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Murshudov' garib@ysbl.york.ac.uk refinement http://www.ccp4.ac.uk/dist/html/refmac5.html Fortran_77 ? 7 XDS . ? ? ? ? 'data reduction' ? ? ? 8 SHELXD . ? ? ? ? phasing ? ? ? # _cell.entry_id 4R4K _cell.length_a 107.355 _cell.length_b 62.823 _cell.length_c 115.349 _cell.angle_alpha 90.000 _cell.angle_beta 106.570 _cell.angle_gamma 90.000 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.Z_PDB 16 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 4R4K _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.space_group_name_Hall ? # _exptl.crystals_number 1 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.entry_id 4R4K # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_Matthews 2.61 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_percent_sol 52.82 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP' _exptl_crystal_grow.pH 4.0 _exptl_crystal_grow.temp 277 _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;26.0% polyethylene glycol 8000, 0.2M lithium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 4.0, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K ; _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'MARMOSAIC 325 mm CCD' _diffrn_detector.details 'double crystal monochromator' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2014-02-14 # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'double crystal' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol MAD _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # loop_ _diffrn_radiation_wavelength.id _diffrn_radiation_wavelength.wavelength _diffrn_radiation_wavelength.wt 1 0.91837 1.0 2 0.97946 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline BL9-2 _diffrn_source.type 'SSRL BEAMLINE BL9-2' _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 0.91837,0.97946 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SSRL # _reflns.entry_id 4R4K _reflns.d_resolution_high 1.69 _reflns.d_resolution_low 29.757 _reflns.number_obs 81133 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.111 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 6.960 _reflns.percent_possible_obs 98.700 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 23.881 _reflns.observed_criterion_sigma_I -3.000 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.number_all ? _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_redundancy ? _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 # loop_ _reflns_shell.d_res_high _reflns_shell.d_res_low _reflns_shell.number_measured_obs _reflns_shell.number_measured_all _reflns_shell.number_unique_obs _reflns_shell.Rmerge_I_obs _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs _reflns_shell.pdbx_Rsym_value _reflns_shell.pdbx_chi_squared _reflns_shell.pdbx_redundancy _reflns_shell.percent_possible_obs _reflns_shell.number_unique_all _reflns_shell.percent_possible_all _reflns_shell.pdbx_ordinal _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1.700 1.760 45152 ? 15524 0.015 1.0 ? ? ? ? ? 98.400 1 1 1.760 1.830 47295 ? 15781 0.015 1.4 ? ? ? ? ? 99.200 2 1 1.830 1.910 45312 ? 15173 0.015 2.0 ? ? ? ? ? 98.500 3 1 1.910 2.020 51571 ? 17212 0.015 3.0 ? ? ? ? ? 98.600 4 1 2.020 2.140 44653 ? 14886 0.015 4.4 ? ? ? ? ? 98.500 5 1 2.140 2.310 48932 ? 16252 0.015 5.8 ? ? ? ? ? 98.600 6 1 2.310 2.540 46966 ? 15570 0.015 7.3 ? ? ? ? ? 99.300 7 1 2.540 2.900 47042 ? 15581 0.015 10.1 ? ? ? ? ? 99.300 8 1 2.900 3.660 47896 ? 16043 0.015 14.9 ? ? ? ? ? 98.700 9 1 3.660 ? 46251 ? 15683 0.015 19.5 ? ? ? ? ? 98.100 10 1 # _refine.entry_id 4R4K _refine.ls_d_res_high 1.6900 _refine.ls_d_res_low 29.757 _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.000 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_percent_reflns_obs 99.0500 _refine.ls_number_reflns_obs 80945 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.details ;1. HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS 2. A MET-INHIBITION PROTOCOL WAS USED FOR SELENOMETHIONINE INCORPORATION DURING PROTEIN EXPRESSION. THE OCCUPANCY OF THE SE ATOMS IN THE MSE RESIDUES WAS REDUCED TO 0.75 TO ACCOUNT FOR THE REDUCED SCATTERING POWER DUE TO PARTIAL S-MET INCORPORATION. 3. POLYETHYLENE GLYCOL (PEU), SULFATE (SO4) AND GLYCEROL (GOL) FROM THE CRYOPROTECTANT AND FROM THE CRYSTALLIZATION CONDITION HAVE BEEN MODELED IN THE SOLVENT STRUCTURE. 4. ATOM RECORD CONTAINS SUM OF TLS AND RESIDUAL B FACTORS. ANISOU RECORD CONTAINS SUM OF TLS AND RESIDUAL U FACTORS. 5. THE MAD PHASES WERE USED AS RESTRAINTS DURING REFINEMENT. ; _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs 0.1765 _refine.ls_R_factor_R_work 0.1752 _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free 0.2026 _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.0000 _refine.ls_number_reflns_R_free 4046 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.B_iso_mean 29.6425 _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.aniso_B[1][1] 0.4000 _refine.aniso_B[2][2] -0.1300 _refine.aniso_B[3][3] -0.3000 _refine.aniso_B[1][2] 0.0000 _refine.aniso_B[1][3] 0.2700 _refine.aniso_B[2][3] -0.0000 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.9650 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free 0.9550 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.1020 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 0.0980 _refine.overall_SU_ML 0.0680 _refine.overall_SU_B 4.2080 _refine.solvent_model_details 'BABINET MODEL WITH MASK' _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.2000 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii 0.8000 _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.8000 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct MAD _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.B_iso_max 116.680 _refine.B_iso_min 11.480 _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.occupancy_max 1.000 _refine.occupancy_min 0.250 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 4916 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 199 _refine_hist.number_atoms_solvent 622 _refine_hist.number_atoms_total 5737 _refine_hist.d_res_high 1.6900 _refine_hist.d_res_low 29.757 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function _refine_ls_restr.pdbx_refine_id r_bond_refined_d 5488 0.010 0.020 ? ? 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EA N N 6 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code A5ZF42_9BACE _struct_ref.pdbx_db_accession A5ZF42 _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;KNEIAQSGEDFKSFLDKFTSSAAFQYTRIKFPLKTPITLLADDGETEKTFPFTKEKWPLLDSETMKEERIEQEEGGIYVS KFTLNEPVHKVFEAGYEESEIDLRVEFEQAADGKWYVVDCYTGWYGYDLPIGELKQTIQQVKEENAAFKEIHP ; _struct_ref.pdbx_align_begin 33 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 4R4K A 2 ? 154 ? A5ZF42 33 ? 185 ? 33 185 2 1 4R4K B 2 ? 154 ? A5ZF42 33 ? 185 ? 33 185 3 1 4R4K C 2 ? 154 ? A5ZF42 33 ? 185 ? 33 185 4 1 4R4K D 2 ? 154 ? A5ZF42 33 ? 185 ? 33 185 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 4R4K GLY A 1 ? UNP A5ZF42 ? ? 'expression tag' 0 1 2 4R4K GLY B 1 ? UNP A5ZF42 ? ? 'expression tag' 0 2 3 4R4K GLY C 1 ? UNP A5ZF42 ? ? 'expression tag' 0 3 4 4R4K GLY D 1 ? UNP A5ZF42 ? ? 'expression tag' 0 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? monomeric 1 2 author_defined_assembly ? monomeric 1 3 author_defined_assembly ? monomeric 1 4 author_defined_assembly ? monomeric 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,E,F,G,H,I,J,K,BA 2 1 B,L,M,N,O,P,CA 3 1 C,Q,R,S,T,U,V,DA 4 1 D,W,X,Y,Z,AA,EA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASP A 11 ? SER A 22 ? ASP A 42 SER A 53 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 2 SER A 22 ? ARG A 29 ? SER A 53 ARG A 60 1 ? 8 HELX_P HELX_P3 3 THR A 54 ? TRP A 58 ? THR A 85 TRP A 89 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 4 TRP A 125 ? GLY A 127 ? TRP A 156 GLY A 158 5 ? 3 HELX_P HELX_P5 5 PRO A 131 ? GLY A 133 ? PRO A 162 GLY A 164 5 ? 3 HELX_P HELX_P6 6 GLU A 134 ? HIS A 153 ? GLU A 165 HIS A 184 1 ? 20 HELX_P HELX_P7 7 ASP B 11 ? SER B 22 ? ASP B 42 SER B 53 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 8 SER B 22 ? ARG B 29 ? SER B 53 ARG B 60 1 ? 8 HELX_P HELX_P9 9 THR B 54 ? TRP B 58 ? THR B 85 TRP B 89 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 10 TRP B 125 ? GLY B 127 ? TRP B 156 GLY B 158 5 ? 3 HELX_P HELX_P11 11 PRO B 131 ? GLY B 133 ? PRO B 162 GLY B 164 5 ? 3 HELX_P HELX_P12 12 GLU B 134 ? HIS B 153 ? GLU B 165 HIS B 184 1 ? 20 HELX_P HELX_P13 13 ASP C 11 ? SER C 22 ? ASP C 42 SER C 53 1 ? 12 HELX_P HELX_P14 14 SER C 22 ? ARG C 29 ? SER C 53 ARG C 60 1 ? 8 HELX_P HELX_P15 15 THR C 54 ? TRP C 58 ? THR C 85 TRP C 89 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 16 GLU C 134 ? HIS C 153 ? GLU C 165 HIS C 184 1 ? 20 HELX_P HELX_P17 17 ASP D 11 ? SER D 22 ? ASP D 42 SER D 53 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 18 SER D 22 ? ARG D 29 ? SER D 53 ARG D 60 1 ? 8 HELX_P HELX_P19 19 ASP D 43 ? GLU D 46 ? ASP D 74 GLU D 77 5 ? 4 HELX_P HELX_P20 20 THR D 54 ? TRP D 58 ? THR D 85 TRP D 89 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 21 TRP D 125 ? GLY D 127 ? TRP D 156 GLY D 158 5 ? 3 HELX_P HELX_P22 22 PRO D 131 ? GLY D 133 ? PRO D 162 GLY D 164 5 ? 3 HELX_P HELX_P23 23 GLU D 134 ? HIS D 153 ? GLU D 165 HIS D 184 1 ? 20 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? A THR 65 C ? ? ? 1_555 A MSE 66 N ? ? A THR 96 A MSE 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale2 covale both ? A MSE 66 C ? ? ? 1_555 A LYS 67 N ? ? A MSE 97 A LYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale3 covale both ? B THR 65 C ? ? ? 1_555 B MSE 66 N ? ? B THR 96 B MSE 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale4 covale both ? B MSE 66 C ? ? ? 1_555 B LYS 67 N ? ? B MSE 97 B LYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale5 covale both ? C THR 65 C ? ? ? 1_555 C MSE 66 N ? ? C THR 96 C MSE 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? ? covale6 covale both ? C MSE 66 C ? ? ? 1_555 C LYS 67 N ? ? C MSE 97 C LYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? ? covale7 covale both ? D THR 65 C ? ? ? 1_555 D MSE 66 N ? ? D THR 96 D MSE 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale8 covale both ? D MSE 66 C ? ? ? 1_555 D LYS 67 N ? ? D MSE 97 D LYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 MSE A 66 ? . . . . MSE A 97 ? 1_555 . . . . . . . MET 1 MSE Selenomethionine 'Named protein modification' 2 MSE B 66 ? . . . . MSE B 97 ? 1_555 . . . . . . . MET 1 MSE Selenomethionine 'Named protein modification' 3 MSE C 66 ? . . . . MSE C 97 ? 1_555 . . . . . . . MET 1 MSE Selenomethionine 'Named protein modification' 4 MSE D 66 ? . . . . MSE D 97 ? 1_555 . . . . . . . MET 1 MSE Selenomethionine 'Named protein modification' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 32 A . ? PHE 63 A PRO 33 A ? PRO 64 A 1 -3.41 2 PHE 32 B . ? PHE 63 B PRO 33 B ? PRO 64 B 1 -10.11 3 PHE 32 C . ? PHE 63 C PRO 33 C ? PRO 64 C 1 -5.94 4 PHE 32 D . ? PHE 63 D PRO 33 D ? PRO 64 D 1 -5.73 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 2 ? B ? 10 ? C ? 2 ? D ? 10 ? E ? 3 ? F ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel B 4 5 ? anti-parallel B 5 6 ? anti-parallel B 6 7 ? anti-parallel B 7 8 ? anti-parallel B 8 9 ? anti-parallel B 9 10 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel D 5 6 ? anti-parallel D 6 7 ? anti-parallel D 7 8 ? anti-parallel D 8 9 ? anti-parallel D 9 10 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? parallel F 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 ILE A 38 ? LEU A 41 ? ILE A 69 LEU A 72 A 2 GLU A 48 ? PHE A 51 ? GLU A 79 PHE A 82 B 1 TRP A 116 ? THR A 123 ? TRP A 147 THR A 154 B 2 LEU A 104 ? GLN A 110 ? LEU A 135 GLN A 141 B 3 HIS A 90 ? TYR A 97 ? HIS A 121 TYR A 128 B 4 ILE A 78 ? GLU A 87 ? ILE A 109 GLU A 118 B 5 GLU A 69 ? GLN A 73 ? GLU A 100 GLN A 104 B 6 GLU C 69 ? GLN C 73 ? GLU C 100 GLN C 104 B 7 ILE C 78 ? GLU C 87 ? ILE C 109 GLU C 118 B 8 HIS C 90 ? TYR C 97 ? HIS C 121 TYR C 128 B 9 LEU C 104 ? GLN C 110 ? LEU C 135 GLN C 141 B 10 TRP C 116 ? THR C 123 ? TRP C 147 THR C 154 C 1 ILE B 38 ? LEU B 41 ? ILE B 69 LEU B 72 C 2 GLU B 48 ? PHE B 51 ? GLU B 79 PHE B 82 D 1 TRP B 116 ? THR B 123 ? TRP B 147 THR B 154 D 2 LEU B 104 ? GLN B 110 ? LEU B 135 GLN B 141 D 3 HIS B 90 ? TYR B 97 ? HIS B 121 TYR B 128 D 4 GLY B 77 ? GLU B 87 ? GLY B 108 GLU B 118 D 5 GLU B 69 ? GLN B 73 ? GLU B 100 GLN B 104 D 6 GLU D 69 ? GLN D 73 ? GLU D 100 GLN D 104 D 7 ILE D 78 ? GLU D 87 ? ILE D 109 GLU D 118 D 8 HIS D 90 ? TYR D 97 ? HIS D 121 TYR D 128 D 9 ILE D 102 ? GLN D 110 ? ILE D 133 GLN D 141 D 10 TRP D 116 ? THR D 123 ? TRP D 147 THR D 154 E 1 GLU C 48 ? PHE C 51 ? GLU C 79 PHE C 82 E 2 ILE C 38 ? LEU C 41 ? ILE C 69 LEU C 72 E 3 LEU C 130 ? PRO C 131 ? LEU C 161 PRO C 162 F 1 ILE D 38 ? ALA D 42 ? ILE D 69 ALA D 73 F 2 THR D 47 ? PHE D 51 ? THR D 78 PHE D 82 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 N LEU A 40 ? N LEU A 71 O LYS A 49 ? O LYS A 80 B 1 2 O ASP A 120 ? O ASP A 151 N GLU A 107 ? N GLU A 138 B 2 3 O PHE A 108 ? O PHE A 139 N LYS A 91 ? N LYS A 122 B 3 4 O GLY A 96 ? O GLY A 127 N VAL A 80 ? N VAL A 111 B 4 5 O TYR A 79 ? O TYR A 110 N ILE A 71 ? N ILE A 102 B 5 6 N GLU A 72 ? N GLU A 103 O ARG C 70 ? O ARG C 101 B 6 7 N ILE C 71 ? N ILE C 102 O TYR C 79 ? O TYR C 110 B 7 8 N VAL C 80 ? N VAL C 111 O GLY C 96 ? O GLY C 127 B 8 9 N LYS C 91 ? N LYS C 122 O PHE C 108 ? O PHE C 139 B 9 10 N GLU C 109 ? N GLU C 140 O TYR C 117 ? O TYR C 148 C 1 2 N LEU B 40 ? N LEU B 71 O LYS B 49 ? O LYS B 80 D 1 2 O TYR B 122 ? O TYR B 153 N ARG B 105 ? N ARG B 136 D 2 3 O PHE B 108 ? O PHE B 139 N LYS B 91 ? N LYS B 122 D 3 4 O GLU B 94 ? O GLU B 125 N LYS B 82 ? N LYS B 113 D 4 5 O TYR B 79 ? O TYR B 110 N ILE B 71 ? N ILE B 102 D 5 6 N GLU B 72 ? N GLU B 103 O GLU D 72 ? O GLU D 103 D 6 7 N ILE D 71 ? N ILE D 102 O TYR D 79 ? O TYR D 110 D 7 8 N VAL D 80 ? N VAL D 111 O GLY D 96 ? O GLY D 127 D 8 9 N LYS D 91 ? N LYS D 122 O PHE D 108 ? O PHE D 139 D 9 10 N GLU D 109 ? N GLU D 140 O TYR D 117 ? O TYR D 148 E 1 2 O LYS C 49 ? O LYS C 80 N LEU C 40 ? N LEU C 71 E 2 3 N LEU C 41 ? N LEU C 72 O LEU C 130 ? O LEU C 161 F 1 2 N LEU D 40 ? N LEU D 71 O LYS D 49 ? 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_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal ACT C O doub N N 1 ACT C OXT sing N N 2 ACT C CH3 sing N N 3 ACT CH3 H1 sing N N 4 ACT CH3 H2 sing N N 5 ACT CH3 H3 sing N N 6 ALA N CA sing N N 7 ALA N H sing N N 8 ALA N H2 sing N N 9 ALA CA C sing N N 10 ALA CA CB sing N N 11 ALA CA HA sing N N 12 ALA C O doub N N 13 ALA C OXT sing N N 14 ALA CB HB1 sing N N 15 ALA CB HB2 sing N N 16 ALA CB HB3 sing N N 17 ALA OXT HXT sing N N 18 ARG N CA sing N N 19 ARG N H sing N N 20 ARG N H2 sing N N 21 ARG CA C sing N N 22 ARG CA CB sing N N 23 ARG CA HA sing N N 24 ARG C O doub N N 25 ARG C OXT sing N N 26 ARG CB CG sing N N 27 ARG CB HB2 sing N N 28 ARG CB HB3 sing N N 29 ARG CG CD sing N N 30 ARG CG HG2 sing N N 31 ARG CG HG3 sing N N 32 ARG CD NE sing N N 33 ARG CD HD2 sing N N 34 ARG CD HD3 sing N N 35 ARG NE CZ sing N N 36 ARG NE HE sing N N 37 ARG CZ NH1 sing N N 38 ARG CZ NH2 doub N N 39 ARG NH1 HH11 sing N N 40 ARG NH1 HH12 sing N N 41 ARG NH2 HH21 sing N N 42 ARG NH2 HH22 sing N N 43 ARG OXT HXT sing N N 44 ASN N CA sing N N 45 ASN N H sing N N 46 ASN N H2 sing N N 47 ASN CA C sing N N 48 ASN CA CB sing N N 49 ASN CA HA sing N N 50 ASN C O doub N N 51 ASN C OXT sing N N 52 ASN CB CG sing N N 53 ASN CB HB2 sing N N 54 ASN CB HB3 sing N N 55 ASN CG OD1 doub N N 56 ASN CG ND2 sing N N 57 ASN ND2 HD21 sing N N 58 ASN ND2 HD22 sing N N 59 ASN OXT HXT sing N N 60 ASP N CA sing N N 61 ASP N H sing N N 62 ASP N H2 sing N N 63 ASP CA C sing N N 64 ASP CA CB sing N N 65 ASP CA HA sing N N 66 ASP C O doub N N 67 ASP C OXT sing N N 68 ASP CB CG sing N N 69 ASP CB HB2 sing N N 70 ASP CB HB3 sing N N 71 ASP CG OD1 doub N N 72 ASP CG OD2 sing N N 73 ASP OD2 HD2 sing N N 74 ASP OXT HXT sing N N 75 CYS N CA sing N N 76 CYS N H sing N N 77 CYS N H2 sing N N 78 CYS CA C sing N N 79 CYS CA CB sing N N 80 CYS CA HA sing N N 81 CYS C O doub N N 82 CYS C OXT sing N N 83 CYS CB SG sing N N 84 CYS CB HB2 sing N N 85 CYS CB HB3 sing N N 86 CYS SG HG sing N N 87 CYS OXT HXT sing N N 88 GLN N CA sing N N 89 GLN N H sing N N 90 GLN N H2 sing N N 91 GLN CA C sing N N 92 GLN CA CB sing N N 93 GLN CA HA sing N N 94 GLN C O doub N N 95 GLN C OXT sing N N 96 GLN CB CG sing N N 97 GLN CB HB2 sing N N 98 GLN CB HB3 sing N N 99 GLN CG CD sing N N 100 GLN CG HG2 sing N N 101 GLN CG HG3 sing N N 102 GLN CD OE1 doub N N 103 GLN CD NE2 sing N N 104 GLN NE2 HE21 sing N N 105 GLN NE2 HE22 sing N N 106 GLN OXT HXT sing N N 107 GLU N CA sing N N 108 GLU N H sing N N 109 GLU N H2 sing N N 110 GLU CA C sing N N 111 GLU CA CB sing N N 112 GLU CA HA sing N N 113 GLU C O doub N N 114 GLU C OXT sing N N 115 GLU CB CG sing N N 116 GLU CB HB2 sing N N 117 GLU CB HB3 sing N N 118 GLU CG CD sing N N 119 GLU CG HG2 sing N N 120 GLU CG HG3 sing N N 121 GLU CD OE1 doub N N 122 GLU CD OE2 sing N N 123 GLU OE2 HE2 sing N N 124 GLU OXT HXT sing N N 125 GLY N CA sing N N 126 GLY N H sing N N 127 GLY N H2 sing N N 128 GLY CA C sing N N 129 GLY CA HA2 sing N N 130 GLY CA HA3 sing N N 131 GLY C O doub N N 132 GLY C OXT sing N N 133 GLY OXT HXT sing N N 134 GOL C1 O1 sing N N 135 GOL C1 C2 sing N N 136 GOL C1 H11 sing N N 137 GOL C1 H12 sing N N 138 GOL O1 HO1 sing N N 139 GOL C2 O2 sing N N 140 GOL C2 C3 sing N N 141 GOL C2 H2 sing N N 142 GOL O2 HO2 sing N N 143 GOL C3 O3 sing N N 144 GOL C3 H31 sing N N 145 GOL C3 H32 sing N N 146 GOL O3 HO3 sing N N 147 HIS N CA sing N N 148 HIS N H sing N N 149 HIS N H2 sing N N 150 HIS CA C sing N N 151 HIS CA CB sing N N 152 HIS CA HA sing N N 153 HIS C O doub N N 154 HIS C OXT sing N N 155 HIS CB CG sing N N 156 HIS CB HB2 sing N N 157 HIS CB HB3 sing N N 158 HIS CG ND1 sing Y N 159 HIS CG CD2 doub Y N 160 HIS ND1 CE1 doub Y N 161 HIS ND1 HD1 sing N N 162 HIS CD2 NE2 sing Y N 163 HIS CD2 HD2 sing N N 164 HIS CE1 NE2 sing Y N 165 HIS CE1 HE1 sing N N 166 HIS NE2 HE2 sing N N 167 HIS OXT HXT sing N N 168 HOH O H1 sing N N 169 HOH O H2 sing N N 170 ILE N CA sing N N 171 ILE N H sing N N 172 ILE N H2 sing N N 173 ILE CA C sing N N 174 ILE CA CB sing N N 175 ILE CA HA sing N N 176 ILE C O doub N N 177 ILE C OXT sing N N 178 ILE CB CG1 sing N N 179 ILE CB CG2 sing N N 180 ILE CB HB sing N N 181 ILE CG1 CD1 sing N N 182 ILE CG1 HG12 sing N N 183 ILE CG1 HG13 sing N N 184 ILE CG2 HG21 sing N N 185 ILE CG2 HG22 sing N N 186 ILE CG2 HG23 sing N N 187 ILE CD1 HD11 sing N N 188 ILE CD1 HD12 sing N N 189 ILE CD1 HD13 sing N N 190 ILE OXT HXT sing N N 191 LEU N CA sing N N 192 LEU N H sing N N 193 LEU N H2 sing N N 194 LEU CA C sing N N 195 LEU CA CB sing N N 196 LEU CA HA sing N N 197 LEU C O doub N N 198 LEU C OXT sing N N 199 LEU CB CG sing N N 200 LEU CB HB2 sing N N 201 LEU CB HB3 sing N N 202 LEU CG CD1 sing N N 203 LEU CG CD2 sing N N 204 LEU CG HG sing N N 205 LEU CD1 HD11 sing N N 206 LEU CD1 HD12 sing N N 207 LEU CD1 HD13 sing N N 208 LEU CD2 HD21 sing N N 209 LEU CD2 HD22 sing N N 210 LEU CD2 HD23 sing N N 211 LEU OXT HXT sing N N 212 LYS N CA sing N N 213 LYS N H sing N N 214 LYS N H2 sing N N 215 LYS CA C sing N N 216 LYS CA CB sing N N 217 LYS CA HA sing N N 218 LYS C O doub N N 219 LYS C OXT sing N N 220 LYS CB CG sing N N 221 LYS CB HB2 sing N N 222 LYS CB HB3 sing N N 223 LYS CG CD sing N N 224 LYS CG HG2 sing N N 225 LYS CG HG3 sing N N 226 LYS CD CE sing N N 227 LYS CD HD2 sing N N 228 LYS CD HD3 sing N N 229 LYS CE NZ sing N N 230 LYS CE HE2 sing N N 231 LYS CE HE3 sing N N 232 LYS NZ HZ1 sing N N 233 LYS NZ HZ2 sing N N 234 LYS NZ HZ3 sing N N 235 LYS OXT HXT sing N N 236 MSE N CA sing N N 237 MSE N H sing N N 238 MSE N H2 sing N N 239 MSE CA C sing N N 240 MSE CA CB sing N N 241 MSE CA HA sing N N 242 MSE C O doub N N 243 MSE C OXT sing N N 244 MSE OXT HXT sing N N 245 MSE CB CG sing N N 246 MSE CB HB2 sing N N 247 MSE CB HB3 sing N N 248 MSE CG SE sing N N 249 MSE CG HG2 sing N N 250 MSE CG HG3 sing N N 251 MSE SE CE sing N N 252 MSE CE HE1 sing N N 253 MSE CE HE2 sing N N 254 MSE CE HE3 sing N N 255 PEU CAA OAB sing N N 256 PEU CAA HAA1 sing N N 257 PEU CAA HAA2 sing N N 258 PEU CAA HAA3 sing N N 259 PEU OAB CAC sing N N 260 PEU CAC CAD sing N N 261 PEU CAC HAC1 sing N N 262 PEU CAC HAC2 sing N N 263 PEU CAD OAE sing N N 264 PEU CAD HAD1 sing N N 265 PEU CAD HAD2 sing N N 266 PEU OAE CAF sing N N 267 PEU CAF CAG sing N N 268 PEU CAF HAF1 sing N N 269 PEU CAF HAF2 sing N N 270 PEU CAG OAH sing N N 271 PEU CAG HAG1 sing N N 272 PEU CAG HAG2 sing N N 273 PEU OAH CAI sing N N 274 PEU CAI CAJ sing N N 275 PEU CAI HAI1 sing N N 276 PEU CAI HAI2 sing N N 277 PEU CAJ OAK sing N N 278 PEU CAJ HAJ1 sing N N 279 PEU CAJ HAJ2 sing N N 280 PEU OAK CAL sing N N 281 PEU CAL CAM sing N N 282 PEU CAL HAL1 sing N N 283 PEU CAL HAL2 sing N N 284 PEU CAM OAN sing N N 285 PEU CAM HAM1 sing N N 286 PEU CAM HAM2 sing N N 287 PEU OAN CAO sing N N 288 PEU CAO CAP sing N N 289 PEU CAO HAO1 sing N N 290 PEU CAO HAO2 sing N N 291 PEU CAP OAQ sing N N 292 PEU CAP HAP1 sing N N 293 PEU CAP HAP2 sing N N 294 PEU OAQ CAR sing N N 295 PEU CAR CAS sing N N 296 PEU CAR HAR1 sing N N 297 PEU CAR HAR2 sing N N 298 PEU CAS OAT sing N N 299 PEU CAS HAS1 sing N N 300 PEU CAS HAS2 sing N N 301 PEU OAT CAU sing N N 302 PEU CAU CAV sing N N 303 PEU CAU HAU1 sing N N 304 PEU CAU HAU2 sing N N 305 PEU CAV OAW sing N N 306 PEU CAV HAV1 sing N N 307 PEU CAV HAV2 sing N N 308 PEU OAW CAX sing N N 309 PEU CAX CAY sing N N 310 PEU CAX HAX1 sing N N 311 PEU CAX HAX2 sing N N 312 PEU CAY OAZ sing N N 313 PEU CAY HAY1 sing N N 314 PEU CAY HAY2 sing N N 315 PEU OAZ CBA sing N N 316 PEU CBA CBB sing N N 317 PEU CBA HBA1 sing N N 318 PEU CBA HBA2 sing N N 319 PEU CBB OBC sing N N 320 PEU CBB HBB1 sing N N 321 PEU CBB HBB2 sing N N 322 PEU OBC CCG sing N N 323 PEU CCG CCF sing N N 324 PEU CCG HCG1 sing N N 325 PEU CCG HCG2 sing N N 326 PEU CCF OCE sing N N 327 PEU CCF HCF1 sing N N 328 PEU CCF HCF2 sing N N 329 PEU OCE CCD sing N N 330 PEU CCD CCC sing N N 331 PEU CCD HCD1 sing N N 332 PEU CCD HCD2 sing N N 333 PEU CCC OCB sing N N 334 PEU CCC HCC1 sing N N 335 PEU 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