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;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; A,E ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; ;MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; D,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT) (DC)(DC)(DA)(DG)(DT)(DA)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG) (DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG) (DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC) (DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG) (DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC) (DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA) (DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA) (DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DC) (DA)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DC)(DC)(DG)(DA)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA) (DG)(DT)(DA)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG) (DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC) (DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC) (DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG) (DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC) (DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC) (DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT) (DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA)(DT) (DG)(DG)(DA)(DA)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DT)(DA) (DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG) (DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA) (DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA) (DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC) (DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG) (DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC) (DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA) (DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DA)(DG) (DT)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DA)(DG)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC) ; ;CAAGGATCCCTGGGAATTCTCCAGTACCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCAC CGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGA TATATACATCCTGTGCTCACACTGTCGTCCGAATTCTCCAGTACCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTC GTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTC TCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGCTTCTGATGGAACTGGAATTCTCCAGTACCTGGAGAATCCCGGTGCCG AGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAG GGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGCCTAAGAGCAGTTATCTAGAATAGCCACC ; I ? 6 polydeoxyribonucleotide no 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(DG)(DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA) (DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG) (DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DT)(DA)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG) (DA)(DA)(DT)(DT)(DC)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG) ; ;GGTGGCTATTCTAGATAACTGCTCTTAGGCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCT TGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCG GCACCGGGATTCTCCAGGTACTGGAGAATTCCAGTTCCATCAGAAGCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGA CTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGA CCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGTACTGGAGAATTCGGACGACAGTGTGAGCACAGGATGTATATATC TGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGT GCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGTACTGGAGAATTCCCAGGGATCCTTG ; J ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 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_refine.ls_d_res_high 2.84 _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? 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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'REAL-SPACE (WEIGHTED MAP SUM AT ATOM CENTERS)' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.558 ? 17533 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 30.693 ? 3776 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.033 ? 1998 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1277 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 43IB _struct.title 'Cryo-EM structure of canonical human nucleosome.' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 43IB _struct_keywords.text 'histone, nucleosome, chromatin, NUCLEAR PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'NUCLEAR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H31_HUMAN P68431 ? 1 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEACEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 2 UNP H4_HUMAN P62805 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP H2A2A_HUMAN Q6FI13 ? 3 ;MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRII PRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK ; 1 4 UNP H2B1C_HUMAN P62807 ? 4 ;MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSVYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASR LAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSK ; 1 5 PDB 43IB 43IB ? 5 ? 1 6 PDB 43IB 43IB ? 6 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 43IB A 1 ? 136 ? P68431 1 ? 136 ? 0 135 2 2 43IB B 1 ? 103 ? P62805 1 ? 103 ? 0 102 3 3 43IB C 1 ? 130 ? Q6FI13 1 ? 130 ? 0 129 4 4 43IB D 1 ? 126 ? P62807 1 ? 126 ? 0 125 5 1 43IB E 1 ? 136 ? P68431 1 ? 136 ? 0 135 6 2 43IB F 1 ? 103 ? P62805 1 ? 103 ? 0 102 7 3 43IB G 1 ? 130 ? Q6FI13 1 ? 130 ? 0 129 8 4 43IB H 1 ? 126 ? 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THR D 90 LEU D 102 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 PRO D 104 ? SER D 125 ? PRO D 103 SER D 124 1 ? 22 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY E 45 ? SER E 58 ? GLY E 44 SER E 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P18 AB9 ARG E 64 ? ASP E 78 ? ARG E 63 ASP E 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P19 AC1 GLN E 86 ? ALA E 115 ? GLN E 85 ALA E 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P20 AC2 MET E 121 ? GLY E 133 ? MET E 120 GLY E 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN F 26 ? ILE F 30 ? ASN F 25 ILE F 29 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 THR F 31 ? GLY F 43 ? THR F 30 GLY F 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P23 AC5 LEU F 50 ? ALA F 77 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P24 AC6 THR F 83 ? GLN F 94 ? THR F 82 GLN F 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 AC7 SER G 17 ? ALA G 22 ? SER G 16 ALA G 21 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 VAL G 28 ? GLY G 38 ? VAL G 27 GLY G 37 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA G 46 ? ASP G 73 ? ALA G 45 ASP G 72 1 ? 28 HELX_P HELX_P28 AD1 ILE G 80 ? ASP G 91 ? ILE G 79 ASP G 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P29 AD2 ASP G 91 ? LEU G 98 ? ASP G 90 LEU G 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P30 AD3 SER H 39 ? HIS H 50 ? SER H 38 HIS H 49 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 SER H 56 ? ASN H 85 ? SER H 55 ASN H 84 1 ? 30 HELX_P HELX_P32 AD5 THR H 91 ? LEU H 103 ? THR H 90 LEU H 102 1 ? 13 HELX_P HELX_P33 AD6 PRO H 104 ? SER H 124 ? PRO H 103 SER H 123 1 ? 21 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog348 hydrog ? ? I DA 164 N1 ? ? ? 1_555 J DT 41 N3 ? ? I DA 63 J DT -63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog349 hydrog ? ? I DA 164 N6 ? ? ? 1_555 J DT 41 O4 ? ? I DA 63 J DT -63 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? 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J -63 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I DT 29 1_555 J DA 176 1_555 I DG 30 1_555 J DC 175 1_555 -1.212 1.629 4.421 -2.964 -4.367 42.109 2.846 1.271 4.310 -6.049 4.106 42.424 1 II_DT-72DG-71:DC71DA72_JJ I -72 ? J 72 ? I -71 ? J 71 ? 1 I DG 30 1_555 J DC 175 1_555 I DG 31 1_555 J DC 174 1_555 -1.050 1.859 3.395 -3.724 -0.023 37.808 2.859 1.113 3.477 -0.035 5.730 37.984 2 II_DG-71DG-70:DC70DC71_JJ I -71 ? J 71 ? I -70 ? J 70 ? 1 I DG 31 1_555 J DC 174 1_555 I DA 32 1_555 J DT 173 1_555 0.972 0.829 3.935 -3.124 7.377 35.978 0.093 -2.054 3.928 11.765 4.982 36.830 3 II_DG-70DA-69:DT69DC70_JJ I -70 ? J 70 ? I -69 ? J 69 ? 1 I DA 32 1_555 J DT 173 1_555 I DG 33 1_555 J DC 172 1_555 -0.482 -0.534 3.098 -5.479 6.058 37.233 -1.546 0.081 3.016 9.350 8.458 38.087 4 II_DA-69DG-68:DC68DT69_JJ I -69 ? J 69 ? I -68 ? J 68 ? 1 I DG 33 1_555 J DC 172 1_555 I DA 34 1_555 J DT 171 1_555 -0.187 -0.773 3.033 -2.271 5.133 34.072 -2.028 -0.005 2.895 8.687 3.843 34.518 5 II_DG-68DA-67:DT67DC68_JJ I -68 ? J 68 ? I -67 ? J 67 ? 1 I DA 34 1_555 J DT 171 1_555 I DA 35 1_555 J DT 170 1_555 -0.006 -0.854 3.194 -3.503 2.371 39.760 -1.513 -0.381 3.130 3.474 5.133 39.975 6 II_DA-67DA-66:DT66DT67_JJ I -67 ? J 67 ? I -66 ? J 66 ? 1 I DA 35 1_555 J DT 170 1_555 I DT 36 1_555 J DA 169 1_555 -0.091 -0.606 3.259 1.830 -1.521 26.548 -0.918 0.675 3.275 -3.303 -3.975 26.653 7 II_DA-66DT-65:DA65DT66_JJ I -66 ? J 66 ? I -65 ? J 65 ? 1 I DT 36 1_555 J DA 169 1_555 I DC 37 1_555 J DG 168 1_555 -0.908 0.304 3.724 -2.351 -7.120 30.841 2.048 1.169 3.623 -13.146 4.340 31.718 8 II_DT-65DC-64:DG64DA65_JJ I -65 ? J 65 ? I -64 ? J 64 ? 1 I DC 37 1_555 J DG 168 1_555 I DC 38 1_555 J DG 167 1_555 -0.584 0.521 3.545 -4.747 -0.216 43.411 0.723 0.288 3.583 -0.291 6.395 43.658 9 II_DC-64DC-63:DG63DG64_JJ I -64 ? J 64 ? I -63 ? J 63 ? 1 I DC 38 1_555 J DG 167 1_555 I DC 39 1_555 J DG 166 1_555 0.217 -1.031 3.131 -4.567 5.254 31.784 -2.694 -1.128 2.871 9.451 8.216 32.518 10 II_DC-63DC-62:DG62DG63_JJ I -63 ? J 63 ? I -62 ? J 62 ? 1 I DC 39 1_555 J DG 166 1_555 I DG 40 1_555 J DC 165 1_555 0.254 -0.475 3.181 5.936 19.838 30.470 -3.323 0.365 2.444 33.348 -9.978 36.702 11 II_DC-62DG-61:DC61DG62_JJ I -62 ? J 62 ? I -61 ? J 61 ? 1 I DG 40 1_555 J DC 165 1_555 I DG 41 1_555 J DC 164 1_555 -0.492 0.413 3.000 -2.765 2.903 33.987 0.277 0.431 3.053 4.945 4.710 34.216 12 II_DG-61DG-60:DC60DC61_JJ I -61 ? J 61 ? I -60 ? J 60 ? 1 I DG 41 1_555 J DC 164 1_555 I DT 42 1_555 J DA 163 1_555 0.269 -0.383 3.174 -2.501 3.015 34.589 -1.083 -0.816 3.104 5.051 4.189 34.804 13 II_DG-60DT-59:DA59DC60_JJ I -60 ? J 60 ? I -59 ? J 59 ? 1 I DT 42 1_555 J DA 163 1_555 I DG 43 1_555 J DC 162 1_555 0.855 0.178 3.093 0.216 2.125 37.339 0.013 -1.307 3.103 3.315 -0.338 37.398 14 II_DT-59DG-58:DC58DA59_JJ I -59 ? J 59 ? I -58 ? J 58 ? 1 I DG 43 1_555 J DC 162 1_555 I DC 44 1_555 J DG 161 1_555 0.198 0.046 3.422 0.518 0.787 34.771 -0.048 -0.248 3.425 1.317 -0.866 34.784 15 II_DG-58DC-57:DG57DC58_JJ I -58 ? J 58 ? I -57 ? J 57 ? 1 I DC 44 1_555 J DG 161 1_555 I DC 45 1_555 J DG 160 1_555 0.427 1.456 3.761 0.289 -2.595 40.964 2.398 -0.573 3.669 -3.703 -0.413 41.044 16 II_DC-57DC-56:DG56DG57_JJ I -57 ? J 57 ? I -56 ? J 56 ? 1 I DC 45 1_555 J DG 160 1_555 I DG 46 1_555 J DC 159 1_555 -0.248 1.432 3.569 1.527 -4.863 38.736 2.765 0.566 3.360 -7.293 -2.291 39.057 17 II_DC-56DG-55:DC55DG56_JJ I -56 ? J 56 ? I -55 ? J 55 ? 1 I DG 46 1_555 J DC 159 1_555 I DA 47 1_555 J DT 158 1_555 -0.740 1.437 3.578 -1.942 0.683 40.821 1.975 0.825 3.631 0.978 2.782 40.870 18 II_DG-55DA-54:DT54DC55_JJ I -55 ? J 55 ? I -54 ? J 54 ? 1 I DA 47 1_555 J DT 158 1_555 I DG 48 1_555 J DC 157 1_555 -0.564 0.896 3.552 -3.330 1.596 34.331 1.238 0.383 3.626 2.694 5.621 34.523 19 II_DA-54DG-53:DC53DT54_JJ I -54 ? J 54 ? I -53 ? J 53 ? 1 I DG 48 1_555 J DC 157 1_555 I DG 49 1_555 J DC 156 1_555 -0.235 -0.025 3.379 -2.412 2.747 33.383 -0.509 -0.002 3.374 4.764 4.182 33.576 20 II_DG-53DG-52:DC52DC53_JJ I -53 ? J 53 ? I -52 ? J 52 ? 1 I DG 49 1_555 J DC 156 1_555 I DC 50 1_555 J DG 155 1_555 0.522 -0.572 3.281 -3.405 4.329 36.291 -1.493 -1.289 3.135 6.901 5.428 36.693 21 II_DG-52DC-51:DG51DC52_JJ I -52 ? J 52 ? I -51 ? J 51 ? 1 I DC 50 1_555 J DG 155 1_555 I DC 51 1_555 J DG 154 1_555 0.380 -0.492 3.397 1.719 5.093 33.645 -1.676 -0.366 3.304 8.730 -2.947 34.059 22 II_DC-51DC-50:DG50DG51_JJ I -51 ? J 51 ? I -50 ? J 50 ? 1 I DC 51 1_555 J DG 154 1_555 I DG 52 1_555 J DC 153 1_555 0.412 -0.057 3.316 1.906 3.213 34.894 -0.584 -0.393 3.315 5.338 -3.167 35.087 23 II_DC-50DG-49:DC49DG50_JJ I -50 ? J 50 ? I -49 ? J 49 ? 1 I DG 52 1_555 J DC 153 1_555 I DC 53 1_555 J DG 152 1_555 0.282 -0.522 3.462 2.870 0.644 38.390 -0.876 -0.051 3.464 0.977 -4.357 38.498 24 II_DG-49DC-48:DG48DC49_JJ I -49 ? J 49 ? I -48 ? J 48 ? 1 I DC 53 1_555 J DG 152 1_555 I DT 54 1_555 J DA 151 1_555 0.518 -0.078 3.555 2.224 0.472 34.219 -0.213 -0.498 3.579 0.801 -3.774 34.293 25 II_DC-48DT-47:DA47DG48_JJ I -48 ? J 48 ? I -47 ? J 47 ? 1 I DT 54 1_555 J DA 151 1_555 I DC 55 1_555 J DG 150 1_555 -0.305 1.193 3.572 3.817 -6.449 41.911 2.337 0.831 3.322 -8.930 -5.285 42.546 26 II_DT-47DC-46:DG46DA47_JJ I -47 ? J 47 ? I -46 ? J 46 ? 1 I DC 55 1_555 J DG 150 1_555 I DA 56 1_555 J DT 149 1_555 -0.019 1.983 3.744 0.560 -1.324 40.530 3.029 0.098 3.679 -1.910 -0.808 40.554 27 II_DC-46DA-45:DT45DG46_JJ I -46 ? J 46 ? I -45 ? J 45 ? 1 I DA 56 1_555 J DT 149 1_555 I DA 57 1_555 J DT 148 1_555 -1.130 1.995 3.606 -3.624 -3.046 41.905 3.117 1.162 3.541 -4.242 5.048 42.160 28 II_DA-45DA-44:DT44DT45_JJ I -45 ? J 45 ? I -44 ? J 44 ? 1 I DA 57 1_555 J DT 148 1_555 I DT 58 1_555 J DA 147 1_555 -0.640 0.206 3.329 -6.388 3.865 27.832 -0.489 -0.206 3.386 7.858 12.986 28.797 29 II_DA-44DT-43:DA43DT44_JJ I -44 ? J 44 ? I -43 ? J 43 ? 1 I DT 58 1_555 J DA 147 1_555 I DT 59 1_555 J DA 146 1_555 0.164 -0.079 3.516 -5.884 6.886 35.068 -1.164 -1.150 3.371 11.198 9.570 36.183 30 II_DT-43DT-42:DA42DA43_JJ I -43 ? J 43 ? I -42 ? J 42 ? 1 I DT 59 1_555 J DA 146 1_555 I DG 60 1_555 J DC 145 1_555 1.046 -0.212 3.081 -2.795 7.743 31.418 -1.633 -2.324 2.848 14.000 5.054 32.453 31 II_DT-42DG-41:DC41DA42_JJ I -42 ? J 42 ? I -41 ? J 41 ? 1 I DG 60 1_555 J DC 145 1_555 I DG 61 1_555 J DC 144 1_555 0.579 -0.515 3.437 2.390 6.601 29.672 -2.351 -0.605 3.284 12.668 -4.587 30.473 32 II_DG-41DG-40:DC40DC41_JJ I -41 ? J 41 ? I -40 ? J 40 ? 1 I DG 61 1_555 J DC 144 1_555 I DT 62 1_555 J DA 143 1_555 0.167 -0.912 3.404 3.418 4.683 35.539 -2.159 0.228 3.263 7.610 -5.554 35.994 33 II_DG-40DT-39:DA39DC40_JJ I -40 ? J 40 ? I -39 ? J 39 ? 1 I DT 62 1_555 J DA 143 1_555 I DC 63 1_555 J DG 142 1_555 0.927 -0.340 3.413 8.145 2.417 37.523 -0.839 -0.323 3.503 3.699 -12.467 38.439 34 II_DT-39DC-38:DG38DA39_JJ I -39 ? J 39 ? I -38 ? J 38 ? 1 I DC 63 1_555 J DG 142 1_555 I DG 64 1_555 J DC 141 1_555 0.062 0.528 3.491 1.649 -1.015 36.389 0.994 0.145 3.475 -1.623 -2.638 36.438 35 II_DC-38DG-37:DC37DG38_JJ I -38 ? J 38 ? I -37 ? J 37 ? 1 I DG 64 1_555 J DC 141 1_555 I DT 65 1_555 J DA 140 1_555 -0.118 -0.344 3.649 0.622 -0.732 33.678 -0.461 0.317 3.653 -1.264 -1.074 33.691 36 II_DG-37DT-36:DA36DC37_JJ I -37 ? J 37 ? I -36 ? J 36 ? 1 I DT 65 1_555 J DA 140 1_555 I DA 66 1_555 J DT 139 1_555 -0.915 2.021 3.622 -0.408 -6.124 46.873 3.056 1.106 3.355 -7.660 0.511 47.251 37 II_DT-36DA-35:DT35DA36_JJ I -36 ? J 36 ? I -35 ? J 35 ? 1 I DA 66 1_555 J DT 139 1_555 I DG 67 1_555 J DC 138 1_555 0.047 0.593 3.497 -0.929 1.388 31.243 0.818 -0.275 3.516 2.575 1.723 31.287 38 II_DA-35DG-34:DC34DT35_JJ I -35 ? J 35 ? I -34 ? J 34 ? 1 I DG 67 1_555 J DC 138 1_555 I DA 68 1_555 J DT 137 1_555 -1.145 1.736 3.449 -3.415 0.926 40.696 2.379 1.238 3.566 1.328 4.899 40.843 39 II_DG-34DA-33:DT33DC34_JJ I -34 ? J 34 ? I -33 ? J 33 ? 1 I DA 68 1_555 J DT 137 1_555 I DC 69 1_555 J DG 136 1_555 -0.091 -0.191 3.373 -8.744 5.683 28.892 -1.515 -1.604 3.172 10.950 16.847 30.678 40 II_DA-33DC-32:DG32DT33_JJ I -33 ? J 33 ? I -32 ? J 32 ? 1 I DC 69 1_555 J DG 136 1_555 I DA 70 1_555 J DT 135 1_555 0.413 -0.064 3.149 -2.566 7.904 34.598 -1.208 -1.035 3.025 13.058 4.239 35.553 41 II_DC-32DA-31:DT31DG32_JJ I -32 ? J 32 ? I -31 ? J 31 ? 1 I DA 70 1_555 J DT 135 1_555 I DG 71 1_555 J DC 134 1_555 0.529 -1.134 3.287 -1.262 3.329 29.489 -2.901 -1.292 3.118 6.511 2.468 29.698 42 II_DA-31DG-30:DC30DT31_JJ I -31 ? J 31 ? I -30 ? J 30 ? 1 I DG 71 1_555 J DC 134 1_555 I DC 72 1_555 J DG 133 1_555 0.340 -0.465 3.303 1.998 2.936 37.395 -1.108 -0.266 3.271 4.567 -3.107 37.557 43 II_DG-30DC-29:DG29DC30_JJ I -30 ? J 30 ? I -29 ? J 29 ? 1 I DC 72 1_555 J DG 133 1_555 I DT 73 1_555 J DA 132 1_555 0.147 -0.672 3.290 2.470 2.186 31.976 -1.605 0.177 3.240 3.956 -4.469 32.141 44 II_DC-29DT-28:DA28DG29_JJ I -29 ? J 29 ? I -28 ? J 28 ? 1 I DT 73 1_555 J DA 132 1_555 I DC 74 1_555 J DG 131 1_555 0.503 0.596 3.762 3.700 0.313 39.016 0.845 -0.238 3.797 0.467 -5.524 39.186 45 II_DT-28DC-27:DG27DA28_JJ I -28 ? J 28 ? I -27 ? J 27 ? 1 I DC 74 1_555 J DG 131 1_555 I DT 75 1_555 J DA 130 1_555 -1.328 0.055 3.338 2.837 -8.991 30.705 1.718 2.914 3.068 -16.498 -5.205 32.086 46 II_DC-27DT-26:DA26DG27_JJ I -27 ? J 27 ? I -26 ? 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J 21 ? 1 I DC 80 1_555 J DG 125 1_555 I DC 81 1_555 J DG 124 1_555 0.051 -0.823 3.227 -0.539 6.679 29.784 -2.840 -0.199 2.975 12.792 1.033 30.511 52 II_DC-21DC-20:DG20DG21_JJ I -21 ? J 21 ? I -20 ? J 20 ? 1 I DC 81 1_555 J DG 124 1_555 I DG 82 1_555 J DC 123 1_555 0.268 -0.734 3.039 0.330 6.645 28.879 -2.706 -0.461 2.807 13.106 -0.650 29.620 53 II_DC-20DG-19:DC19DG20_JJ I -20 ? J 20 ? I -19 ? J 19 ? 1 I DG 82 1_555 J DC 123 1_555 I DC 83 1_555 J DG 122 1_555 0.082 -0.614 3.562 4.344 5.618 34.981 -1.879 0.544 3.411 9.229 -7.136 35.672 54 II_DG-19DC-18:DG18DC19_JJ I -19 ? J 19 ? I -18 ? J 18 ? 1 I DC 83 1_555 J DG 122 1_555 I DT 84 1_555 J DA 121 1_555 0.242 -0.702 3.255 4.240 2.980 31.713 -1.798 0.315 3.182 5.408 -7.694 32.123 55 II_DC-18DT-17:DA17DG18_JJ I -18 ? J 18 ? I -17 ? J 17 ? 1 I DT 84 1_555 J DA 121 1_555 I DT 85 1_555 J DA 120 1_555 0.772 0.796 3.702 4.807 1.001 36.213 1.110 -0.469 3.790 1.601 -7.690 36.533 56 II_DT-17DT-16:DA16DA17_JJ I -17 ? J 17 ? I -16 ? 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