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;MNRGALIKLVESRYVRTDLPEFRPGDTVRVSYKVKEGNRTRIQDFEGIVIRIRRNGFNTTFTVRKVSYGVGVERIFPLHS PLIQKIDIVQRGRARRAKLYFIRNLSDREIRRKLRADRKRIDKDRAAERAAKEEVQK ; ;MNRGALIKLVESRYVRTDLPEFRPGDTVRVSYKVKEGNRTRIQDFEGIVIRIRRNGFNTTFTVRKVSYGVGVERIFPLHS PLIQKIDIVQRGRARRAKLYFIRNLSDREIRRKLRADRKRIDKDRAAERAAKEEVQK ; P ? 16 'polypeptide(L)' no no ;PRAKTGVVRRRKHKKILKLAKGYWGLRSKSFRKARETLFAAGNYAYAHRKRRKRDFRRLWIVRINAACRQHGLNYSTFIH GLKKAGIEVDRKNLADLAVREPQVFAELVERAKAAQG ; ;PRAKTGVVRRRKHKKILKLAKGYWGLRSKSFRKARETLFAAGNYAYAHRKRRKRDFRRLWIVRINAACRQHGLNYSTFIH GLKKAGIEVDRKNLADLAVREPQVFAELVERAKAAQG ; Q ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MFAIVKTGGKQYRVEPGLKLRVEKLDAEPGATVELPVLLLGGEKTVVGTPVVEGASVVAEVLGHGRGKKILVSKFKAKVQ YRRKKGHRQPYTELLIKEIRG ; ;MFAIVKTGGKQYRVEPGLKLRVEKLDAEPGATVELPVLLLGGEKTVVGTPVVEGASVVAEVLGHGRGKKILVSKFKAKVQ YRRKKGHRQPYTELLIKEIRG ; R ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MEAKAIARYVRISPRKVRLVVDLIRGKSLEEARNILRYTNKRGAYFVAKVLESAAANAVNNHDMLEDRLYVKAAYVDEGP ALKRVLPRARGRADIIKKRTSHITVILGEKHG ; ;MEAKAIARYVRISPRKVRLVVDLIRGKSLEEARNILRYTNKRGAYFVAKVLESAAANAVNNHDMLEDRLYVKAAYVDEGP ALKRVLPRARGRADIIKKRTSHITVILGEKHG ; S ? 19 'polypeptide(L)' no no ;TAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAIVQ VAPGQKIEALEG ; ;TAYDVILAPVLSEKAYAGFAEGKYTFWVHPKATKTEIKNAVETAFKVKVVKVNTLHVRGKKKRLGRYLGKRPDRKKAIVQ VAPGQKIEALEG ; T ? 20 'polypeptide(L)' no no ;RVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACGK PTRVRKKFLENGKKIRVCAK ; ;RVKMHVKKGDTVLVASGKYKGRVGKVKEVLPKKYAVIVEGVNIVKKAVRVSPKYPQGGFIEKEAPLHASKVRPICPACGK PTRVRKKFLENGKKIRVCAK ; U ? 21 'polypeptide(L)' no no ;YRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRRRR PEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPGVE LAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAA ; ;YRLKAYYREGEKPSALRRAGKLPGVMYNRHLNRKVYVDLVEFDKVFRQASIHHVIVLELPDGQSLPTLVRQVNLDKRRRR PEHVDFFVLSDEPVEMYVPLRFVGTPAGVRAGGVLQEIHRDILVKVSPRNIPEFIEVDVSGLEIGDSLHASDLKLPPGVE LAVSPEETIAAVVPPEDVEKLAEEAAA ; V ? 22 'polypeptide(L)' no no TKNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVHVRPLA TKNGRDSQAKRLGVKRYEGQVVRAGNILVRQRGTRFKPGKNVGMGRDFTLFALVDGVVEFQDRGRLGRYVHVRPLA W ? 23 'polypeptide(L)' no no ;SGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGLRLEGLSP KEIKKELL ; ;SGKRPIVANSIQRRGKAKREGGVGKKTTGISKRRQYPNLQKVRVRVAGQEITFRVAASHIPKVYELVERAKGLRLEGLSP KEIKKELL ; X ? 24 'polypeptide(L)' no no MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLT MKLSEVRKQLEEARKLSPVELEKLVREKKRELMELRFQASIGQLSQNHKIRDLKRQIARLLT Y ? 25 'polypeptide(L)' no no MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVV MPRLKVKLVKSPIGYPKDQKAALKALGLRRLQQERVLEDTPAIRGNVEKVAHLVRVEVV Z ? 26 'polypeptide(L)' no no VPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKC VPARIICGCGNVIETYSTKPEIYVEVCSKC 1 ? 27 'polypeptide(L)' no no AKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPILVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYA AKHPVPKKKTSKARRDARRSHHALTPPILVPCPECKAMKPPHTVCPECGYYA 2 ? 28 'polypeptide(L)' no no LLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREV LLLECTECKRRNYATEKNKRNTPNKLELRKYCPWCRKHTVHREV 3 ? 29 'polypeptide(L)' no no MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRK MKRTWQPNRRKRAKTHGFRARMRTPGGRKVLKRRRQKGRWRLTPAVRK 4 ? 30 'polypeptide(L)' no no PKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPY PKMKTHKGAKKRVKITASGKVVAMKTGKRHLNWQKSGKEIRQKGRKFVLAKPEAERIKLLLPY 5 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 A n 1 2 G n 1 3 A n 1 4 U n 1 5 G n 1 6 G n 1 7 U n 1 8 A n 1 9 A n 1 10 G n 1 11 G n 1 12 G n 1 13 C n 1 14 C n 1 15 C n 1 16 A n 1 17 C n 1 18 G n 1 19 G n 1 20 U n 1 21 G n 1 22 G n 1 23 A n 1 24 U n 1 25 G n 1 26 C n 1 27 C n 1 28 U n 1 29 C n 1 30 G n 1 31 G n 1 32 C n 1 33 A n 1 34 C n 1 35 C n 1 36 C n 1 37 G n 1 38 A n 1 39 G n 1 40 C n 1 41 C n 1 42 G n 1 43 A n 1 44 U n 1 45 G n 1 46 A n 1 47 A n 1 48 G n 1 49 G n 1 50 A n 1 51 C n 1 52 G n 1 53 U n 1 54 G n 1 55 G n 1 56 C n 1 57 U n 1 58 A n 1 59 C n 1 60 C n 1 61 U n 1 62 G n 1 63 C n 1 64 G n 1 65 A n 1 66 U n 1 67 A n 1 68 A n 1 69 G n 1 70 C n 1 71 C n 1 72 A n 1 73 G n 1 74 G n 1 75 G n 1 76 G n 1 77 G n 1 78 A n 1 79 G n 1 80 C n 1 81 C n 1 82 G n 1 83 G n 1 84 U n 1 85 A n 1 86 G n 1 87 C n 1 88 G n 1 89 G n 1 90 G n 1 91 C n 1 92 G n 1 93 U n 1 94 G n 1 95 G n 1 96 A n 1 97 U n 1 98 C n 1 99 C n 1 100 C n 1 101 U n 1 102 G n 1 103 G n 1 104 A n 1 105 U n 1 106 G n 1 107 U n 1 108 C n 1 109 C n 1 110 G n 1 111 A n 1 112 A n 1 113 U n 1 114 G n 1 115 G n 1 116 G n 1 117 G n 1 118 G n 1 119 A n 1 120 A n 1 121 C n 1 122 C n 1 123 C n 1 124 G n 1 125 G n 1 126 C n 1 127 C n 1 128 G n 1 129 G n 1 130 C n 1 131 G n 1 132 G n 1 133 G n 1 134 A n 1 135 A n 1 136 C n 1 137 G n 1 138 C n 1 139 C n 1 140 G n 1 141 G n 1 142 U n 1 143 C n 1 144 A n 1 145 C n 1 146 C n 1 147 G n 1 148 C n 1 149 G n 1 150 C n 1 151 U n 1 152 U n 1 153 U n 1 154 U n 1 155 U n 1 156 G n 1 157 C n 1 158 G n 1 159 C n 1 160 G n 1 161 G n 1 162 G n 1 163 G n 1 164 G n 1 165 G n 1 166 A n 1 167 A n 1 168 C n 1 169 C n 1 170 U n 1 171 G n 1 172 G n 1 173 G n 1 174 G n 1 175 A n 1 176 A n 1 177 C n 1 178 U n 1 179 G n 1 180 A n 1 181 A n 1 182 A n 1 183 C n 1 184 A n 1 185 U n 1 186 C n 1 187 U n 1 188 C n 1 189 A n 1 190 G n 1 191 U n 1 192 A n 1 193 C n 1 194 C n 1 195 C n 1 196 A n 1 197 G n 1 198 A n 1 199 G n 1 200 G n 1 201 A n 1 202 G n 1 203 A n 1 204 G n 1 205 G n 1 206 A n 1 207 A n 1 208 A n 1 209 G n 1 210 A n 1 211 G n 1 212 A n 1 213 A n 1 214 A n 1 215 U n 1 216 C n 1 217 G n 1 218 A n 1 219 C n 1 220 U n 1 221 C n 1 222 C n 1 223 C n 1 224 U n 1 225 G n 1 226 A n 1 227 G n 1 228 U n 1 229 A n 1 230 G n 1 231 C n 1 232 G n 1 233 G n 1 234 C n 1 235 G n 1 236 A n 1 237 G n 1 238 C n 1 239 G n 1 240 A n 1 241 A n 1 242 A n 1 243 G n 1 244 G n 1 245 G n 1 246 G n 1 247 A n 1 248 C n 1 249 C n 1 250 A n 1 251 G n 1 252 C n 1 253 C n 1 254 U n 1 255 A n 1 256 A n 1 257 A n 1 258 C n 1 259 C n 1 260 G n 1 261 U n 1 262 C n 1 263 C n 1 264 G n 1 265 G n 1 266 C n 1 267 U n 1 268 U n 1 269 G n 1 270 U n 1 271 C n 1 272 C n 1 273 G n 1 274 G n 1 275 G n 1 276 C n 1 277 G n 1 278 G n 1 279 G n 1 280 G n 1 281 U n 1 282 C n 1 283 G n 1 284 U n 1 285 G n 1 286 G n 1 287 G n 1 288 G n 1 289 C n 1 290 C n 1 291 C n 1 292 U n 1 293 C n 1 294 G n 1 295 G n 1 296 C n 1 297 A n 1 298 A n 1 299 C n 1 300 C n 1 301 G n 1 302 A n 1 303 A n 1 304 U n 1 305 C n 1 306 C n 1 307 C n 1 308 C n 1 309 A n 1 310 G n 1 311 C n 1 312 C n 1 313 U n 1 314 A n 1 315 G n 1 316 C n 1 317 C n 1 318 G n 1 319 A n 1 320 A n 1 321 G n 1 322 C n 1 323 U n 1 324 G n 1 325 U n 1 326 U n 1 327 G n 1 328 G n 1 329 G n 1 330 A n 1 331 A n 1 332 G n 1 333 C n 1 334 A n 1 335 G n 1 336 C n 1 337 G n 1 338 C n 1 339 C n 1 340 A n 1 341 G n 1 342 A n 1 343 G n 1 344 A n 1 345 G n 1 346 G n 1 347 G n 1 348 U n 1 349 G n 1 350 A n 1 351 A n 1 352 A n 1 353 G n 1 354 C n 1 355 C n 1 356 C n 1 357 C n 1 358 G n 1 359 U n 1 360 A n 1 361 G n 1 362 G n 1 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2 GB AE017221 AE017221.1 2 ;UCCCCCGUGCCCAUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACU GGGCGGGCGACCGCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGG ; 1537462 ? 3 UNP RL2_THET2 Q72I07 3 ;AVKKFKPYTPSRRFMTVADFSEITKTEPEKSLVKPLKKTGGRNNQGRITVRFRGGGHKRLYRIIDFKRWDKVGIPAKVAA IEYDPNRSARIALLHYVDGEKRYIIAPDGLQVGQQVVAGPDAPIQVGNALPLRFIPVGTVVHAVELEPKKGAKLARAAGT SAQIQGREGDYVILRLPSGELRKVHGECYATVGAVGNADHKNIVLGKAGRSRWLGRRPHVRGAAMNPVDHPHGGGEGRAP RGRPPASPWGWQTKGLKTRKRRKPSSRFIIA ; 2 ? 4 UNP RL3_THET2 Q72I04 4 ;MKGILGVKVGMTRIFRDDRAVPVTVILAGPCPVVQRRTPEKDGYTAVQLGFLPQNPKRVNRPLKGHFAKAGVEPVRILRE IRDFNPEGDTVTVEIFKPGERVDVTGTSKGRGFAGVMKRWNFAGGPDSHGAHKIHRHPGSIGNRKTPGRVYKGKKMAGHY GAERVTVMNLEVVDVIPEENLLLVKGAVPGPNGGLVIVRETKKA ; 1 ? 5 UNP RL4_THET2 Q72I05 5 ;MYQIPVLSPSGRRELAADLPAEINPHLLWEVVRWQLAKRRRGTASTKTRGEVAYSGRKIWPQKHTGRARHGDIGAPIFVG GGVVFGPKPRDYSYTLPKKVRKKGLAMAVADRAREGKLLLVEAFAGVNGKTKEFLAWAKEAGLDGSESVLLVTGNELVRR AARNLPWVVTLAPEGLNVYDIVRTERLVMDLDAWEVFQNRIG ; 1 ? 6 UNP RL5_THET2 Q72I16 6 ;PLDLALKRKYYEEVRPELIRRFGYQNVWEVPRLEKVVINQGLGEAKEDARILEKAAQELALITGQKPAVTRAKKSISNFK LRKGMPIGLRVTLRRDRMWIFLEKLLNVALPRIRDFRGLNPNSFDGRGNYNLGLREQLIFPEITYDMVDALRGMDIAVVT TAETDEEARALLELLGFPFRK ; 2 ? 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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 4L6L _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 289 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 7.5 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;Mix complex 1:1 with solution containing 4% PEG 20000, 8% MPD, 0.2M KSCN, 0.1M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K ; # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector PIXEL _diffrn_detector.type 'PSI PILATUS 6M' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2012-08-08 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator Si-111 _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.1 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'NSLS BEAMLINE X25' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site NSLS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X25 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? 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This file contains the 50S subunit and blasticidin S molecule from the second 70S ribosome ; _struct.pdbx_descriptor 'PROTEIN/RNA Complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4L6L _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME _struct_keywords.text 'Translation termination, peptidyl transfer, ribosomal crystal structure, translation inhibitor, blasticidin S, RIBOSOME' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 26 ? AA N N 27 ? BA N N 28 ? CA N N 29 ? DA N N 30 ? 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WATSON-CRICK ? ? hydrog2966 hydrog ? ? B C 71 O2 ? ? ? 1_555 B G 106 N2 ? ? B C 71 B G 105 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog2967 hydrog ? ? B G 72 N2 ? ? ? 1_555 B A 105 N7 ? ? B G 72 B A 104 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog2968 hydrog ? ? B G 72 N3 ? ? ? 1_555 B A 105 N6 ? ? B G 72 B A 104 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? hydrog2969 hydrog ? ? B A 73 N6 ? ? ? 1_555 B U 104 O2 ? ? B A 73 B U 103 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? hydrog2970 hydrog ? ? B A 73 N7 ? ? ? 1_555 B U 104 N3 ? ? B A 73 B U 103 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? hydrog2971 hydrog ? ? B U 74 O4 ? ? ? 1_555 B G 103 N1 ? ? B U 74 B G 102 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? hydrog2972 hydrog ? ? B U 74 O4 ? ? ? 1_555 B U 104 N3 ? ? B U 74 B U 103 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? hydrog2973 hydrog ? ? B G 75 O6 ? ? ? 1_555 B A 102 N6 ? ? B G 75 B A 101 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog2974 hydrog ? ? B G 75 O6 ? ? ? 1_555 B G 103 N1 ? ? B G 75 B G 102 1_555 ? ? ? ? ? ? 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'G-C PAIR' ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ARG 243 C . ? ARG 244 D PRO 244 C ? PRO 245 D 1 -17.53 2 THR 146 D . ? THR 146 E PRO 147 D ? PRO 147 E 1 9.31 3 GLY 124 I . ? GLY 148 J PRO 125 I ? PRO 149 J 1 -1.86 4 ASP 43 K . ? 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