data_4ABR # _entry.id 4ABR # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.280 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 4ABR PDBE EBI-50666 WWPDB D_1290050666 # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id OBSLTE _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2014-12-10 _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 4V8Q _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 4ABR _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ;THIS ENTRY WITH OTHER SPLIT ENTRIES HAVE BEEN CONSOLIDATED INTO A COMBINED FILE FOR COMPLETE REPRESENTATION. NO COORDINATES HAVE BEEN CHANGED. ; # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type _pdbx_database_related.details PDB 4ABR split . PDB 4ABS split 'STALLED RIBOSOME COMPLEX' PDB 1J1H unspecified 'SOLUTION STRUCTURE OF A TMRNA-BINDING PROTEIN, SMPB, FROMTHERMUS THERMOPHILUS' PDB 1IBK unspecified 'STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH THE ANTIBIOTIC PAROMOMYCIN' PDB 1IBL unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATETRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE ANDWITH THE ANTIBIOTIC PAROMOMYCIN ; PDB 2UUC unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT COMPLEXED WITH A VALINE-ASL WITH CMO5U IN POSITION 34 BOUND TO AN MRNA WITH A GUA-CODON IN THE A-SITE AND PAROMOMYCIN. ; PDB 2WDK unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A- AND P-SITE TRNAS, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT A-,P-, AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE I. ; PDB 2Y0U unspecified 'THE CRYSTAL STRUCTURE OF EF-TU AND A9C-TRNA-TRP BOUND TO A NEAR-COGNATE CODON ON THE 70S RIBOSOME' PDB 2J02 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME COMPLEXED WITH MRNA, TRNA AND PAROMOMYCIN (PART 3 OF 4) THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, MRNA, A-, P - AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE II. ; PDB 1J5E unspecified 'STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT' PDB 2WRQ unspecified 'THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE 70S RIBOSOME BOUND TO EF-TU AND TRNA (PART 3 OF 4).' PDB 2B9O unspecified ;30S RIBOSOMAL SUBUNIT, TRNAS AND MRNA FROM A CRYSTALSTRUCTURE OF THE WHOLE RIBOSOMAL COMPLEX WITH A STOP CODONIN THE A-SITE. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, TRNASAND MRNA FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE WHOLE RIBOSOMALCOMPLEX WITH A STOP CODON IN THE A-SITE AND IS DESCRIBEDIN REMARK 400. ; PDB 1HNX unspecified 'STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH PACTAMYCIN' PDB 2J00 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME COMPLEXED WITH MRNA, TRNA AND PAROMOMYCIN (PART 1 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, MRNA, A-, P - AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE I. ; PDB 2X9T unspecified 'STRUCTURE OF THE 70S RIBOSOME BOUND TO RELEASE FACTOR 2 AND A SUBSTRATE ANALOG PROVIDES INSIGHTS INTO CATALYSIS OF PEPTIDE RELEASE' PDB 2WH3 unspecified 'INSIGHTS INTO TRANSLATIONAL TERMINATION FROM THE STRUCTURE OF RF2 BOUND TO THE RIBOSOME' PDB 2UUB unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT COMPLEXED WITH A VALINE-ASL WITH CMO5U IN POSITION 34 BOUND TO AN MRNA WITH A GUU-CODON IN THE A-SITE AND PAROMOMYCIN. ; PDB 1VOV unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF FIVE 70S RIBOSOMES FROM ESCHERICHIACOLI IN COMPLEX WITH PROTEIN Y. THIS FILE CONTAINS THE 30SSUBUNIT OF ONE 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURECONTAINS FIVE 70S RIBOSOMES AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. ; PDB 1WJX unspecified 'CRYSTAL STURUCTURE OF TT0801 FROM THERMUS THERMOPHILUS' PDB 1EMI unspecified 'STRUCTURE OF 16S RRNA IN THE REGION AROUND RIBOSOMALPROTEIN S8.' PDB 2XQD unspecified 'THE STRUCTURE OF EF-TU AND AMINOACYL-TRNA BOUND TO THE 70S RIBOSOME WITH A GTP ANALOG' PDB 1PNX unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF THE WILD TYPE RIBOSOME FROM E. COLI,30S SUBUNIT OF 70S RIBOSOME. THIS FILE, 1PNX, CONTAINSONLY MOLECULES OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 50SSUBUNIT IS IN THE PDB FILE 1PNY. ; PDB 2V46 unspecified ;STRUCTURE OF THE RIBOSOME RECYCLING FACTOR BOUND TO THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME WITH MRNA, ASL- PHE AND TRNA-FMET (PART 1 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, MRNA, P-SITE ASL, E-SITE TRNA AND RRF FOR MOLECULE 1. ; PDB 2VQF unspecified ;MODIFIED URIDINES WITH C5-METHYLENE SUBSTITUENTS AT THE FIRST POSITION OF THE TRNA ANTICODON STABILIZE U-G WOBBLE PAIRING DURING DECODING ; PDB 2Y10 unspecified 'THE CRYSTAL STRUCTURE OF EF-TU AND TRP-TRNA-TRP BOUND TO A COGNATE CODON ON THE 70S RIBOSOME.' PDB 2WH1 unspecified 'INSIGHTS INTO TRANSLATIONAL TERMINATION FROM THE STRUCTURE OF RF2 BOUND TO THE RIBOSOME' PDB 1N32 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITBOUND TO CODON AND NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODONSTEM-LOOP MISMATCHED AT THE FIRST CODON POSITION AT THE ASITE WITH PAROMOMYCIN ; PDB 2Y18 unspecified 'THE CRYSTAL STRUCTURE OF EF-TU AND TRP-TRNA-TRP BOUND TO A COGNATE CODON ON THE 70S RIBOSOME.' PDB 2Y12 unspecified 'THE CRYSTAL STRUCTURE OF EF-TU AND G24A-TRNA-TRP BOUND TO A NEAR-COGNATE CODON ON THE 70S RIBOSOME' PDB 2WRN unspecified 'THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE 70S RIBOSOME BOUND TO EF-TU AND TRNA (PART 1 OF 4).' PDB 2F4V unspecified '30S RIBOSOME + DESIGNER ANTIBIOTIC' PDB 1TWT unspecified ;MODEL STRUCTURE OF THE T. THERMOPHILUS 70S RIBOSOME, 30SSUBUNIT OF 70S ROBOSOME. THIS FILE, 1TWT, CONTAINS ONLYMOLECULES OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 50S SUBUNIT ISIN THE PDB FILE 1TWV. ; PDB 1QZC unspecified ;COORDINATES OF S12, SH44, LH69 AND SRL SEPARATELY FITTEDINTO THE CRYO-EM MAP OF EF-TU TERNARY COMPLEX (GDP.KIRROMYCIN) BOUND 70S RIBOSOME ; PDB 2UXD unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF AN EXTENDED TRNA ANTICODON STEM LOOP IN COMPLEX WITH ITS COGNATE MRNA CGGG IN THE CONTEXT OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S SUBUNIT. ; PDB 1FKA unspecified 'STRUCTURE OF FUNCTIONALLY ACTIVATED SMALL RIBOSOMAL SUBUNITAT 3.3 A RESOLUTION' PDB 1FJG unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH THE ANTIBIOTICS STREPTOMYCIN, SPECTINOMYCIN,AND PAROMOMYCIN ; PDB 1N36 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN THE PRESENCE OF CRYSTALLOGRAPHICALLY DISORDERED CODONAND NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM- LOOPMISMATCHED AT THE SECOND CODON POSITION ; PDB 2UXC unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF AN EXTENDED TRNA ANTICODON STEM LOOP IN COMPLEX WITH ITS COGNATE MRNA UCGU IN THE CONTEXT OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S SUBUNIT. ; PDB 1HNW unspecified 'STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH TETRACYCLINE' PDB 1L1U unspecified 'TERNARY COMPLEX DOCKED IN THE DECODING SITE OF THE 30SRIBOSOMAL SUBUNIT' PDB 1HR0 unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF INITIATION FACTOR IF1 BOUND TO THE 30SRIBOSOMAL SUBUNIT' PDB 2V48 unspecified ;STRUCTURE OF THE RIBOSOME RECYCLING FACTOR BOUND TO THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME WITH MRNA, ASL- PHE AND TRNA-FMET (PART 3 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, MRNA, P-SITE ASL, E-SITE TRNA AND RRF FOR MOLECULE 2. ; PDB 2XUY unspecified 'TRNA TRANLOCATION ON THE 70S RIBOSOME: THE POST- TRANSLOCATIONAL TRANSLOCATION INTERMEDIATE TI(POST)' PDB 1XMQ unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF T6A37-ASLLYSUUU AAA-MRNA BOUND TO THEDECODING CENTER' PDB 2B64 unspecified ;30S RIBOSOMAL SUBUNIT, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTOR RF1FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE WHOLE RIBOSOMAL COMPLEX.THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, TRNAS, MRNA ANDRELEASE FACTOR RF1 FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE WHOLERIBOSOMAL COMPLEX". THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINSONE 70S RIBOSOME, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTOR RF1 ANDIS DESCRIBED IN REMARK 400. ; PDB 2B9M unspecified ;30S RIBOSOMAL SUBUNIT, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTOR RF2FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE WHOLE RIBOSOMAL COMPLEX.THIS FILE CONTAINS THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT, TRNAS, MRNAAND RELEASE FACTOR RF2 FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THEWHOLE RIBOSOMAL COMPLEX". THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURECONTAINS ONE 70S RIBOSOME, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTORRF2 AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. ; PDB 1PN8 unspecified ;COORDINATES OF S12, L11 PROTEINS AND E-SITE TRNA FROM 70SCRYSTAL STRUCTURE SEPARATELY FITTED INTO THE CRYO-EM MAPOF E.COLI 70S.EF-G.GDPNP COMPLEX. THE ATOMIC COORDINATESORIGINALLY FROM THE E-SITE TRNA WERE FITTED IN THEPOSITION OF THE HYBRID P/E-SITE TRNA. ; PDB 2WDG unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A-SITE TRNA, DEACYLATED P-SITE TRNA, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT A-,P-, AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE I. ; PDB 1XNR unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF AN INOSINE-CYTOSINE WOBBLE BASE PAIRIN THE CONTEXT OF THE DECODING CENTER' PDB 1DV4 unspecified 'PARTIAL STRUCTURE OF 16S RIBONUCLEIC ACID OF THE SMALL RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUS THERMOPHILUS' PDB 1HNZ unspecified 'STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH HYGROMYCIN B' PDB 1RSS unspecified 'RIBOSOMAL PROTEIN S7 FROM THERMUS THERMOPHILUS' PDB 2WDH unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A-SITE TRNA, DEACYLATED P-SITE TRNA, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT A-,P-, AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE II. ; PDB 1JGQ unspecified ;THE PATH OF MESSENGER RNA THROUGH THE RIBOSOME. THIS FILE,1JGQ, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA, ANDMRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY ; PDB 1I94 unspecified 'CRYSTAL STRUCTURES OF THE SMALL RIBOSOMAL SUBUNIT WITHTETRACYCLINE, EDEINE AND IF3' PDB 1I96 unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUSTHERMOPHILUS IN COMPLEX WITH THE TRANSLATION INITIATIONFACTOR IF3 (C-TERMINAL DOMAIN) ; PDB 2XSY unspecified 'TRNA TRANLOCATION ON THE 70S RIBOSOME: THE PRE- TRANSLOCATIONAL TRANSLOCATION INTERMEDIATE TI(PRE)' PDB 2UU9 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT COMPLEXED WITH A VALINE-ASL WITH CMO5U IN POSITION 34 BOUND TO AN MRNA WITH A GUG-CODON IN THE A-SITE AND PAROMOMYCIN. ; PDB 1PN7 unspecified 'COORDINATES OF S12, L11 PROTEINS AND P-TRNA, FROM THE 70S X-RAY STRUCTURE ALIGNED TO THE 70S CRYO-EM MAP OF E.COLIRIBOSOME' PDB 1EG0 unspecified 'FITTING OF COMPONENTS WITH KNOWN STRUCTURE INTO AN 11 .5 A CRYO-EM MAP OF THE E.COLI 70S RIBOSOME' PDB 1IBM unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATETRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE ; PDB 2UXB unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF AN EXTENDED TRNA ANTICODON STEM LOOP IN COMPLEX WITH ITS COGNATE MRNA GGGU IN THE CONTEXT OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S SUBUNIT. ; PDB 3ZZP unspecified 'CIRCULAR PERMUTANT OF RIBOSOMAL PROTEIN S6, LACKING EDGE STRAND BETA-2 OF WILD-TYPE S6.' PDB 2VQE unspecified ;MODIFIED URIDINES WITH C5-METHYLENE SUBSTITUENTS AT THE FIRST POSITION OF THE TRNA ANTICODON STABILIZE U-G WOBBLE PAIRING DURING DECODING ; PDB 1G1X unspecified 'STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEINS S15, S6, S18, AND 16SRIBOSOMAL RNA' PDB 1HA3 unspecified 'ELONGATION FACTOR TU IN COMPLEX WITH AURODOX' PDB 1I95 unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUSTHERMOPHILUS IN COMPLEX WITH EDEINE' PDB 2UUA unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT COMPLEXED WITH A VALINE-ASL WITH CMO5U IN POSITION 34 BOUND TO AN MRNA WITH A GUC-CODON IN THE A-SITE AND PAROMOMYCIN. ; PDB 1XNQ unspecified 'STRUCTURE OF AN INOSINE-ADENINE WOBBLE BASE PAIR COMPLEX INTHE CONTEXT OF THE DECODING CENTER' PDB 2XFZ unspecified 'STRUCTURE OF CYTOTOXIC DOMAIN OF COLICIN E3 BOUND TO THE 70S RIBOSOME (PART 1 OF 4)' PDB 1QD7 unspecified 'PARTIAL MODEL FOR 30S RIBOSOMAL SUBUNIT' PDB 1GIX unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOME AT 5.5 A RESOLUTION. THISFILE, 1GIX, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA,AND MRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY ; PDB 1JGO unspecified ;THE PATH OF MESSENGER RNA THROUGH THE RIBOSOME. THIS FILE,1JGO, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA, ANDMRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY ; PDB 3ZVO unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF THE HYBRID STATE OF RIBOSOME IN COMPLEX WITH THE GUANOSINE TRIPHOSPHATASE RELEASE FACTOR 3' PDB 1JGP unspecified ;THE PATH OF MESSENGER RNA THROUGH THE RIBOSOME. THIS FILE,1JGP, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA, ANDMRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY ; PDB 2XG1 unspecified 'STRUCTURE OF CYTOTOXIC DOMAIN OF COLICIN E3 BOUND TO THE 70S RIBOSOME (PART 3 OF 4)' PDB 2CZJ unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRNA DOMAIN OF TMRNA FROM THERMUSTHERMOPHILUS HB8' PDB 2C78 unspecified 'EF-TU COMPLEXED WITH A GTP ANALOG AND THE ANTIBIOTIC PULVOMYCIN' PDB 2X9R unspecified 'STRUCTURE OF THE 70S RIBOSOME BOUND TO RELEASE FACTOR 2 AND A SUBSTRATE ANALOG PROVIDES INSIGHTS INTO CATALYSIS OF PEPTIDE RELEASE' PDB 1N34 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN THE PRESENCE OF CODON AND CRYSTALLOGRAPHICALLYDISORDERED NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOPMISMATCHED AT THE FIRST CODON POSITION ; PDB 1N33 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITBOUND TO CODON AND NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODONSTEM-LOOP MISMATCHED AT THE SECOND CODON POSITION AT THE ASITE WITH PAROMOMYCIN ; PDB 2Y0W unspecified 'THE CRYSTAL STRUCTURE OF EF-TU AND A9C-TRNA-TRP BOUND TO A NEAR-COGNATE CODON ON THE 70S RIBOSOME' PDB 1PNS unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF A STREPTOMYCIN DEPENDENT RIBOSOME FROME. COLI, 30S SUBUNIT OF 70S RIBOSOME. THIS FILE, 1PNS,CONTAINS THE 30S SUBUNIT, TWO TRNAS, AND ONE MRNAMOLECULE. THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT IS IN FILE 1PNU. ; PDB 2JL7 unspecified ;INSIGHTS INTO TRANSLATIONAL TERMINATION FROM THE STRUCTURE OF RF2 BOUND TO THE RIBOSOME (PART 3 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT. ; PDB 1YL4 unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF 70S RIBOSOME WITH THRS OPERATOR ANDTRNAS. 30S SUBUNIT. THE COORDINATES FOR THE 50S SUBUNITARE IN THE PDB ENTRY 1YL3 ; PDB 2Y0Y unspecified 'THE CRYSTAL STRUCTURE OF EF-TU AND G24A-TRNA-TRP BOUND TO A NEAR-COGNATE CODON ON THE 70S RIBOSOME' PDB 2WDM unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A- AND P-SITE TRNAS, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT A-,P-, AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE II. ; PDB 1XMO unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF MNM5U34T6A37-TRNALYSUUU COMPLEXED WITHAAG-MRNA IN THE DECODING CENTER' PDB 1I97 unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUSTHERMOPHILUS IN COMPLEX WITH TETRACYCLINE' PDB 2Y14 unspecified 'THE CRYSTAL STRUCTURE OF EF-TU AND G24A-TRNA-TRP BOUND TO A COGNATE CODON ON THE 70S RIBOSOME.' # _pdbx_database_status.status_code OBS _pdbx_database_status.entry_id 4ABR _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2011-12-10 _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Neubauer, C.' 1 'Gillet, R.' 2 'Kelley, A.C.' 3 'Ramakrishnan, V.' 4 # _citation.id primary _citation.title 'Decoding in the Absence of a Codon by Tmrna and Smpb in the Ribosome.' _citation.journal_abbrev Science _citation.journal_volume 335 _citation.page_first 1366 _citation.page_last ? _citation.year 2012 _citation.journal_id_ASTM SCIEAS _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0036-8075 _citation.journal_id_CSD 0038 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 22422985 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/SCIENCE.1217039 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Neubauer, C.' 1 primary 'Gillet, R.' 2 primary 'Kelley, A.C.' 3 primary 'Ramakrishnan, V.' 4 # _cell.entry_id 4ABR _cell.length_a 202.170 _cell.length_b 290.760 _cell.length_c 250.650 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 97.63 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4ABR _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'SMALL PROTEIN B SMPB' 16785.490 1 ? ? ? 'PURIFIED USING RECOMBINANT TECHNIQUES' 2 polymer nat '16S RRNA' 493966.312 1 ? ? ? 'CHAIN A (16S RNA) HAS E.COLI NUMBERING, BASED ON A STRUCTURAL ALIGNMENT WITH THE CORRESPONDING E.COLI STRUCTURE IN 2AVY.' 3 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S2' 29317.703 1 ? ? ? ? 4 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S3' 26751.076 1 ? ? ? ? 5 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S4' 24373.447 1 ? ? ? ? 6 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S5' 17583.416 1 ? ? ? ? 7 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S6' 11988.753 1 ? ? ? ? 8 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S7' 18050.973 1 ? ? ? ? 9 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S8' 15868.570 1 ? ? ? ? 10 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S9' 14429.661 1 ? ? ? ? 11 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S10' 11954.968 1 ? ? ? ? 12 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S11' 13737.868 1 ? ? ? ? 13 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S12' 14920.754 1 ? ? ? ? 14 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S13' 14338.861 1 ? ? ? ? 15 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S14' 7158.725 1 ? ? ? ? 16 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S15' 10578.407 1 ? ? ? ? 17 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S16' 10409.983 1 ? ? ? ? 18 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S17' 12325.655 1 ? ? ? ? 19 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S18' 10258.299 1 ? ? ? ? 20 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S19' 10605.464 1 ? ? ? ? 21 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S20' 11736.143 1 ? ? ? ? 22 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN THX' 3350.030 1 ? ? ? ? 23 polymer nat 'E-SITE TRNA FMET OR P-SITE TRNA FMET' 24802.785 2 ? ? ? ? 24 polymer syn MRNA 6228.810 1 ? ? ? 'SEQUENCE GGCAAGGAGGUAA AAUGU A ONLY THE AAUGU SEQUENCE NEAR THE 3-END WAS ORDERED.' 25 polymer man 'TMRNA DELA' 28819.168 1 ? ? ? 'TMRNA DELTA 89 NT LONG. CENTRAL SEGMENT DISORDERED AND NOT PART OF THE PDB FILE.' 26 polymer man 'ELONGATION FACTOR TU' 44728.953 1 ? ? ? 'PURIFIED USING RECOMBINANT TECHNIQUES' 27 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 3 ? ? ? ? 28 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 2 ? ? ? ? 29 non-polymer syn KIRROMYCIN 796.943 1 ? ? ? ? 30 non-polymer syn "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 443.201 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAPVLENRRARHDYEILETYEAGIALKGTEVKSLRAGKVDFTGSFARFEDGELYLENLYIAPYEKGSYANVDPRRKRKLL LHKHELRRLLGKVEQKGLTLVPLKIYFNERGYAKVLLGLARGKKAYEKRREDKKEAVRRALEEL ; ;MAPVLENRRARHDYEILETYEAGIALKGTEVKSLRAGKVDFTGSFARFEDGELYLENLYIAPYEKGSYANVDPRRKRKLL LHKHELRRLLGKVEQKGLTLVPLKIYFNERGYAKVLLGLARGKKAYEKRREDKKEAVRRALEEL ; 2 ? 2 polyribonucleotide no no ;UUUGUUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGU UUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUC GGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAU CAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUG AGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCU UGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUA AUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGG GCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGAC GGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCC ACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAA CGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAG GCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUU ACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUG GCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUC GGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCC UGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCC AGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUA CGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGG CGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGAAGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU CU ; ;UUUGUUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGU UUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUC GGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAU CAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUG AGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCU UGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUA AUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGG GCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGAC GGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCC ACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAA CGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAG GCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUU ACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUG GCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUC GGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCC UGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCC AGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUA CGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGG CGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGAAGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU CU ; A ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MPVEITVKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDI VRMEAERAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPD AIFVVDPTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQ EAEATETPEGESEVEA ; ;MPVEITVKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDI VRMEAERAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPD AIFVVDPTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQ EAEATETPEGESEVEA ; B ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MGNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRG GERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGA EQARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE ; ;MGNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRG GERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGA EQARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE ; C ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MGRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFE EASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQ NLEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR ; ;MGRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFE EASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQ NLEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR ; D ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MPETDFEEKMILIRRTARMQAGGRRFRFGALVVVGDRQGRVGLGFGKAPEVPLAVQKAGYYARRNMVEVPLQNGTIPHEI EVEFGASKIVLKPAAPGTGVIAGAVPRAILELAGVTDILTKELGSRNPINIAYATMEALRQLRTKADVERLRKGEAHAQA QG ; ;MPETDFEEKMILIRRTARMQAGGRRFRFGALVVVGDRQGRVGLGFGKAPEVPLAVQKAGYYARRNMVEVPLQNGTIPHEI EVEFGASKIVLKPAAPGTGVIAGAVPRAILELAGVTDILTKELGSRNPINIAYATMEALRQLRTKADVERLRKGEAHAQA QG ; E ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELR IRDNVRRVMVVKSQEPFLANA ; ;MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELR IRDNVRRVMVVKSQEPFLANA ; F ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRV GGANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; ;MARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRV GGANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; G ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTDVPASRFKEEILRILAREGFIKGYERVDVDGKPYLRVYLKYGPRRQGPDPRPEQVI HHIRRISKPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTSKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTDVPASRFKEEILRILAREGFIKGYERVDVDGKPYLRVYLKYGPRRQGPDPRPEQVI HHIRRISKPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTSKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; H ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MEQYYGTGRRKEAVARVFLRPGNGKVTVNGQDFNEYFQGLVRAVAALEPLRAVDALGRFDAYITVRGGGKSGQIDAIKLG IARALVQYNPDYRAKLKPLGFLTRDARVVERKKYGKHKARRAPQYSKR ; ;MEQYYGTGRRKEAVARVFLRPGNGKVTVNGQDFNEYFQGLVRAVAALEPLRAVDALGRFDAYITVRGGGKSGQIDAIKLG IARALVQYNPDYRAKLKPLGFLTRDARVVERKKYGKHKARRAPQYSKR ; I ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MPKIRIKLRGFDHKTLDASAQKIVEAARRSGAQVSGPIPLPTRVRRFTVIRGPFKHKDSREHFELRTHNRLVDIINPNRK TIEQLMTLDLPTGVEIEIKTVGGGR ; ;MPKIRIKLRGFDHKTLDASAQKIVEAARRSGAQVSGPIPLPTRVRRFTVIRGPFKHKDSREHFELRTHNRLVDIINPNRK TIEQLMTLDLPTGVEIEIKTVGGGR ; J ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MAKKPSKKKVKRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSV DVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS ; ;MAKKPSKKKVKRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSV DVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS ; K ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MVALPTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEH SVVLIRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEAAKTAAKK ; ;MVALPTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEH SVVLIRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEAAKTAAKK ; L ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKR LMDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; ;MARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKR LMDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; M ? 15 'polypeptide(L)' no no MARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW MARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW N ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MPITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRA LIEKLGIRG ; ;MPITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRA LIEKLGIRG ; O ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQEAREGA ; ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQEAREGA ; P ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MPKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESG RMDLVEKYLIRRQNYESLSKRGGKA ; ;MPKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESG RMDLVEKYLIRRQNYESLSKRGGKA ; Q ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MSTKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSAKEQRILAKTIKRARILGLLP FTEKLVRK ; ;MSTKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSAKEQRILAKTIKRARILGLLP FTEKLVRK ; R ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MPRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTY RGHGKEAKATKKK ; ;MPRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTY RGHGKEAKATKKK ; S ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MAQKKPKRNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAIQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARR KSRLMRKVRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; ;MAQKKPKRNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAIQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARR KSRLMRKVRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; T ? 22 'polypeptide(L)' no no MGKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK MGKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK U ? 23 polyribonucleotide no no CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA V,W ? 24 polyribonucleotide no no GGCAAGGAGGUAAAAUGUA GGCAAGGAGGUAAAAUGUA X ? 25 polyribonucleotide no no ;GGGGGUGAAACGGUCUCGACAGGGGUCGCCGAGGGCGUUCGCGCCGUAGGGACCUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCA CCUCCACCAA ; ;GGGGGUGAAACGGUCUCGACAGGGGUCGCCGAGGGCGUUCGCGCCGUAGGGACCUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCA CCUCCACCAA ; Y ? 26 'polypeptide(L)' no no ;AKGEFVRTKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAALTYVAAAENPNVEVKDYGDIDKAPEERARGITINTAHVEYETAKRHYSHV DCPGHADYIKNMITGAAQMDGAILVVSAADGPMPQTREHILLARQVGVPYIVVFMNKVDMVDDPELLDLVEMEVRDLLNQ YEFPGDEVPVIRGSALLALEEMHKNPKTKRGENEWVDKIWELLDAIDEYIPTPVRDVDKPFLMPVEDVFTITGRGTVATG RIERGKVKVGDEVEIVGLAPETRKTVVTGVEMHRKTLQEGIAGDNVGLLLRGVSREEVERGQVLAKPGSITPHTKFEASV YILKKEEGGRHTGFFTGYRPQFYFRTTDVTGVVRLPQGVEMVMPGDNVTFTVELIKPVALEEGLRFAIREGGRTVGAGVV TKILE ; ;AKGEFVRTKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAALTYVAAAENPNVEVKDYGDIDKAPEERARGITINTAHVEYETAKRHYSHV DCPGHADYIKNMITGAAQMDGAILVVSAADGPMPQTREHILLARQVGVPYIVVFMNKVDMVDDPELLDLVEMEVRDLLNQ YEFPGDEVPVIRGSALLALEEMHKNPKTKRGENEWVDKIWELLDAIDEYIPTPVRDVDKPFLMPVEDVFTITGRGTVATG RIERGKVKVGDEVEIVGLAPETRKTVVTGVEMHRKTLQEGIAGDNVGLLLRGVSREEVERGQVLAKPGSITPHTKFEASV YILKKEEGGRHTGFFTGYRPQFYFRTTDVTGVVRLPQGVEMVMPGDNVTFTVELIKPVALEEGLRFAIREGGRTVGAGVV TKILE ; Z ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 PRO n 1 4 VAL n 1 5 LEU n 1 6 GLU n 1 7 ASN n 1 8 ARG n 1 9 ARG n 1 10 ALA n 1 11 ARG n 1 12 HIS n 1 13 ASP n 1 14 TYR n 1 15 GLU n 1 16 ILE n 1 17 LEU n 1 18 GLU n 1 19 THR n 1 20 TYR n 1 21 GLU n 1 22 ALA n 1 23 GLY n 1 24 ILE n 1 25 ALA n 1 26 LEU n 1 27 LYS n 1 28 GLY n 1 29 THR n 1 30 GLU n 1 31 VAL n 1 32 LYS n 1 33 SER n 1 34 LEU n 1 35 ARG n 1 36 ALA n 1 37 GLY n 1 38 LYS n 1 39 VAL n 1 40 ASP n 1 41 PHE n 1 42 THR n 1 43 GLY n 1 44 SER n 1 45 PHE n 1 46 ALA n 1 47 ARG n 1 48 PHE n 1 49 GLU n 1 50 ASP n 1 51 GLY n 1 52 GLU n 1 53 LEU n 1 54 TYR n 1 55 LEU n 1 56 GLU n 1 57 ASN n 1 58 LEU n 1 59 TYR n 1 60 ILE n 1 61 ALA n 1 62 PRO n 1 63 TYR n 1 64 GLU n 1 65 LYS n 1 66 GLY n 1 67 SER n 1 68 TYR n 1 69 ALA n 1 70 ASN n 1 71 VAL n 1 72 ASP n 1 73 PRO n 1 74 ARG n 1 75 ARG n 1 76 LYS n 1 77 ARG n 1 78 LYS n 1 79 LEU n 1 80 LEU n 1 81 LEU n 1 82 HIS n 1 83 LYS n 1 84 HIS n 1 85 GLU n 1 86 LEU n 1 87 ARG n 1 88 ARG n 1 89 LEU n 1 90 LEU n 1 91 GLY n 1 92 LYS n 1 93 VAL n 1 94 GLU n 1 95 GLN n 1 96 LYS n 1 97 GLY n 1 98 LEU n 1 99 THR n 1 100 LEU n 1 101 VAL n 1 102 PRO n 1 103 LEU n 1 104 LYS n 1 105 ILE n 1 106 TYR n 1 107 PHE n 1 108 ASN n 1 109 GLU n 1 110 ARG n 1 111 GLY n 1 112 TYR n 1 113 ALA n 1 114 LYS n 1 115 VAL n 1 116 LEU n 1 117 LEU n 1 118 GLY n 1 119 LEU n 1 120 ALA n 1 121 ARG n 1 122 GLY n 1 123 LYS n 1 124 LYS n 1 125 ALA n 1 126 TYR n 1 127 GLU n 1 128 LYS n 1 129 ARG n 1 130 ARG n 1 131 GLU n 1 132 ASP n 1 133 LYS n 1 134 LYS n 1 135 GLU n 1 136 ALA n 1 137 VAL n 1 138 ARG n 1 139 ARG n 1 140 ALA n 1 141 LEU n 1 142 GLU n 1 143 GLU n 1 144 LEU n 2 1 U n 2 2 U n 2 3 U n 2 4 G n 2 5 U n 2 6 U n 2 7 G n 2 8 G n 2 9 A n 2 10 G n 2 11 A n 2 12 G n 2 13 U n 2 14 U n 2 15 U n 2 16 G n 2 17 A n 2 18 U n 2 19 C n 2 20 C n 2 21 U n 2 22 G n 2 23 G n 2 24 C n 2 25 U n 2 26 C n 2 27 A n 2 28 G n 2 29 G n 2 30 G n 2 31 U n 2 32 G n 2 33 A n 2 34 A n 2 35 C n 2 36 G n 2 37 C n 2 38 U n 2 39 G n 2 40 G n 2 41 C n 2 42 G n 2 43 G n 2 44 C n 2 45 G n 2 46 U n 2 47 G n 2 48 C n 2 49 C n 2 50 U n 2 51 A n 2 52 A n 2 53 G n 2 54 A n 2 55 C n 2 56 A n 2 57 U n 2 58 G n 2 59 C n 2 60 A n 2 61 A n 2 62 G n 2 63 U n 2 64 C n 2 65 G n 2 66 U n 2 67 G n 2 68 C n 2 69 G n 2 70 G n 2 71 G n 2 72 C n 2 73 C n 2 74 G n 2 75 C n 2 76 G n 2 77 G n 2 78 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HB8 ? ? ? ? 'THERMUS THERMOPHILUS' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 25 1 sample ? ? ? ? ? ? ? HB8 ? ? ? ? 'THERMUS THERMOPHILUS' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? 'THERMUS THERMOPHILUS' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ;THE CONSTRUCT WAS BASED ON THE T. THERMOPHILUS SSRA GENE SEQUENCE, CONTAINING RESIDUES 1-37 AND 302-349 LINKED VIA A UUCG LOOP, AND INCLUDED FOUR POINT MUTATIONS (G21A, C317U, G323U, C337A) TO ENSURE HOMOGENOUS FOLDING. ; 26 1 sample ? ? ? ? ? ? ? HB8 ? ? ? ? 'THERMUS THERMOPHILUS' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 2 1 sample ? ? ? 'THERMUS THERMOPHILUS' 300852 ? ? 'HB8 - MRC - MSAW1' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample ? ? ? 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'ESCHERICHIA COLI' 83333 ? ? K-12 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 24 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'ESCHERICHIA COLI' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 562 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 GB NC_006461 2 ? ? 55979969 ? 2 UNP RS2_THET8 3 ? ? P80371 ? 3 UNP RS3_THET8 4 ? ? P80372 ? 4 UNP RS4_THET8 5 ? ? P80373 ? 5 UNP RS5_THET8 6 ? ? Q5SHQ5 ? 6 UNP RS6_THET8 7 ? ? Q5SLP8 ? 7 UNP RS7_THET8 8 ? ? P17291 ? 8 UNP RS8_THET8 9 ? ? Q5SHQ2 ? 9 UNP RS9_THET8 10 ? ? P80374 ? 10 UNP RS10_THET8 11 ? ? Q5SHN7 ? 11 UNP RS11_THET8 12 ? ? 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ASN Z 193 GLU Z 208 1 ? 16 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale ? ? 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A U 841 A C 848 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.623 ? covale11 covale ? ? B G 1149 "O3'" ? ? ? 1_555 B A 1150 P ? ? A G 1166 A A 1168 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.607 ? covale12 covale ? ? B A 1432 "O3'" ? ? ? 1_555 B C 1433 P ? ? A A 1447 A C 1452 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.610 ? covale13 covale ? ? B C 1433 "O3'" ? ? ? 1_555 B G 1434 P ? ? A C 1452 A G 1456 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.613 ? metalc1 metalc ? ? E CYS 26 SG ? ? ? 1_555 BA ZN . ZN ? ? D CYS 26 D ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.750 ? metalc2 metalc ? ? BA ZN . ZN ? ? ? 1_555 E CYS 31 SG ? ? D ZN 1001 D CYS 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.144 ? metalc3 metalc ? ? BA ZN . ZN ? ? ? 1_555 E LEU 19 O ? ? D ZN 1001 D LEU 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc4 metalc ? ? BA ZN . ZN ? ? ? 1_555 E CYS 12 SG ? ? D ZN 1001 D CYS 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc5 metalc ? ? BA ZN . ZN ? ? ? 1_555 E CYS 9 SG ? ? D ZN 1001 D CYS 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc6 metalc ? ? CA ZN . ZN ? ? ? 1_555 O CYS 43 SG ? ? N ZN 1001 N CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? metalc7 metalc ? ? CA ZN . ZN ? ? ? 1_555 O CYS 40 SG ? ? N ZN 1001 N CYS 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? metalc8 metalc ? ? CA ZN . ZN ? ? ? 1_555 O CYS 24 SG ? ? N ZN 1001 N CYS 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc9 metalc ? ? CA ZN . ZN ? ? ? 1_555 O CYS 27 SG ? ? N ZN 1001 N CYS 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? metalc10 metalc ? ? EA MG . MG ? ? ? 1_555 AA THR 25 OG1 ? ? Z MG 1001 Z THR 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? metalc11 metalc ? ? HA GDP . O2B ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? Z GDP 1407 Z MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? hydrog1 hydrog ? ? B G 8 N2 ? ? ? 1_555 B U 544 O4 ? ? A G 7 A U 560 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? hydrog2 hydrog ? ? B G 10 N1 ? ? ? 1_555 B C 26 N3 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? B G 10 N2 ? ? ? 1_555 B C 26 O2 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? B G 10 O6 ? ? ? 1_555 B C 26 N4 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog5 hydrog ? ? B A 11 N1 ? ? ? 1_555 B U 25 N3 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? B A 11 N6 ? ? ? 1_555 B U 25 O4 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog7 hydrog ? ? B G 12 N1 ? ? ? 1_555 B C 24 N3 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog8 hydrog ? ? B G 12 N2 ? ? ? 1_555 B C 24 O2 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog9 hydrog ? ? B G 12 O6 ? ? ? 1_555 B C 24 N4 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog10 hydrog ? ? B U 13 N3 ? ? ? 1_555 B G 23 O6 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog11 hydrog ? ? B U 13 O2 ? ? ? 1_555 B G 23 N1 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog12 hydrog ? ? B U 14 O4 ? ? ? 1_555 B U 21 N3 ? ? A U 13 A U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? hydrog13 hydrog ? ? B U 14 N3 ? ? ? 1_555 B A 893 N7 ? ? A U 13 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog14 hydrog ? ? B U 14 O4 ? ? ? 1_555 B A 893 N6 ? ? A U 13 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog15 hydrog ? ? B G 16 N1 ? ? ? 1_555 B U 898 O2 ? ? A G 15 A U 920 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog16 hydrog ? ? B G 16 O6 ? ? ? 1_555 B U 898 N3 ? ? A G 15 A U 920 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog17 hydrog ? ? B A 17 N6 ? ? ? 1_555 B A 897 N1 ? ? A A 16 A A 919 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? hydrog18 hydrog ? ? B U 18 N3 ? ? ? 1_555 B A 896 N1 ? ? A U 17 A A 918 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog19 hydrog ? ? B U 18 O4 ? ? ? 1_555 B A 896 N6 ? ? A U 17 A A 918 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog20 hydrog ? ? B U 18 O2 ? ? ? 1_555 B G 1062 N2 ? ? A U 17 A G 1079 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? hydrog21 hydrog ? ? B C 19 N3 ? ? ? 1_555 B G 895 N1 ? ? A C 18 A G 917 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog22 hydrog ? ? B C 19 N4 ? ? ? 1_555 B G 895 O6 ? ? A C 18 A G 917 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog23 hydrog ? ? B C 19 O2 ? ? ? 1_555 B G 895 N2 ? ? A C 18 A G 917 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog24 hydrog ? ? B C 20 N3 ? ? ? 1_555 B G 894 N1 ? ? A C 19 A G 916 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog25 hydrog ? ? B C 20 N4 ? ? ? 1_555 B G 894 O6 ? ? A C 19 A G 916 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog26 hydrog ? ? B C 20 O2 ? ? ? 1_555 B G 894 N2 ? ? A C 19 A G 916 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog27 hydrog ? ? B U 21 O2 ? ? ? 1_555 B A 893 N6 ? ? A U 20 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog28 hydrog ? ? B G 22 N2 ? ? ? 1_555 B A 892 N7 ? ? A G 21 A A 914 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog29 hydrog ? ? B G 22 N3 ? ? ? 1_555 B A 892 N6 ? ? A G 21 A A 914 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog30 hydrog ? ? B C 26 N4 ? ? ? 1_555 B A 543 N1 ? ? A C 25 A A 559 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-A MISPAIR' ? ? hydrog31 hydrog ? ? B A 27 N6 ? ? ? 1_555 B G 542 N3 ? ? A A 26 A G 558 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog32 hydrog ? ? B A 27 N7 ? ? ? 1_555 B G 542 N2 ? ? A A 26 A G 558 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog33 hydrog ? ? B G 28 N1 ? ? ? 1_555 B C 540 N3 ? ? A G 27 A C 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog34 hydrog ? ? B G 28 N2 ? ? ? 1_555 B C 540 O2 ? ? A G 27 A C 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog35 hydrog ? ? B G 28 O6 ? ? ? 1_555 B C 540 N4 ? ? A G 27 A C 556 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog36 hydrog ? ? B G 29 N1 ? ? ? 1_555 B C 539 N3 ? ? A G 28 A C 555 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog37 hydrog ? ? B G 29 N2 ? ? ? 1_555 B C 539 O2 ? ? A G 28 A C 555 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog38 hydrog ? ? B G 29 O6 ? ? ? 1_555 B C 539 N4 ? ? A G 28 A C 555 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog39 hydrog ? ? B G 30 N1 ? ? ? 1_555 B C 538 N3 ? ? A G 29 A C 554 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog40 hydrog ? ? B G 30 N2 ? ? ? 1_555 B C 538 O2 ? ? A G 29 A C 554 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog41 hydrog ? ? B G 30 O6 ? ? ? 1_555 B C 538 N4 ? ? A G 29 A C 554 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog42 hydrog ? ? B U 31 N3 ? ? ? 1_555 B A 537 N1 ? ? A U 30 A A 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog43 hydrog ? ? B U 31 O4 ? ? ? 1_555 B A 537 N6 ? ? A U 30 A A 553 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog44 hydrog ? ? B A 33 N1 ? ? ? 1_555 B U 536 N3 ? ? A A 32 A U 552 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog45 hydrog ? ? B A 33 N6 ? ? ? 1_555 B U 536 O4 ? ? A A 32 A U 552 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog46 hydrog ? ? B A 34 N1 ? ? ? 1_555 B U 535 N3 ? ? A A 33 A U 551 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog47 hydrog ? ? B A 34 N6 ? ? ? 1_555 B U 535 O4 ? ? A A 33 A U 551 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog48 hydrog ? ? B C 35 N3 ? ? ? 1_555 B G 534 N1 ? ? A C 34 A G 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog49 hydrog ? ? B C 35 N4 ? ? ? 1_555 B G 534 O6 ? ? A C 34 A G 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog50 hydrog ? ? B C 35 O2 ? ? ? 1_555 B G 534 N2 ? ? A C 34 A G 550 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog51 hydrog ? ? B G 36 N1 ? ? ? 1_555 B C 533 N3 ? ? A G 35 A C 549 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog52 hydrog ? ? B G 36 N2 ? ? ? 1_555 B C 533 O2 ? ? A G 35 A C 549 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog53 hydrog ? ? B G 36 O6 ? ? ? 1_555 B C 533 N4 ? ? A G 35 A C 549 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog54 hydrog ? ? B C 37 N3 ? ? ? 1_555 B G 532 N1 ? ? A C 36 A G 548 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog55 hydrog ? ? B C 37 N4 ? ? ? 1_555 B G 532 O6 ? ? A C 36 A G 548 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog56 hydrog ? ? B C 37 O2 ? ? ? 1_555 B G 532 N2 ? ? A C 36 A G 548 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog57 hydrog ? ? B U 38 N3 ? ? ? 1_555 B A 393 N1 ? ? A U 37 A A 397 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog58 hydrog ? ? B U 38 O2 ? ? ? 1_555 B A 393 N6 ? ? A U 37 A A 397 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? hydrog59 hydrog ? ? B G 40 N1 ? ? ? 1_555 B C 399 N3 ? ? A G 39 A C 403 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog60 hydrog ? ? B G 40 N2 ? ? ? 1_555 B C 399 O2 ? ? A G 39 A C 403 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog61 hydrog ? ? B G 40 O6 ? ? ? 1_555 B C 399 N4 ? ? A G 39 A C 403 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog62 hydrog ? ? B C 41 N3 ? ? ? 1_555 B G 398 N1 ? ? A C 40 A G 402 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog63 hydrog ? ? B C 41 N4 ? ? ? 1_555 B G 398 O6 ? ? A C 40 A G 402 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog64 hydrog ? ? B C 41 O2 ? ? ? 1_555 B G 398 N2 ? ? A C 40 A G 402 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog65 hydrog ? ? B G 42 N1 ? ? ? 1_555 B C 397 N3 ? ? A G 41 A C 401 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog66 hydrog ? ? B G 42 N2 ? ? ? 1_555 B C 397 O2 ? ? A G 41 A C 401 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog67 hydrog ? ? B G 42 O6 ? ? ? 1_555 B C 397 N4 ? ? A G 41 A C 401 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog68 hydrog ? ? B G 43 N1 ? ? ? 1_555 B C 396 N3 ? ? A G 42 A C 400 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog69 hydrog ? ? B G 43 N2 ? ? ? 1_555 B C 396 O2 ? ? 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TYPE_28_PAIR ? ? hydrog79 hydrog ? ? B U 46 O2 ? ? ? 1_555 B G 392 N1 ? ? A U 45 A G 396 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog80 hydrog ? ? B G 47 N1 ? ? ? 1_555 B C 391 N3 ? ? A G 46 A C 395 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog81 hydrog ? ? B G 47 N2 ? ? ? 1_555 B C 391 O2 ? ? A G 46 A C 395 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog82 hydrog ? ? B G 47 O6 ? ? ? 1_555 B C 391 N4 ? ? A G 46 A C 395 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog83 hydrog ? ? B C 48 N3 ? ? ? 1_555 B G 357 N1 ? ? A C 47 A G 361 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog84 hydrog ? ? B C 48 N4 ? ? ? 1_555 B G 357 O6 ? ? A C 47 A G 361 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog85 hydrog ? ? B C 48 O2 ? ? ? 1_555 B G 357 N2 ? ? A C 47 A G 361 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog86 hydrog ? ? B U 50 N3 ? ? ? 1_555 B G 358 N3 ? ? A U 49 A G 362 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? hydrog87 hydrog ? ? B U 50 O4 ? ? ? 1_555 B U 361 N3 ? ? A U 49 A U 365 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? hydrog188 hydrog ? ? B C 132 N3 ? ? ? 1_555 B G 222 N1 ? ? A C 137 A G 226 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog189 hydrog ? ? B C 132 N4 ? ? ? 1_555 B G 222 O6 ? ? A C 137 A G 226 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog190 hydrog ? ? B C 132 O2 ? ? ? 1_555 B G 222 N2 ? ? A C 137 A G 226 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog191 hydrog ? ? B G 133 N1 ? ? ? 1_555 B C 221 N3 ? ? A G 138 A C 225 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog192 hydrog ? ? B G 133 N2 ? ? ? 1_555 B C 221 O2 ? ? A G 138 A C 225 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog193 hydrog ? ? B G 133 O6 ? ? ? 1_555 B C 221 N4 ? ? A G 138 A C 225 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog194 hydrog ? ? B G 134 N1 ? ? ? 1_555 B C 220 N3 ? ? A G 139 A C 224 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog195 hydrog ? ? B G 134 N1 ? ? ? 1_555 B C 221 N3 ? ? A G 139 A C 225 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog196 hydrog ? ? B A 135 N1 ? ? ? 1_555 B U 219 N3 ? ? A A 140 A U 223 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog197 hydrog ? ? B A 135 N6 ? ? ? 1_555 B U 219 O4 ? ? A A 140 A U 223 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog198 hydrog ? ? B A 136 N1 ? ? ? 1_555 B U 218 N3 ? ? A A 141 A U 222 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-U PAIR' ? ? hydrog199 hydrog ? ? B G 137 N2 ? ? ? 1_555 B A 203 N3 ? ? A G 142 A A 196 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog200 hydrog ? ? B G 137 N1 ? ? ? 1_555 B C 217 N3 ? ? A G 142 A C 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog201 hydrog ? ? B G 137 N2 ? ? ? 1_555 B C 217 O2 ? ? A G 142 A C 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog202 hydrog ? ? B G 137 O6 ? ? ? 1_555 B C 217 N4 ? ? A G 142 A C 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog203 hydrog ? ? B G 139 N1 ? ? ? 1_555 B C 173 N3 ? ? A G 144 A C 178 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog204 hydrog ? ? B G 139 N2 ? ? ? 1_555 B C 173 O2 ? ? A G 144 A C 178 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog205 hydrog ? ? B G 139 O6 ? ? ? 1_555 B C 173 N4 ? ? A G 144 A C 178 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog206 hydrog ? ? B G 140 N2 ? ? ? 1_555 B C 172 O2 ? ? A G 145 A C 177 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog207 hydrog ? ? B G 141 N1 ? ? ? 1_555 B C 171 N3 ? ? A G 146 A C 176 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog208 hydrog ? ? B G 141 N2 ? ? ? 1_555 B C 171 O2 ? ? A G 146 A C 176 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog209 hydrog ? ? B G 141 O6 ? ? ? 1_555 B C 171 N4 ? ? A G 146 A C 176 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog210 hydrog ? ? B G 142 N1 ? ? ? 1_555 B C 170 N3 ? ? A G 147 A C 175 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog211 hydrog ? ? B G 142 N2 ? ? ? 1_555 B C 170 O2 ? ? A G 147 A C 175 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog212 hydrog ? ? B G 142 O6 ? ? ? 1_555 B C 170 N4 ? ? A G 147 A C 175 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog213 hydrog ? ? B G 143 N1 ? ? ? 1_555 B C 169 N3 ? ? A G 148 A C 174 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog214 hydrog ? ? B G 143 N2 ? ? ? 1_555 B C 169 O2 ? ? A G 148 A C 174 1_555 ? ? ? ? ? ? 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A G 158 A C 163 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog242 hydrog ? ? B G 153 O6 ? ? ? 1_555 B C 158 N4 ? ? A G 158 A C 163 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog243 hydrog ? ? B G 154 N2 ? ? ? 1_555 B A 157 N7 ? ? A G 159 A A 162 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog244 hydrog ? ? B A 174 N1 ? ? ? 1_555 B A 203 N6 ? ? A A 179 A A 196 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_5_PAIR ? ? hydrog245 hydrog ? ? B A 174 N6 ? ? ? 1_555 B A 203 N7 ? ? A A 179 A A 196 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_5_PAIR ? ? hydrog246 hydrog ? ? B U 175 N3 ? ? ? 1_555 B A 202 N7 ? ? A U 180 A A 195 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? hydrog247 hydrog ? ? B U 175 O2 ? ? ? 1_555 B A 202 N6 ? ? A U 180 A A 195 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? hydrog248 hydrog ? ? B U 175 O2 ? ? ? 1_555 B A 203 N6 ? ? A U 180 A A 196 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog249 hydrog ? ? B G 178 N1 ? ? ? 1_555 B C 201 N3 ? ? A G 183 A C 194 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog250 hydrog ? ? 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B G 206 O6 ? ? ? 1_555 B C 214 N4 ? ? A G 199 A C 218 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog278 hydrog ? ? B G 206 N1 ? ? ? 1_555 B C 215 N3 ? ? A G 199 A C 219 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog279 hydrog ? ? B G 206 N2 ? ? ? 1_555 B C 215 O2 ? ? A G 199 A C 219 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog280 hydrog ? ? B G 206 O6 ? ? ? 1_555 B C 215 N4 ? ? A G 199 A C 219 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog281 hydrog ? ? B G 207 O6 ? ? ? 1_555 B C 213 N4 ? ? A G 200 A C 217 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog282 hydrog ? ? B C 208 N4 ? ? ? 1_555 B U 210 O2 ? ? A C 201 A U 203 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-U MISPAIR' ? ? hydrog283 hydrog ? ? B C 208 N3 ? ? ? 1_555 B G 212 N2 ? ? A C 201 A G 216 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-G PAIR' ? ? hydrog284 hydrog ? ? B G 228 N2 ? ? ? 1_555 B A 259 N3 ? ? A G 232 A A 263 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog285 hydrog ? ? B C 236 N3 ? ? ? 1_555 B G 282 N1 ? ? A C 240 A G 286 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog286 hydrog ? ? B C 236 N4 ? ? ? 1_555 B G 282 O6 ? ? A C 240 A G 286 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog287 hydrog ? ? B C 236 O2 ? ? ? 1_555 B G 282 N2 ? ? A C 240 A G 286 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog288 hydrog ? ? B C 237 N3 ? ? ? 1_555 B G 281 N1 ? ? A C 241 A G 285 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog289 hydrog ? ? B C 237 N4 ? ? ? 1_555 B G 281 O6 ? ? A C 241 A G 285 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog290 hydrog ? ? B C 237 O2 ? ? ? 1_555 B G 281 N2 ? ? A C 241 A G 285 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog291 hydrog ? ? B C 238 N3 ? ? ? 1_555 B G 280 N1 ? ? A C 242 A G 284 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog292 hydrog ? ? B C 238 N4 ? ? ? 1_555 B G 280 O6 ? ? A C 242 A G 284 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog293 hydrog ? ? B C 238 O2 ? ? ? 1_555 B G 280 N2 ? ? A C 242 A G 284 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog294 hydrog ? ? B A 239 N1 ? ? ? 1_555 B A 278 N6 ? ? A A 243 A A 282 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_5_PAIR ? ? hydrog295 hydrog ? ? 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SER C 20 ARG C 21 CA 2 ILE D 57 ? GLU D 58 ? ILE C 57 GLU C 58 CB 1 ASN D 63 ? VAL D 64 ? ASN C 63 VAL C 64 CB 2 ASN D 98 ? VAL D 99 ? ASN C 98 VAL C 99 CC 1 THR D 67 ? HIS D 69 ? THR C 67 HIS C 69 CC 2 ASN D 102 ? GLN D 104 ? ASN C 102 GLN C 104 CD 1 ARG D 164 ? GLY D 171 ? ARG C 164 GLY C 171 CD 2 GLY D 148 ? GLY D 155 ? GLY C 148 GLY C 155 CD 3 VAL D 198 ? PHE D 203 ? VAL C 198 PHE C 203 CD 4 ILE D 182 ? PHE D 186 ? ILE C 182 PHE C 186 CE 1 ARG D 190 ? THR D 191 ? ARG C 190 THR C 191 CE 2 GLY D 194 ? VAL D 195 ? GLY C 194 VAL C 195 DA 1 THR E 127 ? VAL E 128 ? THR D 127 VAL D 128 DA 2 ARG E 131 ? ARG E 132 ? ARG D 131 ARG D 132 EA 1 LYS F 9 ? MET F 19 ? LYS E 9 MET E 19 EA 2 ARG F 24 ? GLY F 35 ? ARG E 24 GLY E 35 EA 3 ARG F 40 ? ALA F 48 ? ARG E 40 ALA E 48 EA 4 MET F 66 ? GLU F 68 ? MET E 66 GLU E 68 EB 1 ILE F 80 ? PHE F 84 ? ILE E 80 PHE E 84 EB 2 SER F 87 ? PRO F 93 ? SER E 87 PRO E 93 EB 3 ILE F 118 ? GLY F 124 ? ILE E 118 GLY E 124 EB 4 VAL F 100 ? ILE F 101 ? 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N GLU J 95 O ARG K 9 ? O ARG J 9 JC 2 3 N GLY K 10 ? N GLY J 10 O HIS K 68 ? O HIS J 68 JC 3 4 N LEU K 71 ? N LEU J 71 O ILE K 38 ? O ILE J 38 NA 1 2 N ARG O 57 ? N ARG N 57 O GLU K 64 ? O GLU J 64 KA 1 2 N SER L 43 ? N SER K 43 O VAL L 30 ? O VAL K 30 KA 2 3 N THR L 33 ? N THR K 33 O ARG L 18 ? O ARG K 18 KA 3 4 N GLY L 17 ? N GLY K 17 O SER L 79 ? O SER K 79 KA 4 5 O VAL L 80 ? O VAL K 80 N LYS L 106 ? N LYS K 106 KA 5 6 N ASP L 110 ? N ASP K 110 O LEU S 85 ? O LEU R 85 LA 1 2 N ILE M 85 ? N ILE L 85 O ARG M 33 ? O ARG L 33 LA 2 3 N THR M 38 ? N THR L 38 O LYS M 57 ? O LYS L 57 LA 3 4 N VAL M 58 ? N VAL L 58 O VAL M 66 ? O VAL L 66 LA 4 5 O THR M 67 ? O THR L 67 N ARG M 97 ? N ARG L 97 NB 1 2 N TYR O 34 ? N TYR N 34 O LEU O 39 ? O LEU N 39 PA 1 2 N ARG Q 5 ? N ARG P 5 O VAL Q 20 ? O VAL P 20 PA 2 3 N VAL Q 21 ? N VAL P 21 O GLU Q 34 ? O GLU P 34 PB 1 2 N TYR Q 38 ? N TYR P 38 O LYS Q 50 ? O LYS P 50 QA 1 2 N GLY R 8 ? N GLY Q 8 O VAL R 57 ? O VAL Q 57 QA 2 3 N ILE R 60 ? 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Z GDP 1407 ? 1_555 83.5 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2012-03-28 2 'Structure model' 1 1 2012-10-03 3 'Structure model' 1 2 2014-12-10 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 2 3 'Structure model' repository Obsolete ? # _pdbx_audit_revision_group.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal 2 _pdbx_audit_revision_group.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_group.group 'Derived calculations' # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal CNS refinement 1.2 ? 1 XDS 'data reduction' . ? 2 XDS 'data scaling' . ? 3 PHASER phasing . ? 4 # _pdbx_database_remark.id 700 _pdbx_database_remark.text ; SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "QA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 5-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 6-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEETS PRESENTED AS "ZG" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 6-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 7-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. ; # _pdbx_entry_details.entry_id 4ABR _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ;KIRROMYCIN (KIR): IDENTICAL TO THE COMPOUND USED E.G. IN 2Y10. ; _pdbx_entry_details.sequence_details ;THE TMRNADELTA CONSTRUCT WAS TRANSCRIBED IN VITRO USING T7 RNA POLYMERASE (5). THE CONSTRUCT WAS BASED ON THE T. THERMOPHILUS SSRA GENE SEQUENCE, CONTAINING RESIDUES 1-37 AND 302-349 LINKED VIA A UUCG LOOP, AND INCLUDED FOUR POINT MUTATIONS (G21A, C317U, G323U, C337A) TO ENSURE HOMOGENOUS FOLDING ; # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 "O3'" Y A 89 ? ? C Y ALA 90 ? ? 1.33 2 1 O D GLY 109 ? ? N D ALA 111 ? ? 2.11 3 1 OD1 D ASN 103 ? ? NE D ARG 114 ? ? 2.16 4 1 O M LEU 90 ? ? N M HIS 92 ? ? 2.18 5 1 O H LYS 21 ? ? OH H TYR 65 ? ? 2.18 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 P Y G 1 ? ? OP3 Y G 1 ? ? 1.525 1.607 -0.082 0.012 N 2 1 C2 Y G 12 ? ? N2 Y G 12 ? ? 1.205 1.341 -0.136 0.010 N 3 1 P Y C 40 ? ? OP3 Y C 40 ? ? 1.524 1.607 -0.083 0.012 N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 N1 A U 56 ? ? "C1'" A U 56 ? ? "C2'" A U 56 ? ? 123.13 114.00 9.13 1.30 N 2 1 "C2'" A A 60 ? ? "C3'" A A 60 ? ? "O3'" A A 60 ? ? 123.48 113.70 9.78 1.60 N 3 1 "C2'" A A 109 ? ? "C3'" A A 109 ? ? "O3'" A A 109 ? ? 124.38 113.70 10.68 1.60 N 4 1 "C2'" A G 115 ? ? "C3'" A G 115 ? ? "O3'" A G 115 ? ? 130.64 113.70 16.94 1.60 N 5 1 "C2'" A G 266 ? ? "C3'" A G 266 ? ? "O3'" A G 266 ? ? 123.97 113.70 10.27 1.60 N 6 1 N1 A C 328 ? ? "C1'" A C 328 ? ? "C2'" A C 328 ? ? 122.51 114.00 8.51 1.30 N 7 1 N9 A G 484 ? ? "C1'" A G 484 ? ? "C2'" A G 484 ? ? 122.45 114.00 8.45 1.30 N 8 1 N1 A U 498 ? ? "C1'" A U 498 ? ? "C2'" A U 498 ? ? 104.59 112.00 -7.41 1.10 N 9 1 "C2'" A G 575 ? ? "C3'" A G 575 ? ? "O3'" A G 575 ? ? 129.25 113.70 15.55 1.60 N 10 1 "C2'" A A 687 ? ? "C3'" A A 687 ? ? "O3'" A A 687 ? ? 124.32 113.70 10.62 1.60 N 11 1 N9 A G 966 ? ? "C1'" A G 966 ? ? "C2'" A G 966 ? ? 101.58 112.00 -10.42 1.10 N 12 1 N9 A G 1050 ? ? "C1'" A G 1050 ? ? 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