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'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 4NCA _struct.title 'Structure of Thermus thermophilus Argonaute bound to guide DNA 19-mer and target DNA in the presence of Mg2+' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4NCA _struct_keywords.text 'Argonaute, RNA interference, DNA interference, NUCLEAR PROTEIN-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'NUCLEAR PROTEIN/DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 5 ? L N N 6 ? M N N 6 ? N N N 6 ? O N N 6 ? P N N 6 ? Q N N 7 ? R N N 7 ? S N N 7 ? T N N 7 ? U N N 7 ? V N N 7 ? W N N 7 ? 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ASN B 20 ARG B 25 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 21 GLY B 38 ? GLU B 40 ? GLY B 38 GLU B 40 5 ? 3 HELX_P HELX_P22 22 GLU B 41 ? GLY B 54 ? GLU B 41 GLY B 54 1 ? 14 HELX_P HELX_P23 23 PRO B 69 ? LEU B 73 ? PRO B 69 LEU B 73 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 24 ASP B 102 ? LEU B 124 ? ASP B 102 LEU B 124 1 ? 23 HELX_P HELX_P25 25 SER B 178 ? ALA B 184 ? SER B 178 ALA B 184 1 ? 7 HELX_P HELX_P26 26 ASP B 211 ? LEU B 215 ? ASP B 211 LEU B 215 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 27 SER B 222 ? LYS B 230 ? SER B 222 LYS B 230 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 28 THR B 266 ? LEU B 270 ? THR B 266 LEU B 270 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 29 PRO B 282 ? LEU B 301 ? PRO B 282 LEU B 301 1 ? 20 HELX_P HELX_P30 30 LYS B 329 ? ALA B 331 ? LYS B 329 ALA B 331 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 31 ASP B 332 ? GLY B 337 ? ASP B 332 GLY B 337 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 32 PRO B 358 ? GLY B 373 ? PRO B 358 GLY B 373 1 ? 16 HELX_P HELX_P33 33 HIS B 384 ? GLN B 387 ? HIS B 384 GLN B 387 5 ? 4 HELX_P HELX_P34 34 GLY B 388 ? GLY B 402 ? 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C DA 3 C MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.785 ? ? metalc29 metalc ? ? N MG . MG ? ? ? 1_555 S HOH . O ? ? C MG 101 C HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? ? metalc30 metalc ? ? O MG . MG ? ? ? 1_555 T HOH . O ? ? D MG 101 D HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? ? metalc31 metalc ? ? O MG . MG ? ? ? 1_555 T HOH . O ? ? D MG 101 D HOH 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? ? metalc32 metalc ? ? E DT 1 OP3 ? ? ? 1_555 P MG . MG ? ? E DT 1 E MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? ? metalc33 metalc ? ? P MG . MG ? ? ? 1_555 U HOH . O ? ? E MG 101 E HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? ? hydrog1 hydrog ? ? C DG 2 N1 ? ? ? 1_555 D DC 9 N3 ? ? C DG 2 D DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? C DG 2 N2 ? ? ? 1_555 D DC 9 O2 ? ? C DG 2 D DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? C DG 2 O6 ? ? ? 1_555 D DC 9 N4 ? ? C DG 2 D DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? C DA 3 N1 ? ? ? 1_555 D DT 8 N3 ? ? C DA 3 D DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? C DA 7 N1 ? ? ? 1_555 D DT 4 N3 ? ? C DA 7 D DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? C DA 7 N6 ? ? ? 1_555 D DT 4 O4 ? ? C DA 7 D DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? C DG 8 N1 ? ? ? 1_555 D DC 3 N3 ? ? C DG 8 D DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? C DG 8 N2 ? ? ? 1_555 D DC 3 O2 ? ? C DG 8 D DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? C DG 8 O6 ? ? ? 1_555 D DC 3 N4 ? ? C DG 8 D DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? C DT 9 N3 ? ? ? 1_555 D DA 2 N1 ? ? C DT 9 D DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? C DT 9 O4 ? ? ? 1_555 D DA 2 N6 ? ? C DT 9 D DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? C DA 10 N1 ? ? ? 1_555 D DT 1 N3 ? ? C DA 10 D DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? C DA 10 N6 ? ? ? 1_555 D DT 1 O4 ? ? C DA 10 D DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? C DG 11 N1 ? ? ? 1_555 G DC 6 N3 ? ? C DG 11 G DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? C DG 11 N2 ? ? ? 1_555 G DC 6 O2 ? ? C DG 11 G DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? C DG 11 O6 ? ? ? 1_555 G DC 6 N4 ? ? C DG 11 G DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? C DG 12 N1 ? ? ? 1_555 G DC 5 N3 ? ? C DG 12 G DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? C DG 12 N2 ? ? ? 1_555 G DC 5 O2 ? ? C DG 12 G DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? C DG 12 O6 ? ? ? 1_555 G DC 5 N4 ? ? C DG 12 G DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? C DT 13 N3 ? ? ? 1_555 G DA 4 N1 ? ? C DT 13 G DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? C DT 13 O4 ? ? ? 1_555 G DA 4 N6 ? ? C DT 13 G DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? C DT 14 N3 ? ? ? 1_555 G DA 3 N1 ? ? C DT 14 G DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? C DG 15 N1 ? ? ? 1_555 G DC 2 N3 ? ? C DG 15 G DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? C DG 15 N2 ? ? ? 1_555 G DC 2 O2 ? ? C DG 15 G DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? C DG 15 O6 ? ? ? 1_555 G DC 2 N4 ? ? C DG 15 G DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? C DT 16 N3 ? ? ? 1_555 G DA 1 N1 ? ? C DT 16 G DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? C DT 16 O4 ? ? ? 1_555 G DA 1 N6 ? ? C DT 16 G DA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? E DG 2 N1 ? ? ? 1_555 F DC 9 N3 ? ? E DG 2 F DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? E DG 2 N2 ? ? ? 1_555 F DC 9 O2 ? ? E DG 2 F DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? E DG 2 O6 ? ? ? 1_555 F DC 9 N4 ? ? E DG 2 F DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? E DA 3 N1 ? ? ? 1_555 F DT 8 N3 ? ? E DA 3 F DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? 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