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NO NUCLEOTIDE IS PRESENT DURING PURIFICATION AND CRYSTALLISATION. THE SAV1866 MODEL IS A BACTERIAL ABC TRANSPORTER, SUSPECTED TO BE A MULTIDRUG EFFLUX TRANSPORTER. IT IS IN THE OUTWARD-FACING CONFIGURATION. 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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 4A82 _exptl.method 'ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY' _exptl.crystals_number 140 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method ? _exptl_crystal_grow.temp ? _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 8.0 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'pH 8.0' # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 97 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l ? _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol ? _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type ? # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength . _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 4A82 _reflns.observed_criterion_sigma_I ? _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 300 _reflns.d_resolution_high 7.0 _reflns.number_obs 13694 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 91 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI ? _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 4 # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY' _refine.entry_id 4A82 _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs 3097 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 2 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 5.00 _refine.ls_d_res_high 2.00 _refine.ls_percent_reflns_obs 60.8 _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.37 _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ;SUBMISSION BASED ON EXPERIMENTAL DATA FROM EMDB EMD-1966. (DEPOSITION ID: 10250). IN ORDER TO PROVIDE A DENSITY MAP FOR EMDB THAT THEY COULD HANDLE, AUTHORS DEPOSITED A MAP WHICH HAD BEEN EXTENDED ALONG A AND B AND THEN CROPPED TO CONTAIN ROUGHLY 2 UNIT CELLS. HENCE THE DIMENSIONS 140.7, 158.84, 247.5 REPRESENT ROUGHLY (NOT EXACTLY) 2 UNIT CELLS. IN ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY THE C DIMENSION IS SET TO BE LARGER THA THE EXPECTED THICKNESS OF THE CRYSTAL (IN THIS CASE 300 ANGSTROM WA USED) AS THE CRYSTAL IS A SINGLE UNIT CELL THICK. THE THICKNESS OF 247.5 ANGSTROM ENCLOSES THE SIGNIFICANT DENSITY IN THE MAP WITH A FEW ANGSTROMS TO SPARE ON EACH SIDE OF THE CRYSTAL. ; _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 9248 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 9248 _refine_hist.d_res_high 2.00 _refine_hist.d_res_low 5.00 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function o_bond_d 0.007 ? ? ? 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'ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY' ? # _struct.entry_id 4A82 _struct.title ;Fitted model of staphylococcus aureus sav1866 model ABC transporter in the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator volume map EMD-1966. ; _struct.pdbx_descriptor 'CYSTIC FIBROSIS TRANSMEMBRANE CONDUCTANCE REGULATOR' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4A82 _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSPORT PROTEIN' _struct_keywords.text 'CYSTIC FIBROSIS, CFTR, ION CHANNEL, TRANSPORT PROTEIN, CASSETTE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? 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VAL B 73 LEU B 107 1 ? 35 HELX_P HELX_P35 35 SER B 108 ? ASN B 114 ? SER B 108 ASN B 114 1 ? 7 HELX_P HELX_P36 36 GLN B 116 ? THR B 137 ? GLN B 116 THR B 137 1 ? 22 HELX_P HELX_P37 37 ASN B 141 ? ASP B 160 ? ASN B 141 ASP B 160 1 ? 20 HELX_P HELX_P38 38 ASP B 160 ? PHE B 169 ? ASP B 160 PHE B 169 1 ? 10 HELX_P HELX_P39 39 PHE B 169 ? PHE B 216 ? PHE B 169 PHE B 216 1 ? 48 HELX_P HELX_P40 40 ILE B 218 ? ILE B 271 ? ILE B 218 ILE B 271 1 ? 54 HELX_P HELX_P41 41 GLY B 278 ? PHE B 291 ? GLY B 278 PHE B 291 1 ? 14 HELX_P HELX_P42 42 GLY B 292 ? ASP B 319 ? GLY B 292 ASP B 319 1 ? 28 HELX_P HELX_P43 43 GLY B 379 ? ASN B 385 ? GLY B 379 ASN B 385 1 ? 7 HELX_P HELX_P44 44 LYS B 406 ? PHE B 408 ? LYS B 406 PHE B 408 5 ? 3 HELX_P HELX_P45 45 LEU B 409 ? GLN B 416 ? LEU B 409 GLN B 416 1 ? 8 HELX_P HELX_P46 46 THR B 430 ? LEU B 436 ? THR B 430 LEU B 436 1 ? 7 HELX_P HELX_P47 47 LEU B 437 ? ARG B 439 ? LEU B 437 ARG B 439 5 ? 3 HELX_P HELX_P48 48 THR B 443 ? ALA B 454 ? 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