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'expression tag' 436 108 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 # _pdbx_entry_details.entry_id 4A8C _pdbx_entry_details.compound_details ;ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN B, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN C, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN D, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN E, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN F, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN G, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN H, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN I, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN J, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN K, SER 214 TO ALA ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN L, SER 214 TO ALA ; _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 4A8C _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria 'Cross-correlation coefficient' _em_3d_fitting.details 'METHOD--RIGID BODY AND FLEXIBLE FITTING REFINEMENT PROTOCOL--X-RAY' _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 3STJ _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name PDB _em_3d_fitting_list.type 'experimental model' _em_3d_fitting_list.accession_code 3STJ # _em_3d_reconstruction.entry_id 4A8C _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.num_particles 29432 _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method 'COMMON LINE, PROJECTION MATCHING' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 1.4 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 1.4 _em_3d_reconstruction.resolution 7.5 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details ;DEGQ 12-MER WERE OBTAINED IN PRESENCE OF A PEPTIDE. THE PEPTIDE SEQUENCE IS SPMFKGVLDMMYGGMRGYQV THE NUMBER OF PEPTIDES BOUND TO DEGQ 12-MER IS UNKNOWN. THE PEPTIDES ARE NOT MODELLED DUE TO THE RESOLUTION OF THE MAP. SUBMISSION BASED ON EXPERIMENTAL DATA FROM EMDB EMD-1983. (DEPOSITION ID: 10374). ; _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '20 MM HEPES/NAOH, 150 MM NACL' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.details '20 MM HEPES/NAOH, 150 MM NACL' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'ESCHERICHIA COLI DEGQ 12- MER IN COMPLEX WITH A BINDING PEPTIDE' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 4A8C _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 110 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 4A8C _em_imaging.id 1 _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature 91 _em_imaging.microscope_model 'FEI TECNAI F20' _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_defocus_max 3000 _em_imaging.tilt_angle_min -0.1 _em_imaging.tilt_angle_max 0 _em_imaging.nominal_cs 2 _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.nominal_magnification 50000 _em_imaging.calibrated_magnification 50000 _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.details 'LOW DOSE MODE' _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details CARBON _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? # _em_vitrification.entry_id 4A8C _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'HOMEMADE PLUNGER' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.details 'VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, INSTRUMENT- MANUAL PLUNGER, METHOD- BLOT FOR 2 SECONDS BEFORE PLUNGING,' _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 4A8C _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' # _em_single_particle_entity.entry_id 4A8C _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry D3 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A SER 1 ? 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A HIS 431 37 1 Y 1 A HIS 432 ? A HIS 432 38 1 Y 1 A HIS 433 ? A HIS 433 39 1 Y 1 A HIS 434 ? A HIS 434 40 1 Y 1 A HIS 435 ? A HIS 435 41 1 Y 1 A HIS 436 ? A HIS 436 42 1 Y 1 B SER 1 ? B SER 1 43 1 Y 1 B ILE 2 ? B ILE 2 44 1 Y 1 B PRO 3 ? B PRO 3 45 1 Y 1 B GLY 4 ? B GLY 4 46 1 Y 1 B GLN 5 ? B GLN 5 47 1 Y 1 B VAL 6 ? B VAL 6 48 1 Y 1 B ALA 7 ? B ALA 7 49 1 Y 1 B ASP 8 ? B ASP 8 50 1 Y 1 B GLN 9 ? B GLN 9 51 1 Y 1 B ALA 10 ? B ALA 10 52 1 Y 1 B SER 36 ? B SER 36 53 1 Y 1 B GLN 37 ? B GLN 37 54 1 Y 1 B GLY 38 ? B GLY 38 55 1 Y 1 B GLN 39 ? B GLN 39 56 1 Y 1 B LYS 40 ? B LYS 40 57 1 Y 1 B ILE 41 ? B ILE 41 58 1 Y 1 B PRO 42 ? B PRO 42 59 1 Y 1 B GLU 43 ? B GLU 43 60 1 Y 1 B GLU 44 ? B GLU 44 61 1 Y 1 B PHE 45 ? B PHE 45 62 1 Y 1 B LYS 46 ? B LYS 46 63 1 Y 1 B LYS 47 ? B LYS 47 64 1 Y 1 B PHE 48 ? B PHE 48 65 1 Y 1 B PHE 49 ? B PHE 49 66 1 Y 1 B GLY 50 ? B GLY 50 67 1 Y 1 B ASP 51 ? B ASP 51 68 1 Y 1 B ASP 52 ? B ASP 52 69 1 Y 1 B LEU 53 ? B LEU 53 70 1 Y 1 B PRO 54 ? 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