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5 UNP MCM6_YEAST P53091 5 ;MSSPFPADTPSSNRPSNSSPPPSSIGAGFGSSSGLDSQIGSRLHFPSSSQPHVSNSQTGPFVNDSTQFSSQRLQTDGSAT NDMEGNEPARSFKSRALNHVKKVDDVTGEKVREAFEQFLEDFSVQSTDTGEVEKVYRAQIEFMKIYDLNTIYIDYQHLSM RENGALAMAISEQYYRFLPFLQKGLRRVVRKYAPELLNTSDSLKRSEGDEGQADEDEQQDDDMNGSSLPRDSGSSAAPGN GTSAMATRSITTSTSPEQTERVFQISFFNLPTVHRIRDIRSEKIGSLLSISGTVTRTSEVRPELYKASFTCDMCRAIVDN VEQSFKYTEPTFCPNPSCENRAFWTLNVTRSRFLDWQKVRIQENANEIPTGSMPRTLDVILRGDSVERAKPGDRCKFTGV EIVVPDVTQLGLPGVKPSSTLDTRGISKTTEGLNSGVTGLRSLGVRDLTYKISFLACHVISIGSNIGASSPDANSNNRET ELQMAANLQANNVYQDNERDQEVFLNSLSSDEINELKEMVKDEHIYDKLVRSIAPAVFGHEAVKKGILLQMLGGVHKSTV EGIKLRGDINICVVGDPSTSKSQFLKYVVGFAPRSVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEEGGDYTIEAGALMLADNGICCIDE FDKMDISDQVAIHEAMEQQTISIAKAGIHATLNARTSILAAANPVGGRYNRKLSLRGNLNMTAPIMSRFDLFFVILDDCN EKIDTELASHIVDLHMKRDEAIEPPFSAEQLRRYIKYARTFKPILTKEARSYLVEKYKELRKDDAQGFSRSSYRITVRQL ESMIRLSEAIARANCVDEITPSFIAEAYDLLRQSIIRVDVDDVEMDEEFDNIESQSHAASGNNDDNDDGTGSGVITSEPP ADIEEGQSEATARPGTSEKKKTTVTYDKYVSMMNMIVRKIAEVDREGAEELTAVDIVDWYLLQKENDLGSLAEYWEERRL AFKVIKRLVKDRILMEIHGTRHNLRDLENEENENNKTVYVIHPNCEVLDQLEPQDSS ; 1 ? 6 UNP MCM7_YEAST P38132 6 ;MSAALPSIQLPVDYNNLFNEITDFLVTFKQDTLSSDATRNENEDENLDAENIEQHLLEKGPKYMAMLQKVANRELNSVII DLDDILQYQNEKFLQGTQADDLVSAIQQNANHFTELFCRAIDNNMPLPTKEIDYKDDVLDVILNQRRLRNERMLSDRTNE IRSENLMDTTMDPPSSMNDALREVVEDETELFPPNLTRRYFLYFKPLSQNCARRYRKKAISSKPLSVRQIKGDFLGQLIT VRGIITRVSDVKPAVEVIAYTCDQCGYEVFQEVNSRTFTPLSECTSEECSQNQTKGQLFMSTRASKFSAFQECKIQELSQ QVPVGHIPRSLNIHVNGTLVRSLSPGDIVDVTGIFLPAPYTGFKALKAGLLTETYLEAQFVRQHKKKFASFSLTSDVEER VMELITSGDVYNRLAKSIAPEIYGNLDVKKALLLLLVGGVDKRVGDGMKIRGDINVCLMGDPGVAKSQLLKAICKISPRG VYTTGKGSSGVGLTAAVMKDPVTDEMILEGGALVLADNGICCIDEFDKMDESDRTAIHEVMEQQTISISKAGINTTLNAR TSILAAANPLYGRYNPRLSPLDNINLPAALLSRFDILFLMLDIPSRDDDEKLAEHVTYVHMHNKQPDLDFTPVEPSKMRE YIAYAKTKRPVMSEAVNDYVVQAYIRLRQDSKREMDSKFSFGQATPRTLLGIIRLSQALAKLRLADMVDIDDVEEALRLV RVSKESLYQETNKSKEDESPTTKIFTIIKKMLQETGKNTLSYENIVKTVRLRGFTMLQLSNCIQEYSYLNVWHLINEGNT LKFVDDGTMDTDQEDSLVSTPKLAPQTTASANVSAQDSDIDLQDA ; 1 ? 7 UNP CDC45_YEAST Q08032 7 ;MYYGISQFSEAYNKILRNSSSHSSCQLVIFVSCLNIDALCATKMLSLLFKKQLVQSQIVPIFGYSELRRHYSQLDDNINS LLLVGFGGVIDLEAFLEIDPQEYVIDTDEKSGEQSFRRDIYVLDAHRPWNLDNIFGSQIIQCFDDGTVDDTLGEQKEAYY KLLELDEESGDDELSGDENDNNGGDDEATDADEVTDEDEEDEDETISNKRGNSSIGPNDLSKRKQRKKQIHEYEGVLEEY YSQGTTVVNSISAQIYSLLSAIGETNLSNLWLNILGTTSLDIAYAQVYNRLYPLLQDEVKRLTPSSRNSVKTPDTLTLNI QPDYYLFLLRHSSLYDSFYYSNYVNAKLSLWNENGKKRLHKMFARMGIPLSTAQETWLYMDHSIKRELGIIFDKNLDRYG LQDIIRDGFVRTLGYRGSISASEFVEALTALLEVGNSTDKDSVKINNDNNDDTDGEEEEDNSAQKLTNLRKRWVSNFWLS WDALDDRKVELLNRGIQLAQDLQRAIFNTGVAILEKKLIKHLRIYRLCVLQDGPDLDLYRNPLTLLRLGNWLIECCAESE DKQLLPMVLASIDENTDTYLVAGLTPRYPRGLDTIHTKKPILNNFSMAFQQITAETDAKVRIDNFESSIIEIRREDLSPF LEKLTLSGLL ; 1 ? 8 UNP SLD5_YEAST Q03406 8 ;MDINIDDILAELDKETTAVDSTKITQGSSSTTHRDANTIVGSSLDLNDKTQIYVSPQQDFSDLMKSWKNERCSPELLPYP HQLMKRLLNRISMQSQLIENISMGFLDMQNASNANPPMPNESKLPLLCMETELERLKFVIRSYIRCRLSKIDKFSLYLRQ LNEDENSLISLTDLLSKDEIKYHDTHSLIWLKLVNDSILKYMPEELQAINDTEGSVNMIDEPDWNKFVFIHVNGPPDGKW NEDPLLQENEFGKPCYTVTIPDLKEEVELTIGSIYVMRYEVIRDLLRDDKVALI ; 1 ? 9 UNP PSF2_YEAST P40359 9 ;MSLPAHLQQTFSPEEIQFIVENEPIKIFPRITTRQKIRGDDRGTGNHTRWQLITTDDKALNNMVAMRSTEVVLWIALLLK QQSKCSIVAPQWLTTKELDRKIQYEKTHPDRFSELPWNWLVLARILFNKAKDDFHDPIHELRGKIQDLREIRQIKVLKGL KYLNESHLQLDNLSLLEINELRPFITEIMDKLREIHTASLTAGTENDEEEFNI ; 1 ? 10 UNP PSF1_YEAST Q12488 10 ;MYGDLGNKLVLEAKRTKQLYARSNQDVNLPMYHEDIIRNILKEVSNLRKNTEYLKEQQQLGMLDDKVAKCQYFVTLLCME RNKRCLLAYQRLRTDILDSMAWNNNGLDLMSSITFSQQDTNNLSHQEQEYLKEYCDLITDLKSGDLVDIDLSGSLVPPSD VFIDVRVLKDAGEIQTEYGVFNLIKDSQFFVRQSDVERLIQQGYLQKI ; 1 ? 11 UNP PSF3_YEAST Q12146 11 ;MGYYDIDDVLADGTEFPCKFQYDIPGLGYLENNPGRPITKNTKLSLPLWLARILAIVGGDEALVDEEPVPFVELLPPDMF STKVMNAIKTDPVALDLHSINSHFFSLAIKWIMLFSEKELANVVSELLLQRAQELNHHASSLSIDLNADSTGKNSANTNI ATSTFLLKLEEMEKEIYKKSHESYKDTKRWMFKK ; 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 3JC5 2 1 ? 868 ? P29469 1 ? 868 ? 1 868 2 2 3JC5 3 1 ? 971 ? P24279 1 ? 971 ? 1 971 3 3 3JC5 4 1 ? 933 ? P30665 1 ? 933 ? 1 933 4 4 3JC5 5 1 ? 775 ? P29496 1 ? 775 ? 1 775 5 5 3JC5 6 1 ? 1017 ? P53091 1 ? 1017 ? 1 1017 6 6 3JC5 7 1 ? 845 ? P38132 1 ? 845 ? 1 845 7 7 3JC5 c 1 ? 650 ? Q08032 1 ? 650 ? 1 650 8 8 3JC5 D 1 ? 294 ? Q03406 1 ? 294 ? 1 294 9 9 3JC5 B 1 ? 213 ? P40359 1 ? 213 ? 1 213 10 10 3JC5 A 1 ? 208 ? Q12488 1 ? 208 ? 1 208 11 11 3JC5 C 1 ? 194 ? Q12146 1 ? 194 ? 1 194 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 7 3JC5 ALA c 22 ? UNP Q08032 HIS 22 CONFLICT 22 1 7 3JC5 GLU c 155 ? UNP Q08032 GLN 155 CONFLICT 155 2 7 3JC5 THR c 551 ? UNP Q08032 TRP 551 CONFLICT 551 3 10 3JC5 ALA A 161 ? UNP Q12488 VAL 161 CONFLICT 161 4 10 3JC5 GLN A 192 ? UNP Q12488 ARG 192 CONFLICT 192 5 10 3JC5 LEU A 207 ? UNP Q12488 LYS 207 CONFLICT 207 6 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 3JC5 _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.crystals_number ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 40041 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 40041 _refine_hist.d_res_high . _refine_hist.d_res_low . # _struct.entry_id 3JC5 _struct.title 'Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion' _struct.pdbx_descriptor ;DNA replication licensing factor MCM2 (E.C.3.6.4.12), DNA replication licensing factor MCM3 (E.C.3.6.4.12), DNA replication licensing factor MCM4 (E.C.3.6.4.12), Minichromosome maintenance protein 5 (E.C.3.6.4.12), DNA replication licensing factor MCM6 (E.C.3.6.4.12), DNA replication licensing factor MCM7 (E.C.3.6.4.12), Cell division control protein 45, DNA replication complex GINS protein SLD5, DNA replication complex GINS protein PSF2, DNA replication complex GINS protein PSF1, DNA replication complex GINS protein PSF3 ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 3JC5 _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE _struct_keywords.text 'CMG helicase, Cryo-EM, HYDROLASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASN A 202 ? LEU A 216 ? ASN 2 202 LEU 2 216 1 ? 15 HELX_P HELX_P2 2 SER A 225 ? MET A 237 ? SER 2 225 MET 2 237 1 ? 13 HELX_P HELX_P3 3 ASN A 245 ? LYS A 253 ? ASN 2 245 LYS 2 253 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 4 LYS A 253 ? ALA A 261 ? LYS 2 253 ALA 2 261 1 ? 9 HELX_P HELX_P5 5 CYS A 263 ? TYR A 283 ? CYS 2 263 TYR 2 283 1 ? 21 HELX_P HELX_P6 6 ARG A 310 ? LEU A 314 ? ARG 2 310 LEU 2 314 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 7 ALA A 393 ? VAL A 397 ? ALA 2 393 VAL 2 397 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 8 ASP A 413 ? VAL A 415 ? ASP 2 413 VAL 2 415 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 9 THR A 477 ? LYS A 486 ? THR 2 477 LYS 2 486 1 ? 10 HELX_P HELX_P10 10 GLY A 492 ? ALA A 502 ? GLY 2 492 ALA 2 502 1 ? 11 HELX_P HELX_P11 11 HIS A 508 ? GLY A 521 ? HIS 2 508 GLY 2 521 1 ? 14 HELX_P HELX_P12 12 ALA A 548 ? ALA A 560 ? ALA 2 548 ALA 2 560 1 ? 13 HELX_P HELX_P13 13 GLY A 594 ? ALA A 599 ? GLY 2 594 ALA 2 599 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 14 PHE A 609 ? MET A 612 ? PHE 2 609 MET 2 612 5 ? 4 HELX_P HELX_P15 15 ASN A 613 ? GLN A 627 ? ASN 2 613 GLN 2 627 1 ? 15 HELX_P HELX_P16 16 PRO A 662 ? VAL A 667 ? PRO 2 662 VAL 2 667 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 17 THR A 670 ? ARG A 676 ? THR 2 670 ARG 2 676 1 ? 7 HELX_P HELX_P18 18 ASP A 688 ? ARG A 705 ? ASP 2 688 ARG 2 705 1 ? 18 HELX_P HELX_P19 19 PRO A 759 ? ILE A 774 ? PRO 2 759 ILE 2 774 1 ? 16 HELX_P HELX_P20 20 ASP A 784 ? SER A 799 ? ASP 2 784 SER 2 799 1 ? 16 HELX_P HELX_P21 21 THR A 806 ? ARG A 824 ? THR 2 806 ARG 2 824 1 ? 19 HELX_P HELX_P22 22 SER A 830 ? GLN A 849 ? SER 2 830 GLN 2 849 1 ? 20 HELX_P HELX_P23 23 SER A 852 ? ARG A 858 ? SER 2 852 ARG 2 858 1 ? 7 HELX_P HELX_P24 24 ALA B 19 ? LEU B 32 ? ALA 3 19 LEU 3 32 1 ? 14 HELX_P HELX_P25 25 TYR B 38 ? ASN B 55 ? TYR 3 38 ASN 3 55 1 ? 18 HELX_P HELX_P26 26 SER B 99 ? ASP B 101 ? SER 3 99 ASP 3 101 5 ? 3 HELX_P HELX_P27 27 ASP B 102 ? ASP B 107 ? ASP 3 102 ASP 3 107 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 28 ASP B 107 ? GLU B 117 ? ASP 3 107 GLU 3 117 1 ? 11 HELX_P HELX_P29 29 PHE B 121 ? SER B 135 ? PHE 3 121 SER 3 135 1 ? 15 HELX_P HELX_P30 30 MET B 261 ? ALA B 265 ? MET 3 261 ALA 3 265 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 31 ASP B 279 ? VAL B 283 ? ASP 3 279 VAL 3 283 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 32 ASP B 344 ? SER B 354 ? 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D CYS 186 SG ? ? ? 1_555 D CYS 211 SG ? ? 5 CYS 186 5 CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf2 disulf ? ? F CYS 474 SG ? ? ? 1_555 F CYS 522 SG ? ? 7 CYS 474 7 CYS 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 234 A . ? LEU 234 2 GLY 235 A ? GLY 235 2 1 -28.82 2 PRO 301 A . ? PRO 301 2 THR 302 A ? THR 302 2 1 -13.68 3 CYS 341 A . ? CYS 341 2 LEU 342 A ? LEU 342 2 1 23.49 4 GLN 353 A . ? GLN 353 2 ASP 354 A ? ASP 354 2 1 -5.97 5 SER 355 A . ? SER 355 2 ASN 356 A ? ASN 356 2 1 -28.73 6 ILE 359 A . ? ILE 359 2 ARG 360 A ? ARG 360 2 1 -1.43 7 ASN 433 A . ? ASN 433 2 TYR 434 A ? TYR 434 2 1 -14.83 8 ASP 435 A . ? ASP 435 2 GLY 436 A ? GLY 436 2 1 4.14 9 GLY 436 A . ? GLY 436 2 ASN 437 A ? ASN 437 2 1 -9.49 10 ARG 459 A . ? ARG 459 2 GLU 460 A ? GLU 460 2 1 -0.47 11 PRO 524 A . ? PRO 524 2 LYS 525 A ? LYS 525 2 1 -19.71 12 ASN 528 A . ? ASN 528 2 GLY 529 A ? GLY 529 2 1 -11.38 13 GLY 570 A . ? GLY 570 2 ALA 571 A ? ALA 571 2 1 -7.00 14 ALA 573 A . ? ALA 573 2 VAL 574 A ? VAL 574 2 1 -1.44 15 LYS 633 A . ? LYS 633 2 ALA 634 A ? ALA 634 2 1 -0.39 16 ARG 684 A . ? ARG 684 2 ASP 685 A ? ASP 685 2 1 -3.63 17 SER 802 A . ? SER 802 2 PHE 803 A ? PHE 803 2 1 -17.81 18 THR 34 B . ? THR 34 3 PHE 35 B ? 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