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;PTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEHSVVL IRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEAA ; L ? 12 'polypeptide(L)' no no ;ARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKRL MDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; ;ARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKRL MDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; M ? 13 'polypeptide(L)' no no ARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW ARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW N ? 14 'polypeptide(L)' no no ;PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRAL IEKLGIRG ; ;PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRAL IEKLGIRG ; O ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQEA ; ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQEA ; P ? 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_entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? HB27 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 262724 ? ? 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Streptomyces 1883 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP RS2_THET2 P62662 1 ;VKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDIVRMEAE RAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPDAIFVVD PTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQE ; 7 ? 2 UNP RS3_THET2 P62663 2 ;GNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRGG ERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGAE QARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVI ; 2 ? 3 UNP RS4_THET2 P62664 3 ;GRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFEE ASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQN LEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR ; 2 ? 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11 UNP RS12_THET2 P61941 11 ;PTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEHSVVL IRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEAA ; 2 ? 12 UNP RS13_THET2 P62655 12 ;ARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKRL MDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; 2 ? 13 UNP RS14Z_THET2 P62656 13 ARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW 2 ? 14 UNP RS15_THET2 P62657 14 ;PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRAL IEKLGIRG ; 2 ? 15 UNP RS16_THET2 P62238 15 ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQEA ; 1 ? 16 UNP RS17_THET2 P62658 16 ;PKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESGR MDLVEKYLIRRQNYQSLSKR ; 2 ? 17 UNP RS18_THET2 P62659 17 KAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSAKEQRILAKTIKRARILGLLPFTEKLVRK 19 ? 18 UNP RS19_THET2 P62660 18 SLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTYRG 4 ? 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23 PDB 4KCY 4KCY 22 GGCUACGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCACAUCACUCAUAAUGAUGGGGUCACAGGUUCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA 1 ? 24 PDB 4KCY 4KCY 23 AAGGAGGUAAAAAUGGUAAAAAA 1 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4KCY B 1 ? 235 ? 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NOR00633 1 ? 6 ? 1 6 22 22 4KCY A 1 ? 1511 ? 4KCY 5 ? 1538 ? 5 1538 23 23 4KCY W 1 ? 77 ? 4KCY 1 ? 76 ? 1 76 24 24 4KCY V 1 ? 23 ? 4KCY 4 ? 26 ? 4 26 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 20 4KCY LYS Y 126 ? UNP Q72I01 HIS 129 CONFLICT 129 1 20 4KCY ASN Y 223 ? UNP Q72I01 HIS 226 CONFLICT 226 2 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 5OH 'L-peptide linking' n '(2S)-amino[(4R,6S)-2-amino-6-hydroxy-3,4,5,6-tetrahydropyrimidin-4-yl]ethanoic acid' ? 'C6 H12 N4 O3' 188.184 A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DPP 'L-peptide linking' n 'DIAMINOPROPANOIC ACID' ? 'C3 H8 N2 O2' 104.108 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 GNP non-polymer . 'PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER' ? 'C10 H17 N6 O13 P3' 522.196 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 KBE 'L-peptide linking' n beta-lysine '(3S)-3,6-diaminohexanoic acid' 'C6 H14 N2 O2' 146.188 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 UAL 'peptide linking' . '(2Z)-2-amino-3-(carbamoylamino)prop-2-enoic acid' ? 'C4 H7 N3 O3' 145.117 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 4KCY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 2 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 3.62 _exptl_crystal.density_percent_sol 66.07 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method ? _exptl_crystal_grow.temp ? _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH ? _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details '2.9% PEG 20K, 2.8% PPG P400, 5.1% MME 550, KSCN 200 mM, TRIS ACETATE 100mM' # loop_ _diffrn.id _diffrn.ambient_temp _diffrn.ambient_temp_details _diffrn.crystal_id 1 100 ? 1 2 100 ? 1 # loop_ _diffrn_detector.diffrn_id _diffrn_detector.detector _diffrn_detector.type _diffrn_detector.pdbx_collection_date _diffrn_detector.details 1 CCD 'MARMOSAIC 300 mm CCD' 2012-06-07 ? 2 CCD 'ADSC QUANTUM 315r' 2012-11-14 ? # loop_ _diffrn_radiation.diffrn_id _diffrn_radiation.wavelength_id _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l _diffrn_radiation.monochromator _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type 1 1 M 'MAR CCD' 'SINGLE WAVELENGTH' x-ray 2 1 M 'ADSC Q315' 'SINGLE WAVELENGTH' x-ray # loop_ _diffrn_radiation_wavelength.id _diffrn_radiation_wavelength.wavelength _diffrn_radiation_wavelength.wt 1 1.03322 1.0 2 1.116 1.0 # loop_ _diffrn_source.diffrn_id _diffrn_source.source _diffrn_source.type _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline _diffrn_source.pdbx_wavelength _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1 SYNCHROTRON 'APS BEAMLINE 23-ID-D' APS 23-ID-D ? 1.03322 2 SYNCHROTRON 'ALS BEAMLINE 12.3.1' ALS 12.3.1 ? 1.116 # _reflns.pdbx_diffrn_id 1,2 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 4KCY _reflns.observed_criterion_sigma_I 1.5 _reflns.observed_criterion_sigma_F 2.0 _reflns.d_resolution_low 351.598 _reflns.d_resolution_high 3.497 _reflns.number_obs 2605789 _reflns.number_all 770789 _reflns.percent_possible_obs ? _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI ? _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy ? _reflns.R_free_details ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 4KCY _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs 2605789 _refine.ls_number_reflns_all 770789 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 2.000 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 40.00 _refine.ls_d_res_high 3.50 _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs 0.262 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.262 _refine.ls_R_factor_R_free 0.309 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free 38147 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model 'PDB Entries 3F1E , 3F1F , 2WRI , 2WRJ' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'ENGH & HUBER' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 24442 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 34612 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 33 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 59087 _refine_hist.d_res_high 3.50 _refine_hist.d_res_low 40.00 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function c_bond_d 0.042 ? 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'X-RAY DIFFRACTION' ? c_bond_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_bond_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg 1.07 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_mcbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_mcangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_scbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_scangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _struct.entry_id 4KCY _struct.title ;70S ribosome translocation intermediate GDPNP-I containing elongation factor EFG/GDPNP, mRNA, and tRNA bound in the pe*/E STATE. This entry contains the 30S ribosomal subunit A. The 50S subunit a can be found in 4KCZ. Molecule B in the same asymmetric unit is deposited as 4KD0 (30S) and 4KD2 (50S) ; _struct.pdbx_descriptor ;30S ribosomal protein S2, 30S ribosomal protein S3, 30S ribosomal protein S4, 30S ribosomal protein S5, 30S ribosomal protein S6, 30S ribosomal protein S7, 30S ribosomal protein S8, 30S ribosomal protein S9, 30S ribosomal protein S10, 30S ribosomal protein S11, 30S ribosomal protein S12, 30S ribosomal protein S13, 30S ribosomal protein S14 type Z, 30S ribosomal protein S15, 30S ribosomal protein S16, 30S ribosomal protein S17, 30S ribosomal protein S18, 30S ribosomal protein S19, 30S ribosomal protein S20, Elongation factor G ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4KCY _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME/ANTIBIOTIC _struct_keywords.text 'GDPNP, CHIMERIC HYBRID STATE RIBOSOME, RIBOSOME, TRANSLOCATION INTERMEDIATE, EF-G, MRNA, TRNA, RIBOSOME-ANTIBIOTIC complex' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 26 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;THE COMPLETE ASYMMETRIC UNIT CONTAINS TWO RIBOSOMES, WHICH ARE SPLIT INTO FOUR PDB ENTRIES 4KCY, 4KCZ, 4KD0 AND 4KD2 DUE TO PDB FORMAT LIMITATIONS. THE FIRST BIOLOGICAL ASSEMBLY IS COMPOSED OF PDB ENTRIES 4KCY (30S) AND 4KCZ (50S). THE SECOND BIOLOGICAL ASSEMBLY IS COMPOSED OF PDB ENTRIES 4KD0 (30S) AND 4KD2 (50S) ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 VAL A 1 ? HIS A 10 ? VAL B 7 HIS B 16 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 2 ASN A 19 ? ARG A 24 ? ASN B 25 ARG B 30 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 3 ASP A 37 ? GLY A 59 ? ASP B 43 GLY B 65 1 ? 23 HELX_P HELX_P4 4 LYS A 68 ? ARG A 81 ? LYS B 74 ARG B 87 1 ? 14 HELX_P HELX_P5 5 ASN A 98 ? LEU A 115 ? 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? -40.55 -10.85 209 1 ILE J 38 ? ? 12.17 110.60 210 1 PRO J 41 ? ? -22.45 103.32 211 1 THR J 42 ? ? -61.76 91.20 212 1 LYS J 55 ? ? 11.48 52.27 213 1 HIS J 56 ? ? -113.78 78.92 214 1 ASP J 58 ? ? -72.76 -146.57 215 1 SER J 59 ? ? 48.50 75.62 216 1 ILE J 75 ? ? -71.89 -130.99 217 1 GLU J 83 ? ? -45.86 -78.70 218 1 LEU J 85 ? ? -83.78 45.21 219 1 MET J 86 ? ? -144.08 -15.87 220 1 THR J 87 ? ? -88.09 -78.19 221 1 ASP J 89 ? ? 179.00 165.87 222 1 LEU J 90 ? ? -156.99 68.07 223 1 THR J 92 ? ? 49.96 29.83 224 1 ALA K 15 ? ? -151.95 -68.70 225 1 ASN K 27 ? ? -173.58 -163.91 226 1 PRO K 35 ? ? -55.49 68.99 227 1 ASP K 36 ? ? 179.43 -106.05 228 1 THR K 41 ? ? 55.01 129.16 229 1 TRP K 42 ? ? -152.74 -31.42 230 1 SER K 43 ? ? 37.06 100.98 231 1 ARG K 54 ? ? -68.45 37.88 232 1 LYS K 55 ? ? -147.75 -24.06 233 1 ALA K 69 ? ? -49.21 -83.13 234 1 TYR K 75 ? ? -69.13 1.74 235 1 GLN K 78 ? ? -157.43 -73.25 236 1 THR K 87 ? ? -94.32 -63.24 237 1 ALA K 89 ? ? -40.08 -11.69 238 1 ARG K 91 ? ? -18.28 -81.43 239 1 ALA K 100 ? ? -90.06 49.11 240 1 SER K 101 ? ? -152.82 -57.18 241 1 SER K 107 ? ? 63.60 163.16 242 1 ILE K 108 ? ? -146.91 -61.97 243 1 VAL K 109 ? ? 35.90 123.45 244 1 ASP K 111 ? ? 7.84 72.48 245 1 PRO K 113 ? ? -41.78 109.83 246 1 HIS K 116 ? ? -109.12 44.20 247 1 ASN K 117 ? ? 67.84 61.37 248 1 CYS K 119 ? ? -71.43 -95.07 249 1 ARG K 120 ? ? 161.50 99.22 250 1 LYS K 124 ? ? -59.99 -80.99 251 1 THR L 6 ? ? 15.64 73.00 252 1 ILE L 7 ? ? 35.28 -52.69 253 1 ARG L 12 ? ? -67.74 -77.61 254 1 LYS L 17 ? ? -66.19 -172.21 255 1 ARG L 19 ? ? 63.64 127.01 256 1 SER L 22 ? ? 66.84 134.65 257 1 PRO L 25 ? ? -70.55 36.06 258 1 LEU L 27 ? ? 66.46 160.19 259 1 PHE L 32 ? ? -154.19 32.57 260 1 ARG L 34 ? ? -7.88 -16.76 261 1 CYS L 37 ? ? 79.15 161.04 262 1 THR L 38 ? ? -170.74 144.60 263 1 VAL L 39 ? ? 76.09 -168.83 264 1 VAL L 40 ? ? -152.99 -50.12 265 1 ARG L 41 ? ? 54.21 -169.27 266 1 THR L 42 ? ? -144.06 -47.18 267 1 VAL L 43 ? ? 52.94 177.56 268 1 THR L 44 ? ? -169.97 93.52 269 1 PRO L 45 ? ? -31.12 116.87 270 1 LYS L 46 ? ? 21.36 -60.24 271 1 LYS L 47 ? ? -151.04 -69.77 272 1 PRO L 48 ? ? -77.19 38.47 273 1 SER L 50 ? ? -172.23 138.49 274 1 ALA L 51 ? ? 177.30 -143.22 275 1 LEU L 52 ? ? -126.11 -65.47 276 1 LYS L 54 ? ? 59.53 -156.56 277 1 VAL L 55 ? ? -150.18 -23.24 278 1 ALA L 56 ? ? -14.05 97.52 279 1 VAL L 58 ? ? 60.14 -69.59 280 1 ARG L 59 ? ? 69.11 -12.21 281 1 LEU L 60 ? ? 50.91 -133.82 282 1 SER L 62 ? ? -84.45 -73.76 283 1 TYR L 64 ? ? 70.72 176.81 284 1 GLU L 65 ? ? -97.97 -79.92 285 1 VAL L 66 ? ? 75.22 -179.90 286 1 TYR L 69 ? ? -73.94 -110.19 287 1 ILE L 70 ? ? 175.54 172.01 288 1 PRO L 71 ? ? -69.32 21.20 289 1 GLU L 73 ? ? 59.71 92.51 290 1 HIS L 75 ? ? -86.49 -150.60 291 1 ASN L 76 ? ? -173.60 -35.79 292 1 GLU L 79 ? ? -171.44 66.63 293 1 HIS L 80 ? ? 179.84 -106.92 294 1 SER L 81 ? ? 77.27 -24.92 295 1 ARG L 86 ? ? -100.53 -80.75 296 1 ARG L 89 ? ? -71.72 -147.03 297 1 VAL L 90 ? ? 172.33 159.46 298 1 LYS L 91 ? ? -65.67 39.01 299 1 LEU L 93 ? ? 28.98 62.50 300 1 PRO L 94 ? ? -22.71 66.08 301 1 VAL L 96 ? ? 61.77 -33.00 302 1 ARG L 97 ? ? -41.87 162.06 303 1 HIS L 99 ? ? -46.65 157.75 304 1 ARG L 102 ? ? 65.05 75.82 305 1 VAL L 104 ? ? 20.16 -130.55 306 1 ASP L 106 ? ? -168.55 -156.47 307 1 ALA L 107 ? ? 63.76 -72.53 308 1 ASP L 112 ? ? 87.64 18.62 309 1 LYS L 115 ? ? -163.08 -92.38 310 1 LYS L 119 ? ? -135.17 -66.21 311 1 TYR L 120 ? ? -64.54 49.21 312 1 THR L 122 ? ? 7.87 112.50 313 1 LYS L 123 ? ? -54.70 -70.58 314 1 PRO L 125 ? ? -53.64 68.64 315 1 ALA L 128 ? ? 58.02 -63.58 316 1 ILE M 4 ? ? -109.03 -67.03 317 1 VAL M 7 ? ? 58.55 17.58 318 1 ARG M 11 ? ? 58.70 -177.53 319 1 ASN M 12 ? ? -44.18 108.91 320 1 LYS M 13 ? ? 173.09 137.47 321 1 TYR M 21 ? ? -61.18 1.77 322 1 ALA M 28 ? ? -60.71 -73.68 323 1 LYS M 36 ? ? -67.50 2.84 324 1 ILE M 39 ? ? 63.42 119.45 325 1 LYS M 46 ? ? -51.06 -84.09 326 1 ASP M 47 ? ? -79.51 35.68 327 1 GLU M 50 ? ? -32.89 -88.62 328 1 ALA M 51 ? ? -17.38 -55.50 329 1 THR M 63 ? ? -92.75 -61.91 330 1 GLU M 67 ? ? 31.57 -114.98 331 1 ILE M 84 ? ? -100.06 -62.42 332 1 GLN M 101 ? ? -79.00 -95.83 333 1 THR M 105 ? ? -103.26 -77.82 334 1 ASN M 106 ? ? -67.71 -136.88 335 1 LYS M 111 ? ? -161.46 41.84 336 1 THR M 116 ? ? -32.27 129.56 337 1 VAL M 117 ? ? -68.64 -73.49 338 1 ALA M 118 ? ? 176.06 -9.95 339 1 LYS M 121 ? ? 62.82 135.22 340 1 ALA M 123 ? ? -68.61 -179.83 341 1 PRO M 124 ? ? -50.62 87.69 342 1 ARG N 3 ? ? -136.05 -66.32 343 1 LYS N 11 ? ? -58.24 -5.15 344 1 THR N 13 ? ? 36.06 105.24 345 1 LYS N 15 ? ? 38.68 -74.61 346 1 CYS N 24 ? ? -64.41 91.81 347 1 CYS N 27 ? ? -161.70 -44.18 348 1 TYR N 34 ? ? -66.37 93.92 349 1 CYS N 40 ? ? -62.04 -179.13 350 1 GLN N 52 ? ? -94.54 56.51 351 1 LEU N 53 ? ? -165.54 110.59 352 1 VAL N 56 ? ? -67.34 -157.58 353 1 ARG N 57 ? ? 173.04 130.71 354 1 LYS N 58 ? ? -64.45 81.82 355 1 PHE O 15 ? ? -119.36 -131.76 356 1 ALA O 16 ? ? 69.63 138.89 357 1 PRO O 19 ? ? -35.24 118.21 358 1 THR O 25 ? ? -48.82 -74.46 359 1 GLU O 26 ? ? -39.07 -39.73 360 1 LYS O 47 ? ? 45.69 13.47 361 1 GLU O 73 ? ? -71.43 -100.98 362 1 ILE O 87 ? ? -149.28 -151.29 363 1 ARG O 88 ? ? 84.94 62.10 364 1 PHE P 9 ? ? -146.70 31.27 365 1 HIS P 13 ? ? -156.27 44.50 366 1 HIS P 16 ? ? -179.53 108.09 367 1 ASP P 23 ? ? -77.12 49.52 368 1 ALA P 24 ? ? 52.13 -62.22 369 1 ARG P 28 ? ? -57.61 -82.76 370 1 ILE P 33 ? ? -115.02 -81.28 371 1 LYS P 35 ? ? -52.55 88.10 372 1 TYR P 39 ? ? -172.76 139.08 373 1 PRO P 41 ? ? -65.77 5.42 374 1 LYS P 43 ? ? 61.41 61.47 375 1 THR P 44 ? ? -58.39 -80.84 376 1 PRO P 46 ? ? -50.28 55.35 377 1 GLU P 54 ? ? -62.76 -72.41 378 1 VAL P 62 ? ? -63.21 0.14 379 1 PRO P 66 ? ? -102.66 -167.72 380 1 THR P 67 ? ? -111.67 -169.03 381 1 ASP P 68 ? ? -67.73 -74.34 382 1 GLU P 83 ? ? 89.95 -28.30 383 1 SER Q 12 ? ? 47.33 107.97 384 1 ASP Q 13 ? ? -66.13 2.92 385 1 LYS Q 14 ? ? -27.25 -32.46 386 1 LYS Q 17 ? ? 59.73 16.64 387 1 PRO Q 28 ? ? -82.71 -119.80 388 1 HIS Q 29 ? ? -174.97 93.03 389 1 PRO Q 30 ? ? -67.10 44.31 390 1 LEU Q 31 ? ? -168.27 -38.83 391 1 PRO Q 47 ? ? -57.58 -0.15 392 1 GLU Q 48 ? ? -150.82 34.88 393 1 GLU Q 49 ? ? 33.10 53.25 394 1 LYS Q 52 ? ? -152.36 -155.63 395 1 LEU Q 53 ? ? -58.35 105.23 396 1 ASP Q 55 ? ? -53.45 105.32 397 1 GLU Q 61 ? ? -49.48 106.23 398 1 PRO Q 64 ? ? -50.83 97.83 399 1 SER Q 66 ? ? -165.27 -160.43 400 1 LYS Q 67 ? ? -69.08 97.31 401 1 ARG Q 68 ? ? 70.47 -22.05 402 1 LYS Q 69 ? ? -66.10 76.55 403 1 PHE Q 71 ? ? 86.75 55.12 404 1 ARG Q 72 ? ? -19.16 -147.70 405 1 VAL Q 73 ? ? -134.19 -111.56 406 1 LEU Q 74 ? ? 120.84 -102.96 407 1 VAL Q 77 ? ? -116.12 -107.01 408 1 MET Q 82 ? ? 41.43 -92.50 409 1 ASP Q 83 ? ? -9.93 -48.19 410 1 LYS Q 100 ? ? -116.85 57.22 411 1 ALA R 20 ? ? -150.44 78.27 412 1 GLU R 28 ? ? -19.38 122.35 413 1 PHE R 29 ? ? -137.13 -157.91 414 1 VAL R 37 ? ? 40.50 -109.55 415 1 GLU R 38 ? ? -38.77 -34.92 416 1 PHE R 43 ? ? -68.45 16.97 417 1 SER R 45 ? ? 77.64 -158.94 418 1 SER R 59 ? ? -70.31 -141.67 419 1 ALA R 60 ? ? -72.14 -70.27 420 1 LEU R 76 ? ? -104.93 44.90 421 1 PHE R 81 ? ? -82.50 -72.51 422 1 ARG R 87 ? ? 61.59 106.53 423 1 LYS S 25 ? ? -145.90 -67.67 424 1 GLU S 27 ? ? -81.08 -134.28 425 1 ARG S 29 ? ? -88.89 38.88 426 1 VAL S 45 ? ? 55.33 -76.29 427 1 HIS S 47 ? ? -88.01 -114.71 428 1 THR S 48 ? ? -100.46 68.30 429 1 ILE S 49 ? ? -65.67 96.95 430 1 ASN S 53 ? ? -131.92 -38.76 431 1 THR S 63 ? ? -135.20 -83.70 432 1 GLU S 64 ? ? -116.54 -79.34 433 1 ASN S 65 ? ? -55.25 -7.28 434 1 VAL S 67 ? ? -16.43 -93.76 435 1 LEU S 71 ? ? -64.01 -79.75 436 1 THR S 77 ? ? 72.09 -66.79 437 1 ARG S 78 ? ? -62.15 70.97 438 1 TYR S 80 ? ? 73.94 134.66 439 1 LEU T 10 ? ? -169.67 -164.16 440 1 GLU T 46 ? ? -57.83 -77.56 441 1 ALA T 49 ? ? -57.83 -77.16 442 1 GLU T 50 ? ? 19.54 -99.23 443 1 THR T 71 ? ? -110.19 -139.76 444 1 LEU T 72 ? ? -57.76 88.69 445 1 LYS T 74 ? ? 40.65 -84.40 446 1 ASN T 75 ? ? -57.97 -92.85 447 1 ALA T 76 ? ? -22.47 -40.61 448 1 PRO T 98 ? ? -69.35 94.22 449 1 LEU T 99 ? ? -116.27 -154.57 450 1 ILE T 100 ? ? 35.18 89.76 451 1 VAL Y 5 ? ? -153.36 -46.14 452 1 GLU Y 6 ? ? 66.35 -42.99 453 1 ASN Y 14 ? ? -168.03 118.16 454 1 HIS Y 20 ? ? -106.78 -164.33 455 1 ILE Y 21 ? ? 38.78 -144.56 456 1 ASP Y 22 ? ? -74.74 -73.61 457 1 ALA Y 23 ? ? 67.49 -11.83 458 1 LYS Y 25 ? ? -15.92 -54.95 459 1 ILE Y 32 ? ? -47.98 -80.27 460 1 LEU Y 33 ? ? 23.97 -67.80 461 1 TYR Y 34 ? ? -107.41 -101.88 462 1 TYR Y 35 ? ? 96.19 -113.47 463 1 THR Y 36 ? ? 134.46 21.21 464 1 ARG Y 38 ? ? -163.68 -158.39 465 1 ILE Y 39 ? ? 145.89 -39.78 466 1 ILE Y 42 ? ? -98.28 33.87 467 1 ALA Y 49 ? ? -137.69 -149.44 468 1 ALA Y 50 ? ? 63.40 156.08 469 1 THR Y 51 ? ? 67.19 61.65 470 1 ASP Y 53 ? ? 96.58 9.81 471 1 GLU Y 56 ? ? 35.20 -118.63 472 1 THR Y 66 ? ? -96.76 -125.87 473 1 THR Y 71 ? ? -65.61 -164.20 474 1 CYS Y 72 ? ? -175.85 113.70 475 1 TRP Y 74 ? ? -174.83 117.17 476 1 LYS Y 75 ? ? 2.59 82.01 477 1 ASP Y 83 ? ? -161.19 -155.88 478 1 THR Y 84 ? ? 33.17 67.12 479 1 HIS Y 87 ? ? 58.05 -47.35 480 1 VAL Y 88 ? ? -40.46 88.41 481 1 ASP Y 89 ? ? 74.23 -74.78 482 1 THR Y 91 ? ? -134.83 -89.53 483 1 ILE Y 92 ? ? 32.06 -63.79 484 1 ARG Y 99 ? ? -72.99 29.53 485 1 VAL Y 100 ? ? -139.22 -52.69 486 1 ASP Y 102 ? ? -65.61 -75.02 487 1 ASP Y 109 ? ? -57.32 95.98 488 1 SER Y 111 ? ? -56.50 -70.11 489 1 GLN Y 112 ? ? -74.73 36.60 490 1 VAL Y 121 ? ? -57.65 -73.72 491 1 LYS Y 129 ? ? 80.35 92.71 492 1 ALA Y 134 ? ? -105.13 -168.88 493 1 PHE Y 135 ? ? -166.92 111.48 494 1 LYS Y 138 ? ? 78.44 33.91 495 1 LEU Y 146 ? ? -177.03 -65.34 496 1 ARG Y 156 ? ? -140.74 -41.18 497 1 PRO Y 161 ? ? -72.44 -73.59 498 1 VAL Y 162 ? ? 57.24 115.82 499 1 MET Y 164 ? ? -146.96 -21.92 500 1 PRO Y 167 ? ? -48.94 170.45 501 1 ARG Y 170 ? ? -73.84 -143.41 502 1 SER Y 175 ? ? -137.32 -30.28 503 1 LEU Y 181 ? ? -92.42 -82.90 504 1 ALA Y 185 ? ? -62.90 81.66 505 1 THR Y 187 ? ? -171.58 139.17 506 1 TYR Y 188 ? ? -80.85 -112.52 507 1 ASP Y 191 ? ? -53.17 -79.44 508 1 THR Y 194 ? ? -75.82 28.62 509 1 ASP Y 195 ? ? -166.04 119.82 510 1 GLU Y 198 ? ? -106.82 45.04 511 1 PRO Y 202 ? ? -68.22 23.02 512 1 GLU Y 203 ? ? 92.57 -115.19 513 1 GLU Y 204 ? ? 35.36 -50.95 514 1 ALA Y 220 ? ? -69.87 2.14 515 1 ASP Y 224 ? ? -73.14 -139.92 516 1 GLU Y 225 ? ? -155.94 -48.30 517 1 GLU Y 233 ? 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