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_diffrn_source.pdbx_wavelength_list 0.97920 # _reflns.entry_id 4JJN _reflns.observed_criterion_sigma_I -3.0 _reflns.observed_criterion_sigma_F -3.0 _reflns.d_resolution_low 139.09 _reflns.d_resolution_high 3.09 _reflns.number_obs 60025 _reflns.number_all 61627 _reflns.percent_possible_obs 97.4 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.039 _reflns.pdbx_Rsym_value 0.039 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 14.0 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 2.9 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 # loop_ _reflns_shell.d_res_high _reflns_shell.d_res_low _reflns_shell.percent_possible_all _reflns_shell.Rmerge_I_obs _reflns_shell.pdbx_Rsym_value _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs _reflns_shell.pdbx_redundancy _reflns_shell.percent_possible_obs _reflns_shell.number_unique_all _reflns_shell.number_measured_all _reflns_shell.number_measured_obs _reflns_shell.number_unique_obs _reflns_shell.pdbx_chi_squared _reflns_shell.pdbx_ordinal _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 3.09 3.26 97.9 0.487 0.487 1.5 2.9 ? 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'X-RAY DIFFRACTION' . 4.5273 4.7659 2538 0.2227 97.00 0.2603 . . 137 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.7659 5.0645 2616 0.2190 99.00 0.2299 . . 153 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.0645 5.4555 2658 0.2320 99.00 0.2402 . . 152 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.4555 6.0044 2556 0.2407 97.00 0.2711 . . 138 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 6.0044 6.8729 2423 0.2468 91.00 0.2839 . . 141 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 6.8729 8.6578 2583 0.1926 97.00 0.1850 . . 132 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 8.6578 85.4830 2415 0.1610 90.00 0.1693 . . 118 . . . . 'X-RAY DIFFRACTION' # _database_PDB_matrix.entry_id 4JJN _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 4JJN _struct.title 'Crystal structure of heterochromatin protein Sir3 in complex with a silenced yeast nucleosome' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4JJN _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN/DNA' _struct_keywords.text 'BAH domain, silencing, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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UNP P06701 ASP 205 'engineered mutation' 205 4 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLY A 44 ? 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'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog279 hydrog ? ? K DC 143 N4 ? ? ? 1_555 L DG 4 O6 ? ? I DC 143 J DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog280 hydrog ? ? K DC 143 O2 ? ? ? 1_555 L DG 5 N2 ? ? I DC 143 J DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog281 hydrog ? ? K DC 144 O2 ? ? ? 1_555 L DG 4 N1 ? ? I DC 144 J DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog282 hydrog ? ? K DG 145 N1 ? ? ? 1_555 L DC 3 N3 ? ? I DG 145 J DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog283 hydrog ? ? K DG 145 N2 ? ? ? 1_555 L DC 3 O2 ? ? I DG 145 J DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog284 hydrog ? ? K DG 145 O6 ? ? ? 1_555 L DC 3 N4 ? ? I DG 145 J DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog285 hydrog ? ? K DA 146 N1 ? ? ? 1_555 L DT 2 N3 ? ? I DA 146 J DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog286 hydrog ? ? K DA 146 N6 ? ? ? 1_555 L DT 2 O4 ? ? I DA 146 J DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog287 hydrog ? ? K DT 147 N3 ? ? ? 1_555 L DA 1 N1 ? ? I DT 147 J DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ARG 134 A . ? ARG 134 A SER 135 A ? SER 135 A 1 0.01 2 HIS 39 E . ? HIS 39 E ARG 40 E ? ARG 40 E 1 -1.64 3 GLY 13 F . ? GLY 13 F GLY 14 F ? GLY 14 F 1 3.22 4 LYS 120 G . ? 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O ALA K 148 N ILE I 57 ? N ILE K 57 M 2 3 N PHE I 58 ? N PHE K 58 O SER I 67 ? O SER K 67 M 3 4 N LEU I 70 ? N LEU K 70 O PHE I 88 ? O PHE K 88 M 4 5 N LEU I 91 ? N LEU K 91 O TYR I 133 ? O TYR K 133 M 5 6 N LEU I 132 ? N LEU K 132 O LEU I 172 ? O LEU K 172 M 6 7 N ALA I 176 ? N ALA K 176 O VAL I 185 ? O VAL K 185 N 1 2 N ILE J 14 ? N ILE L 14 O PHE J 40 ? O PHE L 40 N 2 3 N LEU J 41 ? N LEU L 41 O PHE J 50 ? O PHE L 50 O 1 2 O ALA J 148 ? O ALA L 148 N ILE J 57 ? N ILE L 57 O 2 3 N PHE J 58 ? N PHE L 58 O SER J 67 ? O SER L 67 O 3 4 N LEU J 70 ? N LEU L 70 O PHE J 88 ? O PHE L 88 O 4 5 N LEU J 91 ? N LEU L 91 O TYR J 133 ? O TYR L 133 O 5 6 N LEU J 132 ? N LEU L 132 O LEU J 172 ? O LEU L 172 O 6 7 O PHE J 171 ? O PHE L 171 N GLN J 151 ? N GLN L 151 P 1 2 O ALA J 148 ? O ALA L 148 N ILE J 57 ? N ILE L 57 P 2 3 N PHE J 58 ? N PHE L 58 O SER J 67 ? O SER L 67 P 3 4 N LEU J 70 ? N LEU L 70 O PHE J 88 ? O PHE L 88 P 4 5 N LEU J 91 ? N LEU L 91 O TYR J 133 ? O TYR L 133 P 5 6 N LEU J 132 ? 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