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# _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.9793 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'APS BEAMLINE 24-ID-C' _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 0.9793 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site APS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 24-ID-C # _reflns.entry_id 4NWN _reflns.d_resolution_high 4.500 _reflns.number_obs 59814 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.136 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 13.080 _reflns.percent_possible_obs 98.300 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 183.990 _reflns.observed_criterion_sigma_I -3.000 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 93.927 _reflns.number_all 60851 _reflns.pdbx_Rsym_value ? 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'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 4NWN _struct.title 'Computationally Designed Two-Component Self-Assembling Tetrahedral Cage T32-28' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 4NWN _struct_keywords.text ;two-component, self-assembling, tetrahedron, designed protein cage, computational design, protein engineering, multimerization, nanomaterial, nanostructure, PROTEIN BINDING ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTEIN BINDING' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 1 ? L N N 2 ? M N N 1 ? N N N 2 ? O N N 1 ? P N N 2 ? Q N N 1 ? R N N 2 ? S N N 1 ? T N N 2 ? U N N 1 ? V N N 2 ? W N N 1 ? X N N 2 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;The biological assembly is a protein cage with tetrahedral point group symmetry that comprises the contents of one asymmetric units. ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 SER A 12 ? ALA A 27 ? SER A 12 ALA A 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 2 ASP A 49 ? GLN A 63 ? ASP A 49 GLN A 63 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 3 ALA A 64 ? GLU A 66 ? ALA A 64 GLU A 66 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 4 SER A 80 ? GLY A 87 ? SER A 80 GLY A 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P5 5 SER A 104 ? GLY A 118 ? SER A 104 GLY A 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P6 6 ASP A 143 ? LYS A 161 ? ASP A 143 LYS A 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 7 HIS A 174 ? GLU A 183 ? HIS A 174 GLU A 183 1 ? 10 HELX_P HELX_P8 8 ASN B 123 ? GLY B 128 ? ASN B 123 GLY B 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P9 9 SER C 12 ? ALA C 27 ? SER C 12 ALA C 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P10 10 ASP C 49 ? GLY C 65 ? ASP C 49 GLY C 65 1 ? 17 HELX_P HELX_P11 11 SER C 80 ? GLY C 87 ? SER C 80 GLY C 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P12 12 SER C 104 ? GLY C 118 ? SER C 104 GLY C 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P13 13 ASP C 143 ? LYS C 161 ? ASP C 143 LYS C 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P14 14 HIS C 174 ? GLY C 184 ? HIS C 174 GLY C 184 1 ? 11 HELX_P HELX_P15 15 ALA D 35 ? ALA D 39 ? ALA D 35 ALA D 39 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 16 ASN D 123 ? GLY D 128 ? ASN D 123 GLY D 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P17 17 SER E 12 ? ALA E 27 ? SER E 12 ALA E 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P18 18 ASP E 49 ? GLY E 65 ? ASP E 49 GLY E 65 1 ? 17 HELX_P HELX_P19 19 SER E 80 ? GLY E 87 ? SER E 80 GLY E 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P20 20 SER E 104 ? GLY E 118 ? SER E 104 GLY E 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P21 21 ASP E 143 ? LYS E 161 ? ASP E 143 LYS E 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P22 22 HIS E 174 ? GLY E 184 ? HIS E 174 GLY E 184 1 ? 11 HELX_P HELX_P23 23 ASN F 123 ? GLY F 128 ? ASN F 123 GLY F 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P24 24 SER G 12 ? ALA G 27 ? SER G 12 ALA G 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P25 25 ASP G 49 ? GLY G 65 ? ASP G 49 GLY G 65 1 ? 17 HELX_P HELX_P26 26 SER G 80 ? GLY G 87 ? SER G 80 GLY G 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P27 27 SER G 104 ? GLY G 118 ? SER G 104 GLY G 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P28 28 ASP G 143 ? LYS G 161 ? ASP G 143 LYS G 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P29 29 HIS G 174 ? GLY G 184 ? HIS G 174 GLY G 184 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 30 ASN H 123 ? GLY H 128 ? ASN H 123 GLY H 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P31 31 SER I 12 ? ALA I 27 ? SER I 12 ALA I 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P32 32 ASP I 49 ? GLY I 65 ? ASP I 49 GLY I 65 1 ? 17 HELX_P HELX_P33 33 SER I 80 ? GLY I 87 ? SER I 80 GLY I 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P34 34 SER I 104 ? GLY I 118 ? SER I 104 GLY I 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P35 35 ASP I 143 ? LYS I 161 ? ASP I 143 LYS I 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P36 36 HIS I 174 ? GLU I 183 ? HIS I 174 GLU I 183 1 ? 10 HELX_P HELX_P37 37 ASN J 123 ? GLY J 128 ? ASN J 123 GLY J 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P38 38 SER K 12 ? ALA K 27 ? SER K 12 ALA K 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P39 39 ASP K 49 ? GLY K 65 ? ASP K 49 GLY K 65 1 ? 17 HELX_P HELX_P40 40 SER K 80 ? GLY K 87 ? SER K 80 GLY K 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P41 41 SER K 104 ? GLY K 118 ? SER K 104 GLY K 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 42 ASP K 143 ? LYS K 161 ? ASP K 143 LYS K 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P43 43 HIS K 174 ? GLY K 184 ? HIS K 174 GLY K 184 1 ? 11 HELX_P HELX_P44 44 ASN L 123 ? GLY L 128 ? ASN L 123 GLY L 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P45 45 SER M 12 ? ALA M 27 ? SER M 12 ALA M 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P46 46 ASP M 49 ? GLY M 65 ? ASP M 49 GLY M 65 1 ? 17 HELX_P HELX_P47 47 SER M 80 ? GLY M 87 ? SER M 80 GLY M 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P48 48 SER M 104 ? GLY M 118 ? SER M 104 GLY M 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P49 49 ASP M 143 ? LYS M 161 ? ASP M 143 LYS M 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P50 50 HIS M 174 ? VAL M 182 ? HIS M 174 VAL M 182 1 ? 9 HELX_P HELX_P51 51 ALA N 35 ? ALA N 39 ? ALA N 35 ALA N 39 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 52 ASN N 123 ? GLY N 128 ? ASN N 123 GLY N 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P53 53 SER O 12 ? ALA O 27 ? SER O 12 ALA O 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P54 54 ILE O 50 ? GLY O 65 ? ILE O 50 GLY O 65 1 ? 16 HELX_P HELX_P55 55 SER O 80 ? GLY O 87 ? SER O 80 GLY O 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P56 56 SER O 104 ? GLY O 118 ? SER O 104 GLY O 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P57 57 ASP O 143 ? LYS O 161 ? ASP O 143 LYS O 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P58 58 HIS O 174 ? GLU O 183 ? HIS O 174 GLU O 183 1 ? 10 HELX_P HELX_P59 59 ASN P 123 ? GLY P 128 ? ASN P 123 GLY P 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P60 60 SER Q 12 ? ALA Q 27 ? SER Q 12 ALA Q 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P61 61 ASP Q 49 ? GLY Q 65 ? ASP Q 49 GLY Q 65 1 ? 17 HELX_P HELX_P62 62 SER Q 80 ? GLY Q 87 ? SER Q 80 GLY Q 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P63 63 SER Q 104 ? GLY Q 118 ? SER Q 104 GLY Q 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P64 64 ASP Q 143 ? LYS Q 161 ? ASP Q 143 LYS Q 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P65 65 HIS Q 174 ? GLY Q 184 ? HIS Q 174 GLY Q 184 1 ? 11 HELX_P HELX_P66 66 ASN R 123 ? GLY R 128 ? ASN R 123 GLY R 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P67 67 SER S 12 ? ALA S 27 ? SER S 12 ALA S 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P68 68 ASP S 49 ? GLY S 65 ? ASP S 49 GLY S 65 1 ? 17 HELX_P HELX_P69 69 SER S 80 ? GLY S 87 ? SER S 80 GLY S 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P70 70 SER S 104 ? GLY S 118 ? SER S 104 GLY S 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P71 71 ASP S 143 ? LYS S 161 ? ASP S 143 LYS S 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P72 72 HIS S 174 ? GLY S 184 ? HIS S 174 GLY S 184 1 ? 11 HELX_P HELX_P73 73 ASN T 123 ? GLY T 128 ? ASN T 123 GLY T 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P74 74 SER U 12 ? ALA U 27 ? SER U 12 ALA U 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P75 75 ASP U 49 ? GLY U 65 ? ASP U 49 GLY U 65 1 ? 17 HELX_P HELX_P76 76 SER U 80 ? GLY U 87 ? SER U 80 GLY U 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P77 77 SER U 104 ? GLY U 118 ? SER U 104 GLY U 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P78 78 ASP U 143 ? ALA U 160 ? ASP U 143 ALA U 160 1 ? 18 HELX_P HELX_P79 79 HIS U 174 ? GLY U 184 ? HIS U 174 GLY U 184 1 ? 11 HELX_P HELX_P80 80 ALA V 35 ? ALA V 39 ? ALA V 35 ALA V 39 5 ? 5 HELX_P HELX_P81 81 ASN V 123 ? GLY V 128 ? ASN V 123 GLY V 128 5 ? 6 HELX_P HELX_P82 82 SER W 12 ? ALA W 27 ? SER W 12 ALA W 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P83 83 ASP W 49 ? GLY W 65 ? ASP W 49 GLY W 65 1 ? 17 HELX_P HELX_P84 84 SER W 80 ? GLY W 87 ? SER W 80 GLY W 87 1 ? 8 HELX_P HELX_P85 85 SER W 104 ? GLY W 118 ? SER W 104 GLY W 118 1 ? 15 HELX_P HELX_P86 86 ASP W 143 ? LYS W 161 ? ASP W 143 LYS W 161 1 ? 19 HELX_P HELX_P87 87 HIS W 174 ? GLY W 184 ? HIS W 174 GLY W 184 1 ? 11 HELX_P HELX_P88 88 ASN X 123 ? GLY X 128 ? ASN X 123 GLY X 128 5 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 38 A . ? SER 38 A PRO 39 A ? PRO 39 A 1 0.56 2 GLU 28 B . ? GLU 28 B PRO 29 B ? PRO 29 B 1 1.81 3 SER 38 C . ? SER 38 C PRO 39 C ? PRO 39 C 1 0.71 4 GLU 28 D . ? GLU 28 D PRO 29 D ? PRO 29 D 1 1.95 5 SER 38 E . ? SER 38 E PRO 39 E ? PRO 39 E 1 0.85 6 GLU 28 F . ? GLU 28 F PRO 29 F ? PRO 29 F 1 2.03 7 SER 38 G . ? SER 38 G PRO 39 G ? PRO 39 G 1 0.87 8 GLU 28 H . ? GLU 28 H PRO 29 H ? PRO 29 H 1 1.86 9 SER 38 I . ? SER 38 I PRO 39 I ? PRO 39 I 1 0.69 10 GLU 28 J . ? GLU 28 J PRO 29 J ? PRO 29 J 1 1.67 11 SER 38 K . ? SER 38 K PRO 39 K ? PRO 39 K 1 0.73 12 GLU 28 L . ? GLU 28 L PRO 29 L ? PRO 29 L 1 1.66 13 SER 38 M . ? SER 38 M PRO 39 M ? PRO 39 M 1 0.74 14 GLU 28 N . ? GLU 28 N PRO 29 N ? PRO 29 N 1 1.75 15 SER 38 O . ? SER 38 O PRO 39 O ? PRO 39 O 1 0.55 16 GLU 28 P . ? GLU 28 P PRO 29 P ? PRO 29 P 1 2.02 17 SER 38 Q . ? SER 38 Q PRO 39 Q ? PRO 39 Q 1 0.31 18 GLU 28 R . ? GLU 28 R PRO 29 R ? PRO 29 R 1 1.98 19 SER 38 S . ? SER 38 S PRO 39 S ? PRO 39 S 1 0.17 20 GLU 28 T . ? GLU 28 T PRO 29 T ? PRO 29 T 1 1.70 21 SER 38 U . ? SER 38 U PRO 39 U ? PRO 39 U 1 0.56 22 GLU 28 V . ? GLU 28 V PRO 29 V ? PRO 29 V 1 1.84 23 SER 38 W . ? SER 38 W PRO 39 W ? PRO 39 W 1 0.48 24 GLU 28 X . ? GLU 28 X PRO 29 X ? PRO 29 X 1 1.80 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 4 ? B ? 4 ? C ? 6 ? D ? 4 ? E ? 3 ? F ? 7 ? G ? 4 ? H ? 4 ? I ? 7 ? J ? 8 ? K ? 7 ? L ? 4 ? M ? 4 ? N ? 7 ? O ? 4 ? P ? 3 ? Q ? 7 ? R ? 4 ? S ? 4 ? T ? 4 ? U ? 4 ? V ? 4 ? W ? 7 ? X ? 4 ? Y ? 7 ? Z ? 8 ? AA ? 4 ? AB ? 4 ? AC ? 7 ? AD ? 8 ? AE ? 7 ? AF ? 8 ? AG ? 4 ? AH ? 4 ? AI ? 4 ? AJ ? 4 ? AK ? 4 ? AL ? 4 ? AM ? 4 ? AN ? 7 ? AO ? 8 ? AP ? 3 ? AQ ? 7 ? AR ? 4 ? AS ? 4 ? AT ? 4 ? AU ? 4 ? AV ? 4 ? AW ? 4 ? AX ? 4 ? AY ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel C 4 5 ? anti-parallel C 5 6 ? parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? anti-parallel F 3 4 ? anti-parallel F 4 5 ? anti-parallel F 5 6 ? parallel F 6 7 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel I 3 4 ? anti-parallel I 4 5 ? anti-parallel I 5 6 ? parallel I 6 7 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel J 4 5 ? anti-parallel J 5 6 ? anti-parallel J 6 7 ? anti-parallel J 7 8 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel K 4 5 ? anti-parallel K 5 6 ? parallel K 6 7 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? anti-parallel L 3 4 ? anti-parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel N 4 5 ? anti-parallel N 5 6 ? parallel N 6 7 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel O 3 4 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel Q 4 5 ? anti-parallel Q 5 6 ? parallel Q 6 7 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? anti-parallel R 3 4 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel S 3 4 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel U 2 3 ? anti-parallel U 3 4 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? anti-parallel V 3 4 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel W 2 3 ? anti-parallel W 3 4 ? anti-parallel W 4 5 ? anti-parallel W 5 6 ? parallel W 6 7 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel X 2 3 ? anti-parallel X 3 4 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Y 3 4 ? anti-parallel Y 4 5 ? anti-parallel Y 5 6 ? parallel Y 6 7 ? anti-parallel Z 1 2 ? anti-parallel Z 2 3 ? anti-parallel Z 3 4 ? anti-parallel Z 4 5 ? anti-parallel Z 5 6 ? anti-parallel Z 6 7 ? anti-parallel Z 7 8 ? anti-parallel AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AA 3 4 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? anti-parallel AB 3 4 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? anti-parallel AC 4 5 ? anti-parallel AC 5 6 ? parallel AC 6 7 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? anti-parallel AD 3 4 ? anti-parallel AD 4 5 ? anti-parallel AD 5 6 ? anti-parallel AD 6 7 ? anti-parallel AD 7 8 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel AE 2 3 ? anti-parallel AE 3 4 ? anti-parallel AE 4 5 ? anti-parallel AE 5 6 ? parallel AE 6 7 ? anti-parallel AF 1 2 ? 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