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'Rattus norvegicus' 10116 ? 4922 ? ? ? 'Pichia pastoris' ? ? 'Pichia pastoris' 4922 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample ? ? ? 'Yellow scorpion' 'Leiurus quinquestriatus hebraeus' ? 6884 ? ? ? ? ? 'Leiurus quinquestriatus hebraeus' 6884 ? 562 ? ? ? 'Escherichia coli' ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP KCAB2_RAT P62483 1 ;LQFYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEHLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVI TTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEI MEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPPYSRASLKGYQWLKD KILSEEGRRQQAKLKELQAIAERLGCTLPQLAIAWCLRNEGVSSVLLGASNAEQLMENIGAIQVLPKLSSSIVHEIDSIL GNKPYSKKDYRS ; 36 ? 2 UNP KCNA2_RAT P63142 2 ;MTVATGDPVDEAAALPGHPQDTYDPEADHECCERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLGDPKKRMRYFDPLRNEYFFDR NRPSFDAILYYYQSGGRLRRPVNVPLDIFSEEIRFYELGEEAMEMFREDEGYIKEEERPLPENEFQRQVWLLFEYPESSG PARIIAIVSVMVILISIVSFCLETLPIFRDENEDMHGGGVTFHTYSNSTIGYQQSTSFTDPFFIVETLCIIWFSFEFLVR FFACPSKAGFFTNIMNIIDIVAIIPY ; 1 ? 3 UNP KCNB1_RAT P15387 2 YVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILR 274 ? 4 UNP KCNA2_RAT P63142 2 ;IFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADERDSQFPSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMVPT TIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQYLQVTSCPKIPSSPDLKKSRSASTISKSDYMEIQE GVNNSNEDFREENLKTANCTLANTNYVNITKMLTDV ; 304 ? 5 UNP KAX11_LEIQH P13487 3 QFTNVSCTTSKECWSVCQRLHNTSRGKCMNKKCRCYS 23 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4JTA A 2 ? 333 ? 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'NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE' ;2'-MONOPHOSPHOADENOSINE 5'-DIPHOSPHORIBOSE ; 'C21 H28 N7 O17 P3' 743.405 PCA 'L-peptide linking' n 'PYROGLUTAMIC ACID' ? 'C5 H7 N O3' 129.114 PGW non-polymer . '(1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate' '1-Palmitoyl-2-Oleoyl-sn-Glycero-3-[Phospho-(1-glycerol)]; PHOSPHATIDYLGLYCEROL' 'C40 H77 O10 P' 749.007 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.crystals_number 1 _exptl.entry_id 4JTA _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_Matthews 3.77 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_percent_sol 67.33 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.pH 8.9 _exptl_crystal_grow.temp 293 _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'PEG 400, POTASSIUM CHLORIDE, TRIS , pH 8.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K' _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp ? _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC QUANTUM 315r' _diffrn_detector.pdbx_collection_date ? _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.075 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'NSLS BEAMLINE X29A' _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.075 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site NSLS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X29A # _reflns.entry_id 4JTA _reflns.d_resolution_high 2.500 _reflns.d_resolution_low 50.000 _reflns.number_obs 99907 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.075 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 15.300 _reflns.pdbx_chi_squared 1.985 _reflns.pdbx_redundancy 6.900 _reflns.percent_possible_obs 96.100 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.observed_criterion_sigma_I ? _reflns.number_all ? _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 # loop_ _reflns_shell.d_res_high _reflns_shell.d_res_low _reflns_shell.number_measured_obs _reflns_shell.number_measured_all _reflns_shell.number_unique_obs _reflns_shell.Rmerge_I_obs _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs _reflns_shell.pdbx_Rsym_value _reflns_shell.pdbx_chi_squared _reflns_shell.pdbx_redundancy _reflns_shell.percent_possible_obs _reflns_shell.number_unique_all _reflns_shell.percent_possible_all _reflns_shell.pdbx_ordinal _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 2.500 2.590 ? ? ? 0.440 ? ? 1.075 2.300 ? 7270 71.100 1 1 2.590 2.690 ? ? ? 0.472 ? ? 1.148 3.200 ? 9298 91.000 2 1 2.690 2.820 ? ? ? 0.427 ? ? 1.140 4.500 ? 10120 98.500 3 1 2.820 2.960 ? ? ? 0.304 ? ? 1.210 6.400 ? 10270 100.000 4 1 2.960 3.150 ? ? ? 0.222 ? ? 1.247 8.100 ? 10321 100.000 5 1 3.150 3.390 ? ? ? 0.147 ? ? 1.428 8.500 ? 10306 100.000 6 1 3.390 3.730 ? ? ? 0.098 ? ? 1.645 8.800 ? 10380 100.000 7 1 3.730 4.270 ? ? ? 0.066 ? ? 2.005 8.800 ? 10436 100.000 8 1 4.270 5.380 ? ? ? 0.054 ? ? 2.415 8.700 ? 10548 100.000 9 1 5.380 50.000 ? ? ? 0.043 ? ? 4.343 8.200 ? 10958 99.700 10 1 # _refine.entry_id 4JTA _refine.ls_d_res_high 2.5000 _refine.ls_d_res_low 50.0000 _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.000 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_percent_reflns_obs 92.6000 _refine.ls_number_reflns_obs 96658 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.details ;THERE IS A TOXIN MOLECULE BOUND TO THE CHANNEL TETRAMER GENERATED BY FOUR COPIES OF A TOGETHER WITH FOUR COPIES OF B. HOWEVER IT WAS NOT BUILT BECAUSE IT WAS NOT SUFFICIENTLY WELL ORDERED. RESIDUES 133-144 IN CHAIN B WAS BUILT AS A POLYGLYCINE CHAIN BECAUSE OF LACK OF ADEQUATE ELECTRON DENSITY FOR THE SIDE CHAINS. ; _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.2101 _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free 0.2358 _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 4.4000 _refine.ls_number_reflns_R_free 4605 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.B_iso_mean 72.8609 _refine.solvent_model_param_bsol 72.2764 _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.aniso_B[1][1] -7.0690 _refine.aniso_B[2][2] -7.0690 _refine.aniso_B[3][3] 14.1380 _refine.aniso_B[1][2] 0.0000 _refine.aniso_B[1][3] 0.0000 _refine.aniso_B[2][3] 0.0000 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.solvent_model_details ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.B_iso_max 208.210 _refine.B_iso_min 19.110 _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.occupancy_max 1.000 _refine.occupancy_min 0.250 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 11454 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 334 _refine_hist.number_atoms_solvent 318 _refine_hist.number_atoms_total 12106 _refine_hist.d_res_high 2.5000 _refine_hist.d_res_low 50.0000 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function _refine_ls_restr.pdbx_refine_id c_mcbond_it ? 1.300 1.500 ? ? 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ALA A 125 ARG A 129 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 6 SER A 98 ? GLN A 114 ? SER A 132 GLN A 148 1 ? 17 HELX_P HELX_P7 7 PRO A 131 ? GLN A 145 ? PRO A 165 GLN A 179 1 ? 15 HELX_P HELX_P8 8 SER A 157 ? ASN A 172 ? SER A 191 ASN A 206 1 ? 16 HELX_P HELX_P9 9 ARG A 188 ? GLN A 194 ? ARG A 222 GLN A 228 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 10 GLN A 194 ? GLY A 203 ? GLN A 228 GLY A 237 1 ? 10 HELX_P HELX_P11 11 LEU A 212 ? GLY A 219 ? LEU A 246 GLY A 253 5 ? 8 HELX_P HELX_P12 12 SER A 229 ? LEU A 233 ? SER A 263 LEU A 267 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 13 TYR A 236 ? SER A 245 ? TYR A 270 SER A 279 1 ? 10 HELX_P HELX_P14 14 SER A 245 ? GLY A 266 ? SER A 279 GLY A 300 1 ? 22 HELX_P HELX_P15 15 THR A 268 ? LEU A 278 ? THR A 302 LEU A 312 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 16 ASN A 292 ? ILE A 300 ? ASN A 326 ILE A 334 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 17 GLY A 301 ? LEU A 306 ? GLY A 335 LEU A 340 1 ? 6 HELX_P HELX_P18 18 PRO A 307 ? LEU A 309 ? PRO A 341 LEU A 343 5 ? 3 HELX_P HELX_P19 19 SER A 310 ? GLY A 322 ? 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ILE B 297 HIS B 306 5 ? 10 HELX_P HELX_P34 34 SER B 326 ? SER B 339 ? SER B 307 SER B 320 1 ? 14 HELX_P HELX_P35 35 SER B 339 ? ASP B 367 ? SER B 320 ASP B 348 1 ? 29 HELX_P HELX_P36 36 SER B 375 ? THR B 388 ? SER B 356 THR B 369 1 ? 14 HELX_P HELX_P37 37 THR B 399 ? LEU B 419 ? THR B 380 LEU B 400 1 ? 21 HELX_P HELX_P38 38 PRO B 420 ? ARG B 434 ? PRO B 401 ARG B 415 1 ? 15 HELX_P HELX_P39 39 THR C 31 ? ASN C 45 ? THR P 65 ASN P 79 1 ? 15 HELX_P HELX_P40 40 VAL C 55 ? ALA C 58 ? VAL P 89 ALA P 92 5 ? 4 HELX_P HELX_P41 41 GLY C 59 ? GLY C 73 ? GLY P 93 GLY P 107 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 42 ARG C 75 ? LEU C 79 ? ARG P 109 LEU P 113 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 43 ALA C 91 ? ARG C 95 ? ALA P 125 ARG P 129 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 44 SER C 98 ? GLN C 114 ? SER P 132 GLN P 148 1 ? 17 HELX_P HELX_P45 45 PRO C 131 ? GLN C 145 ? PRO P 165 GLN P 179 1 ? 15 HELX_P HELX_P46 46 SER C 157 ? ASN C 172 ? SER P 191 ASN P 206 1 ? 16 HELX_P HELX_P47 47 ARG C 188 ? GLN C 194 ? 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Q VAL 371 Q K 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.497 ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 2 ? B ? 9 ? C ? 4 ? D ? 2 ? E ? 9 ? 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HA 7 HOH 23 623 129 HOH HOH Q . # _pdbx_struct_mod_residue.id 1 _pdbx_struct_mod_residue.label_asym_id E _pdbx_struct_mod_residue.label_comp_id PCA _pdbx_struct_mod_residue.label_seq_id 1 _pdbx_struct_mod_residue.auth_asym_id Y _pdbx_struct_mod_residue.auth_comp_id PCA _pdbx_struct_mod_residue.auth_seq_id 1 _pdbx_struct_mod_residue.PDB_ins_code ? _pdbx_struct_mod_residue.parent_comp_id GLN _pdbx_struct_mod_residue.details 'PYROGLUTAMIC ACID' # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? octameric 8 2 author_defined_assembly ? nonameric 9 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1,2,3,4 A,B,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,EA,FA 2 2,3,4 C,D,Z,AA,BA,CA,DA,GA,HA 2 1 C,D,E,Z,AA,BA,CA,DA,GA,HA # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 2 'crystal symmetry operation' 2_565 -x,-y+1,z -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 144.4000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 3 'crystal symmetry operation' 3_555 -y+1/2,x+1/2,z 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 72.2000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 72.2000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 4 'crystal symmetry operation' 4_455 y-1/2,-x+1/2,z 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 -72.2000000000 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 72.2000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 # loop_ _pdbx_struct_special_symmetry.id _pdbx_struct_special_symmetry.PDB_model_num _pdbx_struct_special_symmetry.auth_asym_id _pdbx_struct_special_symmetry.auth_comp_id _pdbx_struct_special_symmetry.auth_seq_id _pdbx_struct_special_symmetry.PDB_ins_code _pdbx_struct_special_symmetry.label_asym_id _pdbx_struct_special_symmetry.label_comp_id _pdbx_struct_special_symmetry.label_seq_id 1 1 Y LYS 27 ? 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CA K . # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 O ? 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Brunger' axel.brunger@yale.edu refinement http://cns-online.org/ Fortran_77 ? 4 PDB_EXTRACT 3.11 'April 22, 2011' package PDB deposit@deposit.rcsb.org 'data extraction' http://sw-tools.pdb.org/apps/PDB_EXTRACT/ C++ ? 5 HKL-2000 . ? ? ? ? 'data collection' ? ? ? 6 HKL-2000 . ? ? ? ? 'data reduction' ? ? ? 7 CNS . ? ? ? ? phasing ? ? ? # _pdbx_entry_details.entry_id 4JTA _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details 'PROTEIN IN CHAINS B,Q IS A CHIMERIC PROTEIN OF RAT KV1.2 AND RAT KV2.1. PLEASE REFER TO THE PRIMARY CITATION FOR MORE DETAILS.' _pdbx_entry_details.compound_details ;ONE CHANNEL TETRAMER (GENERATED BY USING THE BIOMT TRANSFORMATIONS ON CHAINS P AND Q AS NOTED ABOVE) BINDS TO ONE MOLECULE OF TOXIN (CHAIN Y). THE TOXIN CAN BIND IN FOUR DISTINCT ORIENTATIONS ALL OF WHICH ARE PARTIALLY OCCUPIED IN THE LATTICE. THE TOXIN WAS REFINED WITH 1/4 OCCUPANCY WITH ONE ORIENTATION OF THE TOXIN IN THE ASYMMETRIC UNIT. THE SYMMETRY OPERATIONS AROUND THE 4 FOLD SYMMETRY AXIS GENERATES THE OTHER POSSIBLE THREE ORIENTATIONS. PLEASE SEE PRIMARY CITATION FOR MORE DETAILS. ; _pdbx_entry_details.source_details ? # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 VAL A 58 ? ? 73.14 -47.13 2 1 PHE A 120 ? ? 174.72 -54.87 3 1 GLN A 221 ? ? -158.59 81.95 4 1 GLU A 223 ? ? -43.69 -72.17 5 1 TYR B 132 ? ? -145.22 -159.40 6 1 ILE B 133 ? ? 95.53 141.57 7 1 LYS B 134 ? ? 132.75 116.74 8 1 GLU B 137 ? ? 118.89 102.61 9 1 ARG B 138 ? ? -65.44 -125.84 10 1 PRO B 139 ? ? 169.20 132.67 11 1 GLU B 142 ? ? -68.60 39.58 12 1 ASN B 143 ? ? 5.78 -112.20 13 1 GLU B 144 ? ? -19.78 -50.05 14 1 PHE B 145 ? ? -91.91 -88.59 15 1 GLN B 146 ? ? -40.22 -76.44 16 1 ARG B 147 ? ? -38.71 -36.22 17 1 GLU B 154 ? ? -154.16 -24.77 18 1 GLU B 191 ? ? -103.91 79.54 19 1 PHE B 218 ? ? 35.08 50.24 20 1 PHE B 242 ? ? -89.59 41.71 21 1 ALA B 243 ? ? -166.98 15.84 22 1 PRO B 245 ? ? -54.23 -77.85 23 1 ASP B 348 ? ? -77.33 41.30 24 1 ASP B 351 ? ? -99.78 46.15 25 1 ARG B 415 ? ? -72.40 37.39 26 1 GLU B 416 ? ? -152.47 -47.92 27 1 VAL P 58 ? ? 67.42 -49.88 28 1 THR P 59 ? ? -68.87 -71.29 29 1 PHE P 120 ? ? 173.14 -58.76 30 1 MET P 219 ? ? -49.89 -14.90 31 1 GLN P 221 ? ? -152.63 87.89 32 1 GLU P 223 ? ? -44.32 -71.58 33 1 TYR P 255 ? ? -95.26 30.44 34 1 PHE Q 54 ? ? -117.39 76.00 35 1 TRP Q 150 ? ? -176.23 -12.30 36 1 LEU Q 151 ? ? -69.22 -77.08 37 1 LEU Q 152 ? ? -82.74 34.96 38 1 PHE Q 153 ? ? -141.34 46.25 39 1 GLU Q 154 ? ? 164.88 -25.71 40 1 PRO Q 156 ? ? -47.95 -10.63 41 1 SER Q 159 ? ? -178.01 -140.29 42 1 ASP Q 190 ? ? -88.11 46.95 43 1 SER Q 206 ? ? -98.48 44.50 44 1 GLN Q 207 ? ? -138.47 -46.09 45 1 THR Q 216 ? ? -25.43 90.21 46 1 SER Q 217 ? ? -177.68 -31.64 47 1 PHE Q 218 ? ? 64.32 74.52 48 1 PHE Q 222 ? ? -58.12 -8.88 49 1 ILE Q 224 ? ? -87.49 -70.82 50 1 ALA Q 243 ? ? -115.72 66.38 51 1 ILE Q 263 ? ? -147.63 -23.29 52 1 LYS Q 277 ? ? -67.87 67.85 53 1 ARG Q 287 ? ? -80.36 30.74 54 1 VAL Q 288 ? ? -130.60 -34.24 55 1 HIS Q 306 ? ? -140.69 12.53 56 1 TYR Q 373 ? ? -31.74 -39.30 57 1 MET Q 376 ? ? -167.05 115.60 58 1 TYR Q 411 ? ? -65.90 -74.27 59 1 THR Y 3 ? ? -91.46 -146.30 60 1 ASN Y 4 ? ? -152.26 54.96 61 1 THR Y 8 ? ? -129.72 -91.11 62 1 SER Y 10 ? ? -36.36 -32.66 63 1 LYS Y 11 ? ? -64.60 5.88 64 1 TRP Y 14 ? ? -77.08 -77.75 65 1 ARG Y 19 ? ? -86.51 -73.40 66 1 SER Y 24 ? ? -159.80 -19.71 67 1 ASN Y 30 ? ? -74.26 29.07 68 1 LYS Y 31 ? ? -119.71 -80.97 69 1 ARG Y 34 ? ? -165.60 112.38 # _pdbx_validate_planes.id 1 _pdbx_validate_planes.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_planes.auth_comp_id TYR _pdbx_validate_planes.auth_asym_id P _pdbx_validate_planes.auth_seq_id 270 _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code ? _pdbx_validate_planes.label_alt_id ? _pdbx_validate_planes.rmsd 0.065 _pdbx_validate_planes.type 'SIDE CHAIN' # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 B ILE 133 ? 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