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2013 _citation.journal_id_ASTM BICHAW _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0006-2960 _citation.journal_id_CSD 0033 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 24131108 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1021/bi4011946 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Qian, P.' 1 primary 'Papiz, M.Z.' 2 primary 'Jackson, P.J.' 3 primary 'Brindley, A.A.' 4 primary 'Ng, I.W.' 5 primary 'Olsen, J.D.' 6 primary 'Dickman, M.J.' 7 primary 'Bullough, P.A.' 8 primary 'Hunter, C.N.' 9 # _cell.entry_id 4JCB _cell.length_a 78.077 _cell.length_b 415.075 _cell.length_c 129.818 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 105.75 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 28 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 4JCB _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? 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loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Antenna pigment protein alpha chain, LH-1' 3 'Antenna pigment protein beta chain, LH-3A' 4 'Photosynthetic reaction center H subunit' 5 'Photosynthetic reaction center L subunit' 6 'Photosynthetic reaction center M subunit' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no MSKFYKIWMIFDPRRVFVAQGVFLFLLAVMIHLILLSTPSYNWLEISAAKYNRVAVAE MSKFYKIWMIFDPRRVFVAQGVFLFLLAVMIHLILLSTPSYNWLEISAAKYNRVAVAE 5,T,V,X,3,7,D,F,1,J,2,N,P,Z ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MADKTIFNDHLNTNPKTNLRLWVAFQMMKGAGWAGGVFFGTLLLIGFFRVVGRMLPIQENQAPAPNITGALETGIELIKH LV ; ;MADKTIFNDHLNTNPKTNLRLWVAFQMMKGAGWAGGVFFGTLLLIGFFRVVGRMLPIQENQAPAPNITGALETGIELIKH LV ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no MADKSDLGYTGLTDEQAQELHSVYMSGLWLFSAVAIVAHLAVYIWRPWF MADKSDLGYTGLTDEQAQELHSVYMSGLWLFSAVAIVAHLAVYIWRPWF S,9,O,Q,6,U,W,Y,4,8,E,G,I,K ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MVGVTAFGNFDLASLAIYSFWIFLAGLIYYLQTENMREGYPLENEDGTPAANQGPFPLPKPKTFILPHGRGTLTVPGPES EDRPIALARTAVSEGFPHAPTGDPMKDGVGPASWVARRDLPELDGHGHNKIKPMKAAAGFHVSAGKNPIGLPVRGCDLEI AGKVVDIWVDIPEQMARFLEVELKDGSTRLLPMQMVKVQSNRVHVNALSSDLFAGIPTIKSPTEVTLLEEDKICGYVAGG LMYAAPKRKSVVAAMLAEYA ; ;MVGVTAFGNFDLASLAIYSFWIFLAGLIYYLQTENMREGYPLENEDGTPAANQGPFPLPKPKTFILPHGRGTLTVPGPES EDRPIALARTAVSEGFPHAPTGDPMKDGVGPASWVARRDLPELDGHGHNKIKPMKAAAGFHVSAGKNPIGLPVRGCDLEI AGKVVDIWVDIPEQMARFLEVELKDGSTRLLPMQMVKVQSNRVHVNALSSDLFAGIPTIKSPTEVTLLEEDKICGYVAGG LMYAAPKRKSVVAAMLAEYA ; H ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MALLSFERKYRVPGGTLVGGNLFDFWVGPFYVGFFGVATFFFAALGIILIAWSAVLQGTWNPQLISVYPPALEYGLGGAP LAKGGLWQIITICATGAFVSWALREVEICRKLGIGYHIPFAFAFAILAYLTLVLFRPVMMGAWGYAFPYGIWTHLDWVSN TGYTYGNFHYNPAHMIAISFFFTNALALALHGALVLSAANPEKGKEMRTPDHEDTFFRDLVGYSIGTLGIHRLGLLLSLS AVFFSALCMIITGTIWFDQWVDWWQWWVKLPWWANIPGGING ; ;MALLSFERKYRVPGGTLVGGNLFDFWVGPFYVGFFGVATFFFAALGIILIAWSAVLQGTWNPQLISVYPPALEYGLGGAP LAKGGLWQIITICATGAFVSWALREVEICRKLGIGYHIPFAFAFAILAYLTLVLFRPVMMGAWGYAFPYGIWTHLDWVSN TGYTYGNFHYNPAHMIAISFFFTNALALALHGALVLSAANPEKGKEMRTPDHEDTFFRDLVGYSIGTLGIHRLGLLLSLS AVFFSALCMIITGTIWFDQWVDWWQWWVKLPWWANIPGGING ; L ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MAEYQNIFSQVQVRGPADLGMTEDVNLANRSGVGPFSTLLGWFGNAQLGPIYLGSLGVLSLFSGLMWFFTIGIWFWYQAG WNPAVFLRDLFFFSLEPPAPEYGLSFAAPLKEGGLWLIASFFMFVAVWSWWGRTYLRAQALGMGKHTAWAFLSAIWLWMV LGFIRPILMGSWSEAVPYGIFSHLDWTNNFSLVHGNLFYNPFHGLSIAFLYGSALLFAMHGATILAVSRFGGERELEQIA DRGTAAERAALFWRWTMGFNATMEGIHRWAIWMAVLVTLTGGIGILLSGTVVDNWYVWGQNHGMAPLN ; ;MAEYQNIFSQVQVRGPADLGMTEDVNLANRSGVGPFSTLLGWFGNAQLGPIYLGSLGVLSLFSGLMWFFTIGIWFWYQAG WNPAVFLRDLFFFSLEPPAPEYGLSFAAPLKEGGLWLIASFFMFVAVWSWWGRTYLRAQALGMGKHTAWAFLSAIWLWMV LGFIRPILMGSWSEAVPYGIFSHLDWTNNFSLVHGNLFYNPFHGLSIAFLYGSALLFAMHGATILAVSRFGGERELEQIA DRGTAAERAALFWRWTMGFNATMEGIHRWAIWMAVLVTLTGGIGILLSGTVVDNWYVWGQNHGMAPLN ; M ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id 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'Photosynthetic membranes' # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP LHA1_RHOSH P0C0X9 1 MSKFYKIWMIFDPRRVFVAQGVFLFLLAVMIHLILLSTPSYNWLEISAAKYNRVAVAE 1 ? 2 UNP PUFX_RHOS4 P13402 2 ;MADKTIFNDHLNTNPKTNLRLWVAFQMMKGAGWAGGVFFGTLLLIGFFRVVGRMLPIQENQAPAPNITGALETGIELIKH LV ; 1 ? 3 UNP LHB1_RHOS4 Q3J1A3 3 MADKSDLGYTGLTDEQAQELHSVYMSGLWLFSAVAIVAHLAVYIWRPWF 1 ? 4 UNP RCEH_RHOSH P0C0Y7 4 ;MVGVTAFGNFDLASLAIYSFWIFLAGLIYYLQTENMREGYPLENEDGTPAANQGPFPLPKPKTFILPHGRGTLTVPGPES EDRPIALARTAVSEGFPHAPTGDPMKDGVGPASWVARRDLPELDGHGHNKIKPMKAAAGFHVSAGKNPIGLPVRGCDLEI AGKVVDIWVDIPEQMARFLEVELKDGSTRLLPMQMVKVQSNRVHVNALSSDLFAGIPTIKSPTEVTLLEEDKICGYVAGG LMYAAPKRKSVVAAMLAEYA ; 1 ? 5 UNP RCEL_RHOSH P0C0Y8 5 ;MALLSFERKYRVPGGTLVGGNLFDFWVGPFYVGFFGVATFFFAALGIILIAWSAVLQGTWNPQLISVYPPALEYGLGGAP LAKGGLWQIITICATGAFVSWALREVEICRKLGIGYHIPFAFAFAILAYLTLVLFRPVMMGAWGYAFPYGIWTHLDWVSN TGYTYGNFHYNPAHMIAISFFFTNALALALHGALVLSAANPEKGKEMRTPDHEDTFFRDLVGYSIGTLGIHRLGLLLSLS AVFFSALCMIITGTIWFDQWVDWWQWWVKLPWWANIPGGING ; 1 ? 6 UNP RCEM_RHOSH P0C0Y9 6 ;MAEYQNIFSQVQVRGPADLGMTEDVNLANRSGVGPFSTLLGWFGNAQLGPIYLGSLGVLSLFSGLMWFFTIGIWFWYQAG WNPAVFLRDLFFFSLEPPAPEYGLSFAAPLKEGGLWLIASFFMFVAVWSWWGRTYLRAQALGMGKHTAWAFLSAIWLWMV LGFIRPILMGSWSEAVPYGIFSHLDWTNNFSLVHGNLFYNPFHGLSIAFLYGSALLFAMHGATILAVSRFGGERELEQIA DRGTAAERAALFWRWTMGFNATMEGIHRWAIWMAVLVTLTGGIGILLSGTVVDNWYVWGQNHGMAPLN ; 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4JCB 5 1 ? 58 ? 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Q3J1A3 1 ? 49 ? 0 48 26 3 4JCB E 1 ? 49 ? Q3J1A3 1 ? 49 ? 0 48 27 3 4JCB G 1 ? 49 ? Q3J1A3 1 ? 49 ? 0 48 28 3 4JCB I 1 ? 49 ? Q3J1A3 1 ? 49 ? 0 48 29 3 4JCB K 1 ? 49 ? Q3J1A3 1 ? 49 ? 0 48 30 4 4JCB H 1 ? 260 ? P0C0Y7 1 ? 260 ? 1 260 31 5 4JCB L 1 ? 282 ? P0C0Y8 1 ? 282 ? 0 281 32 6 4JCB M 1 ? 308 ? P0C0Y9 1 ? 308 ? 0 307 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BCL non-polymer . 'BACTERIOCHLOROPHYLL A' ? 'C55 H74 Mg N4 O6' 911.504 BPH non-polymer . 'BACTERIOPHEOPHYTIN A' ? 'C55 H76 N4 O6' 889.215 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 FE2 non-polymer . 'FE (II) ION' ? 'Fe 2' 55.845 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PO4 non-polymer . 'PHOSPHATE ION' ? 'O4 P -3' 94.971 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U10 non-polymer . UBIQUINONE-10 'Coenzyme Q10' 'C59 H90 O4' 863.343 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 4JCB _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method ? _exptl_crystal_grow.temp 292 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 10.5 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;The core dimer complex was concentrated to an optical density of ~100 at 875 nm and washed in (0.42%) n-nonyl- -D maltopyranoside to exchange the purification detergent, n-dodecyl- -D-maltopyranoside. Crystals grew in 14.00% PEG400, 0.10 M N-cyclohexyl-3-aminopropanesulfonic acid (CAPS) pH 10.5, and 1.0% spermidine. , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K ; # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector 'AREA DETECTOR' _diffrn_detector.type 'ADSC QUANTUM 4' _diffrn_detector.pdbx_collection_date ? _diffrn_detector.details 'SI(111) SINGLE CRYSTAL MONOCHROMATOR AND VERTICALLY FOCUSSING SI CRYSTAL MIRROR' # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'SI(111) SINGLE CRYSTAL' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.912 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SRS BEAMLINE PX9.6' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SRS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline PX9.6 _diffrn_source.pdbx_wavelength 0.912 _diffrn_source.pdbx_wavelength_list ? # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 4JCB _reflns.observed_criterion_sigma_I 0.000 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 20.39 _reflns.d_resolution_high 7.78 _reflns.number_obs 6831 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 82.0 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.09300 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 5.6000 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 2.900 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? # _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.d_res_high 7.78 _reflns_shell.d_res_low 8.40 _reflns_shell.percent_possible_all 80.0 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.90500 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 1.000 _reflns_shell.pdbx_redundancy 2.90 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all ? _reflns_shell.number_measured_all ? _reflns_shell.number_measured_obs ? _reflns_shell.number_unique_obs ? _reflns_shell.pdbx_chi_squared ? # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 4JCB _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs 5997 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F . _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 20.39 _refine.ls_d_res_high 7.78 _refine.ls_percent_reflns_obs 73.65 _refine.ls_R_factor_obs 0.22939 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.22793 _refine.ls_R_factor_R_free 0.25767 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 4.9 _refine.ls_number_reflns_R_free 311 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.898 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free 0.893 _refine.B_iso_mean 250.037 _refine.aniso_B[1][1] -138.15 _refine.aniso_B[2][2] 76.04 _refine.aniso_B[3][3] 62.11 _refine.aniso_B[1][2] -0.00 _refine.aniso_B[1][3] -153.97 _refine.aniso_B[2][3] 0.00 _refine.solvent_model_details 'BABINET MODEL WITH MASK' _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.20 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii 0.80 _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.80 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details 'HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT' _refine.pdbx_starting_model 'MODEL OBTAINED BY FITTING 2D CRYO- ELECTRONMYCROSCOPY IMAGES' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 1.207 _refine.overall_SU_ML 2.374 _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B 300.261 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 17267 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 1736 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 19003 _refine_hist.d_res_high 7.78 _refine_hist.d_res_low 20.39 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function r_bond_refined_d 0.013 0.020 ? 39880 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_bond_other_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_angle_refined_deg 2.630 2.057 ? 55546 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_angle_other_deg ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_1_deg 8.762 5.000 ? 4240 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_2_deg 33.257 22.557 ? 1502 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_3_deg 24.091 15.000 ? 5284 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_4_deg 16.224 15.000 ? 152 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_chiral_restr 0.083 0.200 ? 5720 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_gen_planes_refined 0.008 0.021 ? 31474 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_gen_planes_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbd_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbd_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbtor_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbtor_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_xyhbond_nbd_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_xyhbond_nbd_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_metal_ion_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_metal_ion_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_vdw_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_vdw_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_hbond_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_hbond_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcbond_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcangle_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_scbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_scbond_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_scangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_scangle_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_long_range_B_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_long_range_B_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_rigid_bond_restr ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_sphericity_free ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_sphericity_bonded ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 7.78 _refine_ls_shell.d_res_low 7.950 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work ? _refine_ls_shell.percent_reflns_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? # _struct.entry_id 4JCB _struct.title 'RC-LH1-PufX dimer complex from Rhodobacter sphaeroides' _struct.pdbx_descriptor ;Light-harvesting protein B-875 alpha chain, Intrinsic membrane protein PufX, Light-harvesting protein B-875 beta chain, Reaction center protein H chain, Reaction center protein L chain, Reaction center protein M chain ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4JCB _struct_keywords.pdbx_keywords PHOTOSYNTHESIS _struct_keywords.text ;photosynthesis, antenna complex LH1, Reaction Centre, chromophores, Photosynthetic Complexes, Photosynthetic Light Capture and electron transfer, Photosynthetic Chromophores, membrane spherical vesicles, PufX, quinol, quinone ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 1 ? N N N 1 ? O N N 2 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? R N N 3 ? S N N 3 ? T N N 3 ? U N N 3 ? V N N 3 ? W N N 3 ? X N N 3 ? Y N N 3 ? Z N N 3 ? AA N N 3 ? BA N N 3 ? CA N N 3 ? DA N N 4 ? EA N N 5 ? FA N N 6 ? GA N N 7 ? HA N N 7 ? IA N N 7 ? JA N N 7 ? KA N N 7 ? LA N N 7 ? MA N N 7 ? NA N N 7 ? OA N N 7 ? PA N N 7 ? QA N N 7 ? RA N N 7 ? SA N N 7 ? TA N N 7 ? UA N N 7 ? VA N N 7 ? WA N N 7 ? XA N N 7 ? YA N N 7 ? ZA N N 7 ? AB N N 7 ? BB N N 7 ? CB N N 7 ? DB N N 7 ? EB N N 7 ? FB N N 7 ? GB N N 7 ? HB N N 7 ? IB N N 7 ? JB N N 7 ? KB N N 7 ? LB N N 8 ? MB N N 9 ? NB N N 10 ? OB N N 11 ? PB N N 7 ? QB N N 8 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details 'The biological relevant complex is composed of entries 4JCB and 4JC9 each containing 32 protein chains' # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 PHE A 23 ? LEU A 36 ? PHE 5 23 LEU 5 36 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 2 VAL B 18 ? LEU B 27 ? VAL T 18 LEU T 27 1 ? 10 HELX_P HELX_P3 3 VAL C 22 ? LEU C 33 ? VAL V 22 LEU V 33 1 ? 12 HELX_P HELX_P4 4 LEU C 33 ? THR C 38 ? LEU V 33 THR V 38 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 5 PHE D 11 ? ARG D 15 ? PHE X 11 ARG X 15 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 6 LEU D 24 ? ILE D 34 ? LEU X 24 ILE X 34 1 ? 11 HELX_P HELX_P7 7 LEU D 35 ? SER D 37 ? LEU X 35 SER X 37 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 8 VAL E 22 ? LEU E 36 ? VAL 3 22 LEU 3 36 1 ? 15 HELX_P HELX_P9 9 ALA F 28 ? LEU F 33 ? ALA 7 28 LEU 7 33 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 10 VAL G 22 ? VAL G 29 ? VAL D 22 VAL D 29 1 ? 8 HELX_P HELX_P11 11 HIS G 32 ? SER G 37 ? HIS D 32 SER D 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 12 ARG H 14 ? ALA H 19 ? ARG F 14 ALA F 19 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 13 LEU H 24 ? LEU H 33 ? LEU F 24 LEU F 33 1 ? 10 HELX_P HELX_P14 14 PHE I 25 ? THR I 38 ? PHE 1 25 THR 1 38 1 ? 14 HELX_P HELX_P15 15 LEU J 26 ? ILE J 34 ? LEU J 26 ILE J 34 1 ? 9 HELX_P HELX_P16 16 GLN K 20 ? PHE K 25 ? GLN 2 20 PHE 2 25 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 17 PHE K 25 ? LEU K 36 ? PHE 2 25 LEU 2 36 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 18 ARG L 14 ? VAL L 18 ? ARG N 14 VAL N 18 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 19 VAL L 22 ? LEU L 27 ? VAL N 22 LEU N 27 1 ? 6 HELX_P HELX_P20 20 ALA L 28 ? LEU L 36 ? ALA N 28 LEU N 36 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 21 VAL M 18 ? LEU M 27 ? VAL P 18 LEU P 27 1 ? 10 HELX_P HELX_P22 22 ALA M 28 ? LEU M 36 ? ALA P 28 LEU P 36 1 ? 9 HELX_P HELX_P23 23 ARG N 14 ? ALA N 19 ? ARG Z 14 ALA Z 19 1 ? 6 HELX_P HELX_P24 24 LEU N 27 ? LEU N 33 ? LEU Z 27 LEU Z 33 1 ? 7 HELX_P HELX_P25 25 MET O 28 ? ALA O 34 ? MET B 28 ALA B 34 1 ? 7 HELX_P HELX_P26 26 GLU P 15 ? LEU P 20 ? GLU S 14 LEU S 19 1 ? 6 HELX_P HELX_P27 27 SER P 26 ? ALA P 33 ? SER S 25 ALA S 32 1 ? 8 HELX_P HELX_P28 28 VAL P 37 ? VAL P 42 ? VAL S 36 VAL S 41 5 ? 6 HELX_P HELX_P29 29 THR Q 13 ? GLN Q 18 ? THR 9 12 GLN 9 17 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 30 LEU Q 30 ? ALA Q 41 ? LEU 9 29 ALA 9 40 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 31 GLU R 15 ? LEU R 20 ? GLU O 14 LEU O 19 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 32 VAL R 34 ? HIS R 39 ? VAL O 33 HIS O 38 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 33 HIS R 39 ? ILE R 44 ? HIS O 38 ILE O 43 1 ? 6 HELX_P HELX_P34 34 TYR S 24 ? ALA S 33 ? 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N LYS H 132 O VAL DA 169 ? O VAL H 169 A 2 3 N TRP DA 168 ? N TRP H 168 O PHE DA 178 ? O PHE H 178 A 3 4 N VAL DA 181 ? N VAL H 181 O ARG DA 189 ? O ARG H 189 B 1 2 N ALA DA 144 ? N ALA H 144 O GLN FA 12 ? O GLN M 11 C 1 2 N ARG DA 154 ? N ARG H 154 O VAL DA 203 ? O VAL H 203 D 1 2 N VAL EA 27 ? N VAL L 26 O PHE EA 30 ? 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QB 8 BPH 1 402 402 BPH BPH M . # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 32-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 32 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 NE2 ? EA HIS 191 ? L HIS 190 ? 1_555 FE ? MB FE2 . ? L FE2 305 ? 1_555 NE2 ? FA HIS 220 ? M HIS 219 ? 1_555 162.8 ? 2 NE2 ? EA HIS 191 ? L HIS 190 ? 1_555 FE ? MB FE2 . ? L FE2 305 ? 1_555 NE2 ? EA HIS 231 ? L HIS 230 ? 1_555 111.5 ? 3 NE2 ? FA HIS 220 ? M HIS 219 ? 1_555 FE ? MB FE2 . ? L FE2 305 ? 1_555 NE2 ? EA HIS 231 ? L HIS 230 ? 1_555 85.3 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2013-10-30 2 'Structure model' 1 1 2013-12-25 3 'Structure model' 1 2 2014-12-10 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 2 3 'Structure model' repository Obsolete ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' Other # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal GDA 'data collection' . ? 1 PHASER 'model building' . ? 2 REFMAC refinement 5.7.0029 ? 3 MOSFLM 'data reduction' . ? 4 SCALA 'data scaling' . ? 5 PHASER phasing . ? 6 # _pdbx_entry_details.entry_id 4JCB _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ;THE ISOLATED SAMPLE DOES NOT HAVE THE SAME NUMBER OF AMINO ACID RESIDUES CODED IN DNA FOR PROTEIN PUFX (CHAIN B). PUFX HAS 82 AMINO ACID RESIDUES BASED ON ITS DNA SEQUENCE. IT HAS BEEN SHOWN TO BE POSTRANSLATIONALLY MODIFIED AND THE LAST 12 RESIDUES ARE ABSENT (RATCLIFFE ET AL (2011), BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA,1807,95-107). ; _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O L ALA 176 ? ? 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? -124.07 -78.20 23 1 MET V 9 ? ? 68.04 -71.04 24 1 ARG V 15 ? ? -171.77 -19.51 25 1 LEU V 35 ? ? -98.40 42.13 26 1 SER V 40 ? ? -139.76 -59.78 27 1 ASN V 42 ? ? 67.95 -91.72 28 1 TRP V 43 ? ? 62.12 -25.03 29 1 PRO X 13 ? ? -81.70 30.08 30 1 ARG X 14 ? ? -148.37 18.49 31 1 ARG X 15 ? ? -166.26 41.29 32 1 VAL X 16 ? ? -161.81 -22.98 33 1 PHE X 17 ? ? -101.16 -67.13 34 1 LEU X 35 ? ? -103.99 40.85 35 1 TYR X 41 ? ? -113.28 -90.82 36 1 ASN X 42 ? ? 73.86 -69.39 37 1 TRP X 43 ? ? 70.19 -5.23 38 1 LEU X 44 ? ? -148.64 -17.03 39 1 SER X 47 ? ? -140.18 17.22 40 1 MET 3 9 ? ? 70.57 -7.04 41 1 PRO 3 13 ? ? -61.27 1.59 42 1 ARG 3 14 ? ? -149.43 -42.38 43 1 LEU 3 27 ? ? -64.77 5.65 44 1 ALA 3 28 ? ? -102.51 -72.73 45 1 SER 3 37 ? ? -153.30 79.06 46 1 PRO 3 39 ? ? -92.87 39.70 47 1 SER 3 40 ? ? -152.68 -69.25 48 1 ASN 3 42 ? ? 59.68 -108.12 49 1 TRP 3 43 ? ? 67.59 -4.25 50 1 ALA 3 48 ? ? -153.11 -24.32 51 1 MET 7 9 ? ? 59.60 -135.11 52 1 ILE 7 10 ? ? 34.86 -145.67 53 1 ARG 7 14 ? ? -139.54 -81.95 54 1 ARG 7 15 ? 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? -134.03 -44.61 87 1 SER F 47 ? ? -152.01 3.68 88 1 MET 1 9 ? ? 91.57 -21.23 89 1 ASP 1 12 ? ? -132.72 -54.55 90 1 PRO 1 13 ? ? -59.12 8.47 91 1 VAL 1 16 ? ? -140.78 -19.96 92 1 VAL 1 18 ? ? -153.11 -1.54 93 1 SER 1 40 ? ? -148.82 -35.26 94 1 TYR 1 41 ? ? -72.34 -85.24 95 1 ASN 1 42 ? ? 64.57 -68.03 96 1 TRP 1 43 ? ? 74.14 -26.52 97 1 SER 1 47 ? ? -67.60 -74.60 98 1 MET J 9 ? ? 56.72 -109.10 99 1 PRO J 13 ? ? -79.89 35.01 100 1 ARG J 14 ? ? -157.16 -37.96 101 1 PHE J 17 ? ? -146.29 -65.75 102 1 PHE J 25 ? ? -103.43 -65.73 103 1 ILE J 34 ? ? -84.83 49.29 104 1 LEU J 35 ? ? -149.97 -44.15 105 1 TYR J 41 ? ? -80.81 -94.18 106 1 ASN J 42 ? ? 65.31 -68.60 107 1 TRP J 43 ? ? 64.35 -39.88 108 1 SER J 47 ? ? -144.14 -39.77 109 1 ILE 2 10 ? ? -131.93 -150.82 110 1 ASP 2 12 ? ? -131.13 -45.31 111 1 PHE 2 17 ? ? -145.81 -52.01 112 1 PHE 2 25 ? ? -108.08 -65.53 113 1 PRO 2 39 ? ? -66.99 43.62 114 1 TYR 2 41 ? ? -120.45 -71.39 115 1 ASN 2 42 ? ? 77.77 -56.32 116 1 TRP 2 43 ? ? 32.89 -58.07 117 1 SER 2 47 ? ? 41.59 -91.89 118 1 MET N 9 ? ? 72.19 -26.13 119 1 ASP N 12 ? ? -134.06 -77.12 120 1 ARG N 14 ? ? -151.86 -21.80 121 1 TYR N 41 ? ? -84.83 -89.81 122 1 ASN N 42 ? ? 70.80 -51.74 123 1 TRP N 43 ? ? 62.44 -30.16 124 1 SER N 47 ? ? -69.18 71.46 125 1 ALA N 48 ? ? -154.61 -65.82 126 1 MET P 9 ? ? 66.49 -25.11 127 1 ASP P 12 ? ? -122.25 -51.68 128 1 ARG P 14 ? ? -141.91 -57.89 129 1 VAL P 18 ? ? -130.67 -39.45 130 1 PHE P 25 ? ? -158.47 -41.60 131 1 ASN P 42 ? ? 61.28 -85.82 132 1 TRP P 43 ? ? 61.96 -4.77 133 1 LEU P 44 ? ? -150.37 -9.44 134 1 SER P 47 ? ? 32.59 -93.43 135 1 ARG Z 14 ? ? -124.39 -73.96 136 1 ARG Z 15 ? ? -78.35 34.60 137 1 VAL Z 22 ? ? -140.67 10.05 138 1 PHE Z 23 ? ? -92.51 -77.45 139 1 THR Z 38 ? ? 76.78 -107.08 140 1 PRO Z 39 ? ? -38.29 93.04 141 1 SER Z 40 ? ? 154.05 -40.92 142 1 TYR Z 41 ? ? -92.92 -79.52 143 1 ASN Z 42 ? ? 74.11 -99.49 144 1 TRP Z 43 ? ? 69.50 -18.91 145 1 LEU Z 44 ? ? -140.13 -10.38 146 1 SER Z 47 ? ? -29.67 -62.78 147 1 THR B 5 ? ? 76.14 -18.19 148 1 ILE B 6 ? ? -74.50 -80.89 149 1 PHE B 7 ? ? -90.47 -116.00 150 1 ASN B 8 ? ? -153.77 0.90 151 1 ASP B 9 ? ? -132.49 -152.48 152 1 LEU B 11 ? ? -121.96 -69.90 153 1 ASN B 12 ? ? -143.79 -108.47 154 1 THR B 13 ? ? 58.31 170.64 155 1 LYS B 16 ? ? 76.39 -41.12 156 1 ASN B 18 ? ? 49.59 18.41 157 1 ARG B 20 ? ? -151.24 43.57 158 1 TRP B 22 ? ? 68.04 -82.39 159 1 ALA B 24 ? ? -156.14 -62.78 160 1 PHE B 25 ? ? -122.11 -50.32 161 1 GLN B 26 ? ? -58.03 -82.62 162 1 LEU B 42 ? ? -145.21 24.29 163 1 LEU B 44 ? ? -147.58 15.26 164 1 ILE B 45 ? ? -127.46 -52.39 165 1 ARG B 49 ? ? -113.99 61.32 166 1 VAL B 50 ? ? -141.28 -26.97 167 1 ARG B 53 ? ? -154.06 -60.56 168 1 LYS S 3 ? ? -77.61 -168.90 169 1 SER S 4 ? ? -81.90 -79.75 170 1 LEU S 6 ? ? 69.93 -179.91 171 1 THR S 12 ? ? -176.13 -46.34 172 1 ASP S 13 ? ? 116.99 -74.36 173 1 GLN S 17 ? ? -142.27 -42.54 174 1 LEU S 19 ? ? -87.05 48.86 175 1 HIS S 20 ? ? -132.77 -36.76 176 1 TYR S 23 ? ? -131.01 -58.39 177 1 ALA S 40 ? ? -101.14 44.90 178 1 ARG S 45 ? ? -162.29 -67.73 179 1 TYR 9 8 ? ? 4.52 88.35 180 1 THR 9 12 ? ? 55.26 -88.67 181 1 HIS 9 20 ? ? -152.71 -23.67 182 1 SER 9 31 ? ? -68.76 26.57 183 1 ALA 9 32 ? ? -143.47 -58.04 184 1 VAL 9 41 ? ? -134.65 -51.43 185 1 ARG 9 45 ? ? -144.83 54.78 186 1 LYS O 3 ? ? -108.00 -83.31 187 1 LEU O 6 ? ? 59.45 91.35 188 1 ASP O 13 ? ? -106.20 77.38 189 1 HIS O 20 ? ? -152.19 2.20 190 1 SER O 25 ? ? -120.65 -55.11 191 1 ALA O 40 ? ? -93.55 30.20 192 1 VAL O 41 ? ? -148.64 -34.95 193 1 ARG O 45 ? ? -140.24 50.08 194 1 PRO O 46 ? ? -65.96 -71.04 195 1 TRP O 47 ? ? -66.57 87.06 196 1 TYR Q 8 ? ? 60.01 81.37 197 1 LEU Q 11 ? ? -125.53 -128.73 198 1 THR Q 12 ? ? -160.78 116.30 199 1 ASP Q 13 ? ? -102.37 50.34 200 1 HIS Q 20 ? ? -142.71 -38.24 201 1 TYR Q 23 ? ? -120.44 -55.36 202 1 ALA Q 32 ? ? -147.23 -53.73 203 1 VAL Q 41 ? ? -137.28 -31.52 204 1 LYS 6 3 ? ? -116.62 -119.68 205 1 SER 6 4 ? ? -140.60 -65.27 206 1 ASP 6 5 ? ? -83.14 -154.27 207 1 TYR 6 8 ? ? 16.54 81.91 208 1 THR 6 12 ? ? -35.79 115.58 209 1 ASP 6 13 ? ? -109.06 54.78 210 1 LEU 6 19 ? ? -96.07 34.61 211 1 HIS 6 20 ? ? -137.45 -41.19 212 1 VAL 6 41 ? ? -136.21 -31.56 213 1 ARG 6 45 ? ? -144.83 39.80 214 1 LYS U 3 ? ? -134.00 -142.34 215 1 SER U 4 ? ? -101.20 -128.89 216 1 LEU U 6 ? ? 56.60 90.12 217 1 TYR U 8 ? ? 49.69 96.58 218 1 THR U 12 ? ? 63.63 96.55 219 1 HIS U 20 ? ? -157.22 -37.46 220 1 LEU U 29 ? ? -102.12 42.46 221 1 PHE U 30 ? ? -148.65 -32.32 222 1 ILE U 43 ? ? -146.99 -8.67 223 1 ARG U 45 ? ? -153.48 48.09 224 1 ASP W 2 ? ? -115.91 -71.59 225 1 SER W 4 ? ? -104.77 -147.55 226 1 LEU W 6 ? ? 64.54 98.19 227 1 LEU W 11 ? ? -136.75 -108.39 228 1 THR W 12 ? ? -160.04 100.20 229 1 ASP W 13 ? ? -105.69 65.46 230 1 GLN W 17 ? ? -127.71 -67.63 231 1 GLU W 18 ? ? -60.26 -78.64 232 1 HIS W 20 ? ? -147.49 -39.56 233 1 LEU W 27 ? ? -127.36 -55.25 234 1 PHE W 30 ? ? -131.14 -75.06 235 1 ARG W 45 ? ? -144.96 39.24 236 1 SER Y 4 ? ? -107.23 -118.78 237 1 ASP Y 5 ? ? -82.89 -158.57 238 1 TYR Y 8 ? ? 52.10 93.50 239 1 THR Y 12 ? ? 68.36 111.29 240 1 GLN Y 17 ? ? -148.40 -81.64 241 1 SER Y 21 ? ? -152.55 -28.12 242 1 PHE Y 30 ? ? -139.41 -48.69 243 1 ILE Y 43 ? ? -142.09 11.58 244 1 ASP 4 2 ? ? -137.16 -109.79 245 1 SER 4 4 ? ? -144.57 -131.46 246 1 TYR 4 8 ? ? 58.83 104.92 247 1 LEU 4 11 ? ? -159.24 -40.96 248 1 THR 4 12 ? ? 65.04 105.40 249 1 GLU 4 14 ? ? 79.33 159.83 250 1 GLN 4 15 ? ? 73.11 -52.49 251 1 GLN 4 17 ? ? -164.96 9.81 252 1 GLU 4 18 ? ? -128.61 -63.26 253 1 TYR 4 23 ? ? -151.14 17.08 254 1 MET 4 24 ? ? -151.79 -52.16 255 1 ALA 4 34 ? ? -137.58 -49.71 256 1 ILE 4 43 ? ? -151.55 -15.49 257 1 LYS 8 3 ? ? -87.17 -158.52 258 1 SER 8 4 ? ? -108.46 -74.54 259 1 ASP 8 5 ? ? -107.89 -136.75 260 1 TYR 8 8 ? ? 72.66 134.94 261 1 LEU 8 11 ? ? -170.02 86.07 262 1 GLN 8 17 ? ? -143.95 -25.79 263 1 HIS 8 20 ? ? -158.19 -12.52 264 1 TYR 8 23 ? ? -132.51 -47.82 265 1 LEU 8 27 ? ? -75.12 25.02 266 1 TRP 8 28 ? ? -138.92 -34.64 267 1 PHE 8 30 ? ? -145.71 -33.50 268 1 VAL 8 41 ? ? -132.30 -36.24 269 1 ARG 8 45 ? ? -144.46 43.84 270 1 TRP 8 47 ? ? -117.10 78.23 271 1 SER E 4 ? ? -106.61 -107.19 272 1 ASP E 5 ? ? -124.19 -164.75 273 1 LEU E 11 ? ? -151.25 -45.48 274 1 THR E 12 ? ? 161.83 132.24 275 1 GLU E 18 ? ? -138.01 -72.16 276 1 TRP E 28 ? ? -144.18 -54.35 277 1 VAL E 41 ? ? -137.84 -41.04 278 1 TYR E 42 ? ? -69.01 5.40 279 1 ILE E 43 ? ? -144.86 -5.23 280 1 ASP G 2 ? ? -147.51 -111.21 281 1 SER G 4 ? ? -123.04 -142.40 282 1 TYR G 8 ? ? 54.22 81.94 283 1 LEU G 11 ? ? -152.60 -28.72 284 1 THR G 12 ? ? 68.29 93.90 285 1 ALA G 16 ? ? -92.26 37.36 286 1 HIS G 20 ? ? -165.78 33.08 287 1 SER G 21 ? ? -126.64 -61.83 288 1 ALA G 37 ? ? -90.52 35.30 289 1 SER I 4 ? ? -101.24 -129.06 290 1 ASP I 5 ? ? -92.61 -144.91 291 1 THR I 12 ? ? -36.45 114.47 292 1 GLN I 17 ? ? -145.13 -50.00 293 1 SER I 21 ? ? -148.60 -46.63 294 1 PHE I 30 ? ? -128.51 -60.97 295 1 ALA I 40 ? ? -104.24 45.96 296 1 VAL I 41 ? ? -136.27 -52.10 297 1 SER K 4 ? ? -74.78 -78.68 298 1 ASP K 5 ? ? -138.38 -133.00 299 1 TYR K 8 ? ? 45.53 95.87 300 1 LEU K 11 ? ? -146.00 -120.69 301 1 ASP K 13 ? ? -105.14 58.16 302 1 GLU K 18 ? ? -96.53 -77.64 303 1 LEU K 19 ? ? -88.97 38.89 304 1 SER K 25 ? ? -145.37 -41.86 305 1 VAL K 41 ? ? -145.48 17.07 306 1 ILE K 43 ? ? -146.16 11.90 307 1 PRO K 46 ? ? -53.48 8.19 308 1 TRP K 47 ? ? -155.29 71.52 309 1 LEU H 15 ? ? -149.89 -60.39 310 1 LEU H 27 ? ? -135.92 -51.73 311 1 MET H 36 ? ? -107.23 46.88 312 1 ARG H 37 ? ? -94.20 -68.80 313 1 ASN H 44 ? ? -78.67 -138.79 314 1 ASP H 46 ? ? -156.07 -39.60 315 1 GLN H 53 ? ? -134.36 -44.41 316 1 LYS H 62 ? ? -110.57 -152.82 317 1 GLU H 81 ? ? -102.97 73.02 318 1 THR H 101 ? ? -74.50 -72.72 319 1 LYS H 106 ? ? -95.44 -66.24 320 1 ASP H 124 ? ? -116.43 -76.13 321 1 ALA H 136 ? ? -100.85 -63.56 322 1 ALA H 138 ? ? -51.42 81.88 323 1 HIS H 141 ? ? -98.01 -159.88 324 1 SER H 143 ? ? -127.53 -73.47 325 1 ALA H 161 ? ? -121.93 -53.37 326 1 ILE H 171 ? ? -125.88 -60.11 327 1 MET H 175 ? ? -167.23 117.30 328 1 PRO H 192 ? ? -71.44 -158.75 329 1 GLN H 194 ? ? -88.11 35.88 330 1 SER H 200 ? ? -146.66 -90.24 331 1 VAL H 225 ? ? -115.59 68.96 332 1 TYR H 243 ? ? -91.17 -60.35 333 1 LYS H 249 ? 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? 179.83 110.13 364 1 GLU L 205 ? ? -43.71 151.60 365 1 PRO L 209 ? ? -69.95 11.48 366 1 PHE L 215 ? ? -135.24 -48.04 367 1 LEU L 219 ? ? -122.25 -87.69 368 1 SER L 223 ? ? -157.05 79.83 369 1 LEU L 236 ? ? -130.59 -34.71 370 1 ALA L 240 ? ? -83.22 36.69 371 1 VAL L 241 ? ? -145.53 -33.47 372 1 TRP L 263 ? ? -89.93 47.23 373 1 ILE L 279 ? ? 66.75 -63.25 374 1 PHE M 7 ? ? -69.16 81.02 375 1 SER M 8 ? ? 65.20 100.64 376 1 VAL M 10 ? ? -109.11 -151.28 377 1 PRO M 15 ? ? -90.34 -100.02 378 1 ALA M 16 ? ? -114.55 66.86 379 1 LEU M 18 ? ? -71.55 -75.30 380 1 GLU M 22 ? ? -141.44 -51.95 381 1 ARG M 29 ? ? -64.53 79.96 382 1 THR M 37 ? ? -69.18 70.16 383 1 LEU M 39 ? ? 36.99 59.25 384 1 PHE M 42 ? ? -94.64 -76.66 385 1 VAL M 57 ? ? -72.28 30.78 386 1 LEU M 89 ? ? -48.60 -5.81 387 1 TYR M 101 ? ? -146.40 -50.72 388 1 GLU M 111 ? ? -112.17 -92.15 389 1 VAL M 126 ? ? -140.74 -5.62 390 1 ARG M 132 ? ? -153.80 -11.19 391 1 LEU M 140 ? ? -137.95 -31.88 392 1 ILE M 154 ? ? -75.27 36.29 393 1 MET M 158 ? 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