? 0.157 'SIDE CHAIN' 49 1 TYR G 347 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 50 1 TYR G 452 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 51 1 TYR G 586 ? ? 0.190 'SIDE CHAIN' 52 1 ARG G 640 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN' 53 1 ARG G 654 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 54 1 TYR G 724 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 55 1 TYR G 757 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 56 1 ARG G 817 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 57 1 TYR G 831 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 58 1 ARG G 926 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 59 1 TYR H 26 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 60 1 TYR H 79 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 61 1 TYR H 110 ? ? 0.091 'SIDE CHAIN' 62 1 TYR H 112 ? ? 0.089 'SIDE CHAIN' 63 1 ARG H 140 ? ? 0.107 'SIDE CHAIN' 64 1 ARG H 142 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 65 1 ARG H 164 ? ? 0.151 'SIDE CHAIN' 66 1 ARG H 278 ? ? 0.106 'SIDE CHAIN' 67 1 TYR H 347 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 68 1 TYR H 419 ? ? 0.089 'SIDE CHAIN' 69 1 PHE H 462 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 70 1 ARG H 654 ? ? 0.113 'SIDE CHAIN' 71 1 ARG H 673 ? ? 0.109 'SIDE CHAIN' 72 1 ARG H 767 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 73 1 ARG H 941 ? ? 0.106 'SIDE CHAIN' 74 1 TYR I 93 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 75 1 ARG J 13 ? ? 0.099 'SIDE CHAIN' 76 1 ARG J 116 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' 77 1 ARG K 38 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 78 1 ARG K 80 ? ? 0.097 'SIDE CHAIN' 79 1 ARG L 80 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' # loop_ _pdbx_validate_main_chain_plane.id _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_model_num _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_comp_id _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_asym_id _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_seq_id _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_ins_code _pdbx_validate_main_chain_plane.label_alt_id _pdbx_validate_main_chain_plane.improper_torsion_angle 1 1 GLN A 363 ? ? -15.29 2 1 PRO L 30 ? ? 14.85 3 1 LYS L 32 ? ? 11.21 # _pdbx_helical_symmetry.entry_id 3JBH _pdbx_helical_symmetry.number_of_operations 1 _pdbx_helical_symmetry.rotation_per_n_subunits 30 _pdbx_helical_symmetry.rise_per_n_subunits 100 _pdbx_helical_symmetry.n_subunits_divisor 1 _pdbx_helical_symmetry.dyad_axis no _pdbx_helical_symmetry.circular_symmetry 4 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 3JBH _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria Correlation _em_3d_fitting.details ;METHOD--FLEXIBLE FITTING DETAILS--Protocol- Flexible Fitting. The flexible docking procedure is based on a connected (motion capture) network of identified features within the atomic model. The atomic model is allowed to move according to displacements tracked by 31 control points defined by the network, in order to find the best match to the cryo-EM map ; _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 3DTP _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name PDB _em_3d_fitting_list.type 'experimental model' _em_3d_fitting_list.accession_code 3DTP # _em_3d_reconstruction.entry_id 3JBH _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.5 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type HELICAL _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'Single particle reconstruction with a modification of the IHRSR method' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 2.48 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 2.48 _em_3d_reconstruction.resolution 20 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details ;Three-dimensional single particle reconstruction was carried out by a modification of the IHRSR method, using SPIDER. Low-dose electron micrographs of 1008 frozen-hydrated thick filaments halves ere digitized at 0.248 nm per pixel using a Nikon Super Coolscan 8000 ED scanner. Filaments were aligned with the bare zone at the top, to ensure correct polarity in subsequent steps. A total of 15,504 segments, each 62 nm long, with an overlap of 55.8 nm, and containing aprox. 40,000 unique pairs of interacting myosin heads went into the reconstruction. As an initial reference model we used the tarantula negatively stained 3D-map, which was axially rotated, axially shifted and also out of plane tilted up to plus-minus12deg. for projection matching, giving a total of 4,095 projections (13 tilted projections plus-minus12deg. every 2deg., 45 reference rotated projections (0-90 degrees, 2deg. rotation angle), and 7 image axial shifts of 2.2 nm. The resulting 3D-map combines about 10,700 out of 15,504 filament segments, a yield of 69 percent of included segments. There are 4 helices of myosin heads, rotated 30 degrees, every 145 Angstroms. The filament segments were selected based on visual judgement of good helical order. ; _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '100mM NaCl, 3mM MgCl2, 1mM EGTA, 5mM PIPES, 5mM NaH2PO4, 1mM NaN3' _em_buffer.pH 7 _em_buffer.details '100mM NaCl, 3mM MgCl2, 1mM EGTA, 5mM PIPES, 5mM NaH2PO4, 1mM NaN3' # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 'Myosin filaments from Tarantula striated muscle' COMPLEX 0 ? 'Polymer of a multiple myosin assembled over a paramyosin core' ? 2 'MYOSIN II' ? 1 ? ? ? # _em_image_scans.entry_id 3JBH _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 1008 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 3JBH _em_imaging.id 1 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date 2002-10-23 _em_imaging.temperature 88 _em_imaging.microscope_model 'FEI/PHILIPS CM120T' _em_imaging.nominal_defocus_min 1950 _em_imaging.nominal_defocus_max 1950 _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.nominal_cs 2.0 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 35000 _em_imaging.calibrated_magnification 35000 _em_imaging.electron_source LAB6 _em_imaging.accelerating_voltage 120 _em_imaging.details 'low dose' _em_imaging.specimen_holder_type ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_maximum 90 _em_imaging.recording_temperature_minimum 88 _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'HOLEY CARBON GRIDS.' _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? # _em_vitrification.entry_id 3JBH _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.details ;Blotting was performed from one side of the grid till a thin sample film on it using Whatman No 42 filter paper, then the grid was immediately plunged under gravity into liquid ethane cooled by liquid nitrogen. Grids were stored under liquid nitrogen. ; _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.humidity 80 _em_vitrification.instrument 'HOMEMADE PLUNGER' _em_vitrification.method ;Blotting was performed from one side of the grid till a thin sample film on it using Whatman No 42 filter paper, then the grid was immediately plunged under gravity into liquid ethane cooled by liquid nitrogen. Grids were stored under liquid nitrogen. ; _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.temp 93 _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 3JBH _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state FILAMENT _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method HELICAL # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A GLN 963 ? A GLN 963 2 1 Y 1 A LYS 964 ? A LYS 964 3 1 Y 1 A THR 965 ? A THR 965 4 1 Y 1 A GLU 966 ? A GLU 966 5 1 Y 1 A GLN 967 ? A GLN 967 6 1 Y 1 A ASP 968 ? A ASP 968 7 1 Y 1 A LYS 969 ? A LYS 969 8 1 Y 1 A ALA 970 ? A ALA 970 9 1 Y 1 A ALA 971 ? A ALA 971 10 1 Y 1 A LYS 972 ? A LYS 972 11 1 Y 1 A ASP 973 ? A ASP 973 12 1 Y 1 A HIS 974 ? A HIS 974 13 1 Y 1 A GLN 975 ? A GLN 975 14 1 Y 1 A ILE 976 ? A ILE 976 15 1 Y 1 A ARG 977 ? A ARG 977 16 1 Y 1 A ASN 978 ? A ASN 978 17 1 Y 1 A LEU 979 ? A LEU 979 18 1 Y 1 A ASN 980 ? A ASN 980 19 1 Y 1 A ASP 981 ? A ASP 981 20 1 Y 1 A GLU 982 ? A GLU 982 21 1 Y 1 A ILE 983 ? A ILE 983 22 1 Y 1 A ALA 984 ? A ALA 984 23 1 Y 1 A HIS 985 ? A HIS 985 24 1 Y 1 A GLN 986 ? A GLN 986 25 1 Y 1 A ASP 987 ? A ASP 987 26 1 Y 1 A GLU 988 ? A GLU 988 27 1 Y 1 A LEU 989 ? A LEU 989 28 1 Y 1 A ILE 990 ? A ILE 990 29 1 Y 1 A ASN 991 ? A ASN 991 30 1 Y 1 A LYS 992 ? A LYS 992 31 1 Y 1 A LEU 993 ? A LEU 993 32 1 Y 1 A ASN 994 ? A ASN 994 33 1 Y 1 A ARG 995 ? A ARG 995 34 1 Y 1 A GLU 996 ? A GLU 996 35 1 Y 1 A LYS 997 ? A LYS 997 36 1 Y 1 A LYS 998 ? A LYS 998 37 1 Y 1 A GLN 999 ? A GLN 999 38 1 Y 1 A MET 1000 ? A MET 1000 39 1 Y 1 A GLN 1001 ? A GLN 1001 40 1 Y 1 A GLU 1002 ? A GLU 1002 41 1 Y 1 A MET 1003 ? A MET 1003 42 1 Y 1 A GLY 1004 ? A GLY 1004 43 1 Y 1 A GLN 1005 ? A GLN 1005 44 1 Y 1 A LYS 1006 ? A LYS 1006 45 1 Y 1 A THR 1007 ? A THR 1007 46 1 Y 1 A GLY 1008 ? A GLY 1008 47 1 Y 1 A GLU 1009 ? A GLU 1009 48 1 Y 1 A ASP 1010 ? A ASP 1010 49 1 Y 1 A LEU 1011 ? A LEU 1011 50 1 Y 1 A GLN 1012 ? A GLN 1012 51 1 Y 1 A ALA 1013 ? A ALA 1013 52 1 Y 1 A THR 1014 ? A THR 1014 53 1 Y 1 A GLU 1015 ? A GLU 1015 54 1 Y 1 A ASP 1016 ? A ASP 1016 55 1 Y 1 A LYS 1017 ? A LYS 1017 56 1 Y 1 A LEU 1018 ? A LEU 1018 57 1 Y 1 A ASN 1019 ? A ASN 1019 58 1 Y 1 A HIS 1020 ? A HIS 1020 59 1 Y 1 A MET 1021 ? A MET 1021 60 1 Y 1 A ASN 1022 ? A ASN 1022 61 1 Y 1 A LYS 1023 ? A LYS 1023 62 1 Y 1 A VAL 1024 ? A VAL 1024 63 1 Y 1 A LYS 1025 ? A LYS 1025 64 1 Y 1 A ALA 1026 ? A ALA 1026 65 1 Y 1 A LYS 1027 ? A LYS 1027 66 1 Y 1 A LEU 1028 ? A LEU 1028 67 1 Y 1 A GLU 1029 ? A GLU 1029 68 1 Y 1 A GLN 1030 ? A GLN 1030 69 1 Y 1 A THR 1031 ? A THR 1031 70 1 Y 1 A LEU 1032 ? A LEU 1032 71 1 Y 1 A ASP 1033 ? A ASP 1033 72 1 Y 1 A GLU 1034 ? A GLU 1034 73 1 Y 1 A LEU 1035 ? A LEU 1035 74 1 Y 1 A GLU 1036 ? A GLU 1036 75 1 Y 1 A ASP 1037 ? A ASP 1037 76 1 Y 1 A SER 1038 ? A SER 1038 77 1 Y 1 A LEU 1039 ? A LEU 1039 78 1 Y 1 A GLU 1040 ? A GLU 1040 79 1 Y 1 A ARG 1041 ? A ARG 1041 80 1 Y 1 A GLU 1042 ? A GLU 1042 81 1 Y 1 A LYS 1043 ? A LYS 1043 82 1 Y 1 A LYS 1044 ? A LYS 1044 83 1 Y 1 A LEU 1045 ? A LEU 1045 84 1 Y 1 A ARG 1046 ? A ARG 1046 85 1 Y 1 A GLY 1047 ? A GLY 1047 86 1 Y 1 A ASP 1048 ? A ASP 1048 87 1 Y 1 A VAL 1049 ? A VAL 1049 88 1 Y 1 A GLU 1050 ? A GLU 1050 89 1 Y 1 A LYS 1051 ? A LYS 1051 90 1 Y 1 A THR 1052 ? A THR 1052 91 1 Y 1 A LYS 1053 ? A LYS 1053 92 1 Y 1 A ARG 1054 ? A ARG 1054 93 1 Y 1 A LYS 1055 ? A LYS 1055 94 1 Y 1 A VAL 1056 ? A VAL 1056 95 1 Y 1 A GLU 1057 ? A GLU 1057 96 1 Y 1 A GLY 1058 ? A GLY 1058 97 1 Y 1 A ASP 1059 ? A ASP 1059 98 1 Y 1 A LEU 1060 ? A LEU 1060 99 1 Y 1 A LYS 1061 ? A LYS 1061 100 1 Y 1 A LEU 1062 ? A LEU 1062 101 1 Y 1 A ALA 1063 ? A ALA 1063 102 1 Y 1 A GLN 1064 ? A GLN 1064 103 1 Y 1 A GLU 1065 ? A GLU 1065 104 1 Y 1 A ALA 1066 ? A ALA 1066 105 1 Y 1 A VAL 1067 ? A VAL 1067 106 1 Y 1 A ALA 1068 ? A ALA 1068 107 1 Y 1 A ASP 1069 ? A ASP 1069 108 1 Y 1 A LEU 1070 ? A LEU 1070 109 1 Y 1 A GLU 1071 ? A GLU 1071 110 1 Y 1 A LYS 1072 ? A LYS 1072 111 1 Y 1 A ASN 1073 ? A ASN 1073 112 1 Y 1 A LYS 1074 ? A LYS 1074 113 1 Y 1 A LYS 1075 ? A LYS 1075 114 1 Y 1 A GLU 1076 ? A GLU 1076 115 1 Y 1 A LEU 1077 ? A LEU 1077 116 1 Y 1 A GLU 1078 ? A GLU 1078 117 1 Y 1 A GLN 1079 ? A GLN 1079 118 1 Y 1 A ALA 1080 ? A ALA 1080 119 1 Y 1 A LEU 1081 ? A LEU 1081 120 1 Y 1 A GLN 1082 ? A GLN 1082 121 1 Y 1 A ARG 1083 ? A ARG 1083 122 1 Y 1 A LYS 1084 ? A LYS 1084 123 1 Y 1 A GLU 1085 ? A GLU 1085 124 1 Y 1 A LYS 1086 ? A LYS 1086 125 1 Y 1 A GLU 1087 ? A GLU 1087 126 1 Y 1 A MET 1088 ? A MET 1088 127 1 Y 1 A ALA 1089 ? A ALA 1089 128 1 Y 1 A SER 1090 ? A SER 1090 129 1 Y 1 A LEU 1091 ? A LEU 1091 130 1 Y 1 A SER 1092 ? A SER 1092 131 1 Y 1 A ALA 1093 ? A ALA 1093 132 1 Y 1 A LYS 1094 ? A LYS 1094 133 1 Y 1 A LEU 1095 ? A LEU 1095 134 1 Y 1 A GLU 1096 ? A GLU 1096 135 1 Y 1 A ASP 1097 ? A ASP 1097 136 1 Y 1 A GLU 1098 ? A GLU 1098 137 1 Y 1 A GLN 1099 ? A GLN 1099 138 1 Y 1 A GLY 1100 ? A GLY 1100 139 1 Y 1 A LEU 1101 ? A LEU 1101 140 1 Y 1 A VAL 1102 ? A VAL 1102 141 1 Y 1 A ALA 1103 ? A ALA 1103 142 1 Y 1 A LYS 1104 ? A LYS 1104 143 1 Y 1 A LEU 1105 ? A LEU 1105 144 1 Y 1 A GLN 1106 ? A GLN 1106 145 1 Y 1 A LYS 1107 ? A LYS 1107 146 1 Y 1 A GLN 1108 ? A GLN 1108 147 1 Y 1 A ILE 1109 ? A ILE 1109 148 1 Y 1 A LYS 1110 ? A LYS 1110 149 1 Y 1 A GLU 1111 ? A GLU 1111 150 1 Y 1 A LEU 1112 ? A LEU 1112 151 1 Y 1 A GLN 1113 ? A GLN 1113 152 1 Y 1 A ALA 1114 ? A ALA 1114 153 1 Y 1 A ARG 1115 ? A ARG 1115 154 1 Y 1 A ILE 1116 ? A ILE 1116 155 1 Y 1 A GLU 1117 ? A GLU 1117 156 1 Y 1 A GLU 1118 ? A GLU 1118 157 1 Y 1 A LEU 1119 ? A LEU 1119 158 1 Y 1 A GLU 1120 ? A GLU 1120 159 1 Y 1 A GLU 1121 ? A GLU 1121 160 1 Y 1 A GLU 1122 ? A GLU 1122 161 1 Y 1 A LEU 1123 ? A LEU 1123 162 1 Y 1 A GLU 1124 ? A GLU 1124 163 1 Y 1 A ALA 1125 ? A ALA 1125 164 1 Y 1 A GLU 1126 ? A GLU 1126 165 1 Y 1 A ARG 1127 ? A ARG 1127 166 1 Y 1 A GLN 1128 ? A GLN 1128 167 1 Y 1 A ALA 1129 ? A ALA 1129 168 1 Y 1 A ARG 1130 ? A ARG 1130 169 1 Y 1 A ALA 1131 ? A ALA 1131 170 1 Y 1 A LYS 1132 ? A LYS 1132 171 1 Y 1 A ALA 1133 ? A ALA 1133 172 1 Y 1 A GLU 1134 ? A GLU 1134 173 1 Y 1 A LYS 1135 ? A LYS 1135 174 1 Y 1 A GLN 1136 ? A GLN 1136 175 1 Y 1 A ARG 1137 ? A ARG 1137 176 1 Y 1 A ALA 1138 ? A ALA 1138 177 1 Y 1 A ASP 1139 ? A ASP 1139 178 1 Y 1 A LEU 1140 ? A LEU 1140 179 1 Y 1 A ALA 1141 ? A ALA 1141 180 1 Y 1 A ARG 1142 ? A ARG 1142 181 1 Y 1 A GLU 1143 ? A GLU 1143 182 1 Y 1 A ILE 1144 ? A ILE 1144 183 1 Y 1 A GLU 1145 ? A GLU 1145 184 1 Y 1 A GLU 1146 ? A GLU 1146 185 1 Y 1 A LEU 1147 ? 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