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;SRSNRAGLQFPVGRIHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVMEYLAAEVLELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNK LLSGVTIAQGGVLPNIQAVLLP ; C,G,M,Q ? 4 'polypeptide(L)' no no ;ESYAIYIYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDIFERIAAEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEG TKAVTKYTSS ; ;ESYAIYIYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDIFERIAAEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEG TKAVTKYTSS ; D,H,N,R ? 5 'polypeptide(L)' no no PNVRRSNRIRLKPLEYWRGERIDYQ PNVRRSNRIRLKPLEYWRGERIDYQ V,U,X,W ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT) (DA)(DC)(DT)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT)(DG)(DG) (DA)(DA)(DA)(DC)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DG)(DC) (DA)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DC) (DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DG)(DA) (DG)(DC)(DA)(DG)(DT)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT) 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 5 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'Rattus norvegicus' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name rat _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 10116 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP H3_DROME P02299 1 ;RYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTI MPKDIQLARRIRG ; 41 ? 2 UNP H4_DROME P84040 2 DNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG 25 ? 3 UNP H2A_DROME P84051 3 ;SRSNRAGLQFPVGRIHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVMEYLAAEVLELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNK LLSGVTIAQGGVLPNIQAVLLP ; 16 ? 4 UNP H2B_DROME P02283 4 ;ESYAIYIYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDIFERIAAEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEG TKAVTKYTSS ; 33 ? 5 UNP Q66LH7_RAT Q66LH7 5 PNVRRSNRIRLKPLEYWRGERIDYQ 710 ? 6 PDB 4INM 4INM 6 ? ? ? 7 PDB 4INM 4INM 1 ? ? ? 8 PDB 4INM 4INM 7 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4INM A 1 ? 93 ? 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WATSON-CRICK ? ? hydrog144 hydrog ? ? U DT 91 O4 ? ? ? 1_555 W DA 57 N6 ? ? J DT 17 I DA -17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog145 hydrog ? ? U DT 92 O4 ? ? ? 1_555 W DA 56 N6 ? ? J DT 18 I DA -18 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? hydrog146 hydrog ? ? U DT 94 N3 ? ? ? 1_555 W DA 54 N1 ? ? J DT 20 I DA -20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog147 hydrog ? ? U DT 94 O4 ? ? ? 1_555 W DA 54 N6 ? ? J DT 20 I DA -20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog148 hydrog ? ? U DA 96 N1 ? ? ? 1_555 W DT 52 N3 ? ? J DA 22 I DT -22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog149 hydrog ? ? U DA 96 N6 ? ? ? 1_555 W DT 52 O4 ? ? J DA 22 I DT -22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog150 hydrog ? ? U DG 98 N2 ? ? ? 1_555 W DA 51 N3 ? ? J DG 24 I DA -23 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DA MISPAIR' ? ? hydrog151 hydrog ? ? U DG 99 N1 ? ? ? 1_555 W DC 49 N3 ? ? J DG 25 I DC -25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog152 hydrog ? ? U DG 99 N2 ? ? ? 1_555 W DC 49 O2 ? ? 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LEU C 114 ? ? 143.98 2 1 ARG P 92 ? ? GLN P 93 ? ? -144.31 # _pdbx_validate_main_chain_plane.id 1 _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_comp_id ARG _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_asym_id P _pdbx_validate_main_chain_plane.auth_seq_id 92 _pdbx_validate_main_chain_plane.PDB_ins_code ? _pdbx_validate_main_chain_plane.label_alt_id ? _pdbx_validate_main_chain_plane.improper_torsion_angle -17.42 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 A ARG 72 ? 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H ILE 55 CG1 28 1 Y 0 H ILE 86 ? CG2 ? H ILE 55 CG2 29 1 Y 0 H ILE 86 ? CD1 ? H ILE 55 CD1 30 1 Y 1 U ASN 716 ? CG ? J ASN 7 CG 31 1 Y 1 U ASN 716 ? OD1 ? J ASN 7 OD1 32 1 Y 1 U ASN 716 ? ND2 ? J ASN 7 ND2 33 1 Y 1 U LEU 720 ? CG ? J LEU 11 CG 34 1 Y 1 U LEU 720 ? CD1 ? J LEU 11 CD1 35 1 Y 1 U LEU 720 ? CD2 ? J LEU 11 CD2 36 1 Y 1 K ARG 40 ? CG ? K ARG 1 CG 37 1 Y 1 K ARG 40 ? CD ? K ARG 1 CD 38 1 Y 1 K ARG 40 ? NE ? K ARG 1 NE 39 1 Y 1 K ARG 40 ? CZ ? K ARG 1 CZ 40 1 Y 1 K ARG 40 ? NH1 ? K ARG 1 NH1 41 1 Y 1 K ARG 40 ? NH2 ? K ARG 1 NH2 42 1 Y 1 K ARG 49 ? CG ? K ARG 10 CG 43 1 Y 1 K ARG 49 ? CD ? K ARG 10 CD 44 1 Y 1 K ARG 49 ? NE ? K ARG 10 NE 45 1 Y 1 K ARG 49 ? CZ ? K ARG 10 CZ 46 1 Y 1 K ARG 49 ? NH1 ? K ARG 10 NH1 47 1 Y 1 K ARG 49 ? NH2 ? K ARG 10 NH2 48 1 Y 1 K ASP 106 ? CG ? K ASP 67 CG 49 1 Y 1 K ASP 106 ? OD1 ? K ASP 67 OD1 50 1 Y 1 K ASP 106 ? OD2 ? K ASP 67 OD2 51 1 Y 1 K LEU 109 ? CG ? K LEU 70 CG 52 1 Y 1 K LEU 109 ? CD1 ? K LEU 70 CD1 53 1 Y 1 K LEU 109 ? CD2 ? K LEU 70 CD2 54 1 Y 1 K GLU 134 ? CG ? K GLU 95 CG 55 1 Y 1 K GLU 134 ? CD ? K GLU 95 CD 56 1 Y 1 K GLU 134 ? OE1 ? K GLU 95 OE1 57 1 Y 1 K GLU 134 ? OE2 ? K GLU 95 OE2 58 1 Y 0 M ILE 29 ? CG1 ? M ILE 15 CG1 59 1 Y 0 M ILE 29 ? CG2 ? M ILE 15 CG2 60 1 Y 0 M ILE 29 ? CD1 ? M ILE 15 CD1 61 1 Y 0 M LEU 33 ? CG ? M LEU 19 CG 62 1 Y 0 M LEU 33 ? CD1 ? M LEU 19 CD1 63 1 Y 0 M LEU 33 ? CD2 ? M LEU 19 CD2 64 1 Y 0 M LEU 50 ? CG ? M LEU 36 CG 65 1 Y 0 M LEU 50 ? CD1 ? M LEU 36 CD1 66 1 Y 0 M LEU 50 ? CD2 ? M LEU 36 CD2 67 1 Y 0 M MET 54 ? CG ? M MET 40 CG 68 1 Y 0 M MET 54 ? SD ? M MET 40 SD 69 1 Y 0 M MET 54 ? CE ? M MET 40 CE 70 1 Y 0 N ILE 86 ? CG1 ? N ILE 55 CG1 71 1 Y 0 N ILE 86 ? CG2 ? N ILE 55 CG2 72 1 Y 0 N ILE 86 ? CD1 ? N ILE 55 CD1 73 1 Y 0 Q ILE 29 ? CG1 ? Q ILE 15 CG1 74 1 Y 0 Q ILE 29 ? CG2 ? Q ILE 15 CG2 75 1 Y 0 Q ILE 29 ? CD1 ? Q ILE 15 CD1 76 1 Y 0 Q LEU 33 ? CG ? Q LEU 19 CG 77 1 Y 0 Q LEU 33 ? CD1 ? Q LEU 19 CD1 78 1 Y 0 Q LEU 33 ? CD2 ? Q LEU 19 CD2 79 1 Y 0 Q LEU 50 ? CD1 ? Q LEU 36 CD1 80 1 Y 0 Q LEU 50 ? CD2 ? Q LEU 36 CD2 81 1 Y 0 Q MET 54 ? CG ? Q MET 40 CG 82 1 Y 0 Q MET 54 ? SD ? Q MET 40 SD 83 1 Y 0 Q MET 54 ? CE ? Q MET 40 CE # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A ARG 40 ? A ARG 1 2 1 Y 1 A TYR 41 ? A TYR 2 3 1 Y 1 A GLY 135 ? A GLY 96 4 1 Y 1 A GLY 136 ? A GLY 97 5 1 Y 1 A LEU 137 ? A LEU 98 6 1 Y 1 V PRO 710 ? I PRO 1 7 1 Y 1 V ASN 711 ? I ASN 2 8 1 Y 1 V GLN 734 ? I GLN 25 9 1 Y 1 U PRO 710 ? J PRO 1 10 1 Y 1 U ASN 711 ? J ASN 2 11 1 Y 1 U VAL 712 ? J VAL 3 12 1 Y 1 U ARG 713 ? J ARG 4 13 1 Y 1 U ARG 714 ? J ARG 5 14 1 Y 1 U SER 715 ? J SER 6 15 1 Y 1 U LYS 721 ? J LYS 12 16 1 Y 1 U PRO 722 ? J PRO 13 17 1 Y 1 U LEU 723 ? J LEU 14 18 1 Y 1 U GLU 724 ? J GLU 15 19 1 Y 1 U TYR 725 ? J TYR 16 20 1 Y 1 U TRP 726 ? J TRP 17 21 1 Y 1 U ARG 727 ? J ARG 18 22 1 Y 1 U GLY 728 ? J GLY 19 23 1 Y 1 U GLU 729 ? J GLU 20 24 1 Y 1 U ARG 730 ? J ARG 21 25 1 Y 1 U ILE 731 ? J ILE 22 26 1 Y 1 U ASP 732 ? J ASP 23 27 1 Y 1 U TYR 733 ? J TYR 24 28 1 Y 1 U GLN 734 ? J GLN 25 29 1 Y 1 K GLY 135 ? K GLY 96 30 1 Y 1 K GLY 136 ? K GLY 97 31 1 Y 1 K LEU 137 ? K LEU 98 32 1 Y 1 O ARG 40 ? O ARG 1 33 1 Y 1 O TYR 41 ? O TYR 2 34 1 Y 1 R SER 120 ? R SER 89 35 1 Y 1 R SER 121 ? R SER 90 36 1 Y 1 X PRO 710 ? S PRO 1 37 1 Y 1 X ASN 711 ? S ASN 2 38 1 Y 1 X VAL 712 ? S VAL 3 39 1 Y 1 X GLN 734 ? S GLN 25 40 1 Y 1 W PRO 710 ? T PRO 1 41 1 Y 1 W ASN 711 ? T ASN 2 42 1 Y 1 W VAL 712 ? T VAL 3 43 1 Y 1 W ARG 713 ? T ARG 4 44 1 Y 1 W ARG 714 ? T ARG 5 45 1 Y 1 W ILE 718 ? T ILE 9 46 1 Y 1 W ARG 719 ? T ARG 10 47 1 Y 1 W LEU 720 ? T LEU 11 48 1 Y 1 W LYS 721 ? T LYS 12 49 1 Y 1 W PRO 722 ? T PRO 13 50 1 Y 1 W LEU 723 ? T LEU 14 51 1 Y 1 W GLU 724 ? T GLU 15 52 1 Y 1 W TYR 725 ? T TYR 16 53 1 Y 1 W TRP 726 ? T TRP 17 54 1 Y 1 W ARG 727 ? T ARG 18 55 1 Y 1 W GLY 728 ? T GLY 19 56 1 Y 1 W GLU 729 ? T GLU 20 57 1 Y 1 W ARG 730 ? T ARG 21 58 1 Y 1 W ILE 731 ? T ILE 22 59 1 Y 1 W ASP 732 ? T ASP 23 60 1 Y 1 W TYR 733 ? T TYR 24 61 1 Y 1 W GLN 734 ? T GLN 25 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 4INM 'double helix' 4INM 'a-form double helix' 4INM 'b-form double helix' 4INM 'bulge loop' 4INM 'mismatched base pair' 4INM 'internal loop' 4INM 'triple helix' 4INM 'quadruple helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 W DA 1 1_555 U DT 147 1_555 2.315 -0.784 1.578 -18.333 38.534 8.145 1 I_DA-73:DT73_J I -73 ? 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