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THIS FILE CONTAINS THE 30S, THE P- SITE TRNA AND THE TNAC LEADER PEPTIDE (PART 1 OF ). ; PDB 2VHP unspecified 'STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME' PDB 1P87 unspecified ;REAL SPACE REFINED COORDINATES OF THE 30S SUBUNIT FITTEDINTO THE LOW RESOLUTION CRYO-EM MAP OF THE INITIATION-LIKESTATE OF E. COLI 70S RIBOSOME ; # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Boehringer, D.' 1 ? ;O'Farrell, H.C. ; 2 ? 'Rife, J.P.' 3 ? 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;ARIAGINIPDHKHAVIALTSIYGVGKTRSKAILAAAGIAEDVKISELSEGQIDTLRDEVAKFVVEGDLRREISMSIKRLM DLGCYRGLRHRRGLPVRGQRTKTNARTRKGPRKPIKK ; ;ARIAGINIPDHKHAVIALTSIYGVGKTRSKAILAAAGIAEDVKISELSEGQIDTLRDEVAKFVVEGDLRREISMSIKRLM DLGCYRGLRHRRGLPVRGQRTKTNARTRKGPRKPIKK ; M ? 14 'polypeptide(L)' no no ;AKQSMKAREVKRVALADKYFAKRAELKAIISDVNASDEDRWNAVLKLQTLPRDSSPSRQRNRCRQTGRPHGFLRKFGLSR IKVREAAMRGEIPGLKKASW ; ;AKQSMKAREVKRVALADKYFAKRAELKAIISDVNASDEDRWNAVLKLQTLPRDSSPSRQRNRCRQTGRPHGFLRKFGLSR IKVREAAMRGEIPGLKKASW ; N ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MSLSTEATAKIVSEFGRDANDTGSTEVQVALLTAQINHLQGHFAEHKKDHHSRRGLLRMVSQRRKLLDYLKRKDVARYTR LIERLGLRR ; ;MSLSTEATAKIVSEFGRDANDTGSTEVQVALLTAQINHLQGHFAEHKKDHHSRRGLLRMVSQRRKLLDYLKRKDVARYTR LIERLGLRR ; O ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MVTIRLARHGAKKRPFYQVVVADSRNARNGRFIERVGFFNPIASEKEEGTRLDLDRIAHWVGQGATISDRVAALIKEVNK AA ; ;MVTIRLARHGAKKRPFYQVVVADSRNARNGRFIERVGFFNPIASEKEEGTRLDLDRIAHWVGQGATISDRVAALIKEVNK AA ; P ? 17 'polypeptide(L)' no no ;TDKIRTLQGRVVSDKMEKSIVVAIERFVKHPIYGKFIKRTTKLHVHDENNECGIGDVVEIRECRPLSKTKSWTLVRVVEK AVL ; ;TDKIRTLQGRVVSDKMEKSIVVAIERFVKHPIYGKFIKRTTKLHVHDENNECGIGDVVEIRECRPLSKTKSWTLVRVVEK AVL ; Q ? 18 'polypeptide(L)' no no ARYFRRRKFCRFTAEGVQEIDYKDIATLKNYITESGKIVPSRITGTRAKYQRQLARAIKRARYLSLLPYTDRHQ ARYFRRRKFCRFTAEGVQEIDYKDIATLKNYITESGKIVPSRITGTRAKYQRQLARAIKRARYLSLLPYTDRHQ R ? 19 'polypeptide(L)' no no ;PRSLKKGPFIDLHLLKKVEKAVESGDKKPLRTWSRRSTIFPNMIGLTIAVHNGRQHVPVFVTDEMVGHKLGEFAPTRTYR GHAADKKAKKK ; ;PRSLKKGPFIDLHLLKKVEKAVESGDKKPLRTWSRRSTIFPNMIGLTIAVHNGRQHVPVFVTDEMVGHKLGEFAPTRTYR GHAADKKAKKK ; S ? 20 'polypeptide(L)' no no ;ANIKSAKKRAIQSEKARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIEAGDKAAAQKAFNEMQPIVDRQAAKGLIHKNKAARHKANLTA QINKLA ; ;ANIKSAKKRAIQSEKARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIEAGDKAAAQKAFNEMQPIVDRQAAKGLIHKNKAARHKANLTA QINKLA ; T ? 21 'polypeptide(L)' no no MPVIKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGVLAEVRRREFYEKPTTERKRAKASAVKRHAKKLARENARRTRLY MPVIKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGVLAEVRRREFYEKPTTERKRAKASAVKRHAKKLARENARRTRLY U ? 22 'polypeptide(L)' no no ;QNFLNDQFVIDSIVSAINPQKGQAMVEIGPGLAALTEPVGERLDQLTVIELDRDLAARLQTHPFLGPKLTIYQQDAMTFN FGELAEKMGQPLRVFGNLPYNISTPLMFHLFSYTDAIADMHFMLQKEVVNRLVAGPNSKAYGRLSVMAQYYCNVIPVLEV PPSAFTPPPKVDSAVVRLVPHATMPHPVKDVRVLSRITTEAFNQRRKTIRNSLGNLFSVEVLTGMGIDPAMRAENISVAQ YCQMANYLAENA ; ;QNFLNDQFVIDSIVSAINPQKGQAMVEIGPGLAALTEPVGERLDQLTVIELDRDLAARLQTHPFLGPKLTIYQQDAMTFN FGELAEKMGQPLRVFGNLPYNISTPLMFHLFSYTDAIADMHFMLQKEVVNRLVAGPNSKAYGRLSVMAQYYCNVIPVLEV PPSAFTPPPKVDSAVVRLVPHATMPHPVKDVRVLSRITTEAFNQRRKTIRNSLGNLFSVEVLTGMGIDPAMRAENISVAQ YCQMANYLAENA ; V ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 23 _pdbx_entity_nonpoly.name water _pdbx_entity_nonpoly.comp_id HOH # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 A n 1 2 A n 1 3 A n 1 4 U n 1 5 U n 1 6 G n 1 7 A n 1 8 A n 1 9 G n 1 10 A n 1 11 G n 1 12 U n 1 13 U n 1 14 U n 1 15 G n 1 16 A n 1 17 U n 1 18 C n 1 19 A n 1 20 U n 1 21 G n 1 22 G n 1 23 C n 1 24 U n 1 25 C n 1 26 A n 1 27 G n 1 28 A n 1 29 U n 1 30 U n 1 31 G n 1 32 A n 1 33 A n 1 34 C n 1 35 G n 1 36 C n 1 37 U n 1 38 G n 1 39 G n 1 40 C n 1 41 G n 1 42 G n 1 43 C n 1 44 A n 1 45 G n 1 46 G n 1 47 C n 1 48 C n 1 49 U n 1 50 A n 1 51 A n 1 52 C n 1 53 A n 1 54 C n 1 55 A n 1 56 U n 1 57 G n 1 58 C n 1 59 A n 1 60 A n 1 61 G n 1 62 U n 1 63 C n 1 64 G n 1 65 A n 1 66 A n 1 67 C n 1 68 G n 1 69 G n 1 70 U n 1 71 A n 1 72 A n 1 73 C n 1 74 A n 1 75 G n 1 76 G n 1 77 A n 1 78 A n 1 79 G n 1 80 A n 1 81 A n 1 82 G n 1 83 C n 1 84 U n 1 85 U n 1 86 G n 1 87 C n 1 88 U n 1 89 U n 1 90 C n 1 91 U n 1 92 U n 1 93 U n 1 94 G n 1 95 C n 1 96 U n 1 97 G n 1 98 A n 1 99 C n 1 100 G n 1 101 A n 1 102 G n 1 103 U n 1 104 G n 1 105 G n 1 106 C n 1 107 G n 1 108 G n 1 109 A n 1 110 C n 1 111 G n 1 112 G n 1 113 G n 1 114 U n 1 115 G n 1 116 A n 1 117 G n 1 118 U n 1 119 A n 1 120 A n 1 121 U n 1 122 G n 1 123 U n 1 124 C n 1 125 U n 1 126 G n 1 127 G n 1 128 G n 1 129 A n 1 130 A n 1 131 A n 1 132 C n 1 133 U n 1 134 G n 1 135 C n 1 136 C n 1 137 U n 1 138 G n 1 139 A n 1 140 U n 1 141 G n 1 142 G n 1 143 A n 1 144 G n 1 145 G n 1 146 G n 1 147 G n 1 148 G n 1 149 A n 1 150 U n 1 151 A n 1 152 A n 1 153 C n 1 154 U n 1 155 A n 1 156 C n 1 157 U n 1 158 G n 1 159 G n 1 160 A n 1 161 A n 1 162 A n 1 163 C n 1 164 G n 1 165 G n 1 166 U n 1 167 A n 1 168 G n 1 169 C n 1 170 U n 1 171 A n 1 172 A n 1 173 U n 1 174 A n 1 175 C n 1 176 C n 1 177 G n 1 178 C n 1 179 A n 1 180 U n 1 181 A n 1 182 A n 1 183 C n 1 184 G n 1 185 U n 1 186 C n 1 187 G n 1 188 C n 1 189 A n 1 190 A n 1 191 G n 1 192 A n 1 193 C n 1 194 C n 1 195 A n 1 196 A n 1 197 A n 1 198 G n 1 199 A n 1 200 G n 1 201 G n 1 202 G n 1 203 G n 1 204 G n 1 205 A n 1 206 C n 1 207 C n 1 208 U n 1 209 U n 1 210 C n 1 211 G n 1 212 G n 1 213 G n 1 214 C n 1 215 C n 1 216 U n 1 217 C n 1 218 U n 1 219 U n 1 220 G n 1 221 C n 1 222 C n 1 223 A n 1 224 U n 1 225 C n 1 226 G n 1 227 G n 1 228 A n 1 229 U n 1 230 G n 1 231 U n 1 232 G n 1 233 C n 1 234 C n 1 235 C n 1 236 A n 1 237 G n 1 238 A n 1 239 U n 1 240 G n 1 241 G n 1 242 G n 1 243 A n 1 244 U n 1 245 U n 1 246 A n 1 247 G n 1 248 C n 1 249 U n 1 250 A n 1 251 G n 1 252 U n 1 253 A n 1 254 G n 1 255 G n 1 256 U n 1 257 G n 1 258 G n 1 259 G n 1 260 G n 1 261 U n 1 262 A n 1 263 A n 1 264 C n 1 265 G n 1 266 G n 1 267 C n 1 268 U n 1 269 C n 1 270 A n 1 271 C n 1 272 C n 1 273 U n 1 274 A n 1 275 G n 1 276 G n 1 277 C n 1 278 G n 1 279 A n 1 280 C n 1 281 G n 1 282 A n 1 283 U n 1 284 C n 1 285 C n 1 286 C n 1 287 U n 1 288 A n 1 289 G n 1 290 C n 1 291 U n 1 292 G n 1 293 G n 1 294 U n 1 295 C n 1 296 U n 1 297 G n 1 298 A n 1 299 G n 1 300 A n 1 301 G n 1 302 G n 1 303 A n 1 304 U n 1 305 G n 1 306 A n 1 307 C n 1 308 C n 1 309 A n 1 310 G n 1 311 C n 1 312 C n 1 313 A n 1 314 C n 1 315 A n 1 316 C n 1 317 U n 1 318 G n 1 319 G n 1 320 A n 1 321 A n 1 322 C n 1 323 U n 1 324 G n 1 325 A n 1 326 G n 1 327 A n 1 328 C n 1 329 A n 1 330 C n 1 331 G n 1 332 G n 1 333 U n 1 334 C n 1 335 C n 1 336 A n 1 337 G n 1 338 A n 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P06992 17 ? 268 ? 17 268 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 22-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 22 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASN B 41 ? 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N3 A U 1078 ? ? 1.21 125 1 N1 A G 858 ? ? N B PRO 24 ? ? 1.21 126 1 C2 A G 15 ? ? N3 A A 1080 ? ? 1.21 127 1 "O4'" A A 831 ? ? CB B THR 19 ? ? 1.21 128 1 "C1'" A G 1517 ? ? CG V GLN 141 ? ? 1.22 129 1 N3 A G 15 ? ? N3 A A 1080 ? ? 1.22 130 1 "C5'" A G 829 ? ? CA B ILE 30 ? ? 1.22 131 1 "C5'" A U 828 ? ? CB B PRO 28 ? ? 1.23 132 1 N2 A G 15 ? ? C4 A A 1080 ? ? 1.23 133 1 N3 A U 17 ? ? C5 A U 1078 ? ? 1.23 134 1 C5 A U 828 ? ? CA B MET 26 ? ? 1.23 135 1 "C2'" A A 16 ? ? "C1'" A G 1079 ? ? 1.24 136 1 "O3'" A U 828 ? ? N B PHE 29 ? ? 1.24 137 1 "O2'" A G 830 ? ? N B THR 19 ? ? 1.24 138 1 "C2'" A A 1081 ? ? CE E LYS 22 ? ? 1.24 139 1 C5 A A 831 ? ? CD B ARG 20 ? ? 1.24 140 1 "C1'" A A 16 ? ? "O2'" A G 1079 ? ? 1.24 141 1 C6 A U 828 ? ? N B LYS 27 ? ? 1.24 142 1 O2 A U 828 ? ? CE B MET 26 ? ? 1.24 143 1 "C5'" A G 859 ? ? CA B ASP 191 ? ? 1.25 144 1 OP1 A G 830 ? ? C B HIS 38 ? ? 1.25 145 1 C6 A G 858 ? ? CD B PRO 24 ? ? 1.25 146 1 "C2'" A U 17 ? ? "C1'" A U 1078 ? ? 1.26 147 1 "O2'" A A 16 ? ? "C2'" A G 1079 ? ? 1.27 148 1 C8 A G 832 ? ? NH1 B ARG 20 ? ? 1.27 149 1 "C3'" A A 1080 ? ? CA E LYS 22 ? ? 1.28 150 1 "C1'" A U 17 ? ? "C2'" A U 1078 ? ? 1.29 151 1 "O5'" A A 1080 ? ? C E SER 21 ? ? 1.29 152 1 "O5'" A G 1514 ? ? O V HOH 312 ? ? 1.29 153 1 C5 A U 17 ? ? N3 A U 1078 ? ? 1.29 154 1 "O4'" A A 16 ? ? "O2'" A G 1079 ? ? 1.29 155 1 C4 A U 17 ? ? C4 A U 1078 ? ? 1.29 156 1 OP1 A G 1514 ? ? NH2 V ARG 222 ? ? 1.30 157 1 C4 A G 859 ? ? C B LYS 25 ? ? 1.30 158 1 "C4'" A A 1080 ? ? N E LYS 22 ? ? 1.30 159 1 "C4'" A A 1080 ? ? C E SER 21 ? ? 1.31 160 1 C4 A G 15 ? ? N3 A A 1080 ? ? 1.31 161 1 "C2'" A A 16 ? ? "C2'" A G 1079 ? ? 1.31 162 1 C6 A G 829 ? ? CD2 B TRP 22 ? ? 1.32 163 1 O2 A C 857 ? ? C B TYR 21 ? ? 1.32 164 1 "C5'" A U 828 ? ? N B PRO 28 ? ? 1.32 165 1 N1 A G 829 ? ? CB B TRP 22 ? ? 1.32 166 1 OP2 A A 831 ? ? CA B VAL 37 ? ? 1.33 167 1 N2 A G 830 ? ? N B TYR 21 ? ? 1.33 168 1 C5 A U 828 ? ? N B LYS 27 ? ? 1.33 169 1 "O2'" A U 828 ? ? CG B PHE 29 ? ? 1.33 170 1 N2 A G 15 ? ? N7 A A 1080 ? ? 1.33 171 1 "C2'" A G 858 ? ? OD1 B ASN 23 ? ? 1.33 172 1 N7 A G 1517 ? ? CB V TYR 116 ? ? 1.34 173 1 "C1'" A A 16 ? ? "C2'" A G 1079 ? ? 1.34 174 1 C2 A G 859 ? ? O B LYS 25 ? ? 1.34 175 1 OP1 A A 1081 ? ? N E ILE 29 ? ? 1.34 176 1 C2 A U 17 ? ? C5 A U 1078 ? ? 1.35 177 1 N3 A G 858 ? ? CA B ASN 23 ? ? 1.35 178 1 "C1'" A A 1518 ? ? CB V VAL 187 ? ? 1.36 179 1 "O2'" A G 859 ? ? CB B PRO 192 ? ? 1.36 180 1 "C2'" A G 830 ? ? O B GLN 18 ? ? 1.36 181 1 OP2 A G 830 ? ? CB B HIS 38 ? ? 1.37 182 1 N1 A G 830 ? ? O B ARG 20 ? ? 1.37 183 1 "C4'" A G 859 ? ? CD B PRO 192 ? ? 1.37 184 1 N2 A G 858 ? ? O B ASN 23 ? ? 1.37 185 1 N3 A A 831 ? ? CB B ARG 20 ? ? 1.38 186 1 C5 A A 831 ? ? CG B ARG 20 ? ? 1.38 187 1 N1 A G 829 ? ? CG B TRP 22 ? ? 1.38 188 1 "O5'" A A 831 ? ? CA B VAL 37 ? ? 1.38 189 1 C6 A U 828 ? ? C B MET 26 ? ? 1.38 190 1 N3 A G 858 ? ? O B ASN 23 ? ? 1.38 191 1 N3 A G 858 ? ? N B PRO 24 ? ? 1.39 192 1 C8 A G 829 ? ? CD1 B ILE 30 ? ? 1.39 193 1 "C4'" A A 1081 ? ? CG E LYS 22 ? ? 1.39 194 1 C6 A G 859 ? ? O B LYS 25 ? ? 1.40 195 1 "C3'" A A 1518 ? ? CB V VAL 187 ? ? 1.40 196 1 "C2'" A A 16 ? ? "O2'" A G 1079 ? ? 1.40 197 1 N2 A G 15 ? ? C8 A A 1080 ? ? 1.40 198 1 C2 A G 858 ? ? O B ASN 23 ? ? 1.41 199 1 "C2'" A G 1517 ? ? CD V GLN 141 ? ? 1.41 200 1 N7 A G 861 ? ? OD2 B ASP 193 ? ? 1.41 201 1 "O5'" A A 860 ? ? N B ASP 193 ? ? 1.42 202 1 C4 A C 857 ? ? CD1 B TRP 22 ? ? 1.42 203 1 N2 A G 15 ? ? N9 A A 1080 ? ? 1.42 204 1 "O2'" A A 1518 ? ? CB V VAL 187 ? ? 1.42 205 1 "C4'" A A 16 ? ? "O2'" A G 1079 ? ? 1.42 206 1 "C4'" A U 828 ? ? N B PHE 29 ? ? 1.43 207 1 "C3'" A U 828 ? ? CA B PHE 29 ? ? 1.43 208 1 "O3'" A U 17 ? ? "O2'" A U 1078 ? ? 1.43 209 1 "C4'" A U 828 ? ? C B PRO 28 ? ? 1.43 210 1 N3 A A 16 ? ? C5 A G 1079 ? ? 1.43 211 1 C4 A G 858 ? ? N B PRO 24 ? ? 1.43 212 1 C4 A G 858 ? ? CD B PRO 24 ? ? 1.43 213 1 OP2 A G 832 ? ? CB B LYS 36 ? ? 1.44 214 1 N9 A A 831 ? ? N B ARG 20 ? ? 1.44 215 1 "O3'" A G 1079 ? ? CG1 E VAL 20 ? ? 1.44 216 1 N3 A G 15 ? ? C4 A A 1080 ? ? 1.44 217 1 "C2'" A G 859 ? ? CG B PRO 192 ? ? 1.44 218 1 N1 A A 16 ? ? C5 A G 1079 ? ? 1.45 219 1 N1 A C 857 ? ? O B TYR 21 ? ? 1.45 220 1 "C1'" A A 831 ? ? OG1 B THR 19 ? ? 1.45 221 1 O6 A G 859 ? ? O B PRO 24 ? ? 1.45 222 1 C2 A G 869 ? ? CG B LYS 25 ? ? 1.45 223 1 N4 A C 857 ? ? CE2 B TRP 22 ? ? 1.46 224 1 C4 A G 858 ? ? CA B ASN 23 ? ? 1.46 225 1 "C4'" A A 831 ? ? CB B THR 19 ? ? 1.47 226 1 C2 A A 16 ? ? C6 A G 1079 ? ? 1.47 227 1 C6 A G 859 ? ? C B LYS 25 ? ? 1.47 228 1 C5 A A 831 ? ? CB B ARG 20 ? ? 1.47 229 1 N7 A A 1518 ? ? NE2 V GLN 141 ? ? 1.48 230 1 C6 A G 15 ? ? N1 A A 1080 ? ? 1.48 231 1 C6 A G 858 ? ? CB B PRO 24 ? ? 1.48 232 1 C6 A U 17 ? ? C2 A U 1078 ? ? 1.48 233 1 N9 A A 831 ? ? CB B ARG 20 ? ? 1.48 234 1 "C4'" A A 1518 ? ? CG2 V VAL 187 ? ? 1.49 235 1 "O5'" A G 829 ? ? O B PHE 29 ? ? 1.49 236 1 C4 A G 858 ? ? C B ASN 23 ? ? 1.50 237 1 OP1 A A 860 ? ? N B ASP 193 ? ? 1.50 238 1 "C1'" A A 1519 ? ? O V LYS 186 ? ? 1.50 239 1 N7 A A 831 ? ? CD B ARG 20 ? ? 1.50 240 1 "O2'" A G 1517 ? ? CA V GLN 141 ? ? 1.51 241 1 "C3'" A A 831 ? ? OG1 B THR 19 ? ? 1.51 242 1 "C2'" A U 828 ? ? CA B PHE 29 ? ? 1.51 243 1 "O2'" A G 858 ? ? OD1 B ASN 23 ? ? 1.51 244 1 C8 A G 1517 ? ? CB V TYR 116 ? ? 1.51 245 1 "O5'" A A 860 ? ? CA B ASP 193 ? ? 1.52 246 1 N1 A G 15 ? ? N3 A A 1080 ? ? 1.52 247 1 N3 A U 828 ? ? CA B MET 26 ? ? 1.52 248 1 O4 A U 828 ? ? CB B MET 26 ? ? 1.52 249 1 OP2 A G 829 ? ? N B ILE 30 ? ? 1.52 250 1 O6 A G 829 ? ? CE2 B TRP 22 ? ? 1.53 251 1 "C2'" A U 17 ? ? "C4'" A U 1078 ? ? 1.53 252 1 C5 A G 15 ? ? C2 A A 1080 ? ? 1.53 253 1 "C5'" A A 1081 ? ? O E LYS 22 ? ? 1.54 254 1 O6 A G 858 ? ? CB B PRO 24 ? ? 1.54 255 1 OP1 A U 1073 ? ? CE E LYS 61 ? ? 1.54 256 1 C2 A G 15 ? ? C5 A A 1080 ? ? 1.54 257 1 C5 A G 832 ? ? NH1 B ARG 20 ? ? 1.54 258 1 "C1'" A U 828 ? ? CD2 B PHE 29 ? ? 1.54 259 1 C2 A G 829 ? ? CB B TRP 22 ? ? 1.55 260 1 N7 A A 16 ? ? N2 A G 1079 ? ? 1.55 261 1 C4 A U 828 ? ? C B MET 26 ? ? 1.55 262 1 "O5'" A A 1081 ? ? CB E LYS 22 ? ? 1.55 263 1 N7 A G 858 ? ? CD B PRO 24 ? ? 1.55 264 1 C2 A A 16 ? ? N7 A G 1079 ? ? 1.55 265 1 "O3'" A G 830 ? ? CB B VAL 37 ? ? 1.55 266 1 C5 A U 17 ? ? C2 A U 1078 ? ? 1.56 267 1 "O2'" A G 829 ? ? CG2 B THR 188 ? ? 1.56 268 1 N1 A G 15 ? ? C6 A A 1080 ? ? 1.57 269 1 "O2'" A G 858 ? ? CB B ASN 23 ? ? 1.57 270 1 O U ALA 14 ? ? NE U ARG 16 ? ? 1.57 271 1 P A G 1514 ? ? NH2 V ARG 222 ? ? 1.57 272 1 C6 A G 858 ? ? N B PRO 24 ? ? 1.58 273 1 CD B LYS 44 ? ? NZ H LYS 21 ? ? 1.58 274 1 "C3'" A A 1081 ? ? CE E LYS 22 ? ? 1.58 275 1 OP1 A A 860 ? ? CA B ASP 193 ? ? 1.58 276 1 OP1 A A 1081 ? ? CG1 E ILE 29 ? ? 1.59 277 1 C6 A A 831 ? ? CZ B ARG 20 ? ? 1.59 278 1 C2 A G 858 ? ? CA B PRO 24 ? ? 1.59 279 1 N9 A A 831 ? ? CG B ARG 20 ? ? 1.59 280 1 C5 A U 828 ? ? O B MET 26 ? ? 1.59 281 1 "O4'" A A 831 ? ? CA B THR 19 ? ? 1.59 282 1 "C2'" A U 17 ? ? "O4'" A U 1078 ? ? 1.59 283 1 N1 A A 831 ? ? CZ B ARG 20 ? ? 1.59 284 1 "O2'" A U 870 ? ? NZ B LYS 27 ? ? 1.59 285 1 C5 A A 16 ? ? N2 A G 1079 ? ? 1.60 286 1 "O2'" A U 828 ? ? CA B PHE 29 ? ? 1.60 287 1 "O5'" A G 1514 ? ? NH2 V ARG 222 ? ? 1.60 288 1 "C2'" A G 829 ? ? CG2 B THR 188 ? ? 1.60 289 1 "C1'" A A 1081 ? ? CG E LYS 22 ? ? 1.60 290 1 O2 A C 857 ? ? O B TRP 22 ? ? 1.60 291 1 N9 A A 831 ? ? CA B ARG 20 ? ? 1.60 292 1 "C2'" A A 831 ? ? OG1 B THR 19 ? ? 1.60 293 1 N9 A G 830 ? ? NE2 B HIS 38 ? ? 1.61 294 1 C5 A G 858 ? ? N B PRO 24 ? ? 1.61 295 1 O2 A U 17 ? ? C5 A U 1078 ? ? 1.61 296 1 "C2'" A G 858 ? ? CB B ASN 23 ? ? 1.61 297 1 N7 A G 859 ? ? CB B LYS 25 ? ? 1.61 298 1 OP2 A G 1517 ? ? NH2 V ARG 147 ? ? 1.61 299 1 OP1 A G 859 ? ? CB B ASP 191 ? ? 1.62 300 1 "O2'" A G 830 ? ? CA B THR 19 ? ? 1.62 301 1 NZ B LYS 44 ? ? NZ H LYS 21 ? ? 1.62 302 1 "C4'" A U 17 ? ? "O2'" A U 1078 ? ? 1.62 303 1 "C2'" A A 1518 ? ? CA V VAL 187 ? ? 1.63 304 1 "O3'" A G 859 ? ? N B PRO 192 ? ? 1.63 305 1 "C1'" A G 858 ? ? CB B ASN 23 ? ? 1.63 306 1 OP1 A G 830 ? ? O B HIS 38 ? ? 1.63 307 1 "O5'" A U 828 ? ? C B PRO 28 ? ? 1.63 308 1 O4 A U 17 ? ? N3 A U 1078 ? ? 1.63 309 1 C8 A A 1518 ? ? NE2 V GLN 141 ? ? 1.64 310 1 N6 A A 16 ? ? N1 A G 1079 ? ? 1.64 311 1 OP1 A A 860 ? ? N B GLY 194 ? ? 1.64 312 1 C5 A A 831 ? ? NE B ARG 20 ? ? 1.64 313 1 "C5'" A A 1080 ? ? N E SER 21 ? ? 1.64 314 1 "C3'" A U 828 ? ? C B PRO 28 ? ? 1.65 315 1 "O2'" A G 858 ? ? CG B ASN 23 ? ? 1.65 316 1 C2 A G 869 ? ? CD B LYS 25 ? ? 1.65 317 1 "O5'" A U 828 ? ? CB B PRO 28 ? ? 1.65 318 1 N1 A U 17 ? ? C2 A U 1078 ? ? 1.65 319 1 OP1 A A 1081 ? ? CA E ILE 29 ? ? 1.65 320 1 C8 A G 859 ? ? CB B LYS 25 ? ? 1.65 321 1 "O3'" A A 1080 ? ? N E LYS 22 ? ? 1.65 322 1 C5 A G 858 ? ? CG B PRO 24 ? ? 1.66 323 1 OP2 A A 860 ? ? OD1 B ASP 191 ? ? 1.66 324 1 N9 A A 1518 ? ? CG1 V VAL 187 ? ? 1.66 325 1 "C4'" A A 1080 ? ? CB E SER 21 ? ? 1.66 326 1 N9 A G 858 ? ? CA B ASN 23 ? ? 1.66 327 1 "C1'" A A 831 ? ? N B ARG 20 ? ? 1.67 328 1 N2 A G 829 ? ? C B TRP 22 ? ? 1.67 329 1 C6 A G 858 ? ? CA B PRO 24 ? ? 1.67 330 1 "O2'" A U 870 ? ? CE B LYS 27 ? ? 1.67 331 1 C6 A G 859 ? ? CA B LYS 25 ? ? 1.67 332 1 "C5'" A G 859 ? ? N B ASP 191 ? ? 1.68 333 1 OP1 A G 830 ? ? CA B ILE 39 ? ? 1.68 334 1 O6 A G 15 ? ? N1 A A 1080 ? ? 1.68 335 1 "C4'" A U 17 ? ? "C2'" A U 1078 ? ? 1.68 336 1 "O3'" A G 859 ? ? C B ASP 191 ? ? 1.68 337 1 "C3'" A G 1517 ? ? CD V GLN 141 ? ? 1.68 338 1 "O4'" A U 17 ? ? "C2'" A U 1078 ? ? 1.68 339 1 C5 A G 859 ? ? O B LYS 25 ? ? 1.68 340 1 "O4'" A A 831 ? ? N B ARG 20 ? ? 1.69 341 1 O2 A U 920 ? ? C6 A A 1080 ? ? 1.69 342 1 "O3'" A U 828 ? ? C B PRO 28 ? ? 1.69 343 1 "C4'" A A 1080 ? ? CA E SER 21 ? ? 1.69 344 1 C5 A G 15 ? ? N3 A A 1080 ? ? 1.69 345 1 "C5'" A A 1080 ? ? O E SER 21 ? ? 1.70 346 1 "C3'" A A 16 ? ? "O2'" A G 1079 ? ? 1.70 347 1 N1 A G 15 ? ? C4 A A 1080 ? ? 1.71 348 1 "C1'" A U 17 ? ? "C3'" A U 1078 ? ? 1.71 349 1 "C2'" A A 1080 ? ? N E THR 23 ? ? 1.71 350 1 "C3'" A G 830 ? ? CG2 B VAL 37 ? ? 1.71 351 1 "O4'" A G 859 ? ? CD B PRO 192 ? ? 1.72 352 1 N3 A G 830 ? ? C B ARG 20 ? ? 1.72 353 1 "C2'" A A 1080 ? ? C E LYS 22 ? ? 1.72 354 1 N3 A G 869 ? ? CG B LYS 25 ? ? 1.72 355 1 P A A 831 ? ? C B VAL 37 ? ? 1.72 356 1 "C1'" A G 830 ? ? CE1 B HIS 38 ? ? 1.72 357 1 OP1 A A 860 ? ? C B ASP 193 ? ? 1.73 358 1 OP1 A U 828 ? ? O B PRO 28 ? ? 1.73 359 1 N2 A G 830 ? ? CA B TYR 21 ? ? 1.73 360 1 "C2'" A U 870 ? ? CE B LYS 27 ? ? 1.73 361 1 N3 A U 17 ? ? C6 A U 1078 ? ? 1.73 362 1 N3 A U 828 ? ? CG B MET 26 ? ? 1.73 363 1 "C5'" A A 860 ? ? N B ASP 193 ? ? 1.74 364 1 C5 A G 829 ? ? CE3 B TRP 22 ? ? 1.74 365 1 C2 A G 15 ? ? N9 A A 1080 ? ? 1.74 366 1 P A A 860 ? ? CA B ASP 193 ? ? 1.74 367 1 P A G 832 ? ? CB B LYS 36 ? ? 1.75 368 1 N2 A G 869 ? ? CE B LYS 25 ? ? 1.75 369 1 "C2'" A G 859 ? ? CD B PRO 192 ? ? 1.75 370 1 O2 A C 857 ? ? N B TRP 22 ? ? 1.75 371 1 N9 A G 832 ? ? NH1 B ARG 20 ? ? 1.75 372 1 OP2 A A 831 ? ? O B VAL 37 ? ? 1.75 373 1 O4 A U 17 ? ? O4 A U 1078 ? ? 1.75 374 1 "O4'" A C 18 ? ? "O4'" A U 1078 ? ? 1.76 375 1 "C5'" A U 828 ? ? C B PRO 28 ? ? 1.76 376 1 C5 A G 830 ? ? NE2 B HIS 38 ? ? 1.76 377 1 "C3'" A U 870 ? ? NZ B LYS 27 ? ? 1.76 378 1 "C1'" A G 830 ? ? O B GLN 18 ? ? 1.76 379 1 "C5'" A G 829 ? ? N B ILE 30 ? ? 1.76 380 1 O6 A G 15 ? ? C2 A A 1080 ? ? 1.76 381 1 OP1 A A 831 ? ? CA B VAL 37 ? ? 1.76 382 1 C6 A A 16 ? ? N3 A G 1079 ? ? 1.77 383 1 C4 A G 859 ? ? O B LYS 25 ? ? 1.77 384 1 P A A 831 ? ? CG2 B VAL 37 ? ? 1.77 385 1 "O2'" A U 17 ? ? "C5'" A U 1078 ? ? 1.77 386 1 C2 A A 1519 ? ? CE V LYS 186 ? ? 1.77 387 1 N7 A G 830 ? ? CD2 B HIS 38 ? ? 1.77 388 1 N3 A A 1519 ? ? CD V LYS 186 ? ? 1.77 389 1 P A A 1080 ? ? CG1 E VAL 20 ? ? 1.77 390 1 "C2'" A G 1517 ? ? OE1 V GLN 141 ? ? 1.77 391 1 "C2'" A A 1518 ? ? CG2 V VAL 187 ? ? 1.78 392 1 N3 A G 859 ? ? O B LYS 25 ? ? 1.78 393 1 "O4'" A U 17 ? ? "O4'" A G 1079 ? ? 1.78 394 1 C2 A U 920 ? ? O6 A G 1079 ? ? 1.78 395 1 "C5'" A A 860 ? ? C B PRO 192 ? ? 1.78 396 1 C6 A U 17 ? ? O2 A U 1078 ? ? 1.78 397 1 N9 A A 16 ? ? N3 A G 1079 ? ? 1.78 398 1 "C2'" A U 828 ? ? N B PHE 29 ? ? 1.78 399 1 C8 A A 831 ? ? N B ARG 20 ? ? 1.78 400 1 N1 A A 1519 ? ? CE V LYS 186 ? ? 1.78 401 1 C4 A U 17 ? ? C2 A U 1078 ? ? 1.78 402 1 "O2'" A A 1518 ? ? N V VAL 187 ? ? 1.79 403 1 N6 A A 16 ? ? C2 A G 1079 ? ? 1.79 404 1 C5 A G 859 ? ? N B MET 26 ? ? 1.79 405 1 N6 A A 16 ? ? N2 A G 1079 ? ? 1.79 406 1 O4 A U 870 ? ? CD B PRO 28 ? ? 1.79 407 1 "O3'" A G 1517 ? ? OE1 V GLN 141 ? ? 1.79 408 1 "O2'" A A 16 ? ? "O4'" A G 1079 ? ? 1.79 409 1 "C3'" A G 859 ? ? CD B PRO 192 ? ? 1.79 410 1 C6 A A 16 ? ? N2 A G 1079 ? ? 1.79 411 1 "O4'" A A 1081 ? ? CB E LYS 22 ? ? 1.80 412 1 "C5'" A G 1514 ? ? NH2 V ARG 222 ? ? 1.80 413 1 N3 A A 16 ? ? N3 A G 1079 ? ? 1.80 414 1 "C3'" A A 1081 ? ? CD E LYS 22 ? ? 1.80 415 1 N3 A A 16 ? ? C8 A G 1079 ? ? 1.80 416 1 OP2 A A 1081 ? ? O E ILE 29 ? ? 1.80 417 1 C2 A U 920 ? ? N6 A A 1080 ? ? 1.80 418 1 O6 A G 829 ? ? CZ3 B TRP 22 ? ? 1.80 419 1 N3 A G 15 ? ? N9 A A 1080 ? ? 1.80 420 1 C8 A G 830 ? ? CD2 B HIS 38 ? ? 1.81 421 1 "O2'" A U 921 ? ? "O2'" A A 1081 ? ? 1.81 422 1 "C5'" A G 1514 ? ? O V HOH 312 ? ? 1.81 423 1 "O3'" A G 859 ? ? N B ASP 193 ? ? 1.81 424 1 "C2'" A A 1518 ? ? CG1 V VAL 187 ? ? 1.81 425 1 N1 A G 15 ? ? C5 A A 1080 ? ? 1.81 426 1 OP2 A G 829 ? ? C B ILE 30 ? ? 1.81 427 1 C4 A U 828 ? ? N B MET 26 ? ? 1.81 428 1 P A G 832 ? ? CG B LYS 36 ? ? 1.81 429 1 C2 A G 830 ? ? N B TYR 21 ? ? 1.81 430 1 "C5'" A G 829 ? ? CB B ILE 30 ? ? 1.82 431 1 CE B LYS 44 ? ? NZ H LYS 21 ? ? 1.83 432 1 "C5'" A A 860 ? ? CA B ASP 193 ? ? 1.83 433 1 "O2'" A U 17 ? ? "O3'" A U 1078 ? ? 1.83 434 1 "C4'" A G 859 ? ? CA B ASP 191 ? ? 1.83 435 1 N9 A A 1081 ? ? CD E LYS 22 ? ? 1.83 436 1 "O5'" A G 859 ? ? OD1 B ASN 23 ? ? 1.83 437 1 "C1'" A G 858 ? ? CA B ASN 23 ? ? 1.83 438 1 "O5'" A G 829 ? ? CA B ILE 30 ? ? 1.83 439 1 OP1 A G 829 ? ? C B PHE 29 ? ? 1.83 440 1 C2 A G 829 ? ? CA B TRP 22 ? ? 1.83 441 1 O2 A U 17 ? ? N1 A U 1078 ? ? 1.83 442 1 N7 A A 16 ? ? N3 A G 1079 ? ? 1.83 443 1 C4 A A 831 ? ? CA B ARG 20 ? ? 1.83 444 1 N3 A U 17 ? ? C2 A U 1078 ? ? 1.83 445 1 "O2'" A A 16 ? ? "C1'" A G 1079 ? ? 1.84 446 1 "C5'" A G 859 ? ? O B SER 190 ? ? 1.84 447 1 N1 A U 17 ? ? C6 A U 1078 ? ? 1.84 448 1 N9 A G 1517 ? ? CG V GLN 141 ? ? 1.84 449 1 O6 A G 861 ? ? CE B LYS 25 ? ? 1.84 450 1 C4 A G 859 ? ? N B MET 26 ? ? 1.84 451 1 "C3'" A A 1081 ? ? CG E LYS 22 ? ? 1.84 452 1 C6 A A 831 ? ? CD B ARG 20 ? ? 1.84 453 1 "O5'" A G 830 ? ? ND1 B HIS 38 ? ? 1.84 454 1 N1 A G 858 ? ? CB B PRO 24 ? ? 1.84 455 1 "C5'" A A 860 ? ? O B PRO 192 ? ? 1.84 456 1 O4 A U 828 ? ? CA B MET 26 ? ? 1.85 457 1 OP2 A A 860 ? ? CB B ASP 193 ? ? 1.85 458 1 "O3'" A U 827 ? ? CB B PRO 28 ? ? 1.85 459 1 "C2'" A A 1080 ? ? CA E LYS 22 ? ? 1.85 460 1 OP1 A A 1080 ? ? CG1 E VAL 20 ? ? 1.85 461 1 "C2'" A U 828 ? ? CG B PHE 29 ? ? 1.85 462 1 OP1 A G 1514 ? ? CZ V ARG 222 ? ? 1.85 463 1 OP1 A G 829 ? ? O B PHE 29 ? ? 1.86 464 1 C6 A G 15 ? ? N3 A A 1080 ? ? 1.86 465 1 P A A 860 ? ? CB B ASP 193 ? ? 1.86 466 1 "C1'" A U 828 ? ? CG B PHE 29 ? ? 1.86 467 1 "C3'" A A 860 ? ? OD1 B ASP 193 ? ? 1.86 468 1 O2 A C 857 ? ? C B TRP 22 ? ? 1.86 469 1 "C2'" A A 16 ? ? "O4'" A G 1079 ? ? 1.86 470 1 N7 A G 859 ? ? C B LYS 25 ? ? 1.86 471 1 "O4'" A A 831 ? ? C B THR 19 ? ? 1.86 472 1 O6 A G 861 ? ? NZ B LYS 25 ? ? 1.87 473 1 OP2 A G 832 ? ? N B LYS 36 ? ? 1.87 474 1 OP1 A C 848 ? ? OD1 B ASN 35 ? ? 1.87 475 1 C5 A U 17 ? ? O2 A U 1078 ? ? 1.87 476 1 C8 A G 829 ? ? O B MET 26 ? ? 1.87 477 1 O4 A U 17 ? ? C4 A U 1078 ? ? 1.87 478 1 "O3'" A U 828 ? ? C B PHE 29 ? ? 1.87 479 1 N4 A C 857 ? ? CD1 B TRP 22 ? ? 1.87 480 1 "O2'" A G 859 ? ? CD B PRO 192 ? ? 1.87 481 1 C2 A U 17 ? ? C2 A U 1078 ? ? 1.87 482 1 C4 A G 832 ? ? NH1 B ARG 20 ? ? 1.87 483 1 C5 A G 859 ? ? 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A 920 ? 28 1 1 A A 16 1_555 A A 919 1_555 -2.759 1.335 -0.485 0.640 -9.824 17.682 2 A_A16:A919_A A 16 ? A 919 ? ? 1 1 A U 17 1_555 A A 918 1_555 -0.095 0.019 0.047 -0.505 -0.922 -2.181 3 A_U17:A918_A A 17 ? A 918 ? 20 1 1 A C 18 1_555 A G 917 1_555 0.146 -0.123 0.110 6.679 -2.026 1.767 4 A_C18:G917_A A 18 ? A 917 ? 19 1 1 A A 19 1_555 A U 916 1_555 0.076 -0.007 -0.096 0.541 0.349 -0.804 5 A_A19:U916_A A 19 ? A 916 ? 20 1 1 A U 13 1_555 A A 915 1_555 -0.241 3.439 0.078 2.673 3.291 -66.017 6 A_U13:A915_A A 13 ? A 915 ? 23 3 1 A G 21 1_555 A A 914 1_555 6.753 -4.288 -0.026 -1.122 -0.005 1.650 7 A_G21:A914_A A 21 ? A 914 ? 11 9 1 A G 22 1_555 A U 12 1_555 -2.127 -0.566 -0.222 -0.998 -1.658 -5.733 8 A_G22:U12_A A 22 ? A 12 ? 28 1 1 A C 23 1_555 A G 11 1_555 0.318 -0.098 -0.152 0.358 -4.967 0.609 9 A_C23:G11_A A 23 ? A 11 ? 19 1 1 A U 24 1_555 A A 10 1_555 0.106 -0.119 -0.045 -0.457 -1.091 3.936 10 A_U24:A10_A A 24 ? 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